Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE006247

[Submit comment/correction]

Sequence	AE006247
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE006247
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTTCCCCTCCCCTCCCGCAGCTGCCCTGTACAAGGCTTTCACCACCGGA GCTGGCCGTCACCCTCCTGCCCCAGTCCTCCTGGTAGCACCTCCTCGCCT GGCAGTGGCCAATTTCTGGTCCAGCCGGCCACTGTAGCGAGGCAACAGAG TCTAGCTCGTGTAGAGGAAAGGCTGTTCCAAGCATCGGCATCAAAGATGA GCGACGACGTGATATGGCACTGCATCCGCCACAACCACTGCAGCTTCATG ACAAAGTACAGCTACAGTAGCCTTCTTGTTTCTTGCCTCAGTTTCATTTT GGTTTTCTCTCTGATGATAAGTTGGTTGCTATGCTGGTGTGCGTAGGATT ACGACAGGGGTATTTTGCCGGAATCCATACAACGCCACGGGCATATGCAA CCGGAGCTCCTGCCCGCTCGCCAACAGCCGATATGCCACTATCCGGGACC ACGATGGTGATTACCACACACATCTCTCATCTCTTTTAAATTACGGATTT TGATTAAGCTGCTTTTTATGGAGTTGGACTGAGAATTCGGTTATTTGTTA AAGCCATGGTCTTTAGTTTTATGTGGATGTGCTATAGAACGTTATAATTT GTGTTACATACTAAGACTAGAACTCACCACCAGTTGCTGTAGGATCCATG GATGGTATACAGTCTGTTGATTTGTTCAGTTAGTCTAGAAAAGTTCACGT CAACTTCGAGGCCCAAATAAAGTTATGTGAGCTCAGTGGTTACGCGTTAG AGTATTTTTCTACACCAGCATTAATCATGTATAGTGATGTTATTGTATCT ACCACCATTTAACTCAGCTCAAAGCCATATGTCACACTCCCTCCCCCATG CCTTCATGCCATCCAACTCAGTACACTTTTGGAATGGCAGTCAATTGCAA TTCCTATGGGTGAATATGAAGTATTGTTATCATCTTTTCCTTGTTCTACA AAGCTTGACGCGAAGAACAATTTATAGTCCACTTAAAATTAAAGTGCTGC TCTGCCGCAAGCTCGTATGTCTGAGTACGAAATATCATTATCATCTTTTC CTTGTTCTACAAAGCTTGACACCAAGAACAATTTATAGTCCACTTAAAAT TAAAGTGCTCCTCTACCACAAGCTAATGAAGAAGAATATATTACAACTGT GTGTGTTGTAGCTGAAAAACATAGTAGAGCGCTACCAAAAAACGAATGTG TTTGTGAGACGACCCTGTATCATAATACATTTTGGGGGACTCAATAATAT ATTTCTGTTTCTCTCTTCCATCACAGTTTTCCAGCACGAGCTCTGTCCAT TACTTTCGTTTTGCACAACAGTAACATCGTAAATTCAGTTATATCCTGTT AGGACGACAAGCAATTGTTCGATGTGTCACTTAACTGGTGGAATAAGGTG TGAAACCGAAGCAAGAGTTATATGATGCTGAACAGTAAAACCGATAGATT AAGGAAGTAATTGATGCACGATTCAGAAAACAAGTTTCTCGGAATACTAA TTTCTACTAAGCTAGATTGAAGCAAAGCTACCTCCCATGCATGCTACCTG CATGATGTCGAAGCAGTACTGTTCTACATGTAATAGTCGCTGTGGTCAGC AGGGGCTAGAGTGGCTTAAATTGTTGTTTGCTTCAGCCATTGCTTTAATT TTGTGGTCTTTGTGCTTTAGTTGGTGTGCTTGTAGTTCTGTTTGGAAGGG AAGCTGTGCTTTCGTAGATCGTGTTCGGTTCATCAATTTCAGACCGTAAT CTGATTACACTGTAGTTTGAATCTTCAGAAGTTTCGTTCACGTGGACTGT AATTGGGTCCCATGTAATCCAGTTATATCATTATAGCTAAATGCCCATGC GTTGCCACGGAATAAAACATTTTCTAGAGAAATTAATTTATTGAGCCAAG ATTTATTCCCGGAACCATGCACATTAAATCCATGTTGCTTGTAGTGCTCA ATATAAACAACTTAACTGCTCTCTCTCTACAATTTTTTTTTTACTTAATA TATACTCCTATTGACGGCATATCGTAATAGGATTATTGAACTATTTTCTA TAATGCTTTACAATAGAAATCAGGGCAAGCTTATACTATACATCAACTCA TGTTTGTAACAAAAAGTAGCAGCCGGGTAAAGTCTCTTACTGCCCAAAAC AAAGAAACAGAGAAATAATTAGCAATCAAGTACTCCCTCCTCAAAATAAA TGTCGGAGATTTTTCAAAATTTAGATTCATCTAAATTTTGTTAAACATGG AACATCTATTTTAAGACGGAGGGAGTGGAATCAATATATAGCAGATAAAA TATCTTCTAAATTCAGTTTTCAGCATCTTTTTACATGCTGACATTTTGAT TGTTGTTCAGAGTTTTGTTTTGTAAGTATCAGGGCAAGTAAAGAACATGG ATCAAAAGCTAGCAAAATAATGCAAGAAAACGGAAGCATGTGATTTAATA TTTTATTAAAAAGGTAGAGGATACTCTTCCTTACACTTTTAAGGTTCTTC TAACGGACTATACAACAGGTTGTGTCGGTAAAAAATCGGGAAAAGGAGGA CAAAAAAGGAATAGAAACAACTAAAAAGAAGCGCAGCTTACTGACCCACT GATGAATGGCCTCACTATGCTTGGGCGATCTGACCGAGCAAAGCTGTAGC TCTATGCACAACTTCTGAACATCTGAATGCCGTAGTATAGTAGAAGTGAC TCAAACATGTATGTAGTTTATCCAAAGAAACACCATTCGGTTCTAATGCA ATTTAGTACGTCCACTACAATTTTACTTACTTTCAGGTACTCCCTCCGAC CCATATTAGTTGACTTGAATTTATCTAGATTCGGATGTATCTAGTACTAA AACATGTCTAGATACATCCGAATCTAGACAAATTCGAGTCAACTAATATG GGTCGGAGGGAGTAGTAACAATTAAAGTCCACTTTACATTAAAATCATTA TAGTTTTCTCAGAGAAAAACATGGAACCTCAAGATAACCTGGTCCAAGTA ACAACCACAAAACAAGTCTTAAGATAACACCAAATCTAACCCCATTTCGC AGAGATAAAATTCCTCTGACCAAAAAGGAGATTCTTGGATCTGTATATGA ATGGCCGCCGTAAACTCCAACTCCCAACTCACCATCTATCAACAGGACGT GAGCTTTCATATAACAAAAGCCAAGACGCACACAAAGCTAGTTTTCCAGA TTACACAAAGCCATGTGCTGATGTGCACATGGTCACGAATTGCGTAAGCC ACAGGGAGGCGTAGTGCTACCTCAAAGGGGTTGCCAGAGTTGCCTGGGGG TGGCTATATGACGACCAGTCCGTGTTAGAACAGTCGAACTTGCACCCGTC CATGGACAGAACCAGAGTGGAAATGAGAAGCCAGCCGAGACAGACCGCCG CCTCTTAGAGGATGGTGACGGAGTGGGACGGCGCGATCTGCTTGAGATGC TTCAGATCGAGAATGAACACTGCAGATGCGGGAGGCCGCACACGGCGGGA TAAAAGAAGCAGCAAGATGGGGAGCGGTGTTCACGTGCGGTGTCAACTGA CCTTGGCCGAAGGATGAGCAAAATGGGGAGCGGTGGTTCACGTGCGGAAG GATGAGGAGGACGAACGGGCGGCGCCGGTGCTCGGGAGAGGATGGTCGGG GGGATTGGGATGGGATTGCTCGGGAGAGAACGGTCGCGGGGATTGGGATA GGATTGCCCGGCAGCGCTGGTGCTTGGGAGAGGACGGAGGATGGTCGCGG GGAGCCGGGGAAGGAGATGGAAAGGAACGGAGCCGAACCCCATGGCGCCA CATGCATCGAGCTCACCGGAGCGGCGCGGCCCCTCACTTCCCCTCCGCCC GACGTGATGGCTACGATGGCGGGGCCGAGATGATAAGGTCGGGCCGCGAG TAGAGAGAAGAGTACTTAGCAGTGCTTTGACTTGGCGGTGGCAGCCTTTG TAATAAGTTTGAAGTATCAAGGGCAAAATCGACAAAAGACGGCGGACGGA AAATTCTGCTGGTGACGAACCTACCTCTAGGTAAATTATAGTATAGATTC ATGGCCAATGCAGCCCAACCCCCCACTTTAATCTGAAACCGACAAACCGT ACCAGACCTACCAAGTGAGCCGCTTGCTCTCGACTTCTCTTGTGCATGCA ACAGATCCCCTTTTCCATCCTCTGCCCCATGCATCTTGATAGCCTCACTC TTCCACACCAGCGAGATCCATGGCATCTTGTTCGCATCACAACCAGATAA GCCACGGTCAGGACCACAAGGAAACTGCTTCCCTCACCATGACCATGGAA GCACGACTTGCCGTGGCCGGCAGCAGCGGAAGTTTCTCCGCTGCCAGTGG ATCGGCCGGTGAGGTCCTGGTGGGTCCTGGGCCCAAGAACACCTGATGAG GTAGCTGGCCATATGGCTGGCGAGGAGGTGGATCTGTACGAGCAAAGGGC ATCCGATTTTGGGCAATATATTGATTTAATTTCTTTGACATCTGTGTTGG ATTAGGATGCATTGCTTGCAATGTTCAAGGTGACGCAGAGTTGCTGTTCA AATTATGGTCTGATCCAAACACTGTACTGTATACGATTACTGTTACTAAA ACAAAGTCGAGTTCTTCTCATTCCGTTTCCATTACCAGTGTATTCTGATT TCCTTACTGTTAGCATTACAGTTTTTGTACCAAACACCTTGCTAGTGATA CAACCGTACTTTCTTTCGGTCATGCAGGTATTTTCTATTTATATATGAAA ACTGCTGAAAGAGCTCATCTGCCAAACAAATTATGGGAGAGAGTCAAACT ACCCAGGAATTATGAGAAAGCAATGGAAGTCATCAACAAGCATCTCGTAT GCATTTTTTGCTCCTGGGCTCTTTACACTCCAGGCTCCAGCTGAATGTGA GTCTAGTTAGTCTTATCGCATCCCTTTTGTTTCATCATGTAGGAGTTTTG GCCCAAGCTACTTGTGCACAAGATCAAGCAGCGCCTGACAAAAATGACTC AGTATCGCATAAGGATGAGGAAACTTCAACTTAAAGTGAGGTAAGGACTT CTTGTGTTAGTAGTTTCGTAAAAATTATCTGTTCTTGACTTTCGTGTGTC ACCTGATAGTAGGAAACTGTGATACTCCCTCCGATCCAAATTAATTGGAT GGGGGGGATATTAAATTTTATGCAACATTTCTTTTAATTTTGCTCCATAA ATGATCGATGTAAGATAGCATGCTCCCTCTGTCTAAACCTGAGAATGGTT TGAGATCTAAACCATACCTCAACCAAACCCATGCGATCAAAGTTGGCATC CAAACCAAAACCAAACCCATCTGATATGTACCTCGACCCAACCAAAACCA GACCTCATGTATTTTTCACCCGAACTGAACTTAACTGTGGACTGGAACCA TTATGGGAAATGGGTTTAGAACTGTTTGATCAAATGGGTTGAATAGCCGA CGTACGGTTACCACCACCGCATGCAAAAGCATGCACACCACGGACCACCA CCGCATGCAAAAGCATGCACACCACGGACCACCACCGCATGCAAAAGCAT GCACACCACGGACCACCACCGCATGCAAAAGCATGCACATCACAGACAGG AAGCTAGCTAGCTACAGGGTGATGCCTTCGATCGAGACAGGGAGCAGTGG GAGGTCAGGAGGTAAAATCGTGTCTGGCACGCCTAGGGTCATGTCTGGTG CGCCGCTGGGAGTCATGTCTGGTGCGCCGCTGGGAGTCCTCCGACGCGGG GTTGAGTCTGGCACGCCGTCGGGAGTCCTCCGACGCCGGGAGTCATGTCT GGCATGCAGCCGGGAGTTGTGTCCGGCACGCCGTCGGGAATCCACCAACG CCGGTCGTGTCTGGCACGCTGCTGGGAGTCCTCCGACATCGGGATTCATG TCTGGCATGCCATCGGGAGTCGTGCCCGACATGCCGTCGGGAGTCCTCCG ACGGTGGGTCGTGTCTGGCACGCCGCCAGGAGCCATGTCTGGCATGCCGC GGGAGTTCTCTGACGCCGGGAGTCATGTCTGGCATGCCGCCTGGAGTCCT CCGAATCCAGGTCGTGTCCGACATGTATTGTTATTTTTCTCATGAGCATG GATTCCATGTATGACTGTACGGGCGGACTGCTGTGTGCGAGGCACAATGC ATGTCGTTGGCTGCCACACAGGCAAATAATGCGCTCTCGAGGTAGCTTAG CATGGAGGCCGGCGAGTCAGAGTGCGCCGACTAGTTATCTATGCGTTTCA TATGAGACCAGCATGGATGTCTACACCATCCTCTTCAGGCTGTGGGCAGA CACGGGAAATCAAGCCAGCCGCTCGAGGCCGATCTGGAGCAGGGCGCGGT GCCGTGGGGCTCCTGCTGTGTGCGAACATGCCCCAGCACCGGCACCTGTT CCTTTTTTTACCACACTGGCACATATTCCTGATGGCCAGCTTCTCCTCCT CAATGCAGGAAATCTCTCTCCGACGAGTAGAGTTGCTTCTTCTCCTTCCC GATGCAGGAAATAGGACGTCTCCTCACGAGCTCACCGTTCCGAGCCAAGG AACCAATCTACAGAACCGGTTTAGGACATTAGTTATTAACTATTATGAAC CAAATCGTTTAGGCCCAGACCCAACCGTACCTAACTCTTTCCACCGTAGA ACCAAACCAAACCCAACCGTTAACTAGCTTGGCCCATATCAACCTGAACC AATCAAACCCAGTACAGAAAACTAAACCATTTGACCTGGTTATTGTGAAA CCATTTCCAGATTTACCCGTGTCCCGGTTTAGAGGGCCTAATCTGAAAAA ACATCTGTCCCACATTACCTCTCCTCTAAGGCCCGCATGCATTTAATTAG GACTAGTAACCCCCTCTAATTACTCTCTATTTCTCATTTCTTCTTTCTTT TAGCAAGCTGGAAACAACCTCATGCATGCGCGGTTGGGGCTCTCCCGTTT GCATGCAGTCCGTTCATGCCCCTAATTAAATGTGGGAAGTTAAGCAACGG CAGCTGATTGGAGTAGAGGTAAATCTAACCAGCGATTTGCAGTCCAATAG TCTTTTGCCTTGGTCTCGCCGCAAATCCTAGTGAGACCTCTAAGACTAGT CACAGTGGAGAGTATCATATACTATCTCCATTCCAAAGCTTAAGGCTTAT ATTTTTTTTCAAACGTCAAACTATGTAAAGTTTGACCAAGTTTTTAGAAA AAATATTAATATTTACAATATGAAATCCATGCCCTTTGATACATCAAGAA ACATATTTTCACATGGTATCTATATACTATCATAGTTCTTGATAGTTTTT TCTAAAAGTTTGGTTAAACTTTCCGCGGCTTGACTTAAAAAAAAAAGCCT TAAGCTTTGGAATGGAGGGAGTAGTAGTATCATGTATATGATACCATATT CACAATGCATAATATCATGTAGCAGTATCATAGTCTTAGTGTATTTATTC TTTGTAGAATCTCAATGTAAAATTGTGTACAAGATTAATTTGGGATTAGT TTTTCTAGTTCTACGTGCTATAATACCGTATCTACCTATGATACCAACAC AATCTATTTCATCATTAATTGCAGTGACACATAAGCATTTTGCATGCATG TGATGCATGATACCACCTATGATACCCCCATTGGGGCTAGTCTAAACCAG GACGGAGGGAGTAGTAATTATTTCATGTTAAATTTTATGTGGTTTGGCAT TCTTCCATTTGCTTTCTCACTTGATATGCGAAAACAGTAGAAAAAACTTT TGAGAGCGTAACGGGGGACATATAATACGATCATCAGCATTGATTATGTG ACGAGGCTGGTTAAGCATGCTAAATCTGTCATTTAGGGGACACTGTTTCC TGCTCTGGCAACTAGCCCATATCCAAGGATCTCTTTAGTGCTCCATCATG GGAATCTAGCCTAATCCAATGCTACCTTGCCAAATCCTACAATACAGGAC AACATGTAGCCACCCTCTAATATCCCGCGCAGTCAATTGTGGGTGATTTT CCCCTCCCGTGATGATTGGCTGACCAGGCTTTTGACCCTGGAGGACGCGA TGGCCTAAATTGATGCAAACAGTCAATAAATTCTTGATTTGCTACTTCCC CTGTGATGATCTCAAGTTATTGTGAAGCATTTAATGGGACTTTTGCACAT GGGAGCAGCTTTGGACACCCCAGAAGATGACGAACACTCCACCACCTTGC CCATGAGCAGCAGCTTGTGCCCCGTCGCTGCATCCGAGCTTTACACTTGT GGGCTCTTAACAGCAGTGGTGAACATGCCCAGTGCTCCTTTTTTACACCT ATGCGATGATGCAGAGTGATGGTTTGAGCATTCAATGGTAGTTTTGATGT GTTGTAGCAGATCTCCCTACTGGCATGGGCCGTCTAGTCCAGTGGCCACA TACAGGCTATCCATGTTTAGATCGGTACGTGCTGTGTGGCTGCTCTGCTT GACAGCAACAACCATGACCACTGGCTATAAGCAGCAGAGTCGTCTAGGTT CCTATTACCCGAATAAGGCTCTACTCCCTCCTCTATTCACAAAGCTAAAA CATCTTATATTTTGAAACGGAGGGCAGACATCTTTGAACTGTATAATGTT TTTTTTTGCATGGCTATTGTTATAGCCATTACAGGCATGTGAGCTGCCCA TATGAAGACTAGTGACCTATGAAGTCAGAACATGCACTAACATGAGAGCA AACAAGAGAAGTGCCTATATAGCCTGTGTACGGAACGGAGACGACAACAC TGCTCGTGTTGTTGGCTTGTTGCTTATACGTTCTACAGTTCCAGTTGCCC ACTTCTAAGGTCCAGATGTCATATTTGGTTATGAGTTCTGCACTGCTTTC AGATTGCTTGAATTTTTTGGAAGCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGA TGTTTTAGCTTTGTGAAAGAAGTGTATCTAGACCCTTTTTAGTGTCTTGA TTCACTCCAAACCTGGATGAACCTAGACACTAAAAGATGTCTAGATACAC TTCATTCATAGAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGTGAGTACTA GGCATCAACCGTATACTGGCAAATCTTCCAGCGTGGCAGTCTCGCAGTAA CTGCCCCTCCATTCCATTCACCCTCCTTCTCACACTTGTCACCTCCTTGC CTGTCCTGCTACAGCATTGCCCTCTCACTCGGTAGCCTCCTGCTCCACTG TCGTTATTACCCAAGGTCACGATCCGCCTCCTGCTCCCTGGTTCTCCCCT GCTGCTCTACTGCCTCAGAAGCCATCACCATCTCTCTAGTGAGCAACCTT TTGGCATTCACCAGCCTTGCCAGCGCTGCTCATCAGTCCCACCGCGAGAC ACCACCCCGCTCCCCACTTCTTTTCGCAACCCAGATTCTTTCTTGGCTGC GTAGCACAGTAAGACTAAAGCCAACTGTCTTCAAATCACATGTTTCCTTT ATTCAAACTGAAGATATTATGGTGACAACAAACCTTTTTGTGACAGTACC AGAAAAAAACAGTGAATTGACCAGTGATGACGTGAGAGACTTGTTGGTAT GACATTTATGCCACTAAAATGTAACCAAGTTCAATAGCATGCTGGTCCTT CTCGTTGATATACATACCTACTGTTAACTTCTATGACACTTGAAAAATTC CTAAACATATTCTTCTGCGCTGTTAGAGAGAAGATAATAACAGTCCCCCG GAAGAAGACACTGCGTGAGAGCAGGAGATTGGAGAAAGCTGAAAAGGCTG CTCAACTAGAAAAGGTATTTTTGTCTGATGATCCTTACCAACTTGTCTAT TTCAGACTGCCTTTTTCTAACATCTGCATACTTTTGGTCAGAGTATTGAA AATGAACTGAAAGAACGTCTGAGAAAAGGTGTTTACGGTGACATTTATAA TTACCCCTTCAATCAGTTTGATACTATCCTTGAAATGGAAAACAATGAAT TGGCTCCTGAGATAGAAGAGGAAGAAGTAAGCATGGCACTGAGTATGAGA ATTAAGCTAACTTTGTTATTTTCTCACCACTCAACTTCTTTCCCCTATAT TCTGGATTCACATTCACTTGCCAACCAGGAAGGTGAGATAGAATATGTTG AAGGTGATGATATCGAGATGGGTGACATGGATGATATGGAAGACTTCGAA GGCCTTGGTGATGAAGATGGTAAACCTTTCCTTTGTTTCTACTGAATTTA TTTGGGCAACTGCTCCCGTAGACTAGTTCCTTTGGGTTGAGTTGTATGGC GTGGTGTTAGTCCTATCTTGGGCTTGCACATAAACTCCTTTTCTATCAAT GAACCGAAACACAAAGCTCTTTGCGTTATCGTGATTTTTTTTATTTGGGC ATGTTACAGAGTGCTCTGACTTGTGAAGACCTTTTTTCTCTGTGTTAACT AGATAATATGAAGAAACTTTACACTTTATTAATGTAGGCTTGAAAATGCC ATGTTTATTTAGCATAGCAGTATTAACTGTAAATCTAACCTCCTTTCGAA AGTATAAAATGATTGCAATTGATGCAGATGAAGACGATGGTTTTGAAGAG CCAGTTACAAAGAAACCCACGGGATCAGGCTCCAATTTCAGATCAAAGAT TGGGAAAAAGTCTACGAAGGTTATCACTGAGGTAAATCCATCTTACAGTG TGTTGCCTAAAAGCATAGTTCCTATAAGAACACATCTTTACTGTCTTGTT ACATATTAGTGTTTAGTTGGGCCAAATAAGTTTTAATGGGAAATCAGTAT TATGCTGTTCGCTTTATTTATATTGTTGACAGTTCTTTGGATTATTCCTT CATTGGAGCAGTTTTTCCAAAGAAAGCATTTCGGGCAAGATGATTTCATT CCTCTGTTAATTTGAATTAGCACAATTCCTAGTTGAATATAATTTGTTTC TCACTTGTATGCTACAGGTGGAACAAGATGAAGATATGAGTTGCAGGCAG AGGACACAAAAGTGATTTCACTCAAGCATGTCTTCAGTAAATGCTTGGTT ATCATTTTTGCTGTACTTAAGATAATCTACCTTATCTTATGGTAGTCTGT TGAATTCATATGATGTTTTTATTGCTCAGAACTTGGAAACTGACACGAGT TGTGTGGCATAGAACAATATTGTACTTGAGCGGCTTAAAACAATGAGTGG CTTAAAACAATATTGTACTTGAGGGCATTCGGTCAGTGTGATCCGAATTA GGAGCTTGCAATGTTTATAGAAAGGCTGATATTTTCAAAATTTTAAGATG GCATTTCGAAGTTTCAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.