Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE024578

[Submit comment/correction]

Sequence	AE024578
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE024578
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCAAATCCTCACTCACACACACACACACTCCTCCCGTGCTAGGGTTTC AGAACCGAGCTAGATTCCGGCGGCACGTCAAAAAAAAGCTAGATTCCGGC GGCAGGATGGGCGGCGGCGCGGCGGATGAGCGCCAGGTCCCTCGCCTGGA ACCCATCCTCGACCACCAACGCCATGAAATGGCCTCGTTGCAGATCCCCG ACGAACTCTTGGGGGAAATCCTCCTCCGGCTGCCCACCCCAGCCGACCTC GTCCGCGCCTCCGCTGGCTGTGTCTCCTTCCGCCGCGTGGCTGCCGACCG CTCCTTCCTCCGGCGGTACCGCAAGCTCCACACCCCGCCCCTGCTCGGCT TCCTGGATGATCGCAAAGTCTTCCACTCCGCCATTGCACCGAACCCGTCC GCGTCGGCAGCCACCGCTGTTGCCTTGGCCGCCGACTTCTCCTTCTCCTT CCTCCCCGCTCCCGTCAGCCACTGGGTCCTGCGGGACGTCCGTGACGGCC GCGTGCTCCTCGACAGGCCCATGCGCGTCCACAACAGTTCTGTCTTCTTC CCGGAGGTGGTGGTGTGCGACCCCTTGCACCGGCGATACCTCCTGCTTCC CCAAATCACTTACGACCTAGCCGCGTTGGTGGAGGACCCATTCTTGACAA AGAAAAAGCGAATCGCCCAGACCTTCCTTGTGCCTACCTGCGACGACGAG GAGGCAGATGAGACATCATTCAGAGCGATCTTGATGGCACAGTGCAAAAC TAGGCTAGTCGCTTTTTCTCTTCTCTTCCAACACCGGACAATGGGGACCT GTTCTGTCTCGGCCTTGGAGTGATTTGTTTGCTGGCTTGACACAGTTGAT CGCATGGAATAGGCTGTACTTGCGCCAATATGTGTATGGCTGCTTCTACT GGGCTGATAGTGAAGGAAATAATTTACTTGTGCTTGATACCAAAACAATG GAGTTCTCCATTGCTAAACCCCCACCGGAAGCTGATAGCTGTTGTGATTT CGTCATGGTGGAGGCAGGGGAAGGCAGGCCTGGGATGTTTGTTCTAGCAG ATGGCAGATCTGACCTCAGTTATTTCATCAAGCAAAACGGTTGTGGGAGC TCTAGCCAGTGGAAGAAGGTGAAGACAATCTCACTGGATTTTGGGGTCGA TTTGATATGTCATATGGAGAAGTACCAGCTCCTGTATCTGGAGCAACAGC GAGGCTCACTGCTCGAGTTTGTCTGTTTCATGCTGGACATTGAAATGTTT CAGCTTGAGAAGGTGTGCACTGTGCAGTCTTGCTTCGATACTCTGCACGC CTATAGCAACTTCCCCCCATCCCTGTTGTCGCCACCAACAATATCAAATG GTAAGCTGCAAAGTTATCTACCTTTTTTTATCACACTTTAGATAGTTCAT TATTGGCATCGGTAGGTCTTTTTTACATGATTTGACATTAGTTAGTTTGT ATCTTCTTTTGGCAAGGCTAATGAAGCTCAGAAATATAATTGTTACATAT TTGCTTGTATGTTCCTATTTTAAGGTAATTAGACAAGTAAAGGAAAGGAT TTTGTACACTATGGGAAGCTCTCTTGAGACCTCGTGGATCATAAGAACAC TATATCACTAATTATTTTGAGGAAATGTTTTTGATATTCAACACTGAAGC TAATGGAAGGGAATATGAGTTCAAATCCAGTTCATTTATGTTCAGCTTGG AAACATATTGCAGTCAAGAAGGCCTTATACTGTCTACTTTTATTTTGATA GATATAAAGAGTCTTGGATTTTTTTTTTGGCCATCTTTACACCAATAGAT TTTTCTCATGATTTCAAGTATATCTGCATAACTGATATTTTTTTTATCAA ATAAGAAGCTTAGCCATTGCTACAACTAATGCATGTCCTGTATATCCATA TAAGATGTTAGCAGAATTGAAGTGGTGGGCTTGATTGGTTTCTCAAAGTA CCATTCCAATATTTTTTTTGGCTCAATAGACTTGGCATTCACATTGCAAA AATTGCTTGCCAGCATGTCGGATATCATTGATTTGAAATCAGCTTCTCAA GATAGATTAGAACAGGGCAACCATGTTATATTTTGACAGTTTGAACTTCT CACCTTCCTTTATCTATGTTGTTCAAGTCAAATGGTCAATGCAAGCAAAC ACTTTAATGAGATGACAGTGGATGCACATAGTTTGTTTATTTTCACTACT GATATCCCCCCTTTTTTTTCCTCAGGCAACTGAAGTTAAAAATTTGTTAT ACTGCCAAGCTAGCTAATTTATAAAGTACTGCAACGCGAAGCTACCATTT TCTATGGTTATTTGTTGCAAACTAGTACACATGCTAAACTTGAGAGTTGA TTCTGTATGTACTGTTTGTGCTTTGTTTTAATCCCCAGTATTTTATCTCG GCCATTGCTCCTCCCTTGTTTTTCTTCTGTTTTTTTTGTTTACCTTAGCT TTTCTTGCCGTGCTTCTTCTCTAAGTAAGGTGCTGGCTGTTGCTTAATAC TACTGAGACCAACATTTGTTCCTCTTTGCTGACAAGTTCCTGTGTATCTA TAATTGGAATATGCTAAAATTTTGGGATATTGGGCAGGTGTAGAAAATGG GCCTGAGAAGGAGATGCTGGAACAAGGCTGTGCTGAAAGTTCAGGCGCAC AGTCACCACAGCCAGAATAGTGCTGCTGTGGATGCTGGACGTGAGGAAGT GTCGAGGATCAAAGTAGCTTGTGATGTTGTGATGCAACTCGACAATCGGT CACTTCTAAGTTGGTCTGTAACAGGGTTCTGTTGTCTCTGTTTTTGTTGC AATAGGACCATCTAGAAACAGCCCCACGGTTTATCTGGTACCTAGAGTAT CTTATGTACCTTTATCTGAAGATGGTTGGTAGTGAGATCGTTAACGACGT TAAATTTCAGCACTTTTAGCAGTAGGTTAGTTAATTAAGGCTATGTAATA ACTAACAAGTCAATCTGTTGTGTGCAGTATAAAAATCCCCTGCCGGATGA CCGTGCAGTGGATGGACAATAATCAACATGATTTGCGGTAAGATTTTCTT GGATTAACAATAATCTTAGAAACCAGCCAGATTTCTTGTACGTAGTAGTA CAAAATATGTATGCCATGCAGGATTCGGAGTGATTTAGGTGCATATATTA CGGAATGCAGTGAATCGATCAATCAATTCGTTGTTTGTAGCTAAGTATCC TCGTGGCCCGCGTTTTGACCGGGTCAGCCACCCAAATTAAAGAGTAGCGA TCCTTTTAGGCGGGGAGTCGGAAGAATGGGCGGCAGCGACCCGAAATTTT TATTTTGTTCCCGCCTCTTGTCTGGAAAATTCAAACTGCTCCAAAACCTC GAACCTCCTCGATCTCTGTAAGTAGGGAGACCACGGCGAGGAAGCCGCGT GCGGTATCGCGTGACTTGTGACATTGGCGTCGGCGTGGCCTGAGAGGTAG GCTGCTCCGTGCATGCGAGCACTCTCAATTCGATCTCCGGCCGTGGGCGA CGACCTCTTCTCCGGATCAGTCCAGGTTCCTTTTTTCATGATCTTTTTAT ATATGTATTCCTAGCTCGCCTGTTTGTTTGTTTGTTTGCATGCGAAGTAT GTAGATCCGGCCGTGGATTCGTCAGATCTTGATCAAATTGTTGGATCGAT GTTGTTCTTTTCCCCGTCATCTTCCGTGCTATTTTTAAGATTTATTATAC TCTCTCCGTCCTGAAAAAGATGTCTTAGATTTATCTAGATTCGAATGTAT CTAGACGCTATTTAGTATATAGATTCATTCAAATTTAAATAAATTTGTGA CATCCTTCTCGGATCGACCGGTTTCCTGGCCAGCGCTGGTAGTAATACAT TTTGTGTATGTGTGCTAGTAGCACGTACTAATACGTTTCCTTTTTCTTCT TCTGATCTGGGGGGGAAAGAAAGACAAGGGAGAGACAGCTAGCCTTCATA CCAGAGCCGCCCCCAAGGTGTTTGATGTCGGGCCCCGACGTCAACTCAGG CAGAAGCCAGGTGCTCGTCCAGAGCTGCCCACCAGGTGCTCGACCGAATG TTTGACAGATGAGTTTACACGTGCCTTGTTGAATACAGTTTAGCAGAATT TTACACTGTTGCTAATTCATTGAAGAAACCATTTGTGCTGATTTGCTGCA GCCAGGTAGTACAACGGAATGGAGTCACTTAAGATTGGGCTTTGTTCGTC TTGATGGACGTGCATTATGGACTTTGTTCGTCTTGATGCCGATTTGGGGG CAAGCCGTGTCTCATCAGGAGACAAGTGTAACATCTGTACCTCCTGGTAG ACTGATCTTTGAGGTCATGGCCATGGTGTACTAGTTTGGATCGGTGGCTA GAAAACAAGCTCTGGCAGCCAACAGTAGCAGTTGAACAGAAACAAACTGC CTAAGAAGGTAGAGCCTCTCTTCCCTGATCCCTGATCCCTGTTTGGCTGT TATTGATCGCACGTCCTGTCGATTCCTGGCTATTGAAGGATAGTACATTC ATCACCACCGATGATTTCCCAACTACCCAAATCTGGTAATTAATTTATTG TATATTTTTTTTGAGCTAACATTTATGGTATATCAGTAGTAGTGTGTTCC TGCGCATTTGTTATACTGATCCCCGATTCTTGGGATTGCCTTGTTATTTG CGAACATAGCTAATTACAAGGCTAAATTAAATACTGCTAGTGATGGTGCT GTAGAGTGGCAATTCTGAATTAATCTTGCCTGCAGGGTTTTGTTATATAT CGTTGCTGCTAATGTTAATATTAGTTCAGTGGTATCTATGCGCTAAAAAC TCTGGGAGCAGTTAGACCTATTAGCAGTTTACAGTGAATCACCACTAGTA CAAACGTACCCTAGTGAATTAGCAGTGTAGATTGATTTGTATCGGTGGCC AAAGCTGGACTAGTGAATTTCAGATTTGGATAATGGATGAAACCTGGAGA TTATGCATACTCACAGATTATGCTGCTATGCCTACCTGTTCGGTTTTTGC ATTTGTGTTGCCTTTCTTTACAGGTAGTATCGTAACTGCTACCCTTTAGA GACCTTGTAATCCAACCTCGACGGTAAAAAGGTACATCATGAAGTTTTTT TTTCTAATTATTAATAATTACTTTTTTTATTCAACACACATGACTGCACA GATACATAATCCACATAGTAGTGATGTACCTTCCCTTCCCGTGAGGCTTG GGCATTCATGCCAAATCATATTCAACCGGGTCCAGTATGGCCGGCGCGAG CCCGGGGTTATCAAGTATGGCCTTAAGATCTTTATTGTTGTCCTCCAGGA TAGCCCTCAGGAATGCGACCATGACTCCTCCCATGCTCTGCCTCAGAAGG TTTTTGGTGCCATCCTTGTTACACGTGCACACCAGTTTGCTCATCCAGTT GACAATGTTGTGCACGCCATCGTCCAGCATGTCCATGTGACCGTAGTCCT TGGCCACAAAGTGGTCGCGTGGAGGGATGCACTCGTTATAGAACGCAGTG TGGTTGAGGCCTGCTGGGGTGCATTTTGACTCGGAGCCATCCTCCTGAAG CTTCCCGGTTCCCAAGACCAGGGCCGGCATCCCCAAGTCGAGCGAGCGAG GCTTGAAGGTGAGGATCTTTGGTGTGCACTGTGAGCCTGTGGCTACCCCG GCCACCGGGTCGACGCCGATGAGGGCAGAAAACTTGAGCGCCAGCTTGAT CTTAGGGTCCCCCAACCCCAGGGCTAGAGCGAAGGCTGCGTGCCCGCCTC GGCTGTGGCCTGCCAGGGCCAACCTGGAGAGGTCAGGCTTGACGTCTTCG AGCTTGAACGTGTTCTCCAGGACGAACTGGAGCCCGTCCTGCCCTGGGAG CCAGTTTGTGATATGCTTAGCCATGTTTATGTCCCAACTGGCGTCTCGGA GGAACGTCACCGTGTAGAGCTGGTGATACAAGTGTAGGTGGAAGGTGAGA GTACTATATTGTGAAAATACCCGTTTCATCTTTTCTTGATTGTGTCGATC ATATCCATTCCTAACCGGCCAGTAATTTTTGTATCCGTTCCATTCAATGG TTGTCCAACGGCCCATTAAAATTTAATTCATGTTCGCAGTTGAAACTGAG GTTAGACTGCCTAAATAATATGTGGCTTGCAGTGCTCCTAAAAAGTATGA TGAGTTGTGTACATACATATTTCGTCGATTTCGATTAGTAAATACATGAC CTGTGGAATGCAACTGTTTGAACAATTTTAAAGAAGTAACCCTGAAAATG GGCAGGAAGAGAACAAAGATGGCGCCGAGATGCAGCAGCTAGCCTACGTA CCTCTGGTGCTACCGCGATGAATCCATGGGAGGCGACATGCCTGAGGAGC TGCTCATAATCGTGGGCCGCCAACTGGAAACCATGCAGGAACACGATGAC AGGGTACGTCCCTGCCTCCGTTGGGGCGATAACCACGATGGGCTTGTCAA GGCTCTGCGTGACCTTCATCAAATTCGGCTTCACAGTCCGCACCTCGACG GGTAGCCCCTTGTCGAACACCGACGTTGTTGCCATGCTCCTCCTTTGTTT CTCTCCGCTGTGTTTGTGTGGGCAGATATGATGGAGATGAGCTTGGTCTG GTGTTGGTGCATCCATGGAAGGAGATGGAGATCGCACTTATAGGCCGGGC AGAGGAGCTGAGCAAATGAGGAACACATGTTTTGGTATGTTTTTATCCTA GACTAGACTGGCTTGTAGTACTATGTTCTCCGAGTAGCGATTTCAGTTGT CCTAATAGGTTAACGTTTCTATCTACATGCCAAAACAAGCGTGTGAAACA CATGAGCTAGCGGACGCTGGGAGATGCTAGGACCAGTGGAGAGCAGCTTG TGTAATTTGTAAAATTCGCATGCGTGCAACTTGCACATTCACATATTTAA ATCGTCAGTAGTTAAACAAAATTGAGTCGCGTAAATATAATGTTTTTTGC GTCACACAATCAACTCGACATGTGATTGGTCATGACCTGTGCCTCAAGAC TCATGTGTTTACACAGAATACCCAATTCAATTTCTATCCATAGTGTTAGA AGAAAAATTACAATTTGTGAGTGCATGGTTTGCCTGCTATATATTCATAG ATGAAGTGTGTTTTTCTATTTCTCTGTGGGTATATTGACATAAATTCGAA ATTCTATCATACACAGGCGCGTCTCTGCGAGAATGCTGTTAAAATCTTGT TTTCACATCGTTATTCATGTAACCTAAGGGCAGAATTTATACATAATATC CCAACCATGAGAAACCCCATCGGCATGTTGCACGCTTCCAACGTGTGGTT GCATACACACATATATATATCTTCGTTTATTGGAAAAGAAAAATACAAAT TTGTCTATATGCAGGAGAACCAAACAAATACTTTATATGGTCCCAAGTAT TTAGCAAAGGGTACGAGGAACACATGTTTCTGTACGTGTTTATCCTAGAC TAGAATAGACTCGCTTGTAGTACTATGTTCTCTGAGTGGTGATTTCAGTT GTCCTAATAGCGTTTATCTGTACACGACAAAACAAGGCGTGAAGCACATG ACCTCGCGGACCATCCTGTGGGCAGAAGCCACGGGATGGCAGGACCAGTG TCCATTCGGAGGCAACTTTGCGTAATTTGTAAATTTTGCATGCGTTCAAC TAGTGGCACGAAATAGTTTTGACAACATTAGTATACAATATGCATACATA TTTTCCCTCAACTGAGTGTGAGATGTTTACTCATTCAATTTTTTTTCTAA AAATTCATCAATAGTTAAGCGAAAATTTGTCCCATAAATATATTGCTATT CTGTCACATAATAAACTCAACAGGTCAATTGGTCGACTAGTGTATCCCAA TTATGATTCCACCCATACAGTGAGAAAAGAAATACAATTTGTGAGCACAT GTTTTGACTACTATCCGTAGGTGAATTTATGTTTTTTTTCTATTTCCCTG TGGGTAAATTAAACATTAAATCAAAATTTTATCTCATAGTTGCGTCTTTG TGATGACGCTGTCAAAATCTTTGTTCTTTTACCTCGTTACTTGCTTAACC ACCTAAAGGACAGAATGTATATAATACAAATTATTCTCAACCATGAGAAA CCATATCTCCGTGTTGCACGCTTCCAACTAGTGGTTGCATACACACGCAT ATCTTCATTTACTGGAAAACAAATACAAATTTGTCTATATGCAGGAGAAC CAGACAAATGTTGATGTGGTCCCAAGCATTTAGCAACATTCTATTGGCAT TTGCAGATACCTTTGGGATAAGTTGGATAAAAAACACTTTATATTTCTCT TAATTTCTTAATGCAATGAGAAAAATATAGGACCGTATCGCCTACACTGT TTAGGCACCTGTACCAAAAAAATTAGGAAAAAGAACTGAAATAATTATGT AAGTTGGATCAGTAGTACATATCGGGCCATTAATATCCCATCGCACATGT AAGTGGTCTTTTGTGCGGTTTAAGCGATCCTTTACGGCCCAATCTATCCG CCATCTGCCGGTGGCTGAATGAAGGAGGAACACATGTTTGGGTAAGTTTT TATCCTAGACTGCAGCCTGCAGGCTTCCCCCCTCAATCAAAAAAAGAAAA GAAAAGGTGCAGCCTGCAGGCTTGTAGCACTATGTGCTCTAAGTAGTGAT TTGAGTTGTCAGAAACTTGCAGTCTGTAAAAAATGCTACGCGTCCCTGGG AAGAGTATTTCTCTGTACATGAAAAAACAAGACGTGAAGCACGTGAGCTA GCGGACGCTGGGAGATGCTAGGATCATGCTACAGGAGCCACAAACGGTAT GCTAAACTTTGACGACCATTCAATAGCAACATGTGTAATTTGTAAAATTC AAATGCATTCAATTTGATGAATGTATTTTTTATCTATTTCTCTTTGGGTA TATTGAAATGAGTTCGAAATTCTATCATATACAGGTGCGTCTTTGTGACA ACTAGCACAATAGCCCTCGCAAATGAGTGGGCATCGTTTGGAAGTCTCTC ACAATGTTTGTGCAGTACAATAGAAAATTATATTATGTAAGTAGAATTAA TGTAATTCTAATTTCACCAGAAATACTACACTAAATAAAAGATTAATTGT GGAAGAATCGTATTTAATTAGTTTGCACAACACTTGAAACTTATTTATAG GTTAGAATTATTAAAGTTCTAATATCACCATAAGAACTGTACTAAACAAA TATTATTTGTGCAGGAAACATAGTTAAGCATCTTTAATTTATGAGTGAAT AATAAACGCTGCCATTAAAAATATCAATGACCATATGTGACATTACTACA TCGTAATAATATTCTATAAGTACATATCACCAAATTTGTATTGCAAACTA GGATATAGATTTTATCTATATTACTTCAGTGTGAGGTTAAAACTCGGGTT ATATCGTCCACTTTTAGATTGATTTAGAGTTTGAAAAAGGTATATGTTAG TGCCTACACAATAAGTTCTTGCTTGATGATATTAGGCATCTAAGTTCAAT TATTTATGGTTCATACTTTTTGTCAGATGTGGAGAAACTTACGGATATAT ATAACTTCATGTAGTTTCAATAATTATGGGGCAAGAGATCAATAAGTTTA TTTTCAATAAGCTAATTTATGAAGTACTGCAACACGAAGCTACCTTTTGT TGTGACTTCTAAGTTTTGTTGTCTAGCAAATGCTAAACTCCTAAGTTTTT TACCACACATTACATAGTTCATTATTGGTATTGGTAATTATTCTTTACAC GATCTAATTTTTTTTTTTCTCTTTTTTGGCTAATCAAGCGCATGAACATA ATTGTGATGTATTTGGTTGTCTATTCCCATTTTAAGGTGATTAGACATGT GAAGGAAAGGGCTTTTGAACACTATAAGAAGCACTTCTTGAAAGCTCGTG GATCATAAGAACAATACATCACAATAATGGTTTTGAAGAAATGTTTTTAA TTTATCTCATGATGCTGGTTTCTAGTAAATCTGCATAACTAATATGGTTA GAAATTCCAACCTTGGAAATAAGAGGCTTAGCCATTGCGACAACAAAATG AATGTCCGTATATCAATATATGATGTTAGCAAAATTGAAGTGATGAGCTT GATTGATTTATCAAAGTACCGCTCCAAAATAAAGAAATTGCTCTATCGAC TTTGCATTCACATAGAAAAAACTGCTTACCAGCTTGTGGTCTGAAACCAT TTGATTTGTAATCAGCTTCTCAAGATAAATTAGTAACAGGGCACCCATAT TATCTTTTGATAGTTTGAACTTCTCGCCTCCTATCTCTGTGGTTCAAGTC AAATGCCCAATGCAAGCATTCTTTTTTATGGGATGGCAGAGGATGCATGT AGTTGGTTTATTGTCACCACTGATGCCCCTGTTTATATCCTTGGGCGACT TAAGTTAGATATTTGTTATACTTCCATGCTCTATAATTTATGAAGCACTG CAACGCGAAGCAACCATTTTTTCTGTGTGTTCAAACTTTTGTTGTCTGGC TTTGACTTACAACTGGTATTGCAAACTTATAAATGCTAAATCCGAGTGTG GAGTCTCCATCTGGTATGTGGTTTGTTTTAATACCCTGTATTTTATCTCA TCCTTTGCTTCTTCCCTTGCTTTCCTTCTTGTTTATTGGTTCATCTCATC TTTTCTTCCCGTACATTTCCTGTAAGCTATGCTCCGAGTTTTGTCTGATA CTAAGACCTAGCTTTTGTTCCTCTTTGCTTAAAATCTCTTGTGTATCTAC AATCTGAATACACTTAACTTGGAGACATTGTTCAAGTGTTGAAAACAGGG CCGAGAAGGAGATGCTGGAACAAGACTCTGCTGCCAGCTCAAGTGCACAG TAACCAGTCAGAGTAGTGCTGATGCAAATGCTGGAGGTCTGGCAAAGGAT TAGAGATGTTGGGGAGGTTGCTATGCAACTTCACAATTAATAACCACTTA GTTGGTCTGTTGGAGGGTGCTTTTGGCTCTGCTTAGTTGCAATATGGAAA TTGGTTGGTGAATTAACCTGAAGTTTATGTTATGTGCCTTTATCTGACAA TAGGCTGGTGTGTGAGACATGGTAGAGAGAGAGTTAACGGTGTTTAGATT CTGCTGTTCAGTAGTAAGTTCATTAAGACTTTGTAACGAGTCATTGTGGC TGTAATAATCTTGTTGTATGGCTGCCAGTCTGTGTACGTGCTACAACTGT TGCATGGTATGTAGAAATCAAACCGTGCAGTGCTGATCCACTCTGCAGTC A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.