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GrainGenes Sequence Report: AE021925

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Sequence
AE021925
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021925
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCGTACTTGCTGCCGCACCTGCACTCCGGCTGGGCGGTGGACCAGGC
CATCCTCGCCGAGGAAGAGCGGCTTGTCATCATCCGCTTCGGCCACGACT
GGGACGAGACCTGCATGCAGGTATCGGAGATCTATCCCCTGAGGAACTGC
AATTTTCAGTAATGATTGTGTCTGCAGTTGGGCTTGGTGAATTTTTTGGA
GTCGATGGGGTGTCAGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGGATGTTGGAT
TTGTTGCAGGGGTCATGGATTCGCGAAATTGGGGAACCATTTGGTATAAT
GATGTAGCGGTAGATTAGGCTATGTTTAGGGATCATCGGGCAAGACCCCT
CTCATGTTGGGCCATGTCCCTCCACATGGAGGTGTGTTGGCAGCCCAACA
TTAGCCCTTGAAGTCCAACACGTTTCAACCGTTGATCGATGTTCGTATCC
AACGGCTGAGGTGCTCCTTGGGAGAGGAGTACAAAAGAAAAACCTAGCCA
CCCTTGGTGGCTGTGTCTCAATCAGAGAGCTGAGCAAGCAAACCATCGTG
GCTGCTGTGAGAGGGTGAGAGAACACACAAGAACACCACAACCTAGTGAG
AAGAGAGGAAGAAGGAGAGTTGATTTTTGTCCAGATTTCTAAGATCTGAC
CGGTCTGTCTTCAAGCTGGTGTTTGGAGGCTCAAAGGTGCTTGGATTAAC
TCCAAACTTGGTGAGATCGTTCCTTGCTTTGAGTACTTCGATCTGGTTAG
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CAGTTCAGACTGCTGTAGTTTCAGCACAGAGCAGTTTTGGTAGACGAACA
GTTTGGGCAGGCAAACTGTGTCTGATTGACCTGAAATTTGGTGTGTATGT
TGGGTACTCGTATATCAGCTTGTCTACCAAGTTTGGTGCTGATTGGATCT
GCGGTTTAAGAGCAGTTTGCTGATTACCCAAGGGGATAGAAACTGAGATA
CTCTGCTTTGCTGTAATCTTTCTCTCAAGTGGTTGTTGTTGTTGCCGGTT
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CCGTGGTTTTTTTCCTCCTCACCTTGAGGAGGTTTTTCCATGTAAATCCT
TGTGTCACGTGTGCATGTGCTCGTTGTTTTATTTCCGCTGCATATCTGTT
GATTGAAACTATCCTCGAAGGTTCACCGTAGGCTGGAGCGTGGGAGGTTG
TGTGTCTATCTCCTCCTCCCAACCCCGACAAAGTGGTATCCGAGCCGAGG
TTCAGTTTTGTATTCAGTTTTAGAGCAAGGTTTGTTTTGGGCTGATTGCA
TTTGCTTGTGGTGAAGGATGGAAGTGAATACCAACATAATGATTTCTTTG
AATGGTACAAATTATCAATCTTGGAAGTGCAAGATGAAGGACTTGTTATA
TGTGAAGGATTACTGGATGCCAGTTTTCTCCACTGAGATGCCCAGCGATA
TGAAAGAAGATCAATGTGAGGTACTTCATCTCCAAGCTTGTGAGTTCGTC
CGCCAATGGGTGGATGATAATGTTTTGAACCATATCATTGAGGAGACACA
TGCACGTACCTTATGGCAGAAATTGGAGGAGTTGTATGCCCGCAAAGAAG
GTACCAACAAGATGTTCTTGATCAAAAAATTGATGCGTTTGAGGTACAAG
GAGGGCACTCCAATTGCAGATCATGTAAATGAATTCCAGGGCATTATAAA
TCAGCTATCTTCAATGGGAATTACATTTGAAGATGAAGTCCGAGCCTTGC
TGGTACTTGGCTTATTACCGGACACTTGGGAGACCTTTAAGGTCACCGTG
TGCAATTCAGCACCTAACGGAGTTGTCACTTGGAACCTTGTGAAGACCAA
GGTACTAAATGAAGAGTCCAGAAAAATTGCTGATAAGGATGGTTCTTCCT
CAGATTCAGAAATGTTAGTGACCGAGTCATGGGGGAGAAGCAAGAGCAAA
GGTCCGAGTAAGGGAGGAGAAAGAAGTAGAAGCAAATCAAGAGGCAAAGA
CAAGTATGCTGGTGTTATATGCCATCACTGCCGTGAGAAGGGCCACATCA
AGTGGCATTGTGAACAATGGAAGAAAGACAAAAAGAAAAAGAAGAAAGTT
CAGAAACAGACCGACTGTGAAAGTGACAGTGAGGGAGGCCGGATTGCTGC
GGTAGAGGAGATCATGTTTCTCATGCATGAAGAACATGATGGCAACAGTG
TTTCCACCATTGAGGAGAGGATCACTGTAGTTTCTGATGATACCATCAGC
CTTGCAGATGGTGATGAGATGACTTGGATTCCAGACAGCGGTGCCACCAT
ACATGCTACATCTCGTAGAGAGCTCTTCACCAACTACACAGCGGGTGATT
TTGGTATTGTGAAGATGGGAAATAATGATAGAGCAAAAATCATTGGAAGA
GGAGATGTGCACTTGGAGACTGAAAATGGTACGACACTAGTTCTCAAGTC
GGTGAGGCATGTTGAGGCCCTTCGGCTCAACATTATCTCAGTTGGATTGC
TTGATAGAGATGGGTACTTGAGCAGATTTGGAAATACACAGTACAAGCTC
ACCAAAGGAAATCTGATTGTTGCTAAAGGTAACATGGTTTTAGTTTTGTA
TCATGTTCATGCTAAGCTTTCTGCTGCTTGTGTCAATGCGTTGCAGAAAG
AGGATGCGTGTGCCTTATGGCACAAGAGGCTTGGGCACATGAGTGAGAAG
GGGATGACGGTGCTAGTGAAGAAAAATCTGTTGAAAGGTGTGAAGGGTGT
TCACATCAAGAAATGTTCAGATTGTCTAGCGAGGAAGCAACACAGAGTTG
CGTTCAAGACTCAACCTCCTCACAAGAAGCCCGAGATGCTGGATTTGATA
CATTCCGATGTTTGCAAAATGTCGGTGAGGTCAATGGGTGGAGCAAAGTA
CTCTGTCACATTTATTGATGACTTTTCCAGGAAGGTTTGGGTCTATGTTT
TGAAGAACAAACATCAAGTACTAAGTTTGTTCAAGCAACTCCAAGTCTCA
GTTGAGAGAGAAACTGAGAAGAAGATCAAGTGCATTCACACTGATAATGG
GGGAGAGTATATTGGCCCATTTGATGCCTATTGCAAGGAGCAGGGAATTA
GGCACCAATTTACTCCTCCGAAGACACGACAGCTGAATGGTCTTGCTGAG
AGGATGAACATGAAATTTTTTGAGAGGGTTAGATGCTTGCTATCGAGTGC
AAAGCTACCTAAACATTATTGGGGTGAGGCTTTGTCGACTGCAGTTTATC
TTATTAATCTCTCACCAAGTTATCCATTGTAGGGAGATGGTCCAAACAGG
GTCTTTTATGACAAGGACGTCTCATATGAGCACCTCAAGGTTTTTGGGTG
CAAGGCCTTTGTTCATATCCCTCAAGATGAAAGGTCAAAGCTTGATTCAA
AGACACGACAATGTATATTTCTTGGCTATGGAGGTGATCAGTTCGGCTAT
AAGATGTATGATCCAATAGCAAGAAAGGTTGTGAGAAGCCGTGATATTGT
GTTTGTTGAAGACCAAACAATTGAGGATATTGTGAAGACAAAGGTGTAGG
CTTCGGTGCAAGTTTCGGTGCATGTTCCTCCTCGAAATCAGTAGCAAGAC
AGAATTTATTCTGACCCAGTTCCTGCAGATTCAGCTGAAGAAGAAGCTGA
AGATGATGATGTAGAAGATGTGCAAGGTGATGCACATAGTGGTACAGGTG
AGGATGCTTCCCAGCAGCAAGAGTATGATGCTGAAGAAGATGATCATGAT
CAGCAAGCACCTGAACCAGATAGTCCACCAGCTGCTCCACTCAGACGGTC
TAGCAGAGACCGTGTTCCTTCCACCAGGTATGATTCAGACCAATATGTGG
TGTTATTTTCTGATGGTTCAGAACCTGAGTGCTTTCAAGATGCGATGAAA
GATGAGAACAAGAAGGAGTGGAATAAGGCTATGCAAGAAGAGATGGATTC
CTTGCATAAGAATCATACTTATGAGCTGGTGAAGTTGCCCAAGGGCAAGA
AAGTTCTAAAGAACAAGTGGGTCTACAGAATCAAGCAAGAAGAGCACACA
TCACATCCAAGGTACAAGGCCAGGCTAGTTGTAAAAGGATTCGCCAGAGA
AAAGGTATTGATTTTGATGAAATATTTTCTCCGGTGGTGAAGATGACGTC
AATCCGAATGATCGTTGGCATGGCAGCAAGTCTCAACTTGGAGGTTGAGC
AAATGGATGTGAAGACAGCTTTCCTTCATGGAGAGTTGGAGGAAGAAATC
TACATGGAGCAGCCTGAGGGGTTTCTTGTTAAAGGCAAAGAAGACTATGT
GTGCAAATTGAAGAAAAGTCTCTATGGCATGAAACAAGCACCAAGACAAT
GGTACATGAAGTTTGAATCTGTCATGGGGGAGCAAGGCTACAAGAGGTGT
AGCTCAGACCATTGTGTATTCATCCAGAGATTCTCAGGTGATGATCTTAT
CATGTTATTGCTCTATGTGGATGATATCTTTATTGTTGGCAAGAATGTCT
CAAGAATTGCTAGGCTAAAGAAAAGAGTTGAGAAAAAGTTTTGCCATGAA
AGACTTGGGTCCAGCAAAGTGTATTCTCGGCATGAGAATTGAGAGAGACA
GAAAATCCAATAAGTTGTACTTGTCTCAAGAGAAATATATTGAGAAGGTA
CTTCGCAAGTTCAAAATGGACAAGGCAAAGGAAGTGAGATGTCCACTTGC
AGCTCATTTCAAGTTGAGTAAAAAGCAATGTCCCTCCACTGATGACATGG
AAAAGGAAATGCAAAAGGTTCCTTATGCTTCAGCTGTTGGGAGTTTGATG
TATGCTATGGTGTGCACACGGCCTGACATTGCTCAAGCGGTTAGTACTGT
GAGCAGATTTATGTCCAATCCAGGAAAACCACATTGGGAAGCCGTGAAGT
GGATTTTGAGGTATCTCCGGGGCAGCACTAATATGAAGCTTTGCTTTGGT
GGTAGTGAGCCCAAGCTGATTGCATATTCAGATTCAGACTTGGCTGGAGA
TGTCGATGGAAGGAAGTCTACTTCATGTTATTTGATTACCCATTCAAGGG
GAGCAGTGGCATGGCAAAGCAGGTTGCAAAAGTGTGTGGCGCTAAACACA
ACTGAGGCCGAGTTCATCGCAGTGACTGAGGCGAGCAAAGAGCTATTGTG
GCTAAAACGATTGGCTTGTGAGCTTGGTTTTGAGCAAGACAAGTATGTGT
TGTTTTGTGACAACCAAAGTGCCATTCACCTGAGTAAAAATGCAAGTTTT
CATTCGAGGTCAAAGCATATTGATGTGCGCTATAGTGGATTCGAGATGTG
CTGAATTCCAAGCAAATGCAAATTGAGAAGGTGCACACAGATGACAATGG
GGCTGATATGTTGACCTAGGTGGTGACAAAAGGAAAGCTCGAGGTATGCC
GTCGGCTCGCTGGCATGACTGCCGGTTGGCAGTGAGACCCTCCATGATGT
CGGGAGGGGGAGTTTGTTGGGCCATGTCCCTCCACATGGAGGTGTGTTGG
CAGCCCAACATCAGCCCGTGAAGTCCAACACGTTTCAACCGTTGATCGAT
GTTCGTATCCAACGGCTGAGGTGCTCCTTGGGAGAGGAGTACAAAAGAAA
AACCTAGCCACCCTTGGTGGCTGTGTCTCAATCAGAGAGATGAGCAAGAA
AGCCATCGTGGCTGCTGTGAGAGGGTGAGAGAATACACAAGAACACCACA
ACCTAGTGAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAGGTGATTTTTGTCCAGATTTCT
AAGATCTGATCGGTCTGTCTTCAAGCTGGTGTTTGGAGGCTCAAAGGTGT
TTGGATTAACTCCAAACTTGGTGAGCTCGTTCCTTGCTTTGAGTACTTCG
ATCTGGTTAGCTGGTTTGAGGTCTGTGTTAATATAGCTTCAGATTTGGAA
GCGGTTTATTCAGTTCGGACAGCTGCAGTTTCAGCACAGAGCAGTTTTGG
TAGACGAACAGTTTAGGCAGGCAAACGGTGTCCGATTGACCTAAAATTTG
GTGTGTATGTTGGGTACTCGTATATCAACTTGTCTACCAAGTTTGGTGCT
GATTGGATCTGCGGTTTAAGAGCAGTTTGCTAATTACCGAAGGGGACATA
AACTGAGATACTCTGCTTTGCTGTAATCTTTCTCTCAACTGGTTGTTGTT
GTTGTTGCCGGTTGGCAACGTGCTGAGTGTGTTGTACGTCTCTAGATGTT
TTAGAGAAAGACTCTGTACCCAGGTTGCTCATAGTGAAGCTCGCGTGGAC
CAGTTGGTCTGCACCCGTGGTTTTTTTTCTCCTCACCTTGAGAAGGTTTT
TCCACGTAAATCCTTGTGTCACCTGTACATGTGCTCGTTGTTTTATTTCC
GCTACATATCTGTTGATTGAAACTATCCTCAAAGGTTCACCACAGGCTGG
AGCGTGGGAGGTTGTGTGTCTATCTCCTCCTCCCAACCCCAACATCTCAC
TGTCACTGATACTGGTAACTGTGTCAATTCTACCGATTAGCTAGTATAAG
GATTCGATTAGGAACTTAGGATTAATTATAAATGTCCTAGTAGTAGAATA
TAGCTGAGCTGATGTTAGGTTTCACTTGGTGCAACCCTGCTCTGTAGCAG
ATTAGTAGATACGGTCAATATATATTCTTGCCATTAGACACTACTGCACT
GCTCTCGTTACTGTCGACATATTTTACTGAATGTGCATTCAATATTTCCT
TTGTCATATCATCAAGAGGATAGTCTTAGTTTATAGTTAGAGCAGACGTG
GATGGAATTTAGGGTGCTCCTTTTTCTTGAATTAATTCTTTTAATTGATA
TTGAGAGCTACTACAACAGCTTGATAAAATTGAATGACCATTATGTCCTG
TCCTGCATCTTACAACACAACTCTGAGGAAGTTGAGCAGTGTCCGTTCCT
TCTTTTTGATCCATGAGCCACTCATCTTTATGTTTTGCGCAAAAACACGT
TTGTTTTTTGGAAATGGATGCTTTATTATTTAATAATAATTGTTTACACG
CGGCTTCTGCATAACTAGGATGCACGCAGCCGATCAACCGCACAAAAAGT
GATAAAAAGTACCGTTATTACAAAATATGCTATGAAGATAAAGAAAGCCT
CGAACTATGGCAGCTATATCCGCAGATCACGCTGTCATTCATGTCGGGAG
AAAATATCTCTCGTTGTGTCCTACAATCGCGTACACCCCTCCACAAACAA
GTCGTGAAACTCCATACGTTGTAGAGTAGTCCAGGATCGAAGGATAGTCA
TGGCTCGATAGATAACCTGCATAGAAGACATAATGTTATGAAAAATATTG
TCATTTCTACATAGCCAAAGTGACCAAATAATGGCAAGCGCTCCCATCCT
AAACAAAGTCCCGTATTTATCTAGTATCACATGCAATCGGTTACCAAATA
CACTGGCAACCGAGCGTGGATGAGATAAACTAGAGGCAATTTGGATGATT
GACCATATAGCACGAGCAAATTTACACAGAAAGGATAAATGTCGAATTGT
CTCATTATGATGATATTATGATGCCAGAAAACGCATTGTGTACTTCCATG
CCAATTCCTCTTAACAAGATTATCTTTTGTAAGAATTACCCTTTTACGGA
GATACCATGTGAATAACTTTGTTCTAAGAGGTATTTTTATCGTCTAAATT
TTATTATTATCATCGACTGGGATATCAGGTTGGATCAGAGCTCTATGCAT
AGAGTCAAAAGAAAATTTACCACTCTCAAGTAATTTCCATTTGAACTCAT
CCATACTATCCGACAGTTGTATATTGGACGATCATGATAAGAGATTATTC
CAAGATATCAGTCTTGGACCTATGAGACTTCTTCTGAAAGACACATTAAG
AGGATTAGTTTCCATTACTATGAAAAGTGTATACCCTTTGTGTCTAACAA
TCGAATATAGAGCTGGATATTGTTCATGAAGAGAATTTTGGCCAAGCCAT
TTATCTTCCCAGAACCTAATCTAATCCGCGATCCGTCCTTAATATCGAAA
ACACCAAAACAGAAGAAATGTTTTTTGGATGCTATTAGTCCAGCCCAAAA
ATGTGAATCACCGGGTTTCCAAACCACTTGAGACACAGCTTTGGAACTAA
CATACTTCGTCCATAGAATGGTTTGCCAGACACCATCTTCAGTAAGTAGT
TTGAAAATCCATTTACCCAGAAGCGCGGTGTTTTTGACTTGCATATCATG
TATGCCCAGTCCACCATATTCTTTGGGTCGTCAAACCACATTCCATCTGG
CCAGTCGATATTTCTTCTTTTCATTATCCCTTTGCTGAAAGAATCTTGAT
CGGAAATAATCCACTTTCTTTAGGACACCTTTTGGTAGCTAGAAGAACGA
GATCATATACAGTACTATGTTGGTGAGTACTGAATTTATGAGTACAAGTC
TTCCGCCAAGGGATAGTAATTTACCTTTCCAACTATTAAGACGTTTTTGG
AGTCTTTGCTCAACGAGTTTCTATTCAGCAATCGTGAGACGCCGATAATG
GATCGGTATTCCCAAATAATTGATTGGAAATTGTCGCTGACCACATCCGA
ATAACTCAGCATATAGGTGGCCCTCGTTTTGAGCCTCGCCAAAACAATAA
AAATCACTCTTATGAAAAATAATTTTCAATCCAGATAGTTGCTCAGAAGC
TGATAATATTAATTTCAGATTCTTAGATTTCTCCAGATCGTGTTTCATAC
ATAAGATTGTATCATTGGCATATTGAAGGATGGAGAGACCACCATTAACC
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AAGGATAGCCAACATATCAGCCACTATGTGTTAAGTAGTATAAGCGATAA
TGGATCCCCTTGTCTCAGCCTTTTTTTGGTCTGGAAGTATTTCTCAGTGT
CGTCGTTGACATTAATGGCAACACTACCACCAGACACAAAGGACTGTATG
TGTACACCACTCCTCTGAAAAACCTTTCATTCGGAGTGTTTGCTGAAGAA
AAGACCAATTAACTTTATCGTATGTCTTCTCAAAGTCAATCTTAAACAAT
ACCATCTTGAGTTCATTCTGAGTGCCTACTTGTTTGTGTGCAGATGGATG
AGGTGCTTGCAGGGGTGGCTGAAACCGTAAAGAACTTTGCGGTGATCTAC
CTTGTTGACATCACCGAGGTTCCTGACTTCAACACCATGTACGAGTTGTA
CGACCCGTCGACGGTGATGTTCTTCTTCCAGAACAAGCACATCATGATCG
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CAAGAGTTCGTTGACATCGTGGAGACCGTGTACAGGGGAGCTCGGAAGGG
CCGTGGTCTGGTGATTGCTCCAAAGGATTATTCCACCAAGTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.