Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE009275

[Submit comment/correction]

Sequence	AE009275
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE009275
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCTTTCTAAATTTTGTCACGAAACAATCTCCCCGTGAGGCGCGGCGGCG CTAGATCGCGCCTGAACCTCTCCTCTGGATCCAGACCCGTGCCGCTGCTC ACGCCCGCGCCCGACGACGAAGATGTTGGAGCCTCCCCGGGCATCCCCTC CTATGGCAAGGGCCGATACATCTCCGCCCATGTCTCCACCCCCCGCATCC CCTCCCATGGCAAGGGCAGACACATCCCCGCCCACGTCTCCATGCGAGGA GCAGCAGCCGCAGAAGGGGGTGAACATCACGGGGAGCGCGAGGAGATGAA CAACGGGCGGCGTGGTGGTCGAGTTCTCGGTGGCAAGGCTCGCTGCCGTC ATGTACCGGAAGCGGCAGGCCAACATCCCTGTCCAGTCCAGGTATGCTGA CTACTCCGCCACTCAAATCTTGTCGGTTCTCTCTCCGTTTCCCAGGAGCA AATCCTTGGTCCAGGAAGGCGACATGCCAAGTTTTTTTCTGAATTGATGC AGACCAACCACTTAATTAAATGTCTGAAGGTAATAGTTTATGGGTTTCAA AAAATTGATCAGTGCAGGAGCAATTCTAGCGTAAGTTCTATGGGTTTTGC TTTGTGGTTGTTTGGATAGCAAATATTAGCAATCAGTTTTGAGAAATCAA GTTTTGAGAGGATTTTTAGGAGAAACGGAGTTTTGAGAAAATCATGTTTG GGTTTAGAAATTCTAAAGCCCGTATTGTGTACTCCCCCCCAGCTTTCCCC TTCTCCGTCTCGCGGACTTTGGCGCCACGAACGCATGTAGAGGCCTAGTC TTTTTCATGGATCCCCACCGCCGTCGCCAGCGAGCCCGTCGATCTCGTCA TCGGTGCTCCTCCGCTCCGCCCGTGCGTGCCCTCCCTAGCGCCCCGCGGT TCCTCTTCGCCGGCCGCACCTCCTCCGAGCCGCTGAAGCCCGCCGTTCGC CGTCCTCTGGCCCGGTCATTCTAGGGACCTCCTCTCCTCTACGACCCTGC TCGCTAGCGCCGCTGTCTTCCTCTTGGCCGGCGAGCCCCCATCAAGCCTC TGCTTCTGTGCTCCTCGTTATCCGTACTCCCGAGCAGAGCCGCCGTCCCG CTGCATCTCCCCTTCTCCAGGCTCGCCCCGGCCCTGACCCCGCCTCCGCC CTTCGTCTGCGCGTAGGACCGCGACCTCCTGGTGCTCTAGTTCGAGCACG GAGGCCCTCGTCGTCCTCTCCCTTGCAGCAGCGTGTCCGCCAAGCTGCGC CACAGGACCCGCCTCTCGGGAGTTCCTCCTATCGCCATGGACGCCCGCTC TGCGACTCATCACCATCTGCACGGGGGATCCGACCTTCTCAAGATCCTTG ACGGGCCCTGCAGGTTGCCTCCTTTCCTCTGTAGCAGGCAGCAACAAGAT CTTCTCCACCGGCTGTTGTTTGACCATGCCGTGACCCTAGGAGCACCCGA GGGGCCTCCTTCTTGTTCTACAGATGTCATGCTCGTATCGGCCTCAGTGT TTGTTCTGGCCAGCAGAAGCCGTTCATAGATGTTCCCCGTGAATGCCGCA GGAAGATGGATGCCGAAGACTCCCTAATCAAGTTCTACGCCAATATTAAA GCCGAAACAGGATCTCCCGAGACCAATCCGATGACGATGCACCGAGATGA TCCGCAACCCCCACAAGGATATCGTGTCGCCGCCAAGATCTTCATGGAGA CCGAAGACCCCATCGAACCCCAAGATCTTCGTACCCTAGAGTGTGACCTC TATCCGAGACCCCTATTTTTATAATATGACATTATCAAATGTTGCATATT AAATCATCAATACTCACATACATGTTTATTTGTTTGGGGATATTTTGTCG ACTCACCTAATAATTAAATATGGAGACTATATGAGGGTCATTCTAGTCTT ATATTGCCTCCATTTAAATTTGTGAAGCGAACCGATGCCATGTCTTGCCT TACAACATTTAAATTGTGGGGTATCTAAATAACTTTAACCTTACAATTAA TTGTCGAGACCCCGGTTCCGCTTAATATTGCGTAATTGCATCGCATCTTT GGCATGCCATGCATCATACATGTCCGATCTTCTGCCGTAGTATTAAATAG TGCATCCGGTGTTTCTTTTAGTGTTTTGCTTCTTCGCGGATCAGGCCGTT GAGTGGATGTGAGTATCGACAAGTTCTTCGGATAATGTACATTTGGCAGT GTTTTACAGGCGAGCAATCTTCCTCTTTCTACCTATTTTGCATTTATAAT CTTTACTTCCTCCTGTTGATCTATTGCTATCCGTGTTGCGATGCTTTAGT TTCTGTGCACCCTTTATATTCCTTGCAGCCTCTATATTGCCTTGGACACA TCCTATTGCATGTTGTTTGATAGATAGTCGGCCTTGCGAGTCATAGTTGC TTGCTCAGGTTATGCTTCGCTTTGTTGTCGTTCCACTGTTGTTGGAAGGT TGGCACATGTTTAATGGTGAAGATGATCATGAGTTTAAATACAACTTGAT TAAAATGCTAGGAATAGTTATAACTAATGCAGAGGCACCGGTGGGCAATA GATAATATTTGGTTTTTCCACGCTCACTTGTGTCCCATAGGCCCCGAGTA CTTGATACCTGTTCCTTGACTATTCGCACTATCTACATACGGGAGACTCT ATGAATCCCCCTTTGCCTGAGCTTGATTCACACTTTATTTCTTGGGGCCA CAAACTAGTTTGGAGCTTTATTACTATCCTGTACTTATGTCATGTTTTAC TGCTTTATTTACGATTGTGCGTGGAGCACCTGTACTATTTAGGAATTTCG GAGTGTTTTCGCGGTATCGACAAGCCCATTCACACTTTTGGGTTCCCAGT CGTTTACAGCCATTGGCACAAACCTTGGGTCTGCCTCGGAGCCGGCCAAC TTCGTTGCGGGTAGCTTAATGGGGTGGCCCCCTGAAATAATTTATGAATC CCGTGAATGCTTTGTCGTGAGGCCTCGTTGCGTTTTATTTGGTTCTTCCC GAGGTTGATCGTGTGTGTGTTGCTATTTGTGCACCCCTGCAGGGTAAAAC TTTCTGAAAGCCGTGTCCGCAATTATGGATGACTTGGAGCATAGTATCTC GATCATAGACAACTATAACTAAAGTAGTGCTATAAATTTGACTTTGACAT GTCTAGTAATCAGTTTCAGTACAACGGAATGAGTAAATAAAAGTGCCAAT AACTGCTGGAGTTGGGATGTCTCATGCTAATTGTATCTGACTAGTAAGTA TTGCAACTACAATGGAATGATTAACTAAAATTGCCCACTGATTATGATAT CGGGATGACTCATGCTATCTATATCTGACTAGTAAGTGCTGCAACTATAA TTGAATGAATAAAATTGCCAAGTGTGTGAGTTCCTTGGTTTGACTTACTC GTTTGGTCTCGAGGGGGAAATACCAGGATGGGTATGATTGGTGTTAGTAT CAGGTTGGTTCCGAATAGGTCATTCTTATCTCTCTCTACAATTGTATCGA GTATCTATAGGTTGTTAGTGCATGCTTCGCTGCCGCTTCAGTCCACCATA CCTATGTAGGCGAGAGCCGCCAAATTCTAAACTCGCCGTGTACTGGCCTC AGTACTGACCGCTCCCTTTTTCTTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGT TTTAGCAGGATTGAGATCGACGTCGTTAGCAGAGTTACCCTTCCGGCTTG GCCTGGGCAGGGTTATGGACGCAATTGGTTATTCTTCCGGGCTCTTAGCC CCATTTGCATCTTATCCGTACTCGGATGTTGTATCATTTTCAAGGTGATT TGGATCTTTGTATTGTATATCTGTATTTTTGACTCATGGAGTCGTTGTTG TATATATATGTTTTTATGGGTTCCATCGTGGACTATTGTGTAATGATATT ACTTCGTTTTCCACCCGCACGCAAGTGCCGGGTGGACATCTTTGAATCGT TTCTATGCAGGTTTGGCGGGAATCGCTGAAACTTGCAAGGGCCGATTCGA GGGTGTTACACCAACGCTCGCCCGCCTCCGGTCACTCCTGCAGGTCGACG GTGCCAAGAACCTCGGAGTTGGCCCCGTCCCCGCCAGTTGACGCCCTCCT CATCTGACCTCGACTCCACCCGCTCCTCTGCAGCCGATATCCCGCAAGGT GAGCCTCTCGTCACTCTCTCCTTAGCTCCTGTTGATTTCTTGCTTCTCTA CATGTTGCCATGCTTATCCTTAGGTCATGTTCTCATCTAAAAAAAGGCTC TGCATCTGTATCAAAATACCTTGTAAAAAGGGGGTTAGAATGACATTTCT ATTATGAATTGGTAACGACTTGATCGGTAGAGGATTTTGAAAGGACAAAC CAATATTAATAAGAACACCTGAATAAACACAAGCATAAGGTTCACATGGG TATGTGCCATGGCTATCAAGCCACTACAAGACACAAAATAGTAGGAAGAT AAGAAGTTCTAGGGTATTTGATATGTGATGGACAACCCAGGTTATTTTTA GATGCACCAAAGCACGACAACAGGAGTGCAAGAATCATAGCTTAAGCTCT AATAATGTTTTAGCCCAACAATATTAACTTCTAAACAAAATGTTAGCTTA CAAGTTGAAACACACATAGATGCTCATGGCAATATGCTGCATCTGTCTAA CATCTATGGATTTTGAGAATGTCACGCGTTATGGGCTTATCAGTAATCAA AAATGACCACACGCAGTAGGCGTTTGTTCAGTTCCTATGGCCATTATGAT TAACATTTGGCATAAAAGTTAATACTCCCTCTGATCCTAAATAAGTGACA TAGTTTTGAACAAGAGTTAGTTTAAAACCGTGACACTTATTTAGAATAGG AGGGAGTATCACATATTATCATCAAAATTTAAGCAAGGCCAAAATATGTC TACAATGGCATTACATGACCTGGATTATATTGCAAGGTTCCAATGTAACA AGCTAACATATAACATAAGAACCTAGCCTGGAGAAAGCTAATAGACCTGG ATTGTATTGTAAGGCTTCAATGTATAACAAGCTAACATATATAGATATGG AGAACCGTAATCATACCAGAAGAAGCTTTCTTGTGGAAAGCTAATTGAGA CATAGAGTGCATCATATGTAGTAGTCTAAGGATCTCCTTAACTAAATCAT ATTTTAGTTACATCTACAATTCAGTTGTCACGCTTACTTATATTATGAAG TTTAAAAAATGAAATTAGGGGAAAGACAGCACACCACATAAACTTGTACT ACTCCGTACAATAGATGAACTTTTTTCTTGCTAAGGTCAGAATCACAGGA ACACCCCCACCTAGGCAACTATTGATGGCCAGAACATGAAATCCGTAGGC GAAGAGATGTAGGAAGAAGAGGCTGAACATGTTGCAGTTAGGGACCATTT AATTTCAGTACTGGGGTGTTCAGTTGTAGCATATTTTCTTAAGATTATAG TAGCAATGGAATTGCAATGGGTGCTTACCTAAGGACATGATAGGATGTTG ACATATAGACCTTGTTTGACCTTCTTTCTGATTTGGCTTCAGATACTTCA TTGCTTTCCTTTTGTCACCACTTGCAAAATGTCTCACAAACAGCTCCTCT ATATCGTCCATCAGTCTGATTGCCTATTAATTTTGTATTTTTAGCTACTG CCAGACGAAGAACCTGATGAATTCCCTACGTTCAAAAACCTTGCAACCTT ATTGCTAGATGATTGTGAATTGGGTGAAAAGTTCCATATTCTGCAGTACT TTCTAAAATCACCGGTGAGCACATCAACAAAACCTCCTTCCCCTTATGCT TCACTGCAATGTTGATATGTTATATGTGTACTGCTCTTCTTTGATTTATC TTCCTATTGGTTAATCTCCTAAATATGTGGTGTTGTTTTAAATATTTCAT TAATTTATTTCTTGTTCAAAATAATAGTGATGGGTTCTAAAAGGGATAGA ATTAGGAAGTTTATGTTGCAAGAACAAGAACAAGATGATGAACTCTTCTT CGCTTTGGTGTCGGCTATATACTCTTCTCTCTATGAGGAAAAACGGCTAG TACACACATCGTCTTTACCCGGTGCTAGATTGGTGAAGGAGATATTAGAA GGACATGAGAGTTGGTCTAGGGTCGAATTTCGTATGGAGCCCGAGATTTC TAGGTCCATCTCAAATTATCTTAGAAGAGAGTATCTACTGGAAGGCACGC CGAGGGTGAGTGTTGAAGAACAGCTAGGCATGTTCATGTATATGATTTCA CATAATTCTACCAATCAAGATCTACAAAAAATTCCAACATAGCGCCGGAA CAGTTCATAGGAAGATGAATGAGATTTTCAACTTAATCCCAACTCTATTC CAGAGATTCGTAAAGGTTCCAAGTTCTCTCTAGCCCCACTCGAAGATCAT GTCCAACCCTCGCTTTTGGCCTTATTTCCAAGTGAACAACTATACACATA GCTACTTTTCCAAACATCACCCATATATATTTCTAAGCCACTGGTTTTGT TTTCAAATATGCAGAATTGCATTGGGGCAATCGATGTGACACATATCCCC ATAACTATTGCCGAAGAAAAATCTACTCCATATAGGAACAGGAAAGGAAC CCTTTCTTAGAACGTGATGATAGCATGTGACTTCGATCTGAATTTCACAT TCATTTCATGCGGTTGGGAAGGGTCTGCATCTGATGCTGGTGTTCTTTGG TCTGCTATTAGCAAGGGGTTTCATGTGCCTCATGGAATTCTATCTTGTTG ATGGTGGGTATGGAAACACACCCTCTTTTCTTGCTCCATACCCAGGGGTT CGGTACCATCTCGGGGAATTTAGGAGGCATCGGGGTTCTCATACTGGTTA TGCTAATTATCAGGAGCTCTTCAACCACCGACACACACTTGCTCGAAAAC CACATTGAAAGAGGAATAGGTGTTTTGAAGAAGAGGTTCCCTATTTTGAA AGTGGGAAATCATTATCCCATAGGATCCCAAAATAAGATTCATGATGCAT GTGTTGCATTCCACAACATAATTAGAGGCCAAAATGGCGATGAGGCATGG TTGGATCACCAACCTGCACTTATTCCACCATCGGCCTATGTTGATGTTCC AGATGGAGATGATGCCCACCACCAAGATCAAGTTGAGTCAAACAATGGAA ATGCTCTTAGAGATCATATTGCGCTTCAGATGTGGAATGATTATATCAAC TAATTGGACATGATTATTTTTGTAATTTCTATTTCTTGTTGAACCTTTGA TGTATTGGTACTATGGAGTAACTTATTATTTATTTATCCGAGACCATTAT TGTTCTTATTTATTTATCTGAGACAATTATTGTTCTTATTTATTTACCCG AGACCATCATTGTTCTTTGAATATTGTAGCTATGTCAAAAGAAATATCAC GGGCATCTTGGGGTCATTCATATGAGAGAGGTCTTGTAGATATACTAGTC GAGCATAATGTTCCTATATATAGAGGTCAAAATGGGTGGGTGGCTGAAGG TTGGATAAGCATAACAACTAAATTCAATCAAAAGTTTCCATGTGCTAAGC ATACAAAGCAACAACTCCAAGAGAAAGAAAAGGATATGAAAGGAAACTAC AAGACTGTTCAACAAGCAAGAAACTTAAGTGGAACAGGTTGAGATGATTC CCTTAGTATGATCATTGTTGAACCTAAAATCTGGGAGAGGATTAAAAAGG TAAACATCGTGCTTTCCGATGTAGGTGTTGTTTTTGCAAGATATTGATGC TAATCGTACGTGTATTAAATAGGATTATCCTAGGGTGAGGAAATTTGAAG CAAAGCCATTTATGCTCTTCCCAAAATTGGCCTCACTATATGAAGGTATG CTTCATATCTTCTTTTCCGTTTTGAAGCAAATCCATTAGCTTGTATGAAT CCCAAGTAATATGTTGCTTTATTTTTCATTTTGAGCAGGAAGTATTGCTA CTAGAGATCTGAACTTTCTATCAATTCCTCAAGTGGACATTACAAGTGGA GTTGTTTCTCCCACATAATCATCTGCCAATCAATATGGTAACCCCTTTTC TACCGCTCATGATGGTGGTCAGTCCTCTACGAATCTGCATGGCCAAGGGC GACATGATGTTGAACCTTCAATAAGTGCTAGTTCTGAACAAAAGGGAGAA GAACCTGTGAGAAAAAGGAAGCAAAGTCAGATTTCTGTAGTGCTTGAAGA CTATGTGGATTTCTAAAAGAAGCAAAGTCAGCAATTTGTCAAAGAGATGA AGGAACCAAAGCAAGCAAATCAGTTCTCGATTGCCAACTGTGTAGCTGCA CTAGAACCCATGGGAGATCTAACTGTTGTAGAGAAATCTAAGGCACTGCG GCTTTTCAAATGCCAGCTGAATCGAGAAATTTTCCTCAACACCAAAGACC CAATTCTTCGAATCTTTTGGTTGAAAGAAGAAATTGCTGCCATAGAGAGA ACATAAGGTAGGTAATGTAGAACTATAGCTTCTATACTTGCTTGCACAAT GAACTGCACTTCTTTAAATACCATGAGTTTTCGTCAGTTTATGTTATGTT ATTATGCTGTTCTTCTACACCGCTAGCTGCATCTAGGTGGCATGCTACAT ACTGGAAGTATCTCAGTTGTAGTATTGCAGTTGTTCAAGAAGTTATAATA ATTGGCAAATGTACACGTAGTAATGTAGCTGTATCTTAGTTGTCCTCGTG CATATATGCCGTGTCACATAAAAAATAGTTTCAGCCTTTTGCCATGTTCT TGCATAATATAGCTTCAGCCTTCAGACCACATTATGAATTTTCAAATGGA CAAGAAGTAGACTAATCGTACTAGGGAATGAGGACTTGTCTCCAATACAT TTGTAGTTTATGTTTGGATCTAGTTGATCAAGGTCATTTTCAGGAAAAGA GATATACTTGAGATGCATCATATATACTAGCTAGATGGATTATGAGTATA AGGCAATTGTCTTAGAAATATTCTTTGTTTTAGTGCACATTGGAGATGAA CAATTCTAGGACTTCCCTGCTCATATTGGTTTGTTTGATACTAAATCTTG GATATGTTATTTAGCTAGGGAGTAATATATGATTCATAATTTTATATCTT GGCATCTACTAGCTTGTTGAACCAGAGTAGTAATCTTTTATTGTATGATA ATTTTCAGAGAAGAAAATTAAGTAATATTATTGTGGGTATGGCAGTGGCC AAGTTAGGTTTTAGTAAAAGAAACAGTACCCAACCATATCATCTTTAAAT ACCTAGATTTTTAGTCAGAATGTTATCATGTTGTTGTTGTACACTGGTAG CTGCATACAGGTGGCATGGTGCATACTGGAAGGATCTTAGTAGTAGTAAT GTAGTAGCGTGTTATGCACACTTGAGATTTTCCTATGCTACTTATGAAAT TTCTATCGTCGGGTGATTATTGCAATTGTTCAAGAACTAGTAATAATCAT GCTTAAAACAGACTTTACCTTGCTTATATTCAAATCCTTCTGCTCTGCAG GTTTTGTATAGAAAAGTCAATGAAATGTTCTTCATGGATGAGTCAAATAA TTTCTATGCTTTATCATGAAGCAAAATACTTGCTCTCCTGGATAGTTGAC CATAAGATTTCCATTTCTGAAACATTATTAGCACAACAAATTTCTCATTG TCGTGTGATTTGTAAAGCTTGGTGTGTAAGACTAATTGTATGCATCTTAT GATGTGTGTCAATATGTTGTTGTTATGTTAATTTTCTGTTTTAGTCAAAT TTATTGATATATTATATCCTTAAAATTTATGTTATATTCTCAATTCCTGG TTTCCTAAGTTTTTTAAATAAATATGATATACTTTAGGTTCTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.