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GrainGenes Sequence Report: AE005544

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Sequence
AE005544
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE005544
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGACCGCAGGGGATCAGGAGGGGCCGCTCGCCCGTATAAAAGGAGCGGC
CGGCGAAAGCATCTGGCTCCTCCAGTTTTACCCAAACAGCCCTCGCCTCC
ACAAGCCAATCGTCCCCGTCTCGTCTCCACCTTGCGCCGCCTCTCCTCTA
CCCTGGTGCCGGAGCTTCCGCGGCGCCGCGGGCGGCAGGTTCGTCCCTCT
CGCGACCTCCAATTCGGTCCCTCGTTCTCCCCCCGAATCCGTGTCCAGTC
CGTCCCATTGGGGCGCGGGCTCCGTTGGCTCCGGGGCAATTGCGCGTCGA
GGGTTTAGGGTTTTGATTCCACTCCGGATCGGTGCGCTCGCATGGTGCTG
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GGATGCGGCTGTGGCCGCGCAAGCTGCAGAGAAGCCAGCTGAAGGTGAGG
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TGTTAAGACACAATCAGGTGAAAAGCTAGAGCTACAGGTTAGTGTAAAAA
TCCATTACCTTTATCTCCTGTTTTTATACCCTATGATCACAAAAACATGA
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GCTAACAAGCACAATTTTTTTTATATTGGTCATATGAAAATAGTATTGAT
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TACTGTATTACATATGCAGCTAAGCCCTGGAGATTCTGTCATTGATGTCA
AGCAATTCCTCTTGGACGCGCCTGAGACTTGCTTCTACACATGCTATGAT
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TGGTTACTGGTATGTAATACAGGCATTACGGATTCTTCATTTTTGTTGTT
TCTTTCACTATTTGGTACAGTGGGGCTGAAAATATTGTTTCTTTTCAGCA
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CACCGACTTATAGGAGGTAACTCTTCTGACTGTGATTTATTTTTGGATAC
CTTTGGAAGAACCATTGTTCCAAACATCAGCCTTCTAGATTCCTATGATA
GGCTGGTTAAAATGTATAGCTTAGTATTTATTGAACAGTGGAAATGGTAC
TTGAGTTTAATCTTCACAATTTAGCGTGACTGATGGTTTCTTCAGTCATG
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GGAATCCTACATGTGGTAGTGGCGTAGTAGACAGAATCGGGAAATGAAGA
GTTCAATATCTCTTTGTAACTAAAGTTGTATCATACATACCAGGTTCCTC
CTATGCTGGAATGTATCGATTTGATGCCAACAAGGGAAATTATCATTCAT
TCCTATGATCTTAATATTTTACGCGGCCTGTTATCCTCCTGAATCTTTGG
TTGACTGTTCCTCCTATGCTGTAATGTATTGAATTGAATATGGGCTATAT
ATGGAATGCTCTTATTTGCTCTTATTCATTATTAAGCTTTTACTTTGCAA
GCCTTGTTAACTTTGAATCATCATTTTTCTGTGTATTCTTCCCTCAGTGG
TTGTCAACTGCTATTTGTATTGTTGAGCAATTAACAACTGTTAATGTTTT
CCTTAGGTTACATGGGGATCTCATTTACATTGATGTTGTAACATTAGAAG
GAAACAAATACTGCATCACAGGGAGCTCCAAAGCTTTTTATGTGAACGCT
AGCAATGGAAGTATTTTGGATTCAAGACCTTTGAAACAATCTCACGAGGC
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GTTTAGTGATTTCTCTGGAGATTTATCTGAATAACTATAATGCCCCTCAG
TAGTATTTCATTTTTTAATGCTGACAATTGGCAAATCTTGTGAAGGTTTT
CGTGAAATATTGGACCGCAAAGCATCAGCCCATCCTTTTGAGAATGTCCA
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AAACCTGGAAGTTGCCACCGTTATTAATTTCTTAATAAGTCTTGAGGTTG
AACTTGTTTATTAATGATTCTTGATGGCTCCAGGTCGATTTATACAGCTA
CCTAGCATAATAGGTTACATAAACTTTTAACACATTTTTATGTACAACAG
AACATAAAAGGGACGCAGCCAGGGCTGAGGATTCTGTTGTGTTGTCATAT
GGAACTGAGTTGATTGGTATGCAGAGAGACTGGAATGAGGAATTGCAGTC
CTGCCGAGAGTTCCCTCATGGCAATCCTCAAGAAAGGTTCTTATTTACCA
TTGCATGATTTTTGTAACACAGAATCTTCAGTGACATATTGTTTCTGGAT
ATTGTGTAGGATATTGCGAGGCAGAGCGCTTTATAAAGTGACATGTGATT
TTGTTGATGCCGCGGTAAAAGGAGCAGTTGGTGTCATCAATAGATGTATA
CCTCCAATTAATCCAACTGATCCAGAATGTTTTCATATGTGAGTAAAACT
TAAACCATACTGTTTGAAGAATAACTCCCACATCACTTCTTTTTCTCTTT
TCTGCTTTTACGTGTTTCTTGCCTTTTCATGTCTGTGATAAGAGTATATA
TTTGTATAACTATCACATATTTGTGCTTATAAATTCTGATTTTAGAACCT
GAAGCTCTTGACACTTTGTCACACTTAAAAAGTTAGGTACTAATATGTCC
TGCTTAAAATGTCATGTAGGGACCCACCGGATTTAAGTGTTAGCAGTTGT
AGCTTCTCTTCTGTTGCACATAATTATTGATAAACTAAGAAATAAAGATT
TATGTTTATGATATTGTACCCTGGATCTGGCTATGTCCCAGTTTTCACAT
TTTAACTTGATGCAATGCACTTCTTTTCTTATTGCCAATTTTCACTTTTA
GTACTTTCAGTTTGTTTTTTGGATACGATTATATCTGGTTTGAGTGGCTT
GACTAACGGCGGACAACAACATTTCGGATATTCTTATGTTTGCTTATAAT
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GTTTTGCTGTCGACTCTGACTATGAGCACATTTCAAAGGACCAAAAGCCA
GATCGCCAAAATGGTCCTGGCAGAAGTATGCCAGTCCCCTCCCCGGATTT
GGGGGCTAAGGCTGATAGGAACCATGAAGATTCTAATGCAGCACTGAACT
CAAAAACTGAAGAGCCTAAAGGTGTTTTGGAAGCACCTACAGAGGCACAA
ATAGCAGACAGTGAGCAAGCGACCTATGCTTCTGCTAATAATGACTTAAA
AGGAACTAAGTCTTACCAAGAAGCTGATATTCCTGGGCTTTACAATCTTG
CGATGGCAATAATTGATTACAGAGGTCACCGGGTTGTAGCTCAGGTATGC
CTAGAAAGGAGTTACTGATTCATGCACTTGTCTATACTTTTCCTGCTTAC
ATCATGTGTTTATGCTATTCCATTGAATTCCAATTTTTTTGTTGCACACC
TGACTTCACCTGTCTGTTCTTGAAAGGTTACTATAATCACATTTGTTTAA
TTAGTAGATTCCCTAAAGAAGATGATTCAGTGTAGACTAATGCTGATTGT
ATGAAGATTTTGATAATTACATTTTGTATTTTATCAACATATATCCATGT
TTGAACCACCTCTTTTTATTCCGAATGCTTTGCCTATGTATTAATTCGAC
TTACGTGCAATTATATCGGATTTGTAGAGCATCATACCAGGTATTCTTCA
AGGAGACAAGTCTGACTCCCTTCTGTATGGTTCCGTCGATAATGGCAAGA
AGATATCTTGGAACGAGTCATTCCATGCAAAGGTCAGCCGTCATTTTTCA
TGCAATCTGGATAGTATTGTTCCACATGATTGGATGATTTTATCTGTTTA
TCATCACCTCTATACATCTTTTCCAGTCCATACAGAAATTCAGTTGTGGT
CAGTTAGTTACTCAAATATACTGTTTTCTTGTTATGTTAGTTAAGATTTA
GTTGCATAAACTGTAATGACTATAACAGGAGACTGGTTTATTGTAGTATT
TTATTTTCAAGGGCACATTTTGTAATGTTTGCGTTTTTTCCTAAGTGGTG
CACACTGGATTTTTCTTGTCAAAGGACGTTATAAAAGTTACATATGCAAG
TATTCGCAAGGTTCATGTATCATACATGGTTTCTGAAGTGTCCGTGGAAA
GCAGCAACCTTTTTCCTGATTTGGGTATTCGTATTTCACGATGACATCTT
CATTCAAACTCTAAATAAGATCTGCTCTGTTAGGTTGTTGAGGCTGCAAA
GCGGCTCCATGTGAAGGAGCATGTGGTTTTGGATGGTTCTGGCAATCCTG
TAAAATTAGCTGCTACAGTTGAATGCAAGGGAATTGTTGGTAGTGATGAC
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GCGGTGCAACTGTGCCTTCTTTTATTATTTCTTCAAGGCTCTTTGCTTGC
AACACTGGTTGTTGAGTTAAGTTTTGTTTGGCTTTTATGGCTTTGTTAGA
AACATTTATAACATGTAATAAACCTAATAGGGGTGCATTCTGTTCTGGCC
TGAACTTAAACTATCACATGCCTGAACTGTCATTTTGTCAATGATTTCCA
GTTCAGTTTTCCTCCGGGCTTTTTTATTTGGTAGAAAAAGATTCCTTAAG
AAAGAATGAACGGATTTTGTCCGAAGGCTTGCCCCTCTGGACATAATCCA
GAGAGTTGTTCTGTAGGCGATTTTCCCTAGTTGTACTGGTTAGCAAGGTT
GTGGTGCATATGAGCTCTTCTTAGGGGATTATGCTTGGTTGGCAAACTTT
AGGATAAAATCTTGTCTTTTATGCTTATAGAGTGACATTGAACATGTAAA
TAACCTGGTACTACTAGTGAGTGCATTTTGATCCCAGCCAAATTGCATTA
TCACATGCCTGAACTGTTAGCAATCTCTTATCTTGTTTCTCTTGGTTTTT
TCATGACTTGTCAATTTAGTGCTATCTTTGTTCACTTAAATTGTACTGTG
GTCATGTTTATTTCATGCCGACTTTCCCCTCACTCTATAGGCATTATATT
TTGGATCTGATGCGAGTGACTCCTCGAGATTCTAACTACATTGGACTGCA
GCACCGCTTCTGTGTGTTGAGACCTGAGCTTGTAGCTTCATTTGTTGAGG
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CTCTGACACATGATTTATTTCATTAGCTAATCCTAATTACCTTATGTTGA
ATTGGGTAGGCTGAGTCTGTAAAGAAATCCCCTGCGCAGAAAGTTCCAGA
TGTCTCCGCAGAATTGGATGGGCCAGAATCTAATGATGACAATGCCAGCG
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TGTTTAGGAAAGGTGCATGCATTTCTCTGTACTGAGAACAGTTTTTCTTG
GGAGGGGGGTGCTGAGAATATATTAAATAGAGTAATAGATCTTGTTGTTT
GTATGGAAGCTAGAAACTTATTGTCGGTGTTTCAGGCTGCTTCTGTGGAC
GGACATGACAAGTCTGATGAAAGCCCTGCTCCGACACCTGCTGAAAGGAA
CGACTCAATTGATGAAATTCTTTTCAATCCAAATGTATTTACGGAGTATA
AGCTTGCCGGCAGTCCTGAGGTTAGTTTAAGAACTAATGTTTGTTTGTTA
TCGCTATCACGATTTAAAAAACATTGTGTTCTTCGATATTCTTAGGAGAT
TGCAGCAGACGAAGCTTTGGTTAAAAAGGTTGGATCATATTTGCTAGACA
CGGTGATCCCAAAGTTTGTTCAGGATCTTTGCTCCCTTGATGTCTCCCCT
ATGGATGGCCAAACTTTAACTGATGTGCTGCATAGCAACGGGATAAATGT
TCGGTATCTGGGCAAAGTGAGTTTCTCTGGACTGATACAAGCTGAAAGTG
AAAACATTGCATTGCCTTTTTATGTTCTTAAAGTAATTCCTTTCTCAGGT
TGCAGGTATGATCAAGCATTTGCCACATTTATGGGACTTGTTTATGGCTG
AGATAATTGTTAGGTCCGCAAAGCATGTTGTGAAGGTACGGTTCCTATCC
TCATTGCTTGATGCAGCTGTTTATTTTTGTGATACTGAACACTTTACCAT
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ATTGTTTCTAGGCGGTTCATCTACCTTTTAATGCTAACTCTAGCTGGTTG
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ATCTATGCACCCACCATAGGTATTATATTGATTACTATATACCATTTGTC
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AAACCAGTTAGAAAATTGATTCCTATTTGAAGAGCGCCTGAAGTACTTCA
AGCCACATTAGCTTTTGTTCTGAACTGTTTCCGGAGGTGCAAAAAAAGTG
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TGACGCGCTGAGTGCTCATTTTAGGATTATCAGACTATTTTTAAAACAAG
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GATGTCCCACCTTGTGAGGTGGCTATTACAAGATAGCCACGTGATATTCT
TTCTGCCATACAGAAATATGCATGGTTAAAAAATGTGCGTCTAGGCACTA
GGCGGCAGCAAAATGCCTAGCGTGTAATCATGCTATGCGTGCGCCTATGC
GAGGTAAGCGCTAGGCAGATCGAAACTAGGAAATAACGCCTAGCACGCTT
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TCAGTTATGCTGCAAGGATACTTGTTTGTTGACCATTGTTTGCTCTTCCT
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TTCGCATCTAACATCCGAGGGAATTTGGTCCAACATTAAGGAGTTCGCAA
AACATAAATATCAGGTAGGGGCGCTTGCTATTTCTTTCCATTTTCATCTT
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GATGATGCGAGAGTTGGGGCTAAAAGAGTATCAGTTCTCCGCAATCTTTG
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TGGTTTGGTCTTGGCTTAGCGTTTTATTTATTAGTTCGTGTTGTTACTTG
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GAATCATGTTTCACATTGTATATAGTACCTGGCCCAATTATTTGGGCAGT
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GAGGTATACATTTCTTTTACCATCTTGTCATTGTAAAACTTTGAACTCAG
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GAAGCTTTTTCGCTACTTCAACAGGTAAACAACACAATGTCAGTTATCCT
AGCATGTGAATCCACAGAGCTTCAAAAAATATGCAGTACTATTAGTACCG
CTTTCCTTCAAAAAAATCAACAGAACTTCTGATTTTACCCCCTAATCATT
GCTTTACCAGATCAATGGTCCCATGCACAAGGATGCTGCAAACTGTTGCC
GGTAACACACTAGCTTATTCACAATTGATTATTTTCTTAGCATTTGCTTT
TATTGTGGGTGCATTGCTGAGGTCATGAACCTCCTTGATAAATATCTTCC
ACAGCATATCCAGAGCAATGTATATCATGCTATATGCTCACTTCAGTTTT
AATGTTCGAACTGTTTTTTAGATAAACTGTGTGAGGAACAATATGAGAAA
TTATGTCATCACATTTTTAGTGTAAATATGCAAGTTACTTTTGAGGATGA
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ATGGTTTTGTACCATGCTGGTGATACAGCAGGAGCAATTGTGCAGCAACA
TCGAGAGCTTATCATAAATGAGCGATGCCTTGGTCTAGATCATCCTGATA
CAGCCCACAGGCATGTATATTGGTTTAATTTATTTTTGTACTATAATTTT
AAATGTTGTCAAATTGAAGTTACCATCAAATTGACCTATTTACCCATTCA
AAACTGAATTTCTTGTTATTCTTGCAAATCATTACATACAGTTCTAAGTT
TTGCCAGTTGTCCAGGTCAAATTCTCATTTAAAAAGCAATAGGTTGTAAA
AAATGTAACTGGATTTTCTGGTGGGTCTCTATACTCTAGAAGCATAAAGA
AATGTTACAAACCTTTATGAGCTGTCTACTTTCTTTTGCTGGGTTAGTGG
TATCTTCTCAGCTTGTTAGTAGTAGTACTAGAACATGATCTCTTTGGTTT
GTCCCCTGCAACCAATATGGCAGTACAATCTTCTTATAGGCTGGGTTTGG
CATTACATTGGATCCATTTTCGTATTTGTTTGACCCCCTTTTGCCTACTT
TTGTGCCTATTTTCTACAGCAGATTATAAAATAATCACAGCATGACACAG
TTCAGCAACGACACACTGAGTAAATGTTCTCTTTCTTTTCAGCTACGGTA
ACATGGCTTTGTTCTATCATGGGCTCAATCAAACTCAACTTGCGCTGCGG
CACATGTCCCGTACACTGCTGTTGCTGAGTTTAGCATCTGGTCCTGATCA
TCCGGATGTTGCAGCAACTCTTATAAATGTGGCAATGATGTACCAGGATG
CTAGTAATATGAGTACTGCTCTTAGGTATCTGCAAGAAGCTCTTAAAAAG
AATGAGCGCCTTTTAGGCCCTGGTCATATTCAAACAGCAGTTTGTTATCA
TGCTCTTGCCATTGCATTCAGTTGTATGGGTTTATACAAGCTTTCAGTTC
AGGTCAGTACTGACGGGAAATGATTGACATAGTAACATTGTTTGACCCAT
TGTACTGAGTTCTTGATTTTCGTGGCAGCATGAAACCAGCACACATGATA
TACTGGTAAAACAGTTGGGGAGTGATGATTCACGGACAAAAGATTCAGGA
AATTGGTTGAAAACATTTAAGGAGCGAGAACAGCAGGTATGTGTTGAAAT
GATATATGTTGTGGCCATTAGCATGTTGCCTCCCAATGAGACTCAGGGAA
GGAGACGGCTAGGGAAGAGTTCATAAAGGGGAATACTTGAATTAGGAAAG
ATGAGTTAGAGATAGGATTAGAAAAGGTTAATTCGGAATAGTAAGGATTA
GGAAAGTATAATGCCTTGGGTGTCAAGTTAGGAGGTATTATATATCTGTC
AACTATTTAAGTTATTGGATCATCAAGCAAGAACAATCAATCTAATTTCC
CTAAAGAAGCTCAAAATACAACACAGCATATGCCCGTTGTAAATTTTGAG
AACTGTGGATTTGCTTCTGCTTTAAATACCTTTCTTCCTTGGCAAGCTGA
ATCTAGTTGTATTGTCTACTGGAGATGAAACTCACTTTTTTTTACAGGCT
AATGCCCAGAAGCAAAAGGGCCAGGCAGCAAACCCCTCTGCTACCGCTCT
CGATTTATTGAAGGTAAGCTTATTATTAGGTGCAACTTTCAAGTTTTGCA
CTTGGACCTTGTAATTCGTCAGAACAGCAAAATGAGACGGAAATATCGAT
TTTCTGAGTGGGATGATTTGAATTGCCTGATATTTTGTGAGAATAATATT
TGCTGTATGGTCTCCTGATGTTAACTCCATATATGGAAGCTGGCAAACCC
TAGTCTTACACTCCTAGCTGTAAATTTATCATGGATGGGCAGTTGGCACG
GTTAGTGTGCATATTCCTATGTTTGGTCCTGTTCTTACCAAATGCTGTCC
CTATCCCTGAAAATGCATATTCCTATTTTTTTTACTTCATTTGGAAGTCG
ATATCAGTACCCTACCTTTGTTTCATAGTAGTTCTTGGTTGTACCAAATC
CTTACTTTTATGATTTCACAGGCACATCCTGGATTGTATCAAGCAATGAA
GGCAGCTGCGATCCAATCTGGTGATGGATCAGCAAATGTCAACAAATCGC
TTAATGCTGCAGTAGTTGGAGAAGGTGTTCCTCGAGGAAGGGGTGTCGAC
GAGCGAGCTGCTAAGGCAACTGCAGAAGTCCGTAAAAAGGCTGCTGCCAG
AGGAGTTACTCTGCGCAACGGACCTCCTGCAAACAGTGTTGCTGAACTAA
ATCAGATTCTTAACCTTATCAACTCAGCAGCTTCTGTTTCTGCTGCTTCT
CCTGCTGCCAACACTCAAACAACTGAATCTGAAGGGCTGCAGTTGAATGG
TCCTGCCCTGAATGGTGCAAAGGAAGCCAAGGATACAAATCGCCTATCTG
CCAAGGTTGACAGTCAAACTCCAGTAGGATTAGGTGCTTCATTGGAGCTG
AAGAAGCAGAAGTCCAAGCAGAAAGCTCAGTAAAAAAATCTACAATGGTT
GTTTTCTCACTACAATTTTGGACCTCTAGGGTGATTTTTTACCCATAGGA
TTGTCACGTCCACATAGTGGCAAAGTTATTTTTATTTGTTTCGGGTGGGG
TTCTTAGGATGGGTGAAATAATAATAATGATGAAGGATGAAGTGAAGAGA
ATTCTTGTGATAGGAGTGCTGGTGGGAGAAATGATCAAGCCCTCTCAGTA
TCTAGATCATCCTTTTGAGCCTTAATTTCTGTAAACTGGCCACACAGATT
TTTTTGGACCAGCGGAATTAACAGGTTGAGGGTTTTATTGAGGCATAGCA
GGGTAAATATCTTATATTTTAGTTTTGCTATACTGTCAGGAGGGGTTTGT
ACCAGAAAATATTTCGTATCAGCATATTCTGGATGTTGTTCAGTCACCAT
AATTCGTTGATGTCGATTGTCGACAGACTTCCGAGCCAGATCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.