Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE004468

[Submit comment/correction]

Sequence
AE004468
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004468
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGAACCCAGTCGTGTCAGTCCAACTCCTTCCCGCTCCCCTCGTTCCGT
CCCTCCAGTCCCAGATCCACCTGACCACCTCCCCTCGACTGCCGGTGCAC
GCCGCGCAATGGCCGGCCGCCCCCGCCCGCAGTCGCACTCTCCGTCCGCC
TCCACGCGGCGGCGCGAACGGTGGCTGGTCATCCTCGGCATCGTGCTCCA
CGCCGTGTACATGCTGAGCATATTCGACATCTACTTCAAGTCCCCCATCG
TCCACGGCATGCCCCCCGTGCCGCCCCGCCTCTCCGCGCCTCCCGCCAAG
CGCCTCGTCCTCCTTGTAGGTTCGTCGCCTCACTCCGCTCCTGTGATCTG
GCTGCTCAAGGTTTCTCTCGATTTGGGGCTTTGGGGGTGTTCGACCGTGT
TGTGAGGGTTTTGAAACGTTGGTGCGTGCAGCGGACGGGCTCAGGGCAGA
CAAGTTCTTCGAGCCAGACGAGCGGGGGAGGTACAGGGCGCCGTTCCTGC
GCGGAGTGATCGAGGAGAAGGGCCGGTGGGGCGTCAGCCACGCGCGGCCG
CCCACCGAATCCAGGCCCGGGCACGTCGCCATCATCGCCGGCTTCTACGA
GGATCCCAGTGCTGTCACAAAAGGTGCGCTGTTTCAGCTCTAGCTCCACT
GTAACTGGCTAGTAGTATTCTACTATTCTTCATGTTCGTAGAGCTACGTT
GTTGGTTGTTAGTGCCTACCGCCAAGCTGAACTCCTGCCATTAGTTACGG
TTACTGGCTTTTACTGCTAATCCCATAACACAATTAATGCCTGCATTATA
ACGATTCAAGATTGAAGGGGATGCAAATACTCTGTATGTTGCTAATCTTG
ATCATTATCATAGTTTTTAGGCGTTCTCTGAGCATTTTGATTAGAATTCA
CTGTCTTACTTAAATGTGATGTTAGTGTTCAATGGTGGGTGTTTGCTGGT
GGGAACAATGACAGATTATGTATAGTTGCTGTACCTTGGATTGGACAAGA
CTGATATGGACATGTGTTTACAGCTAGTCACTCAACTTATTGAAATATTT
TAGTATACTGGATTTGGTTTCTATATTGCTTAATTTGACATGGGCTTCCT
TGCTAGTTATCAGAATCTTGAGTGATATGTGCATCAGGGTGGTATTGTTT
TCTATTACTTCTGGACTAGTGTGGTGGTACTTGTTCCCGCAATCCACTGA
CATACTGGCCACTATCTATGTACTAGACCATGTGCCAGTGACCATGGTCC
ATGTGAATATGATTGAAAGGCATGAGAGTATGATTAAAAGTGTAGGATTT
ACAACATGCACTTGATTATAATGAACAAACATCAAGTTATTGTGCTATCT
CCGGATCCCCTATGATAGCTTGTTTTGTGTTGATGGAGGGGTATTAAGGC
ACTTTAGCGATACATGTAGGAAGTGATGGCCTGTTAAAATTGCATACAAA
TGCTCCCACGATGTTCACACATTTTACTTATTGGGCAGTGCAGGATGGAA
GGCCAATCCAGTAGAGTTTGATTCTGTCTTCAATCAAAGTCGACACACTA
TCTCGTATGGGAGTCCAGATATTGTTCCTATATTCTGCAGCAGCATACCT
CACAGTACCTGGGGTAGTTATCCCCATGAATATGAAGACTTTGCAACAGG
TCAGACTCTGCCACCTGTATTTTATTGTATTCTGATCTTTATGTTAATCA
GAGAATCATTGTGTTTGTGTGCCTTCATCAACATGTATGGTCGTATGGAC
ACCACTGTAGAATGCATGCCCATTGTATTGAATATCCCTGTACTCTAAAA
GTTCATGTTACGGTCTTTCAATTGATAATTTAGATGTGAAATAGGGTTCT
AGAGCTGCTCTCTGAGTTTGGTCCGTAATTGTGTATGAGAGATATGAAAT
CACAACTATTATCATTGAACTAATAACCTTCTGTGAGCCAGGTTAAAAAG
TTAATTCTATAAATAGCAATGTTACTTGTATGAATAACAGAGGGATTTTA
CCCACTGTAAAATCTAAATATCGCATAATTTAAGGCATCAATCCTCTACT
TTTCTGGTTTTGCTTTGTCTATGGAATCATGTATTTACTTGGTTAGGGAC
CTTGATTGCAGATGCATCATTTTTGGATCATTGGTCATTTGACCAGTTTG
AAGGTCTTCTGAACAGGTCTCTTCATGATGTTAAATTGAGGCAGTTACTT
CTACAGGATAAGTTGGTTATATTTCTACACTTGCTGGGTTGCGATTCTAA
TGGTCATGCACATCGGCCCTATTCAAGCATCTATCTGAATAATGTGAAAG
TTGTTGATGAAATAGCTGAGAAAATGTACAATCTCATGGAAAACTACTTC
AACGACAACCAAACAGCTTATGTTTTTACAGCAGACCATGGAATGAGTGA
CAAAGGTACAGTAAAGTATTATACGCACAATGATGTTTCCAAACAACTTC
CATTATTTTTCCATTTGATTTTTAGAGCTAGAGATTTCTATAAAGTTCTA
GACCTAAAGGTTTGAAAGCCTAGGGCATGGCATCGTGGTCCTTCATACTG
GTAGTGCACTTATTTTTGGTCTAACATTGCGTGACATTGCCTTGGGGTGC
ACTTGCATCAAGGACTTCTTACTGTCTCACTGACCTGTTGGTAATAGCAG
AGGCTTATGTTCTTGGTTCACTTATTATTTTGTAGAGTACGGTTGGTTTT
TGTACAGCATATCATTCATTTTTATGATGCCATTTTTTATTAATCCATAT
AATTATGCATTTCCACTTATAGGAAGCCATGGAGATGGGCACCCTTCAAA
TACCGATACCCCTCTTGTAGCATGGGGGGCTGGAATTAGGAGTCCGAAGT
TCTTAGCCTATACAAACAAACCTGATGATGGTTTTCGGTTTGTTGATGAC
CACAGACATGATATGCCCACACCACAGAATTGGGCTCTTGAAGGCTTCGA
AAGAGTGGATGTCAACCAGGCTGACATAGCCCCTCTGATGGTTGTTTTCA
AATTTAATAGGAAATCTTATTTTACTTTCTTCCTCGGCATCATCTGCATT
TTGTTAACTGTGTTTTCTCCGTTTTTCCTAAATTTTGCAGGCCACACTTG
TGGGTTTACCATGCCCTATGAATTCTGTGGGAAACTTACCTTCCCATTAT
CTGAAATTAAGCAAGGTTAGGAAATAAACATCATAATACTATCCAAAGAT
CTTTTGTTCTTGCAGCATTGGCTTGCACACTTTTTTTGTTGAATTTACAT
CCCAATTATTTATGTGTCATTATACAGGCTGATGAAGTTGAAGCAGTTCT
GGCAAACACAAAGCAAATTCTTAACCAGTTTCTCCGAAAGTCAGGTACCC
ATTTAGAACAAGACCTGAAACATATTTGGATTAGAAATTTTAATTATTCC
ACTCTTCTAAGCTTCTAGGCTGTTGCATTTTGATTGTACATATGACTTGA
CCGTGTTAATGAGAGACTATTCATTATTTATCCGCAATATGTTTTACAGT
AGATCACCGGAAACTGCTAACTATGAATCCCATCTTGTCAATCAACTTCC
TCCTTTCTATCTTATGCAAATATACCACCTCCAAGCTGATTAAATTAGAT
AATATTCTTACTCCATGCATGTGTTCCCTTAACAATCTCAGAGCAGAAGC
AATCCAGTTCACTCTACTTCAAGCCTTTTAAACCACTGGTAAACTATTTG
GCTGTCCTCAACCAAATTGAAGATCTAATATCTGCAAGGGACTATGAAAC
CGCCATGAAGAATTCCGAAGAGCTCCGAAGTATGGCTCTTTCTGGTCTCC
ATTATTTTCAAACATATGACTGGTTCATGTTAATGACAACAATTACCCTG
GGATATATTGGATGGATGGCAAACCTCATGCTGCACGTGCTACAGTCTTA
TACAACATTTCCTGCTGATCTTCTGAAGAGGACTCAAGTTTATCCCAAGA
ATACCTCCATGAAAGTAAGATTGGCTGTCAAGTCTTTCTTTCGAATTTAT
GTCTATATCATACCTCTATTGCTTTTTTTTTCTAGCTTTGCTCAATTTGG
ACTGCCGTTAATACTTTTTTCTATACTCAATTATGTGTTTTTGTTTCTGT
TCCTCACAGATACTCCTATTTTCTCTCATGAAATCTAGCATAGCTGTAAA
ATTACGTAACATTAGATAGAATTTTGTTCAGAATATAGTAATATATGTAC
TTGGAGTCATTCTTGGGAATCGTAAAATTTACTATTCCCTCCATCCCAAA
TTAATTGACGCAGATTTGTCTAGATACGCATATCTAGACACGTTTTAGTG
TGTAGATACATGCGAATCTAGACATCTGCGTCAATTAATCTGGGACGGAC
GGATGTGTTTGGTGACAGGCAGCTGATGTGTTTGTTTTAACTATTTTGAT
CTTATCTCTTTTACTTACTATCACGGCAAAGCCTTTTCTATTAGGTGACA
GCTGATGTGTTTGTTTTACACTATTTTGATCTTATCTTTTCTGGTTGCAG
GTATACATAGGTGGATGCGTGTTTATGGGTTTATCATCCATTGTACTACT
TCTAGAGAAATCTCCACTTCTTTACCATGCTTATGTATTCATGACAATAT
TCCTCTGGACCAGAATTGTACATAACCTGGGATTCATGAAGTCAGCATGG
AGAGAGTTATCTAATTTGCCATTCAAGTATATTATGAATCTCCTGATCAG
TTCGGTTGCTGCATTGTTCATACTTGAGTTTCTGGTGTGTACACAACCTG
TTCTTGACACCCCAAAGAAAGACTGAGATTTGACATGGGATTTGATAGTT
GATACTTCTGTGCAGGTTATGAGCTTCTTTGATCGGAAGCTTTATACCTG
GTGCTTTTTGGCCCTTGGGATACTTGCTTCAGTTTATGGAGCCTTGTTCG
TTCAAGCTACCCCTGCAGTTGCAATATACACATGGCTCACATGCTGGTTC
CTATCTATATTCACATTGATGCCAGCTGAAATTCCAGAAAACAACAACTT
AGTGTATGCTACTTTGCTGACAGGATTAATGCATGCGTTTCTTTTATTTT
GTTAAAATTGGCTGAGACCAAAGATATAGAAGTTACATGTACATAATATA
CCATCGATGTTCTCTGATATTCATGACTTCGGGAGTTAACGCAGTTGGGA
CACGTTTAAATGTCACCATATTTTAGCTACCCTCTTTTTTGTTTACTCAC
CCTTTTTTTGTTTGATGAATCCTACTTATGCAGAATTTTTAGTGGGGCGC
TGATAGTACTGATTGCGATGGCTTCGAGATGGACAACCACCAATACTAGC
AGCTTTTGGCTGTATCTTAATCTAGCAAACAAACGGGCCCCTAAATTCTC
CAAGTTATTTTTTGCTCAGGTGCAGACCACAAACGCCAATTTTTGTATTG
ATATTTATCTTGTTAGAGTTAAATTTGAGACAGTGTTGACAACTGCCACT
GTGCACTAGGTTATTTTGATCGCAATGTCTTCAATAATGGTGTGGTTAAC
TACATCTCATCGGTCTCTGCACAAAGAACTGCACCCATTGCACCAATTGA
TCAACTGGTGCATAGCTGGTAAGTCATAATCATTGACCCAATAATCTTGC
AATTTGAGCTGTTAATTTCTCCAGGGTCTCAAATTTCCTGCTTTACTTTT
TTTTCATGACTATGTGTGTTCTGTTGTTACATCTTGTTTTATACAGCAGC
AACTTACTGGTCTGTACTCTGAACCTCGCAAAACTAGTACAGTAGTTTTT
TTTTTGACACCAAGAACTGCCAGAATGGCTGTTAGTAGCCCACCTTTCTT
TTTTTAGTATATCAGTTTTCTACACACATGATCACATGTGCCTCACTACA
TGTGTCATGTACTAGGGTGCATAACAGATAAATACTGCCGGGAAGCCGGG
ACAGCTCAGCTGTTAGTGATGGGAGTGGTTAAAAACTGGGATGATGATTG
TTGTTCAATTAATTCCTGAAAGAGTCTCTTACATACAGAGGTCTAACAAA
CTGACTAAGGATGGAGGGATTCCCCTGAACATAAACTACTCCTATAAGAT
ATCGACTATTGATTATAATCCTTATTTGGGACAATAATAGGAATTGATGT
TATTCACTTTGGTATATCAATTTTGACCTCCGCATCCTGGTATCAAGTTT
GGTCAGAGTGTTGATGCCTTGATGACTATTAACCTTGCACGAAGTTCTCT
GACATTGTTGTAATAGGAATACGAAATATCTCGTCGCTTGCTACGCCCTT
CAGTCAATTCCTTTGAGTTATGGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCTTGA
TAGTCCATCGGTTAGGCTGATTGTATCACAGAAATATTAATAACCACATA
TATCTATCAGTGTTTATTTTTACGGGAAACAGTATATGAGGACTGCACCG
GAATATTTTAAGAAAAAATGGACATACAAAAGTAGGAAATACAAATTATC
TGAGACACTGGGAAATAGTTCAGTCTGGGCAAGGAAACTAACTTTATTTT
TATTTTACCACATGGATCAACAAAGCTTCCATATAAATCTAGTAGTCTAA
ACTCCATTAAGTATGCAACATTTGTGTGTCGATACTATATGTGCCATCTT
TTGATTAATGTTATCCTTGTTTTCTCTTGTTAAATTTCTAAGAATTTTGG
GTGTTGGTTTTAACCTATCATGTTTTGCAGGTTTTTCAATGGTGCTACCG
CTTTTTTCACCTTGTAGCGTTCTGTCCCGTCTTACATCTATCTTCTTGGG
TTTTGCTCCTCCGTTTCTACTGCTCTCTATTGGGTACACAGTTAACTTAT
GCTTAAGTGTTCATAGATCAACTATTTTGTTGATGTACTGCATCCATGGG
ATACCATGTACATGAATATGATGTTTGAAATTTCAACCTTTGCAGCTATG
AAGCGGTTTTCTATAGTGCTTTTGCAATGGTACTGATCGGATGGATATTT
CTCGAGTCTGCTAACCTGTATTGCTCGGAAGGAAGTGATTCTACATGTTA
CAGTAGCCTTGCAGATGGCTCAGTTTTTGGATATGACGAAAGATGCTTAC
AGCTATCTGATTTTCGAATCCCTCTGTTGTTTGTAAGTTTATGACCCTTT
TCCATTTAATCTTGTGGGTTTGAGCGCGCCTTCCAAGTAATATGATCTCA
ACTCCATAGCTGTGGTGCATAATAACACCGAGAAAGCCATTTCAGCATGA
TACAAGGTCCCTGATATACCGGGCATAGTTGCATATGTCGTCCTCGCTAA
GATTAAGATGTATTAGATCCAGCCAAAGATGCTAAATGCTTTTGAGTAGG
GACCAGTGGAGCCTATGTGAAATCAATCGCCATGCCAGATGAAGTAGGTT
GCAGGAAAGTCTCAGTACTATTGGGGTAGGATAAGGGAATTGATAGTAGC
ATAGGCTAAAAATTTTAGGGTACTGGTGTCAACTGAGTGGGATTGGAGGG
TTTAATTGAACTGAAATCAGTGCAAGTTCCTTTAGGTTCCTAGTTGCCTT
ACATAGGTTCAGGTTCTTGTCAGTTGTCACATACTTGCCTCCACAAGCTT
GTTCAGGTGCAGCGTGATACCCACTGGCTGTGTGAAGGCCTTCCTTTATT
GACACAGTATTATTTCAGGCCATTCAACACCCTAATCTCTTTTTCTACCT
TGCTGGCTCGAAAGTTCAAAGGCCCTGAATTACTGGTCCTTGTGTACTTT
TTACAATTCAAGATATAAAACTTAGTCTCCTGGTATTTAGTTCCTGTATT
GCATCCAAGCAACCTCTAGCTGAATAAAGGATAGTTCGTTTTGCATTTTA
AATGAGCAGCATACTGTTAGAGTAAAAGAATTTGTCTAACTCCTTGGCAG
AAAGATATCATGTTATCTTCATTATTGCGTTCATATACTCCCTCCGACCC
AAATTAATTGACTTGGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGACATGTTT
TAGTGTTAGATACATCCGAATGTAGGCAAATCCAAGTCAATTAATTTGGG
TTGGAGGGAGTACTACTTTGTATTTTTTAAGTATTCCATGATTTTTCAAT
GGTACTGTGAAACTATTTTACCATGATTTTAATCAGAAGACCATTTTCGT
GAGCACTGTACCTTTTTTCCTTGCAGATGATCTTATTCAATGTTGCCTTC
TTTGGAACTGGTAACTTTGCAAGTATTGCAAGCTTTGAGATCTCATCTGT
GTATCGATTCATCACAATATTTAGCGTAAGTGGTTGAGCTGTGCTAATGT
TTTGTAAGGTCATTTTTTTTTTAAATTCCAGTTATTGACAATTCCTCCTT
TTTTCTTGGCAGCCATTTCTTATGGCGGCACTTCTTATTTTCAAATTGTT
CATTCCATATATGCTTGTCATGTAAGTTTTCTCTGCCTTTTTTACTATTG
CATTTACCATATGGTGATGGCTAATAAATTAAGTTAATGTTGATGTGCTG
GAGTATCTCCATTTGTGACCTGGAGGTCCTGGGTTTGAATTAGCTTCTTT
GCATAATAAAAAGCAAGGGAAATGCTGTCTAGAAATACCCTTCCCCATAC
CCCACAATGTGTGGGAGCTTTCAGCACTGGGTACCCTCTTTAGAAGGGTG
GGCCTGACGCAATGGTAGACCATCTCCAATTGTGTCCTGGAGGTCCTGGG
TTCGAATCAGCCTCCTTGCATAATAAAAAACAAGGGAAAGGCTGCCTAGA
AATACCCTTCCCCAGACCTCACAATGTGTGGGAGCTTTCAGCACCGGGTA
GGCCCCTTTTTTTTTTGATGTGCTGGACAAAGTTTGGCAGTCCAATTACT
TTGTGCTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGGGA
GTGTATCTAGACCCCTTTTAGTATGTGGGTTCATTTAGATTTGGAGTGAA
CCTACACACTAAAAGTGGTCTAAATACGCTCCTTTCACAAAGCTAAAACA
TCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGCTGTGTACACACTGTACAAAATA
TGATTTCAGTGAAGGTTCCTGTTACAAAGTAAGTTATGCCGTGTGATTCA
AAGATGACACAAATCTGTATCACCTTATTTTCAGAGACAAGTTTTGGAAG
AATGAATTGTAGTGCTTGAAGATAATTGATGCATCATGCATGAAAATGAG
TATATATATATGTATTAGTCTTTAATCCGTAATTTCTGAAACGCCAGTTA
CCTTTTTGCATCTGACATGACAATAGACTCTAGAGCTTCATCATTTATAT
ATAGACGAGGTTAGATTTGTAATCTTCAAATTGGTTCTTACTTTTCTTTT
TTTGAAGGTAAATTGTTTTTTTACTTGGGTCGGTTTGGGAATAATTCTGG
TCTGGTTCATCTTTAACCTCTTTAGTTTGTCATGAGCATATTTGAAAGAA
AAAAACACAATTATGGGACATCTTCCATGGAAACTTTTGATTTGCGAAGT
GCCTGTTTAGTCTCTACTGTCTAGCATAATAGAGTTGATAGTCTTCATAT
GATGGGGCGTTGGGCCTTCCATATGGCACCTAGATAAATTTTCAGTCCTT
TTTATTCATGTTCAACTGGATGCTATCTGTGGTTAAGCTTATACAGTATG
TTGTAACTTACTGCAGATGTACATTTAGTGCCATAACCAAGATTGTACGA
ATTCCACGGATCGGTTGTTATTTTCTTGTAATACTGCTTTCAGATGTCAT
GACAATTCATTTCTTTTTCCTGGTACGTTTGTTCTGCCCATATGTACTTG
AAATATTCTTTCAACATTTCTAGCTATTTGCTTCCTTTTACATTTAAATG
TCTTTTTGATTTGTCATGTTTCAACTCTGCAAGATAATTTTACGGCATCG
ATAGTGTTGTATAAAGCAAGCTTGTAAGTTGTCGTAAGTACAAGTAATGG
TCTTGTAGTTGTAACTCTTGTTATGAGATTAAAGTTGCAGAGCTGAAATT
CTTAAATTCGAAATGCACCTGAGGCCAAAATTCCTTTCAAAAGAAGTGTG
CCTGAACCTAGAACCTAGATGTTCTTTGTTTAACTGCCAGTGACATGCTC
AGCACACTGATTACTATGTTTAGGGCACGTTTGCCATGCAGGAATGTCAC
ATGAATACACAATGCACGGTTCAGTTCCCACATGAGTTGGAGCTTTGTTC
AGTTCCCACATGAGTTGGAGCTTTTTCCTGTGTTTCAAACATAGACTAGG
CTTTTGTTTACTTGATTATTATCTCTGTTCAAAGTGCAGTTCCTACTTCT
GCAGTAAATATTATGCTGAATATTCTTTTTTTTTGCGAGTCATATTCTTG
TTTATTTTGATTACAGGTCCAAAACACGGGGAGTTGGATGGAGATTGGCA
ACAGCATTAGCCATTTTGGAATCGTCAGCGCGCAAGTGGTCTTCGTATTG
CTCCTTTTTGCACTCACAAATATATACACAAAAGATATCGAGGTCTCATC
TCGGCAGCTAACCTCACGGAAAGTTATGTAAATTAGTGTGACCGTTTCAT
TTTGTATTTGTACAATTTTTTTTTTGTAGAACTAACTTTTGGGCTTTGCT
TTTTATACGTTGCCCAAGTTTTGGAACTCACCCCCTGTAGTTGTTGGATT
TATTAATTTGATTGCCCTCCTCTTTTCTTAGAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.