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GrainGenes Sequence Report: AE002149

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Sequence
AE002149
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE002149
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCAGCCGTGCTAGATATATAGATTCATCTCCTCGTTGGCAGCACAAAACA
TCTTCCAGGTGAGATCAATCCACGCACTCGAATATGTCGGTTCATACGAT
TTTCTATTCTTATTCGTTTAGTTTTCTGCAAGTATGTGTGGCTTTTTTTC
GTCTGTAAGCTGGCTAGCTAAATCATATTGGATTGATCCGATTGATATCG
CCCCTTCAGCACGGCTCTTGTCGGGGATCGGAATTAATGGCGTCTCGCCG
AGAACTATTTCTTGAGAAAGAAAGTTACAATGATGTATGGCCTATGAATG
GTCTTGCTGTGCTCATGGGCTACCTTTCCATGGCCATCAAGGGTTTGGGT
TTTCTGGTGCTCACTTGGACAACCGTCGTGCTTCTAGGTGGCTTTGTCTC
TATGCTGCATAAGAAGGATTTTTGGTCTTTGACATTCATCACCCTTGTAC
AGATGGCTGGGTTAGTACCTCTTCCTACATCAAATTCATACTAGTTGAAT
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TCCCATGCGGTAATATTTGTAACACTAATCTAGGGTCAACAATCAACTCC
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TAAGACCCTTCGACCATAAGGTATTGCTTCTACATCTTCCTCTTTGCAGA
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ACAATAAGAATCGTAGCATTTCAAAACACCGAATTAGCAATGAAAATATG
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GGACCTCGCTCGTGTGTTCACATGAAAACACAGAAAAGTTTGTAGTATTT
TGAAAACACATATGCTATGTCAAACAAATCGCAATTGTTTTGCCTCGTAC
TCACACGGACTTCACTAGAGAGGGCTCTCTGTTGAATTAGGCTCTCCAAA
ACCTAGTCAGTGCTAGATGTAGGCAGCACATAGTCTCATCCCCATGATAA
TCCCTTTGTTTACCTTCAGTTCACTAGGTAGAATCCGATGTTTTCGAGCT
ATAACTCGACACACCTCGAAGGCTATCCACGACAGCACAACGGGAGGGCA
TCGAATACAGGAAATGGTGATGGGCGGTGTCAGAGGGCACCGGGGTTTTA
TACGGTGTCTCCTCGAGCTCTGCAGCCGGCAAGGGAACGGGTACTCTGGG
AAATGGCGATGTAGCGCATGCGGCGGGCAAGACTTTGTAGAAGAGTTTTT
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TATTATAACCACAAGAAGAAAATAACGAAGAACGGAAAAAAAATCATTGC
ATGGGACACAAGATTTAACGTGGAAAACCTCTACAACAAATAGTACAAAA
AACAACGGATCCCAGCCAGTGAAACTTCACTATGTGGGGAGTGTTTTTAT
ACAACACCAGGGATTATCAGATGTGACTATCCCAACTTACACGGGTATGA
CTAATCAGGTTCCTACGATTAGTTACCCTAGTTGCATAAAGGCTTACGGC
CCGTGAAGCCTATAAAGAATAAAGGAAGATCCAAGAAGTATCCGGCGGAT
AGAAAGCTCTCTTGGCTATCAAAGAAGAAATAGAAACCGACAATGTATTA
GTATTGTAACTGTAACTTCTAACCTATCCGTATACGGCTTCGGGACCTAG
CCTATTATACAAAGGCTGGGAGGAGCCAACGGAGAGGCACCGAAAGCCTT
GAGCAATTTGTAACCATATTGTCCCTAAGAAATCAGACAACTTCAACTTC
CTTGTTTGTCTGATCAGCCAATGAAATCCCCAGCGTTTTATTTTCCACGA
AACTCTAAGTCCATAATCATGGGCATTGCTGAGGTTACCCCTTGTCAATT
GGCATCGTCTGTGGGACATCTAAATGTTGGAGCCATGGATTCGGTGGCCC
CCTCTTCACCAAGCAAAAGCTCGACAGCAGCGGATCCATGCCCGCACACC
CCTCTTTCGGTTACTGTCGACTTCAACAGTAGCTCCGATCTCATAATCGG
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CTATTCGGGGTCCGACGGTCGTAACAGAAGCGCCTACGGCAATTCTGAAG
GGAATATGTCCTAAGAGACAATAATAAAGTTGCTATTATATGTATTCCAA
GTATATGATAGATGTTTATTTTGCATGCTATAATTGTATTAATACGAAAC
GTTAATACATGTGTGTTTAATAAATAAAATAGAAAGTTCCTAGTTATTCC
TCTCTTGAACTAGCTCGTTGATTAACAAGATGATCAAAGTTTCCTGATCA
TGGACATTGGATGTAGTTAATAACAAGGTCACAACATTTGTAAAATGATG
TGATGAACATTCATCCGAAGTATAGCATTACGATCAAAGTCATTGTGTTT
ATATTTCTATCACATTGTACAAAGTAAGTCTAGTCCTTAGACCATGAGAT
CATATTAATCACTAACATCGGAAGAGTATCTTGATAACTTCAAACGTCAC
ACCGTAAAAGAGTGACTATAAAGGTGGGTTCAGTGTTACAAAGGTGTTAT
GTAGATGCTCATGGATGAAGAGTGGGATTTGTCCATCCCGATGACGGATA
GATATAATCTGGGCCCTCTCGTAGATATTACATTAAGAATAACTTGCAAG
CAAGTGATGTGATCATTAGAATGTTATATCACGGGAACGAGAAAAAAGTA
CATGTCGGTAATGAGATCAAACTAGGTATTTGGATACCGATGATCGAATC
TCGGACATGTAATATATCGTGAGACCATTGTAACGTACGTCATGAATGGC
CAAGGATGAAGAAATATTCGGGCACGTACAAAAACTTTCGTAATAGTTTG
TTAGGACTAGAGTTTGAGTCTATGTTCAGATGCAAGCATCCGAACATAGC
CTCGCGGCTACTCCCATCGGGAGCGCTGGCCACCCACCCGAGATTTTTTT
TAGCTTGGGAATATTCTCAGTTAGAGACATTATTCTAAACCTATGTCCCA
ATGCAAGCATCCAAACATAGCCTCGGGGGCTACTTCCATTGGGAGCGCTG
TCGCACACCCGATAGAAAAACACTCTATAAACAGAGTCAAGCAGAGTGTA
CCCGAGAAAACTCCAACGGAGTCGAACAAATATAAACCTATGACAATTAC
ATATTTGTATCCTCAGTCGGTTACTCCCACTGGGAGCACCTATATGTGAT
CCAATAAAAGCTGACAATTTCAGCAATTCCGATAGCCAAACAAGACGGTC
GAAAAAAACTCAAATAAATCCTCAAAACCTGTCCGCCGCGATAATACGTC
TGAGTGTCGTGTCCACGATATTAAGGTAAGACCCTAGGATCCATCATGTG
TGGCTTGGTAATCGTACATGAATGCACATTGCCAGGAAATTATCCGTATC
TATGATACGATGAAAAATCCCGATGGACGCGTTGGGTACCCAAAATAATA
GTACTGAAATTTAGTATTCGATAAGACCTCAACGGCTCAAACTGAATTAC
ACTAGCAAGTACCAATTTCAGGCCTGTGACTTGTATTTGATGTAGGTTCA
CGGTGTTTTTGCCTAGGAGCAATTAACTGATTTTCGATCCGTCGGATGCA
TCAGACCCGTTATACCAAATCCTTATGAAAATCAAATTTAATATTAAAAT
TATTTATCAAAATTTTCGGCTAAACAACAGAAATTGTCTTTGAGATTCAA
CCCGAATCTATGATTATGGTGGAATCTCGGAGGTTAGTGATATGGGTATG
ACTAATCAGGTTCCTACGATTAGTTACCCTAGTTGCATAAAGGCTTATGG
CCCGTAAATCCTATAAATAATAAAGGAAGGTCCAAGAAGCGTCCGACGGA
TAGAAACCGCATCTTGGCTATCAAGGAAGAAATAGAAACTGACATTGTAT
TAGTGTTGTAATTGTAACTTGTAATCTATCCGTATACGGCCTCGAGCCCA
TCCTATTATATAAAGGCTAGGAGGAGCTAACGGAGAGGCACCGATAGCCT
TGAGAAATCTGTAAGCATATTGTCCATAAGCAATCAGACGACTTTGACTT
CCTTGTTTGTCTGATCAGCCGATGAAATCCCTAGCGTTCTCTTTATCACA
AAACTCTAAGTCCATAACCATGGGTATTGCCGAGGTTGTCCCTCATCACC
GACCGATGGCTTACCAGACGTATATATAACGGTGGAAACCTAGATCTTAA
GCAATCTGTACCGGGTGGGCTACGCACCTCCGAACCACAAGCCTACCAAT
GATGGAACTCGCTCCGCTCGTCAAAAGTAAGATTCCTTTATGAATTTCGA
TCAAACTTCAATCAACTCCACTTGAGAAAAAACACTTCTCGTAGAATAAA
AAACAACCATGTGAATATGCACTTAACATCCCTTGGCTCAAGCTTTCCAT
TATCAACTTGAGCATAAGCAGTGCAACCAAAAAATCTCAACTGTGAATAA
TCAGCAGGTGAACTAGACTATATCTCAATAGGATTTTTTTCTCAAATGAA
ATAGAAGATGACGTATAGATGAGGTAGCATGGTGTATTGGCTGCTTCAAT
CCAAAAATGTCTACCCATAGCATTGGACAACATTCGACAAGCCCTTGAGA
TGATGGTTCTATTCATGAGCTCAGCCACGCCATTTTGATGAGGAGTATAG
GGGATGGTGTGATGCCTTAGCATACCATCGTCACTGTAAAACTCCTCAAA
AATATTAGAATAGAATTACATACCATTATCAGTACATAATACTTTTACCT
TCCTTTCAATTTGATATTCTATCATGACCTTCCACTTCTTAAAGCATAAA
AAACATCTGATTTATGTTTCATAAAATAAGGTCACACTTATCTTGAGTAA
TCATCGATGGTAGTAAACATATAATTAACATCACCAATAGAAGTCTTACA
GAAAGATCCCCATACATCAACATGCATATAATTTAATGTGTCTTTGGTGG
TATGAATTATGGTTACAAAAAATTTAGTACCGAGTGTACTCAAACTTACT
CAAGTTGCAACCATCAACCATCTCTATATTCACCAATAATTTCATGCCAT
GTTGACTCATATGCCCAAGGCTCATATGCCACATATTAGTTTTACCACAA
ACATGAACATCATTAGAAGTAACAACAGTAGTAATATCAGGCAAAGCGCT
ACCTCGAACATATAATTTTGCAAAATTCATATCACCTATCATGTGAATGA
GAGATCCTTTTGATACCTACTGGTGACCAGGCTCGCTCGGCTCATCATAA
CTTAGCCTCCTTTATGAATTTGTATCAAACTTCAATACGACCGTGTCATG
GGTGGGTCTAGGTGACACGCATCCCTCATTGGACCAAGGGGACATGTGAC
CCGCGATCCCTCGGATGTAATAAAGTTTTTCCCTTTATGCATGACTTGAT
GTTGTCAGATAATTATTATCTGATAGCTAACAATAATTGAGATGATGTGA
AAGCACGCATGTGTAGAGAAATCTAGTAGTGGGGGTACCTATTTTGATAT
AGAAGAAACATAACAAAACCTACAAAGTATGTGACGAAAAATGTAGGAAA
AGATAAAAACTTTTGAATTTAATTTAATGCGACACCATCTTTTAACAAAA
ATGTGAAGCATAAACCATATATATTTTCCTGAATGAAATGTATGACTTGA
TTTCCCTGGAAAAAAGACATGCGGACTTGAGGAGGTGGCATAATTTGCAT
GGATAGATTAATGTAAAAAGTAACTTATGAGTACATGCATGACTTGCTGT
TGTCAGACAATTTCGATCTGACTCACTATCAATAATTGAGATAACATGGA
AGCATACACTAGCAAGAGCTAGCTATTAAGATATGGAAGATCACTAGAAT
TGAGGACCAAACGAGTAAGATTAAAAAGAAACAACATCTCTAGAGTCCGG
ATGGTAAACAAAACAAACTATGTTCCTAGCCCAAGCTAATTATGATATGA
TCGAGCTTTTATATGTGAGATTATCCAGGGAATTTCCAAGTAATATTGCC
TCTGGCGAAACCAATTTTTCAAAGGTCTAAACTATCTAGAACTATGTTAA
ATAAAAAGGACAAACGGTCTCAAAAGTATTAATATTTTTATCCGTCTCTC
AACCAATAGTACTGAAATCACCTCATACTATTATAGCGAGAGTCTCATTG
TTGTCAGCCTGCACAAGTAGATTAGAAAATAGATTTTGAATTCAGGTTGT
GCCACTACATATATATATAAACCGCGAAAAGAATCCACAGGTTGTGCCAC
CCCATAAACCGGGATAATAATCCAATCAAAACTATCCAATTTATTATGAA
GCCAAAATCTAAAAAACTATTTTCCATGCTCTATTGTGGCAACATCATAA
ATAGAAAGATTGACGCCCAAAAGGATGCCTCCAGATTGACCTGCACCGGA
GTTTTTCTTGTGTATAGGAGAAAAATCCAACTTTCTACTCTATAGAATGG
CAATAAAGTCCAGGTTATGCTCTTTAACTAAATCCAAGACAAGTTGTTGT
TTAGCGAGGTCACAAAAACCTTGGATATTCTATAACATGTCATGTACTAT
AATACTTTTTAGTACAACAATGCCTAGATTCTAAATTCTGTTCGATGAAT
TATCTTATGTTATTCCCCCGGTATTGCAACGTTATGTGGAAAAGAAATAG
GTATGGAGGTCTAGAAACATGACATTCATCCCTCATGCTAGTAACTCACA
CTTACGATTGTTTTGATAGTGGAAAACATGTGATATTTTAGTATAAAATT
AGTTTCTTTTTCTAACACCTTGTCTTTAGTTGGTCCTACCACTTATGATG
TATATTTATTATGTATCTCACTTGAAAAATGTAAAACAGGGTCTTCGATG
TTGTTCTGAATGAAAAACTAAGCTATATGTGGAATTCAGTCATTGGATTG
ATAGTGAGTGCGATTTCTGGCGTGATGGGCTTGCCCCCCTGGGATAAAAC
TCTGCCTAATTTTGGACTCTTTGTGCTTGCATTAATTGTGGTGTTGGTTC
AACTCATGGTGTTGGGTGCATTATTATGCCCTCTGGCAATTATCTACATG
CTTGGGGTATTGATGTCCGGAGGGATTTCATTGTGGCGTCTGATAGAGCA
TGATTATGGGTCCAACTCTGGTGGAGAAGCAACAAACCTTGTCCCGGCGA
TGGACACCTTGTACTATCTTGCTCTAATTCAAGGTGTAATCTTCTGCTAT
AGGTTCATCTTGGGTCGTAGTGGGCAGATGATGGCTAAACAAGTAGCCAC
CAAATGTGATGACTGGCAATTGCAATTAGTCACCAACTACATGCATGATA
CAATGACCGCATGCGCGAAGGACCCATCATTTGCCATTGACATGATCGGT
TCAGGCTCACCTGTTAGCAGCATTTCCGGGGTGAAGATGTTGTACACAGC
CATATTCATTACAGAGAGGAGACTGGAGCAGCTCGTAGTAGATAATAAGA
GGAGGACTGATGCATATTCTAACGAATGAGCCTTTCTCATCGGGCAGCGC
ATGTTGATGAAACATCTCCTCCTGTATGCATCCTCCTCTAGACATGTACT
CCAAAGATTGCTAGAGACACTAGATTCAAGAGGCATACATGACAGAGAGA
CGAGGAAGCAGGCCGAAACAATAGTAGAGCGCCTTGCATTCAATATCAAT
TTGGAGAAGTTCCCCGGGGGGATTCAACACATATCTTCCTTGCTCGGGAC
ATTCGAAGAATACTTTATAGCCCAGCCCTATGAGAGAGACTATCTGCTGG
ATAATTACGAGCAAGAGTGGAAACTAAATGCTCGTTGTCTACCCCCTACT
AGTGAATCTAGGAAGGCTTACAAGGAGTTGTTGCATGGCCTGCGCATCCT
CATGAGGCTTGGAGCCGACGAAAACAACTGTAGAGTCATTAGTGACACCG
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GGAAGTGATTATCCAATTAACCGGTGCTCCTGGAGAAGCTGGTGCCAAGG
TACGACGTGAAATCTCAAGCTGTCGAGGAGCATTGGGAACTTTGTGGAGG
ATTATTAATTGCAATAAATGTAAACATGAGCTGCAGCTAAATGCCATTCG
CATCCTCACGAAGCTATACATGGACATTGAAAGTAGCAAATTAGTAGACT
CTGTTCTCAAGAAAGAAATCAGCAGCAGATCAACAGATTTTGTTATCAGG
CAAGAAAGGAGAAGCAGAGAAGATTTTATTAAGATGCTGCTGTACATCTT
CACTCACGAAGAAAAGTATAGCTGCAGCATAAGAGGATCTGTTGTAGGAG
GAGCACTGCTGGAGATTTGCCTACGTGGAGGAAGCAGTGACGCTGCAATT
GTCTTGCAAGCAAGTGGTAGTCATGTTGTTGATAGTCTCACTAAGGTACT
ACTTCAAATGGACATTAGTAATGCACGTAGAGGAAAAGCAGCTGAAATTC
TCGAGTATCTATGTACTCATTACACAAAGGATGATGAATACCTTGCAAAA
CATAAGAAAGCAATGACCAATGCAGTTCCAGCAATGATAGATGTGATGCC
AAAGGTAACTCTAATCTCTAAACCCTTTTGTCGACTAGTAAATAATATTC
GTTTTTACAGTCAACACATGAGTATACATACGCGATTTCAATTATGACCT
GTTTCTCTTGAGACTAATAATGTCATATTCATTTTTGTCACAGGTGATTG
AAGAACTACTTAGTTATGGAGGCAAATTACATGTAGGAAAAGAATTTCAC
CAGTACGGGTTCCCTAAACCAAAAACTGATATTGAACATGAAAGTGATTA
TGACGTGGGCGAAATAATTAGCTCTTTATTGTTCTCCCTTCTGCCTAACT
ATGGGCAGAACCAAGAAGATGCACTTGAGTTAGTCATGTTGTCAGTTGGG
TTAGCCAATTTTCTATCATCCTTGTTATCTCTTTGTGGGACGATCTACAA
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CCGACGGTCGAAAACCTGTCAGTGTTCAAAGCTATTGCAAAGATGGTAAC
ATCATTGATGAAACACGGCGGCCGGTTAGTTAAAGGAGATGGTCTTAAGA
TCTTGATGGAGGCACTCTCTATTGCTTCCAACAACATGCTGGATCTCGAT
CACTCTATGGTTTTCTGGTCTACCGCCAACAGTGGTAGTGCTCTTAAGTA
CCATGTACCCACACCGTGGAAGATTGATGAGCCTACTCTCGCATCCCTCG
TGCAAGATTTGTGTGCCATGGTGCCATCTTCCTCTGTGACCATGGTGCCT
TGATATGGGATTAAGATTGTATATGCACTGAGTGTTCCATCATGGTAACT
ATCAGATCAATGGTGTTGTTGTGGATTTGCGATGTTGTGATGTGTGTGGG
TCAATGTGTCCCAGAGAACGTCAAGTTTAATGTTGGTGTGTTTGGGCAGT
TACTCTGTTTATGTCTTGCTGCAGGTGTGATGATTTTTATAAAATCTTGT
AAGTCAATTCTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.