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GrainGenes Sequence Report: AE006955

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Sequence
AE006955
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006955
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCTCAGCGCGGTAAGTCAACATTGGCAAGGCGACAGTGCAACACACGC
GCGCACACAACCTTCAGATCCAATCGACCAGCACATACTACTACTCCACC
TCCGAGCGACCGAGACCAGTTTGCCACCGCCCACTTCGTCCTCCGTTCGC
AAATCCTCTCCTCCGCGCCGCGCCCTCCCTGGCCGGCGAGAGCCCACCCA
CGCGGCTCCGCCTCTCCAGCGCCCACGAAGCCCCAATAGGACCCCGAGGT
CCCCGTATCCGCGCCGCGTCGCAGCCGTAGCCGTCGCGGGCGCCACAATG
GTACGTGCGCCTCTCTCCCTCCCTCTCTCCCGACAAACGGCTTCCTCCCC
GCCTCTCCTCGCCTCTTACACGAGAATGCGATCCGAGATCAGGCGATGGC
GAGCCGTCCCTTGCCGCGCGGTACCGCGGCGAGATCCGCCGCCAGACACG
TGGAATTCCCAGTGGATCTGGGCTTTCAGTTCGTTATGTACTGACGTGGT
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TGGATCAGAGGAAGCTCGCGCAGAGGTCGGAGAGGGTCAAGTCCGTGGAT
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ACGAGGAACTTCTAGAAGGCTATTGTAAGGGAACAAGTGACAAAGGAGGC
GCACAATGAAAATATAAGATTCTTTTCCTTATGACTGAGATATGACCTTG
TGTAGTTGGTCTTAAAACTCTACTAATGAAAATGTATTATTTTTCCCCAG
ACAATGGTGAAATCATTTGAAGTCACAGAGTTACCAGGTATGCTTTTCCA
CCTAAATGCTTACTTCCCTTTCTTGATATACCGTCTTATTGATATATCAT
GTCAATCACAGTGCGTTCGGCTAAGTTCATTGCACGAAAGCAATGGGTCG
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TTAAGCTTTGGGATTGGGATAAGGGCTGGGCATGCACTCATATATTTGAG
GGACATTCTCACTATGTGATGCAAGTCACATTTAACCCAAAGGATACCAA
TACTTTTGCTAGTGCTTCCCTTGATCGCACAATAAAGGTCTGTAATTTTT
TTTCTGTTAAAGAATAGGCTGGTTAAAGTTGTGCTCTGTTTTGTATCTGG
CTCTGTACACTTATAATATCTGATGTCAACTTCAGATATGGAGCATTGGT
TCACCTGATCCTAACTTCACATTAGATGGCCACTCAAAAGGTGTGAACTG
TGTTGATTACTTCACTGGTGGTGATCGGCCATTTTTAATTACTGGCTCTG
ATGATCAGACTGCAAAGGTGCGCAATCTGCACTGAATTGTGCCTATGTGA
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TTGCTCTCCCCCACCCCCAATCTCTCTCTCTCTATGATATTCTCGGAGAT
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CAGATGGTTTCATGATTTAATTGTAGATTTAACCATTTTGTGAAATGGTT
ACACACTTGCTCATCTGAGTGTAAGTTTTGCATTGCAACACGCGAAAGCA
TCACAACTAGAAGTAGGGATCAACAAAGAGACATATTTGATCTTATATCT
GTATTGGTTGGTGCCACAGCTGGTTGTTACGGCTGTACATTATAGTATCT
TGAAATATATGACTATGTGGCCATTAGCAATTATGTATGTGATTAATTCC
TATATATCACTGGTGCTTAGAACAAGAGAATTCTTGGGAGTATAATCTTC
CGTTAGTACCGAGAGCAATTAATTGTTGGAGCTATTATTTTCCAGATTTG
GTATAATTCGGTGAGGTATCTCTTGAATTCTCTTACTCCCTCTGATCCAA
ATTACGTGTCGCAGTTTTTGGCTAAATGTTGCCCAAAATGTCTAGATTCA
ACGAACCCGTGCCAATTAATTTGGATCGAGGGAGTACCAAATTATGAAAT
TAGCACCCAACACCATAATTCATGGGAATCTGCTGCTTTCTGATCTATTT
AATAAAAATGAATTTCACTTGTCAATACGTTACTGTATATGCATCTGCCT
AGTTGCAGCTAACATTTCTGTCATCATATTTCTGTATTTTATTATTCCAT
TTGCATCAATTCTTTCTATTATTTAAACAAGTGAATAACACTTTTCTGGA
TGCACTCACAGGCTCGAGAACACTCTTAATTATGGCCTTGAGCGAGTTTG
GGCTTTAGGGTACATGAAAGGATCAAGAAGGTAATGAACAATTAGCACTT
GCACTACATGAATCTTTGGTGATATGGCCAATGTGAAGGCCATGACAGTG
AATATCATCTCTTATTTGCTATTTAAGCTCCAGACTGAACATTTTGTACT
ATATTTATTCCTCAAATATCAGGAGAAGACAATCATTTTCATATACTGAT
TCTCTGTGCCACTATTTCCTACAATGCGACGGCATTGTTTATATCATTAT
ATGCTAAGCTGTTAGATCCAGAATTTGCTATTCACCTAAACATGTAGAGT
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ATGTCTTATTATTTGTAGGATTGTGATTGGATATGATGAAGGGACGATTA
TGATTAAAATTGGCCGTGAAGTTCCAGTTGCTAGCATGGATAACAGTGGA
AAAATCATATGGGCCAAACATAATGAAATCCAAACTGTCAATATCAAGAC
TGTTGGTGCAGGCAATGAGGTTCTTGTTCACCATGCCAATATGTTGAAAA
CTTGTTATCGTGGTATAAGCTTTACTTATGTTATTTAACATGTTTCATTT
GTCAGATTGCGGACGGTGAGCGGTTACCGTTGGCTGTGAAGGAGTTGGGA
AGCTGTGATCTTTACCCACAAGTAGGTTACCTTTGATATGGAAGTGAATG
CATCATTCACATAGTGATGCTCTTCTTTGTCAACTAGGAGTAGATGTCTG
TTATTGAGTCCCAAGTTTCTGATTGAGTTGTTTCGTTTTCAGTTGAGTAC
ATCATATTACAATACATTTCATGATGCATGCTAAAATATTTTTATTATAT
TTGGTTTTAAATGCACATGATTGGTGAGTTTGTAACCCCACTATATATGG
ATATATTCTGTTATTCTGGTTGCTGCAGTATAATTAAACTCTAACACAGA
AATGGAACATGTTACTTCATTTTTTGCAATGGCACAATGTGGAATTAAGT
TTTGGTTTTGAATTGAACTGTGTTGGGTTATAAAAAACGCACATGGGGAT
GTTATGACTTATGACCACTTAGTCACTAACGGATTCTCCTGTACAGCATT
GACCATTACTTTGAGTTATCATGAATGTGCCTTCATGGTGAAACTATTAA
CCATCCATTTTGTAGCTGTACCTGTCCCTTGTTCTATTTTCATTAGCAAC
TTACTAGTTTTGATCTTCATTTCAGAGTTTAAGACACAATCCAAACGGGA
GATTTGTTGTTGTATGTGGAGATGGAGAATACATAATTTATACAGCACTA
GCATGGAGAAATAGATCCTTTGGGTCTGCACTTGAAATCGTTTGGTCAAG
TGATGGTGAATACGCTGTCAGGGAAAGCACCTCGAGGATAAAGATATACA
GTAAAAATTTCCAGGTTTGTATTTAGTATAACTAACTTCTTTTACGGTAA
TTATTACCGTTTTATCTTTGACAAACATCTGTAGATAAGAGAACACACAC
TTGCTACTGCACATATTCTGTCACCTGTTTTGTTACCATCTTCATAGATG
AAAACAGAATTCCTGCAATTTATTGACGGTTGTTCAGTATTTCTTTTGTT
TCATAACACAAGGCTGCCCAACTACCCGTATAAATTGTTGGAATATTTTT
AGTAACGACACATGTCATTGTTGTCCCATCTTATTCTCATTTCACCATTT
CTTAATCCATGTGAAAAATAAAAACAGACTTATCTTATAAACCAAAGGAA
GGAACTTTCTCATGTAAACTATAAAGTGCAAAGGAATAAATAGGATATGT
GTAAGTATTTAGTGCTGCTGGTTCAGCATCAGGCTGTGAACTTGAGCATT
TAGTAGTCAACATATCATATTTTGTATGTTAGTACTTCTATTATTCCAAT
GAAGTATGATGCATATATTTGGTATTAAGAATCTTTCAAGGCTTGAACAC
TGGCAGAGGATGAAGCTAATGCTTGAACATGCCAATCTTCTTCACTATAC
AATTCCTGACACATAGAAAGCTAACAATTTCAGGAGAGAAAAAGCATAAG
ACCAACATTCTCCACAGAACGTGTTTTTGGTGGAGTATTACTGGCTATGT
GTACAAATGACTTCATCTGCTTTTATGACTGGGCGGAATGCAGGTTGATA
CGTCGAATTGATGTCAATGTGAAAGTGAGTTAATTGAATTGCTTCATGAA
TGGAACATCTTTTCTATGCCTTTTCGTATGGTATGCCACTAAAAATATCT
GTTTTAATTGTTGTAGAATGTCTACTGGGCTGACAGTGGTGACTTGGTGA
CGGTTGCAAGTGATACATCATTCTACATTTTGAAGTACAATGTGAGTTTT
ATTAAAACGCTGTTGCCTTTCACAGTTTGTAGCTAAATGCTCTTTTCTTG
TGTTTACCAAGACATCATCAATTTACATGAAACACTTGTATGCATGTGTT
TTCCGCTTTAACATCCTGTAATAATACACCATTATTTTTCTATCTTCCAG
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GGGTGTGGAAGATGCCTTCGAACTGCTTCATGAGATCAATGAACGCATCC
GGACTGGGCTATGGGTTGGCGATTGTTTTATTTACAATAATTCTCAATCA
CGTCTTAATTACTGCGTCGGAGGAGAGGTGAGCTTTTTATCATATGAAAA
GTCGCTATTATGTATAGTTCCAGTGAGGTCATTCATTACCAGTTGTAGTT
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CCTTGTTTCACTTGGACAGACCGATGTACTTACTAGGATATCTTGTCAAT
CAGAGCCGTGTCTATCTTATTGACAAGCAATTTAAGTGAGTTATCTTCGT
TGCTCTTGTACTTTTCATGGTATAAACTAACAATGAACTTCCGAAGCTAA
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TTGAATATAAAACACTAGTACTGCGTGGGGATTTCGATCGTGCAAATGAT
ATTTTGCCATCTATACCAAAGGAACAATATGACAGGTGCCCCATGTTCTA
CTATTTGCTGTACTATGCAGTTCAGGCCTCGGCAAACAAAGATAACCTTT
TATTTTCAGCGTGGCACATTTCTTGGAATCACGGGGCATGTTGGAGGAAG
CCCTTGAGATAGCAACAGACTCTAATTACAGATTTGATCTGGCAGTACAG
CTTGGTCGAGTCGATGATGCAAAGGCATAGTGGACTATATTGTTTTTCTT
ATTTCCAAGAAAGTTGTCTCCATTATTCAAGTATTCTGAGTAGTTGCTTT
GCAGGCAATTGCTCTTGAGGTGCAAAGCGAGTCTAAGTGGAAGCAGTTAG
GGGAGCTAGCTATCTCTACTGGAAAGGTACACGACTACTAGGTGTATCAC
TTACCTTCTATGCTCACTGTATATTATGCTAATGAATTAGATTATTGTGC
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TGACTAGACATGATACAGCCTAATATAATACTGGGTAGACATTTCTATAG
ATAAATATTACAATCACGGTTTTGATGGGATGCTTTGCTTGTTGCTCAAC
ATCATGCTGGAGGTTCCCTAATCATTTGAAACCCTTAAGTCACATCCTAA
TAACTTCCCCATGTTATGTTTCTGCCTTGCACTTGGATGGAAACCTGAGT
CTGCGTACTCTTGGTCTTGGTCTCACGTGTCATGCAACTTTTTTCAGCTC
GAGATGGCAGAGGAGTGTCTTCTACATGCCATGGATCTCAGTGGTCTATT
GCTTTTGTATTCATCCATCGCGGATGCCGAAGGGATAACAAAATTGGGGT
CTATGGCCAAAGAACAAGGAAAGAACAATGTTGCCTTCCTTTGTTTGTTC
ATGCTAGGCAAGTTGGAGGAATGCCTTCAATTGTTGATTGAAAGGTACTG
GCGTTTGTGTGAGGCTGTCCCTGTTGTATACAGTATTTCTCCAAACAAGT
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TAATGATGTTTCAAATTCAATAAGCACAATGTACCAGCTAACTCCAATGC
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AATCATGCTTTCTTATATTTTATAAGTTGATCTCTCTCTTGTTTAGACTT
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CTTGGCTGATCCTGATGAGTATCCAAATTTATTTGAAGACTGGCAGATTG
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ATTGAAAACGATGTCTATCTGTAGCTATTAGTTATTATCCTTCTGACAAA
ATCCTTTTTTTAATAGGGGTATCTATCCACCTGCTGAGGAGTACATGATT
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TGTAGATGAAGAGGAGGATGCACATGAAGAGGATGTACATGAAGCAGAGG
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TCTTTCAGACAAAATCACACCTATCTGATAAATATTGATTATAAATGAAT
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ATCTTTTCCAGCATATCACTCTGGAGAGCTATCTAGTCAAATATATTCGG
TCTTTCTAACTTGATTTGTATACCAAATAGGGCTTGGTCCGCTTGAAGTT
GGAGCATTAGGGCTAGGACTAGGAGGTAGGATGCACCTGATGGATATTGA
ATCGGTGATTGACAGGTCCACACTTAGTCCTGCTCGCAAATAGTGTATAC
CAAATAGGGCTTGGTCCGCTTGAAGTTGGAGCATTATGGCTAGGACTAGG
AGGTAGGATGAACCTGATGGATGTTGAATCGGTGATTAACTGGTCCACGC
TTAGTCCTGATCGCAAGAGAGCTGAACCTTGGTGCTGTACTTGGCTTGGT
GTGCACCTGCCCTAGCGATCGATCTGCTGCGGTGCTGCTCCCAAACAATC
GGACTTCAGAGAGTGAGAAGTTTAGAAATCAGAAGTTCACTGGAACTTGC
CTGGCTCGATGATCCGCGGGTGTCCCTGATGCCTTGCAGTCCCAGGCCCC
TGCATTGGTCGATCTCAGGCCTGATCGATCTTCCCGGTGAGAAGGGCACG
TGCCGGTGCGAAGGCGAAGCGAGCAAACCAGGCAACTAGGAACCAACCAG
GATCGAACGCGGGCGTGGACCGTGGAGCGATCGGATTGGGAGATGGACCG
ATTGGGAGACGGAACGTGGAACTAGTCGATGTAAACGTCCTAGCTGGACA
GCACGTCGTACTGGGCTGCAGTAAACGGGGCCCCTAGAATTTGGGGGCCC
TGTTTGATCGAGCTCTTCGAACATGCCCATCGACGGGGCTGGCGCAAACG
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ATGCTTTTTTGCATCACTATTCACTAGCACTCCCCTTTGCTCGATGTTAT
GGTTTTTTGAAATCAGTCAAAAATTACATTGAGCAGCAACACCCGAGACA
ACATCAATGGTAGTGGGGAACCTTGTTGGTTGGTTCATTTTTCTTTTGGA
AGATATTCCATGCTATGAACCTCTGTCATGAAAGCAGTTCCTCTTATTGA
TCATCTCATTCACTGAGAACAGCTGTTTTGGTTGGCACTGTGATTGCACT
ATTTTTTGGTGACAGAAACTTCATTGTAACATGCGAAGCTGGGCTCACAA
ATGCATAAACAATTTGGTATTTTTGTCTTGGAGAGAGCCCTACAGATGTC
CTGGCCGTGGCACTGCCGGGTCAACACTCTCCCCATGCAATTGCTCTATC
TTCTTCCCTGCACCTGCCCCTGCTTCCAACCCTGTGGCACCATCTCCACT
GCTTAGTGCTTACCCCAGCGCGCCTTCGCACATCTGCTGCCAGCGGCAGA
GTCAGGGCACCTCATCCCAGCCGTCACCGTGACGTCAGCCCCCTCTTCCT
CTTCCTCTTCCTCTTCCTCATCCTTCTCTTTTCCCCCTGCTCCTCCTGCC
ATTCATCTCCTCCAATCAACTGTGCCCAAGAGTTTGGTCCCTAAGATCTG
TGAGCGAGCATTGTTGATTTCTCATTGTCTTTGCACTCCTGGGCTTCTTT
TGGTACACTCTGATCCAACTCAATCTGTTTGGCTGGGAAGGGATTTTGTT
TCAAATTCCCAGTGGACATCCAAAGGAGCCCTTACAGGAACAATTCTAGG
ATTACCCTGGGCAATGTGGGTCACCACTAAGGCCTTGTTTACTTCTCTTG
TATTCGCTAGTGTATTCGCGGGGATCAGAGGGGATTATTCCAATTCCCAC
AAAATCCCTGTAGTCCGTTTAGCAATCCGGGTTTGGCCGGGATAATCCCG
GTATATCCCCACAAATACTCTTGTTTTTCTCTAGATTAAGAACTCTCCTC
CATGGTAGAGTATTTTTGGGAAGAGTATTTGAGGGGATTGGAGAGTATTG
GGTGAACACCAAATCCCCTCCTATCCCTTAAACTCTAGTGGATAAAAATA
CGAGATAAGTAAACAGGGCCTAATGGGTACATTGTGTTGATTAGTTGGGT
CTTCTTATGGAACTCTGCATTTATGTAAACATAAAGACTGTTACTGTTAT
TATTATTTTTACTCTCATCACTTCTATTCCTCCCTTTCATACTCTATCCT
TGCATGCATTATAACACCATCTTGGTTCAACAGGTTTTCGAAGATGACGG
TGTAGAAGATAGCCAAGAGGATGCTGTTGAGGTTGATGCTGATGGTTCTA
CTGATGGCACTATCCATGTGAATGGAATTGACAGTGAGGAACAGTGGGGT
ACGAATAAAGAAGAACCATCAGCATAAAAGCTGTAGTTGAGCAAGTGTAC
AGTCCCAAATCCTTTTTGGTTTTTTCTCCTAGTGCACCAATGATTTTAAG
GAAAACCTGCTGCTGAATAACATTTGCCTCCCATTCTTGACATATAGATA
TCCTTCAGTTGCATCACCATTTGGCCTTTAGCTTTAGGCAATTCTGGTAT
CTGACTGCCTTTACTCCTGAGTGTTTGCAATAACACAGAAGCTTAGGGTA
GTTTTGGTTGACTTAAAATTCCACCAATATTAGTGGTACGTATTATGAAA
GCTAGCCAAACTATTTATTAAATAAAAGCCTGCAAGGAAAGTCCTTCCAC
CCTTGGCCTATTTTAGCATTTATTTACTGTTTCATTAACAACTAACAAGT
CACTGCTAAATTGAGGCGTGTAGCAGTTAACTTTGTTGTGTGGACATTGT
TTTGGAATTCCAGTCAATCTGCTATTTTAACCATTTTTCTAATGGTTGCC
TTGTTTTGCAGTGCTGACTCCTGATCAATAGTGGGTAGTGGAACAGCAAC
TTGCTACAAAGGTTTAGTTTGTAAAGGCAAGTACTCTTCTGAGTGGGCAC
AGCTTACAGTTTTATGTGTCGGTTCATTTTCTTGAGCTAACATCGTTAGT
TATACTGTAATTTTCTGTTGCAGGTTTGTTACTGGGACGATGTAAAAGCT
GTTTCTCCACATTTGTATCAGCACGGCATGTGTTCTAGGACTGGTGTGGC
CGATTACAATGTTCAGCAGCAATTTGATTAGCACTTCGCCGTGTCATAGA
GAATTTTGTGCTTCATTTTCATATAGTGGTTGGGCCAGTAGGTTTCTGGA
ATGTTTCGTAGGGTGTAAGAGGATCATTATCTTCATTTGGAGATCGGATT
TGTTGGAGTTGCCATATTTTACACAAAGTACATAGGGCAGTGGCCTGCCA
GTTTGGGAACGTTTCTCCCGCCCCGTATGTAAACCTCAGGTGTTCAAACA
CAGTAATTGGATTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.