Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE012876

[Submit comment/correction]

Sequence	AE012876
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE012876
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGCGCGACCGGCACGCCTAGTGCGAACGACAGTTGTTCGCTCGACCGAAA CACCGACCAAAGCCCCCTCCCAAACCCTCCTCCGGGCCGTCCGGCCCCCG CCCCGCGCCGCCGCCTAGCCTAGCCTCCATGGACCTCTCCGACGACTGGC GCTTCCTCTTCCCCGTCTCCTCCATCTTCAACCCGCCGTCCCTCGCCCCG CCGGACGCCTCCCGCGGGCCCCTCCTCTTCTCCCCTCTCCCGCCGCCCGC CCCGCTCCTATCCCTCCCCTTCCCCTTCCCGCCTGCCCTGCACGCCTCCA CCACCGGCGACCTCTTCCACGCCCTCCGCTACTTCGTAGCTTCCACCTCC TTCCTCCCCTACTCCGACCTCCGATCCCTCTCGCGACCCCTCCTCGCCGC GCCATCGCCGCCGTTCCCCCCGCCTTCCAATCTGCTCGCCGTCCTCCGGT CCCGCTCCTCGAGTTCCCTCGTCCTATTCTTCCCGTACGGAGAGAACGCG GACAAGATCGCCTTCGCTACTCTGGACTCGTCCCTTGCGAGCTCCGAGCC GTTCGTTCAGAGCGGTGGGCTCAAGCACCCTGGGCACCGCATACTGCAGC TCGCAGCCGCCCCTGCCCAGCCGTCCTGGTCGTCGGGGCCGGAGGACAGC CATGTCGAAGGCTTCCTTCTTGCTGCGACGCTGTACTCAGTGAACTGGTT CAGAGTCGAGCCGGGGAATTCCCCGGCACTCGTGCCGGTGGCCAAGCAGG GGTTTGATGCTGCTGTCGTGCACGCGTGCTGGAGCAAGCATTTTCCGTCG CAATGCGCGGTGCTACTAGAGACCGGCGAATTGTGCTGGTTTGATCTGGA GACACGGCTTGGAGGCAAGACGAGGGTTGGTTTTGGCAGCAGCAATGGTG AGGACTTGGGGGACTGGCTCAGATGTGTGTATGGAGCGCAACCGTGGATG GTGATCGTCGCAAGCACAAAAGCCGTCCTCATGGTTGATTTGAGATTTGC GGATCGTGGCGAATACAAGGTTATAGCAAAAGTTGGGGTGCCAGGGCTGT TTGAAACTGAGCCTTTTGAGATGACTGAGCATTATCTTGCATTCTGCAAG GCTGGGTTTGATGATTTCCACATGTCAGCAGTGACAGAGCGTCACTTGAT TCTCCTTGACACGAGACAGCCGTTGACACCTGTATTGTCTTGGCAGCATG GGCTTGACAGCCCGAATCATGTTGCTATGTTTCGCCTATCTGAATTGAGA CCTTCCAAGGAGTATGAGTGGGCTTCAAATTCAGGTTTTGCCATTTTGGT CGGTTCATTTTGGAACGGAGATTTCAGCCTGTTCTGCTACGGGCCTAAGG GGCAAGGATGTCCAGACAACTCTCATTTATATGCATGGGATATTCCTTCA CGGCTTTCTCTGACAGGTCAGCATTGTGGCTGCAGCAATGGAATCATGAA AGAGATATTCTCGACGCCTGTTTCAGGACATGGCAAGTATGCTTCCCAAC ACGGTGTGAACTCCATTGTTGGCTACTATGTGCTTCCAGATGATCTCTCA ATATCGGAGCCAACAGTTTCCAGCTTTGCTTTGATCCGGCTGACAGCATC GGGGAAGTTAGAAATGCAACAATATCGTGCAACAAGAGATTTGCATGATA CCATTGACACCCCATGTGATGAATCAGAACATGCATCCATGGATATTAAT TCACCCATTTTTGTCGACACTGAGGAAGAAAATGTCTCTACCAAATATCG ATTCTTGAAGTTGCATTTCCTATCTGAGTATCTGAAAGGCAATCTATGCA GTGCATTGGCGAAGCATGAAACTAGTGTTACTGAAGACAGGGAGCAAATT ACTATTAGTGAAGATGTTTCAGCATTTGCGGAGGAGAACTCTAGGTCCAG TTCGTTATCAGTTTCAGATTTTCTTTGTAATGCTAGTGTCCCCATGAATG CTTTTGAAATCGCATGTCAGAGCATATTGAGCGGTCTATCTTCAGATATT CTTCATATCTCCTTTTCTAAATACAAGGACATGCTAAAGTCCGGTACAAA AGAAGGCTTATTAGAATATTTAGAAGTTCCTAGATGTTTGCCGCATAATG AACTTCGGCCTTTCCTGTTAGCAAAACCATCAAGCACAGGTGAGAAGCTG ACTAGCAAAGTGATATCTCAAAATGCTATTGTCGGACCAGTGCTTCCTGT ACCTGTTCTACTTGCAATGGAAGAGAGGATCATGGGCATAGACAGCCCTT ACGACAGCGAAACTGCAGAAACCGACTTTGTACGTGATCGATGTTGTGAA GTTCTCGAAGCCTTTGTTCCTGAACTATCCATACCTGAGGCAGACTGGTT CTCCTCAGAAAAGTTGAATGAAAAGAAGCCATATTTTGTTTACAAGCCTC GGATTGAGAATAGGTTTACTCTTGATGAAACTGCTGTAAAGAAGGAAACC GAAGAGGCAAATGTTGGTGATTGTGCCTGTTTACAAACATCTGCAGCACC ATACAAGGATGAGAACTTCATGGAATTTGTTTGTGGAAAACCTGGGATTC CTGATTCTGGGCCTGAACAAGCCACATCTGATTTGTTTGATTTCAGCCCA GTGAGGATGGATTTTGATTCCACAGACCTAAACATTCAGCCTGCTGAAGG AAAAATGTACAAATGCTTGAAGAAACAATTTTTAACCTGGCAAAATAAAT TCAAGCCATACCAAGATTTTTGTAGCTCACATGGAATACAAAAGCCGTCA TAATGGCCTGCCATGCTCCATTAAGTTCTAACAGCTATTGTATATTTTCA TGTAATTGTATCGTGTTTATTGAGTAAAAGACAGACTAATGAAACTCTCA GGCACTTGGCCTGATAGACATATGGTGTTGTTTGCATTTGAGATGTGTTG TATACATATTCCTTACTAAGGTCACAATGCTGCAATATCGGGGGCGAGAT GTGGTGGACAGCACAGAAAAGCAAGTAAGTGGTAGGATTTGACATACCTG GCTTAAAATACTGTTGAACTTTCTATCATGTTACATTTTTACAATCTTAT GTTGAGATACAATTTTATCACTGATAGTAATAGAACTCATTTATTTTCAG AATCAACCTTCAGTTTCATTGTTAACACTACATATGACGGTAACAAAATT TATGGCAATCATTGTGCTTCTTCGAAGATATGCTTATATTGATATGCAGT TTAGCATTAACCAAGGTTGGAGTTAACATACTGTACTTTATTTTCAGCAC TCAACCTTCTCTTTTGTCTTTTACGGGTCTGTTATATCCCCAAGATTTGT CACCTTCACGCGTGTTCAGTAGAAATTTCACTCGGTCTGAATATCTGTTC AGAAGCGTTGGTACACCTTTATAGACGGTGTTCTAAGGTCAGATTCCTTT TTTGGTAATTAGCTACCTTTTGTATCACATTCTAAGTTTTTTGGATGTGC AATATTCATTATTTACCCTTTTCAGTAATGATGCCCCACATGGTAATTAA AATAGAAGGAAATAGTAGTATCATGCTGAAGGATATTTTGGTTTATTTAA ATTCAAACCATGTACCATTCAGAAGTGATTTATATTCTCTTCAGCTAACT AATGGCTAGACAATCTACAAGCTTATGAAAATTTTAGATTTCTGGGGTTC ATTTACTTCTAATTTTTATTTTGTTTACACTTTTGGATAGTGAAATAACA AGAAAGATAATTAGGGAGAATATCCGAGTGCTTAACTCTAAAAGTTTCTT AAGCATGCATCTCAAATCTGAGCTAAGTATTCCCTCCGTCCGCAAATAAG TGTACTTTTAGCCTTGTCTTAAGTCAAACTTAGTAAAGTTTGACTAACTT TATAGGGAAACGTAGCAATATTTATAACACTAAATTGATACCACTAGATT TGTTTTCAAATCTAGTTTCATAATATGACAATTTCATGTAATATATGTTG CTATATTTATCTATAAGGTTGGTCAAATTTAATAAAGTTTGACTTCGCCA AAAGCTAAAAGTATACTTATTTGTGGATGGAGGGAGTACTAATTTTGCAC TTATATGTCTATGCTGCTCCAGATCCTTACCTTGGGATGCTAAAACACGG AATGAGAAACTACTGAAGCGAAAGCCAAGCTCCGATGGTTCGAACCAAGA GTCGAAGACCATATTGCTGCATTAGAGAGGCAACAATAGCAACGGCAATG GAGCCCCATACCTGCCAACCCCATGGTGATTTCATCCATTAGGGGTTGGG GATGAGTGGAAAACTCCCCCATGGGGATACTTGTTGAACTAATTCATTCC CCATAGGGTATCGAGGGGATGGGGATGGTACCCTATACCACTACCCGATA CCCTACGGGGACCCCGCTTTTCACATATGACATGTAGGGTCAGCAATATG TCTATATATACACCTCCAAAAACCCTAAACAATTCACAAAATATTCCACA AAAATCACCAAAGCCCCCAAAAATCCTACACGTCCACCTGGGCCGCCACC ATGACGAAGCCATCTGGACGTTCTGCATCGGCGGTGGCTAGACGAGGACA GCCTCGTGACAAATTGTCTCCCCCTGGCGTGGTTCCTTCCTCAAGCTCGA CCAATGTATCCGCCGAACTGCCCCAGCCTCGTCTCGTGCAACCCTCCATT TCCAAGGTATGAATCTCACCCGTGTCTGCTGATATCTCCCTCTCTCACCT CTCCTGTGAAAATCCCCAATTGAGTGCCTTCTCCTGCTTTTTTGTTGGGC ATTGGAATCTTCCAGGTTGGTTTTAATCTTGGATTGGTTTCAATCTCTCA GATTCATTTCAATCTCTCTCTCTAACACCTTAGTGTCCTCTAGATTGAAA TCTTGTAGTTAGTCATTCACTATTTTTTTATGAGCTTGCATGCATACTTG CCACGAACTGTGCAGATCTGCGCCTGCCTACGTTATTCATTAGGATTTAT TCTAATATATCATTTTTCTGTTTGATCGGTTGACCACGGGACACTAGCAG ATATGCGCCTGCCTAGCTGATTGATTAGGATTTCTTCTAGCATATCCATG TCTCTATATGCTCACAGGACACTACAGATACAGATCTGTGCGTGCTTAGT TAACTGATTAGGATTTGTTCTAGTATATCCATGTTTCTCTATCATCACAG GACAATACAGATCTGTGCAATTCTTGTTAATTGATTATGATTTGTTCTAC TCCCTCCGTCCAGTAATAAGTGGCTTGAATTTGTCTAGATTCGCATGTAT CTAAACGTGTTTTAGTATATAGATACATTTGAATCTAGACAAATTCGGGT CACTTATTTCTAGACGGAGGGAGTAGTATATTCATGTTCCTTTATGATCA CACGACACTACAGTTCTATGCATGCCTAGTTAATTTATTAGGATCTGCTT TAGTTTATACAGATTTCTTTCTGATCGCATATCAATATAATTTAGAAAAG GGTTTGGAAAGAAAAGGAGCTCTCGGAATGCATAGATGCTATGCAAATCA TCATAGAGCTTTGAAGCACACTAGTATCTGACACTAGTAAATAATTTTAC CTTGTTATGTACATGTCCTGATGGCTTGATTTATATGCACGTTGATGATA AATGGTGTATAATTTTTTGTTTTACATGATCTACATGTAATGAGTAACTA CTAACAAATAAAACCAGATTTGATCTTGCAGCTAATGTGATGCAATCGCT CATTACGTATACATCAATTTACATGCATTTATTCATGTCCACTTAGTGAC ATAGATAATAATTATTATTGTGGGTTGGTGACACTAATTGATGAAATTTG AACATTCTTATTTCATCTTGTAGGTCCTTGATCCATTCGATATTTCATCC ACCCCTGCAAGCGGTACTCTGGCCATAGGTCCTACACTGCCAGCCTCACA GCACGAGGCTCGTGAGTCTGTAGCAGAGGCATAGCCGGAGCCCATGAACA CAGATACAATTGTCATCGAGGATGATTGCAAAGAAGATGACTCGGAAGAA GATGATGATGATGAGCAGGTTGTGGTTCGGCCCAAGAGGAAGTTAACATC TCCTGTTTGGAAGGAGTTTAAGAGAGTGAAGGTCATGAATAAAATGAAGG CAAGGTGTAACTGGTGCTCGAAGAAGCTTGGAGGAGAACCAAGAAATGGG ACAAAGCATCTCCTTGACCATTTGAAGGTATGCCCATATCGCCAGAGGCC TGAGGTGACCAAGAAGCAAACCTCACTGAGGTTTAGTTCAAACTGAGGCT AGGAAGGCTCTTGCTTCCATGATTAGTATGCATGAGTATTCCTTGTCAAT TGTTGATCACATTGGGTTCAGAAAATTTGTTTCTGCACTTCAGCCATTAG CGCTGGCTTGGTGGCGAGGCTAGCGAGTGCGCAGCCAGCCCACCCGGGTT CGAGTCCCCAGGGGACCGAATTAAATGGGGTGTTATCCGAGCGCGTTTAA TTCGCTGCTGGAGAGGTCTCATCTACCGAACAACGTACAGCTCGCGAGGG ATCATTCCCCGGGGGTCAACATTTTTTAAGATGGTGACCAGAAGTCTATT AGGATGGACGTTATAGATAACTATGGAGTTGAAAAGAAGAGGGCCATCAA CTACATGCAGAAGAATCATGGAAGGGTGGCTATCACTACAGATATGTGGA TGTCTGATAATCAAAAGAGGGGCTATATGGCTATCACAGGGCATTTCATT GACGAGTCATGGAAGCTTCAGAGCAATATTATGAGGTACTTGCTCATATT TTTGCATTAACTATCTGGTCATAAAACTGCATTGCTGTTGTATAAAATAG TCTCTTAACTTCAAGCTCTTGCTTTTCAATTTGCAGATTTGTTTGTGTGC TAGCTCCACATACTGCTCAAGTAATTGCTGATATACTTCATGATGCTCTA GTTGAATGGTATCTAGAGGATAAGGTTTCCACGTTGACTGTTGATAATGC TACAACAAATGATGCTTGCATTCCCATATTAGAGAATTTGATAGGTCCAA GTAAGCTTATGTTAGGTGGCAAGCTTATGCATATGCGTTGTTGTGCGCAT ATTCTTAATCTGATTGTTAAGGGTAGCCTGGAAGTGACGGCTGAATCAAC TGAAAAGGTTCGTGATAGTATTGCCTTTTGGACTGCCACGCCTAAGAGGA TAGAGATTTTTCAGGAAGTCGCAAAGATGCTGAAAGTAGACCAGAGTAAA AAATTATCTCTTGATGTGAAAACACGTTGGAACTCTACTTACTTTATGCT TAGTATTTGTTTACGCTACAAGAGTGTATTTAATAGATTGAAGCAACGTG AGAAGAGCTTCACCTGTGCTCCTACTGATGACGATTGGAAATTTTGTGAA GAGGTCTGTGATAGGCTAAAGTTTTTTGCTGAAATTACTGAAATATTTTG TGGCACTCAGTATGTAACTGCTAATGTTTACTTCCCTAAGATATGTGAGA TTAAAATGAATATGAAGAAGTGGTCCAGCTGTGGGAATGAAATTATAGAG GCTATGTCGGATGCTATGAGTCGGAAATTTAACAAGTACTGGTCTGATAT GCAAGGTCTCATGGGTATTGCTACACTCCTGGATCCAAGGTTTAAGATTG ATATGCTGCATGTGTGCTTTGAGATGCTCCTTGGTGATGACTCTAGTACT GATTGTGAGAGTAAAGTTGATGAGATCCGTGATTTGCTCTCTAGTCTGAT GCTTGAGTATCAAATAGAGAATGGGCAAGAGAATACAGAAGTGCAGCCGG TCTCCTCCATCTCTTCAATGGAAGCTAAGGAGGTGATGTCCATCTTCACT GCACGTGTAGCTAGAAAGAAGCCAGCAACAAGTCTGTCCAGACCTGAGTT GGATCGTTACTTGGATGATGAGTACGTTCCAGCTAATCAAGAGAACTTTG ATGTCTTAGGATGGTGGAATGTTGCTGGGTCACGCTATCCTACTCTGAGA GCTGTTGCACGTGATATATATGCCATCCCTGTGAGTACAAGTGGAAGGGT CCTTAGTGAGCATCGCAGCCGTCTCACGCCTGAATTGTTGAAGGCCTTAA TGTGTTCACAGAACAGGCAGCAAAACAAAGCTAAAGGTTTATACATTTCT ATGTTATGTAATTCTTTAACCATTATAATTTTGTGATCGCAAGGAGCTTA TTTCAGTATTTGTTTTTGACATGTAGACGATGAAAAGGCTGAAGCTGCTA GTTTCTGGAGTTGCCTTGATGACATAGAAGAAGGTTTAGAGGTGAGTTAT TCTACCTGACAACACTTGTCTAATGAAAGTGTTCCTTTTATTGTGTAAAT CCTCATCTTATTGTCATTTACTGCAGTGCATCACACTGTAGAGGGGTTCC GTCTACGTCCACTACATCTCAAGCCAACTTCGATGAAGAATAATGCCAAG CTTCACCAAGCATCTTGCTGTTAGCTTGTTGTCTCTGCAATACTTTCGTA TAAGGTCTTGTTTTTCTTTATCACTTCTGTGAGCGAGTCAGCAAACTTTC TCTAGCTGTCGAATGTGGTCATGCGGATCATTGGTGTTTGTACCTTTGCT TCACTAAATTTGTGATACTCTCTTTGAGGTTATGTTCAAACTATTTATCA TCTCGATAATATTTGGTGAACCTATTTGTGAGCTTGTTATATTTGTGTAT GCACTCTCGTTTATTATTATTGCATCTGTATGGCCCTCTTTCACTATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.