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GrainGenes Sequence Report: AE031247

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Sequence
AE031247
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031247
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCATCTCGCCAGAAACCCTCTGTTCCCGCGGCTCTGAGCCCTAGATACC
TTTTGCTGCTTCCTCGCCGGCGATGGCCGCGCCGCCGGAGACAATCCAGG
CGCCGGTTCCGCGGAAAGGGGAGGAGGGAAATAACGGTGTCGAGGTCTGC
CTGTTCGATGAATCGACGGAGGAGTTCTCCAACGCGGTACGCGCCATCTC
GGAGCTCGCCGCCGGCGAGCCCGAGCCGAGTTTCCCCGACACTGAAGTAG
ACAGGCTCTCTTCCTCAATAACGTTCCTCAGGTGAAAAACCGCTCTCCTT
GCTCCCGCTACGCCGCTGCCCAATCACCGAGACAGAATTGGTAATTTTCA
GTTGTTGGGCGTGTGGTGGCCGTGTGTAACGGCGACAAAAAATTAATGGT
TGCTTCATTGGTTGAGCTTTTACACGTGCTGCCGGACTTAATTACGTGGT
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GGCACTGGATCAACTTCATCCAGAGATGACACACAAGAGATAACCTTACC
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GAGGGCGTAGCTTCGCTGATTTCTTGGATCATATATGTGCAAATCAATGC
AGGTCACACACTTGGAAGATGGGAGGGATGATAATACAAACAGGTATTAT
TTCTAGAATCTAGACTTCTTTAACTATACAGAATCTATTTATTTTGTTAC
ATGATTCTCCAAAGTAGTTACAGAAGGTAGTATTGTCGTGGAGAGATACA
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TACCATTCAAAGGTCGCTGCACATGGACTGGTAAGTAGACAATTATTTCT
TGTGTTGTTGGTGGTGAGGAATTTTCTACACAAGTACAATAATTTCTTGT
TGTTTCACACGTAGCATGACCTCAAATAGACCTTTCATCAATACCTTTTC
TAATTATATACTAGTAAAAAATATTTGAAACAGTTAATGATATGAAAGTA
CTTCCATTGACCAATGTAGGAATACCATTTTGTGCTTTTGTGTATATTAG
CGATTAATAAAATTTTAAGTTTTCTGACTGCACATGCTGTAAAAGTATGA
CGATTTAAGAATGAAATCAGTTTTGTCTTGGTCCAGGATTAATCGTGTAT
AGTGAGTTGGGTTTTGCTGCTTTTGGGTGATTTATTAGTATGAACAGTGA
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TTTTTTTTTCTAAATTTCGTTAACTGAAATTTCAGTAGTGCCATAAACTA
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GAACTGTGATTAAATCTCTTAATTGTTGCAGCTCTGATTTCATTTTGTTC
GCTGGGGGAAATGTTTGGTCGGTTGACTGGTGCCCAAGGTTGTGCGACAA
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CATCTTGTTATCCAATGTTTGCCTTGCAAGGCTATCTGGAGAAATGTGTT
GTTCACTGCCCAAGTTTAGCAACGAGAAAAGGACATAATCTGTTTGCATG
ACACGTGGGTCCTAAGCCCACATGTCAATGACACATTGATTCGTTTTAAT
TGACTGTGTACTTTATGTTGGCATATAGATATATATCTGAAAAAACTCTA
GACATACGTTGCAGTACTTTTCTAGTGCATCTTTGCATTCTGGCTCCTTG
TATTTTTGCACTTATTTTTCAGCATCTATGAATAGTACTCTCTCCGATCC
ATAATAAGTGCCCCTCATTTTGTACTAAGCTAGTACAAACTCTGTACTAA
GTGAACGACACTTATTATGGATTGGAGGGAGTACTTTTTCTTCTGATTTT
TAATTGCAAGAATTTAGTAGATTTACAAAACGATTAGTAGAACATATGAG
TTACTTAGAGCTGATCATGACCATCTATCTGTTGCAGTATCTCGCTGTTG
CTGCTCATCCTCCTGGTTCTTCTTACCATAAAATTGGTATGCCACTGATT
GGCAGAGGCATGATTCAAGTTTGGTGTCTCGTAGCACCCTTTGAAGAGGC
ACATACTCATCAGTCAACGATTGAGTACAGTAAGGGCAATCGTAGAGGAA
GGCCTAGAAAAATACCAAATGTGAACAATTCTATTGACAGTTCATCAGTT
CCACAAAAACCTATAGGGAGACCAAGAAAGATAAAATTGACAACTACTGA
TGATCACGCAGAACCAAGTCCGAAAAGACCAAGAGGAAGACCAAGAAAAT
ATCCGCTCTCCATTGCCAAAGTATTAGATTCAACGGGAAATAATGGAAGT
CAAGATCCCAGTTTTATTGACCCTCTTATCACTTCAGGAGTTATTCCAGG
TGATCTTGCATTGTCTTGTGCCATACCAACTGTGAAGCTTGCTGTATCAA
CCCCCAAAAAAGGTAGGGGTCGACCTAAGAAAATGCCTAAGTGTTCGCCT
GTCGTTGAATTGAAAGAAGATATGTCTAGAGCTCTAGTATGTATAGAACC
AAAGAAAAAAAGGGGGAGGCCCCGGAAATGTCCATCCCCAAGCAGCAGCA
AGCCTGTTTTGGGCACTGATACTGAATTTGGAAGAGAAATTGCGTGCTTA
GCTGTTTCAGTTTACAATTCGGGCCACAATGTTGCAGAACAAAACAATCA
GACAATTCCCAAACCAAGTGACAATGTGGCCTCAGTTGAAAATTGTGAGA
AAAAAATAATTGTCTACACCAGAAGGCGTGTACGACGACCTATAGAGAAA
TCTGCTTCAAATGAGACTTGCTCACTGGTTCTTAGTGGTGAGATACAGAA
GATGGAGAAATCATCCACGTCTATCATGCCTAATCATTTGTCTTCTGCCG
AGAAGCCCAAGCTACTGGGTTCATCTATAAGTGAAGACATGGTCAATGGG
GATGTTTTGGTTGGATCTAAGAATGCAGTTGTTAACTGTGAAGTCATGGA
AATGAATGATGGCGAGGCTCCCAATCAAATTGTGCATGTTCCTTTTGAAA
ATAGTGCCCAGATCATTGATGAATTGGAAGATACAGAAGTAGCTCCATTC
AAAGAATCAAGTAACAATAATAATATAATTACTTGTTCAGAAAAGTTGAA
CTTTTCTGCAATCCCAAAAGGCCTTCATCTACCAAGGGTCGTCTTGTGTT
TAGCTCATAATGGCAAAGTTGCTTGGGACATCAAATGGAAGCCTCCTTTA
CCAAATCAGTCAGAACAGAAATCACGTTTGGGTTTTCTTGCAATACTGTT
GGGAAATGGCTCACTCGAAGTGTGAGTACATCCTGTGCTAGTGATCATCA
TTTTGAATATTTTTTTCATTATTTTTTGAATATCACCACTTCTTACGTAC
TTATTAATTATTTTGCACAGATGGGAAGTTCCATCTCCAAGCATGATCCA
GAAAATATTTTCTTCTTCTTTAGTGGAGGGAACCGACCCTCGCTTTCTAA
AGCTGCGACCTGTATTTAGATGTGCTAAAGTGAAGTGCGGGAATAGACAG
AGGTATTCCGACTTTTACTTTTCATTTTGCTATTATAACTAGGTGGAAAA
TAAAAAAATTCCGTTAAATTCGTCAGCATGAATTTTCATTTTGAAGCCAT
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TTCTCCTCATGATATGATACTGGCAGGATGTCATGATGGAACGGTATCTT
TTCTACCTGTATTAAATTATTTCCTTAGTTTAGATCAGATAACTTCACTG
TTGGGTTATAATGTGCTATTCTGAAAGTTTCATGGTTGGATTTTGATGTT
CCAGGTTGCTTTATGGAAGTTCTCTACAGACTTGTCATCACAAGGTATTT
TAGGGTCTGTTACCCTCCTTTTCATAGGATCATATCACTTATGCCGTTCA
CCTGTTTAAAAAGCAATCTATTTGAATGCCTAAAATGCATATCTCCTATT
TATTTCGTCTCGGTGTTATATTAACTGGCTGTTCTGGTTACTGTATAGAT
TCAAAACCTTTTATGTGTGTCACTGCAGAATCTGTTCCCATCAGAGCCCT
CTCGTGGGCACCATATGTAAGGTACTAAGTTTTATTATACTTCTGTTTTA
TTCCAGAAGGTAAACACTGAGTTCTGACTTCATATCATTTTGGCAGTGAG
GAAAACACAAATACCTTTGTCACTGCTGGAGAGGATGGACTAAAATTCTG
GGATTTAAGGTAGCATAAACTCTACTAGGAACTGGAATCAGTAACTTAAA
TCTTTGTTGCGGACAAAACTACTCTTTGCCACACGATGTACAATATTGCG
TATATGGAGCTGTACTGAGGCTTATCTTGATAGTTGATACAGTTTCCTAT
TTATTTGGTTAATATTTCACTCAAGAAGTCCACATAGAGTTATCTATTTT
TTTCCAAACAAATTGACTGCACTTGCAGTTTGAGAACCATGCATATTTTT
TGTGCTGTTTCGTAATGATAAAATTTGGGTCAATAAACAAAGGTGTTTTT
AACTGCTGAATCTGTTATTCCCACATGAACAAATATGCCTGTCTTTCAAC
ATCACTTTATAGTTGCCAAAGTCCACGGTTGTCATCAAGTTTTATGAAAA
AATTGAGGTGAAAGTAACCAACCGAGGTGTAGCAGCTACTCTTGAAAAGC
ACAAATTTCCTTGCACTAGCATAACCCTAGTTGAGTAGATATTGTCAGCA
CACAATAATATAATCTTGGATTTACAAGTTTTTGCTATGATTTTCTGAAA
GGGTTGCAATATTTAAATACTGATTTGCATTTCATTTAATTCGTTTTTGC
AGAGAACCATACCGTCCTCTGTGGGAACTAACTACTGCCCCAAGGGCTGT
TTTAAGTCTTCACTGGTTGAAGGATGCAAGGTAATATTTCGTTCCATTTC
TAGCAACTAAATGTCATTTCGTTTTTAGTAACAAGTTCCATTCTCCCATA
GTAAATTAATCCTGCAGACACTAATGTTACTCTGCTTCCTTCACTCTGAC
ATTTACTTAGCTTTCATCACTACCCATTGAGATAGCTAGCCTTTTTTTAC
CCATTTAGGGACTTGGTTTTACCTTGTTTTTCACTTTTCCCTATATGTAA
GAAACAGCGATTGTTGCTAATGAATGGAATCTAATGTGCTTGAATTGAGG
CCTCTTCGTCCTGGAATTTTATTTAAATCAGAGGGCGACTTGTATATCAG
TTACCTTGGTGTTTATCCATTTTTAATCAAGCATCATAGATTGGTTACCA
TTGTTGAAATATATTGCCCGCCCTTCTCCATCAGTTCGGACTGATGGGTG
AATTGGTTAGGTGCAAACAACTTGCAACCAGAGGTTCAGGGTTCAAAACC
CAATTAACGCAATAAATAATTGAGACCTGCTTCAGCTTAACTGGGTTTTG
AACCCTGAACCTCCAGTTGCATATTGTATGCACATAACCAATTCTCCCAT
CAGTCTGAACTGTTGGAGAAGGGCGGGCAATGTATTTCAACACTCCCCCT
CACGTCTAGACCCCACTAGGCCTATGTGGGATCGATGAAACCCGCAAATA
TTTTTTATTAGATACTGCATTGGCCAGGTCTTGAACTTGAGACCTTTTGG
CTCTGACCATATTGACTTGGATGCACCTACCAGCTCACCCAAAAGTTTGA
ACTGATGAGAAAGGCTCGTAATATATTTCAACAACATTATGCCCTATAAA
CCATGTTTACCTTGGCCGAGCAAGTAAATTGGGGTCTAGTCCCGTTCATT
TTGTCAAAACTGTTGGGTTTGAAGAGGTACGATGGTTGTTTCCACTTTCC
ACTTTCCAGGTATACTAGTAAATGAGTGCGTTGCATGTCCTCGTGATGCA
ACAAGTATCTTTTAAATTCCATTTAAGTAAATCGTTTAATATAACGACTC
ATCGTCAAATCTTTCTGGCTACTAGGAAAATAGTCACCCGTGTGCAGATT
AAAGTTTGCCTTCTTCCAAGTTTGATACCTAAAACAATTACATGGGAAAT
ATTGTTTTCCACCTATGTGTAGATTGAAGTTGACCACATTCGTTGTATCG
CAATAATATGTGTGAAGATTAAAGATATAAGTTTCTTCTGCAAGTACTAT
ACACTCTTGCGTAACCTACGATTAAAGTTGTGTGGCCTGGCTCGTTCATT
TTACTGGGGAAGAGACTCATTTCTGCTTTTATATAGAGTTTGCACTTGTA
GTTTTTTATTCACCCATCCTTTCAGGTCAAAATTTCCTAGGGATCCCCTG
TAAGTTATGTAACATATATTTTTATTGAATATATAGCAGTAGGAGTCTCT
CCTGCTGTAAGGTCTCAAAAGAAAAAGAAATGCCCTTTAGCGAGGGAAAA
CTTCCATGTAAAAAATTGAACATATGGGACCTTAACTCTTTGTCTGAATA
ACATGTCAGTGCAACTATGATGTTAATGTCTAGAAGTCCTACCAGCAACA
ACACGTGCAAGAAGGAAGTCCTAATACAGTTTTTTTTTCCTTAAATGCAA
CCTGATTCTTGTACCCACAATATACAGTACACGAATACATTCTCCACAAA
TATATGGATAAAACAAAATATCACTGTTTTTCAGAGCTCCATATATACAG
ATTAAACAAAAATCAAACATAGAAGATACTTCATATGAAACAGGTGAAAG
AGAAACATTCATATGAACTATAAAACTATCATCAAATGCCTAATGGTGTA
GCATAAACAGTACAAATAAGATTCAGTGGTGGATCACACGGCTCCAGTCT
GAGCTCTGACTGCATACAATGTGTCTGCAAGTACTTCAAGAGAAGGCGAA
GTGCAGCTGTGCAGGTTAAGGAGTGTTAAATATTCGAATGCTTTTGGAGT
ACTTGGTAGAGTCAAATGGAAGAAAATCTTAAGCTTTGCATTTAACCTAC
AAAGACAGATGCAAAATATCTTGAATTCCACCAATTGAGAAAGAGTCATA
AGGAATGCATGCCCTTCAGTTTGGAAGGAGTTACCTGTGACCGCCGAGTG
GGTTCTGGGGTAGTTTTGTCGGTCGGAGAATTTTGCACAGCTCCACTCTT
CTGTTCCATAACTTCCTGTCAAAATATATTTATACATCAGGTCCAAACCT
CTTAGTGAAGATAGTGATATATCCGCCTTCTATAAAATTAAGGTACGCCT
TCGGCATACTCTCCAAAAAAAAGAAGATAGTGATATATTCAATGGAAATA
GTAACAGCCAGATATGTATCATGCTCTACTGTTTCTCCGACAGAAAGAAA
AAGAAGGAACGGGGAGGAGATGTACCAGCAGTAAGATGAATACTAATGTT
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ATGCTGGATTAAAATGAATATACAATGTTTGAAAAGTCCAATGGTGTAAA
CTGACCTCCCCACAAGCCTCCATGGCAGCAAACCATTCTCCGAAAATTTG
TGCACTGCCTAATTCTTTCATAAAAGATAAGGAGACACTATCAATATACT
ACTAGTAAGCTTAGGCGCGGCGGCACGCCGTGCCCATGGTGATATCTCTT
TTTTGATAATTGTTTCAAAATGCACTAAGTATTTAAATTGGACCATGTGT
TCTAAAGGTTGCAGACATTTGTGAAGTATTGTGCTAACCTTAAGGTTTGT
ACACCTGTTTGTCCTTATAAATCGTAAGTGGTGTTAATTAAATTTGAAAA
TGTCATAAGAATTATATGTGTGATTACATGCAGCACAAAAGTTTGTCAAT
GTAGTAAGCAAACTATATCTATAATTTCAATAAGAAATTAAAAGCTAGGC
TTGAAAGGTCTAAACAGAGTACATTTATGTCCATTTTTTTCAACCTTTGG
TGCCGTAGAATTCAGTACCTATATTGGGTGGACTGCATGATAGTCCTGAA
CTATGGCAAGTTATGCTTGCAAATGCTCGTGAGAGTGTGACTGGGTGCGG
AGCAATGGGCTTTTACCGTCTGCGGTGGTATGTGCCGGTTGATAGTGTGA
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AGAGATGCGACATTTAACTGGATTTGATCGGTCGACTCAGTCAGGGTTGG
TCTAGGTTGTTGGTGGCATGGTGCTTTTGCGCAGTGGTGTTAGATCAAAA
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AAAAAAACAGGCCTCTGGTGGAAATAAGATAAGCCAATTATTTCTATTTT
TGATGTGCCATAGTATTGTAATTGCAAAGAAAGTTACAAGTGCATGATAT
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GATTGATGGGCATTTTGTCCATGAGCACTTCTCATTGATGGAAACTAAAA
CGTAAACAGTAATCCTACCTTGCACTAGGGGAAGGGGCGGGTATGGCCTC
GGGCAGCGGCGTCAGGGTGGAGACGACGGCGCAGAGCTGTTGAGGAGGCG
GAGGCAGCTGCCGGCGTCGAGGCAAGTACACAGTGCACGATGTGGCGAGG
GCGGCAGTGGATCGAGCTGGCGGCAGCGTTGTTGGTGTTGATGGTCGTGT
GGCGAGGGGCGGCGAAGATGGCGCGCGGCGGTTGCGGTGGCGTGGCGGTA
ACGGCAGGCGGTGGTTGCGGAGGCGTGGGTCGTCGAGCGTGGGGCGGCGG
CGGTGGTGGGGGATGGCAGAGGCGAAGCCCTTTGTTTTCCTCTCGGTGTA
GAGGATTAGGAGATGTTTGCGGGACTAGGGAACTGTTTGCTTGATGGTTT
CGTCATACAACATTTTGTTGTGTTTAGTTGTTGGATTAAGAGGGACGGAC
GGTTCAGATGCTTCGGATCTGACAGTCTGTCTTTTTGTATTAGCGTAGAT
AAACCCCTTAGGGACATAGGCATGACATGGATCCAAGATCTATCACTTGG
CTTCCCCTAAACAAAGTGAACATGCAAGCTTGCAATGTTTGGTGAGGATT
ATAACATTGAAGAATGGCTAACTAAAACTTGCTTGTCCAATATGATATTT
TATATTTGTCCATGATTATGTCTACTGTTTATATGTGCAGGTTATATTAT
TTCATGTCCAGTAGTTTAATAATGTTAAGCGTGGTCAGCAATCTTCTTTT
CACATGATTCTATGTTAACTGTTACCACTTTTCATGTTCAGAGGTATTGT
CATCTCATTGGAAGATGGCACATTGAAGTTTCTCAGCTTACCCAAAATTG
CTAATGATGTTCCAGTCACTGGAAGGCCATTCGCTGGGACTAAAACTCAG
GGCGTTTCTACTTACCAGTTGTCAGAACATTTGATATGGAATGTCCATGT
TTCAGAAATTACTGGTACTTTCCAGAACCATGCCTAATCATAGTCAATAT
CCACCCTAAGCACTATGCGTTACAAGTTTTCTCATAAGAAGTCTTGGGTT
GTACCTGTTTTTTGATTTTTAGAGAACTATTTGGAATCTGGAAGCACAAT
ATTGGAGGCCCTCACACAGTTTGTAAATAAATGAATATAAAGATTTATGC
TATTTACCGTATACACTAATAATTGAGTAGTTTATTGCTTTTGTAATTTT
CACCTCTGATGACATCCTGTTTTGGACACTTGCTTATCTTTTTATTGCTA
TTTTATTATTTTAGTAATATTCTCCTACATCTTGGACACTTGATAGTGTT
ACTTAAATAAATCTGTATATAGAAGAGAGAATTAGTAGCTTCTCTTAAAA
ATATCAAACTCAAGCACATAAAATCGCTATGATCCTTAAATTTGCAAATT
TTTGCCTATTTACAGGTTATGCAGCTTATTGCGGGGCAGATGGTACCGCT
GTGCGCTTCCAGGTAGACTCACTAGCCTGTACTCAATAACCATGGTCACT
GTCTATCGGTGCTTGTCATTCAGAATCTCTGTGCTGTGCTAAACAAATAT
TCCACACGTGTAGCTTACTTCGAGATTCTGGGAGAAGGAACCTGGGAAGA
ACCGTGTACCTTATTTCCTTTGTGGTTCGTTAGCAGAAGAGGGATCCGTC
ATTAAGATTGGTGGTACGTTGCAACACTCTCCTCTACCAAATGTTCCTCT
TGTTGCAAAGAAGGGTCCAAAAGCGCAAGATATACGAAAAGAGAAACTAC
AAACTATCACCAACTCAGGTAAAACTCTTTCCATTTTGCTGCAACGTGTA
TCATTGGCTTACTACCTCACACGCCCACTGAACCACCCGCAGAATTTGTA
GATCCAGAACCCAGAGAGGGTCAACTAGATGGACCTGATGAAGGTCAAGA
AAGTCATGCGTTAGTTTTAGCTGATCATCTAATGCAAGAAAATGGTGGCA
TATGCAAAAACACGGTTGATGAATACCCTAAAGACTTTGAGGTCTTCCCT
CCCAAATCTGTAGCACTGCATCAATTGAGATGGAACTTGAACAAAGGTAG
CGAGAAATGGTTATGCTACGGAGGCGCTGCAGGCATTATTCGATGCCAGA
AGATCTAAAAGGCAATCACAAGTGGTGAATGTTCGCAACAAACCAGGAGA
ATCTGCATTATCCACCACCTACACAATAAGCTGTTGCGGCATCTGCTGTT
ACTTGCAGCAATATATTGATTCTTGTCTCCGACTTCTGAACTGTTGGTTG
CTGGTGATGCCTGAACTACTCATCCTGTCTACTGACATGGCAGAGCTGTG
TAACTTAGGAACTCCAACAGATCCTTGCAGTTTAGGAACTCAAGTTCAGG
CAAAATCAGCTAGCTGGTCCATTGTATCTTGGGCTCCAGCAAATTATAAA
GAGCTGGTTCTGAAAATATTATCAGCTTAGCAACTCAATAAGGGGCATCA
GTACGTAGTGTGTTGTGGGGCTTAGCCCCAACTTTTCCGAGCCTGGTGTG
GTTGTAACTGACTGATTCTTTCCTTTTCTTTTCTCTAACAAACTGATGTA
CATGTATTGTTGATGCGGTCAAACAAACTGAACACTGCCCCCACCAATTG
TAATATCGATAAACAGAAAGACAATGTTGATTCAAATATGTGATAGAGAA
ATAATAGAAATCAGGAGCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.