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GrainGenes Sequence Report: AE024580

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Sequence
AE024580
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE024580
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCCGTCCCCGACCGGCTCACTGCCGTATGTCCTCGGCCGCCTCGCTCCTG
TCCATGCCGACTGCCTCGCTCCGGCCGCCTCTTCCCACTCAACCAGAGGC
TAGACACCGTTTCCTCCTCCCACACCAACCTGTCCGTCCCTGTCCGCCTC
GCTCCGGCCGCCTCACTCCGGCCGCCTTGCTCCCGTCCGTCCCCGACCGC
CTCGCTCCGGCCGCCTCTTCCCACTCAATCAGAGGCCAGCCTCCGTCTCC
TCCCACACCAACCCGTCGCCTCCTCCCTCACCAACTCGTTGCCTCCTCCA
ACATAAACCCTCCCTGAGATCGAGTGTGCACCCAGGCAGTAGCACGGAGA
TGGAAGCTGTCTTCAGCTGAGGACATTAGCTTGACCAGTAGGTGCTCAGG
ATGCGCCAGCTTCAGTTGGCTGCAGAAATGCTTAGTTTCTTCAAATGGTA
ATATTCGGGTTAAATTTCAGTACTACTATGGTAGGTAATTCTGCTTATCT
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GAGTTTGCGACACTTGGTATCTTCACACCCAGTCATTTTCTTGTTATGTT
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CATTCAACTTTGATGCCTTGAAGGCACTTGTCGCACGGTCGCCAGCTCTG
CGTCGACTACATGTGAATGACCATGTCTCAATAGAGTAGTTGCATCGTCT
TATGGGAATATTTTGCAGCATCCAGATCACTTGTTCACTGTAACATTCAG
CACTGATTGTCTCGTACTGTATTTCTTTATTATCTCATTAGAGTCAGCCC
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GTGGCTTGACTGTGCAGCAGTATATATCATGACTACAAGGTATGCTCTCT
CGAATGGTACATTCTTGCAGTATGTATGTTACTCGGCATTGTTCTTGCGA
TGCTCAGCATGTTTATACTTCAACTTCGTGTTGACAAATAAATCTGATGC
TTTGGAAAGAAAATATTTCTGAATAGGTTTATCTAAAGTTGCCTTAAAGA
AAATGTGTCTGTATCTATTCAAATAAAGTATGTGTTTGGCAACATGGCAA
AAACGACAATGACTGATATGGTAAAATAAAGTACTGTAGCTAACATGTCT
CTGAGAACCAACAATGACTGAAATAGCTAAGCACATTTTGTACTACTGTG
CTCCATCTTGTCCACCATGCTTCTTTTTTTCTCCCAATAACCACTTCATC
CTCCCATATTTTGGCACTTCTTCTGTCACAACCTTGGACATTGAAATGGT
CTGTGATTGCATAATTATGAGTAAATTAATAACATATTTGAAGAAATATG
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AGTTTCTCTTCTTGGCATTCTTGGAATGTGAAGTCCACAAGAAGATTGAC
TATCTGGTTGAGTAGATGATATAGAACTTGACTGTCCAGTACCATCGGAT
GCATGCATTTGTTTCTTCTTATGTGGAATAAATGGCCTATGTGCAGGAGC
TTGTGGCAAGGTTGTAGCTTTCTTTCTAGGTCTAGCTTTCTTCTCATAGT
ACAAAACATGTTTATCTTTCTGCTGGTCTTCTTGCGCAGTAGTAGTATTA
CATTCCTGTAGCAGACATTTTATGACTCAAATTGTGTATCAGCAGTTAAA
TAGCAGCAATATAAAATAGTAGAAGCATACTAATATAATAACCTTATTTG
CTTTTCTCCTAGCAGTATTAGCTTTTTTCTTCTTGTGGGCATGTTCTCCC
ACAACATCTGGATTACTTGTGCACTTTCTTTTGTTATGGCCTCCACCTCC
ACATGCTGAGCATTTGCCACTAACACCCTTTCTAGGCAATTTATTGCCCT
TTGGTTTTTCTTGCTCTTCTCTTCTTCTCTCTGTCTTTGGCCTTCCAGCC
ATTTTCTTTTTAAGGGGTGGAAAAGGCCTCGGGTTTGGAGCTACTCGCCA
GCTCTCTTTTCCCTCTACTGGCTGCAAAACATGACTGTATACATGGTCGT
AAAGATCTATCCTGTAGCAAGGAGCAATAAAATCATCTAGTTCTCTCTTC
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CCAATATCTGCAGCTACATGTGTAACTCTCCAAGTTCACAGTGAACATTC
TCCAAGTCCCTTCCATAACCTCAAATCCTTCAGTTCCATTGTAGAGCACT
GTGCAGATATTTGACCTTTTCACATTTAACTTTAGCTTCTTGAAAATGTT
GGGGCATATTGTTCCAACCCAACCTTCTGACTTTGCCTTATTCTCTGCTA
TTCTGGCCATCACCTTCCTCCTCATGATTTCCATAGAAAAAATTACTGGA
TAAAATCTTGCTCTCATTATAGCTTTCTCCAATTTGCATATATGTGCCTT
GCACACATTCTGTGTTCTGCCTCAGGGATTATCTCATTCACTGCCTTGAT
TAGGCCCTTCTGCTGATCAGATATGATAACCCATCCATCACCTTGGTTAT
TGATCTGTATGTCCTTTTGAAGTAGTGACAGGAACCAGTACCAGCTATCA
TGGTTTTCCCCTTCAACTGTAGCCCATGCAATTGGGTACATTTGGTTGTT
TGGGTCTCGTCCAATTGCGCACAAAATCTGTCCACTAACTGCACCTTTCA
GGAAACATCCATCAAGCCCAACAACTCTCCTACAACCAGCAAGAAATCCT
CTCTTGCAACCTTCTAGGCAGACATACATTCTTTCAAACACAGGCCTATC
AGTTACATCGGGATTTAAAGTTACTGAAACTGTGCTTCCAGGATTGCTTC
TGACCAGTTCCAGATGGTAGTCATACACTCTAGAAAATTCTCCATTTGTT
CCATCAACAATCCTCTCCATAACAATTCTTTTTGCTCGTTTGCATTTTGA
TTCACTAACATCAGCACATAAGTCCTCAAGCACTCTCTCCTGCATCTTCT
CAATCCTCCAACCAGGATTATCCTTGATCTCTCTAAAATACTTCTCTGCT
ATCACTGTGCTAGTGACTAGCTTGTTGTTCCTCCTTGCTACACAATGGTG
CACATTGTTGTACCTGCTAACTGTGAACCAAGGTGACCTGTTGGGGACTA
ATGAGCCATATATGCTCCAGTTGCAACCAATCCAGCTGCATTTGGCCAAG
ACTCTTGTCCTCTCATCCTTGGGAAATATTATGTGTTTGATTTTTTTTAA
TCCATAATTGACTAGTGCTTGTTTGAATTGTCTGCTATCATGGAAAGCCT
GCCCAACCTCAAACTCTTGCACCTCAGCACTCTCATCATACACTCTGTGT
TTCGTCTTCCTTGTTCTCACATTTCCATCACTGTCTTCATCATATGCCAG
TTCGTCTTCACTATCAAAGCAATCACTTCCATCTTCTTGTTGTTCCTTAG
GATTTTCTGGAATAATGAATTCTTCTGGTACTCCGGTTGCTTTCTGCTCA
TCCTCTCCAAGCATTTGTCTCTTCACTCTCTTCTTTAATTCTTGTGCTTG
TTTTCTGTAACAAATGCCATCTTCATCTTCACCACTACTATCAGCACTAT
CTAATTCATGGACATCCTCATAATCACTGTCTAAACTATCTTCACCAACA
TCTTCTTCATGTTTCTCTTATATCCCCTTGCCTTTATCCTGCTTTGCTAC
CCTAACAACTGGCAATTTCCTTGCTACATTTGGCTGCTCTTGGTGTTGCT
CCTGGTGCTGGTCATACTCAAGTTGCTCCTCCACTTGCTGCTGCTCATGC
TCTACTTGGTGTTGCTCTTGGTGCTGCTCATGGTGCTGCTCTTGGTGCAA
AAATGGGTGCTGCTCTTGGTGCCAAATTGGGTGCTTCTCATGCTCTACTT
GGTGCTGCGCTTGGTGCTGCTCTTGCTCAGTTTGGTGCTTCTCATGTCCT
ATTTGCTGCTGCCCATGCTCTACTTGGTGCTGCTCATGTCCTATTTGCAT
TGCTGCCCTAACAACTGGCAATTTACTTGCTCCATTTGGCTCAATTAAAT
GTTGCTCTTGGTGCTTCTCATGCTGATGGTGCTTCTCTTGGTGCCAAATT
GTGTTCTCATGCTGAAGTTGGTGCTGCTCTTGGTGCCATAATGGATGATG
CTCATGCTGAAGTTGTTGTTCCTCTTGCTGCTTCTCATGCTCAGCTTCAT
AATCAACAGCAAATTCTTCCTCCCCTTCATCTGAATTGGATACATGTGGG
TGCGTTACAAAGATCTCAACAAAACCATGACATTCTCTTGTCACATAACT
AGCCATGCTGCTCACAGTTGTATTGTCAACAAGACTGCACATGAATTTTT
TCTCCTTCTTAATTAGTATCCAACTCAGACTTATCTCCAGCAAATCTTCA
TCGGAAAGCACCATGTAATCAGACAAGTGCCTCTTCAAATCTGCCAGAGT
CAGCTTTGTAATGGGCACAGTTGACATGCCACTCCTTCCCCCGACATACT
TCCATTCCTTATCAATGTATTCCAACCTCCCACGATAATGGAAACGAACA
CACAACGAATCCATCCTACAGAAAGGAACATTCAGATAAGCATTGTGGGC
ATAGTTCTTGCTAGTCTTGCCCGCTGCATTCAATTTAGAAAGAAATAAGT
ATACATACCCCCATATCTTTCATGTTTTGGACCAGACATAAGTTTGCAAA
ACCAGACATGCATTGGGCTTTTTTTCTTTATTGTCTTCCTCTCCTGGGAC
TCTAACGAATTGTTTGATTGAGATGGTTTGTAAACAATACGTCTAAAAAA
CTTGCATATATATGCCCTTCTTCTATGAAAACAATACGTCTAAAAAACTT
GTATATATATACTTGCTACAGTGCTACTTACTACTCTGATATTGCAATTT
GAGTAGAACTTATCTACTGTGACATGTAGCTATTTGAGTATTACTATTAA
TCCATTAAGTGCTAACTAGGGCAACCACTGAAACATATCGATTTGTGTTG
AAACTGACAGTACATGCACATGGTTTCCTGCTGAAATTTCTAAATTCTAA
AACCCGCTCTTTCAATTCAGGTACAAAGCTACGAGTCAGGGACCTGACCT
GCTTTTCGACGACGCACTGCAATCAACAGATCATGCCATATATCCTCCGT
CGTCACGAGCCTGGTGAATAGTAGCACGCCGCCGCCGCTGTCAGGGAAGG
AGGGGTAAGACCGTGAGTAGGAGGGGACAACAGAGAGGAAGAGAAGAGGA
GATCGACAAGCACCTGTGGCCGCCGCCGTCGCGAGCGTGATCAGGTGGAG
GAATCGCGAGTGTGATCAGGTGGAGCCGTCGCGAGCGTGATTAGAAGAGA
CGTGAGCCGTCCTGATCGTGCCTCATCCCATCACCACCTGGGAGCGTGAT
TAGGGGAGTCGCCAGCCGTCCTGATCGTGCCTCCTCCAGGTGCCGAACGT
GATCCCTGACTTGGGTTTTTCTTTTAAGACCATATATGCCAACGTGGCCA
AAACCAGAGTCACGCATGGCAAAACCCGTCTAAAAAACAGCCCATCACCA
CCTGGGGGTAATTTGCCCGGTTTTAGATACTTTGGGGGGCTAATTGACCC
ATTTGGTACATAGGGGGTTAGTGATCCAAACCCAATAGATAAGAGGGTTA
AGTAGACTTTTTTCTTCGGATATTTACAGGAGAAGGCCTTCTTCCCCAAA
TCCTCGGGCTCATTCACACTCACTCCTCTCCCGTGCTAGGGTTTCACCAC
CGAGCTAGGTTCCGGCGGCGGGATGGGCGGCGGCGCGGCGGACGAGCGCC
AGAGTCGCGTGGTCCCTCGCCTTGAATCCGTCCTCGACCATCAACGCCAT
GAAATGGACTCGCTGCCGATCCCCGACGAACTCCTCGGGGAAATCCTCCT
TCGGCTGCCCACCCCAGCCGACCTCGTCCGCGCCTCCGCTGCCGGTGTCT
CCTTCCGCCGCGTGGCTGCCGACCGCTCCTTCCTCCGGCGGTACCGCAAG
CTCCACACCCCACCCCTGCTCGGCTTCCTCGCTGAACGCAAAGTCTTCCA
TCCCGCCACCGAGCCGCACCCCTCCGCATCGGCAGCCAGCGCTGTTGCTG
TGGCCGCCGACTTCTCCTTATCCTTCCTCCCCACCCCCGCTCACAGCTGG
GTCCTACGGGACACCCGTGACGGCCGCGTGCTCCTCGACAGGCCAATGCG
CGTCCCTAACGGTACTGTCTTCTTCCCGGAGGTGGTGGTGTGCGACCCCT
TGCACCGGCGATACCTCCTGCTTCCCCCGCTCCCTGACGACCTAGCTGCT
ACAGTGGAGGACCCATTGATGAACAAAAAAAAGCAGCTCAGGGTCCAGAA
CTTCCTTGTCCCTACCGGTGACGGCGAGGAAGCAGATGAGACATCATTCA
AAGTGATCTGGATGTCACACTGCAAAACTAGGCTAGTCACCTATGTCTTC
TCTTCCAACACTGGACAATGGCAAGCTGTTCCATCTCGGCATTGGAGCGA
TGTGTCTGCTCGCTTGCCACCGTTGACAGCGACCAAACTCTTTAACTCGT
ACTCGCGTCAATATGCGTATGGCTGCTTCTACTGGTGGATAGATTACAGA
AAACAAAGTATGTTACTAGTGCTCGATACCGAAACAATGGAGTACTCTGT
TGCTGAACCCCCATTGGAAGAGAATGTTTCTTGTGATTTTGCCATTGTGG
AGGTAGGGGAAGGCAGGCTTGGGATGTTTCTGCTCTCAGATGACACATAT
CACCTCAGTTATTTCATTAGGCAAAGTGATGCTGAGAGTTCTAGCAAGTG
GCAGAAGGTGAAGACAGTTTTACTAGTTTCTGGGACCTTTTTTACATGTA
ATACGGAGAAGTTCTTGCTCCTCTATCAGCCACAAAGCTCACTGCTTGAG
GAAGGCGTTTTCATTCTGGACACTGAAACATTCCAGCTTGAGAAGGTGTG
CGCTTCAAGGCCTCACATTTGTGAGCTGCGTGCATATAACAACTTTCCTC
CATCCCTGTTGTCGCCGCCAACAATATCAAATGGTAAACGATCAAGTTAT
CTACTTTTAATCACACATATTGTCTAATGCTTGTTAATTCATTGTCGGGA
TCGGTATTCTTCTTTACATGATTTTGTTTTAGTTATTTTTTCTCCGCTTT
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AATTAGACAAGAAAGGATTTTGAACACTATGAGCGACATTCTTCAGACCC
CGTTGATCATAAAAACACTAACAGCAATAATTATTTTGAAGAAATATTTT
TGATAGTTAAGACTGAAGAAAATTTAGGAGGAGATAAAATTTTATATCCA
GCTCGTTTATGGATTCTTTCACCTCTGAAACATTGATTCTACTCAAGCGG
GACTTATATTGTCTGGTTTTTTTTGATAGATGTGAGAAGGCAAAAAATCT
TTCTTTGTCATCTTTACACGTATAAATTTATCTCATGATGGGTTCAAATA
AATCTGCATAATTGGTATGGTTAGAAATAAGAGGCTTACTCAGTGCTACA
ACAAATGCATCTCATGTATAACAGTATATGATGTGAGCAAAATTCAAGTG
GTGAGCATGATCTCAGAGTACTGTTCCAGAAGAATATAAAGTGATCAATG
GACTTGGCATTCATATAGTGAGGACAGCTTGCCAGCTTGTAGTCGGAAAC
TGTTTGATTTGGAATCAGCTTTTCAAAATAAATTAGAAGCAGGCATCCAT
GTTCACTTTTGACAGTTTGAATCTCTAACCTTCCTCCATCTTTATCCTTC
CAGTCACATACCAAATTCAAGCAATCGTTTTTATTGGATGGCAGAGGATG
CACGTAGTTTGTTGATTGTCACTACTGATACCTCTGTTTCTTTTCCTTCA
GTGACTTAAATCAAGTGGTAAACTTTCTGTTGCATCCTAGTCGTTTCCTT
TCCTTCACGCTTATCATTTTCACAAATTGTCTGATCTGATGCTTGGTAGT
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GGTCTGTTCTTGAGTCTAGGCACCTAGTTGCCATTACAAGGTAATCAGAT
AAATAAAATAAAGAATCTTACGCACTATGAGTAGCAATCATGTGACCTCG
TGGAATTGTAAGAAACACCATATCACGTTATTTCTGTTTTAGCACCCAAA
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TTGGATTGTTTCACCCTAGAGATATTTATTTCAGTGAACAGGACTTATCT
CCTATGTATCATCTGAGCAAAATTGACTGAAATAAATAGTCCAAAACAAA
TCTGCAAAAATGCAAATAGTCCGTGCGCGCCGCCGCTGGTGTCTCCTTCC
CCCGCATGGCTGCTGACCACTTCTTTCTCTGGCGGTACCGCAAGCTCCAT
GCCCCGCCCTTGCTCGGCTTCATGGAGCGACTCAAAGTCTTCCATACCGC
CACCAAGCCACACCCCTCCGCATTGGCAGCCAGCGCTGTTGCTGTGTTTG
CCGACTTCTTCTTCTCCTTCCTCCCCGCCCCTGCCAACGACTGGCCAGTC
CTACGGGGCATCCGTTGTGGCCACGTGCTCCTCGACAGGCCAATGCGCGT
CCCTAATGGTACCGTCTTCTTCCTGGAGGTGGTGGTGTGCGACCCCTTGC
ACCGGCGATACCTCCTGCTTCCCCCACTGCCAGACGACCTAGCCGCTACA
GTGGAGGATCCATTCTGAAAAGAAAAGTGGCTCAGCGTCCAGATCTTTCT
TGTCCCTACCAGCGACTGCGAGGAAGCAGATGAGACATCATTCAGAGCGA
TCTTGATGTCACAGTGCAAAACTAGGCTAGTCGCCTTTGTCTTTTCTTCC
AACACTGGACAATGGCGATCTGCTCCATCTCGGCGCTGGATCGATTTGTC
TGCTGACTTGCCACGGTTGACAACAAGGAATCGCTTCTACTCCTCGAGGC
AGGGGCAAGAACAAAGCTCACTGCTCGAGGCAGATTGTTTCACGCTGGAC
GTCGAAAGGTTCTAGCTTGAGAAGTTGTGCGCTTTAGAGTCTAATGACAC
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AACCATATCAAGTGGTAAGCTACCAAGTTATCTACTTTTCTATCACATAT
CACATATCACATAGTTCATTACTGGGATCGGTAACTTCTTTACACGATTT
GGTGTTAATTTGTTTTCTCTGCTTTTGGCAAAGCTAATCAAGCTCGGGAA
CATTTAAGATTTATTTATGCGTCTATTTTAATAGGAAAGTAAGAGGAAGT
ATTTTGAAGACTATGAGAAGCACTCTTGAGATCTAGTAGATCATAAAAAA
ACTATTTGTAAATATTATTTAGAAGAAATGTTTTTGATACTCAAGTATGA
AGCTACTGAAGAAGGAATATGCGCCTACATCTTGTTCATTTATAGATTGT
TTCACCTTGCAAACATTTATTCCAGCCAAGCAGGACTTATGTTTTCTGCT
TTTATTTCAAAAGATATAAGGAGCTAGAAAAATCTGTTTTGGTCATCTTT
CATCTTTAGGTTTATCTCATGATTTTGGTTTCTAGTAAAACTGCATAACT
AATATGTTCCCTCTATATCCGTATATGATTTTAACCAAAAAGAAGTGATG
AACTTTGGTTGATTTCACAAAGTACTGTTGAAAATAGATAAACTGCTCAA
TGGACTTGCATTCATGTAGCAGAAACTGCTTGCCAGCTTGTGGTCATAAT
GAAATTAGCTTCTCAAAATAAACTAGAAACAGGGCACCCATGTTCTGTTT
TGACAGTTTGAACTTCTCGCCTTCTTATATCTCTGTCTGTCAAGTCACAT
GCCCAATGCAAGCAATCATTTTGATTTAATGACAGAAGATGCACGTAGTT
TGTTGATTTTCACTACCTGTACCTTTGTTTTTTTTTCCTTCGGTGACTTA
AGTTAGAAATTTGTTAATACTGCCATGCTAGCTAATTTATGAAATACTGC
AATGCGAAGCTACCATTTGTCTGGCTTATTTTTGTTGTCTGGCTATGGTT
TACAACTTGTATTGCGAACTACAAATGCAAAACTTGAGTGTTGATTCTCC
ATGTACTGTATGTGATTTGTTTTAATCCTGCGAACTACAAATGCAAAACT
TGAGTGTTGATTCTCCATGTACTGTATGTGATTTGTTTTAATCCTGCGAA
CTACAAATGCAAAACTTGAGTGTTGATTCTCCATGTACTGTATGTGATTT
GTTTTAATCCCCTATTTATCCCAGTCTTTCTTTCTTCGTGTGCTTTCCTT
CTTGTTTATCTGTTCATCTCAGCCTTTTCTTCTTGTACGTTTCCAAGTGT
TGTCTGATACTAAGACCTAACTTGTGTACCTCTTTGCTGACAACTTGTTG
TATATCTAAAATCTGAATACATTTAACTTTGAGATATTGCGCAGGTGTTG
AAAAGAAGGCTGAGAAGGAGATGCTGGAACTACAAGTAACATTATGGGCC
TAAGTCGGTAAGTCTTCTGGGTCTTCCCGTAGCCGGATTGGACTCCGTCT
TCTCTCCTGACTAGGCCGCCCGTGAAGCAAAGCTCTAACCCGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.