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GrainGenes Sequence Report: AE039170

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Sequence
AE039170
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039170
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGTGATCTGCCTCCCGAACTCAGACATTCCCAAACCTCCACCGTTCTCC
GGCGAGCCCTCCCCCGCCGGCCCTGTCCCCCCAAATCACGGACGCCCGCC
CGACCGCCACCCCGAAGGTATTCGCCTCTCTCCCTCGTCCTCAACCGCTG
TGCAAAATGCCGTGGTGTGGAGATCTCCCTTTCTCGACTTCGATTGATCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCGGCGACGAACCCTAAGTTGATTG
GGCCGTACCTGGAATCTCTCTGCTCCAGTCAAAATCCCCGCGCCCTTGGA
AGCACTATTATCAGTTTTATCCATTTTCTCGTTAGATCCGCCCCCGGTTA
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CATGCGTTAGCCAGATGACCGAGTTTGCGCTACAACATCCAATTAAAGTT
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AAATCCAACTCAGGAGGACCTGATACAATCCCATTCAGTGGATGTGAATA
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ATTGCTCTTTCACGTAGACACACCAGACAAGGCTAGGTACAGTATCGAAA
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CAAAATTATGCCACTGCATCTGAATGGGAAGATGCCTTTCATCTTTCAAC
ATTGAAAGTTCACCGACATGTCTTTTGACTAAGTCATGTACCATTTTATC
ATATCTGTTCATATGTTGAGAAATGAGAACTAACTGCTGAATTTTTTACA
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TCATAAGAGTCAAACTATCTCGAGTGTGGTATCTAAACTTATCCTTATCC
TTGAATTTTCTAACTAAATAAATCTCTTTCCTAATTTGAATGTTGCCATC
TGTTCTAACTTGTAAGATAGTCAGTCCTGTAGATCATTTCAAACTTGCAA
TCTCCTTTTGTTTCTATATCATAATATGTATATTTTTAAGGTCATGCCGG
CACTGTACACCTTATAAAACCTCCCTCAGTATTATAATCTTCAGAATATT
CCTTCCAGGGGGAAGATTCATTGGTTTGGAACGTGTTGGAGAGGAGCTAC
AGACCCATGCCTTATTTGCCTTGCAGATATCGGGCTTCGGGTGCTAAATC
TTTTGCCTTGCCAGTTTCTTTGCAGGAAATTCCTCTGGTCAAGAGCACAA
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CTATGTGCCATTGATGAGTAATGTGGTGTACTTAAGCATCTTAGTAACGC
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TTTATTGCGTTTGATTGGATGCCTTGAGATATGGCAGCATCGATATGGTG
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GATAGTTTGGTTGGTAATCTTAAATGGAGCTTACTTCTATGATTTATGAT
AATAGTCACTAACTGGATAAATTCCTTGGTCAGTTCAATGGACTCTTGAT
CATCCTTTTTCATCTTTCTTGTGGTTATTGCTATACTATTTTATACGCAA
ATGCCAATTAATTTATGCTTGACTTTTCTATTTTAAATAATAGCTTCTCT
TTTTTGCTCCCTTGACAGGTATTGTGACAGCTTACTTGCAAATCCTGCTA
CTCCCTTTGTGGCACCTGCAATTGGAATAATTGTCTTTGCTCTATGGGGC
TTTTTGCCTCTAATGAAGGACATCCGAAATCGTATTGATGTATGCTTTTG
TTATATGTGACTTTATCTATTTTTATTTCTGAGTAGCTAAAAATATCACA
ATATTCTGTAATATACCTTGCAGCACGGAGGAAACTGGAAACAGAGCCCT
ACATACCTAATTTCTAGATCCTACCTTCAACCTTTGCTACTTTGGACAGG
GGCGACACTAATCTGCAGGTATAACCACAACAAAATTTAGTGATGTTTTC
TTGCAGTAGTAATCCTATCTGATCGATATTGCGGCCTCTGAATTCTTAGC
TATGTATCAGTTGCAAAGTTTCGGTTTAATTTGTGTTCTTTGCTCGCACA
CTGCCCTACAGGGGCTTGGATCCAGTTGTGCTCCCTTCAGCGGCAAGCCA
AGCTGTTAAAACTCGTCTTGTAACTTTTGTGAGATCATTATCTACCGTCC
TGGCTACTGCATATATTACGACAAGGTGCACATGATACATTGACATGCTT
GCTAATTGTTTCATAGTTAGTTTAATGAACCAATCATGCCTATCTTCTTA
CAGATAATGACAGCAGCATTTCACTGGTAGTCTAATGCAAAAGCCTGGGA
AGTACTAACATGGTTTATCTTCTTTTAGCTTGATTCAGCAGGTACATAAA
TTCCTAGTGGACGCGCGTGACCCCAATGATAGAAAAAATGTAAGATTGAT
TTTGTTATAATATAATATAGCTAGAATCTCTTTCATTGTTTGGGTACCTA
CTGTAGTTCTGTCAGCTTGATTTTTTGTTGTTGAGAAAACGCAAAGGATT
CTTTGTGTTTCATTCATTGAAAAGGCAGAAGGTTTGGTACAATCCTCCTA
AGAGGCAGTTATAACATGCATGGCAAAATTTAGTGTACATCCCCGGTTGC
TGGTAGCATGGCTGCAAGACCTAGCGCGCCGGCTTGTGGCCACAGGCGGG
CTTCCTCTTTGATCGCAGACACCAGGTTCCTGACTGAGGGTTGCAATACT
TCAAAGACGCAGCTGTTCCGGTGCTTCCAGATCATCCATGGCACGGGAAG
TGCAGCCGTTTCGAGCTCCTAGCGTGGTGGTTTCGGCGTGGCATGTTTTG
CCTGCACCAGCCAATTGAAGAGCGAGCCCCTTTCCTGTCAGCTTGATTTC
AATCTTACTGATATAAGCCATTTTAAGGAACATGTAGGAAATACATTTTA
TTTTAATAACAAGCTATAGCTACCCCACCCATGTGAGGACTTGAACTTGG
GTGGTGGGATTGTGCAGCTACTCCACCCAAGTGAGCTAGCTTTATACTGA
TGTAACTATGACAAGATGCAGATTTTATTCTGAACGAAAACATTAGGGGA
ACAAGATGCAGATTTGCAGGGTTTGCTGGAGTTTGGTAGATAAGGATGCG
AGTTTGTTGGGATAGTTAGATACAGGGAGATGACAGCATGCTGGCGGAAG
GGAACCCCCTCCCCATTATGTGCTGTTCTTTAACTGACTAACTACGGGAA
GTAAAGATGTGGGCTTGAGGTTGTGTAGCAGTTTTTTGAAGGAAGTTTTG
ATCTCGTTTTCTTCAGTTTTTCATAGCAGCATTGTGGGGGTCGTTAGTGT
ATGAAGATAGAAAGCACGGCGGTAGTGCTTTTGTTACGATACTGACATAG
TGCAGAATTTGTGAATTCAAGGTCTCTTACGTTCTCTTTGTTGCAAGCAT
CTAAATTTTTATGAAATAAATCTGATGGCAATAGCATGAACTCCCTCCGT
CTCATAACCTAAGATGTTACTACAACCAATGTACTCATATATTGGTTGTA
ATAACATCATATATTAGTATATTGGTTGTAATAACATCTTAGATTATGGG
ACGGAGGGAGTACTTGTTAGCATGGATTAAACTATCTTAGTGTGATGGGA
ATTTTATCTTCTCAGTTGTAGATTCAAGATATCCTCTTTTTTTTTTTTGG
TTCTTGTTGCTTGATATTTTTTCCTCAATTACCTCCATGTTATAGTAGCA
TTCATTGAAGTTTGTTTCTTACAGATGGGTTTGGATTTTACCATGAAAGC
TGTTTATACTGGCATTTGGATTGCCGCTCTTTCTCTCTTTATGGAGTTGC
TGGGTGTCAATACTAAGAAGTGGATAACTGCTGGAGGTTTTGGGACAGTA
ATGCTTACGCTTGCTGGTCGTGAGGTTGTACAGAACTTTCTGGAATCCTG
TGCCACAGTGCTAAAGTATGCTAATAGCTATCTCAATTCATTGCAGATTT
TGACCAACTTTATCTCAAGTATTATGATCAATGCCTCACGCCCATTTGTT
GTGAATGAATGGATCACTACAAAAATAGATGGCGTTGAGGTCATTGGTGT
TGTTGAGGTTGGTGTCTTACTCTTGTATGCTTTATTTCAAATTTCCTTGA
ACTATTTTCCATTTAGTGTAGATATGACGTGGGCGGAGGCGGTAAAAAGG
GACTTGAGGGAGTGGAATATGTCGATAGACTTTGGCTCTCAATAGGACTG
CATGGAAATCAGTTATTCAAGTGCCAGAATCTTAGTTTACTCGTTTCTTG
TTGACTTTTTATCTCTATTTTCTTGGTTGCCTTATGTTTTCTGTTGGGTT
TCATATCTAGCCTACCCCAACTTGCTTGGGAAAAAGGCTTTGATGTTGTT
GTTGTGTAGATATGCTGTTCTGTTTGTTTCATTTTATGTACTCCCTCCGT
CCCAGAATAACTGACGCGGGGTATGTACAAATTACAAATTGCAAATAAGC
CCACGTAAATCCAGATCATCACAAATTTAGCTGGAATAAAAATCCAAAAT
TTTGGCCGTGACGCCAGCCGTGATCCCCGCCCGCCCGCCCGCAATCAGCG
TGGTCAGCGCGCGATCCCTATCCGCCCACCCGGGATCTGCGATTAGCGCG
AGCAACATCCGCCTGTGATCAGCGCCTGCCCATGATCAGCTCCGCCCGAG
ATCCACCTGCGCAGCCGCGATCAGCTCCTTCACGCCGGCGCCCGTGCACC
ACTGCCGTCCGCAACGATGCGCAGGAGCTCGACGGAGGCGACGCGCTCGA
GCGTGACGGAGGCCTCCGACGGTTCCCTCGCCACCGTCGCTCTGCAGCTC
TGCCGAGGAAGTCGTCTTCTTCCTGCTCAGCGAACAACGCAACCACGAGC
AGGAGCTCCGCCTGCGATCCCGCCAGACAGCTGCGATCAGCTCATGCTCG
CCGGTGCCCTGCACCGCCGCCGTCCACAATGACGCACCAGAGCTCCACGA
AGGGGACAAGCACGTGCAGGACCTCGAGCTCAACCACGAGAAGGAGCTCT
ACCATGCGCATGAGCTCGACGGTGGCGACACACCGCCGCTTGGCCGACGC
CCTTGTGCTCGATGGAGGTGACGGCTCGACGGAGGCCACACGCAGGAGCA
CCGTCCCTCGCCGTCGCCTCTCCACTGCCGCCTGCGCCGCTCCACCGAGG
AAGGAGGTCTTCCACAAGAATGCCTATGTAGTTGTTAGTTCCTGAATCAA
TCTGTAAAAATTGAATCAAACTTCAATTTGAATCACGGTTATTGTTACCA
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CAACTAAATCAATTTGGTCAACTGAGACAACTAACAATCTCAAACTGTAC
AAGTCTAAAGCAGCACATAAGAGCAGCGCAAAAGAGCATATTCAAGTAAA
TTCAGTGATGTTCCTTTTCAAGTGTTGAAAATTTAGTGACACCGGCCTAA
AGCAGCAAGCATGCTCATGCCAACTCAACGAATTCGGTGATGTTGCACTG
GCCCTGAGTCACCCAAATGGTTGCAAGAAGGCATTCCTTTTTTCTTTTGT
CAACATGTATCATCATTTCACTGAGCTAGAAAGGTCGCAGCAGATTTACC
TTCTTAGTCTTCATCCCCAGCTCTTCCTGTTTAGGTGTCTGCAGCTTGCA
GCAGCTTGAGCGAACCGAGTTCTGTGCGCCTTCTTTTGCCACCTACCGCT
CATCCGCCTTTGGCTCCAGATCTTCCACCTTCCATTGATCATCTAGCGGT
GCAACAACGCTGGCATTGACACAATAGATTCATATTCAGAATGTGCACGC
ATTTTAGTAAAAAAAACACTAGCAATCTTTGTGATTTTCCAATTACGATT
GTTAACTTAGTTTGAATGGAACAACAACAAAAAAAAGTAGAGATGCATAA
TTTAAATTGTTCATCTTTCTTGACTGATTCTTCAGGTTGAATCACTGTTA
ATGTAGCTTTGAATCAATATGGCTCATTCAGATTGAGGCAATGATACTTG
TAACTCTAGACGAAATTATGGTTTCTAAAATTTATTCTGGATATTTCCAT
CACATGCCTAATTTAGATACTGGTACAGGACTCCAGATTTAGCATAACTT
GACTACGGTAACTCATGAAACAAAGACCTGGTTCATTGCTCTTACAAGCT
TTCTGTTTGCACCCTTTTATTCATACCACAGTCCTGGTAGCTGTTCTAAT
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TTACTTCAAACAGCCAAAAAAAGGGATGATCAAACGGGAACAATAGAGTG
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TCTTAACTGGCCAACTCGGCAGCGTTTATGATGGCATTACGTGCAACGTT
CGGACCAATGCCAGTCCACATAGCGGCACCCCCTTCCTAAAGATGATATA
GACAGACCTTCGGACTGAAGCCTGACCAAGGTCAGTGGGGTTGACCACAG
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ATGACGAAGGGTACCAGTGGTGAAGCCAGCAGCTATCTTCTTGTACAGAG
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TAGGATGGTCCCTTTCCAGAGCGCGGCCGCTCCCTCCTCCCTGGCGATAG
TGGTGGTGGTGCCAATCAGGCGGCAGGCCCCAATAGTTGGGCGCGGCGAG
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GGATGCCCCAGGGCCCAAGCTCCACGCCTCCATGGATGCCCCAGGATTCC
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GCGACGAGAAAGTGGAGTGTGGGTTGTGTCGGGAATACATGAAGGGCTTC
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TTTTATTTTTATGTACTGTTACCAGTTACACATTCATACCCAAATTTTAT
TGATACTTCATATTATCATCACGCTGACTTAAACTAATTTGATTTTCAGC
ATGTTGGCATGTGGTCTCCAACAGTTATTAGAGGTGATGATAAAGAAGCT
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ATGCTGGAAAAATTAGTGTAACTGCTCTGAATCAGTCTTGCACATTACAT
CTCTTTCTTTGACTTGTTTTATCGGTATATGGAGACCTATCTTAAACCCG
TCTGCCTGCTTTCTTTTGGCAGATAATTGTTGCGGATATGAGGAAAGTCT
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TTTGAGAAAATTGATGAAGAAACTCAAGCTCTCATGGTATATTAAGTAAT
TCCTTTGAATGTAAATGCTAGTGCGCCATCGCTCGTTATGAAGGGCTGTA
TCGTGAGTATGGCACACCATTATTGGCTAGAGCCTTTTTGTTGTTTACCT
TATTTAATATATGCTCAGTATGTCTCTCCCTACTATTTTGAAAAAGAAGA
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AATAAAAGAAATCAGTTAGTGGGTAGTTGTTGCTTTTCCTCTCCTTTTTT
TCACATCTACTTACCTTTTTGTCCAATCTGTGTCAATATTCTTCGTTTCA
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TGAAGACTACACATTTGGACGAGTATCTTAATGTCCAGGTAATGTGTCTG
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TGTAATGTATAACTCTATCAAGAATATTATTTTCTAGCTTGTAGTGTTTG
TACTAAATAGCTGCACAATTTAAGTAGAATCAGCTGTACTGGGAGTAACA
TTCTGACCCATTGAGTGTATGTGTCCCTAACATAACTACATCCGAGGTCC
CATTTCCTGTTCCCAGGCTGATTCTCACCTATTGGCAAGAACTGGATTTT
GATCAGTTATGGCCATCAGTGGTAAACCAGCCAGAATCTTTTTCCAAATT
GAAACAAAACTAAATAGTACATATAGCTACCTTGCAACGCTCCAGTCAAG
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ACACAGAGCAGCAGCCAGTGACACGAGTCATTTGCCACTAGAGAATCTAA
AGGATCAAAATGAAGTGATATATGTGTAAACTTGGTTTAAAATGGTTTGT
TTTGGTCCAGAATATAAGTGAACAGGTGGTTTTGATAGTGTGATAGAAAT
CATGGGTACATGGAGCATGATTATTGCAGATAATATTGCCAGTCTCAACT
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TTTGGAACTCCTGATCTCTGTTCACTATGTGGTAGCACTTCATTTATCAT
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GTGCATTTATTTTACCAGCATTTAGATATCACTTCAAACACTGACACAAT
GTTTTTTGATGTTCCAATACACAACAGGAAGATGTTATGCTGGATTTTCT
TAGAATAGTTGGCCATCACAGGGCAAGGCTGGCAACCCAAACTCGAACAG
TTCAGAAATCATACGGAAATGCAGACATTGATAACATCCCATTTGGAGAG
GAGATGTATAATCGTGTACGCGGTCGTCCAATTCTGATCGACACCTCTGC
AAAGGTCAGCGAAGGCAGGTCTAAACCTAGACCAACATCACGTGAAGAGC
GGAATGTCAAGACAAGCGCATCGGTGGATACCAAGTCAGTTTCACCTGAT
AGTGCTAGTTTAAGCAACTCCGACAAGAAGGAACAGAAAAAAACGGTGTC
AGAAGATGGTCCGATGAAGAATAGCAAGAATGGTCACGTGACATCAACGC
CACCATCTCCGTCAACAGAAAATGTTGATCCCATCACGTCGACTTCCAAG
GCGGCCACGGAACGACAAGGAGATGGGTCAGTTTCTCTGCCTAATCCTAA
GAAAGAATCTAGACCTGCCTTGGAAGATAACATTGTTCTGGGTGTAGCAC
TTGAGGGCTCCAAGAGGACACTCCCCATTCAAGAAGGAGTGGTTCCTCAT
GTATCCGAAAGTGAGCAAGACACTGTTGAGGCCGGTTCCTTACTTAAGGA
TAAGAAAGGTCCAAGCCAGATGCCGTGAGGTCGACCGAGTGAATGCTGGC
CACATGAATATTTGATTGTTGACAGGCAATTCAAGTTCAGACAAGGTCCT
GGCCAAGGATTTGTCACCAAGCCTACCTTTTTTGTGTGCTTGTGCAAATG
CTGTCACACATCTTTTTTCTTTCGTTCTTTTTGTTGTTGTAAATCTCGGC
CTCTAATAATTCTGTTTTTTGTAATCAACCTGTTAATAAAATGTATCTTA
GTCATTGACTATGCTCTCCAAGATGCTCTACAAATAGTGTCGCTGCTGTA
TCTATCTGATTGATCTGCTTTGGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.