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GrainGenes Sequence Report: AE045123

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Sequence
AE045123
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE045123
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCAGGTGCTTCGTCAGGCATTCTTCTTGGCGCTGCTACTCTGCCTTGTG
TCATATGCTTGCACGATTAATCCAACTTTCGAGGATCGTACTGACAGATC
CTAATGAACCAGAAGGTATCTTTCTATTTTATCATCTTGATCATCTTCAT
CAATAATTGACAAGTCAGCCATCTTTTGAAGTGTATTTATTATCTTTTAT
GTGATATTGATGTTTTCTCTGATGCATACAGTTTACCAACTGCACTTTTT
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AGTTCTGGCTTGAGCTATTGGTGCGATTTAGGAACTGAGACTACCTCAGT
TGGTAGGAGGTATGGTGGACACTCGGCCCACCACCTAGTTTGAGTCCTCT
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TTTCTCCTGTTAATCTGAAGGAAACCTTATAGTGTGTTTATATCTGTTCC
TTATTTTGGCAGGGGATTTTGCTTGGAATTTTTCTACTTCCCTTGTTGTG
CAAATGTTCCCTTCAAGTTTGGGTTTGCTGTCGAACACTGGGGAAGCAAA
GAACACAAGCAGTTGAGAAACGGGCAGAAAAAAGAATAGGTTCTGTTGTA
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CTAACATATTATTTTAACTTTGCACTTTGTTCTTTCTCTTAAAAGTTAAA
ATCTTCTCTGTATTTCGTAGATACTTATTTTCTGTTTTCTTAATGGCTCA
TTATTTCACAGGGTTCTTCACTATATGTTCATTAATTCACATGAACGTCT
TGCTTTATGTGCATACTGGATATGTGTGATATATGTATCTATTAGAAGGC
TCTACAGTATATCAAAGGAAAACACAACAGAAAGGATTCTTTTGCGCAAG
TACTATCATCTTGTTGCTGTTCTGATTTTCCCTCCTGCTGTTATGCTTCA
GGTAATGTACATGTTCCTTAATTTAAATCCCATCAGAACATTCAAGATTA
TCTAGATTAACTTGTTCTATGTTTTGCAGCCTGCTTTCTTGGACTTGGCA
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TTATATTATTCAATAATTTCTGAAATCCTAGAGGCCCACTTGGCCCATTC
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TGGAAGTTGGACCAGCTTATAAGGAGAGCTCTTCCACCACTTGTACGAGC
TTGAGAAGAGAAGACATACACACGCGCGCTTCTCCTCCGCCGCCCGCCTC
GCCACGCCTCGTCACGACGCGCGCGCGCCGCGGGTTGCGGGTTGCGGGAC
TGCCTCGAGCCGAGAGCTTCTCTTTCTTTTTGCCACGCATAAATAGATAA
TAATTTGAACAGTCAACTCAGTGGAGATTTAATTCGAGCTTAGTGGAGGT
TGTTCGGCTTCGGTCGATGCCTGTTCGCTTCCTCTCCCAACGCCGACTGT
TCGCCTGCCTACTCGTGCCTATAAGAGCGAGAGGTCGCTCCTCTCCTCGG
ATACACCAACGCACCCACCCAGTTTCAGAGCATTGCGCTGCTTAGATCTT
CCCCATCCCGTCTTGCGGCGTGCACCGCGAGCTGGGATAGTAGGCCTCCG
AGACCCCGCTACTTCGAGTCCTGTACGGGAGAAGGGCGATAAGGTTTTTG
GGGAGCGCTACCAGCGCGACTACTGGCTCATCACGGACTCCTTCACGGAT
AGCGACTGCAGCGACGTCTTGCCCAACGACGACTTCTTCCCCGACATCAA
CGACCTTTTCCTCGACAACATGGTTGACGACGGTGCCAACGCTAATGGGA
ACACCGACGGTTCCTCTACCGTGATGTATATCATCTTTTGATCTTTTTCT
ATTATTCTGCATATGCTTTATCTGTCTTTTACTATGGTTAAATCTCTTGG
AAAATTGCTCTATTTATCAACAATCCAAAAACCTTATTATAGGCAATTTG
CTCCAAGTGGTTTCGTTGCTTCTGTGAAGCCACCAGTTTTTGAGGGTACG
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CTGCTATGACGCCACTCTTGGCAAGCCTGAGGGAGAGCTTACTCCTGCTC
AGGAACAAGTTTTTCGGAAAACTGATACCCTGTTCAAGGATGCTTTGCTG
TCTATTTTAGGGGATAACATTGTTGAACCCTATATGTCATTTGATAATGG
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GCAGTGAATTGTATGTCATGGAACAACTCTATGACTACAAGATGACTGAT
GACCGCTCCGTGGTTAAGCAGGCTCATGAAATACAGTCACTGGCCAAGGA
GCTTGAGCACTTCCCTTGTGTTTTACCGGACAAGTTCATTGCCGGGGGCA
TTATTGCCAAACCTCCCCCTTCATGGAGGAACTTTGCTACTTCCCTGAAA
CACAAGAGACAAGAGTTTTCCGTAACATATCTCATTGGAACTCTTGATGT
GGAAGAGAAGGCGAGAGCAAAAGACACACGTGCTCAAGGTGCTGAGGGAG
GTTCAAGTGCCAATCTGGTACAACAAAAGAACTTCCAGTCACACAAGTCC
AAGAACAAGAGAAAGTTTGATGGAAAAGGAAAGTTCGATGGAAAGAACAA
AGCCTCACAGTCTACTAGCTTCAAGAAGAAGACTGATAAGAAGAAAGGTG
CTTGTCATGTGTGCGGTGATCCTGATCATTGGGCTCCTGCTTGCCCCAAC
CGCTTTGACAAGCACCAACATAGAAAAGGCAGCAAGACTGCTAATGTTGT
CATGGGCGACGTTGAGATGAAAGATGTTGGGTATGGTATATTACCTACTG
TTCTTTCATTGTGTCATTCTTCTGATTGGTGGATTGACACGGGCGCTAAT
GTACATGTTTGTTTTGATGTTTCCATGTTTTCTTCATATCAGGTCAGAGG
GGCTCAGTCCGTGCTGATGGGGAACGACTCACATGCTTTTGTTCATGGTG
TTGGTACGGTCGATCTGAAGTTCACTTCGGGAAAGACCGTGCGCCTGAAG
AACGTGCATCATGTTCCCTCAATAAATAAGAATCTTGTTAGTGGATCACT
TCTATGTCATGATGGCTACAAGATTGTGTTTGAGTCCAATAAATTTGTAC
TGTCTAAGTTTGGAACATTTATTGGTAAAGGATATGAGTGTGGAGGTTTG
TTCTGCCTGTCACTGTCAGATGTGTGTAATAAAGTCGTGAATCATGTTTC
ATCCGATCTTGTATCAAATATCTGGCATTTACATCTTTGTCATGTTAATT
TTGGTTGCATGACGCGGTTAGCTAAAATTAATATAATCCCAAAATTCACT
ACTGTGAAGGGATCTAAATGCCAAACTTGTGTGCAATCAAAGCAACCTCG
CAAGTCACATACGACTGCAGAGGTGAGAGATTTGGCGCCACTAGAGCTCA
TACATTCAGATCTTTGTGAGATGAATGGTGTGTTAACAAAAGGTGGAAAG
AAATATTTTATGACATTGATCGATGACTCTACGAGATATTGTCATGTGTA
TCTTCTGAAATCAAAAGATGAGGCTTTGAGTTACTTCAAAATCTATAAAG
CTGAAGCGGAAAACCAACTTGATCGAAAGATTAAGAGGCTTAGGTATGAT
CGTGGTGGAGAGTACTTTTCCAACGAGTTCGATTCTTTTGTGCGAAACAT
GGTATAATCCATGAGAGGACGCCTCCCTACTCGCCCCAGTCAAACGGGGT
AGCCGAAAGAAAGAACCGTACTCTAACAGATTTGGTTAATGCCATGTTAG
ACACATCGGGTCTCTCCAAGGAATGGTGGGGGGAGGCATTACTGACTGCA
TGCCATGTCCTAAACCGAGTTCCCACTAAGAACAAAGAGATTACTCCATT
TGAAGAATGGGAAAAGATAAGATTAAATCTTTCTTACTTGGGAACTTGGG
GATGTCTGTCAAAGGTTCATGTGCCAATCCCAAAGAAGCGCAAACTTGGA
CCAAAAACCGTGGACTGTGTTTTTTTAGGATATGCTTTTCATAGCATTGG
CTATAGATTCCTGATAGTAAAATCTGGAGTACCAGAAATGCATGTTGGTA
TAATCATGGAGTCAAATGATGTGACTTTCTTTGAGGATATCTTTCCCATG
AAGGATATACCTAGCTCATCAAATCAGGAGATACCTGACTCATTGAATCA
GGAAATACCCACAATTCCTAAACATACCATTCCTATTGAACACTCGGAAA
AACCTGAGGAGGATGATAATGAAATTCCTAAGAGGAGTAAGAGACAGAGG
ACTGCAAAATCCTTTGGTAATGATTTCATTGTGTACCTTGTGGATGATAC
TCCTACTTCTATTTCAGAAGCCTATGCATCTCCTGATGCTGACTACTGGA
AGGAAGCCGTTCGTAGTGAGATGGATTCCATCTTAGCGAATGGAACATGG
GAGATCACCGACCGTCCTTATGGATGCAAACCTGTAGGATGCAAATGGGT
GTTTAAAAAGAAACTTAGGCCTGATGGTACTATTGAGAAGTACAAGGCAA
GACTTGTAGCCAAGGGTTATACCCAAAAAGAAGGTGAGGACTTCTTTGAT
ACTTACTCACGCGTAGCCAGATTAACCACCATTCGACTAATGTTGTCTTT
GGCTGCCTCACATGGTCTTCTCGTTCACCAAATGGACGTTAAGACGACTT
TCCTAAATGGAGAGTTGGATGAGGAAATCTATATGGATCAGCCAGATGGA
TTTGTAGTAAGTGGTCAAGAAGGAAAAGTGTGTAAGTTATTGAAGTCTTT
ATATGGCCTTAAACAAGCACCTAAGCAGTGGCACGAGAAGTTTGAGAGAA
CCCTAACCACTGCAGGTTTTGCTGTAAACGAAGCTGACAAATGTGTGTAC
TATCGCTATGGTGGGGGCGAGGGAGTAATTCTTTGTTTGTATGTTGATGA
CATACTGATTTTTGGGACCAATCTTAATGTGATTAAGGAAGTCGAGGATT
TCTTATCTCGGTCTTTTGAGATGAAGGATCTAGGAGTAGCTGATGTTATT
TTGAACATCAAGCTATTGCGAGATGATAATGGTGGGATCACACTGCTTCA
GTCTCACTATGTGGAAAAGATCTTGAGTCGTTTTGGGTATAGCAACTGCA
AGTCTTCTCCAACACCGTATGATCCTAGCGTGTTACTTCGAAAGAATAGA
GGCACTACTAGAGATCAATTGACATATTCTCAGATTATTGGGTCGCTTAT
ATATTTAGCTAGCGCTACGAGGCCTGACATCACTTTTGTTGTAAGCAAAC
TCAGTCGGTTTGTTTCAAATCCTGGAGATGATCATTGGCAAGCTCTTGAG
AGAGTCATGCGCTATCTAAATGGCACTGCGAGCAACGGCATTCACTATAC
TGGGTACCCAAGGGTGCTGGAGGGATATAGTGATTCAAATTGGATATCTG
ATGCTGATGAGATAAAGGCCACAAGTGGATATATATTTACACTTGGTGGT
GGTGCTGTTTCTTGGAAGTCTTGCAAGCAGACCATCTTAACGAGGTCAAC
TATGGAAGCAGAACTCGCAGCATTAGACACAACCACTGTTGAAGCAGAGT
GGCTTCGAGAACTCTTGATGGACTTACCTATGGTTGAGAAACCTATACCC
GCAATCCCAATGAACTGTGATAATCAAACTGTGATTGTTAAAGTTAAGAG
TTCTAAGGATAATATGAAGTCCTCAAGACATGTGAAGAGGAGATTGAAAT
CTGTCAGGAAAATGAGAAACTCCGGAGTTATTGCATTGGATTATATCCAA
ATATCTAAGAATCTGGCAGATCCCTTCACAAAGGGTCTATCACGTAACGT
GATAGAAAATGCATTAAAGGAGATGGGTACGAGACCCACAATATAAGTTT
TCCACAATGGTAAACCACTCTATGTGATCGGAGATCCCGTGAATTAGAAT
TGGGAGAAGCTGTTGGTTAACTGAGAGGAAAGTATCCCTACTTTAAAACA
CCACTCCGTGAAGATGCAATACTTTCCTATTCTGCATGGCAAGTTGATTT
ATCTTAATGTGTTCTAAGTGGCTTAGTTTAAGCAGAGATGTTACCCTGCA
GAACATCTTTTGAAGAACATACCTATATGAGTCTGACTATTAAACGTCGT
AGTCTATGAGAGTTGGGTGCTCTCTAATAAACTCATGAAAGGCTATGGAG
TATGACACATAAGCTCCACCCGAGGGGAAGTCCCACGGCAGCCCAGTATT
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ATAGTCCACTGTACAAGTTGCAAACTAGTGTAGCATATAGTTCTAGGTGG
AAGTTCAACTTAACAGTCTCCACTAGTACCAGTATATAAACAATGTTTTG
GAACCATAGGCAAATTTATGTGTGCCTCTGGGATCTGGTAGGGGATTGTT
GGAATTTTGCCTAATAAAGGCACATCCTATTTATATTATTCAACAATTCC
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CAAGAGTTTAGTCCCACATTGCTAGTTGAGTGGAAGTTGGGCCAGCTTAT
AAGGAGAGCTCTTCCACCACTTGTACGAGTTTGAGAAGAGAAGACATATA
CACGCGCGCTCCTCCTCCGCCGCCCGCCTCGCCATGCCTCGTCACGGCGC
GCGCGCGCCGCGGGTTGCGGGTTTCGGGTTGCGGGAATGCCTCGAGCCGA
GAGCTTCTCTTTCTTTTTACCACACATAAATGGATAATAATTTGAACAGT
CAACTCAGTGGAGATTTAATTCGAGCTTAGTGGAGGCTGTTCGGCTTCGG
TCGATGCCTGTTCACTTCCTCTCCCGACGCCGACTGTTCGCCTGCCTACT
CGTGCCTATAAGAGCGAGAGGTCGCTCCTCTCCTCAGATACACCAACGCA
CACACCTAGTTTCAGAGCATTGCGCTATTTAGATCTTCCCCATCCCGTCT
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GACGTCTTCCCCAACGACGACTTATTCCCCGACATCAACGACATTTTCCT
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ATGACTTATCTTTCTTTTACTATGGTGAAATCTCTTGGAAAATTGCTCTG
TTTATCAACAGTATACCTCTTTGGCATACTGTACATCAATTCATGAATGC
CTTCACTGATCATCATGATTCTGAGATTCTCATTATTAGGTAAGTGTGCT
TTGTCTTTATTTTCCATATTTATATCTCCTTTGCATATTTCATTAGGTAA
AACTTGTCTTTTATTGTTTCGTTTTTAGTCATTTTTCACTCTTACTGGGC
TGTGCACTTCCTAAGTGGATGTCATCTGGATTCAATGACCGACCACTTGC
CCCTTTTGCTGGAATTCTCAGCTTGGGAATATGTGACACCATGGTATGTC
CAGTGTTCAATAGTCTGTTAACTTTTTGTACTGTCAGTCTCTTTTCCCTG
ATGAATTCTCCCATTTGACATGGGGGTGGAGGCGGTAAAAAGTGACTTGA
GGGATTGGAATGTACCTATAAATTTGGCTCTTGATAGGATTGCATAGAAA
TCAGCAATCCATGTGTCAGAATCTTATTTTTTTGTTTCTTTTTTCTGTCT
TCTTTCCTTTTTGGTTTCCTTTTGTTTCTGTCAGGTTTCATATAACTTGC
TTGGGAAAAAGGCTTTGATGTTGTTGTTGTTGTTGTACCTAGGCATCAAT
GATAGGGTACAAGTATGGTGTTCTAAGATGGAGCAAGACAGGAAGTGAGT
TTGGTCATAATTATTTCTCATTCCTCCTTCCTCCTTCCACACTTGCTCTC
TGATTACTTATGCATTTTTTCCTGAAATGTTAGAGAAAACAATTGAAGGC
ACAACAGCAGGCATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.