Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE036312

[Submit comment/correction]

Sequence	AE036312
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE036312
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCTCTCTCTCTCCTATACTCATCGTGACCAAAACGAAGCTCTCCGTGCT CTGAAACCCTAGCCGCACGAAGACATCGCGCCGCGTGACCGTCCTAGCAG GCGAAGCGATGGCCGCGGAAAACTACTGGAGGTACGCCGACGCCCGGCAG CAGCAGGCGATGGTGGCGGCCGCTGCGGCCGCGGCGGGGATGGCGCCGGC AGCTTCCGTGGCGCAGGCAGCCACTGCTGCGGCGGGCATGCAGCAGCACC AGCACCAGCACCAGCAGGCGGCCTTGGCGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAG GCCGCCGCGCCGTCTCTCAAGCGCGCGCGCCCCGACTACGGCGGTGAGTT TGCGTCCCCCGGATCTGCGCCCTCTAGAATCCAGATCTGGAACTCCTTTT TGTTCTCGTTGTGGTGGTTGTTTGTTTGCGGGTCGGGATTGTCTCGTGGT TAGTGGTAGTTTTGACTTATATAGACGAGTTATTGCTTAGAGTTAGATCT AATATCCCTCAAGTTTTTTGTAAGCATCATAGCGGCTTAGAGTTAGATCT ATTAATCCTCTGAGTAATTTTGGTTTATATAGTTGCTTACGAGATATTTC TTAGAGTTAGATCTAATAACCCGCTAAGTAATTTTGGGGGTATATACTCT AGCATCGTCATCGTAATTTGTTAATTAATATATCTGGAATTAATTTTCGA GAACAACAGGGAGAGATGCTTGCAGAAGTGAAAAAACTGAAGTATACATA TATGGTAGATCGGCTGATTGGACTTCTGGTGGCCGCTATTGCTGCTACAT GGTTCCCTGCAGGGTGTTACTACAGGAAACGTATTAATGGTTGTCCTTGA TTAGGTAGAGACTTTTGTTAATTGTTTGGACTTAATAGTTGGCGAATCGC TAGTGCTGAAAGGATTCCTAAGATCCCCTGACAGGAAAAAATCCTGTTAT GATAAACAATTAAACACATGTGCGATTCTGATTTGCTAGTTTTTTATCTT GCTTTCCATCATCTATGTTTTTATTTATATTTTTCCATTGTACTTTTGTT ATGACTTGCTTATCTAACGAAAGATTCTAAGCTCGCTGATTAGTTCTTAT ATTAATTAAAGGTATTGTTGGCAAATGTGATTTACACAACCTTCTCGTAA TTTGTTGTTTTAACAGATGGGCCTGGAGGACAAGAGATGGCTGGATATTA TCCACGTGAAAATGCGGGTTACCTACTTAGAGACAATGAAGCAATTGGAG CATCCTATGACCGTTACTTACGCAATGGGGTACAATTTTAAGTTTTATCA TGTGAAACACACATAATTTCTCTAAGCACATTTTGTTGATACTTGTGCCT TATTGATGTGCTTGTAGATGTCTTCTGTTGCGGCCAATGAACCAAGTAGG GCAGCTGTTGGTGGTATGGGTGGCGCTGCGATGGTTGGTGGTGGAATGAG TGGATATCCTGTTGATGATCGCCGTATGATGGGTGTCGTTGGTATGGACA GAGGCATGGGGTTTGGTGCGAGGCCTGAGCCTCCTCTCCCACCAGACGCG TCCAACACTTTGTATATTGAAGGCCTGCCTGCAAACTGCACGCGTAGGGA GGTTTCACGTATCCTTAAAACTATGCTGCTAACATGATGTGATTAACTTC ATTTCTTAATGGACGACTCATTAAAATTGTGTTGTTGATTGTTACTCCGC TCTTATTAATCATTTAATTCCATTCCTGCTGGTTTAGGATGCTCGTGTTC TTGTCCCCCTTTGTCTGGCTTGCTTGATTCCAATCCTATTATTTGATATG CCCTGATGAGCTTCTTGATCAGTACTCCCTCCGTCCAAAATTAGTTGACC CAATTTTGTCTAGATACGCGTTTTAGTGTGTAGATACATGATTCAATTAA TTTGGGATGGATGGAGGAGGGATGTATCAACGGAGTATAGTATTGAGTAC ATCATCTCACCCAATAAGTACTTTTACTCCTTAACCTTATCCTCTGCAGA TATATTCCGCCCTTTTGTAGGTTTCCGTGAAGTGAGGCTTGTCAACAAGG AGTCAAGACATGTATGTTAATAAATATGTTCTGTGTTTACAAAAACCATG TTTATTCTATTGTCGATACATCTTAACCTGGTAACTTTGGTGCAGCCTGG TGGAGATCCTCATGTCCTATGTTTCGTTGATTTTGATAGCCCTGCCCAAG CTACTATTGCACTTGAAGCATTGCAAGGTGAACAATTATGTATTTACATA CATTATCTGATTTTAATGTTTGATAATGTCCAGTTCTTATGTTTTTTTTG CTTCCATATTGTTTGCACTCACCTTTACTTTCTCATATGCTTTCTTCAAA ATTCGATGTCATTCGGTTGTCTTAAGTTTATCTGTTCTAAATTATGTCTG TTATGCTTTCTTCGTTTGCAGCATAGTTAGGTTGTACTGTATGGCCCTGT TGACTTGTTGGGGATTATTAGGAGCAACACACCTTCTTTTCACTGCTCAG TGATAGTACCAGAGCATTTATTCACACACTACATGTTCGTGAGGGCATTT TGCTAGACTAGCATGTACCGCGTAGAATTTACAAGTTTGGCTCTGAAAGT TTGTCATTGACCATCTATGACATTGCTCAATGATAGCTAGTTCTGGAGCG CTTTAAAGTTCGTAACTTCCCATGTAGACGTATCCATGCCAGTCCAAGCT TTCAGTTTTTAGTTGTTACTGTACCTTATTCCCTATGCGTTCGATCTTAT AATTGCACCTGCATTCTATTGGCATGGGGTCAACGTTGAGGTTGGATATC TTGTTCTCTCGACGACGAAAGCAAAATAAACCGTCGCGATTCATTTTGCA GGTTATAAGTTTGACGAACACGATCGTGAATCAGCCCACTTACGGCTGCA ATTCTCGCGCTTTCCCGGTCCGAGGTCAGCTGGCGGGCCTCGTGGTAGGC GTTAAGTCGTGCGGTCAGGTGGTTGCCGAACCTATCGTTATACGAGCGAT CAAACCTCCGTGGCGTAACGCTTTGCGCTGATTCTCCGACGATGGCTTGT AGGGTTCGTCAGCTCAACTTGCGAAAGCGTGAAAAGGACGATGCAATAAT CTTTATATTCAAGTATCCATTAGATTGCCGTGTCGCATTTTAGGATTGGA TCATCGTATTTATTCCTCAATACTGTATCTGCCGTAGTATCTTGATGTCT ACTGTATTTTGTTATCTCGCGGCGTGGTCCAGACAATTTCAGCTTGTTTT CATGTGAAATGTTAAATTTTTGAAGCAACCGCTCATGTTATTTAGCCGTG TTATTTAGCTGTGCTTAGTAATATAAAGTCTTCTCTTTGCCTTGCATTTA TCAGTATACCTAGGTAATATATAAAATAGGTGATTTTCCTTATGCTTCTT GTGGCGTGCAATATATTGTTGTCCTGGCAGTGACCTCTTCCCACCTTCAT TAACATAAGGTACACGCATCTGTACTTTTTTTTGTATAAGCGTAGTTGTC TCTTGTCTGCCCTAATTTCGATAAGTGACCAAGCATAGCTATTGCGTGGG TATGTATATACTGTATAAATATAAAGATCCTGAACCACAGGTGTGTTCTG CATGCATGGCTGCAGTCGCAATCTGCGAAGCTGTAGTATAGTCTCATGCA TCAGTTATTAGTTGGTTATATCTCTTGGAAAACTGACAAGTTTGAAATTT TGAATTTCATACTGGTGTCAATAATTTTAGTGGTCACGAAGTTACCTTGG ACGTCTGCTTGAAGGTAGTATCCACTGTTAGTTGGTGCGAGTAGATGTTT ATCATCAGTTTCCCGCATCTCATCTTATATTATTCTTCAGTGCCTGTGAT GTTTGTTTGGAAGTAGGTTGAGCTAGTGTGCTGCTTGTTATGAGTGTTAG TATTGAGATCTTGCATATTATCTTCATATTATATTTCTTTATTTTTCCTA ATAAATGGTCGACCCTCAGGTCCTAGCATTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAT CTATTGGGTATACCCTGTAAAATCATTCTAATGTAGGCCGGAGCAGCATG GTGTATAAATAAGGTTTTATCCAGATTGAATAGTGTTTACGGTGAACTGT TTGTATTCTTCTTAGTTGATAGCATAATCAGCCAATGATAGTTGTAGGTT TATGTTTTTTGTGCAAGTTACAGACATTATTTGAATTGGCATGGTTCATT CAGTGTGTTCTTTTGCACATTATATCATGTATTGAATGTTTGCATTAATA ATTCTTTTGTTTCTGATGCGACATGAATTGCTGCCATAAACATGTTACTT TAGGTATATACAGCCAAAATTGCAGTAGTGATCCTTTTTTTTACAAGTAC TAGCGATCCATTTAATTATACTCTAGACGAGTATTGCTGAAATCCATCAA GTGAACACATGGGTTGTCTGATTGAATGTTTCAACACGTGCGGACTTCCA TGCGTGATGACTGCCACACGCATTTGATTATGACCATTGCTCTTAATTGT TAAGATCTTCCTTTCACAGGCAGTTGAGTGGTGCTAACAGATACTTTTTT ACTTGTTGTATCAGCAAGTTAACGAGGAAACAAAATGAGACAATCTTTTA GTAGATGCTTTCTGAAACAGGCCACGACTGCTGTGGTAGCATAGTAATAG AAATTTTGTGGGCAGAAAAGATCAGTGGCTGGAACTAGTGATTAATATTA CTCTTCCTAAGCCCACTGAATTTGTACATCTGATGCTCGAACATCACTCT AAAACTGTTGTGATGGGACCAAAGTCCGCTCCCTATTTACTTGGAAGATC AAAAGAGCCAAAGATTATTGTTCCCTAACGAGCACCTATTCAAAGAGCCA AAGATTGTAGTTCCTGAACGAGCACCTGAAAAGATTCCGGAGGATCCTCC TGATCCGAGGGTCCTGGGTGTTCCTTTTTCTGAAATCGTAGCATCAAGTA TATCTTGGCGGGCTATAAGATGGTCAGATTTGTAAGTATCTCTTGTAAAA TATGAGAACACCAAATCCTTCTAAACCCTAACTTCCATATCTCATATTCG TTGCACCCTTGGTGGGGTTGTCAGCTCGATCTCCCGTCTTTCGAGGGTGG TGGGACATGGTAATGTTGCTGTGGCTTCTAACTAGAGAATGGAAGAAAGT CTGTTTGTGTTGGACAACCACGTTAGCTCAGCCTTTTGAGAAGAAAAGGA AATTGGCATCTATGGTAGTTCATGAAAATGACACCCTCCAAAATACAAAT CATCCTGAACATCAATATTTCATTTGTAAGTAAGTGTTGTGAGTTTGTTT AGTTTGGTTAAGTAAGTATGTATCTACGCCTCCGATCAAAATTAATGCTA TCAGATCTGTCTAGATTTGGATGTATCTAGCGCTAGATCATGACTAGATA TATATTTAAATCAACAATATGAATCGGTGGTGTTCCAATCTAGTTTGATT GCTTGGTTCATCCTTATGCAATGGACAACTACGATTAAATGATGATCGAA CTCTTGATGCAAGAGGAAGCTGATATTGCCGCTGAACAAAGATTGTTTGA TGGTCTTGTCCGCCATTTTTTGTTACCGAGAGCAGTGAAATGTCACTCGA TTCTTGAACTAGTCAAATTGTAATTTATTTGAGTTGTTGTATGAATAATT TTATTTTTTATGTTTGGTGTTTTGTGAAACTATTATGTGCTTAAACTATG TACTCTGGTTCAATTTAGTTGTCCAGTCTAGATATAAATGTATTTATACA CTGTTGTTTCAAAATTATGCGGAATCTTGCTATTTGTAAAGAAAATGACC CCATTTTGGGGTCTCTCCCGTATTGGCCTGACCCTCCGAATACGTTGGCG CCACACCCCATAGCACATTGTCAGCACCGTTACAGCCAATGAGTTGGGGC CTTCTGGTGGTGATGCTCTAGTATCTGTGTTTAGTAGTACTATATACTTT TAGATAATTTATTAGTAGTATTCTACTATATCTTAATTTTGCCATATAAA CCTTGTATTCTTTAGAAACATATAAAATTTGTATTCTCTAAAATTCGCAT TGCCATCCTTGTAATATTTATATGTCATGCCATGTTATATTTTGCCTCTA CCATCTCCTATTACATGCAATTTTGTACATCAACTTTATTTCTGCAATTG AAATTGCCTTTTCTTCCATTTTTTTTAACTGAAACAAACAAAAATGCCAT TAAGTAATTACCTCAAATTTGATACTCAATTTGTTCCTTCCACTATTGAG TACTCTGAAAAGTATTAAGTTTACTGAAAAGTACAACGTGACTATCTTTG ACCAAGTTGCTAAAAAATATAGAATTTTCAGCACCATACGATTTTTGTCA GATTCATCATGAATTATGTTCTCATAATTTTTATTTTAGTATTTTTGATG CTAATAGATTTTTCAAAAACTTGATCAAAGATAGTCAAGTTTGACTTTGT GAAAAACTAATACATCTCATAGGATGGAAGCGAGGGAGTATTTGTGAAAC ACAAGGTAATGGACATAACTTTTTTTTAGGCGTACATTCTATCATTTGGA CTAAATGATTATCTCTAAAGCGCTCTTCCAATATTTGATCAAGGCGTTTA TTGATGTATCTCAGATTATACTTCCTGCTTTTGCAAGACACAGTAGAGAT TATCACGAGAGTGTTAACTTATAATTTACGGTCTACATATTGTTGGAATT TTGACTAATATGATCCCAGACAAATTAGACTTTTTGCAAAACCTTCTGAA ATCCTATAGGCTCATTTGGCCATTCATGCATCACAAGAGGTAGGACTAAA GTTTAGTCTCACATTATTAGTTGCGTGGGAATTGGATTAGCAAAGAAACA GATAGTCCTGTAATAATGGATATCTATGATTGCTTGTATGATGAATTAAT CTCTTTTGCTTCTGATCATGCAAAGTGGATAATGAGCTTCTTTGGCACCT TTGCAATACATTTAACCGCAAAATAATAAAAAGCATATACATGCCCATTA TTTATGGCAAAGGTTGCTTTACCACTTTTACGAGCATGAGAAAAAATGAG AAAAAGAAAGACAATGTGCGTGCTTCTCCGCCGCCGCCGCTCGCCTTGCC TTCATCACGATGTGCATCGCAGGTTCAGAATATGAACGGTCTGCACTAGT GGAGTTGTAATACGAACTCAATGTAGATTAATACGCACTAATGGCTATTC GACTTTAGCCGCTGCATTCGACTTCAGCCGCTGCGTTCGACTTCCGTTTT TTAGTTTCATCTTCTTGCACTGGTTGTTCGCCTACACCTCACGTGTCTAC AAAAGAGAGGTCGCATCTCTCTAGAGAGACAGACACATAGAGCCATCCAT TCTAGAGCATTGAGCAGTTTTTAGGTCTTCCCCATCCCGTCTTGAGACGT GCACTGTGAGTCAGAACGTAGGCCTCGGAACCCCGCCTCTTTAGATCTTG TATGGGGGAAGGGCGGTAAGGTTATTGGAGAGCGTTGTCGGGCGACTACT AGCTTTATCACAGAGTTCTTTATGGACACTGACGACTTCTTCCCGAACGA TGACTACTTCACGGACAATGCAAGCGGTTCTTCTGCACCGTATAAGTCTT TCATTCATCTTGTTCAGATCATGCTCCATATACTGCAAATTACATCTCAT ATACTATCAATCTATTTTGACTTGCTTCTTATATTCTATCTGTTAGATTG TATGGCTAGTTTTACTCATATATTACTAGTCATATTTTATCTACTATTTT TATGAATTAAATGATATGTCAAATTGCTCATATTTCCAGCAATCCGAAAA CCTTACTATAGGAAATTTACTCCAAGTGGCTCTGCTATGAGGCCGCCAAT CTTTGAGGCTATGCACTATAAGAGATGACAGAGAAATTCTCTGGTTTTAA ACCATGAGTTGCTAGAATGCCACTCTTGTCAAACCTAAGGGAGAACTCAC TCCTATTTAGGAGGAAGATTTTCAGAAAAACGGATACCCACTTTAAGGTG GATCTCTTGAGTGTTTTTTACGAGAACACTAACACAAAGGCGCGCTTTGC CGCACCATCTTAAAGAAAGAATGATAGAAATATCTTAGAACTTTTTAGTA ACAATTGAAAATGTTGAATATTTCCTATTTTCTTTGCTTTTTTTAGCAAA ATCCTAATGTTTATGCTCATTATGAAAGTTACCAGACATATATACCAACC TACGTAGTTTTTTTCTTCATAAGATTTTATGATATAATTTTCTCTCTGTA GTGATTCTCGTTAGTAAACATGGTATACAAAAAGTCCTTGTTAAAATATT TTGAAAGTAGCAAAATATAAAACTGTATCAGTTAAGGAGGTTGTGCTATT TAAGCTTCACTATGCTAGAATGACACTCGGAAAAATATTAGGCACATGCC AATAGCACCTAGGGTCCCACAGTTAAGGCCATGCCAATAGCACGTAGGGT CCCACGGTTAAGGCCGTGATATTTTCACTTTCATCAAATATTATGAAAAC CACCATGTTTATGCATCAATTTGACTAACGATAATAACATGTGCAATTAC ATTTGTACTGATAATCACTAACAATAACAATAATATAGTTGTAGAGGTTA GCTACTTCTTCCTCTTGGCTTCAAACTCCAGGCAATAAACTCACCAATGT ATCTATGGATTGACAACTATAGAGTAGACTTTCAACTTTAATAAAACCAA CAAATTATTGGATGTGAATATTATGCATATGCAAAAACAATATACCTTTT GTAGTCATCATGCATTTTCAGATAGAACACTGGGCTCTGCTACCATGGAA GACATGACGATGTGGGAATCAAGAATCTTGAGGATGTCATCACAAATTTT TAGTTCAGTTTAAACCATTGTACAATACTCGTACAGATGTGACATAAGCC TCGTTCCGACAACTCTTCTTATTCTCAATGTATTTGTTGTTCTTATTAAA AAACTTGTTACGCTTATTAAGTTATATATCATGACTAGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.