Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE046298

[Submit comment/correction]

Sequence	AE046298
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE046298
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTTAGCCAGCCTCCCTCGCTAAACCCGATCCGGTTACTCGACTCGACTA GGGCGCACACACGCCCGCCTCCTCCCCCCCGTCCCTCTCCCCTTTCCACC TCCCGCCCTATCTCCTCCACCTCGTCGACGAAGCGGCTGCCATCGCCGCC GCCGCCGCCACCGCCACCGCCCCCGACGACGACGAACCGCGTGGTGCAGG TAACACTCGATCTCCCGGACAGGTCGCCCTCCCCCGATGCACGCTGAACG GCACGGGTCTGAGGTGAGGGAAGGAGGGGCGTATGGTGAGGCCAGATCCG GACGACGCGGGGGGAAGGGTCGAATCGGAGGAGGGATTTTATTTTTATTT TTCGGTTCTCGTCGGGACGAGCATTGGCGCGCTCGCGGCCCGGCGCCGCC CGATCCAATCTGCGGGCGTTCGGGCGTGCGAGGTCTCTCCTCCGGCCGCC GTCGGGTTGGGACGGGGCGCGTGCTTGGATTGCTTAGGTTGGGCGGGCGC GGGCGCCCGGGAGCTGATGGCGTTGTGCCCCAGCTCCCGTGCTGGGGCGC GCAGTAAATTTTGTCGCTAGCTGTTTGCAGGGGCAGGCGCGTTGGAAGGA TAGAGGATTAGTTTTGACGTAGGTGATTTAATGCTGCCTAGGTTTAAGTA GTCTTCGCTGCCTCAGGATTCTAGGTCTTGTTAGGTTCAGCGACGGATTG TATGTTTCGTAGACCAGCCATGGTGTCCCTGTGATCTGGAAGGAGTATTT TATGCCGTGTGACAGGAACTAGCTCTTCTTGGATCCATTGTATATGTGAT TGCTTGAGCGTCTCACTATTTAAACTCTTCAATGCCAGCTCTGTACACAG TACTTTTTATCGAGTGCTCGTTACAAGTTTGCATAGCCCGATGGATATAG GTTTTACGTACAAACTAGTGAACAGCCATTCCTACCTAGTTGTTTCTGGT TCTGGTGTCTTGGGGTGGTAAGTTATAGGTTTGTCCTTTTTATGTTGCTT TTGTTACCGAAGCCAGATGTCTAATGGCTTAAGTGTCTTGATTCATATTG TAGGAAGGACGAGGTCGATACTGTAGCTACACTGCACCTCCTCGAGTGGA TAGATTAATGGCTGGAGAGTTGGTCGAAGACCATTCAGCGGATGGTAGGT CCTCGTCAACCGAGGACTTGCCGAGCGATCAACAAAGCCATTCTGGGGAA TCTTTAGCTGAGTGGAGGTCAAGCGAGCAAGTCGAGAATGGAACACCATC CACTTCACCAGCTTACTCAGACACTGACGATGATGATTGTGGTATGTTTG TTCACCTTATCATGTCTTCATATTACCTGTTATTGCTTTATCCGAACATG TTTTTTGTAACTTTTAATATATCCTTTTCCAGTTACCGTCTTGTCTCGGT CATATAGACCTACCGAGTCATCATGAAACTGTTCTTTCTATAGAAGTAAA ACAATTGATTTGGTTGTGGTGCTACTTACTGCATGTAGAACTGATTAAGT GATGTCCCTGAATCACTGCCCATGGCCCCATGCACTATAGTGGAATTGGA ATGATGACTTACATTTACCTTTTGGGAGTTTATTTTATCGTTGCAGCTGT GCAATTCTGGGTTGAATGGGTTAGGGTTAGGAAAACTATTCTGAGCAAAT TAGGGCATGCCAGTTTTTTTTCCTGATTCAGCCGGTTATCTTCTGTGCTC TGATGAATCAGGATTCAGGAGTTTGAAGCAGTGAGAAATAGTTGCATTTG GACCACTTAAAACATAGGCCCATTGATCGTTGCTAGAAATTAACTAATTA TGCAACGGCAATTGTTCACATACAAGCTTGAAAAGTCCTCAGGTGATGCT AAGTTTTATTTGATTCTAGTGCTGAGCCGACCTTAACGATATTATATACA TTCAAATGTATCGTTTTGGTGCTGTAACTTCTACTGAATTTTAGTCATGT AGTATTTGCTCATGAGACATGCAATATCGTTCATAAGTGTAACTCATATC AAAATGCTAACTGAAATTTCAGTCAGATTAGAGTTGGATGGTTGAGATGA GTACCATGATACTTCGATACTTATCACCAAAGCATTACTTGACTTGTATA TTCCTGAGGTTCTAGAGTTATTTATTGGAAGCCCAAGTATTTTTTGCTGA ACCTTGAGGTTGAAACTCAGTCAAGTAATTGTGAAGTTATGTATGGAAAT GGAAAAAGTAATAATGGAATACTAAAATATCATCATTTGTCACACTAGCA AATAGTTTTGACACGTTCAAGAATATTTATTTATTTGACGCTGTAGTTAT ATCAGTTTCTTAGGGTTCTATCATGTTTGAATGCCATGAGAGTCAAATAC ATGTTCCCTAACAACCGTTGCTTAATTTACGTTACTTGTAAAACCTGACC TCACATATCCGTTTCAAGTTTCAACAAGAAAAGGAAACATCAGGCCTGGT CTGTTTTAATGGATTCACTGTGAGAGAAAAATATACTCCCTCCATCCCAA AATTTAAGGCATATAAGATTAGTCAAAAGTCAACATCTTCTCAGTTCAAC CAAGTTTATACACAAAAACATGAATATAAACTTGGTCAAACTGAGAAGTT GTTGACTTTTGACTAAGCTTATATGCCTTACATTTTGGGACGGAGGGAGT ACTTCTTAATTAGGTTACAACAGTAGGAATCCACCTACCACCTCATGCTT CCAAATCAGTTGCACCATCAACAAGCCAATGCTCCATCATGTGGTTTATT TAACAGGCTCTGTGTTACCTTGTTTAGTATGCTCCATCACATGCCATTTT TTTGTTTCGAGAATGATTGTTTTATATGGTACTTATTAATTCCATTCTGA TCACCATGCTGGCTTGGTGTTTGGAGCGGGATGTTTTGGTATCACTGTAT CAGAGCATTCTGGTGTTCCATTCTCGGTTTCTATAAGTTACATGCATATA ATTTTATATACATGCATACAATACTGCTTGTGCCATGGATGATCAAGGAC GGGTGCCAAGGGTCTAGGATCGATAGTGCCAATGGTCTAGGATCGATAGT GCCAATGACCTGTGACGTTCACTGATGTACTTTTTCTCTTTGTTCTTCCC TCCCTAGGGAGGATGTAACCAAACTCTCCACCTGTTCAATGCAATGAAAA GCAAAAGTCTTTTGCGTTTTCTCGAGAAAAAAAATGCATACAATACTCAT ACTATTAAAGAAAGTAGAAAAAAGTATGAAAAGGACAAAATGATTAGTGG GGGCTTGCCTAGCATTCTGTACAACGTGAGCTAGAAGTGACCGGCCCATG CCCCCGAGAGCAACAAGCCTGTAGGTACCAGCCCAATGTTCCACAGCCGT TCTGGTTTTGTTAGAAAGGGAAAACCTTCCATGTTAGTCCCACCTCGCTG AGAAGAGGATTAAGTGGGTGGATTAGCGCCTACGTAAGAGTACCAGAGTA CTGCAAGACTAACAGTACTACATTGTTCAGCCAGTACCGGGATGACTGGT ACGAGAGTTGTGGCCGGAATGACCGGAGTTTTGACTGGCATGTGATGGCA CCTTGTGCATACAATTTTTTTAACCGGAGAACCAAACGTTCTGCCCATTC TGGTCGGAAACAGAATTGATAGTTACACAATTTACTACCTCACATATAGG AAGATTCTACTGGAGTGCATGTTTATGAGAATTGGACATTCTAATAAGTT GATTTAGTTTTTTATATCTGCATTTAATCCTTGTAATTTCTTAAATATTA GCATCAACTGTTATTTGACGATTTGCTTTTATTTCCTTGTATCAGGGCCA AGGCCTTCTGAACTATATGGGAAGTTTACATGGAGGATTGATAATTTTTC CCAAATTAACAAGAGGGAGCTACGGAGCAACTCCTTTGACGTTGGTGGTT ATAAATGGTATGGTATTCATAGATTATCAGTTGGAGTTACAGTATCATCT TTAGAAGTTTCTTCTTGTTTTTAATTTGTTATTATTGTACTGCATCTATG GCATGTCTACTTTCAATGTGGTGCCTCTTAATTTTATTTGCATACACATT TAATCTGGACACGACTATTTATTTTACTTGCCTATCTTTTATCTAGTCTG TATGTACTTCACTGTCTGTTCTATATCCTGCTAACTTTCATATGTCAATA AGTACCACCTTTGAGGTAGATTTGTAGGGCCAAGCTTTTGTTTGGCATCA TGTGTTGATATCTGCTGGTTGACTTCCAGGTACATCCTGATTTATCCACA AGGATGTGATGTTTGCAATCACTTGTCACTGTTTCTTTGTGTTGCGAACC ATGATAAGCTGCTCCCAGGTAGATGAAATGATCCATGTATTGCCAACCAT GCCACACTTCTTGATTGCACAATGGTATCTTGAATTTTGTTTGCTTCTAT TTTCAGGATGGAGTCACTTTGCACAGTTTACAATAGCTGTAATTAATAAA GATCCGAAGAAATCCAAGTATTCTGGTGAGTTTGAATATACTGCTATTCT TGTTTAGCTGGTTGTTTTGGTTGAGTTTTGCCTATGAAGCTTAAAGGAAG TGCCATTTCAGATACGCTGCACCGATTTTGGAAGAAAGAGCATGACTGGG GGTGGAAAAAATTTATGGAGCTCTCAAAATTACATGATGGCTTTGTTGTT GAAGATGTTCTAACCATCAAAGCTCAAGTTCAAGTCATTAGGTATCTGTT TTCTGTAGTTATTTGGCTTCCTTTTTCCTTCTGTTGGTTGCACCAACTCT GGGTGGACTGTAGTGTTGCATCGTTTTGTTTTGGAATTGAGTATATATTT ACTTTGCATAACCATGTCTGCTTCTGCATTGTGTTATTTGAGGGAGAAGG CAGACCGCCCATTTCGTTGCCTTGATGGCCAGTACCGAAGGGAACTAGTT AGGGTGTATTTATCAAATGTGGAGCAAATTTGCCGGCGATTTATTGATGA AAGAAGAAGCAAGCTTTGCAGGTTGATTGAGGATAGACTCAGATGGTCCA GGTTAGATAAATTATCTTTTTGCCTACTGTGTTATGGCTTATGACCAAGC ACATTTCTAACATATACCATTTTCTAATCTAATATATAACATTTTGAATG TCTCGTGCCAATCTCTTATAAAATGTTTAATTGGTGTGTTGCAGTTTCAA TGCATTCTGGCTAGGGATGGATCCAAGTGTGCGGCAGCACATGACTAGGG AAAAGACTGACACCATATTGAAAGTTCTAGTGAAGCATTTTTTCATAGAA AAGGAAGTTACATCAACCTTAGTAATGGATTCACTGTATAGCGGACTGAA GGCTCTGGAATATCAGAGCAAGAACAAAAAGGGGGTGTCCAAACTAACGG AGATAGATGTTAGGAACACTTCTATGGTGCTTGTTGAGCAGGATATGTTT GTCTTGGCAGATGATGTGTTACTCTTGCTTGAAAGAGCTACATTAGACAC ACTGCCACACCAACCATTGCCTGCGAAGGATGAAAAAAGTTCACAGAACC GCACAAAGGTATGCCTTTTTCTGTTTATCAGTTTATACAGTTAGCTTATT GAGGTAACATTCATCTACTGTACAATATATATAACATGGTCACTCTATTG GATATTAGCTGCAGATATTTTCATTTTGTCTTCAACCTTTTTATTTATAT AATTTCAAGCACCTTTTGTCATAACCAGAAGATCTGTATTTTTGAGGTTG TATTCAACAAACTAAGTATTAGTAAACAATAGTGTTGTGAGATAGGATAT AAGTGTCACTTACTTGTGTCTTGATGTTCTAACAAACTAAATATTAGTAA ACAATTGTGTTGTGAGATAGGATCTAAGTGTCATTTACTTGCGTCTTGAT GTTCTACAAACTGGAAAATAAGGTTCTTGTTCTACTCTATGTAAGAAGTC CTAACAGACTATGTGATTATAGGATAGCAGCTCAGGTGATGACTTCAACA AAGACTCTATTGAGCGTGATGATAGACGACTTATAGAGCTCGGCTGGAAG ACGCTAGAATTTTTTGCCTTGGCTCATATATTCAGGTGAGAAGTTTTTCT GCAGTACAACGTGGCTATCTAGGGGTTCATATTTTCTCCACAGTTGTATA TTGCAAGAGTCAGCAACTTGAGATATAAATTCCCCGCATTTATCGCTAGA CTTGACCTGTTTTTTTCTGTTACTTCGATACTTCTACTATTCCAGTGCTA GTTACCATCTGTGGCAAGGCATCCAACTGCCATTATTAGATACTTGATAT ATCTGTTTCCATATTATTTTCCTTGGGAAACCAGGTATACCATGATGAAA TTCATACATCTTATAGGTCTTGGACTCTTGAGTAAATTATAGTCTCATTC ACATGTTACTTACAATTCTTGAATCAGTCGAATTGAAGTGGCATACCAAG AGGCGGTGGCTTTGAAGCGCCAAGAGGAGCTCATTCGTGAAGAAGAAGCT GCTGGGCTAGCAGAAATTGAACTTAAGGCAAAGCGGAGTGCTGCTGAGAA GGAAAAGCGTATCAGGAAAAAACAGGTTTGATTCATCTGCTAGTGGCTAG TGTGACCATGCCATCTTATTTAATCACTATAAATTTTATCGGTCTTTCTA AATTCAGATAGAACAATCTCTTGGTTTCTAGTTTTTGCCATATTCCCCCC TTAATCTGTTTGGATGTTACTTTGTATGTACAGTTGAATTATAGGATATT GAAGTGTTGGCACCTAATTTATTTCATCATCTGCTATTCTGTTAGTTGAG GACATCTTTGATAATGTCTTCTCTTTCCCCCAGGCCAAACAGAAGAAAAA CAGTCGGAAAAATAATAAAGGCAAAAATGAAAGGGTTGACATGAAGGATA TATGTATAGAGAGCTGTCCATCAGATGATAGAATCCCTGATGATTTCTCA AGTCAAACTGAAGAAGTGACCTCAAATGCCGACAATCCGGACGAAGCGTC TGATGTCTCTGATGATAGAGATGATAATTCAGAGGTGCTTCATGGTGATT TTGAAGACTGTGAATCCAGTCCGGTTAATTGGGAAACAGATGCTTCAGAA ACTCAAGGGACGACTGTGCCTGAAGGTGGTGATGTGCAAAATGACCAAGC AGGAAAGAGGACTTCATTTGTGGATGATAGCTCGTCTACTTGTTCATCTG ACTCAGTTCCTTCAGTTATGAATGGGTCATCTTCAGGAGGTGCCTGGACA AGTGTCAGATCCTCATCCAATAGGTATATTTTTGTTTTATTACTTTTTCC CATTGTTTTGTCGCATATTATTTATTATGCTGTATTTCGTGATTCAGGGG GAATAACCGGAGGAATAAGGATACTGATGCACGGACAGGGCTTGCACATG GTGGATCAAATTCAGCACCTAATGGTATTTTCGGATCTAGCAACTCAAAG GACATGCGACTTGAAACTGAGGTATGCACAGACCCACCAGCCTTTTCATT TATGTTGGGCAGTTTGTGAGAAATATGCCATAAAGCAGTTCATTTCAGAT GATAAAAAATGTATTGCAGAAGGGCGTTGTTCTCTCTTGCTATTTCTTTC ATCAGTTTGTTAAGTAGTCTGCTTGACTGAATAAGAATCCAAATTAACTC ATTTCAGGACGACAAAGTTGTATCACAGAAGAAGCAAAATGCACACCGGC ATGTTGATGTCATGAGCCCCTCCAAGTTAAGAGTGACAGAGTCTTCCTTT CCTTCTATGAGTCTTGTTAAGAAGCAACCTATCTTCCCCCAGCAGCCAAA ATCTTCATTAGAAAGCACCAACAGTCTGAGTTCCCGTGCAAGCGAAGTTT CAGGTGCTGCAGCTACTACTACAAGAACTGGTGTCTCTTCAACCCAAACA GTTCAGCTAGTTCCTAATAAAGGACCTCCATCAAATCCTCCAACCCATAC TGAGAAGTCAGTTCCAGTTGTAAGTAGACCTCTGCAGGTACCTGTACCCA TCAAATCTGTAGCTCAGAAGCCTGCTTCTCTGGTAAATAGCGCTGCCACT ACCCAGGTCCTTACAGTTTCGAGGCCCTTGAGTGCACCACAAGTCCCTGC AGCAAAACAAGCGGCACCTGCTGTTTCAACAGTTCAGACTGCACCTGCTC TTTCTCGCTCGAGGAGTGCAGTTGGACGGTTAGGCAATGAACCTTCTGCC AGTGCTCCTAGCTACATTCCCCGGTCATACCGTAATGCCATGATGGAAAA AAGTTCTGCTGGGGCAAGCGGTCTCACTCATTCAACAAGTTTGTCAGGTC AGGGAGTTACACTCTCACACTCAATGTTTTCATCATCACCTTCCATTCTG TCACCAGATACCTCATCTAGGAAAGAAAATTCATCATTGAAGCCTGGATT TACGTTTGGAACCGTGAAGCCTGAGTCACTCAACCAGTACCAGTGGAGAG AGGAGGGCTCACAAGAGGCGAGCTGCAGCAGCAGCAGTAATGATCATGGG GTACTGAATTCAAGCATGGGCAATGGGCCTGAGAAGCTCAATCCGAATGG AAGACCACGAAGCAAGCAGCTGTTGTCAGAAATTTCTACCAGATTTACTC CATACCAACCACAAGGCGTGGTCGGCGATGAGTTTCCTCACCTAGACATC ATCAATGACTTGCTGGATGAGGAGCTCAGCGACAGAAGAAAGGTTCTACA GCCAGGATTTGCTCGGCAGTTCTCTCTGCCCAACAATGCCAGCACGCCTG ATTATGGCATGTTTAGTGATCCGTACCTATTTGACCAGTCGGAGCAGTAC TATGACGAGGATCTTCCACCGTACTACAGTGATCTGAATGGTGCCCCTCA AGGTCTCAGGGACAGGAGTTATTCACAGTTTGACCTGCCCTCTTACTCCA GCAGCCAGTTTGATGATATGGCGATGAGCCAGTGGCCATACAGCCGCGCT GACAACTCCTCCATGCCAAGCTTCGGGGCAGACATGAACGCCTACCCCTA TCAGTTGAGGGATTATCCGACCTCAGCAAACGGAGCAAGCAGCCGCTATC CATCCTATCACCCTGCGAACGGGCATTGAGCCCTTCCGAGAGATGAATAA TGATTGCAACCGTAATAATGCGTCGTTGTAGTCCCGTGCTGTTTGCTTCT GAGCCGAGTGTAATTGTAATCCTTCCCTAGAGCTAGTAGTCTTCTAAAGA AAATGCTTCTCAGTTCCTTAATAGGCTATATTTCGTTGCTTGATATAATT CAGTCAGTTTTGCCCCTGTGCTTGGTAAAGAATATCAAATCAGTTACATG CATACATAGTTACATAGTTTGGGTTAGCCTCTTGCATCATTGATTTGCCT TGGTAGTTGTTGTTACCAATGCGTGTTTTGGTTGATGAGCTGCTGGCCTC GCTGAGTATTCCATGATTTCACGGAAGCAGCGGAGAACACCAAGCTGCAT GTTCTGGGTTACCTACGGAAGCAACATGGATTATTTTCCATGCCGCCCTA TGTTAGCCAAAAGGATGATTACAATGTAGTGGAATCAGGTGTTGTATGTT GCTCTTCTGAATATTCCATGATTTTTTGTTGTATGTTCCAAAATATTACT CCCTCTGTTCCAAAATATATGATGTTTTAGTTTTGTGAAAGAGTGTATTT TGGAACGGAGGGAGTATCTAACAAGTCATTGTTGCGAAGACAACATGTTG ACAAATGACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.