Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE006654

[Submit comment/correction]

Sequence	AE006654
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE006654
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAGCGCTACCAAAGCACACGCACAGCATCTAAAAAAAAAGGACACACAAG CAGAGCACAGTAGCCAAGCGACTGAGCGAGCGAGCCCCAGTGAGTCACTC CCACCGCCGCTCCCGATTCCCGCCGCCGCCGCCATCCGCGGCTCGAGCTT CTCCACCCGCCACCCCTGTAGACCGCGATCTCCTCCCGAATAGCTGGCCG GAGCTGCTGCTCCGCCTGCTTCGCCCCTCTGGAGATCCGCCCGGAGCAGC ATTTGTCTTTCTGGGTAAACCCTAGTCTCAGGTGATTTGTGTGTTCCTTT TGCCTGGGCTGCTAAAAATCGAGCCTTTTCGAGGGATTCCGGCCGCGTAT TATGGAGGCTGCTGTTGCTAGTGTAAATCCGTCCGTGGGGGTTCTTCCGT CTGTGTCGGTGCGACCGCATCGGAGATTTCGGCGACCGCATTTGACTCTG GTTGTATGCTTGAGATCTGGGAGCTCGTAGGATTCTCATTTCGAGCGTAT AGCAGGGCGGTGTGTGACAGAACCCTTTCTTTCTTTATTTATTTTGAGAT GCGCCAGAGAAATATTCGATCTTGCTGCCCTGAATGTGGTGCCCATTTCT CTGCGGTCTTTTCAAGGTGTAGATTTACTGTTTCGATATCCATATTCACG TCCATACGCGATATCTCTCGTACCACATATTTTTCTCTTCTGTAGTGTGT TTTGTCGGGAATACAAATGAAATATGTTGCTCAAGAGTTTGGACGCCTTT CTTCCCATTATTTCCCCCAAAGCAGCTGCATGCAAGTTCTGCCACCCTCC ATACTGTTTCAGGTAGTCTAGTGGTTGATTCGCTGGAAAATTTGGGGATA TTAAAATGGTGATGTGAGCCACATGGAGAACTTGTTTCTCAGGGCTTAGC ATTCTAGGGTATTTAACCATTTTGGGAAACCATGAATCATGGTTTTTAAG GCGGTGAGGTGTCCTAAGGCGTAATACCTCCGCTCTGACGCCTAAGCGCC TGAAGCGGACAAATTTCCAAGGCACCGCCTGGGCGCCTTATCGCCTAAGC GTCCTAAGGCGGATGCCTTAAAAACCATGGCATGAATCTCTAATTTCAGA ACATATGTTATACTATGTCATGGTTGTTCTTGTAAGTTGAAGCCATGGCC AAACAAGTGGGGTCTTCTTGATATTATCATGTAAAAATGAAGTTTTTATG AGCTGGTTGATTGGAGAAGCTTAATCCTGTTCAAGGCCATAAACTCTTCG AATACAACAATTTAGGTTTCCATATTCTACTTTTGAGATAGTGGAAACTG TAAACTTATTTTCAGCTATGTTGTTTTTGGTAGGTCAATCGGTGATTTGG AATGTTTTTCCGAGCCGAAGCAGAGAATTCCTGGAGCTGGATAATAACAT CCTTTTAGGGATATGCTCCAACCAAGGGAAGCTGATGTGCCTGTACTCTT TGTTGTATTTATAGTACTTCCGGTCATAGCTTATTTTCTTCTTGGGAGAT GGCATGAGGCTGTAAATAAGAAAGCAAGGGTAGGTGTGCTTGCCCAGAAA GCTGCAGAAGAAGCCTTTGAAGTGGAAACAATGGCTTGTCCAGATGTTTT ATTGCCAGGACCCTCTCTGAGACCTATGCCTTATTTGAGATCTGTTCCTT CTTTAAGGTCTGAGTACCACGAGTGTGCTACTTGCCATGGCCCTGCGAAG ACTAGGTGCTCCAGGTGCAAGTCTGTTAGATACTGGTAAGATTCTGACCT ATTGTTGTTTGGTACTTTACTTAAACTCCAAATAACTGTGTAGGCACAAA TAGCTGTTTGAATCTTACTTTTTATCTGATGTTTGTTGATTATAATAAGT TTATTTACTGAAAAGGAACTATACCTCCACTTGGTCACCTGGGTGGGTGA GCCACTTATTTGATTGTATTGATGACATATCTAATTGTAGCTAAGCTTGT AGGATTAAGTACCCTGTAGCTACATTCAATCCAGCACCTGACTGGAGCAA GCAACACATCTAATAACTTCAGCCTTTCTACAATTCCAAATTTGTGACTG ATTTATCCCTGCACCATGACTGTTTATCATTCGATCTTTCTTATTCCTGT GATAATTGATGTTAAACTTATATTGCTCTGTTGTTGCACTTTGTAATGCC AATTTGAATGTTTACAGCTCAGGAAAGTGTCAAATACTACACTGGAGGCA AGGGCATAAGCAAACATGCCAGCAATGGCATGTTAATGGTGGCAGCAGCT CTGGTGGGCTACCTACTACGGAGAGTTCTGAACAGATGCCGTTCTTAACC AACCTAAATTCACCTCTTCCAGGGGGTGATGTTCACCTGCATGACATGAA TTTTGACACGGTATCAGAGCCATCTTTTGGGACAACTGATAGCTATAATC TTGATGCTGATCTATTCCCAACAGACAGAACCAACATGAATAAGTCAAAC CAGAATCTTCATTCAACTGAAAATGGTGCTTCTGTTGCATCTTGTGAAAA GAGCAATTACAGTGTTGACGAAGAAGCCAATTCTTCTGAGGTTCTATCAG CAAATAAGGTAGCGTATCTTGTAATTCAATTTTTATTCTCCAAATTTGGT TTATTCAGTGTTTCACTTTTTGCTTTCAGGTTTCAAACAACAGTTTTAGT TGTTCAGATGAGAAGAATGGCAACCATGATTTGGCTTATGCTCTCAGTGG TTCAGTACAACAACCCAATAGTTGTGCTCCTGAAACAAGAAAACGGCCAA AAGCAAGCATCACGGTTTATGAACCCGACATGGGTGTCTATTTAACTTCT GATATGATCAGTTCTTGTGAGGGGCCATATGCTTCCTCAACAGCATCACT ACACAGGAGCAATTCATGTGGAAAATCTACTGGAAAGGGAAATATGATTC ATAGTAAGCCTCCATATCCACCAGGTAAGGTGGCTTCATCACAAAAACAA CAGGAGGAGTCAACATCATATCAATACGATGGCCATGAGAAGAATCCTTA CGTCAAACATGAGCAAAGTAAATATTTCTTTTCTGATGAAGTGGGCTACC TTTTTCTTATGGTTCCCTCTTTTATCTCATATATGCACTGTATTGTGTAG GATCAGCAAAAGCAAATGTTTCAACAAGCAACAATATACAAGGATGCACT GGAATCTCAAAATTAGGAGCATCCAAGGTTGAAGTCTTGAAGAAGCCCTC AAAATTTCTTAAAACCAGCCTGGTGGGTTTAATCAATGATAATAAAAGGA GCAAGGTTCGGAATCAGTTATGACAGATCTTTGTTGTAGTTACCTTGCTA TTTCTGTATGTAATTACTTTCTTCTAAATTATTATTTCAGGTATTGTTTT GCTATGAGGATCTTGTCAAGTTCTTTCAGTACGAAGTACGGGGCATTTCT CCTAGAGGTCTTTTCAACTGTGGGAACAGGTATTACATTGTCTATGTTCA ACTGTTGTGCTGCCGTAATTCATGGTTTTAAAGGCGTCGCCTAGGCGTCC AAGCGCCCCTCCGCCTTGCAGAAATGGCCGCTTTAGGCGCCTAGGCGTCC AAAGCGCCCGCCTAGGCGTCGCCTAAGCGTCAGAGCGCCCCTATGTCGCC TTAAGACGCCTTAACGCCTTAAAAACCATGCCATAATTTGTTTGTTATTA TATGCACTTTTTCTTAAGAAGATCCACATGCAGCATGTCTGAAAATAAAA TATGTAAGTATCTTAACAGGAGGGATACAACTGAATTTTGCTTAGGAGGT GATTTACAAGTATTAGGCACATACTTTGTTAGACTTAGATCAGCAAATTT AAAGATAATGTGATGCAAAAATAGAATCAAATTGCACTACATGTGCAACT AGTTTAAATAAGGATAATTCCCAGTTCACCAAAAAAAATGGTAGTGAAAT AATTAGTTTATATAAGGAGTAATTTATTTAGTCAAGCAAACTGTGAGTCT AGTCTCTAGTGTTGTTTCTTTTGTCTGTAAATTAATAATTTTCTTGGTTC AATTGTAGCTTGTCATGGGTTATATCTAATTACTATTATTCCTTGTTTGC AGCTGCTATGCTAACGCTGTTCTACAATGCCTTATGTGCACAAAACCCCT GATGATCCACCTGCTTCTGAGATTGCATTCTAAAGACTGTAATACTAAAC CCCTAAAGTTTTCCCCTTCAATACTGTTGTTTACTTTGGCCTGTCTCATT TTGTATGTTATCTTATTTTAGGTTGCTCAAAGAACTGGTGTCTTATGTGT GAACTTGAGCAATATGCTTCAACTTTACGTGAAAGTGGCGGACCTGTGTC TCCTAGCAGAATCCTTTCTAATCTGAGGAATATCGGATGTCGATTGGGTG GTGGAAGTCAGGAAGATGCTCATGAATTTTTAAGGTGTTCTAACTTAGAT GCTAGATTTAGTTCCTCTCTTATTTTAAAAAGTGTGGTTCTTTGCTTTTT CAGTGTTTTACTTTTTCCCAAATTCAGTTAGGCATTTTTTTCGATAAATG GCGCTTTTATTAGACTCAAAAGTTTACATCAAGGTGAAAATTCAGTTAGT CATAACAGCAACCGAAGTTTGTTCAGAATTTCGTGAACTGATGTCTGGTT GGCTGGTTATTTGGTTTAACCAAGATTTGGAAAACGGGCTAAGAATATCA GTCCATCAAGAAATCTCTCGTAGAATTCCTGGAACAACCTAGTCGTGCTA AATTCCTCCCTAAAACAGTAGCAGGAAATAAATTACTCTGAACTGGCGAT AATTGCTCTATTGCTGCTGCCATCGTTGTGTGCTTCTCGTGGTTGTGAAA TACCGTCAATGGTTGGGGTGTTGTCATGTTGAGTTGAGCTTGGAGCCTGG TGCTCGAGGGCAGAGAATTGCCAGCCAAGCGGTGTTGGATACCACAACCA CCACGTTGAAGTTCCGCTTTGCACCAGTGGCTTAGAGCCTTAGAGTGCTG AGGAGCAGCCTGCAGGGACTTCAGGTTGGGCGTATCGGGGAGCATGCGAT GCACACAGCCGCAGAGTGGCAAGGTTAGGGACGGTTTTGGGGAATTGGCA CGACTGCACATGGGATTGGGGTATTGGGCCAGGCACCTACCCTTACTCAG TGTCTAGTTTATCTTTTATGCCAATATTTTTGTCTTTCCCTTATAGGTGA GAACTGAATTTAACAAACTTTTTTGGTTAGTCAATAGTAGAAGCCAAATT AACAATTGAAAACTGTACTATTCGGTTTTAGTGTTGGTTTTGTCTTCGTT TGTTATGCCCATCCCTAATTGGCTTGTTCTATTGACAAGGTAGCTTGATT GCAGTATGGAGGTGATCGTATGGAAACCTAGTCAAAACTTTTATTTTATA CTTAAAAAGCCTGTCGTTCCATATTATTGCTTGAATAACAACATCATTAT GCATACGTTGCTATAAAATATTTTAATTTTCTTGATAAGGGAGGCAGAAC CAGCAGTGTTATAAATTTAACAGATATACCATCTCTTTTATGTTGATCAT ATGTCACATTTTGTTCATAACGTGCTTGATTTTCAACATCATCAGGCATC TTGTGATGTCTATGCAAGCAGCATGCTTGGATGGACTGGGTGGTGAGAAG CATGTAGAACCAAGCTTGCAGGAAACTACACTGATACAACAAATGTTTGG TGGGCGCCTTAAATCTAAGGTAATTTTGTAAGTTTCTGGCTTGAGTTACA TGTTTTGAAGAATGATGCTAATTTACTTAATCTCATGCTTAAGTTGTTAC AATGTATATCTAATATTTTTCCCTGTATGTAAAAGATGCAGTTTGCCTCT TAATTTCCTTCTAGGCTTGTGCCAACTCTCTTGCTCATGTGGCATGCATT GTTTGTCTATCATGTACTAACTGTTTTTTTTGATAAAGGTTAAGTGCCTC AGATGCCATCATGAATCTGAAAGATATGAGAATATAATGGACCTTACTTT GGAGATTCATGGTTGGGTGGAGTCGTTGCAAGATGCTTTGACACAATTCA CTTCTCCTGAAGATTTAGATGGGGATAATATGTATAAATGTGGAAGGTAC CGTGACAACTAACACACTTACTATCATTGGACCACAGCCTATTGAAGCCT CTTAATTTTATTGCAGGTGTTGTGCTTACGTCAAAGCAAGAAAACAACTA AGCGTGCATGAGGTGCCAAACATATTAACAGTAGTTTTGAAAAGATTCCA GGTATCATTGGATTTCATCACTGCATCAATACTGATCTGTTCATGTATGT AGGTGTAATGGGGCATGCATTTATCAGTATGATTTTTTTATGAACTTACT GATTTATAGGACTAATTCGAGATGTGTTTTGTGCATTCGAATTACCAACC AAACCCACCTGAATACTAACTTATATTTAGTTCCCATAGGATAGAAAATA TAATTGGTTGGCTATTTATATTTAGTTTACAATCACTCTGCAATCCCACA GTTGCCTGTATTTTTTTAAATGAATGAGCTAATTTTTTTCTGCTTCAGAC AGGAAAGTACGGCAAGATTAACAAATGTGTCACATTTCCTGATATGTTGG ACATGGTTCCTTTTGTGACTGGGTCTGGCGATCACCCTCCTCTTTACTTC TTGTACGCTGTGGTCGTGCATGTGGATACAGAAAATGCATCATTCTCTGG TCATTATATATCATATGTCAAAGATATGCAGGGGACATGGTTGAGAATTG ATGATTCGGAGGTATTAATAAATTTCCTTGGAAGTAGATTAAGAACCTTT GTACCTGTTGCTTGAAGATGGTATAGATTTGTTATAAAGAAGCAAACACA ATCACAAATTAGATGCACAACAGCTCGTTGTATACTCTTTTCAAATACAC TTATGGTGTAATCTTACTGTTTAGTGCTTATGGAAGTTATCATGAAATGA GGTCAGTTCTCTTTTAAAAATGAGGTATTTTAGTGTGTTGTTGGCGACAA ACATATCACATTGTGTTTAAAGGGGTGCTTAAGAAAATAAACCAAGCATT TGCTTAAGCACCAGGGCTTATTTGTATAAGAAAGGTGCCATCTTCCTAGT GTAAATAAGCACCAATGCTTAAATAAAAACCGGCTAAATGTTTGAAGCGC TGATTTAAGCATTTTGCATTGTACATGCCCTTATAGTTCCATTTCAGTCA TGGAAAATACAATCTGAGAATTTGCATGAGCTGTTGTGGTAATTCGTGTC TTACTAAATGCAGGTCAAGGCTGTATCACTGAATCAAGTTATGTCAGAAG GTGCATATATGCTATTCTATTTGAGGTACCACCAACCTATGATTTGTTTG AATTATTCCCTTGTCTTCACTAGTCTCATATTTGCAAAATCTCATTCAGA TCTTTTCCTCGCCCTCCGAGGATCTACATTGAGAAAGGCCTATTGCCTGT TTCATCATCCTCAAAGCGTCACTCGTCAAAATCCTCGAAAGGCTCTAAAC AAGATCAGAAGCAGACAGAATCACTCTTTGCTTCTGATGATCAAATCCGT GGTATTTATGATTTTAGACCGGACGAGGAAGGCTACTGGCAAGATCAGCA GGCCGAGTTAGGGTCCAGAAATTTGTATCACATGGATGATGCTTTTACAG ATTCGGTCAGCACAGACTTCTCGGACGCCACATCAAGTGAATGGTCGCTG TTTACGAGCTCTGATGAATCTTCATTTACCACTGAAAGCACTAGAGATTC ATTCAGTGTCGTCGATTATGGCGACAATGCTGGCCTGGATCCAATCACCT CAATATTTGGGCCATATTACGCTCCTGACCATCCTGCTGGCAGTTTCGCC TCATGCACAAGGTTCTCGCCTTCCAATCCCCAAACAAGATACCATTCGGA AAGCACAGGCTTTGTCTTGGATTCTTCCTTGCCAACCCACCCATATGGCA ATGTACATAGAGGAAGATATCCAGACAGGGCCTGCACATCTTCAGCCGAA CCGCTTGCTTCAGCGAACCAGCGAAGCGTGTATGGTAGGTATGGCCACAG TAGAGATGGTTTTGTTCAAACATCTGGGTTTTGTCACATGTAATGGCCTC TACATCTGATAGTTTTAGCTGGAGCTCGGTGGCTGTGGTTAGCAGCTGCC TGTTAATATCGCCTCATGTTTTATTTTAGGTGAGGCATATTTAATCTTAG CTGCATATTCTAGAGGTAGGTACCCCTGTGTAGCGAAGTAAACTAGATTT TCTGTCTAGATGCTTAGCGTCTGGGATGACATGTTAGAACTTGGGGACAG GCCCTGTGCAATCCTTGTTCATTCTAAAGATGGTCAAGCAATTTATTTAT TGTGTGGAGGAAGGTTCCATTGTCTTGAGATTTCTGACATTCTTTGAGCA AAGGAAAAGAGTTCACTCTGAAGATATGGCTGATTTGAGCCTCTGGGGCC ATTTTGTTCAGAAAAATGAAGTTTGGTCTACCCGGGAGAAAAGTTATGAT GGCATGTACAATGCAAGGTGCTTAGAGAGATGCGTAGGAAAAATAGATTT CTCTTTAGATGCTTAGCCAGCTGTTTAACTAGGAAAAATAAGAAAAGTTT GATTTATTTTTGTAATCACCTTGCATTATAGGTGGTTTTAGGAATTAGGA TATCGTTTGATGTCTGATGTTATTACTTTCATAAAAAGGATGTAACAAAT TTATCTAAATTTAGATAATTCTATATACTAAATAGTGTCTAGATACATTC AAATTCAAATTTAGATAAATATCGATATCTTTTTCAGAATGGAGGGAGAA TCGCAGATTTATCCAAATTCGGATGTATCTAGACACTTGTACTGCCAAAT TTGGATTTATCCAAATTCTGATGTATCTAGACACTTGTACTGCCAAATTC AGATTTATCCAAATTTGGATGTATCGGGACGAAGGAAATCCGGATGTACC TGGACGAAGGGAGTACATCAGTGTGTCAGATTTATCCAAATTCGGATGTA TCGGGACGAAGGAAATCCGGATGTACCTGGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.