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GrainGenes Sequence Report: AE028151

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Sequence
AE028151
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE028151
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCAAGGCATCGTCTGCGTGGGGCGGGAGGAGGAGGGGTGGAGCAAAGC
GGTCGGCAGCGTCGGGGTGGCGGGCGGCGACGAGCAAGGAAGTATGGAAG
AGGAGAGAGAGCGAGGAAGGGAGGGTGTCGCATGGACCTCAGGTTTGGTC
GGATTTTTGGCAAGGTTGATTTTGCAAATTGACCCGTCGACATTTTTTCC
GGGTATATACTCCGTAGTATGTAAAAAATGGGTTAAATATAAACATCATG
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AGATGCACGGAAGATGAATTCCAGAATCATGTAGAACCAGAAGTGACGCA
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AAAACATACAAAGTATTCCCTAGTATAGGAGGTCTAGAAAAGAAGTCTCC
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TGACAAGTCAAGTTTTTACAAAACAAGGACTGATATTGCTCTGACAAATA
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GAGGAAACCTGCCGTCATCTCTAATAGGAAATTGCTTCCTCTTGAGCTGA
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AAATATTCTTTCCAGCATGTTGGCCCAGCACAATTATGTGGACATTTTAT
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CCTTAACGCCTTAAAAACCATGGCTTCATGGATCCGCACCAATTTTGTCT
TTGTAAGGAAGACCTGATGTATTGTTTAATTTCAGTAAAACTAATATTTT
CTTCCGTCATCTTTTCCATGGGAACCTCGGTTAAGTCCATCTACAACAAC
ATAGAAAAAATTAAAATTATTTGAGCAAGACAAGCAATGCTTCATGTGTT
GCTATTTTTTTTTTGAAATTTGGGTGTGTATTATTCAAACAGTTTCTTGG
TTACATCCAGAATGACAGTCACTTTGAGCTGATTCAACCACACAGGGAGG
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TCTTCCCTTTAATGTCCAGATCAAGCTCTGAATTTGTAACCTGCGTAAAC
GAAGACAAATATGATTGGATAAAAGAGGCTGATTGCTTAACACTGCATTT
TCCGTCGCCAAAGACCGAGTTATTTCTTAGATGCCAGGATCGCCACCATA
AGAATAATAACTTTGATCTCATTTCATCGCTGCACTGATTCAAGAGTAGA
AGTACCCAGTCCACCCCTGAGTATCTGAACATACTTTCAGGTGGCAGAGA
CCATTCATCCCTTAGGCAGTGTCTTAGAGCCTTTGCCTTTGGACAAGCCA
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GGTAGTACATCCATATTTCTTCTACATATGTGCACTTGTACACCAAGCGT
ATTAGAGGCAAGCTTCCAGCCAAAAACTTTCAGTTTAGGTGGCACTTTTG
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GTTGCTTCTTGCTTTCCTTTTTCCTGCAATTGTAATCCCAGTTTATACGC
ACTTCTGACCGAAAAAAGCCAGATTTTTCATGAGCCCATGCAATGAAGTC
ATCTCTCGGAACTGATGGAATGGTGATATGCATGACTTCATCAGCATCCG
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GGATTTATGAGATCAGAAACCCACCTTAATCGTAGATTATTTGCCTTGCC
TAGGACTTTGTGATTTCCCCTCAGCAACCAGTTGTCACGCCAAATTCTGA
CTTTTGTTCCTGTGCCAATTCTCCAGATGATGCCCTGTTTCAACAACTCA
AGGCCATGCACTATTCCTTGCCAACAAGGAGATGTGTTCTGACTGAAAAC
AGTATCTGTAAGTTCCCCGGAAGGATAATATCTTGACTTGAGGAGCCTTG
CACAAAGACTGTCCGGATACTCTAATAGACGCCAAGCTTGTCTTGCAAGT
AGAGCTTGGTTAAAAATCCTCAAGTCCCTAAAACCAATGCCACCATGACT
TTTTGAAATTGTCATCTTTTCCCAAGACATCCAGTGCACCTTCCTTCTAT
CATTTTCATCACCCCACCAGAAGTTTCTAATAATTTGGGTGAGTTCATCG
CAAAGTCGAGCAGAAAACTTAAAAACACTCATTGCATAAGTTGAGATTGC
TTGAGCGACTGACTTTACTAATGCTTCTTTCGCTGCCCCAGACATATACT
TTTCATTCCAATGTGAACATTTCTTTAACAACTTATCTTTTGTTGCTTTT
AGCTTTCCATCCTTTATTCGCCCTTCTGGAATTGGGAGACCTAAGTATTT
TTCCTCTAGAGTCATGGAGCCTACATTTAAAATAGAGGCTACAGTTTTTC
CATCTTCTTCGGAGCAGTTATGTCCAAGCATGATAGAGCACTTAGGAGGG
CTTAAAAGTTGGCCCGTTCCTTTCTCATATTCACGAAGAACACCATTTAC
ACGAGTAGCTTGTTCGGCATTAGCATTAAAGAATAATAGACTATCATCTG
CAAATAAGAGGTGTGAGATACCTGGGCTTCTTCTACAAATCTTCAACTCT
TGAATCTTCTTCATGCTTATATGATGATTTAGAAGAGTGGACAGACCCTC
GCCGACGAAGAGAAATAGATATGGCGATAGAGGGTCTCCTTGGCGCAAAC
CTCTCAATGGTCTGAAACTATTTAACAACTTTCCATTAAACCTGACTGAA
AGGCGGACAGTTTTAACACAAGTCATAATCCAGTTGATCCATTGTTCGGA
GAAACCAATCCTCCTCATTGCTTCTTCAAGGAAAAGCCAATCGACTCTAT
CATAAGCCTTCATAAGATCTAATTTATAGGCGCAAAATTTACCCGCATAT
TTTTAGCCTTTCTGTAAGGAATGTATACACTCGAAGGCGATGGTTGCATT
ATCTGTGATCATACGTCCTGGTACGAATGCACTCTGGGTCTCCGAGATGA
AATCCTGAAGAAGCGGTCTCATTCTGTTAATTAGACACTTCGCCACAATT
TTGTATATCACATTGCATAGGCTTATCGGTCTGAAATCCTTAAGGGTAAT
GGGGTTTTTAATTTTTGGAATCATAACTATAGACGTATCATTTACTCCAT
CAGCCATTTCACATTCTTCGAAAAATTTCCGGACAGCTCTTATAATATCT
TCTTTTACAATGCCCCAGTTCCTTTGGAAAAATGCTGCTGGGAATCCATC
GGGCCCGGGCGCTTTTGTCGGACCAATTTGAAAAAGAGCAAAACTAATTT
CTTCATCGGTGAATGGCGCGCACAAAAGATCATTTGTTGGGCCGTCTACC
TTACTCTGCAAATATTGTGTGATGATTGCCGGCTGTACTGATTGGTCAGC
AGTGTAAAGTTCTTTGAAGAATTCTGGTGTCTGATGCTCCATCACAGCAG
GTTCAGTGGTTACCACCCCGTCAGTCGTTTCAAGCTTTTCAATCTTATTC
TTTTTTTGGCGCCACGTCGCAGTCCGATGAAAGAAGCCGGTGTTTCTGTC
TCCCGCCCTCAACCAGGAGACACGAGACCTCTGCCTCCACCTGAGCTCTT
CCTTTTCCAGAAGCTTGTTAATTTCCGCACCTATCATTTTAGCTTCTTTC
ATGCTGTTTTTGTCATGCCTCTTACTCAGATTTTCTAGTCGGTTCCTTTT
CTTTTTCAAAAGCTTTGGAATCGAGCCAATTGTGCGCCCGCTCCACTCAT
GCAAAGATGACATGACTCCCTGCAGATTAGTTGCAATATCCCCAAGATTG
GTTGGCTTTCTGTGCCTGGACCATGCACTAGCAATCTCTTCACCCAACGT
TTCTTCACTTTCCCAGTAGCACTCATATCTGCGCACAGGAGGAGTACAAC
TCAAAGCATAGGCAGGCTCTAAAATAATTAACACTGGACAATGATCAGCT
CTTGTGGAAATTAAGTGATGTACCTGGTGTTTAGGAAACATACTTGACCA
ATTCGAGTCTGCAATCGCACGGTCAAGTCTCACACGGACATTCCGATGCC
CACTCTGATTATTATCATACGTCCAAGGTAAACCTTTGAACCCCAAATCA
TGAAGATTGCAGTGAGACAAAACTTCACGGAATTCCATCATTTGCCTTTC
ACTCCTATGCCTTGAAGAGAAGTGTTCTTTTTGCCACATGCACTCGTTAA
AGTCTCCCATCATAAACCAAGGACCTGGGAGAAGTGGTTTTATGCGTTTC
ATCATGTTCCACATGTTATATCTTTCATGTGTTCGAGGTTCTCCATATAC
AAAAGTGCATCTCCATTTATTTCCAGCAGGGTGATTTGTAATGGTTACAT
CAATATGACAGCTGCTCATTTTAAACAACTCTGCATGGATGCTTTCATCC
CAAAATAGAGCTAAACCCTCCTTTTCCCTCCTCACTAAAAGTCACGACAT
GTTTTAAACCCAGCCTCCAACGGAGGCCTTCAACATAGTCCTTTTTCTGT
CTCGTCTCCGAGAGGAAAAGCAACTTTGGTTTGTGAGTGCGCACTAGCCT
CTCCAGCTCTTGAACCGTCGCAGGTTGGCCAAGCCCACGGCAGTTCCAGC
TCATCATCGACATGGTTGCTGACAAGCTCGCTCCTGCCACCTCCGGAGAG
TGCTCCCCAGGCTGAGCACGGTTCACCACTTTCCTTTTGTTCTCGTTACA
GTGCCGCCTCACCCAGCGTTGCTTCGATGTTATGTTGTTCTCCACACAAT
TGGCAACATGTGCACTTGAGGTATCAGCAGAAACGGTAGTCTTTATACCT
TCGTTAACATTAAGCGTTTGCACTGCCGCTGCCATCTGCTGGACGTCCTC
TGTTGGTGCAGTGACTGTTTGGTCTTCCTCTGGCCCTCGCCCAACAGTAG
TGGTTATGCTCCTTCCATTGCCCTGATGACTACCTTCAGGTGCAGAGGCA
TGTGCGATCTTACATCCAGGGCTTGGTGTGTCGTTGGGGCAGAGCTGGCG
TTTTGCATCGACTGGCTGAGTAGTCAGGGAGTAACTGAATGGAATGGGCA
TCACTTTTTCGTGAGGGCATGATATTTGGTCAACCTGATTTATAGTCCCT
GGGCCTCGATCTCCTTCTTTATCCTGCCGGATCTCCGGTTGTATCCGAAA
CAGACTAACAGAATTCCCATTGTCGCAATCTTTGGATGATAGTGCAATTT
GATTTACATACTCCGTACTAGATGGATCAATGGCGATCAGCCCAGATACT
CTGGCGGCACAGTTTAGGCGTTTGTTTTCACCATCCAAACATCCAGTGAG
GTTTTCTTTTTCCGCACTGATCGCATTCCTAACTGGCGATTCCAAAATCT
CTGCCGACTGATACGGCATCGACAAATGGAACTCATCCTGCGGAAATCCA
ACCAAAAGATTAGGCCTCACCTTAGTTGCGTCCTCCTGATTCGATCCCCA
TCTAGTAATATGAGGATCAGCGGAAATTGGGCGGGACGGGGATGGCCCCG
TGCGTTCCACGATTTTCTCTCCTCCTTCCTCCTCTGCTTCCCCGCTTCCA
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CGCCGTCTGAGAACCGCTTTCGGCGATGAACAACTGGGCTCTAGATCGGA
AACGAGATAGGGATTTTTGGGGATTTTGGGCGCTAAGGACAAGTGATTTC
ACTCTGTTTCTCACTGAGGATGGGAATAAATCAACCCGGGGAACAGTATC
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TCACACACACTGAATCAATCATAGTATGGTTGCATGTGTGTTGCTATTTT
GATTATGTGGAACTGCATGATCATATATAGATTAACTACTCTTGACCCAG
TTGAAGCATCAAAACTCAGGAACTATAATATGACATATATATAGATTAAA
ATAGTTGATATTTTGTTTCTGAGGAAGACGCTGCCGGAGAGGCGGGATGG
AGTTGATACTAATCGTGCGGGGGCAGCGTAGATTTAGGACATGTAGTAAA
ATCCAATAGCTTAAGGGGATTTGAAAACAGTGGGTAGTTTACTTATCCAG
TTGATTGTCATTTGTTTCTATCTTGTTTAGTTTACATGACCAAATAGTTC
ATGTGAACAAATAAAGATAATTGAATCATAATTTTCTGTATTGTCGCGTA
AAAAACTATTAACATGCCGATGCCACTCCTCTCTGGTTGATTGTCACTGG
TTTGTATCTTGTTCAGGCTTTGCTAGCTAAAATGTCTTTCAAGTGTGCAC
ATTGTGGGAGAGTACTGATGGACAGGGTCGATTTTGTGCATTAAAGGTAT
AATACTTTTAGTTAAGGTGATACTTTTCAACGGTTTCTACCGTGGTGAGA
CTTTTGAAATGGTGAAATATAGTCATTTAACTTGTGTAAAGGCTATTGCA
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AGCAGAGGGGAACATAGACCTGGGCAATAGATTCACTATGGAAGAACCAC
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TATCACTATTGCTAGAAGTTTGGTACTGGCGATAATATGGTTTAACAATA
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TCACGCCAGGTTCTGGGTCAGCTCGAGCAATGGGGAGTCAGGAAAGCACC
TTATATCGATGTGCGTGATTGTTGTTTGCGTGATTGATGTTGCAGGAGCG
TGGGAGGCTAGGATCATACTCCTGGTCTCTCCGCACGACCATAAATAGCC
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TTTTTGATACAAATGCCCCGTTTTTGCTGCAGTAGCAAAACACGATTTGT
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GCCTAGAAACTCGCCGGGAAAAACCTCGCAGGAGTCGACGTAGCAAAAAA
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GAAGACCTTGTAGCAAAAACTTGACACTGTTGTAGCAAAACCACAAGACA
ATTATAGCAACAAAGTTCTTCTAATATAGCAAAAACCTAACTTCACCAGA
GACTCTCCCCGCAAACATTGTCGGACACCTTGTAGCAAAAACTTTGCGCA
ATTATAGCAAAACCTTAAAACTATTGTAGCATTTTGCAGATGTTTTTTAG
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TGAGGAGCAGGTGCAGGCGGAGGTGGAGGAGGCACCATTAGCGTGGGCGG
AGGTTGAGGCAGTGGTGAGAGAACGCGGTCGGGCATGGAGGTGGACAACA
ACTTGAGCTTGCTCATGGAGTTTCGTCGGGAGAGAAAGGAATTGGGGAGA
GAAGATGGGAAAAGAAAGAGATAAGGAAAGGGAACAGCGGTAGTGGTGGG
TCCTGCCGTACATGACGCGTACAAGCAGGCGTGACGGCACCCGGACGACG
GATCCCGGGGGATTACTATCATTTTCCTAAATAATAGTATGTGCGTGCGG
ATTTGTTTGGCTTGGCCCATTTTATGCGCTCGGAGAGAAGCGCGAATGAA
ACGACCTAGTGGCCCACATAAGCGCGTGCGGGTGAGCGGATAGGTTAGCG
ACAAAAGAAAAGACGTACTGCGGTCAGGCAGAAAACAGAACACCCTTTTC
TATTATATATAAACTCTATTAGACCATCTGGGTGTTATTCTGCACCCGGG
CCGGTCCACTGAGCCACTCGGTTCCATCCGACCTGTTCGGTGTGGCTCGC
ATGCTCACAGCACCCAACCATCCACCATAATTTTTTTCTTTTACCTCAGA
CAATTTATTTTCTCAATTACGGCCCTGGATCTGGAGCTAACCCACCGGTC
ACCTCATCCCCCGGTTTTCAATCGTGGGCACATGGCGGCGAGGCAGTTCA
GAACTGTGTGGGTGACGGCGAGCGGCCAGTGTGTTTTGCGGGATCCTTCG
TCGTTGGTTGGTGGAATCGGTGACGCCGTGGTCGGCCGGCTGTATCGGCG
GCGTGGTGGTTGCGGGAGGCGCTACAGGCGGCATCGGCATCCTGGTCGGC
AGCCCGGCAGGCGGTGGCTGCGGGGTGAATCCCATGAGATCCTGTCATCG
CCGCGCCTCCTCTCCACCATCCTCGGCGCCCTCTCTGCCAGGCTACTCTT
CCGCACCGCCGCCCATGGTAGAGGCGGGTCCTGCTCCGGGTCAGCTCTGG
GCGAAATATTTTCCGAGGTGGCTCAGGCATTCTCTTGCAGGGCACGGGCA
GGTGGCGTATCAGGACGCAAGAGCACTCTCCAGTCTCCAACTTGGTTGAT
CCTTTTTTTCAATAGGTGGTGAGTTCCCGATCTCCAGCGCCACGTTTCCT
TGCTGTGTTTGTTGGATGCCGTTAGTTTAGCCATGATTGTTTCTTCCAGT
GTAATAGAGTGGAAATCTACAAGTGGCATGATTAGTATTAGATTGAGAAA
TCGATCTTTTTGGTGATGTCTTAATGTCTTATTTTGATCTGCAGGATAAA
AATAGAATTCATCAATAAACAGAAATTAAGTTTTTGTAGTCCTTTCGTTG
GTGTCCTGCCAGTATACAACAGCAATCCTATTTCTTCATTAGGACTGATG
TTTAATGGACCTTATGTATTGCTAAATGCAACCTACTTTTGTCTTGGGCA
ACTAGCAATTTTTGACTGTACTTTTCGCATAATGGATTGATTTGCTCTGA
TATGTGTTGATTCCATCATTGTAGATACTTCTAACAGGCTGATGAAGAGG
GGCACTGCAACATTTTAGATTTACTCCAGCCAATTACACATTGGGTTGCT
TCTTTGCTGAATTTGTCCAGAGCGCACAACATTGAAGCTGCAAGTAGATG
TTCAATTCTAGTTCTTGTTGCTTGAATTGTCAAACGCAAATTAGGGTCCG
TAACAATTAGCATGTCTGCATCAAATTCTAGTTCTTGGTGTGGATAGCAC
TCACTGTACACCAGTTGTAAACTTTTTACACCGATAGTTTCTTTTCTGAT
ATGGGTGTGGGTTACAAGCTAGCGCACTTACCAGCCGCACTTCATTTTTT
CTCCTCCTTTGTTTCTAATTCAGCGGCTGCGGCGGGACAGTTTGGGTATT
GGACTCTGGTCCGATCCTTCGAGTGGCGGGCGGATTCAGTGGCCAGGCTG
GTGGGCTCTGCATCGACCATGTCCTCGGCAGCGTCGTGGTTGGCTTTGTG
GTCGTCCGCCCGAACCAGCGACAGTGTGGTTGCCGGCGGCAATGCGGCGT
GGTGAGCAGCATGTTCAGGCTGCCGGTGGCTGTGGGCTGCATCGGCATCC
AAGTGGCATCTCTGCGTCCTGCAGATTGTGTGCTTCTTCAGCAAAGCCGG
CCGACACCAAGTTTTCTCAACCATCCGCGCAGAAGCTTTCGCTGGACACC
TTCTACTGTAAGCAACATGTTCTTTTTGCTGTCAGATACTCAGATCCAGC
ATTACTTTTGCATACCTGTGTATGTCTCAGCTTGGATGTGAAATGGTCGA
GGTACTGCAAGCACATGGCAACAACCGTCCTACCTCCAGAGGTTAATTTG
GTATTGCTCTGCACAGGACATCTCAGGTGTTGGTTTTATCTAATCACAGG
GGCATATAGTTATGTTTTGCAAACCTAATCTCTCTTTGCTGTCCTGCTAG
CTAGATGATGGCCCAGTATTTCAGTTAAGGTCTGTAATGCATGTACTTTG
AAGTCAATTTGAAGGTCTAATTTTTTTCAGACTAATAACCGTCAGAACAT
GAAATGCTGCTATGCTCATTAAGTTTAGCATAAGTTATACCCGCAAAAAA
AAGAGTTTAGAATAAGTTATACGATAATCTTACTTGCAAAACCTTCAAAG
AGGAAATTTCACGTGGTATGATACTTGCAAATTTATTATGTTTCCTTCCA
TACAGAAAAGTTGATTTGTATTTTTTTTTCTGTTTTTCGTGTGTATCTCT
AGCATGCAATGGAGGTCAAGAGTAATTTGTAATCATAGCCTTGGTGGCTG
CAGGCGGCATCAGCATAATGTTGAGCAGTAGGTGGCCTCAGCACTTCTGT
TTGTCGTTTTAGGGCAGAGCATGACAGCAGGCTTCCACTTAAGGTACGGT
GGCCGTGCTTTCCTTTCTGGTTTTTTCTTGATTCAGAACTAGAAGGGAGG
ATAAGTTTATGTATAACTTGAAGCATGTTAGAAAAGAGCTACTGCACATT
TCGACAAATCGATTGTCAAGCCACTGCTCCAAATAATAGAAACAAACAGC
AAGGAGCCAAGGAGTATCACTATGTTGTAAGGACGCATCTAACATGTGCA
GTAAATTTTTACTAAAAGTATGTAGCTCTCATGTGAGGATTAAAAGTCAT
CAATCAATCACAAAATACATGTCCCTTGATTTGACTGTGTTAGCTGCTAA
TTCTTCAGGAATTGGCGAGCAAAGGAAGTTTGGAGTCTGATTTGATTCAG
CAAGCTGCTCATAATCTGATAAATGACAAGTTTAATGAGGTTATACTGAA
CATGGCATACTTATTCTCCTAGAATGTTTAAGAACTATCAATATTTAAAT
GGTTGTTTGTCAAGAAACATGCACTAGAAGCTGCATTTGCTTGATTAACC
TTGGTACACTTCTTAGAAAATATACTCCATCTTTCTGTGTTCATCACCTT
TCCCAGTATTTTCCATGTTGTTCCTTTTCCTGTTGATTTTTTCATGCGTT
AACATTCCATCCATCAGAAGCTAATTCCTTCCTTGATTGTCTTATTGATA
CCATTGATTTTATACACATTTTTGCTAGAAACTATGCAGCTTTAATTGAT
TTAATAAATATTATGTGGTACATCATGTAATTTACATGTTCCTATGGTTC
CCCGGATTAGTTTCAATGATTTTGCGAGCACATTGGCCACACCGTTAATT
TTTACGTCGAATTGCAAGTGGCAACACTTATTCTCCTGGTTTTGTTGGCT
TTCAAAGCAGGTTACAGCTAGACTTAGTGTGGTTATTTAGATATTTCATT
AAATATGCCGATGATGGTGTGAAAATGAGAATTCTTTTGCTCTTCTTAAG
GTCATGTCACCTTCGTAATGATTTAATTTTTGCCAAAGCAATGCTTTGGA
TGAAAATTATCTTTAGTTTCTTGATTCTTATCTTTATTAATTTTCCATTT
TTCAGGATTGCTGGTGATGTTCAAAATGCTAAGGAAAGTGTCCTGCTCCT
GGATACACAAAAGAAATGTAGAGCTGCACCGCTTGTTGTGGTCTTCAACA
TCGTGCCCATAGTAGGATAGAAATGCAATGTACTGAAATTGATGTAACCA
AATAATTTCAACGACTTATGTAATTTATTAGTACTACCGAAATCTTGCAG
TTTATATATCGACACATGTGCATGGCGACATATGTTTTTATCCCCATGGA
GTTATTACTATGTGCACTCAGGTTGTCCTAGTCAATCTTAGCACATCAGA
ACTTGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.