Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE039573

[Submit comment/correction]

Sequence
AE039573
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039573
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GACCCATTCCACCGCCTCGCTTTCGACCGTGCCGCTACTGGTACTGGACT
CGGGCGCTCCCCAAATTCCCCGCCTCAGTCCCCCCCTTCCTCCCGCCATG
AGCTCCTCCTCCGGCCGCCGCTCCTCGCCGCCGGCGAAGCCGGTGGCCTC
ATCCTCGGGCCAGAAGCGGGCGAGGGGGGACGACGACCCCGGCACCTCGC
TCTCCAACCCCGACACCGCCCCCGCCCCCGCCCAAAACCCTCGCCGCGCC
TTCTCCTCCTCCCCGTTCGCCGACTTCGGGAGCTACATGTCCGCGAAGAA
CAGCAAGCTCGCCGCGCAGTTCAACGCCGACGCGTCCACCTCCGCCGCGG
CTCCCGGCGCCCTCTTCGCGGGCGTCTCCATCTTCGTCGACGGCTTCACC
GTCCCCTCTAGCCAGGTGCCCGCCGCCGGCTCATACTGTACTCGCGTGAT
TTGATCGCATTTTGTTGTAGCTATATACCGGTGGAGGTCATGCCAATTTA
TTCCAACCTTATTGTTTTGGGGATTTTCCAGGAGCTGAAGGAGATTATGC
TGAACAACGGAGGCCGTTTCGTCAACTACTTCTCGAGGCAAACGGTGACG
CACATCATCTGCACCCACCTTCCGGAGAGCAAAATGCGGAATATGAGGTA
CAGAAGTGGGAAGAGGAAATGAGGTTCACTCTTTCTGCTAGTGCTAAATG
TGTAACATTTTTTGTGTTTGTCCATGCTGCTTAACCCAGAGCATTCAGTA
AGGGGCTTCCTGTCGTGAAGCCGGCGTGGGTGGTGGATTCCCTTGCAGAG
AACCGGCTCCTCAACTGTATTTTCTTTTCTCCCTCTCTTTATTATCCAGT
ATGGTAGTGCTGAATGATACACTCCACTCTTGCAGCTTTAGCTTGAGTGA
TTCGATGGACCATGTTGCTAGCAATAATTTTTAGTGATAGGTTTCATTGA
GTTGTATATGCTCCTTGAGGGTATGATGCAATTAACCAAGGCCCCTTCTT
CAAAATTTTAATTTATGGACATGTGCCATATTCACCAATAAATACTAAAA
AAGCAGGTGCTAGATCAATTAGTGAAATTATTTAACCGAGTGCAATGTTA
ATAATTATGTAAAAAAGTCACTTCTTTCCTTATTCCCCCTAGAACAGTTT
CATCTTTCTATTCTCATAGCAGGTGCTCATATGATTCTGTACTAGACATG
TATAGCCTTTGCTGATTTCTTATAACACCCGTAGTTTGTAACCACTTATA
TTAGTTTATTTGTAACTATGATGGAATTATTTCTGTTTTCTTATTTTTCA
CTCAGGCATTCCATATCAAATAAGTCAGCATAGTTCTTCAAGCCGAAAGC
AGATGAAGCTTTCTGCTTTCTTTTCTGAGAAACAAAATGGAATACATAAT
CAGGGTGACCGGAATGGTGAAAGCAAAGACCTTGGGTTCCAAACTTCTTC
TGCTCAGGAGGGATCACAAGACCAAAATGAATCTCATGAAAAAGAAGAAG
GTGAAAGCAAAGACCTTGGGTTCCAAACTTCTTCTGCTCAGGAGGGATCA
CAAGACCAAAATGAATCTCGTGAAAAAGAAGGATCATTAATGAGTGTTGA
GGTAGCAGAGGACTCTTTATCCCCGGATGAACATGAGGTTTCAACATTCG
AAGAACGGGATGGTGAAGATTTTGTGATAAACGAGGATGATAATGATTCT
GAAACAGCAGTTTCAGAAAGTGTGGACAATGACATGGATGCTAAACTTTA
TGTGCCTGACTCCCCTGATGCTACATCAGATGTGTGTGGTACAAACTCTG
TGGCCAGCCATTTGTCACTGGGTTCGTTGGAGAAAGATACAGCTAAATCT
TCTAGCCGTTCACATTCAACCCTAACAGATCCAAACTTTGTAGAAAATTA
TTTCAAGGCATGTTCCTCAATCTATTTAGCATCATTTGGTGTTCCGTTTT
TTATTTTTGCCACACAATTGTTGGCATGCTTTGGCTCCATATTAGAACAC
TATTATTGAAATCTTGAATTTACTATCTTCTAAGGAAGATGTCCAACTCT
TGTTCTGGAGTTGTTAAGGATTAAACATAATGGAATCTTGTGTGCAGTAA
GTGTACTGGACGGGACTTTTAGGATAATTTATACTTTTTGAAGTTTCTCT
TACTGACACACATTTTGCTTCTATTTCATTATAATATCATATATTCTTTC
ATAGATGTTAATACTGTAGTTTTTGTCAGAATGACTAATTTTACCATGAA
CCTATGTGGTATTCTAGCATTCTCGATTGCATTTCATTGGGACCTGGAGA
AATCGCTACCGCAAGCGCTTCTCAAATTCACTTGGAGCTAAAAGCAGTAA
GGGCAAAGATCATTCAGGGAAGAAGAAAACAATAATTCATATTGATATGG
TAATCTTGTCAGCTTTCCATCCTTTTGTTAGCTAGACATATAAATTGCAT
TTTTTGATAATGATGATGCTTTGAAATAATCTTCCAAACATTAATATGCT
TTGTGGCCAGCGGTAATAAAGCTTCCATTATCTCATTTTTTTAATACGCT
CTGTATATTTAGCTATACAGCTTGTCATATTATTTAATGACTAATAGAAT
CTGGTTTAGTTGCAAAGATAAAAAGTATGCCATTCTTTGGAAGCCCTGAC
CAGTTCAAAGTTTTGCAAGTTGATTTTTAAATCCAAAAGGCATGGTAAAT
TTGTATCTACTTGTAAAGGACACTTCATATTTTGAGAGGAATGTGCTAAA
ACGAGCTAAATATGTCAGAGTCGGCAATGCATTGGTTATTACTTATTACT
ATCAATATAGTTATATAACCATGAACTAGTTCTCCATATCACTGGATGGT
ATGGAGAAAAAAAATCATCCGCATAAACTAGCAGGAAAGTAGCAAATCAG
ACCTTTTAAACTTCGCTCCGAGCTACAATTTTCAATCAATGGTTGAATTA
ATGCTCAAAGAAGAGAGAAGGTCAATATTTGCTTAGTTGCTTATCTTGAA
CCTTGGAATAATCCTTCTGCAATCCGAGTGCTGTATTTTATTATCTGCTG
TCATCAGACATAAAGCAGAGCTATTTGTGTTATACTTGTTACCTTGATCT
TTGACATAATCTTTCTACAATTCCAGGACTGCTTTTTTGTATCCGTTGTC
ATCAGAAATAGGCCAGAGCTGCACGATAAGCCGGTAGCAGTTTGTCATTC
TGACAATCCTAAAGGAACCGCAGAAATATCATCTGCAAACTATCCTGCAC
GAAACTATGGTATTTTATTTTGCTGGAAATTACAATTGGAGCTTAAAATC
TTGTGGTGGACATACATGAATATATTTTATGTCCTCCTTATGGATTCCAG
GGATAAAGGCTGGCATGTTTGTTAGAGACGCCAAAGCTCGGTGCCCTCAC
CTAACAGTAGTTCCTTATAACTTTGATGCATATGGGGAGGTATTCTTCTA
GCTTACCACGATTGCCTGTCCGTCTCAAGCTTTCGTCTGGACACTGCTTT
TGTTCAAATTGATATTCTTGGTATGGAACTATATTGTAGGTTGCTGACCA
GTTCTATGGTATTTTGCATAAATATTGCAGTAAGGTTCAGGTCTGTACTG
TATTATCCCATGCTTTCTCGGCATATATTTATTAATACAATCCCCACTCG
ATGATTGCCACATATACATCCATAAGTCTAACTGAGTTATTTAGGCTTTG
AGCTGTGATGAAGCTTTTCTGGATATGACTGAATGCTTATACGATAACGC
GGAAGAAGTTACACAGAGAATGAGAAATGAGATATTTGGTACAACTAAGT
GCACTGCTAGTGCAGGCATTGCTGAGAACAGGCTCCTAGCCCGTTTAGCC
ACCAGATCTGCAAAGCCGAATGGACAGTTATTTATTTCATCCGAGAAGGT
ATGTGTGCATATTAACTGTCCCATCCTTAGCTTTGTACATTATCTTCATG
TACCAGGTGGGTTTGAAATGGCTGTTCAGCTGGGAGTATGAGATAAATGA
AAAAAACCTTTGGTGTGTGTGTCATGTAAAAGACCTTTAGTTTCTATTTG
GTTCACAATTTCAGATTACTGATTTTGCTTTAGTCTTTGCACAGGCAGAT
TATTAGTCCAATGATTTGCTTTCTTATTCAGGGCACTGTTTTGTTTGTGT
TGCTCAATCGACTATTGTTTTGTCTAAAATCAACTTTATTACAGGCTGAT
GATTATTTGAATACCCTCCCTATCAAAGCACTTCCAGGCATTGGTTTTAC
TGTTTCTGATAAACTGAAAAGCAATGAAGTTGAATACTGTGGTCAGCTTC
GCAACGTATCAAAGGTTTGCCAACGTCTCACTTGTGTAGTTTAACATGCA
GTCACCCCTTCTCTTAAAGTAAGTTGGCAAGGTGCTGTCCAATGGTTCCT
TATTTTACAAGTTTGATGCCATGCACGTCTAATTTGTGCTAACGTGGAAT
GGAATGAATACCAGTTCATCTTCTGCAATTTTAATGGCAATAATTTATCA
CTCTATATCAGGCATCTGCTTGTAATGGTCATACCATGCGTCACCAGTCT
CTGATCTGTAGATTTGTGCATATGTTTTTTACTGAATTCTGGCAAATACT
TTTTGTAGGATGCTCTCCATAAGGACTTTGGAAAAAAGATTAGTAATATG
TTATGGAACTATTGCAGAGGAATTGACCATTCAGTTGTTGAAGATGTTCA
GGTAGAAGCATCCTAGTTATTTTTTGTTGTGAGAACCCATAACTCTATTA
TCAAGGTCATAACCTTCTTGCGTGGGAACATGTGAATGCCCAGTGTTGTG
TTAAGGTTGCTAGCTAAGCCTGGTCTCTTGTTGCAAACACCTTGAACTAA
TCACATTCTTGTTATTCCTTTCTCCCGATTTGAATTTGTAACAGATTTCG
TATTGACAGGTAGTATGTATTGTGAACACAATGGAACAACAGTCCCCCCA
AATGTCTAAGAACTGTTCTTTTTCGAACAACTGTGACATGAAGGACGTAG
GCCTTTGATGGAAATCAGATAAATACTGCTAATGTTGTGCACATTTTTCA
CTTAAATGCCAAAATAATATTTCTTGAAGACATAGAAAATCTGTTACTGT
TCCTGCGGTACAATTTCCTACTCTTATAGGTTGTTGTTGCACACAAAAAC
AATAGAGCAAAATGAAATCTGTTACTGTTCCTGCGCCTATCTTGCCTGCC
ACCTTCTGACGAGGCCACCCTCTTCGACTGGTGGACGGAGGCCCATCGCT
GCACACCCAAGCCAATGCGCAAAGGGCTTGCCTCCGCGACGCTGCTTATC
CCATGGATGATCTGGAAGGCACGCAACGATTGCGTTTTTGAGCGTGCGCA
ACCATCCGTCCAGGCCCTGGGCAGCAAAATCAGAGAGGAAGCCTCGGCGT
GGGTACTGGCAGGGGCAAAAGGGTTGAGGGACATAACCCCGACGACGTGG
GATGTACACTAGTAGCAGCATTTGTAATCTGATCGTTTACCTCCTGGGAG
GCGTGTAACAACTCTACCTTTTCAATATAATGAAACGCAAAGCTTTTGCG
TTTTCTCAAAATAATATGTTAACATTATTTTTTTTAACAGCATTGCGTCC
ATCCTGCAAATATGGATTGCACCTGTTTGCTTGATTTTGAAATATGGTGC
TTTTCCCCTAGCGTTTGCATAGCATGGATTATTTGCTAAAATGCAACTGT
GTGATATGGCATGCATTAAGGGTAGCTCAAGACAGCGGACAGCCGGACAC
AACCATAAATGCTAGGGCTAAAATGATCTCCTGAATATAATACATGCTTT
GTTTTGAACTGTGTTAGCTACTTAGCTGTTGACATGGACGCATATTTGCT
TCTTACAGGGATCAAATGGCTTTGATTTTATTCATCAATGGTGCTTAGCA
GGCACCATGTTCATTTTGGTCATCCTTCCATTTGGAATGGAATAACCTGA
TATATTTGATTTTTTTGCTACACATATATTACAGGAAACAAAATCTGTGG
GTGCTGAAGTCAATTGGGGAGTCAGATTTAATGAGAACAAAGATGTGTGC
CTTTTTTATCCACTCTTCTATTATATATCATTTTAGTGCTGTGCCTTTTT
GGGTTTGATATTATTATGTTTATCTTTGCAGGCTGATCATTTTCTTGTCA
ACCTAAGCAAGGAGGTTTCTTTACGCTTACAAGGATGTGGACTACAGGGT
CGTACAATTACCCTTAAGGTTGTTTCTGTTGACTGTACGCACTTATTAAT
CCATTTCTGTGGCAGTTGGTTATAGTTTCATAACCGATATGTTCTGCTTT
GAAGGTCAAAACAAGAAGGAAAGGTGCTGGAGAGCCAATAAAGTTTATGG
GATGTGGTGACTGCGAAACCATGAGTCGTTCTACCACGGTAAGGGTTAAA
TGATGCATTTGAAATTTTTAATAGACGAGTCATGTCATTTTGTCGTGATC
TTAGTTTATTTTTGTCTTTCTGTATCAACTTGCATTCCATCTCATTGTGT
TCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAAATAG
TGTATCTAGACCCCTTTTAGTGTGTAGATTCATGTAGGTTTGGAGTGAAC
CTACATACTAAAAGGAGTCTAGATACACTCCTTTCACAAAGCTAAAACAT
CTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGTGTTGACCATTTGCAGAATGGGTC
AGGCAAACGTTTATCATGTAAAACATGTTCTCGGTTCTTAGTTTCACATT
CTTAATACAAAATTTCCTTTCTGTTATCACTATTTTTTTACCTTTCTTTT
CCTTCGCTATTTCAAAGATCACAGGTGCAACTGACAATTTAGTTACCCTT
CAGAGAATCGCAAGACAATTGTTTGCAGCTTTTCATGTTGGTAAGTTGGA
TATATTCTCTCTCATATCTTATATATGCCGCCTCCAACCCAAATGTCTCT
TTAAAATATTATTTTCTTGGGGTTACTTCGTTGAAGTCTAATTTCTGTAA
TGCCGTATTTTAGATGTGAAGGAAGTTCGGGGAGTTGGACTAAAAATGTC
GAAGCTTGAGCATGCAGATTTAGCTCGAGGAGGTATCTTCTAACTATTTG
ATTTCTCATCTATGCGTTCTTCTCTTTATTGTTCAACACTCTTTTGGCAC
TGTATAAATATGTCTTGCTATTTGTATCGGGATAACTAAAAACGCTGTCA
AGAGTTGGGTCTGAAATCATCAGATTACTAAGGTTTATCAAGTTACCAAT
TTGAAAGTTGGAATGGTAATTGGCGCTTAACAAGTTTCTTTAACTTCTGA
CATTCAAGAGTACGGCTGAAGATAATGCGTTTTCTTATTTGTTGGAATAT
ACAGTAGAGAGCGTCGTTTTGGAGGACGAGCTCTAGTGAGGACTTCATTT
TTTTTTTGAAAAATTTAAATTAAAAATTCAAAAAAAATCGAAAAAAATAC
TGGGATGTAGGTAATGATTTATAATACATGCGCGCAAAGAATAATTCGAA
AATAATTTGTATTCTGGCCACAGCAAAAAAGAGAAAATTTCAGATCTGAG
TGTGAACAATGCAAATTTGAATGGGCCTCCGTTTTCCCAGAATTTGTCAT
ATTTGTTTTTTTTGCTATGCCCAAAATACAAGATATTTTTGATTGCAAAT
TTGCATACGTGTATTTCTTGTTGTTTTCTACACGTAGGTATTTTTTCAAA
AATATTTGATGATTTTTGAAAAATTCAAAAACGGGCTCCATGGAGCCCGT
CCTCTAAAAGTATTTTCCGCAGTTTTGTCGTACTATAATGGCCCGAGTGC
TGTCACCAAACTATGCAACATGTGTGAATAGATAACTGCATATATTTATG
ATTATTTTCCTTGTTTGGAAATATAAGGCATATTTTGTCTTGCACATAAA
CCAAGGAGATTCTAGCGGTGACTATAGAGCGAATACCACACTTAGTTTGC
ATTCAAATATGAAATACACTCTATACTTCTGAGTAAGAAATAAGCCTTGT
ATTTTCGAACAGAGGGAGTAGTTAAATATATCACTGTTGCACTGAAATTG
TGGAATATTGGCATAATTGGGCTAATGAATAGGCCAAACCCACTGTAATA
TTCCTGCACATGTTGCTGTAGTGTTTATGTAACATTGTTTTTATAAGCTA
CTATCTTGTAAAATAGGCTTTATCTCTAGTGATATCAGAAGATGTCTTTC
CAGAGATTAATGCAATAAGTCAACATCTTTTACTTCCTCCACACCACCCA
TATGAGTTATGACAGCTTGACTTCTCAAATGTTCCGTACTCAAATAACAT
TGGAAAAACAGTTCAAATGTAATCTCCAGATTGCAATGTTAATAATTGTC
TGCCCAAATCTTCTTAAGTCTACCACACTTCTTCCTTAGCTAGTGGTTAC
CTGATTTTATGGATACTTATCTTTCAATGGTTGTTATTTTTAAACGAAGC
ACCACAAGGGAATATGCTTAAATCATGGCTTGGTTCATCAGCTGAGAAGC
TCAAGAAACAGGGCAGTGAGAAAGCCCGCTTGCGTGGAAACAGTGATGAT
GCAGGTATAGGGCATTTTATCATACTAAGGTGTTGTTTCCGTGTTTTAGT
GTTGTTTTGCATAGTTTTTACTTCATAGTGTTGAATTTACGAACTTTCCA
TTCCTTATAGATTTTTTTAGAAGTCTTTGATTTGTCAGATATTATGTAGG
AACCAGTGAGCTGCGAAACATGGGAAGATCCAGGCCATCATTTACACGTA
TGGCATCCCAGTCATCGAAGGTGAACCTCACAATTGATAGGTCTGCCAGA
GTTGATGCCGTTGAGCTGCCTCCATTATCTGAACTTGATCTGGAGGTCCT
CAAGAACCTTCCTCCCGAGATAATATCTGAAATGAATGTCGTGTACAAGG
GAGAATTGCGAGGATTTCTGGACATGATAAGCAGAGATGAAGGCAAGGAA
AGCAATTCAAAATCTCCTGTTTTACCTGCCATTAATCAAAACTCTTTGCC
TGCTTGTGATGCAAAGTTGCATGGATATGGAGAGCACAGAGACTCCATGC
ATTTGGGAAAGCAGGACGATGTTAAGGTGAGCTGATCAGTAAACTTAAAA
CTGGAAACGTAGTGGAATCACAGTTCAAAGCTGCCACTGTCATGTTCATG
TTTTGAACCGTTCCTTGAGTATTCTAAGTGTTGGTATTACTGCCGTAGGG
GACAACATACCAGGAGGTTCAAGCTGCCAATGCTTCGTGCTCAAGAAGCG
GTGAAATGGTTGATACGGACAGTGTCACACGGCTTGATTTCATGCCTAAT
TCTCTAAGCCAGACAGACTTCACAGTTCTGCAGGAATTACCTGAGGATGT
CAAGGCTGATTTGTTTAATGTGCTTCCATTACATAGGTCAAGAGATCCTA
CATGCAGCACTTTCAATGTTACTGAAAGTAAATCTCCAAATGATGGAGGA
ACTGATGATCCAATTTGTCACCTCCCAGAAAGTTCTAAAAAATGGGCCGA
ACAGTTGAAAGTTAGCAGTTCTCTAATATTGAATGCTATTGCAGAGCAAC
ACACAGATTCTGTCTCCAATAAACCTTTATCTTCCATATTAGAGCCTATG
GCTTCCCTCCTCCATCTTTGTCCTAACTCAGGTAGCGAAGAATGGAACGA
CACACTCTCCTGCCTCTTTGGGCTTCTTACAGAGTATATACACCTGAAAG
TTGATTCTGATATCGAAGAGCTGCACAAATGTTTCCTTCTTTTGAAAAGG
TAAAGCATATAACCACTCAACCATTAATACATATATGAACATAAAATATT
ATGGGCAGTCTCTTTGAAGAAGGTAGTTCATGAAACCATGTTACTGGTAA
TTACTGAACTTTCTCACTGTAGGTTCTCGTCAGCATCTGAGCTTTTTCTG
GAATTACACAACAGCATTCTTCCTTTGCTACAGGTAAATTTACATGCTCA
GTTATTATCTGTATTTCTTGAAGACATCATTGTAAGATTTACCTCTGTAT
TTGTTATGGCTGTTTGTCCCTTTCCTTTATCACTTTTGTTCTTTCATATA
CTTCATGGTTGAAGTACCTTATTAGTTTTTAGATGGAGCCTATCAGCTGT
CTGGTTTTCATTTTTTTTCCGATTATAAAATTCATAGTTGCTCCAGTTTA
AAGTTTGAAGGTTTTAAGGAAATTGCATATGTGCATAAATTTGCAAGGTG
GATGGCAGACATGAACTCAGTAATTCAGAAACTGGACATTTATGTCTGCA
AACTCGTAAAACCGATCGAGTGAAGCCCAAACCTCTAATTGTTTGGTTGT
TTGGTCATTTTGTAGGATTCCATCAGTCAGCACTATGGTGGGGTATTGCG
TCTCTAGTTCAAAATTCAGCCACGATTGACCATGTAGTGATACGAAGGAT
GCGCCGGGGTATCAGCGGTGAATCTAGCGCCATCATTTTCTGTTTAACAA
TGGAGTGTAATTGGCTCTTCTGGTTTGTGGATGTGAACTGGTTCAGTGTC
TTGAACTGGAGTGTTGTGGGTTAGTCATGTACGGAAGGGAAATCCTGTAC
GCCTGTAAATATTTCTTTTCGAGAATGTACACCTGAAAATATTACTTACA
TGAATGAGGCCGTGAGCTCGTATTTTGTTCTTTGTAACATAGCTTACTAT
TGCAAAAAGAAGGCACGAGTTGATATATAGGGCAGTTCAAATTTTTGTGG
A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.