Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE039540

[Submit comment/correction]

Sequence	AE039540
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE039540
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGTCCGCCGCATCGCCGTCGTGGGTCATCCTGGGGAGAGTGCCGCG GGTGACGGCCGCCGCCGACCTTCCTGCCGGCGCGGACCTCTCCCTCACGC TGCTGGCGCCACCGCAAGCCGCGCTCCTCACCATCCCCGCGCATCTTCCC TGGCCGCACCACCTCCAGCAACTTTCCGTCTGTCCTCGCCTCCTAAGAAC GCTACGGGGCGTTTTGTGTACATCCGGATGAAAAAACGTTCCGGGAATGG CCTCCTGAAAATGCTAGTGGAGATCCTTAACAGTCTATGCTTATGTATGA TTAAGCTGTTCAATTTTATTCCCCTTTACCGAGCTTTCCGTGCCGGAATC TGCTTCTCACGTGCTCGTCGCCTTTGCTTAATTATCTAGACAAAGCTTTT TTTCTCTATATATCTTTACTACCTTACGTCATTTTTTATTTCCCATTTTA CCCCGCTTGGCTTAGATATGATATGTAGTACTACACAAATTGCCACCGTC AAGTGTACACTAGATAAATTCCACGGCCGGCGCCTCTCCTCTCCCGCTTT CTCCCTGGCTAAATTGATTCAATCGGCTCAATATAATTCGAGTTTTACTT AGCTTCTTTTATCACAAGTCTAACACAATTTTATCCAGCACATGCCTATG TATGATTATGTTGTTCAATTTTATTCTGCTTCACCGAACATTCCGTGTCC GAAATCTGTTTCTCGTGTGCCTTTATTCTTCTTTACCGAGCATTTTGTGC CTTTGTTCTAACCATACGACCCTTATTAGTGCAGACACCATTTACGGGAA GAAAAGTGACCGACAAGGAGGTGAGCGGTGTTCTAAATTGAAGAACTCCT AATCCTTTTACCTGTTGCAATTTTAAATGCTGAAATCATATAGGAAATGT ATGTTGCATACTGTAAATTAACATGTTTTTCCTGGCCCAAATGTGTCCCT GAATGCTTGATTGAATAACAATGAACTGCTATACAACAACATTTATATTC CTCTGTACATTGATATTTTGATTACAAACTCTGAAGCTTCTGAATATATG TTTTCGTTGATCCTATTAATTATCAATTTGGTGGTACTGTACTTAGTATT GCTCAATCTTCATCAATCATTATTGGCCAGTACAATTCTATTGTTTCTCA CTGGGCTTATTCTGACAGAGATCTGAATGTCCACGTTTGGTGTCTGAGGA CTGAGGTGATTATCAACAAAGTATAGCAGCTATTAAGCGATATATAGAAA AGATCTGGCTGGTATGTTTTCTCCAAGCTCAACAAATGGTGCAGATTATC TTAAGATCGAGCATCATAATTGTGTTGTGGTTCAAATCTATGTGTAACTC TACTCAGTACAATGTATCTTCAAAGGGGTATTTTATTAAATTTAATTGAC TAATTGTGGTCAGCATTTAGCAAATATATTTTCTCTTCATTAAGTTCCGA GCTCTCGCTGAATTGCGCTCCATGTTTCGAATCCACAATCATTACTCAAT GCAGTACACACGCTGAATTGTGTTGTGGTTCAAATCTATGTGTAACTTGT TTTTCTATATATATCTTTACTAATGTACGATATTTTTCATTTCCGGTTTT ACCCCAGTATCGCTTGGCTTAGTTATGATATACTCTCTCTGTTTTATAAT ATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAACATAATGTATCTAGACGCATTTTAGTG TGTAGATTCGGAGAGGTTCACTCTGAATCTACACACTAAAAGTTGTCTAG ATACATTACCTTTACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGCAGGGA GTATTACACAAATTACCAAGGTCAAGTGTACACTAGATAAATTTCATGCC TCTTCTCTCCCTCTTATCGCGTAGAGGTCACCCAACCGCAAATTGGGAGA ACAAGCAAACTAGGCGTCGAGGCTATGTCGCCAACCACCAAGCTCCGCAA CACTCCTTCGCCACATCGACTACTTTGGAGCTTCTCCCGAGAGATGTGGC CCATTAAGGCTTAGGGCGGTCCCTTCACCGCCACACACTCATGGCCAGTG CCTCTACAAGATCCGTTGGGCCACCCGTTGCACCGCCTCTCCAAACGCAG CCATCGCCGCTAGAATGGACAAAGCCATCCAGATCTGGGCCTCCTACGCC CGCACCGCCTCTCCCCGCGTAGCCATCACCGCCGTCCTAACACCATCCTT CCACAAGCATCTTCCCGCACCCAGCACCGCAAGTTGTTGCACTGCCCGAA GCCCACACGTGGAGAGCGTGCCCACACCATCCTCCACAAGAGGATAACGA CACCACATGCATGGTCGTCTATTGCGCTGGAGTGCTGAGTTTCCGCCCAA AAAATTCCTCGAACCACACCCGGCATTTCCGACTGTCCACTATCCCCAAG TCAGGCCTCCGAAAACGCAATCAGGGAGATTCCCTTGCCAAAGTACCGTG GGCATCTTAGCATGTACCATGGTAGAGATAGCATGTCTTTGCTTAGCCAT CCACATGAGTACAGTGCATTATCTTTAACTGTCATCTCTAACAATTAACG AGAGTTAACTATTTTTAGTAGGAATACTATGAAATTGTGTTCCCTGACAT CACCTATACACGCCCTTGTGGGGAAAAATCTCGTCACAACCCTATATGCA GGCATTCCGTGATGTGTTATCTGAATGTGATTTGACTGATATTGGGTATG ACGGCGACCCTTTTACCTGGAAAAGAGGTTGTCTGAGGGAACGACTGGAT CGGGCACTGGCTAATAATGGATGGCAGATGATGCACCCGGGTGCAAGGTT ACAACACCTGGAATATGTTCGTTCGGACCATCGTCCAATCCTGTTAGATA CAGATTATCAAGATGTTCAGGTTAACCAGAACAAGCAGCGAAGATTTGAG GCAAAGTGGCTTAGAGAGGAGTCGTTTAGAGAAGAGGTTCAAAAAGCTTG GGACACGGCAAACTCTACCGTGACTTGTGGTGGTGTCCTAACTAAACTGG CACATATGCATGATTCGCTGCATGCTTGGGACAAGGCTGTCCTAAGGGAC TCGAAGCGCCGCATCAGAAAGGCCCAGCGTAAGCTAGATTGTGCTATGTG TGGCCCTATGACAGATGAAAATGAACTGATTGCTAAAGAAATGGCAGCTC TTATTGAACTCCTTTTGGAACAAGAAGAAGTACATTGGGCACAAAGATCT CGGGTGAATTGGTTGCAGTATGGAGATAGAAATACAACCTTTTTCCATCA ATTTGCTTCGGCTAGGAGGAAAAAGAATTACATTAAAAAATTAAAAAATG GAACTGATTGGGTTGAGGGTACTGCATCTCTTAAACCTCTTGTGCTCCAA TATTTTTCTGATCTTTTCTCTCCCGAAGTCAAGGTTACTGACCCAGCTGT CCTTGAGAAGATCCAACCTAAAGTAGCTCAGTCAATGAATGAAAATTTGA TGGCTCCCTTTTCTCCAGAGGATGTTAAAAAAGCTGCGTTTAGTATTGGA GATTTGAAGGCCCTAGGGCCCGACGGCCTCCATGCCTTATTTTATAAGAG ATTCTGGCATATATGTGGCGAGGACATAACTACTGAAATTCTTCAAGCAA TGAATACAGGAGTGATCCCAGAAGGATGGAATGATACTACAGTGGTCCTT ATACCAAAGATTGACAATTCAGAGTCGATCACTCAGTATCGGCCTATCAG TTTATGCAATGTTATATACAAAATTATATCTAAAATGTTGGCTTTGCGGT TGAAGGAGATCCTTCCTGATGTTATTTGTCCTACACAGAGTGCCTTTGTT CCAGGGCGTCTAATCACTGACAATGTTTTAGTGGCCTATGAGAGTATCCA TACCATCAAAAATAAGAGATCTGGTAATACGGGGGCATGTGCGGTTAAAT TAGATATGCATAAGGCATATGACCGAGTTGAGTGGGTGTTCCTGGAAAAT ATGATGAGGAAATTGGGTTTTTCTGAAAGGTGGATTGAGCTGATGATGGC CTGTGTTAGCTCGGTAAGATATCAAGTAAGGTTCAACTCGGAGGAAACTG ATATGTTTACCCCTACGAGAGGTCTTCGCCAGGGGGATCCCCTATCTCCA TATCTGTTCCTTTTATGTGCAGAGGGTTTTTCCAGTCTTTTGCGGCATGA AGAAGAAGTTGGTGGCATCGATGGGATAAGGGTGTGCAGGAATGCACCGT CAGTCTCGCATCTACTTTTTGCTGATGATTCCCTTATTCTCATGAAGGCA GATACGAATAATGCAACTTCCTTGCATCAGGTTTTGGATACTTATTGTGC TAGCTCGGACAGTTGGTGAGTCTGGCTAAATCAAGCATTTTCTTTTCTCC CAATACAAATGTTTTAGTAAGAGCGAAAATATGTGAAGCTCTGCATATTG ACACGGAAGCATTATCTGATAAATATCTTGGTCTCCCAGCTCTTGTGGGA GCAGATAGGAGTGACTGTTTTGTCCACTTTGTTGAGAGGATTATCCAGCG CATTATTGGATGGAAGGAAAAGCAATTGTCCATCGGCGGTAAGGAGATTT TGTTGAAGGCGGTGGCACAAGCCATTCCGGTATATGCTATGTCTGTTTTC CAAATACCGAAAGGAATCTGTAAGAAAATGTCGGATGCAGTTTCACAATT CTGGTGGGGTGACGATGAGAACAGTAAGAAAATGCACTGGTTTGCCTGGT GGAAATTGTGTTGCCCCAAGATATAAGGAGGTATGGGTTTTAGAGATTTT CACTCCTTCAATTTGGCTATGTTAGCTAAACAAGTGTGGAGGCTAGTTAC AGACCATAATTCTTTGTGTGCGACAGTCCTCCGAGCAAAATACTATCCTC ATGGAGATATCTTGAAAGCTGGGCCAAAAACGGGCTCTTTCTTTACTTGG CAAAGTATTTTGGCGGGTTTGTCAACGTTTAAAAGGGGATATATATGGAG AGTCGGCACAAGTGAATCTATTAATATATATACAGATCCTTGGATTCCCT CAAGTCCAGATAGACGAATCATTACGCCAAGGGGAGGAGGTTTGTACTCA AAAGTCTCGGATCTCATCAGTCCTATTAGTGGCACATGGGATGAGGAGTT AATTAAAGATATCTTCTGCCCGGTTGATGTTAATTGTATTCTGCGCATCC CTATAAATAATCAAGGATTTGATGATTTTATAGCCTGGCATTTTGCAAAA AATGGTAGATATTCTGTGCGATCAGGCTATCATCTTCAATGGAGGCACAC GTTTGGAGCTACAGTGGGTTTGGAGCTACGGTGGGTCAGTTGTCGCTTCC TGGATCATCAGCAGCGAACCCAGTTTGAAAGTCCCTTTGGCAGCTAAAAG TACCAAGCAAAATCAAAAAATTTATTTGGCGGTCACTACATGGCATATTA CCCTTGAAATCAATTCTTGTTAATAGACAAGCGGGTACTAGTGGCCAATG TCCAATATGTTCACAAGCTCCTGAAGATATTATTCATTTGCTCTTCCAGT GTGACACGGCTAGAGAGTTGTGGAGATCGTTAGGCTTAGAAGCTACCATT GAGGAGGCGTCGATGACTAATCGGGATGGCTCAGCGGTACTGGAACATTT GATCCGAAACCAAAATGGTATGCTCCCAGGCTTTGACAACATTGGTGAAA AGGAAATCATAGCTGTGGCATGTTGGTACCTTTGGTGGATACGCAGGCAA CGTACGCATAATGAATCTGTCCCCCTATTGCTCAATGCAAAATGTCCGTT CTTGGTATTACGGCAAACACTATCAAAACTATGTCTAAACTGAGTGTTCC ACGACACCGATGGAAGAAACCAGAATCAAGACAGTTAAAGGTGAATGTAG ATGCTTCTTTTCATTCTGATTCTTTTACAGGTTCTGCGGGAGCAGTACTA AGGGACTCTGATGGAAGGTTTATAGCGGCGTCCACCATTTTCCTTCCAAA TGTAGACTCAGCAGCTTCAGCTGAAGCAATGGCTATGCGTGAAGGGCTGG CTCTAGCGAATCGGCTTGGGTGTAATAATGTAATAGCAGAATCAGATTCA ATGGAGGTCATTGAAGCTTGCAATGGAGAAGAGGCATGGTGGGGTGTATC CTCGGCAGTGTTGGCGGACTGTATCGACGAAGCGTCTATGATTGGGACTG CTATGTTTCAACATTGTCCGAGGGAAGCTAACGGAGTAGCACATGAACTA GGTCATGTTTTTTTAGTAATATTTCTTGTAATTGGGTCGATGAACCCCCT AGCTTCATTCTGCAATCTCTTGTAAACGATGCAACAATTGTTTGATGGGA TGCAAGTTTTAGACGCACTTTTTTTCCTTACTAGGATACCTAAGGGGATT GGGAGGTTTTAATGAGACGGCTTGCATGCTTAATATATGATGTTCAAAAA AAAAGATGGACATGCGTACAGACTTCCACAAAATCCCAAAAATTACGGCG TAGTAGCTCTAACTAATCACGGTTATATTCCGAAAATAGCTCCGCTAAGC CCCGCGCTAGCCATTGACACAAAATCCGCTGGTCGTGGATTGTATGCATA GATTCCATACTGGGCAATTAGACAGAGACCACCTCTCTCCCCCTCTCGCC GTGCAATTCTACCAGCCCTACTATCCAGCATTCCAGATATCTGCTATCCT TTTCCTTCCAGATCCCATAGAAAACTCAATGGCCAGAAATAACGAACCTC CGGAAAATTGGATCGCTAAGATTAGCGGCAACGATTAGGCGGCTTACATC TCCAGCTCCGAAGACGACGAAGGTTTCATGTCGGAGCGATTGGCGCATGG AAGACGAAGAGCTGGCGCACTATGTCTCAGTTTTCAAGGATGACGACGCG CAGTATTTCTGGGTGGAGGCGGAGTTGAATTGGCGACGCCGTTCGCCGGT TGCCGTCCAAGTGCAGGCGGACTTGGCGAAGCGGCCGGATGCGGGGCGAT CGGGTGCAGAACGGCGGAAGCGTCGTTCTCTGTTTCTAGGTTGAGCGACC GTCAACAATTTGTCCCACATCGCTAACCAACGGACCGTGTCACCTATTTA AATACCCGGGTACGTCGTGCAGCTTCGCCTTCGGGATGAAGGCATGAGCA AAAAAAAAAAGTTGTATGTAGTGTACATAAATGTACAGAAGAATTGTACA TGTACCATAGTGTATATTAGCTGTACATTAAAAATGTATACAACAAAACA TGTGCTACACATTAGCACCAAAGCTCTTTTTTTTCTGTATATATATTTAC AATCATTTTTTATTTCTGTTTTTACCCTAGCATGGCTTGGCTTAGTTATG ATATATTACACAAATTGCCACCGTAAGTGTACACTAGATAAATTCCACGG CCTCTTCTCTACCGCTTTCTCCCTGGTTAAATTGATTGAATCGGCTCTAT CTAAGTTGAGTTATACTTAGCTTCTTCTGTCATTGATCTCAAGTCCTAAC ACAACTTAATCCGGTGTATGCTTATGTATGATCACGTTGTTCAATTTTAT TCTGCTTTACCGAGCATTCCGTGCCCAGAATCTGTTCCTCATGTGCCTTT ATTCTGCTTTACCAAGCATTTCGTGCCTGCTTTGTTCTAACCATACGACC CTTATTACTGCAGACACCATGTACCAGAAGAAAAGTGACCGACAAGGAGG TGAGCGGTGTTCTAAATTGAAGAAGAACTCCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.