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GrainGenes Sequence Report: AE015557

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Sequence
AE015557
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE015557
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCCCACTGCCAATGGCGCTCTCCTCCTACTTGCTCGCCGGCAGCCGAG
CAGCCTCCCTCCCCTCCTTCCCATCCCTCCGGCCCCGCTGCAGCCACCAC
AGTCCGCCGTCCCTTGTCATAGCCCCGCTCCCGTCCGCCCAGAGATGGCG
TGGCTCGCTCCGCTTCTGCGCCTCCTCGTCTTCACCGCCGCCGGTGCCCC
CCGAGGACGAAGAGCCCTCGGACTACGAGGTAGTGCGATGTTTTATTTCT
CCAATTTGAGTGATGAGGTCTTGATTTATTGTTTTATCAGATTATTTGTA
TGCTGCTGCAGCTTCAAGTTTTCCCATCCCCAGGAGTCAAGCATTCAGTT
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CCACGCAAAATGAAAATGTAGGATAAAAAATAGTGCAATTTTTTTTGTCG
AAGAACACTCAATTAGGTCAACTGTTGATCTGAGCTATATAATTGGTCAA
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CCCCATTTCCTGTCATCTTCAAGGTTGTGCATTGGTAGTCTGACAGTAGG
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AAAGTTTAATATTCTATTTTTTATATCTAATTTTAGTGAGAGAACACTAT
GTCATAGGAATCCCTTAACACCGAAATATTTATTTTACCTGTATGTGTGC
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TACCTTTGTGTTTCACCCAAATTTCAGCTATCAGAGACGACGGGAAATTG
TGACCCTTTATGCTCCGTTGATGAAGTTAGCTCGCAGTATTTTGAAGCTA
ATTACAAGCCAAAAAATGATCTTGTTAAAGCTTTAGCTATCCTTGCAACA
TCTTTGGCCGGGGCAGCTGCGATAAACCATTCTTGGGTTGCTGCTAACCA
GGTCCATAGATTCGCAGTATTTTTTGGGTCAAAATTTCCTTTTTTTACCA
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GTTGAAATATTTCCTTTTACAGGACATTGCAATGGTGCTAGTATTTGCAC
TTGGCTATGCAGGTATCATTTTTGAGGAATCACTAGCATTTAACAAAAGC
GGAGTTGGGTTATTGATGGCTGTTTGCCTATGGGTTGTCAGAAGCATTGG
GGTAAGCTATAATTTATGGAGCCACCTTTGAGACTTGAACAACTCTTTTG
AGATTCAATTTATCAATCATCTCTCTCGAAATCAATTTAAGATTTGGCTC
AGTTGGACTGTCTTGATAACGGTTGATATGTACATACATCCTTAGATACT
TTAAATAGAGAGCAACTTACTCAATATGTTTATTTCTTAGTTTATCTTGT
TAATAAAAAGTTATGAACCTCCCTAATAATTCTTCGTGTTTGGAACACCA
TAATCTTAACACGAGGATGATTTGCATTTTCTTTCCATGGTATTCATTAG
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CCGATGTAGCTGTTCAAGAGTTGAGTCAGACTACTGTTGAAGTTAGTGAA
ATAGTATTTTTCTTGCTTGGTGCAATGACCATTGTGGAGATTGTTGATTC
ACATCAAGGTTTTAAGCTGGTGACTGACAATATATCTACAAGAAATCCTA
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ACTACCACGAATCAACAAACAGATAAGAGTTTTCAGTGATAAACCATGGA
GAGTTAGTACCAAAGTGTACTAGAGCCACTTCTTTTGAGTTTATAATAGA
CCTTTGTTTGTCCAGAGTCCAGACTAGATAGATATTTTAAACTTATGATA
AACTTATATTTAGTGCTCGCAAAAAGGAACTTACATTTAGTGACCTATGA
CAATAGATAAAATACACCCTTCGTACTGCACGTTATTCTACTTTGAAGGT
ATCTGTCTTTTACCTTGAACTGAATAATTCTCCACCCTGTTAATTCAATC
CAGAGAAAACCTTAAAACTTCCATAAAAGAAATCTTCCACCTGTCTCTTT
TTGCTAGTGTTGCACAGTTCTCTTTGAGATTACTTGTTCTCTTACCATCT
GTCGACCTTACAAACTAAGGCTTCTCTAATGCCAGTGACTCAGCAGATTT
ATTGTTGATATTTGTTTGTGTAATCTTATCTGCCGTCACGCTGTACCTAG
TCTCTAGTCCAGGTAATTTTAGTTGAGAAACTCTACCATCTTCAGTACTA
AGAATCCGTAGGTCGGCTGTCTCATGACCACCATCCAAGAGGATGTGCAT
TTGTGGGCCATACTGGCATTAGGGAGTTTCGCTTGATATTACCCGCATGG
TGTAATGGAGTGGCGTTATGGTGTAGCCTTCTCATAGTCATGCAAGTAAT
CTACCTGCTTATCAATGCGTCGAGATGCAGGCTTTGTGTTTCCCTGAAAA
GAACTGATCTATATGTTCATTACGATAGAAAGGTTTTAGAATGCCAGGAT
AGGCTGCTGTAACAGGACGACTGGGAGAGGGTTACAACAAATGGATGGAT
AACGGACACAACCTTGAAGCCCTTTACATTGGGCAGTGCACCATCCTTTA
AGCTCCCCTTACTCGCAGATTAGGAAGGCCAACTGAACTGCGATAACAAA
GCGATTCCTTCTTGGTGGAGATTTTAGGGTACCCTAAGTCAGTTCGAATC
TGACGAGTCGCAACCATCTTATTTGAAAGCTCATCGAGCGAGGTTCCATA
AGCTTTGGTAGATGCGTCGAAGGTGAGCTATACTGTTGAACTTCTTTCTA
AAGCTGGCAAATGATGGGCATGACCAAGCCATAGAAGCCTTGCCTGCTGA
GCCTGTACAGTACTTCTCCAGAGTCTCCCACTAATCTTCCAGCTCCACAT
AGACCCAACCCAAGTTGGAGCAAGTTAAAAGAAATATCGAGTTGCACTAA
AAAAAATAGCTTAGAGTTGCCCATGGCATCTAGATAGCCCACGGAAGGGA
CTGCACCTGGAAAGAGAAACAATAGACAGAACTAGCAGAGTACTTCCCTG
ACATTTCCAAGTCCATGAATCTACTGCATCCAGGAGGAGAGTGATATATC
TGTTTGCATCCTCAATATCCAAAAGAACTGAGTGAATGTGGTAATATTCA
GAGGATTCCTGATGTCTGTGATCCATTCATCCTCAGGGAAGGCTTTAGTC
ACCATTCGCTTGCGGTGGATGGATAGTGGGATGACCTTGTAGAGATTGGG
GACAAGGGATTGGATAGAGCAACCATTGATCGGTCCAGAAATGGCTACAA
GTCCTGCTGCTGATCTGGACATTGGCTTCATTTCATCTCTTTTTGGATCT
GTCTTTGGTGAATAAAAGAATGCCGTTGCTCGACTAGTCACTGATTCACC
GTGTAACCTTACAATACTAACCTTTTATTTCAGAGCCATTCATTATCATG
CTTTATTTTTTGACAAATTTTTTCGAATTTCAGATTGGCTTTGTAACCTT
TTTTATGAGTTCTGTACTCGACAACTTGACTTCGACTATTGTCATGGTGT
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TATTATCTCAACTGTTACCTTTGTATATAATTTGGCAACTGTTCTGCTCT
TATGCCATCATAGTTTCTGTCAATGATCTTATCCTTGTAATCTCCTTATT
TTCATTCTTTCCTTACTCTCTACAGTGTACACAGTAACAAAATCTGGTTT
TTAATCATCCCCGTATCGTATTTCTACCATTCTTTTCATTAAAACATATC
TGGTTCAGTGCTATACTTTCTCACACTCAAATTAGGCTCCGTAACTTTAC
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GACCTATTATTGACGTATCAAAGGTTAATTTTCTCACCGAATTTTGCTTA
AGCTGTGGTGATTAAATGTTTTATTGTAGAAATGCTTTCTTACTATCAAG
ATGATCTCAAGTTGAAATGTGGGGTTTTATTGCAGTTGAGTGGTTGGTCC
AACAAAATTTGAGTTCTGGAGAACTTTCTTGCATACTTTAAAAAGAAATT
ATGGGGTAAGCCTCCACAGTATTAATAGGAATCAAAATTTTTACTGCACA
TAGCACCAAGAAAGGGTTAAATAAATAGGAAATTTATGTAGTGCCAATTA
CCCTTCTGGCACGAAAGAGTAAAGCATGCTAGTTTTGGCATCAAATCTCC
CACGAAATTTTATAAAGGTTGTTCTAATGTATGACCATATGAAATTTGAA
AGTTGAACTAAAATAATAATTTCTTTATAATTAAAAGGAAAAATAGAAGG
GAAATGTTATTAGCTGTACAAACTTCAAACACTCCACTTTTATCTCTTGA
TGGTGGTATGTTGGTTCATTAGCTTCTCAGCTTGTTTGAAGAACTGTTGA
TTTGAAGCCAACTTTTTTTGAAGAATCGTTTGAGGCAACTTTGTGTAGCT
TGACACTTTCTCCAAGTGGTATGTTAGCACTTGATATTTTTCGAAAATTA
GGATCGAGTTAGAGATGAACACGACATCGTAAATTAGATCCCATTTTATC
TCAATAGGCTGCTCTACGGAACTTTTTCTCCTTCAATCCATCAATAAAAT
GGTTTGAAGGAGTGTTTGGCATCTTTAGTAATCATTGGCTTATTTGGACA
GATTGTTAGGTGCTGTCGTTGTAATAGCAGCTAATGCTGGAGGTGCATGG
ACACCAATTGGTGATGTGACAACCACTATGTTGTGGATCCATGGTCAGAT
AACGACTTTAAAGATAATGCAGGTCAGATTTGCACATTATCCTTGTATTT
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GTTCATCGAGTTTGTGACCTGCCATGCTATAACTTTCTACCTTACTGAAC
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AGAATATATGTCCGTAAGGGTAAACCTTCTAAAGGTTGATTAACTTAAAC
TGCACCGAAGGAGAACATCTGAACATGTCTCTTGAGAGATATAACTACAA
GATAAGACACAAAATTTATCTCTTTTTCTTCAAAGGCACTTATATTTCTA
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ATTTTAGGTGAATTGCTTAAATCAATATACTAACTCTAAGGAAGATGGTT
CCAAATCTAAATTTTCTGTAGTATTGGGATTTTCCCACCACAAAGAAGAC
ATTTTACTGAGTGACCCTCATGATCGTTTACGAGCAGTCAATCATTTTCT
GAATTTTTGTGTGTTTGTTTATTTTTCTGCATGCCGCTTCAGCAAAGTGC
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TCATTGATGGTCCCACTGGCCCTGATGTCCTTCACCAGGTTTTTAACAAA
GGACCACTTCTGATAATGACATTAAACAATATACTCGTGATGCCTGATGG
AATAATTTGTATATGTTCCTTGTAGTGAAGCAAATGGATCATCTCAGACA
TCTTCTAGTTTGCTGTCATCGGAGCAGATGGCCCCTCGAGGACAACTTGT
ATTTGCTGTTGGACTTGGAGCCCTATTGTTTGTTCCAGTGTTCAAATCTC
TCACTGGATTGCCACCTTTCATGGGGATGCTCCTTGGTCTTGGGATTCTC
TGGATTCTGACAGACGCGATACATTATGGAGAATCTGGAAGGCAGCGATT
GAAAGTTCCACAGGCGCTTTCACGGATTGATACTCAAGGAATTCTATTCT
TCTTAGGTATTCTGTTGTCTGTTGGCAGGTAACCACCCCACCACCACATG
TAGAAAAGCTCTGGGATCTTAAATTAGCGTAGCTAAAATCAGGTGGTGCT
AGTGTTGGCCTAAAGATATTAGGAGGCATTTTACCTACTCCCTCCGATCC
ATAATAATTGTCGTGGTTATCTAGTCTTCACTCTAAGATTGATACACCTA
AAGAAGATGTGGAAGGTAGTCGTAGTCTTTCACTGACTGGCGACCTAGCA
GTGTGAGGTTCTCCTGAGGGTCAAAAGCATCAGAGGCCCTGTGACTGTGA
GAGGAAAGAGCCTCTGGTGTCCGAGCTTCAAGAGCCCCCAATAGGCTTAG
CAAGATAGCTAGTCTCGGATATCCTATATGAAATTACAGTCAGATTCGCT
AAAAAACCTGGATAGCCGAATACGGTCAAATATTGCTCTCTTGTAGTCTA
AATTTCGGAGTTGGGATCCTATGTATCGGGTGGACAGATGAGCGGAAAAT
ATCCGTTCCATTTTCACCCTTAAGCAGGAGAAACGACAGGTGTAATAGCT
AAGTAAACAGGGCACCACAAACAGCCAAAACCGAAGAACAGCACCAAGAA
GATGAGTCTCCTTGGTATGAACAACTGCAAGGGCCTCCATCAGAGTCACT
TCTGCGTGCCAAATCCGCTTAATTTTTCTATTTTCATCGCAAAATTCCTG
TAATCATGAAGGATTTGGTTTAGGTGACATCATATGGTTCTAGCTCTAGC
GCCGCCAGTGGAGAATGGCAGGCCAGCAGCTGCCACAAATCTGCTTAAAC
TCAGCCAGAGGACCTCTCAATCTGATGCCACACTGTGGACAGCTGCGCAT
TGGACTTGTTGGCAGTGGCATCTCCCTGTTGCAGCGGCGACTCCTGATGC
ATGGGAACAAGGTACAAAGAACTGCCAGCTGGCTCGCAACGGTTGTGATT
TGTGAAGATGTGACCGCATCAACTTGCCAAAGAAAACCGAGTATGGAAAC
ACTCCACAGCATCCTCTATCTGAAAACTGGTTTTAGTAGCCTCCTCACCG
GGGCTTGGGTTCAGCAGGCGGATATGGCGGATCACTGGTGAGAAACTCCA
AAAGATGGCGACTCTGCATATAAATACGCAAGTGCAGACTCCATTCTCAA
TATTTGAGATCATCAAAGTTCACCATGCAGCGAACAACAGAACGGTGCCA
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TGGCTGCTTGTGAGACAATGGCTGCTGCAGCGAGTAACACTGGCGGCAGC
TGGCAGCACATGCGCCCTCAGAAAAAGGAAGCAGCGTGGCCACACTAGAG
GCGAGTGTTTGGGCAGCAGCCCAGGGAGGAAGATAGTGTCTCAAGGATGA
TGGCGACTAGGCAACGTCATAATGAGGCTGGTAAAGACCCACTGAGGCCA
CAGGAAGAACCACCATGGCAGCAACTATTAATCTGAACGAAGAGGACAGC
AAGCGGCAAGATGCGTGGTGGGGTGTTGGTGTGCGAGTGCAGGCGCACGA
GGGGTGGAGTCCCCGTGGCGATAGAGGCGGTAGGGACGGTGGGAGACGAT
CTAGTGTTTTGGGCAAGCGCTAAGCTCTAAGCATGCTTCAAGCCTACCAT
ACGGTGTTATGATTATTCATTATACGGCTATTCGGCCAATATATTACATA
CACGCACTGGTTTGTCATATCTGTAGGACATCTGTTGTGCAACTGGAAAA
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ATCTGACAGCTCTAACTCTCAGTTTGGTGCTATAAACTTGGTTACCCTGT
TATGGAGCGTGTTCTACTTTTTACAGTCTAATCCTTTGCCAAGTAGATAG
TCTTAATTTTCTAATTGTTGGTTTTGTTCTGCCTGTCTCTTGGCACTAGC
TTGGAATCTGCAGGAATTTTGAGGCAGTTAGCGAACTATCTTGATGCCAA
TGTTCCAAATGCCGACCTCATTGCAACTATCATTGGTGTAGCATCAGCAA
TTATAGACAATGTTCCACTTGTTGCTGCAACCATGGGGATGTATGACCTG
ACTTCATTTCCTCAAGATTCAGATTTCTGGCAGCTTGTTGCGTTCTGTGC
TGGTACGGGTGGTTCAATGCTTATCATTGGCTCTGCAGCAGGAGTGGCAT
TTATGGGAATGGAAAAGGTGGATTTCTTTTGGTACTTCCGCAAGGTAAAC
TTCTTTCTCATTCAACTCTTAAAGTGAGATGTGAAACAGCATAATAACAA
TTAACACAATCTGTTACAGGAAAAGAAACCTCATATTATATGATGTTAGC
AAGGTGTATTGAGTGCATTCTGATATTTCATTGCCATACTTTTGAATAAA
ATCACATTTCTGATATTATTTACTGCTGTAGCTTTCATAGAATTGAGAGC
AGAAGTTATATTTTGGACTGCAGCTTAGCTTAGAGTTTTTTCTTTGGTAT
GGCATTTTAAGAAAAATGCTTCCGGTTCTTCAAATGTATTTTAATTAATT
TGTGTAAAGCTGTGCTTATTATAGTTCTCTAGAGATGTAGGTTTTGAACC
AAAGTTCTGTTTGTTTGTCTACAGCATAGTTCAGCGACGCAAGCTTTGCG
TTTTCTCGGAAAATAAAACATAGTTCAGCGGTTGATGCGTGGCCTGCTCA
TTGTCCTCGATGTAGAAGTAGGTCAATTAATGTTGAAGGACAAGTAGAGT
CCCCATGTCCCCTTGATGACCTCAGGCTCAGTTCGGGTTGCTACACTGTT
TATTATCATGATCCCCACCTGTTTAAGGGTTACCAATCCACCAAAAAGCA
AGGAATCCACGCTTTTCATCTCACTGTTTTAGTATGAGGTTTAGTAAAAG
GACAAGAGTTGATGTCTTCGAGACAGGTGAGATTTGGATGATGATCGAAT
GCGAGTTCTTGTCTTAGGGTTCAAATGTTACATTTCAGAAGGAGTCTTTT
CGAATCGTCACCATGGGAAACAAAGTTTTCCACCAGAGTTCAAAACCTAG
TACCCTTGACTGTTTGATGTAGACAATAGATCGAAGGCAACTAAATAATG
CAGGGCCTGCATAATACACTACATACGACATTGCAAGCGACGCGTGTCCA
ATACTACAATGGTTTATGCATATGTGAGTTAAAATCGGTCGCTGACATGA
TACTTGTTGCGTTTGCAGGTGAGTGGTTTTGCCCTTGCAGGTTATGTAGC
CGGTATCATCACTTATCTAGCTGCTCAAAATATCCCTCTATCTCTACCCA
CTTCACTGGCAGAGATCCCGTTTATCACGGGTTCATGAAAGGTTGACCGT
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AAGAGAGGACATTTGCAAACTTGGCTCCTCATAAATACACGGGCTGAAAT
GGTCGAGAATAAACCGTGCCCTGAGCGCCCATTGCTCCAGATTTTGTGTA
CTAGTAGAATTGAAAGGCTCGGGATGCATATGCATTAAGAAGTTTGTGGC
AGGCTAGGGCAGAATGATGATTATGTAAATTAAGTCGCTAGTTGTCCATA
CCAAGGACAAACGCATTGGCCCCAAAACTCCTAATATCGGAGCTATCTAG
TTGTAACGACCAGGTTTTCTGGTAGAAGTATCATGTATGCTTTTGGAAAG
AGGGGAGGTGATCTGTACCCTCTGAAGACACAACAATACGATCCTGAAAT
TTTATCACTCGGTATGACTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.