Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE045860

[Submit comment/correction]

Sequence	AE045860
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE045860
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATCCGCAGGGGCAGGCGCAGGCGGAGGCCGATGCGGCGGCGGTGCT GGGCGCGGACCCGGTGCCGCTCACGGCGCTGCTCGGGGACCTGGTCTCCC CGGCCAACGAGGCCCGGTCGCGGGCGGAGCGGATGTTCCACTCGCTCCGC GCCTCCCACCCGGACGCGCTCGCGCTCCGCCTCGCCCACCTGCTGCTCTC CCCCTCGCACCCCTCCGCGCCCATGGCCGCCGTGCTCCTGCGCCGCCTCA TCTCGCCGGGCTCCCAGGCCTTCGTCTACCCCGCCATGGCCCCCGCCACG CAGTCCTCGCTCCGGGCGCTCCTCCTCTCCGCGGCCTCGGCCCCCGCGCT CTCCAAGTCAATCTCGAAGAAGCTCTCCGACGCCGTCGCCGAGCTCGCCA CCTTCCTGCTGCCCTCCAACTCATGGCCCGATCTCCTCACCTTCCTCTAC AAATCCATCGCCTCCCCCTCCTCGCCACCGGCGCTGCAGGAGTCGGCGCT CAACACCCTGGCCCGCCTCGCCTCCCACCTCGCCGCCGGTTTTCCCAACC TCCACGCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCTCGCACCCCTCGTCCGCCGATGTC CGCGTCGCGGGACTCAACGCCGCCATCAGCGTCATCCAGTCCCTCTCCTC CGCCGCTGACCGCGACCAGTTCCAGGACCTCCTCCCCGCCATGATGCGTG CCCTTGCAGAGTCGCTCAACTGTGGCAACGAGGGCTCCGCGCAGGAGGCG CTGGAGATGATGATTGAGCTCGCCGGTGCGGAGCCACGCTTCCTCCGCCG CCAGCTGCCTGACGTGGTCGCCTCCATGCTGCAGATCGCCGAGGCCCCCG GATTGGAGGACGGCACACGCCACCTCGCCGTCGAGTTTGTCGTTACCCTC GCGGAGGCAAGGGAGCGTGCTCCTGGGATGATGAGGAGGCTGCCACGGTA CGTGGGCAGGCTCTTTGCGGTGGTCATGACGATGCTGCTTGATGTCCAGG ATGAACCGGCATGGTATGCTGCGGTGACAGAGGAGGAGGATGCTGGGGAA ACTGGAAGCTTTGTTTTCGCACAGGAGTGTCTTGACCGGCTTGCGATCGC TGTCGGTGGGAATACGATTTTGCCTGTGGCTGCTGAGCTGCTCCCATCTT TTATCGGCGCTGAAGAGTGGAAGAGACGGCATGCAGCGCTGGTGACGATT GCGCAGATAGCAGAGGGCTGTGCTAAGGTGATGACTAAGAATCTGGATCA GGTAGTTGGGATGGTGCTGAATTCCTTCAAGGATCCTCATCCTCGGGTCA GGTGGGCAGCGATCAATGCGGTAGGGCAGCTTTCGACGGACCTGGGGCCT GAGTTACAGAACCAGCTGCACCATGTGGTACTACCAGCATTGGCTTCAGC CATGGATGATTCCGAGAACCCACGCGTACAGGCAAGTGATTGCTTAACAT TTGCATTATAAGTCATCTGCAGCACTCTCCTTTCATTATTATTTCTTCTA TCCAAATTTCTTAAAGAAGTTGATTATCATCGCGTAACCCACATGCTTGC TACATTACCCTACAAATCACCCAAATGATACTTAGACAAGTGATTTCCTA TAATCCTGATGTTGCTAAGAACTTTCTACATATTGGTTACTGGATGTTTG CGCTCGCGTTCAGAGACAATTTACACTGACTGAATCTATCAGGTCTAGAT GCTGTGTTCTTAATTCCTGAGATGTCAGCCTGCATTCAGATCCTTTTTCG CTTCTTCTTTTTCAATCATATGTAGAAGTCATGAATTACGTAGACAATCT ATGAGGGTAAAAATTGTTCTGCACAAATGATGATGATGACCCAAGAGTAT CTACTGGTTCTAATGTTCAAATTCTATTCAAAACAGTAACTGATTTTAAA GACAACCTAAGTGAGAGTTAAGAGCATCTCCAATTTCTAATATGTCCATC TGTGTAATATCTTATAGAATGAATTTGAAAGTGGAGACCAGAGAGATTCA ACAATCATTTTTTTTATGTAGCCGCAAGGTATACGTTTTGGTAGGACCAT AAAATGCAACTTGCGCTTTCTTGGATATGTACTTGTGATTGAATTTTCAT GAGTGTTTCCTCCATCAAGTGATCAACTAATATTCGGCATGCATTTTATA TTTCCAATGAGTTCAGGCACACGCAGCTTCTGCAATTCTGAACTTCAGCG AAAATTGCAGACCTGACATTTTAACACCATACTTGGATGTGATAGTCAGC AAACTTCTCGTGTTGCTTCAGGTAAATTTTGCTTCCAACCTTGAATCTTC AGTGGCTACGGTATATACATCATGTGCATAATTTGATACATATTTTGCAA AAATTTGTTTGTTTTCCTTACAGTCTGGAAGCCAAATGGTGCAAGAAGGT GCTTTAACTGCTTTAGCATCAGCTGCAGATTCTTCTCAGGTACAAAATGA AATACTTACTATTGACGGTTTTCTGGTAAATATTATTGCTAATTCTCTCC AAACATATTGCTTCAGGAACACTTCCAAAAATATTATGATGGAGTCATGC CATATCTCAAGGCTATACTCATGAATGCAACTGATAAATCAAGCAGAATG TTGCGTGCCAAATCCATGGAATGCATTAGTTTAGTTGGTATGGCTGTTGG GAAACAAAAATTTAGAGATGACGCTAAGCAGGTAATGATTTTCTACTTCT TCCGATTCATACTTATTTCATGTTGTGAGAACCTTTCAAGTTATTAAATA CCAATTCTTAAATATCAAATTAGATTGTAGAGATGTTATATGCAGTTTGT TCTGATTTTATTGCTGACGTGTTCACTTGCTTGTTGTCTGCAAAATTCAT TAATTGGCCCTTTGAGTATACTACTTTTTGCTTGTTAGGTGATGGAAGTT CTGATGTCACTGCAAGGATCTCAGATGGAGGCTGATGACCCGATAACAAG TTACATGCTGCAAGTACGTTGAAAATCAAAATCCTAATGGCAGTTATACG ACCACTCGTGTGCTTATTTTGACTTTATCAAATTGCCATCACTACTGTGC CTCACTTTTGCTTAATTTAATTGCATTTGTAGGCATGGGCGAGACTGTGT AAATGCCTTGGTCAGGAGTTCCTTCCGTACATGAGTGTCGTTATGCCCCC TCTACTTCAGTCTGCTCAGCTGAAACCAGATGTGAGCATCACTTCTGCAG GCGATGATGGTGAATCTGACGACGAGGGGTATGTTTTAGGATTTCCCTCC ATGTCTAAATTGGTATTTGTCATAGTATTTTGTTTTCTTGTAGGATGGGG TGGGGCGGGTTGCATCTTTGGCTTTCCAGCATGACTGCTGCGAAGTATCT AGGGTTAAGGTTTGGTGTGATCCTCTTAAACAGGGTAATGCGCTTAACTG GGTTAGGGTCGTAGGGTCAGCCACATGTGGCTGCAAACACAGATGAAACC CATCAACCTGTGAGTTTGCAGCACTTGCAAACACAACTCAAACATGTCGC CTGCACATGCCGGTGGAGGGTGCTTGCTTTCAGACACCAGCTATTAGTAC GTGGTGAGCGGAGGTCCTGGCTGTTGCACCACAGCAGTGGTGATGATCGA GGGCATTAGGTTAGGTGGGCGAGGATGTGGAAGGCACCACCAGTGGGTGG TGGAGAGGAAGGGATGGAATGATTGCTTCAGACATTCAGGTTGTTGATGC CTTTGCGTTTCTCCCAAGAAGAAGACACTCTCGAAGTTAGGTCCTGGCTC GGTTGACCCTAGATTTGGTCAAATCATGGCCGCCGTTCACCCTCATTTTG TATGGGTCGGTCCAGTATGCAGTGGTGCCACAATTTCAGTGTTGGTTCAG TGTGCCAAGGGGCTGATGCCCCCACCCCTATTTCCCTGTATTGATTTTTC ATTCGCTGGTCAGTCACATGATGGAAATGGTGAATCTGATCATGCAGGCA TGTTTTTAGTAGTTTCCTGCGTGCTTTGGCATGATGTTTGTGGTACTTTG GTTTGTTATTTCGAATTCACATGTGTTAGTCAGATCCATACATGATTGAA ACCCAGCATTGACTTGTGTCCATTTAGTTCAACCACTTTTTACTGAACCA GTGCTGAGACTTTTACACCCTGCTAGGCACCTGTATGAGCTAAAAAAAAT CCTTAATGCCTGTACGAAATATGAATGCAGTGTTGAGACTATTACTCTGG GAGATAAGAGAATTGGCATCAGGACCAGTCTTCTGGAAGAGAAAGCAACA GCATGCAGTATGCTGTGTTGCTATGCTGATGAGCTCAAGGAAGGGTTTTT CCCATGGATTGATCAGGTCATGTTGCCCTTCTTTTTAAAAATTCATCCTT CCCTGTCTCTTTTTTCTCATTGTATGTGTGTGGAAGAGTTGCAGCTGAAT CTTTATTTTTACAGGTTGCAACTACTCTGGTACCTCTCCTCAAATTCTAT TTTCACGACGAAGTTAGGAAAGCAGCTATTTCAGGTTAGGGATCATTAAT TTTGTTTTGTTTTTTCTTATATTTTACATATTCTCAAGCTGTATGCATAA TGCATCTTCACAGCGATGCCTGAGCTTCTACGTTCAGCAAAGTTGGCAGT AGAAAAAGGCCAAGCTCAAGGCCGTGATAGTTCTTATCTTAAGCAACTAT CTGATTACATAGTTCCAGCTCTTGTAGAGGTTATAAATAAAGTAAGTACA GCATGCTAAGACATTCTTAATTCTGCCAAGTGCTCATTATGTTAGTTGGA TTGTTCTTTGGTTTAAGCATTTTATTGAAACTCTGTAGGAACCTGATACA CAAATTTGCGCAAGCATGTTGGAGTCATTGAACGAGTCAATACAGGTATT GTATTTTGTGTTACTATATTCAGTTACAGTTATTGTGTTACTCTGTAGGA ACTCTGTAGGAAAAAAGTTGTGTTTTTTTCAGAAGCAGATATCTTGACTT TGTGCACAGCTAGCTTTTGCTTATTTTGACATATTTTTGTCATGATTATT CAAGCTTACTTGACTATGCTAAAATTTACACCTGTGCTTGTGTGAATATA TGGGAATAGTGTACTACTCTGTGGACCTACTATGTAGTATGTGCTGCACA ATTTTGGCTATAAAGTTAACATGATTATGTCCATAGTGCTGTGCTGATTG GTTCTTCTGCTAAAAGATTTCGTGGAAGTACTCTTCCATCCTACTCATGT TTTTTTTATAACATTGAACAATCTCTATCTACTAAGTACATGTCATCAAC TCACAAACATCTGTGCCTTTTCAGTTCTGTGGCATATTCGAGTGCACTCT GTGAGATCACTGATAAGTACTAATAATCTGTAATCTATTGTCTTCGTTCA GATGTCAGGAACACTACTTGACGAAGGCCAAGTTAGATATATAGTGGAAT GTATCAAAGAAGTACTAACAGCAAGCTCTAATAGGAGGACAGACCGAACA GAGAGGTCAAAGGCCGAAGACTTTGATTCAGAGGAAGATGAGCTACTAAG GGAAGAAAACGAGCAGGAGGATGAAATCTTTGATCAAGTAAGCTAATGAA ATGCTAGACTATAACTTTTAGCAGTACTTCTATTTCTGATCCATAGTGAT ATAGACAAGTGACAACTATGTGTACTGAAATCAAGGATTTAATTAGATGC CTCATTAGTTACCTTATAAATGTAATTAAAGCAATGAAAGTTGCATGCAC GATTGTTTTGTACTTTCAGCTGCTAGCGTAAACAGCTGCTAATGCTAATT GCGAATCATCATTACCAGTAGTTTACACAAGTTTACTCTTTGTGATTTCG CAGGTTGGTGATTGTTTGGGCACTCTGGTCAAAACTTTCAAGGCTTATTT CCTCCCATTTTTTGATGAGCTCTCTGTCTATTTGACACCTATGTTGGTAA GTGAAATTATTAACCATGGGATTTGGAGGCTATATTTCATTAGCCTAGGA GTAGTTCTGAAAACTGAACTTTACACGTTTTTTTTTGTTGCTAATGCCAA GTCTTAACCCATTCTCCATCACCCTTTTAGCCATTTTCAGATAGTATGTT CTTAGACCCGATTGCTTGCTTAGCTATTCAAGCTTTCTAATTTGTAATCC TTTCTTAAGGTGTTTTCTTGTTTCAAAGGAAACTTCAATGTGTATACATC TCTCCTGTTCTGCTTTTATGTGGATCTGGTGACCCGTGATAACAACTAAA CTTCTAATTGCACAAATTGCACTCTTGTTACACAATGCGTTATTTGGATG GACCTCGTAACTTAAGTTATTTTCTATCACATTTGATCATTTACTAGGGC AAGGATAAGACATCAGAAGAAAGAAGAGTTACCATATGCATTTTTGACGA TGTCGCAGAACACTGTCAAGAAGCGGCAGTTAGGTAACAGCCTTTTGATC CTCCTACTCTTTTTTATAAGAAATTATTCGTAAAACCGTTTCCCATGAAG CAAAGTTTTTATGTTATCTGGTCCTCAGGTATTATGACACATATCTCCCT TCTCTGTTAGAAGCCTGCACAAGTGAAAACCCAGATGTTAGACAGGTCTG AATCTTTCTTCACCGCACATGATAACATTGCATAATTTCTCTAGAGGTGT GTGGGTTCATATTTAACCCGCTGTTTTCAGGCTGCAGTTTATGGTATTGG CATCTGTGCAGAGTTTGGTGGTTCAGCATTCAGGCCTCATACTGGGGGTA TGTGTTTTGCTTACTGTCATTCGGACTATTTTATTGTTACATTTGTTGTT GACATCGATTATTTGTTTCTCCAGAAGCACTGTCTAGATTATACAATGTA ATCAAACATCCCCATGCATTGGATTTGGATAACGCGATGGCATATGACAA TTCTGTTTCCGCTCTTGGAAAGATATGTCAATTTCATCGTGATAGCATTG ATGCATCTCAGGTATCGTATGCGCCATATGCCTTTATTTTCTTAATCTGA GGTGCCATTGCACCCCAACTGCCTGCCTGCTTCGGAGTATGTGATGAACT GGTGATTAAATGTAGGAAGTATTTAACTGTAACTCCTACACTTGTTTCCT TGAGAATAAAAAAAGGCTTGCGGATGGGTATCAATGTCTGACGTTAATGT GATAATACTGTCTCAAGTGTATCATGTTCATTCTTTATTAAGAAATAGCT GTGCTTGCTGAAAGCACATCACAGCACCTCAAGGCTCAAAAACGGGCACG TAGTGTCCAAACATTTGTATCAACTACTTGAAAACCTTAAATGGGTGTGC AAACATTAACTGGTTTTGAACTAACAAAACTCAATGGATTTTAAGTTGAA ACCAGACTATGTAATCATATCTAAAGTTAAACTTGTCTTCCAATTCAACT AGTTATGTACACCTGTAGAAGGTTACCAGGCAGGTTATATATGGATATTT TCCCCTTTTCTTTTAATTAGTATTATTTGGAATCTGATAATTCTCAAAAG CGAACTCACTGCCTACAACTCTACTATTTCTACTGTAAGCTAAAGATCTA CTTAGTTGCAGTATTGCTCTCTTGCTGTCACTAGATGTTTTTTAATTAAG ATATACATCTGAACCCAACAAATACTAAGATATCGTTATGTACTTCAAAA AAGGAAAAGTGTTTGTTGGACCTTATTGGGATTGAATGTCACTTATCTGT GTCCTACTCCATTTGCCCCAAATGTCAGATGATGGGTTTTACCTCTTAAT AGTTACTTTTTTATTTTATTAATAACCAGTGCTTCTGACATGCAGCACTT TTCAATTTTAACAGGTTATTCCTGCTTGGTTAAGTTGTCTTCCATTGAAA AATGACTTAATTGAGGCCAGGATTGTCCATGAACAGATGTGTGCAATGCT TGAGAAGTAAGCTAGCCAAAAATTATTTCCATGGGATTGTGCAGTTTTAC CAAGTCTGGTGTATAGAAGCACCAACCCTACATTTACTCAGTAGCATGAT TATGTTTCTCTTTTACTGACCTTGTTGGCATGACTAACAGGTCCGATAGG GAGCTTTTGGGCCATAACAATCAGTATCTTCCAAAGATTGTATCTATTTT TGCAGAGGTATTCTTTTATGTTTATTTCCCATTTTGTTTTGATTTACTAC TAAACATGTTACTTCCTGGATTTTTGGCACCACAGAGGATTGCTGCCTAT ATTTGTATACTATTCTGTTTGATGCCTTAACCTTCAGAAATTGATTTGAA ATTAACTTTAAATGATAGATAAGCTATTATTGAAATGTAGTATCGACAAA TATGGGTACCAAATGCTGTCTGTCTTCTTAACAACTCAACTTCCAGATTG AACCTGAAACAGGGTTGCTGCTACTTTACCATATGTGGATAATTAGGGTC ACAGTGCTGTCATCAGTAGCATGTGCTTTGGCAACCATTTGCCACACATT TCAATTGCTGAATCATGTGTTGCTCTTTGTGTAATGCTGGCACTCATCTT TTCTTTTCTTTTCCATGATCCTATTTTAGCATTCACCAGTTCATATTGTT CTCCTTCACAAATCATGGGTCCTTCCATAGTGACACAAGTTAACTCTTCA TTCCCTGAGACTATTTTGTGTTGCATTTCTTGTTCTATAAATGAATTAAT ATAATTAATTTTATATAAACATTGAAATTCTACATGGTCTGTGAATATAG TATGCAAATTTGTTACGGAATCTTATCTATTTTTTCCGCGAAACACAGCA GGAGCGCTGCCTATTCATTAAGAGGAGTAGAGAAAAAATCTTATCTATTT TTTCATGCAACAGTCACAGGGCTATATGGCCCACAGTGGCTTCAGAACGT CCACAGTAGTTTTTTAACACCATATCTTTTTTTGCCGAGTGCAGATATTA TGTGCGGGTAAGGATCTGGCAACAGAGCAGACTTCTAGCAAGATAGTTAA TCTGCTAAGACAGCTTCAGAGCACTCTGCCTCCTGCAGTACTTGCCTCGA CATGGTCTTCTCTTCAGCCACAGCAACAGCTTGCGCTACAATCTGTATTG ACATCATAGCTGGCCAGAATAACCTCAATGGTTTTACACACATGTCTCTT CACAGCTTACCTTTTTTTTCTTGTGTTTTATTCACATATTTTTGTGCTTG GGTTCCTGGGGTTTGTGCAGCATACAAATGCCCTGAGCTTTTGTACGAAG GGCAAGGTTTGCGCCCTGTGTGTATATTATTGCGGAGTGATGTGTATGAG GCTGGGTTATCTCCACATCACCGCGGTGAAGTTGTAAAGTTACATACCTG ATTTACTAGTGATGTTAGTTGGATCCAGAGAGTTGTAAATTGACAGCAAT TTTGATCGATGGCGGGTGATAAGTTATCATCTGTCAACACTTGTTTCATC TTCTCTGTCTTAAATTTGGGTTGCCTATTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.