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GrainGenes Sequence Report: AE039405

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Sequence
AE039405
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039405
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTTCAAGTACGCATTGCATCAGGGCGGTGCCTGCTGCTTACGAGCCAA
TGAGCTCGTGCTTCCTATACCAGTTTATTCTTACTGATTTTTCCCCACTG
CCATCGGCAGAGGTTGTGGTGTTGCTGCAACAAAATGGACTGGGTTGTGC
TTAGGAAGTTAGATGAAGTTTGCTTGCTTGCCTGCTTTCTTTCTTTGTTT
TCTTAATAATAATGTTATACTATGCATCGTGTTGTTGATGAAGTTCCGTA
ACCGAGTGTTATTCTGGTTGCAGCACTGAGCCGCATTTGTTCATCAGCGG
CCGATGATGGCGACAACATTGATGCCCATTTCGTGGACAAGATGAATTTC
GGTCAGACACCGTCACACCTGTCTGGGCAGACCGCACAGATGAATCCAGG
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CAGGGCAAACTGGCGCGGATCCCTTCAGGACGATGCGCCAAATCATGCTT
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TAGCGTTCATGCCATTCAACTGGCCGTGTCAACTCTTGAGCAGTCTGCCA
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GTTAGGCCCATCAAAACACGCATATCCTGTCAGTCACTGTTTCATGGGTA
CAAGTGAATACAAAATGTACAAATAACTGAAAGATGACAATCTTGTACCA
CCCAGCTAGAGAAACACCAGGATGATGATGGTGAAACTGTACACTGGGGC
ACAGTTCTCCAACGTACCACGACATTATGCAAAAGGCCAATGCAGTCCCA
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AAAGACAAGCTTTCTGCTTATTTTCTAAAAAAATATGAGGATTTATGGAG
AGGTGTACCTGAGGGTTTTTCACTGACATGTGCTAACGAGGCATTATAAT
ACCCTTCCTTTCTTCCCAGATGTGTAATTTGTTTTCTTGCATGTGCTAAG
AAAAGTACTTCTGCTTTCATTTCGTTTCTTAACAGTTCTGGCTTTACTAT
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CTGTGGGCAGGCTGATTACTCTGCGATGACGAAGGGACCAATGAATGGAG
TTTTCGCTCATGCTATGGAGATCATGAAGGCCGAAGGACGTCAACAACTG
AAGGGAAGGGTAGCATCTGGCTCCAGCTATGGCACAATGATTCCAACACC
TGGTATGACTCAAAGTGCAAATGTGAATTTTGTAGCGTCTGAATTGATGG
ACACCAGTTCCACAGGTGCTAACTCAACTACAGGTGCGAATAACTTTTCT
TGGCTTATATCTCTAGATGCTAGATGCTTCTTTTTGTTTGGCCGGTCCTT
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GTATAATGGGTATCAGAACCCGTCCGCCAATATCCTGCTAAATTCTACCA
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TGTTATCCAATGCAACACCTTGGTGGCCTTGCTGTTTCTACAGTACATCC
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ACAGGATCAAAAGCATGTATTAACCCATCTCCTTATGCTAGTTCGTGCAA
CAAACCGTTCAAAGAACAATTTAATGCTCCTCCGCCACTGAAGACACCAA
GTACGTCTGCTTTCCTTTTATAGATGAAAACCCTCTACTATACCATTCTT
TTTGATGATTTGTGCTTCGATACATAAGAAACTAATTGGTACTGACCATA
CTGAAACTTTGTTGCTTCAAGTTCTGCAAAAGGAATATGGCCTTGGAATC
TAATTCTTGATTTATCCATCTTGATTACATGACAAGAATGCATTTCAGAT
AAAGAAGGAAAAACCTTTGAAACTTTCTCCATTTATAGGGAGCAGAAGTA
AATTGTATGTTTACTTTTGTTCAATATAGATAAAAGACATGCTACATGTT
GTACAAGAAGATATATCCTTGTCACCATAATTTTGGTGGCGTTAAATCTA
AGAATGCAAGCACAGCTTTATTGTAGCAAACCTTGCTTTTACATGATACT
ACCTTGTTCTTACATGGTACTGTAGGACATAGTGTTTAAGTGTCGTCGAG
TCAGTGGCATGCAAATTAGTAAGGATTAGCTTTCTAAAACGTTGACCAAT
GGGGGAAGGGTCCCTCCCTTGGCTATACGTTGTTAGATAGATGAGACCTC
TCCAGCTGCGGATTAATACACACTAGATAACACCCCGTTTAATTCGGTCG
CACCTGTGACTCGAACCGGGGTGGGTGAGCTGACCACTGTGAGGTCAAGC
CACCAGATAATCCATCCTATGTATAAGGATTAGTGTTGAAGCATGCAAAG
TAATAGTGAATGAAGGGTCTTCTCTTAGTAAAAGTCATTTTTTGTCCTCC
CTTTGTTCTGTAGAGATTTATGTCTTCACAAAGTATATTTCTGCTGCCAA
TAGTATAAGTATCAACTAATAATACTTGTGATATTTGTTGTTTTTGAAAC
TACCCATATAGCAAAGTTATATGTTTTGACGAATTATATTGACAATACAT
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TTTAGGCTTGTCTATATTTGTAGGTGTGTAAAATTTAAGAGACTTGTAAC
TTCTATCTGCTAAACTATTTTCTATAGCACTGCACTGGGCTTATCTTGTT
ACTAATCGTTTGAGGCGGTATTGCTTATTTTGATAATAGACTTCATATGT
GTCCAATATGGTTGACCGTGAGGCTTTTACTGTCATAAGTCGATATCAAT
TATGTTGGATCTGATTTATTCAAATAGCAAAGTAATAGTCACTAGAGGCG
TTTGGCACTGCAAAACTTTTCTTCTACAGCATATGGCTGTTTCTAGAATA
GGAACTGATTCATCCACCCCAACAGGTACAAGTAACCATCATGTGAAAAC
CGAAGTCTTGAATCCGCAAGAGAAGGTGAACTATAGTACATCACAAGCAT
TCCTGCAACTATATTGTAAATCTCAAGCAACAGAAAAGACACATTTGACT
AATGGTTTTTAATTGAAAAGCAGGGTCAAAATTTTATTTGTCAGAGAAAG
ATGGTTCAAGATAGAGGACATCAGCCAGTTTCATCCGATTGGCGCATTGT
TGGGTGTTCGGTGACTTCAGTTGACTCTAAGTTGTCAAATCACCCAAGAA
AAGAAGATAAACATGGCTCAGGAAACATAAGTGATGAATATAATCAGCTG
CGGTGGTTACTGATGTTAAACCATGCAGAATGTTGTGAAGCTCCTACAGG
AAGTTGTAAATCTCAGTATTGTGTTCGTGTACAGGAGATTGTGAAGCATC
TTAGACGCTGTCAAACAGAAAATTGTTCATATCAGTACTGCATGCAGTCA
AAGAAGTTGTCTTGTCACTATAAGAACTGCATTAATGAGCAGTGTACTCT
TTGCAGCAAGGTAAAGACAAGATTGCACCGCTCTTCTGAACAGGCACGCA
AGAGCAGTCTGGATGACCATAGATTAATTACTAAGGACAGTACGGTTCAA
AGAATTACCAAGGATGCACTTGATGGTAAAATGGATATCGACCTTGTCAT
AGATGAAACCAGCGATGAGCAACCATTGGCACCGAAACGTTTAAAGTTGC
ATCATGTGTCTTCCAATGCATCAAAGAATGGAAATGGAGTCCCTCATGTC
TCTGTTCAAGAACCAAAGCCAGTGTTGCAGGAGCAAAAAAACAACATGCT
GCTGAAACAGGAGGCTGATGTGAGGGTTGATACGCAACATCCAATAAATC
CTATTGGTTATGGTACTGATGGAAAAGTAAGTGTTGTGAAAAATAACATG
ATTCCTCATGTTAAGGAAGAAAATGTATTGGCTGACAAAGATAGAAATGA
GAATGTTCTTGATCTTAAGAACAAAACAAACGGTCATACGGATGTTACAG
TGTCTAAATCAGGGAAACCAAAGATAAAAGGTGTTTCACTCTTGGAATTG
TTCACTCCAGAACAAATTAAAGAGCACACCGACAGTCTAAAGCTATGGGT
TGGTCAGGTATGCTTTTTGAACTTGAAAACATCTCCAGTATTCTCTAGTA
TCTTTTTGCAGAGTTGCTAGGCACAGTTAGGTGGATCTAAGGGAGTGTCA
AATGAATTAAGAAAACCCAAATGGATATGGTCAAATTTCTTCTCCATTGT
TTCCTATGTTAAATATGTTAACATTTTGAAGTAACTTACTCTCTTATTGG
TTAATTGTGTTTCTAGCAAATTGTTACAAAAATTTAGATTAATTCTGTAT
ATAGAGTGGGATAGGGATTTTTTTTCGAGAAAATGCAAAGGACCTTTGCG
GTTCATTGCATTGAAAAGATGTTTGTGTCCACAATCCTCCTAGGAGGCAA
CTCAAACAAAAAGTGAAAAATACAGGCTATATGTTTTGGATGGTTGGATG
TTCATCAGAATTCCAAAGGCTAAGAAAGGCGACTATATCTTCGAATTATT
ATCAGGAAAGAACTTAGGATCAGACATTTCCCTGTCCTGTTGATCTTTTT
ACATATCCCTGTCATTGCCGGGTCCATGTGGTCAGCACCAGAGTTTAAGA
AAAAACTGGCTTCAGAAAATTTCACTCAGTCAGTCAGTCATGAATGCTAT
ATGTTTTGGATCAGGCAGTTTCAAAAAAAAATGTAGAAAAACAATATTAA
ATGTGAATACATGAACTTGTGAGATAAACAATATATTTTTAGTACATGAT
GCATGACTATGGGAGGGCTGTACTTGCAACATCACAAATGAAAACTTTTA
GATGCACGCATATGAAATATCAAAAAAATGGAAAGACAAAGTACCAATGT
CCACTACTTTTATGCAATATTTACATTTATCAACAGTAAAGATTTGTAAA
AATGTATGCATTTACTGTGGGCAAATTGCAAGTTTGTTAGAATTTCTTCT
TGTAAGCATGTCATTTTTTATAAACATGATTCAATATCCTTTTACTTCAT
AATTTCAGCTCAGTAAACATATGGATCGATAGTTTCATTGGTTTTAATAA
TGTTGGTATTTTTTTGTTCTGCAGTAACTAGCTGATTTCTGCTGCTTTCT
GTTTCTTACCTTGATCAATGTTCTACCACTGCTGGAATTTTTAACCCCTG
AAATTTCACATCTTTTGCTTTTTTTTTGAATAGGTAGACTTCTTAAAATA
ATGCTTTACTGCTATTACAATTGTACATAATGTAAACATATCCTACAGTT
AAATGCTTGTGGGACTATAAAGTATAAACTATTTTGTCTGTTCCATTGTT
TGGCAGAGCAAAGCTAAAGTTGGAATGAATCAAGCATTGGAACATTCTGA
CAATGAGGGCTCATGCCAGCTTTGCAAAGTAGTGAAGCTTAATTTTGAAC
CTCCACCGATATATTGTTCTCCCTGTGGTGCTCGAATAAAACGAAATGCA
CCATACTACACTGCTCCTTCAACTGAGACCTCTCACAATTTCTGTCATTT
CTGTTATAACGAGCCTCGCAGTCAAACAATTCAGGTGGAAGGTAATCACT
TTTCCAAGGCAAAACTTGTGAAGAAGAGAAATGATGATGAAACAGAAGAA
GGGGTAAGCTTTCCCTTTTGGTAGGCCGTGAATTATAGTTGCACTCTTTT
CTTGCATACTAACTTATTGTAATTGATTGGGCCTACAGTGGGTTATGTGT
GACAAATGTGAACGCTGGCAGCACCAGATTTGTGCCCTTTTCAATGCCAA
AAGGGATGATACAGGCGAAGCAGAATATACATGCCCCAAGTGCTATGTTT
GGGAGATAGAGCATGGTTTGCGTGTGCCTTTGCCGCAAAGTGCTGTTCTT
GGCGCTAAGGATCTGCCAAAGACTGTGCTTAGCGATCATATAGAAGGACG
CCTTTTTAAACGGCTCAGGGAAGAGAGACAGGAACGTGCGAATCGTGCTG
GGAAAAGCTTTGACGAGGTTAGTGCTAGTTCGGAACTCACCAACATAAAT
TATGCTTGAGTTGTGTGTATGTGTGCACCCTTGTTTATCTAGCTGATCTG
GATTTCTGTAATGAGGATCATCAGTATTGTAGTGTAGTGAAGATTGAGAT
GCTATGAGGCAGCTGAGAAAAATCTTATTTGAGGTTGGACTTGTTTTGGA
AAGTGCCTTCATGCCAAATGCTAGCTATGTTAGTTACCTGTCCTCATTAG
GTCAATATCAAAAAAGGCGGCTACAAAAAAGGCGGTGGCATGGTTAAAAG
CCAATTTGTATTACCATAGTTAGAAGTCTACAAAAAAGCGGCGGCATGTG
TAATCCTATTATCTTGGTTAAAGCCTATAAAAATTTGGCCCCACTTCTAC
TTTGTGACCAAGTTATAGCAGTAGAGGACTTCAAAGACAAATAAGGGATT
GACTTCCCTAAGCTTCTTTTGTACGTGCCTACGTGGTCCTCATGAGGTTA
ATCTCGAAATCTCCATGTTGAAGTTAGCTTCTTCTGTATATGGTTCTGCA
CTGTCTTAATATGCTGGTCTCTTCTTGGAACTTTCTGCTAATAAAGGAGT
CAGAAAAGTAAGTTTGCATAGCAGCCATGACAGCTTAGCTGACTACGTTT
TACCTTGTACTGTTATTATATAGCCTATGATCTGAACTCGACCATTGTGG
TACATGTCCCCCTTTTTCCCTCTGTAATATGTGCTGCTGATGCTCAAGTG
TCTTAGTTAAACTGATAAGATGACCCCTCACATCGAAGCAAGCGTAGTGG
ACATAACCTCGTGATACGGTTTTGCTATGTTATGTGTTGTCAGCACTTAC
TCAAGTAAATTGCTGGGATTTTTTCATGTACTACAGTATAAGTATATACC
ACTATTATATTCACCAATCTATCCACCTTTCCAAGTTTCCCTCAATAGAT
ACTTCTTTGTTGGGTGACTTTCTCCTAATGTTTTCTCACTTGCTAGGTTT
CTGGAGCAGACGGACTTGTGGTCAGAGTTGTTTCATCAGTGGACAAAAAA
TTGGAAGTTAAACCACGGTTTTATGAGATTTTTCAAGAAGACAAGTATCC
AGCAGAATTCCCTTACAAATCCAAGGTAAGAGAACACCTCCTGACAATTG
AAGTATAAAATCAGTTGATGCTGTTGGCATTTGGCAATTCAAGTTACTAT
TTTTCTGAGATGAAAGTTTTGTTAAGTCATCCTCTGTAATATTGCCAAAT
ATTCGGCAGGCTATTCTCTTATTTCAGAAAATAGAAGGTGTTGAAGTATG
CCTATTTGGCATGTATGTTCAAGAATATGGTGCAGATTGTGCAGACCCAA
ACCAACGCCGGGTTTATCTGTCGTACCTTGATTCTGTCAAATTCTTTAGA
CCTGAAGTAAAAACAGTGTCTGGGGAGGCCTTGAGGACATATGTCTATCA
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TAGAAAGTTTAGTATGCCAAGCAAGGTTAATGGTTTCCTGAATCCAGTAT
TTACTCAAACTTTAGTTCAGTATTTTCAAATATTTGGTGCTGTCAGTGTA
ATATTGGTTTATACGCATGCAGATAGGTTATCTTGAGTATTGTAAGCAGC
GCGGATTCACTAGCTGTTACATATGGGCTTGCCCACCTTTGAAGGGTGAA
GATTACATTCTATATTGCCATCCAGAGATTCAGAAGACACCAAGGTCTGA
TTTGCTGCGCGAATGGTAAGATCATCGATGAGAATTTGTACTAATATGCT
TCTTAAATGAACACCTTACCGTAGGCGGCATCTGTAATTATGTGTCATGT
GACTAAGAATTCTCTCACAGGTACTTATCTATGCTTCGAAAAGCTACCAA
GGAGCGTATTGTTGTTGAGACGACAAATCTCTATGATCACTTTTTTATCA
CTACTAAAGAATGCAAGGCTAAAGTTACAGCAGCTCGCTTGCCATATTTC
GATGGAGATTATTGGCCAGGAACTGCAGAAGATATGATCAACCAATTTTT
CGTAGAAGAAGGTGATAGAAAGTTGCAAAAGAAGGGGAAAGTAAAGAAGA
CTATCACAAAGAGAGCTCTTAGAGCTGCTGGCCAGACTGATCTATGTGGG
AATGCTTCAAAGGATGCTATATTGATGCAAAAGGTTTAGTTTCATATAGT
GCTCTACTTTTTGATGCCCCAAATTTGTATCAGTTGTGTCACATGTTATT
CTTAGCCTCCAAGTTGATGATGTGCAGCTCGGAGAAACCATTTACCCAAT
GAAGGAAGATTTCATCATGGTCCATTTGCAGCATTCTTGCAGTCACTGCT
CTACTCTTATGGTAGCTGGAAAACGCTGGGTCTGCCACCAATGCAAAAGT
TTTTATATTTGTGACAGGTAAGTAACTTCTATTCATCTCATGTGTTACTT
TCCTGTGGTAGACCCAATATATGATACATAAGTTCGATAGATGTGCATGA
CTATGGGCGAGTGTTTCTATGCATGCTGCAACTTGAGAGCATCAGCCAAC
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TAGTCTTTATACAACTTCATAAGTGGATAAACTGCACTAAGATCTTACAG
CTAGTCTAATACTAGATGTTAGTCTGTTACCCTTGCTTCTGCAACATGAT
GAGTTTCTTGCTGCAGTTGTTATGATGTGGAGCAACAGCTTGAAGGAAAG
GAGAGGCACCCGAGTAATAGTAGAGACTCACATGTGCTCCACCCAGTAAG
TTCTGGATAACTTCTTATAATCTAGTTTTTAACTCATAAAAAATAATGAA
GCAACAAAGCAAGTTATCACAGAACTTTTTAACATAATTTTATTTCTTAG
GTTGACATTGTTGGGGTGCCCAAAGATACAAAGGATAGTGACGATATCAT
AGAGTGTGAGTTTTTCGACACCCGGCAGGCATTCCTCAGTCTTTGTCAAG
GAAATCGCTATCAACATGACACACTTCGCCGCGCAAAGCATTCCTCAATG
ATGATGTTATACCACCTTCATAATCCAACTGCACCAGCTTTTGTCATCTC
GTGTAATATCTGCAAACTCGACATTGAAACTGGTCAAGGGTGGCGGTGTG
AAGAATGCACAGACTTTGATGTATGCGGTGCATGTTACGAAAAAGATGGA
GGTGCCAACCACCGTCACAAGTTAACAAATCATCCATCATCTGCAGACCG
TAATGCTCAAAGTAAAGAAGCTCGGCAGATGCGTGTTCAGCAGGTGATTT
ATACCCTGAATCATAAATGCCGGAAAAATCATTCTTTTATGCTGCTGTTT
TAGTTTGTTGAGCGAACACTTGATGCCTCTTTATTTCTGCACTGTTAAGT
CTAAATGCCAGTACTTGTGCACTTATTTTGCTGAAAACCACATCTGTCCA
CTTATTGTGCTATTGTCGTGCATACCATAGGTTTATAGTTTCTGCATAAC
TGAGCTATGTCTATGAACTTTGTGCTATCTGCTTTCTAGATTAGTCCATG
AAGGAATGGGTCTTAAACTAAGTGATGATGTTTCTTTGGTGGCTGTGCAG
GCACGGGAAATGCTTGCCCTTTTGGTCCATGCGCATGCATGCCGTGACGC
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CGAGAAAGTGCACAAAACGGGCATCCGGAGGCTGCAAAGTGTGTCTGAAG
ATGTGGGCTCTGCTTCATTTCCATGCCCGCGCTTGCAAAGAGTCAAAGTG
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CCCTTGTACCCACATCGTTAAGAACGGTTAGATGATTTATCGGGCTTGCT
TGCTTGCTTGATTACAGGGATCTGAAAGACATTATAAGGAGATCGCAGCA
GCAGGCGGAAACCAGGAGGAGGGCCGCCGTGAACGAGATGATGAGGGAAA
GAGCCGCAGAAGCTGCTAGGCCTTCTAGGAGGTAGTGCATTCAGGCATCA
TACTGGTATACTTTTTTACAGGAAAAGATAGCAAGTACATATGTACACCG
CAGCTCTTCTCGAGCCCAAACAGACAAGTTCAGGATGGGCAGATTGAGAG
GATGCCCAAGCATACTACAGCGAAAAATCAGTTATACCGGAGTTGAAATG
TCTTGGTCAGAGACGGTGGTTCTGACGAGGCTTCGACGACTCTGTCTGGG
GCTTATACTGTATGTTAGTGTTGGTCTTGTTCTGTAGCCTGTTTATGTAC
AATTAGGATTTTGGAGAGCTCCTATACATGTGCGAAAGAAGCGCATTCAG
TCGTTCAGAGGTGGAGAATGTGTCATAGTTGATGTTTTTTTTGTTGCTGC
TGTTGTCTCCTCTAAGAGAGGGCCGTAGGAAAGAAACAGAACGTGGATGG
TTTCATTTGTTCTTTCCAGTCCCCACATTTTTGCAATGTCTGTGTGGGAT
GGATGTTCAGTTATACAAAGATATATATATCTATACCAGAGAATGACTTA
GTAGATTCTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.