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GrainGenes Sequence Report: AE038870

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Sequence
AE038870
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE038870
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCCTGGTACATCGAGAGCGCTGCAGTTGGAAGGAAGGCATCTACAAC
GATACACAGATTGAAGATGTGGGGAACACGTGCTACGTCCAATTGGCCAT
CGTCCACACCGACGGCAAGGCGCTGCACCCGGCAGCAAGTGCGGTGCTCG
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ACAAAGGCATTGCCGTTAATGGTAGTGGCAAGAGATAGTAGAGGCGTCTC
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GTATGCTAATTCTTCTGTAAATCCATATGAATTTATTATAAATGCAATTT
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GAGAAAATGTCTCCAGGAAGATCCATGACTGCAAAAGCTTGAATAAAATA
ATCGGCTTTCTCCTGCTTAGCATCCGCTGTAATCCTAAGGACATGGACCT
TTCCAGAACTTGTGCAGATGCAAGCAAATTTGTCATAAAAAATTAGCTAG
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GTTGAGTACCTATCAGATGACCCAGATGGCGTTGACAATAACACCTCATC
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GATCATCAGATGTCTGCAATTGAAATTATTATTACTAAGTCACAAATAAG
CAGTCGCTACCAACAATGCGTCGAGTTTGCTTTTTTTGGTTCACCATTTT
ATCCACTACTTATCTTAGATACTATCTGTCCCCAAATAGGTGGCGTATAA
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AAATTCAACAACTATAATATTAAATAAGTATATTATGAAAATATATCTTA
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ATATATTCTTGGACAAACTTTGAAAACAATGATCGTTTATCTAGGTTTAT
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TGGGACGGCAGCAGACAAATGATTGCTTACTTGCCAGATACAATAATTGA
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CATACATTGTTTACTTTGAAGGTTTTTATTTTCCACTTTATTATTATTTA
GGAACTTAATTAACTTTAGCTGCACACTCGCACTGTGACAAAAAAATGTT
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GAGAACATAGTATTCATCATAACTCTGTAGATACTCCATCGGGTCCTAGA
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CTTTTTGTATAATTTATTCATATAAAGAAAGTTGTATATTTGGAAAGTAC
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ATATCAGTTGTCAATATTTCAAAAGCATCACTACTCCATTGTCGTCTAGA
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ATTCTAAATCTTTTTGTGGGGGAAAAGACGTTTCGTTTTATCAGAAACAT
GATTACTTGTCCATAATCACGAGCTAGTATATCCATTTATCACGACAGGA
GACACGGTGCTCTTTTCTTTACTACTAGGTTAGTTCAGTAGGCATGTAGG
CTATTTGTGCATATGCCATTCTCGCAATAGATATACTCTGTCTCGGTGAT
GCAATGCAATCAACTTGTATCTTCCCATTTAATAATAACCTACACTTGCA
TTATGATGTATTTATATGGCCATTTGAAATGCTGGAAATTAGGATATGCA
AAAGGTTCTTAGTAATAATTTCTCTCCAAATTAAAGCTTCCTTGTGTGAA
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AAAAAAAATATGATCATGTGTAGCTTCATGTTTGAGGTGCACACGAAGTT
ATTTTACCGAAAACCGATATGTTTTGTGTGCTGTGTAAAAAATACAAGTT
TTTGCATCATGGAGCACGTTATTTTAGCACCAAATTTTGTCTTTTTTGTA
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ATAGTTGCAAACTTGCACTAAAAACAAGGGTAGTGCAACTACAATTTTTT
AGGACAGTTGCACTAGCTGGTGAGAAAGATGTTGGCTTTTCTACCCTAGT
GAGTGCTATATCTTCCCAAGTCCCATCATTAACACAATATCTATGAGAAC
ATAGTATTCATTAAAAATGTGTGTAGATATTCCATCCAGCCCTATATCAA
TTTAGACCTTTCCAAATACAGTTTTGACTATTATTTTGAAAACAATATAC
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TCCACACATGATTTTCAAGTAAGAGATGTAGTATTTGTAAAGATATTGGT
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TCTGATTTAGGTCGTCTCTAGTACTTGCATTAATCATTTTGTCAAATATT
ATTCTTGAATATTTTTCTTTTGTTTTGTTTCACTCCGATAATATAGTAGA
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TTTTGGCCGAACTTTCATTTATCACGACAAAAGAGGCACAGCTCTTTTAT
TTACTAATTTGTTAGTTCAGTAGGCATGCAGGTTCTCTTGGCTGACTTGT
AGACCCAATTTGATTTTCACCTAGCTATATAATATTTGTGCATATGCCAT
CCACTCCCTATTAGTACACTTTGTGTCTCGTTGATGAAGTGCAATCAACT
CTTATCTTGCCATTTAAGTGATTTCATGCACTCAATTCTAATGTATTTAT
ATGGAGTGTAAAATGCTGAAAATTAGAGCATGCAAAGGTTCTTAATAATA
ATAGTTCTCAAATGAAATCTTGCTTGTGTGAAACCAACATCTGATGCTCT
TTGTGTCTTCTTTCCTTGCGATGAGATGTTGTTCGTGTCCTGTACTATGA
ATGTTACGTGACAACGAATATATATATATACAATGCTCTTGGTGGTTGCC
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TCTAAACGTTAACAGTAGTTAACTAAATGTGGTGTGTATCATTGCCTAGT
CAAGACAAGCATACATACGTGTTGTATATCGGCTTGTGTCGTGGATTATT
GGAGGTATTATCCATCATCTCTGTAATGAGCAATTAGACAGGATGCTCTA
AACGTTAACAGTAGTTAACTAAATGTGGTGTGCATCATTTGTCTAGCCAA
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CGTTAACGGTGGCTAATTAAACGTGGTGCCCATCACGATGTTAATAATAA
GATTTGCTTCGCACATCGCTATAAAATCTTCTGACCGACGCCCATCACCA
TCCTACAACTATAGACAAAGCAGCCTACATTTTTCTTTGTACAGTTTAAG
GTTACTATCAGCTAGTGCAGCTACATAACTTAGTTCACTTCTGTAATTCA
GCAAACGTTGCATGTATGTACTCATCTATAAATAAATACATACATACCTT
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CCGCTAGGCGATTCACACCGTGGAATGTGTGTTGCTCACCGCCAGAGACA
CCAGAACCGAGGCGAAGCTTCGCAGACTACCAACCCAACTCCTGGGACTA
CGAGGCCATAATGCGTCTCAAGGGTGGAACCTGTACATATCATGATCAGG
TGACTGCTTTAATAATATATACATTTTCGCATATACTCCTACATATTCAA
CACTTATCAAGACAAAAGAACTGTCTTCTATCTTATACTTCCTTTATCCC
ACAATATAAGCAGAAAATCGTTTTGGAGCTCGGGCTACATGGAGCCCTTT
ATTTTTTCAAAATTTGGAAACATGATTTCAAAGTTTCAAAAAAGTCTGAA
AAAAATCAGAGACATAGATAATGATGTAACTACCAACTCGAAAAACTTAC
AGCCTGAAATGCCTTAAAATTTGGGTGTAACAAAAATGACAAAATCTAAC
AGATTTTGGAGGTTTGAATCTGTGCACGGTTCACTATTCTAGATGTCAGA
TTTTGCCATTTTTATGTAGCCCAAAATACTTGGTATTTCAGGTTGTGAGG
TTTTCAAGTTGAAAAGGTACATCATCATCTATATCTACAAAAAAAATCTG
AATATTTTGAAAATTTTAATCGGTGTTTTCGAATTGTTCAAATAAAGGGC
TAATCCCGAGCTCCAAACATTCGTATTAATAATATATGATGTTATTACAA
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AATAAAACTGACTGACCTCATGGGTCTTGGCACAGGTCTGCTCATCAAGC
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CAGGGAGGAAGGTTTCCCGGTCTCCCCAGATAGTCAATTTATCAAGAAAC
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GCAGAGAGATGTCGAGGGGATTCTGTCACTCTATGAGGCTTCATATCTTG
CATTTGGAGATGAGAAGATACTGGATGAAGCAAGAGATTTTTGTGTTGAT
GCTCTCACTAAACTTTTGCCCTCGATGCATCCCCAGTTAAGGCATAGTGT
AGTTCATGCCTTAGACCTTCCATTGCACTAGAGGACACCAAGACTAGAAG
CAAGATGGTTTGTAGATCATTATGGTCGAGATGCAAACTTCGATCCGTTG
CTCCTTCATTTTGCTAAGCTGGACTTCAACAAGGTTCAGAGCGTGCATCA
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TTCCAAAAAGAAAAGATGCATGCATGTATGTTGAGTACTATATTTTTGGT
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TGTGGCCATTGGTCAAAAATTGACATTCGCAAGAGATCGCTTGATGGAAT
ACTTCCATTATGCAAATGGCATTGTCTGGGAACCAGACCTTGGAGTATGT
CGGGAATCACTTGCTAAAATCACTAATCGAATATAACTTGGATGATGTTT
ATGATGTGTAAGGTACTCCAGACGAGCTCGTCCTCTTCACAGATGCAATC
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AATAATAATATATATGGTTTTACAACCCTAAACACATGTAATCTTGCCGA
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AGCCCTCTACTCAGGTATGTACAACACGTCCAATGAGGTGGCTGACCATG
CTCTGAAATCACATGGTTGTGATGTGGGTTTGCTTCTTCAGAAAGCGGTA
AAGGAACTTAAGTGCACTCATAACTTTTTATAGCACATAGGTAGTTAAAC
GTACAAATTTAAATAGTACAAACAATCAGTAAATTAATTAGTTAATTAAT
TGCAATGGCATGACTTGTGCAGGGCATTCTTGGTGGAAGCAAAATGGTAT
GATGGAAACTACAAACCGACCCTCCATGAGTATTTGGATAATGGATGGCT
TTCATCCTCAGTGCCAGTACTGCTCATGCATGTGTTTCCCATGCTCAACA
CGGAACTCACCTCAAAGTATCTACACCAAGGTGGAAGCTACCCAACATCT
GGGTCAGCATCTCTAATTTTTCGACTGTGTAATGACTACGCAACACATTC
TGTATGTATATAATAGCATATCTATCTTAGTCCATACCAACTTTTGGATG
AGTTCAAGCCTTGTATCATGAAAAAACTAATGATATTTGTTTTTCATGTG
TACCTTGTGATCGAAATTGCAGGTTGAGCTGCAGAGAGGGGATACACCAT
CCTCCATAGCTATCCACATATCAGAAAACACTTGTGATGAGCAAGAATCT
TGTAAAGCCATGCAAGATCTTCGCATGGTTGCTTGGAAGTCGATGAATGA
AGATGCATTCAACCACCACCAATGTTCTCCACCTTTCTCCAAGGTGTGCA
TGAATTTGGCCAGAATATCACATTGTGTTTACCAAGGGTGCGATGGTATT
GGTGCGCCAGATGATCAGAATAAGAAGCAAATCAAGGAGTTGTTCCTGGA
GCCTTTTATCGTGAATAGTTAGTTAGTAAACGAGAACTCTTACTTGTGGA
AGACAATCATATTCTTCCAGCTATGAAGATAATACTATCATGGCAGCGAA
GCAATCATCTTAAAGTAGATGGATACTACCCAGATAAATCAGAAGTTTTA
TCACAACCACGTGGCTACCAATGAGCAGTTGTCTCCATGTCGGGTGGTCT
CAAGCCTCAAAGGCAGTGTCGTTAATGGTACTGGCAAGATATGGTAGAGG
CATCTCCCACAACAGCCTCATCCCTACCATCGTTGTTGGCATAAACCTCA
TGATCATATGTGATGTAAATCCAATATGAATTTATTACAAATGCAATTTC
TTTTGTAAGTCTAGCTAGAGTCGATGGGGTAGTGCCTCTCTAAAATGGCC
AGGTCATTGGCACATGATTAGGCCATCAAGGATTCTCACGTGTTCTTCCT
TAAATTTATTTCCTAATGATTTTGGTTAGTATATGCAGATGAACATATTC
GTGTATAACATTGAACTGGCTGATCATGTGCTAATTTCTGTACATTTGGA
CAATTTTGATGTTGTAAAATGTAAATTTAAAAATACTGAACAAGTCAACA
GTACATAAAAACACTTGAACAGGATTCTTGGAAACATCTTATATGTTATT
GATCAGGATAATTCTTCCAAATTAGTACAGTAAACTGGCATTGTTTACAA
ACTAAACCAGGAAGTGTAGTTCAATCCTGTGAATGTCGAATGGTCCTTCC
AAAGTCATTGTTTCTCTCCCTTGACCTCCAATGTACTGCTTGAGGCACCT
GCTCCTGTCACCGGCACTGAAGCTCCACTGTTCGATGCTCTCATCCCCGG
CCTATTGATTTCAGGTTGCCCGATGCAATCATGATTGGCAAGGGCAGCTC
ATCTAGGATCAAGGATACGCTCTCCTCTTCCCTTGTCCCTGTTTATGATC
ATATATATCTTGTTCTTCCGATTTGGGTGCCTCTTCCCCTCGTTATTTAT
GAAATCACTAGCATAAGGAATACGAGTAGTATGTGCACAGAATTGTTGTA
TGAGCTGCAAGTATAATGTTAAATTTGTATCTTTGATTCACAATAGTAAG
ATTGAGGGAAGATAAACAAACTAAGTGCTCCCTACTTCGATCCTAAATTT
GAGACCAATTTCAATGTATGTTTGGAAGCTCAAAAATAACCTTTCTACAT
GGTTTTAGTACTTTCTATATGAAGAAATGAGAACTTAAAAGTTTTGGTAC
AGAAGAGAGAGCCTGGTAGAGGCGGCAACCGGGCAATTCTTTCCTTTCCT
GGTAGAGAAGACAACGAAAGAAGAAAACAATAGAACAATTCTGATTTGTA
AACATACCAGAAGCCTATATTGAAGATCGATCATGTCCCTCTCTTTTTAT
TTCAACGGTCTATAGGCACAGCCGGTGCTCGAGTTGAATAGTTTCACCGG
GTACGTTCTCCTTGCTCTGGACATGCACTATACTTGTGTGGAGTGGGTGT
TTACAAAATAGTTACAGCGAAAGTGTAAACTCTCTTTGCCTCACGAGTTT
CAGTGATCCCTTTATTTTTTTTTTTAAATGAGAACTCTGATAAACTTTGG
AGTTTTGAAAATATGCACTATTCACTATACTCAAATCCATATTTTATTTG
TTTTATAGCTAAGAATGTAAAGTATAAATTGAGCTTTTTAACATCTGTAG
GATATATCATTGAGTAGGTTCAGAATTTTTTGAAACTTGTAAACATGGTT
TTTGAAAATAAGGGAATCATTGATCTCAGGAGCCGGAAATCCCTACTCTA
GCACAAAGACTCATTTGGAACATACATCTACAATTTTTGAAGAGCATATT
TTTCTAGACATCAATGATAGTATGTAAGTACTTTTTATTGCAATGAAGCG
AGTACAATGTTCGATTGACAAGTGATACTAAATCATGGAATTGGCATAAA
AGCATATACAGAAATGCTGGAGTGCTAGTGCGTGGACTACGTGTAGAGTT
TATTGAAGGGGTATTTTCCGTGTCAAACACTCCTCAACTTGATCCGCCTC
CGGGAAGTCGCCACGAGGAAGCACCCACCGGCTAGATCATTGGGCCGATA
ATCAGCCAAACTTAGAGGAGGCCGCACCGCTGCGTGGCCAGCGCCATGGC
CACACATGCGTCTCCCTAAGGATCAATGTGGGATCCCACGGTCCCCCACA
CCAGCCATAGCCTGGCCACACCTCCAGCGAGGAGGCCGCCGCCGCCATGC
CCGGAACCGCTATTCCGACTCCCATGTGGTATGTGGGGAGAAGGCTGTCG
TCCACACGGAGGATCGGCGCAGGCGCAAGCGTCAAGGTCCAGATCCTGCG
GACCTAGAACCACCGCGCCGACGCTAGAACTTCCCCGCCGCGTGGCCAAC
CCCGTCAGGAGCCACCACGACCCGAGAATAGATCGGAGCGCCGTCGTCCT
TCACTCGAGATCACGCCCAGATGAGGCCCCCCTGCCGCCGGGCAGCACGG
GGCTTTGCCCGGTGACCTCTCCGGCAGCGGCGGAGAGGAGGAGAGGAGGG
TAGGGAGGCCGAGAGAGGGGCGGCGCGGCGCCGCCAGCAGGAGGAGGGTT
CACGTCAGGACGAGGAGGAGGAGAGTTATGCAAAAAGAAATAAGACGAAC
AAAGATGCATGGATCTTTGCATGGATGCTTGGAAGTCGATGAACGAAGAT
GCATTCAACCACCACCAATGTCCTCCACCTTTCTCCAAGAAGTGCAGGAA
TTTGGCCCGTATATCTCATTGTATTTACTAAGGGTGCGATGGTTTTGGTG
CACCAGATGATCACAATAAGAAGTAGCTCTAGGAGTTGTTCCTAGAGCCT
TTCTTCGTGAGTACCTATTAAAAATGATACTTTTATTGAAGGGGTATTTT
CCAGCTATCAAGCCGACCAATCTAGAAGGCTTTCCGCGGCAAAGAGTAAA
CGTTGTTTATTAATCTGCTCTCACTATTGAATCCCGTACACTGGGTCAGC
ACTAAGGTTGTAATGTGATTGTGAAATTGAATATCAGGCACTTAACTGGA
GATCCTCAAGTTCCATTTGCATGTGGAGATCTTTTGAGACCTAAATTAAG
CTTATAAGTAGCTAATGCACTCTACTTTTTACTGTTTCTTTAAAATATCA
AACTTCTCAGTCATATGCTTTCACAATCGCATATATGGATAAAAAAACCA
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TTTTTCTTTTTTTTTGAGGGACTGAGTGTGCACGGTAGGGTGATCTTTGA
TGTGTCATTTGTGTTTTACTGTTATGTCTACACTTGGGCAATGCAGAATT
CAAAGAAAGGTTAAATGATCTGCACATGGGGAAAACTGATGAAACAATCT
AAAGTACTAAAATAATATGAAGTCACTTGTGGACCTCTGCAAGTCATTTG
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TTATATTGATGAACTGTATAGCATATGCACATTACATGAATACTTCCATA
TTGTTTCTTTTAATGTTGTGGTTAATCTAGTCAGGACTTGCTTTGGGAGA
ATGTATCCGATAAAACTAGTAAACTGACGCACCGGTTGCCCCAAGCCAAT
TGTCTATACTGTACTAGAGATAGGTTCGTCTACACTTTTCCATCCGAATT
TTTCTAGACAAGTTTTCCCCTCATAGTAAGGAAATATTACTGCACTGCCA
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GAGCTCCTCCCGGAGCTGTCCCGAGCGGGCCTCCTGCAGCAATTCCCTAC
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CTCCCGGCCATATTAGCGGGCACCAGGGATGGAGAGGCTCGACAGGGACA
GAGACGCATGTCCGACGACGGATTGGAGGGCTGCGGCGGCCCCAAACCAC
CCCATTCCCAAGGCATATGCGGGAGGATCGGCGGCTGCGTCTATGGCGAC
AAGGGAGATGGCAGCGTCGTTCGATCTGGTCGTTGGTGGTGGGAAGGGAG
GCGGAGGCGGTGGCGTCGTTTGATCTGGCCGTGGAGAGGCCGACTCATGT
TGTGGAGTGCCGGATCCGAGCACCCTATCTCCGGATCTTGCCATGGAGGC
GACGACAGCCTCATCCTAGAAACTTCAAATTCCTTGGTCCTAGAAACATG
ACTTAGAGTATGTTCTTTGATTCGGGGCCACGAGAAGCAGCTGCAGGTGT
GCAGATCTGGCTAAGCGGGAAGGGCAGGTTATAGGTGGAGAGACAACGGC
TGGCTTCTGCTGATGAAAATCGTCGACTTGCTCATGTTGTTGTCAGGTTG
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TTGTATTTACCAAGGGTGCGATGGTTTTGGTGCACCAGATGATCACAATA
AGAAGCAGCTCAAGGAGTTGTTCCTGGAACCTTTCTTCGTGAGTACCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.