Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE025015

[Submit comment/correction]

Sequence	AE025015
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE025015
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCAATGAAGATGTATGGCTTACCAATATCGACGAACATAACACGTGT TCTAGTGTGTTTGGAGGAGGTTGGTGCAAATTACGAAGTTGTTCCAATTA ACTTCTCCATGGGTGAGCACAAGAGCATCGAACATATTGCACGTAATGTA AGTTCCCTTTTTTTAAATAAATATATATCAATTCTAGTGGACACCATACA TTTTCCTTGTCATGGATTTGTGCATCTAAGGACGCAAATCCAAGAAAACT TGTCTTTCTTTATTAGAAAAAACAACTTTTCCTTACTGCATTACAAATAT GGTAGAATGGGGTAAAACCCACTGAATCATACTTTGCTAAGTGAGTAATA AAATGTTGATTCACAATTACTAGGAGTGAGATGTACAAAGTTATAGATCT AGTTTTTCTATAGTTTTACCATATTCATATTAAAATGTTGATTTACATGC TTGAGAGACTTCTTGACTCTTATTTTGTTTCCAACAGCCATTTGGTCAAG TCCCAGCTTTTCATGATGGTGATTTGGTTTTGTTTGGTAAGATAATGATT TGTTTTCTCGTAATGCAACCGTAATTATAGTTCTATTTTCTTATTACTCT TCCATGCGTATATTAAACTATAATTGCAGAGTCATGCACAATATCTAAGT ATGTTCTCCACAAGAACAACTTTGAACTTCTGAAGGAAGATAACCTTTCT GACTTGGCTAAGGTTGATATGTGGCTGGATGATAGGCCCATGTCAGTTAT CATCTACCAGTGTCTCATAATTCCTAATTATCTTGATGGAGAAACTGATG TCTAGGTTGTTGAACAAAATGTTGAGATGTTGAAGAAAACATTTGATGTC TACAAGGCTCGCTTGTCTAAGTTCAAGTACTTAGCTGGAGATTTCATCAA CTTGGCTGATCTGAGCCATTTCCCAACTGCATACTACATGGTGGATACCC CACATACTTCACTGCTCGATGAGTGCCCTCATGTGAAGGCTTGGATCACT GAAATATTGGCTAGGACAACTGTTAAGAAGGTTGCAGATATGATGAAGGC AACTTCCTAGAGAATCCATGTTTGTCCTTGGAGGTCCTGTTGTTTTAGAA TAAGTGAATTTTAATGAGAGATGTACTAAATAATCTTCATTTGCTCTCAT TGAGACTAAAATGGATTTGCTGAAAATTTAATAAAGTGAGAAAATGTGAC CCTATTAGCCAAAATTTCAAGAATACTTAATGTGTGCCAAAAATTTATCA GATATGTTGAACCATTTAAGGGTATGATCTGCTTTGTTGTACCTTAATAA TGACTTACAAATAAGAGTCCTACATGCATATCCATAAACACGATTTGTGC AGCACCTTTTACTTTTAATCTATGTGGCTTTTCTGCATGGTTTTTCATAT GCTTGGTGGTCGTTGCCCATGGTCTCTAGTGGGGTAATGACGTGAAGCGT AGGGTCCGAGGACAGAAAAACATGGAGCTATTATGTTTGTACAAGAAAGT TGTTAGCACTAATATTGATATTATGCATTGTCCATATATTCGAGAGTATC TAACCACGGAGAGCTATTTGGTATTCTTTGGTATTCTTTATGCCTCTCGT TACGTTTTACCAAAGAATATTTAGAAGTTGTCTTTGATTATAGAATGAAG TGTTTTGAGAGAGTTATATTTGTGTGCAAAAGACTGAAGATTAAAACAAA GGGATGCAAACAAGAGACACATGCGATACAAAATGTTATAAAACTATAAG AGGGATAAAACGTTCTCAGGGAGTGTTGGATCTACAACTAGAATTGTGGT TACTTATGATTAGTATTGATCTATATCAGATGTAACTTTTCGTGTGGATG AACTTTCATATAAAAACATTTTGAAATGAGGTCGTACAAAAAAGTTATGG CCATTTTACTGGAACATAATGTTTTTTTTCCAAAAATAATGTTGGAATTC GTGTATTTTATTTTTCCTAACTACTAAATGACAAAAAAAATTAGGTCTCA AAGGATTTTCAAATTTGAAATTTTTATCATTTTATTTTATTTTTTCTAAA ACTGAAAATGGCGAGGGGGGGGGGTGAGGCCACACTGCTTACCGCCAGCA CCCAACTATTCCCGTGCACTAGTGGTATCATGCCTTATAGCACCGACGGG TGGACTATGGAATATGCTGACGGTAGTTGCATTAGCCCTGGCGCCTGGGA TGGAAGTGTTGGGTTCACTACATAGAAAACAAAAAAATTCCTACGATGAG AACTATACGTCAAGATCTATCTACTAGATACAGAGCAAGGGGTGGATATA CATCCATGGAGAACTTAACCTCGAAGACAAAAAAGTTTTGTTAACGAGTT GAAACTTGTAGATGATGTAGTCGTACGCTTGCCGATCGCAAGATCGTGTG GATGTCCGACCGGCACAAATCAACAGCGCATCTGTCCTCGCACACACATT AAAGCCACCGGACAACCTCCACCTCCTCGCTCCAGCGAATCAGCTGAAGC AGCAACTCCTTCCAGACGCAAGGCCATGGGGAACATGTATCTCGCTAATC CGAGACCATGGGGGAATATCTAGAGGGGTAGAGAGATCCTTCACGAGGAG GTGTGCTTTGTGAGGGTGGAGAGGGGGGCCTTTTATAGGAGAGGCGGGTT CCTCCCCTACCATAGCCGGCGGCCAAGGAGGGTGCCCCCACCTCTTCCTC ATTCATGTGGTGGAAGCTCCACTCACATCAATTTTGACTCCACCCAAAAT TCCACTCACATGCATTAAATTTTCAAATTTAATGCAACTCTCAATTATTA AAACTCTTTTATTTATTTTATTCAGAATTTTGTTAATTACTTTAATTAAC AAACATTCACATAAAACCCCTTGCAACATTTCAATATCACATAACCACTT TCTGCGATTTCACCGAAACAATTCCGGTTTCTATCGAAACAATTCCTGCG CTTTGCAATCCTTTCGTCTGAAACATATGTGGTCCTAAATGGTGTCCAGC AACCCTTAAGTGTGTCACCCTACGGTTCGTGAATAATGCAGACATGATTG AGACTCCTCTCAGATCAATAATCAGAAGTGGAACCTGGAGATCCATACTG ACTCCTGCACATTCAACGATGACTTCTGTGATCGTGAGAACCTTTAACGC TAGTAATTTAATCCCTTTGTCTCATGATATAATACATGTCCGAGATTCGA TCATAGGTATCCAAATACCTAGTTTGATCTCGTTACCGACATGCACTCTT TTCTCGTTCCTGTGATATAACATTCTAGTGATCACATCACTTGATTGCAA GCTATCTCAATGTGATATCACTGAGAGGTCCAGAGTATATCTATCCGTCA TCGGGATTAACAAATTCCACTCTTGATCCATGAGCCTGAACATAACACCT TCGTAGCACTGAACCCACCTTTCTAATCACCCTGTTACAGTGTGACGTTT GATGTTATCAAGATACTCTTCCAGTGTTAGGAATTAACATGATATCATGG TCTAAGGACTAAGATTACTTCGTATGATATTATAGCAATATAAACATAAT GACTTTGATCGTAATGCTATATTTCAGATGAATGTTCATCACATCATTTC ACAAATGTTGTGACCTCGTTATTAACAACATCCAATGTCCATGATCAGGA AAGTTTGATCATCTTATTAATCAACGAGGTAGTCTATAAGAGAGGCATAA CTAGGAACCCTTTTTGTTTATTAAACACACATGAATTGACGTTTCCTATC AATACAATTATAGCATGCAAAATAAACATCTATCATATACGAGGAATACA TAATAACAACTTTATTATTGCCTCTCAAGGCATATTTACTTCAGTCTCCC ACTTGCACTAGAGACAATAATCTACTTTACATAGTGATAAATCTAACACC CATGGAGTTCTGGTGTTGATCATGTTTTTCCCTAGGGAGAACTTTAGTCA ACGGATCTGCTACATTTAGGTCTGTGTGTACTTTACAAATATTTATATCT CCATCCATGACATGCTCGCGGATGGAGTGAAACCAGAGCTTAATATGCTT GGAATTCTTGTGAGACCTTGGTTCCTTGGCGTTGGCTATGGATCCATTGT TGTCACAATAGATCACAATTGGGTCCAATGCACTAGGAACCACACCTAGT TCTGTTATGAACTCCTTCATCCAAACCGCTTCCTGCACCGCTTCTGAAGC AGCAACATATTCCACCTCCGTCATTGATCCAGCCACCACAGGTTGTTTGG AACTCCTCCAACTATCTGCTGTTCCGTTCAAGAGAAATACGTATCCGGAT TGAGACTTAGAGTCATCCGGATCAGTGTCAAAGCTAGCATTGACATAACA CTTAGCGACTAGCTCCTCTTCACCTCCGTATACAAGAAACATATCCTTAG TTCTTCTTAAGTACTTAAGGATATTCTTGACCGCTATCTAGTGTTCCGAA CCTGGATCAAATTGGTACCTACTAGTCAAACTAATAGCATGTGCCACATC CGGTCTTGTACATAGCATGGCGTACATTATAGAGCCTATGGCTGAGGCAT AGGGGATCTTATCCATTATCTCTCTTTCTTCCATCGTAGCCGGACTTTGA GTCTTACTCAATGTCTTGCCTTGCAACATAGGTAAGAATCCTTTCTTACT TCCATCCATATTAAACTTCTTTAATATCTTATCAAGGTATGTACTCTGCG ATAGCCCAATTAGGCATCTTGATCTATCTCTATAGATTTTAATGCCTAAT ATATATGAATCGTCACCAAGGTCTTTCGTCGAAAATTTGCTCTTTAGATA ACTTTTAACACTTTTTAAAAGATATATATCATTTCCAATCAATAATATGT CATCCACATATAATATCAGAAATGCCACATTGCTCCCACTCACTTTCTTG TAAATACAAGCCTCTCCATAAGTTTGGACAAGTCCAAACTCTTTGATCAC CTCATTAAAGCGGAGATTCCAACTCCGGGATACTTGCTTCAGTCCATAGA TGGATCGCTGAAGCTTGCATACCTTATCAGCATCCTTAGGATCGACAAAA CCCTTAGGTTGTATAATATACAACTCTTCTTCAATATTACCATTGAGGAA CGTAGTTTTGACATCCATCTGCCATATTTCATAACTGAAATATGCAACAA TTGCTAACATAATCCTAACCGACTTTAGCATCGCTATGGGAGAGAATGTC TCATCGTAGTCAACTCCTTGAATTTGTCAAAACCCCTTTGCGACAAGTCG AGCATTATAGATGGTCACATTACCATCAACATCAGTTTTTCTTTTGAAAA TCCATTTATTCTCAACGGCCTTTCGATCGTGAGGTAAGTCTACCAAGGAC CAAACCTGGTTTTCGTACATGGATTCCATCTCGGATTTCATTGCTTCTAG CCATTTGTTGGAATCAGGGCTCATCATCGCTTCTTCATACGTCGCAGGGT CATCTATTTCATCAATCATGAAATTCATAACATGATTGCCATATAGTTCA GGAGCTGCATGTGTCCTGCTTGACCTGCGAGGTTTGGCAGTATCCTCTTT CAAAGTTTCATGATCATTATCATTAGCTCTCTCTTCATCAGGTGAAGTCA ACTCTGAAACAACTTCCGGTGCTACGCCACTCGCCAATTCATGAAGAGAA GGTTCAATAACCTCTTCGAGTTCTACCTTCCGACTACTCACACCTTTCGC GAGAAATTTCTTCTCAAGAAAGGATCCATTCTTGGCAACACAAACCTTGC CCTCGGATCTATGATAGAAGGTATACCCAATCGTTTCCTTAGGTTATCCT ATGAAGACACATTTTTCCGCTTTGGGTTCGAGTTTATCCGGCTGAAGTTT CTTCACATAAACATCGCATCCCCAAACTTTAAGAAATGATAGCTTAGGTT TGTTTCCAAACCATAATTCATACGATGTCGTTTCAACAGATTTAGATGGT GCCTGATTTAAGGTCAATGCAGCGGTTTCCAGTGCATAACCCCAAAATGA CAGTGACAAGTCAGTCAGAGACATCATAGATCGAACCATAACGAATAAAG TACGATTACGATGTTCTGACACACGATTGGGCCGCAGAAATTTGATCCAG TGCATACTCTCCTCCACGATTGGGCCGCAGAAATTTGATCTTTCTGTTAT GATGATTTTCCACTTCATTCTGAAATTTCTTGAACTTTTTAAAAGTTTCA GACTTATGTTCCATCAAATAGATATACCCGTATCTACTCAAATCATCTGT GAAAGTAACAAAATAACGATATCCACCTCGCGCTGACACACTCATTGGTC CACACACATCAGTATATATGATTTTCAATAAATCTGTCGTCCGTTCCATT GAACCGGAAAACAGCGTTTTAGTCATCTTGCCCATAAGGCATGGCTCACA TGTATCAAATTATACAAAATCAAGGGATTCCAAAAGTCTGTCAGAATGGA GTTTCTTCATGCGTTTAACGCCAATATGACCTAGACGGCAGTGCCACATA TATGTAGATATATCATTATCAAGTTTAATCCTTTTAGCATCCACATTATG AATATGTGTAATACTACTATCAAGATCCAATAGAAATAAACCATTCAACA CAAGTACATGACCATAAAAGATATCATTCATATAAATCGAACAACCATTG TTTTCAGATTTAATGGAATAACCACTTTACATCAAACACGATCCAGATAC AATGTTCATGCTCAGTGTAGGCACCAAATAACAATTATTCAGATTTATAA CTAATCCCGATGGCATATGGAGAGGTAGCGTTCCGACGGCGATCACATCA ACTCTTGATCCATTGCCGACCCGCATCGTGACCTCATCCCTTGCTAGCTG TCGCTTGTTCCGCAACCCCTGAATCAAGTTACATATATTAGCAACTGATC CCGTATCAAATACCCAGGTGCTACTACGAGTACTAGTCAAGTACACATCA ATAACATGTATATCACATATACCTTTGTTTGCCTTGCCGGCCTTCTTGTC CGCCAAATACTTGGGACAGTTGCGCTTCCAATGCCCAGTCCCCTTACAAT AGTAGCACTCGGTATCAGACTTAGGGCCAGCTCGGGATTTCTTTTCAGGT GCGGCAACAGATTTTCCGCCCTTCTTTCCCTTCTGCTTGCCTTTCTTGTC CTTCTTGAAACCGATGGTCTTATTGATCATCAACACTTGATGTTCTTTCC TAATCTCCACTTCTGCAGTCTTAAGCATTGACAGAAGCTCGGGAAGAGAC TTCTTCATGCCCTGCATATTATAGTTCATGACGAAGCTCTTGTAGCTAGA TGGCAGAGATTGGAGAACACGATGTATGCCTAAGTCAATGGGAATCGTTA TTCCCAAGGACACAAGCTTATCAGTGTACCCAGACATTTTGAGTACGTGC TCACTAACGGAGTTGTTCTCCTCCATCATGTAGCTAAAGAACTTTTCAGA AGCATCACAACTCTCTACGGCAGCAAGGGTATCGAAAATAATTTTCAATT CTCCCATGGTATCAAAGGCATTCCCATTTTCGAAACGCTTTCGAAGTTCT GGCTTACACTTCACCATATCCCTTTTCCCAAAATACTTACACATATCCCT TTTCCCAAAATATCATCTATCTTCACTCCAAAGCTTCGTATACTTCACTT CACCATATCCCTTTTCCCAAAATACTTACACATATCACTGTAACCAAGTG ATATGTTTCCTTGGAGAGATGGCCATGAAGGTGTATGGCTTGCCAATGTC GACGAATGTAGCACGTGTTCTAGTGTGTTTGGAGGAGGTTGGTGCAAATT ACGAGGTTGTTCCAATTAACTTCTCCATGGATGAGCACAAGAGCATCCAA CATATTGCACGGAATGTAAGTTCCTTTTCAAAATACATATATATCAATTC TAGTGGACACCATACATTTTCCTTGTCATGGATTTGTGCATCTAAGGACG TAAATTCAAGAAAATTTGTCTTTCTTTATTAGAAAAAAACAACTTTTCCT TACTCCATTACAAATATGGTGGAATGGGGTAAAAACTACTGAATCATATT TTGCTAAGTGAGTAATAAAATTTTGATTCACAAATACTAGGAGTGAGGTG TACAAAGTTACAGATCTAGTTTTCCTATAGTTTTATCATGTTCATATTAA AATGTTGATTTACATGCTTGAGAGACTTCTTGACTCTTATTTTGTTTCCA CCAGCCAATTGGTCAAGTCCCAGCTTTTCAGGATGGTGATTTGGTTTTGT TTGGTAAGATATTCTCGTGATGCAATCGTAATTATAGTTCTATTTTCTTA TTACTCTTCAATGTGTATATTAAACGATAATTGCAGAGTCACGCACAATA TCTAAGTATGTTCTCCGCAAGAACAACTCTAAACTTCTGAAGGAAGATAA CCTTTCTGACTTGGCTAAGGTTGATATGTGGCTAGAGGTGGAATCCCACA AATTTCATAGGCCCATGTCTGTTATCATCTACCAGTGTCTCATAATTCCT AATTATCTTCATGGAGAAACTAATGTCAAGGTTGTTGAAGAGAATTTCAA GATGTTGAAGAAAACATTTAATGTGTACGAGGCTCGCTTGTCTATGTTCA AGTACTTAGCTGGAGATTTCATCAGCTTGGCTGATCTGAGCCATTTCCCA ACTGCATACTACCTGATGGATACCCACATGCTTCACAACTCGCTAAGTAC CCTCGTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.