Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE017404

[Submit comment/correction]

Sequence	AE017404
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE017404
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ACTTTGTAAGAGGCAAGTCAGACGAGCCGCGTCCCACCCGCACCGATGGA AGACCCCGCACGGGCGCCACCACCGCCATTCGCCGTATACCTAGTCACCG GCGGCTCCTCCTCGCCGGACCTATCCCATCTCATCCAGTCCCTCGACGCG GCCCGCATCGTCGCCTTCGACGCAGAGTGGAAGCCGCGCCGCCGCGGCGC ATCCGCCCACGGCGACGATGCCACGCCGGCACCCCCGAATCCACCGCAGT TGCCGACGGTTACGGTTCTCCAGCTTGCCTGCCGCAGCGAAGAAGGAGGC AACGAGGTATTCGTCGTCGACCTCCTCGCCGTGCCGCTCGCCGACCTGTG GGCACCGCTGAGGGAGTTGTTTGAACGGCCCGAGGTGCTGAAGCTGGGGT TCCGGTTCAAGCAGGATCTCGTATACCTCTCCGCCACCTTCACCGCCGCC CTTGGAGACGACTCTGGATTCGATAGGGTAGAGTGCCTTCCATGCTAATT GTGTAGCTTTTATTATAAGATCGTCTACAATGTTCTCTATTGAATACCTC AAATTCCTTTTTATTAGGCAACACTGCTGTTGTAGAACTGGTTTATAGAT GTGGAAAATTTCTCCTAATACTAAATTTTTTCAGCTACATATCACAGCTG CCTTTCAGCTGGCTTTGGAAGAAGAGATTATGCATTAAAATCTTGTGAGT AATATTTTGCTTCCATTCATCTTTGCAAGGTGGAGCCTTTCTTGGATGTC ACCAACGTCTATTATTACTTCAAGGGGCATGACAGGCAAAAGAGGCTCCC CAAGGAGACCAAGAGTTTGGCCACAATTTGTGAGGAACTCCTAAATGTCT CTTTATCCAAGGTTAGTCTAGATGACATTTACTGCCTTCATACTGGAAAC TTCCATCTTGTCAGCATGGTTGCATGAGCCGTCAAAATTCCATTGCCATA TGAATCAATCGGTTGGCAGACATTTACCAGAGTAGAGACTGCTATAACTA TAAAATAGAAAGATTGTAGGATAGCTTTGCCAATCCTGTTGGTTCTGTTT ATTACTTAAAATTACTTGATCAAAACTAGTATTCTCTACTATCTCGATCA GCACATCTGATAAAAAAAAATCCTTCCTCCGTGATTTTATTTGCAGCTTT GCTCATAATTTCCCTAAATAGTCATGATATTATATATACAACTACATTGT ATATCCAATTCTGGTTAACCCACTACCACTAGTGTATCTGCTCCGAGCAC CTCTGCCTAGAGCCCTGAACAAAGCCAACATTGAGCTAGCCTGGCACAAA GGGTTTAGCTGAAGCCTAGTTCTTTCTACATGTAAGCTTGGTTGGTAGGG TTCCTTTTCCTCATACATATTCTCAGTAATCAATATGAAGCAGAGCTAGC ACTACCAGGTTGTTTGAGTAGGCAAATGTACAAACATATGCATATAGCAT CTGACTTTGATACAAGTCCTAATGTGAGTTCTTTAGCTGTTTTTTTCTGA TGAACATGCAAATTACTTTCAAGCTTCGTGGGCCATTTCAACTCAAGCTT CTTGGTCTTCTTGCGTAGTGCAAGCATGCAAATTCATCTTATTTGTCTTC TCTGTTTTCATCTTCACTACTGAAAAGACAATGCTCACATAAATAGTTTA GCATTAGTATTTCAATCATTACCTAATTTTCATCCTTATTACACTAGGAG CTCCAGTGTAGCGATTGGTCCTGCCGACCTTTGACTGAAGGACAAATACG ATATGCTGCATCAGATGCCTATTACTTACTAGATATATTTGATCTTTTTC AGCAAAAAGTCAGCACTGAAGGTATTTTTGCTCATGCTTAGCACCATTGA TTTGATCATGGGAATTTGTTGCTCTTTCCTTTTTATTTCTTGTAGGAGAA TAATGTCTCATGCGATGTTTAACTTGAAGAGCTAAGAATTGGTTATCCTT CATTTTTTTGGTGTTCTTGTTGTAATTATTTATTGTGCTATTGCAGAAAA AAAATTGCCAACAAAGGAACTAGCTTCAGATGAGTTTTGCTCACCAAGTG TACTAGAATGCTCATCATCTGGATATGCCATTTGCTCTGATGGCTATTCA ACATCCATTATAGCGAAGTATAGTGAGAGTATTTTGTTGACAGAATCAGA TACAAAAGCACGTTCCTCAAGAAGAAAAGAGAAACAAAAGCTTCCTACCG ATGCCAAGTACAAAGAGAAGTTTGATTGCAGTACTGAATGGCAGGGTCCC CCGCCATGGGATCCATCCGTTGGTGGAGATGGATACCCAAAGTTTTTGTG TGATGTCATGGTAACAGTTTTCCTAATCCCATTGCTATCAACAACTGTGT GATTTTTGTGATCTCATTCAACTACCACTGAATAAGATGAACTTGAAGTG TGACAGATATACAACCATATAAATTAGTCAAGCAAAGAAGTTGTTCTCTA TTTGCAAAGACTGCTAAATTTGACGTGAATTTTTTTGAACAGATTGAGGG TCTAGCTAAGCACTTGAGATGTGTTGGAATAGATGCCGCCACACCATTTT GTAGGAAACCTCAACCAAGGTCTTCCCAATACTTTCTGCAATAGTATTGC AACATTTGTATTGTAGTTTCTTATTAAAATTTATAATTAATATGTTATTA ACCACTTGTTTTAATTAGGGAGTTATTAAATCAAATTTATAAGGAAGGGC GCATATTACTAACACGGGATGTTAAGCTCTTAAAATATCAGGATTTGGCG TCTAATCAGGTATACAAAGTGAAAAGCCTGCTAAAGCATGATCAACTAGC TGAGGTATGTGCTTATTTTGATCTGTTATGTTTTCAATTTCAGCTATAAG TTGCTTTACAGATCAAACTCCTGTTAATTAGATTAAATTAGACCAGAAAT TTCATTAGTAAAAAAAAGCAAGTCGACATTTCTCTTGTTTGTTGATTCTA TGGTTATGCAAGCCCAAGCAATTGATATTTCTATCATTGGTCCAGTATGA GCTAAATTATTGGAGAGATACCTCTCAACACCTTGTTTGAACCAGTAGTA ACCAGTTTTTCTGGCAGTTCCTTGCAGTTACTTACTCCCTCTGCCCTGAA AAGGATGTCGCAAGTTTGTTTAAATTTAGATGAATCTATATACTAAATAG TGTCTAGATACATTCGAATTTAGAAAAATCTGCGACATCCTTTTCAGGAC GGAAGGAGTATATAAAATGAGAAATTCAAATTCACCTAGTTTTTCTGAAG TAACACTCAGTATTTGATTTATTATGTGCAGATGGCATTACTAGTTTTGT CATTAAGAGTACTTCCATGTCAAATGAATTCTTCATTACTAACACATAAA TATAGAAAGTAGTGGTTAAAGACATAAAAGGATTGTTGGAGATCGTGTTG ATGTCAAAACAAGAAGTAAAAAAAGTGTCAGGTTATAAACACTTTTAACC TGTAAAATAATTTTGAATAGAGCAGTACACATGGGAACTTGTGAGAGCAA GAAGTAATAAAACCAACCAGTCTTTCGACCGGAGGTGATGTGAACATGTG ATACACTGGCATTTATCAGTGATCACCTTTGATTCTGTTCTTGTCATGAA ACTCGGAGGGGAATAATTAGATTGAAAAGTTTGTGAGTTTTGAAAACTCG AAGGGTGAACCTAGATATATTCATTTCCTAATATTTCTATATATTATTTA ATGGATGCAAATATTTTTCCTATCTCATTAACTAATGAGCACAATAAAAA AAGACTTAGCAGCCTGCGTCGCCCTCCATCACAACTCTGCCTGACGTCCA TTATAGGCAGACTCACCACCAACACACACCGGTGACTTTACAGTGGTCCC GCAGCTGGCCCAGGACACTGAGCATCGTGCAGCTGCATCTGGGTGTCCCA AACCCCACATTGAGAAGCTAGATTCAGTAGTGACCCCAACAGCATGAATG TAGAGGGATGTGCTGCCGCTTCCCTCACCGCTCTGACCAGCGGTAGCAGC GGCAAGGAGGACGGTGGAGGAGATAGCACGCCCATGGCTGCTCCTAGTGT TTGGCTTGGTTGCCTCTGGTATAACTGAGGAGAGCAACACGGGATGTGGA GATAGTTGCTTTTCTCTAGTATTTCTATGGGTGAATTGTGTCACAAAGGA AAGGAAGGCTATTCTGATGCGAGCTGATTCAATTGCTTAACTTGCTTGTT GCAGGTGATTGACACCTTCCAGTTAAAGATCTCTGAGGACCGACTAATGT CAAGATGTACAAAGTGCAACGGAAGTTTCATCCAGACACCACTAACACTG GATGAAGCCATGGAAGCCTCAAAAGGTTTTCAGGTCATTCCCTCGTGCAT CTTCAACAGGAATCTGGAGTTCTGGAAGTGCACTGACTGCAACCAACTCT ATTGGGAGGTACATTGTCTTCTGTTCCAGTTCCCTGTTCAGAGCAGATCT TGTTGTCTTTCTACCTTTTGTATCCAACAATTTTTTATTTACCACAGGGA ACTCAGTACCATAATGCAGTTCAGAAGTTCATGTCAGTCTGCAACATTAG TGAGTGAGCATTTGCAACATTTCGTTTGTAACATTTTCAATGGCTCCAGG GATTCCATCACTTTCCATTGGCAGAATCATCAAATCTCAGACTGGGGAAC TGTTCTTTCAATAACAGCAAGCGATGAGGCAGACCTTTCAATTTGTTGGT GTGCTATCCCTTGTTGTGTTGTTGTAAATATGCTCATGTTGTTTTGCACC TGGAATTCAACATGTACTGGGGAACTGTTCTTTCAATAACAGCACCTTGT GTTTTTGTCTATCTCTTTAGACAAATAACCAGTCACAACTTTATCAAGTA TGATAATATCTACTCCCTCCGTTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTG TGAATAAAGTGTATCTAGACTCCTTTCAGTGTATAGGTTCATCTAAGTTT GGAGTGAACTACACACTAAAAGGAGTCTAGATACACTCTTTTCACAAAGC TAAAATCTTATATTTGGAAACGGAGGGAGTAGTTAGCAATTTACGAATTA GCAAGAAGAATTGCTGGACACTTTTCCATCCACATATTGGCATCTTTATT GAAGTTACATTCTACACTTCAAGAGTTCGCTGGAATCTATAGGCGAACAC CCGTATGCTAGTTAACATTTACACATATCTCTTAAAACCTATATACAGAG GTTACAGATGACAGTACTACGGTTGCACCACCCTGCCTTGACATTGTTCT GCATTGGTGAAGTTCATATTGTTCTTGCAGCGGTGTTTCAGATATCTGCA TTGATACCGAAAATACGGACTTTATGCATGTTTGGCAGCTTAGCTACGAC AAGCACTAAAACTGCTACAGTGTTGAGGAAGAGCATTGGCTGATTGTAGT CGGTCAAGTGTGACGCAATCAGATACCTGCAGAAAAAGCACATTTTAGAA CATACCAAGTCAGAGATTTTTAACAGCACAACATAAATTATCTATGTTGA CTTGATAACTAAGCTTGGACATGATCTCACAAAGGGCACTGTCTGGCCCG AAAAAACCTATATTCTGGTTATTCGTGAGATGCTTGGACATGATGGCAGT TCATGTTTCACTTATTCTAGAACTAACAGAATAAAAACACGGAAAGAGCG TGCTATGAAGCATGATGGCAGCCCATGGCCTATTCTAGAACTAACGGAAT AAAGAACATAGAAAGGAGTGTACATCAATATACACCTTTATTATTGCATC TGTGTTGATTCAAAGTTCCTATTTGAATGACAAGCACATAAGCATGAACA TGCGCACAGTCCAAATGGAATTAACTAGTTTATGAATCTCAGAACGAAGA ATGCTTCCACTAGAAAACGCTGGCCATCATAAAATGCAAGGTGAGATAAT AGATTTGATACTCATAACATACTCCATTATGGTGAGCTAATCAAATGCTT TCTATGTATCTCAAGTCCATTGGGGTGGAAAGGAACTTACAGGACAACAG GTACCACGGTTAAGAACTTCCTATTACGAGTAAGCTGCTGCCCATTGTCA ATTTGCTCCCACCAAGTCAATCTGTTGTAGATGCCTTGATCATCAGCAGC AAACGGAGTTCCTTTCTTCCAATGGAAAAAGTGGTAGGTGATCTGAAAAG TAAACAAGGATCTACTATTATGAAGAGTTTGGAGGAATGGAAATCTAGAA ACCAGGTTAAATACACAGGACATGTTTTACTGGACAGAACATGGAGAGAA CCATCTAAAGCATGTGTCCTATCAGAGATTCAGATTCTCAATGGCTAAAT TACCCTGCTTTGGTGAAGCAGAAAAAGTTGTGCGAACTTGAAATATAAAT CTCCAATCAGCCAAGCCAATCTCAGTATGGCAATACTCGATCCATATGTT ACCAGTGCCATGTTTTTGTATGAGAATCAAAAAACAATAAATTACGTTGC AATACTCAATTAGGCTTCATATAAATATAAATTGACTTTTGGCAAGTCCT ACGATAACAAGCAGAGATTCTAATAAACTAAACAAAATTTTGAATCAGCT AAGTAGTTGGTTTTGGCTTTTGCCAAGGCATCCCACAAACAGTACTAAGC AAAGGGGTGTAGTTGAGTTAAACGAATAGAATAACCCCACGTCAGAAGAA TTTGCTTTAGTACCCGCGAATAAATTAAATTACGCCAGAACACATTTACA GGATCATTTATGCGTAGAATCAGTGGCCATAGACTTGATTTATCAGTACA GCAACGATACATCATCAAAGGTACTAGCAACAGTAGAAGCCACACAATGG TTTTGCTAAGTTTCGTACGTACATCTATCTATCTATCTATCTATACTATA ATATTTCTTGAGGTAGGTTCGTCTACCAAAATTTTCGTTCTGATTTTTTC CGGACGGTTTTGCCCCTATGTTTTTTTGGAAATTACTCACCACTACCATC TTAAAGTGAAAAAAACGGGTTGATCGCTCCACCTGCTCCTTCTACCTGCC GTCCGCGCACGCGCGCGATTCCCCATCCGGTGGCTGGTGATTGGAACGCC GCCGCTGCCGGCTGGGACTGGAGCACCGCTGCCGGCCGGAACTGGTGCGC CGCTGCCGATTCGGCCGCCTTCTGACACCAGGTAACCCGCGGCAGCCCTT TCCATTGATTCTTGCATGGCCCAGCTACGCGTCCTTGCTAGGCTACGATT CCCCATCCGGCGGCCGGGATTGGAGCGCCGCCGATGCCACCCGGGATTGG AGCCCCGCTGCGCTGCCTCTGCCGTCCGGTAGTGGAGCGCCGCCGCCGAT TCAATCGCCGGAGCACCACGGGATGCTTCTGTCAAGGTTGGTGGACGGAT GCTTCTGTGAAGGTTGGTGGATGCAGCGACGCAGGCGTGCATGTGATTTG AAAATGAAGATGCCCTCGACCGTGGGCATGTGTAGTGTGTTATGTGTTTG AGTCTGACACCTGCTGCTTTTTTTGTTCATGCGTTGATGATTTCTTCAGA AACTTTTAGCATGCTCTTGATGCGTGGTGTACAGATGATTCTGAAAATTG GTGGACGCAACTTCCTGTTGATCTTTCTGTGCTGCTGTATTATCTTTCTC ACTATCCACTATGAGATTTTAATTTCAACGCCCAACAAAAGGAGACTTAC GGCAGATCTAAAATTAACTGTTTTGGAATTTTGAGCTCTTTCTTCTGCGA TGAATTATTCTACCGTGGTACCTGTGTGATTTTAACCAAGTGATTCTCTT TCTCTAATTCTCTAATCCGTTCGGTCGTGTGCTAACAATTTCACCCGCGT ACTCTTATGAGTTCTAGGTTATTTTGTGCTAAGTAATTATGCTATGACTC CCAATTATGATTAGAACAGTAGTGGTAATGAAAATCCGGATTAACAAAGT TGGTCTTTGAATTTTTGGCTGGCATGTTGTGTTTTGCCTGTGCAGCTTGG CAACAACACCGGTGATGTTTGTCCCCGACCAAACTATACACCTGAACTTC ATGTGCCAATTCAAGACCCTATCGCCAAGCTAGCAGCTCTGCGCCCGGTA TGACAGCGTGAGATGAATGCGTTGAGATGACAATAACTGTGTGCCTGAGA GAGAGAGCGTGCCAGAAAAGTGATGATGAGAGCATGGTTTGTAGTTTGAG TAACTAAAATGTCGTGATCTATTTCTAAGCTCGATAATATCGGCCGCTGA ATGTTAGAATATTTATGTGCATTGGGAAATGTTTTCATGTGCACTGGAAA ATGAAATTTGAGAACCCGTGGTGACGCACGGTAGCAGGAACTTCTTCTCG AGCCAAGCGGCTGGTAGACTGCGGCCAGTCTGCAGTAAATGCTACCTCCT CCAAGATTTTGCGAGACTTTAAAATTTTCTAATGTACCTTAGGGTCAAGC ATTTCTTATTTCTTTATTACAAATAGATGAGCTTTGTGTATCTTTGTAAT TGTACCACATTTTTATTTCAATGAAGGAGGTGCTATCTTGTACATCAGTT ATTTATAAAATTTATCCGTCGAGTAGTCTATATGCTTAAATTATTTTAGC CTTTGTTTAGAGTAGAGTTGTGTTTTTATACGAAGAAGGAATATTTTTAT TTAAATGAAGGAGGTGATACCTTGTACATCAGTTCTTTATAAAACTTAGC CGTCGGGTAGTTTATATGCTTAAATTTATTTAGCCTTTGTTTAGGATAGC GTTATACGAAGAAGGAAACCTTTTTACGGAGTAGAATCGTTTTCTTTCGA GCAAATAATTTACTGAGCTTACCATTATCAATTCTCAACTCTAACTTCAC ATATCCAATATTGTAGGGACAAACTTCAATACTCCCTCCGATTCAAATTA ATGTTTTCAGATTTGTCTAGATTTAGATGTATCTAGCACTAACATGACTA GATATATTTCAAACTAGACAAATTTGAGAATATTAATATGGCTCGGAGGG AGTATTTTAAGCCATAACTTCACACATATAGAACACCATAGCATCTCCCG AATCTATTATACAGTGAGGCGTGAATCTGCTCATATTATCATGCTCTCTA GCTGTTCTTCATTGGGAAAGTTTCTTTTTTTGCGCTTTATGATTAAATTA ATGCTAAGAAAAAACATGAGGGATGTAACAAAGGAATATAACTAGGTGCA ACCAACATGGTAAATAATTATGATACGGTTTTTATCAATGTTTTTATGCA TAAGTTGTAAAGTTGTTTCTTTTGTTCTGTGGCAACGCACGGGCATTCAG CTAGTAACCGTAATAGTTGCACGAACCAAACGGTTCTTGAGCACAAGTTG AGGACAAGAGATAAGCAGAAACAATTCTCGACTTGAGCCCACCCAATGAA GAAGCATGAGGAAACAAATAATAAATTTAAGCAATAAGTAGAGGAGGGCA GTACATACGGCGAAGTGTCCGAGGTTGACGGCGGTCCACGCGGCCCCGGG GGAGCAGCCGGAGACGGAGAGGACGAGGAGCCAGGCGAAGAAGAGGAGCA GGATGTAGGTGGTCCAGACCCCGGGGTACATGAACCACTCGGTGTTCTTG TTCACGTCCACAGGCGGCGCCGCCTCCACATAGTACGCCCCTCGCCGCCC CATCCTCGGCCGGTTCGTCGGATCTCAGGACGAGCGGAGCGAGGGGTGGT GTGGCTGTGATCTGGTTGGTTCGCCCTATGGGTTTGTTTGGGTTGGGATT GGGGTGTGAGCGTAGCGGAGCCCGTGATGTTGGTCTCATGCCCAGTCAGA TGGGGAAATGTCCAAAACCGATTCTAGATTGTTCCACGAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.