Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE021987

[Submit comment/correction]

Sequence
AE021987
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021987
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCATACTCGACGAGCGCAGAGCGAAAGCGTCCCCTTCTCAATCTCCCTTC
CACCTCCTTCTCCACCCACCTGAAAGCGACGCCGGCGCACCGAGCACATC
GAACTCCCCCGTCCTCTCGGCACCCGGCTGCCCCCTCGCCCAGCGACAGC
GACCGCCGGTCGCTTCTAATGACCTAAGCATCCCCGTTCTGCGCCCCCCT
TTTCCCTCTCCTCCCGTCCCATCCCTCTCCGCCCTTATGACCTCTTCGTC
CCCTGCCTCAAACCCTAACCCCGTCCCCACACCACCCCCAAACCCCACAA
CCAAGGCCACTCCCGCGAGCGCGAACGCGATCCCCTCGTCGTCGCCGCCC
AAGGAGCAGCTGCCGCCGCAGAGCCAGGACGGGGTCGTTGCGGGAGGAGG
AGGTGGCGGTGGAGCGGGGGTAGATGGTGGGGGTGAGGGCGGCGCCGAGG
TGGCGGAGGCGGTGGTAGCGGGCGAAGCGATGGAGGTTGATGGCGGCGTG
GGAGGAGGTGGAGTTGCGGATGTGGAAGGGGGAGGTGGTGGTGGAGTGGC
GGGGGGAGCGCAGGTTACGTCTTCACCAGCGACCGTGTTCCGGATCCGGC
TCAAGCAGCCCCCCGCGAGCCTCCGGCACAAGATGCGCGTGCCTGAGCTG
TGCAGGAACTTCAGGTGTGCCCGCTTTGAGTCGCCGGAAATCTGAGAGCT
GTTTATAGTTTCCTTTTTTTTTATGCGACAAGTGGAAAATGTGTAGTTGT
GCTCTTTTCATACATTAGCGCGTAGATGGAACTGTGGTTTTCTTTTTGTT
TCCCGTGAATATGTTATGTTTTGGTAAAAATCAAGCTTGAACTCGGGTCA
CAGACTTAATGAGGTCACTCTTCCCAATCCCGAAAAAATTGGTAAACGCG
ATGACATCCATTTTAGAATATTCACATTTGTATCTCAAATGACGCATGAG
CAGATCTCTTGGAGTTCTATTGGTCATTCCATAGCTAGTTTGTCTGGAAT
TGCCATGTGCTGACACCAATTATCTGCCACACTATGGTGTAAGTGTAATT
GCTTGGTTAAACATGGTAATCTTTTGCAGAGTCTTTTTCTTGTTAAACAT
GGTAACCTTGTTGGAGTCAAATGGGCGAGTAATTCTGTGTTTTCTCCCGG
GTTTAGGAACCAATTGGTGGGTTGTGTTATCAATCCGCGCCTCCTCATGT
TTTCAGGAGCTCACAGTACTCTGTAATCTTTATCTGGTTTGACCTAAAAA
ATGTGATTGTTATATACCAGCTGGTGTGGTGATGAACTTGAAGTTATTCT
TCTAAAAAACTTCTAAGTTCCATGTACATTTTCCTTCTTAAATCTGATAA
ACACAGTGTGCTTACTCTGATTTGCTTTACCATCAGCTGAAAACTTGTAA
GTCATATTTTTTTCCTCATCTTGGTGGTCTTCCTATTGCAGCGCTGTTGC
TTGGTGTGGGAAGCTGAATGCAATTGCATGTGCATCAGAGACTTGTGCAC
GGATTCCGAGGTCAGATCTTCCTCTATCTATTCCACAGTCTTCGCTTGTC
CATGAAGGGACATTTAGTGGCAGGGTTAGGTAGTATCGTTAGCCATTTTG
ATATAGAGGTGCTTCATTGTTATTTAATCATTTCGTGGAAAAGTTCATTT
GCCATTTTTGCAAAGTAATGTATTGTATACTTTCAGCTCTAATTCAAGTC
CACCTTTTTGGATTCCTATACACATACTGAATCCCGAGAGACCGACAGAA
TGTTCTGTTTTCAATGTGAGAGCAGGTAAATATCTATTCATCCGTTACTC
TAAATTTTCTTGCATCCTCTATATAGCATTGGTAAATAAAATCCACACTT
ACAACTTCAAATCGCAAATATATGCTGTAATTTAATTATGTTTGCATGTG
CTAATTATCCCAAACCAGAACCAGTTTCTTGTCTAATTACATTGTTAATT
GGACAGATTCTCCACGTGATTTTGTTCAGTTCATTGAATGGTCTCCTCGG
TCATGCCCTCGTTCACTATTAGTGGCAAATTTTCATGGGAGGATTACTAT
ATGGACACAGCCAAGTAAGGTATGCAAACGAAGTCCAGATCGCATAATAA
TTCTTCTTGTGTGGAGGGGGTCTAATGCTATTTAATTCAGCTTTTCCGTT
GTTATTACTCAGGATTTTATTATCTTCATACATTAAATGCCATTTTAATA
ATCTGGTTAATTTCTTTTTGACATGGTGAAGGGCCCTGTTAATCTTGTAC
GTGACTCTAGCTCCTGGCAATGTGAACATGAATGGCGTCAAGATCTTTCT
GTGGTTACCAAGTGGTTGTCCGGAGTTTCTCCGGTATGTTGTTAGTGTAT
TACCTATATTCTGCTTGCCTGATAAGGTGTGACGTACTACCTTACGATTG
AACCAACAGTTTACCTGCACATGCTGTTAAGGGACCTGATTTCCTAGTGC
ACTTGTGTAGATTTTATCTCATTTGGCTGTTCATTATTTTTGTACCATAC
AACCTCACGTAGTTCTTGACTATATTATCATAACAAGAATAACAAAAGTA
GTGAATATGAGCCTATTCTAAGAATTCCTCCATAGACATTTAATTTAAAA
CTACTTTCAACATTTAATTAAAGGTCCAGCTTGCGAATGTTACAGCGCCT
TGTATGTTCTGTGTTTGATTACCTATTTAGCCTGACAATTACTAGCTGTC
GCTAAATTTCTTACTTTCTTTGGTTCTACAGTATAGATGGCTTCCTACAA
ACTCCGGTACTTCTACAAACATGAAAACCTTTGAGGAAAAATTCCTTACA
CAGCACCCTCAGAATTCAGGTTGGTGAGCCAAATGTATTACTTCAAAAAT
AATATTTTCTTCTGGGGAGGGGGGCTTGCTTTCAGTGTGTTTTATTTTAC
TCTGACATGACTCTGTTTACTGCAGCAGGATGGCCAAATATTCTATGTGT
TTGTTCAGTATTTTCATCAGGATCTGTTCAGCTTCATTGGTCAGAGTGGC
CTTCCGGAAACTCAGCAGAACCTAGATGGTTTTCTACTAGCAAAGGGCTT
CTCGGAGCAGGCCCCAGTGGTATAATGGCTGCTGATGCTATTATTACTGA
GTCTGGAGCTTTACATGTTGCTGGTGTTCCCCTTGTTAATCCTTCTACTG
TAGTGGTTTGGGAGGTGATGCCTGGTCTGGGCAATGGTATTCAGGCGACT
GCAAAGATAAATGCAACAAGCCCTCTTCCTCCATCTCTGAACCCCCCTTC
CTGGACTGGTTTTGCTCCATTAGCAGCTTATCTCTTTTCCTTGCAAGATC
ACCTTGTTTCTGAGGGTGCACAAACAAGAAAACAGACAGATAATGAGATT
ACCGAGGCTGCATCCATCCATTGTTGTCCAGTTTCTAATTTTTCAGCTTA
TGTCAGTCCTGAAGCTGCTGCCCAGTCAGCCACTACTACAACATGGGGAT
CTGGGGTTACTTCAGTTGCTTTTGATCCCACTCGAGGAGGAGGAGTCATT
ACAGTTGTAATTGTTGAAGGTACGTATATACAGCTTAATTCAGGAAATCA
ATCAGTACAATGCCATGCAATCTCAGAGGGACTGTTGTAATTTGCTCTGT
GACATGGCATGAACCCTACTCTAATGGGGTAGTCCTGTCCTTCTGATAAG
ACTCCATGTCCTTATCATCATACATCTCTTACGCGCATCTTCAAGAATCC
AACTATATATCTCGAGAAAAAACCCGAGGTCATTATGGTTAATACAGGTG
ACAGCCTGATAGGCCTCTGAATAACATATTTTGTTCTAGCTGTTTGTGCT
GTCTTGCTTACGTGGTTTGTGCCATGGTCATAAAACTCTTGATCATTTAC
TAATATATGTAGACTCTTCTCAGTAATTTTTTGGTCTCAGGTGTTGATAT
GATGCTATCTCAAGTATTATTAGGTGAATAAGTTCCTCTTAGCTATCTTT
ATTTTTTTCTACTGACAATCATTAAATCGTTGCAGGTCAGTATATGTCTC
CGTATGACCCTGACGAAGGACCTTCCATCACTGGATGGAGAGTCCAGTGC
TGGGAATCTTCACTTCAACCTGTTGTTCTTCACCCAATATTTGGAAGCCC
TTCTAGCTTTGGTGGGCAGCCACCTATGCAAACTGTTTGGTCCACTAGGG
TTAACAAAAGCATTCCACCAACAGAAGAACTTAAAAATCCTCAAACATAT
GTTCCAATGCCAACAACTTCAGATGAACGGAGCTCTTCTGAGTGCAGTGT
TGACAGGGCAAACAGACTTAGTTTTGATCCTTATGATCTTCCGAATGATG
TTAGACAACTGGCCCAAATAGTTTATTCTGCACATGGTGGTGAGGTTGCT
GTCGCTTTCTTGCGTGGTGGAGTGCACATTTTCTCAGGCCCAAACTTTGA
TCAGGTTGACAGCTATCATGTCAATGTTGGCTCATCAATTGCTCCTCCAG
CCTTCTCCTCTAGCAGCTGTTGCTTGGCATCAGTATGGCATGACACACTT
AAAGATCGAACTATCTTAAAGATAATACGTGTGCTTCCCCCCGCAATTCT
TAATGCTCAGACAAAGGTCAGCTCAGCTGTTTGGGAACGGGCAATAGCAG
ATAGGTATGCAACCCAGTTAATATGAGCTGATTGAAATGATATATTTCCA
TCTCACAGTTGTATTGTTTTGTCAGATTTTGGTGGACTTTGATGGCTGGT
GTGGATTGGTGGGACGCTGTTGGTTGCACACAGAGTGCTGCTGAAGATGG
TATCGGTAAGTAACTAAGTATGTAGTTTGTGCAGTTCAATTTGTTTGAGC
TGTCCATGTAATTTGAAGGGAAGTCAATCCTCTGCTGCACTGTACAATTT
CCACAACTGGCATTTTGGTTCCTACAAGTCTATATTTTAGGGCTGAATCA
AATGAAATTAGATTCTGATTTGCAGAAGTCAAAGTGATAGTGGTAGAAGT
ACTACTTACATTGTTCTCTACATAAACAAACTATATTAGGAGGACTCAGT
CAAAAAATGGGAGTATGTTCATGTTTCGTATGCAGAAGACCCTATTATCT
GGAATGGGGCAACTGGCTCGCAAGCACCATCTTGGAACTGTGCACGTGCA
TCTATCTCATCTTGAAATGTGCTTTTGCCTCATGCTCCATGCCTAGATTC
CTTATCGTGTTTCCTCTTTGATTCAAAGGATTTGCATAGAAATTTTGGAG
GTTCAAATCCTTAGAATTTTTTCTATTGTGGTTGTTTGATTTGCAGGATT
GAATCCCATATGATTTTTTTCCAAGGATTCCTTAACCCAATCTAACATCC
ACTCAAACCTCTTTTTTAGAATCCTTTACTTTTCCTGTGATAGAATCAAA
CAAACTTTGGTGCATACGAAATCCTGTAGGATTTGAGTGGGCATGACATT
GCAATCATAGTTTTTTCCTATTCTTGTGTTTTTAGAATCCCGCGAATCAA
AGATGCCTTTTTCTGCTACGACTTGTGACAGAATTTCCTGAGCAACTGCA
ATGTCTCTATTTTAGTATAACTATTTGTTGCATATGGTTTGCAACATGTG
ATTTGTACTACTCCCTCTCCGCCCCTAAAAGGATGTCGTAGATTTGTCTA
GATTCACATGTATCTATACACTAAACGTGTCTAGATACATACGAATCTAG
ACAAATCTATGACATCCTTTTCAGGAAGGAGGGAGTACTTAGGAAGAAAC
TAAAATCCTTGCTCTTTGTTTCAGTGTCACTTAACAGTGTGATAGCCTTG
CTGGATACGGACTTCCATTGTCTTCCAACTATGCAACAGAGGCAACAACA
CTGTCCTGTAAGTGGTGTTGTGGTTCACTATGCACAATGTAGCAATGACC
TTCAATTACTCATCAGATATTATGGACTTTCTTACTAGTATTTAATAGAT
GTGTCTGATTGCCTTCTTGAGCTCTTGAGGCAGTGCATTTATCAGTTACC
TTCTTCTACCATTTTTCTCCCTGCAATCACAAGGGAGATGCATATGCGTA
TACACACCACCAGCTTTTTTGCCCCCTCCCCACTCCAACACTTTCTTTAA
TTTAATAGAGCTTCTGTTCACTTCTTTTTGTAGTACTAGTCTTGTGATTT
ATATATTTACTACTCCCTCTGTCCAGAATTAACTGCTCACATTTGTCTAG
ATTCGCATGTATCTACGTGTCTAGATTCGCAGTTAATTCCGAACAGAGGG
AGTATTTCTTGAGTGAAGAGTGAAATTACATCACAGAAGTCATTGGAGAG
AGAATATGGCCCGCTTCACGAAACACTTGTATTTCATAGATGCTTGGATT
GTCATGTTACATTATAATTAGGGGTAATTTATATGCAAGCACCTAATAAG
CATTGGTGGCTAGCACCTTACATTACGTGGCAAGAAAGATGGTTTTCTTG
GCACATGGATTAACCTATAAACTTTCAAAACCTTACGATTGGTTGATTTA
CTGCACGCAGGACCTCGATAGGATCAAGTGTAGGCTGTTGGAAGGAACAA
ATGCTCAAGATGTCAGAGCACTTGTGTTGGACATGCAAGCAAGATTGCTT
CTGGATATGCTTGGCAAGGGAATAGAGTCTGCCTTGATAAATCCATCAAC
TCTGCTTCCTGAACCCTGGTTAGCTTCTAGTGATATGCTGTCTAACATTG
AGCCTGACAAAATGACTGTTGAGCCAGCTCTACTTCCAAACATCCAGGTC
TACTTTACTTCCTGTGCTTTCCATATCATTGTCATTTAACTTAAATTCAA
CTTGCTATTCTTCATTGTTTTTGCTTTTATGGACTTGGTACGTGCGGAGC
ATTAGCAATTTGGGGACTTCTGTTTACACTTGCACGTAAATGGCGTTAAG
TTTCTTTTATTGTGAGCATTGCTTTCCCTAGGTTAGGTGAAACCATGTTC
AGCTCATCAACTGCTTCTTACGCTCCTGTCTAAATTGCCTTAATATATAT
TAACATAAACTGCATGCGTAGAAGCTTTGCGTTATTATTTGGTGGATTAC
TTATCCTTCTAGCACTGAATGCAGGGTTATGTTGATGCTGTTCTTGATTT
AGCATCACATTTTATCACACGCTTGCGGCGTTATGCAAGCTTCTGCCGGA
CTTTGGCTAGCCATGCTGTAGGAGCATCTTCTGGTTCAGGCAGTTCCAGG
AATATGGTTACTAGTCCAACCAACAGTTCTCCATCACCATCAAACAATCA
AGGTTAATTTTTTAGTTCCTGCTATTTGCTAGAACTTTTTGTATTCCTGT
AGTTTGTGCATAACAGAAGCACTTCAAAATATATTGTATGTCATTTCATG
TTTTGCATTGCTGAGTTGCTAGTATACTTTCCCATTTAGCATTGCTGCTT
AGCATGTGATACTCTCCCCCTGCAATTCACAGGTACTCAAGGTGGAGTAG
CATCTGCGTCTGGGAGTTCACAGATGCAAGAGTGGGTCCAAGGTGCGATC
GCTAAGATTAGCAACAATGCTGATGGTGCTGCCAATGCAGCACCAAATCC
AGTTAGTGGGAGGTCATCATTTATGCCTATCAGCATTAACACCGGGACTT
TTCCTGGGACACCTGCTGTTAGACTTATTGGGGACTGCCATTTCCTTCAT
AGATTATGTCAGTTGCTGCTATTTTGTTTGCTTTTCCGGAGAAGGCAATC
GCCAAGATTACTCGCAAACGCACAAAAAAATCCTGATTCTGCCATGCAGA
AAATACAACACTTGATGAACGGTAAGATGGAGGACAATAGTTCCGCTGTT
TCTGCAGTAAGATCTGGTCTAGGGGCTGCCAAAATGGAAGATGGTCCAAC
TGCACGTGGACAGTTGGTTCTTGGAGCAAAGGGTCTTGAAGAAAATCCAA
TGGGCAAGTCTGTTAGAATTGGTTCTGGCAATGCTGGCCAGGGTTATACG
TCGGATGAGGTACTTTTGATATCCCTGAGGTTTTTTGTTTGTTAAACCGC
GGTAACACACGTTGTTTTGAGAGAAGCCAAAATGTTGGAGAGGAAGTGGA
CCGCGAGGGTGTGCTCACATTTGAGTTTACCTCAGGTGGCAAAGTTAAAT
CACCTACCAAACAGGCTATAGTTATTATTTTATCTGAGCAATTTTGACCG
ATGACAATTATACATTCCTGAACCTATAACTGCTCATTCTATTTGAAAAT
GAATCTCTAGCCTGTCGTTTATTGACTAACCATGTATATATAAGCTACTG
CATGGTGTGCTATATCTGATCGTTATCTGTGACCTGCGAGTAGCTAACTT
GTTCAGAGCTGCTGCAAGACTAGTAATAATAATGATTTGGTTGCATAATT
ACGTAGTATACATCTTTATCAGTGATTTGCCTCACATGCTTCTGTTTCAG
TTTAGTAATTAAGTCCGTTTGTGAAATACTTGGTTGTGTAGCACACTTAA
TATGTGATGACTAGATACTTTGTTTCATCGTTGCAGGTGAAGGTCCTTTT
TCTCATATTGGTTGATCTTTGTCGAAGGACGTCAAGTTTGCAGCATCCGT
TACCTGTTTCTCAGGTTGGCACCAGCAACATTATTATAAGGTTGCACTTC
ATCGATGGCACTTACACTGTGCTCCCAGAGGTTGTGGAAGCATCTCTTGG
TCCCCATATGCAGGTGCAGTGCAAATTTCTCATAAAAGGCTCCGCCGGTT
GTATTCTGTGGGTTTCCAACTTTTGAAATAATACGAGATCAGAATAATGG
TTAATCGTCCCATCGGAACAAAGATTTTAGTATTCAGTTCTGTCCGTGCC
ACTGTAACTTGCCCATGTTAATGATGCATTGAGCCCCTAAAAGAACACTT
GTTATGTATTTTTGGTTACTATAGTGATTTCGGTACTTGCAAGTTGCAAT
ACTTGATTCTACTAAACTAGTGCTGAAGATAATTAAAACCACATGAAATG
GTATTGGCAAATAGCTAGGGTGGGCTGGGGTAGGGTCCATGAACCTGTCA
CTACAATGATGCAATCTACTCTTAGAACCCCTTCTACCTTTGCCTGTAAC
ACTTGTTAGGGGTGATAAGCCTCATTTTCAGCGAACTGTGGTGAAGAGGT
TGTGCACTGATCTGAATATGCATTGTGCTGTATGTGCATCCATTTAATTC
TGTAATTATTGCAGAATATGCCTCGTCCACGAGGAGCTGATGCTGCTGGT
CTTTTACTTCGAGAATTAGAACTGCAACCTCCTTCTGAAGAATGGCATAG
GCGCAACATGTTTGGAGGGCCCTGGTCAGAACCAGATGATCTTGCTCCAT
TGGATAATATGCCACACCTGAAAATCGGTGGTCATATCAACCCTCATTTA
TCTGACATGGAAGAGGATGGCAACACTAACTTGGGGATTCAAAGTCTTTG
GCCAAGAAAGCGCCGGATGTCTGAAAGAGACGCAGCATTTGGTCTGAAAA
CATCTGTGGGTCTTGGAGCTTATCTAGGTGTGATGGGGTCTCGACGAGAT
GTTATCACAGCCGTGTGGAGAACAGGTCTTGATGGTGAATGGTATAAGGT
GAGTATGAATCGCTTCACATTCTAGTCTCATTCAAGGGTTCTTAGACAAG
ACTTGTTAGTGTATCCTATCCAGTTTATGTGTGCCTAATGGCCGTCCTCT
CTTTTGCAGTGCATACGGTGCTTGCGGCAAACTTGTGCATTTGCCCAGCC
TGGTGTCCCGAACCCTGCAAATGAACGCGAGGCATGGTGGATCAGCCGGT
GGACCCAAGCTTGCCCAATGTGTGGTGGGTCATGGGTGAGAGTTGTATGA
TTGCTGTCTCCTCCTTGACGACGCTGATTCTTCTCTGTTGGTAGCTTGCT
AGGCCATGCGACAATTTTGTGTTGAGGCCCCAGATCTGTTATTTACCTGC
AGGCCCAAAGCAGACAGACAGGGCTTAGCTCTAACGGCTGTGTAAAAATA
TAGTTGTATTATTAGGAGAGAGATATTATGCGTTCATCATGTGTACAAAT
GTATCACAATGTAGGAAGGAAGCTGTTAGATGGGTTATGCATACTGCCTG
AGTGCCTGTGTTCGTTGTAGCTAAACTATAGCGATATGGGTGTGATGATT
TCCCCTGATACTTGTGGCACTCGACTGTTTGACAAACAAATTATGTGGAG
TTCCTGCAAATGTTATGTCATGTTCCGAAGCTGATGTTGTTCAATAACAA
GTTACCTGGCAGACATCATGTATCTCAGATCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.