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GrainGenes Sequence Report: AE021517

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Sequence
AE021517
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE021517
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCTGCCCCTTCGCTTCTCCGATTTGCCGTCCCCCGTCTCTCCTCGCTGC
CGCTCGGGCTCGGCGGCTGAGAGAGAGAGAGAGATGACGGGACTACGAGG
CAGCGGTGAAGCGGCCCCTGGGGACTATGTCTACTTCAAGTCCGTCGTCC
CGCTCCACAAGATCTCTGTAAGCGTCATACCTCCCGAATCACCCTCTACG
ATCTCCCTGTGTACCCACGCGCGCATGGACTCTAGCGCGGCGTTGGGGCG
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GATCGCTCCGTTGATAGGCTAAGACTAGCAATTCAAAGGGGAATCGAAGA
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GCCTTCTCTGCAACATTGTTTTAGCATCTTCCACATTGTCTTCTATGAGA
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CATAGAGAGCCATGAGTGCCATTTCTTTGGTTGGGCAAATGCCATGCGTC
TGAGATAGTTTTCCAAACATTGGTTCACTCTCTCAGTCTGACCATCAGAT
TGAGGATGATAAGCAGTACTGAGATGCAATTTAACCCCTAGAGCCTTGAA
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TAGGAAATCCCTCCACAAAGTCCATGCTTATATGAGTCCAAGCAAAAACA
GGAACATGAAGTGGTTGTAGTTTACCAGGGTACTTGTATGTTCTGGCTTG
TTGATTTGGCATATCGGGCACTGCTTGATGAATTGCATGACAGACTGCCT
TATGCCAGGCCAGTGGAACAGTAGTTGCAGCATATGGAATGTTGCCCTTT
CTCCTGAATGTCCTCCCATTTCAGACTGGTGGAATGCAGTGATTAGTTTG
TTCCTTAATTTCCCATGAGAGCCTACCACAATCTTGCCCTTGAATTTTAG
AATTCCTTTTGCTATGACATAATTCTCATGAGAAGTGTTGTCAATGGCTA
ATTCTGTCAGAAGTTTCTTGCATGCTTCATCATTTTCATAGCTTGTTGTC
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GTCAGTTCTGATGACTACAGAGGTTGCTGCAAAATAGTGTTTCCATTTTA
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TGGTTGAGCAAAGTTTGACATTGCTAGGACTGGAGCATTTGACATCTTCT
GTTTGAGTGTTAGAAAGGCTTGTTCGTGTAAGTCAGACCAGGAAAAGGAA
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GCTTTGACCAAAACTGCATTTTTCCTTTTTAGCATGCAGTTTATTTTGCT
TGAGGATCTCCAGTACCATTGTCAACTGATTTGCATGGTCAACATCAGTC
TTACTATAGATTAGAATATCATCAAAGAAGACCAATGCAAACTTCATCAA
TGCTTGAAAGGTTGCAGGAGCATTAGTTAAGCCAAAAGGCATCACTGCAT
ATTCATAATGCCCCAAATGTGTGCTAAAAGCAGTTTTTGGAATGTCACTT
CCTTTCATCCTTATTTGATGGTAGCCACCTCTTAAGTCTAGTTTGGAAAA
TATTCTTGCACCATTAAACTCATGTAGCAAGTCTTCAATCACAGGTATAG
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GCTGAGGCTAGGCCTTACGACTTTTGTTCTAATCATTTTCTTGATGATTT
CTTCCATAGCATCTTTTTGGTGATGGGGTAGCCTGTAGTACCTTTGATTG
ATAATTTTGGCATCAGGTAGCAGTGTTATAGCATATTCACAGTCTCTTTT
TGGAGGCAAACTAACTGGTTCAGAGAAAACCTCAGGGAATTTATCCAAGA
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AATCCACTTGTGCAACAAAAACTGCAACCCCACATGTTTGCTGTTCCATC
ATGAGGTTAATATTTGCAGTCTCTTGCATTGTGACAGTAGTTGGCAGTGA
TTCATCCCAGAAGGTGAGTACTTTGTTTTCATTCCCAGTAATTTGCATAC
ACATTTTCTTGTAGTCCAATAAGACTGGACTGTGATGTTTGATCCAGTCA
GTCCCAAGAATCATGTCATACCCATGCAATGGTAGAACTTTGAAGTCAAA
CCTCAAATCCTGACCTTGAATGTTGTATTGGGTATCAGTTGTGTGGAATT
TTGTGAAAAGTTGTGCACCATTAGCCACCACTACTTTCACCATTACTTTG
AATGTTGGGAATGAGTGTGCTGTTTGCCTATCTTGACTGTGATGTGTAGC
AACAAATACCTTTTCAAGGTAGAAAAGCAGTTTATCTTGACAACACTAAC
AAGCTACCTGTCTCACCAACAAATAGTTTTCCTCTTCCTCTGCCATATCC
TCCATGTTATCCTGAGCATGGGCAGCCCGTTGTTGATCAATTTTAACCTG
GTTGTTGAAATTTGGATGCCTGTACTTGAGAGTGCCATCCAAATTCAGGT
CTCTGCCTAGGTGGTCTTGCAGTCTGCTAGAGCCTCCCGGAGCAGTATGA
GGCCTGTCAGATTTTGTGGGTATCTTGGGCATCACACCAGTAGGATTTGC
TGGTGGAGTGAGAGGAATAGTACTGCTTTGGCCTGAAGGAAGCTCATTGT
GTTGAGCTGCTTCTGTAGCGGGAACCAGAGTTGCTTCTCCTTCCATGGGA
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TGTCATTGTCTCTTTCTCTCCGCAAGTTCTTCACATCTAGTTGCAGTAGT
TCGAGTTCTTCTGTTGATGCAGAATCCGCTTTTGACTCCATGTCCGCAAG
TCGTAGGAGTTAGGAAAAAAAATTTGGGCCATTTCTTTGTATTTGATAGG
AGGCTGTCCGAAATTACTTCCCAATCTACCGCTGCCGCACCGACGCCAAC
ACCACCCGCCTCCGATTGACACACGAGCAGGGGTCTGCAATGGATTTTAC
CACTGCAGAAGTATACTATAGCAACCAAGAGATTACCTGTGCTTGTGTCC
GAGCTGTGCTGCCGCCGCCAAGCAGAGAACCATAAGGCTCCAGATACCAA
TTGATAGGCTAAGACTAGCAATTCAAAGGGGAATCGAAGAATCACACAAC
ATCAGGGGTAATTCACACAGGAATTGGCCACTTGCAGAGGGCAGATTATC
TAGGGTTCGGTGGCTGATGGGGATATGCCAAAGGGGGTATGCCCAGCAGG
ACGTTCCGATTGGGCCGGAAGGCCTGCGAGTTCGTCTGAAAGACAGCGAC
TGGACTATGAAGAAAGGAAAGGCCCAGCGACTGGCGACTAGAAGCCTAGA
AGCGTAGCAGAAGCCCAGTCGGACTAGGTCAAAAGTCTCCGGATCCTTAT
CTTGTTCGGGGACAGCTTGTAAACCCTAGCGAGGTGCTTCATATATAAAC
CTCCCTAGGGTATCCTGGGACCTTACGTTCCATCATACACGCCCTCAAGC
GACTCGCTGCCTAGCCGCCGAGCTCGCCACCCCTGTAACTCGCTCTCTCA
TAATCTAATCTAGCAGGAGTAGGTCGTTACCCTCCGGGGGGCCGAACCTG
GGTAAACCCATGTGCATCCGCCCCCATCTCGCACCGCAGATGGCCGCCTA
CTCTTCCTCACGAAACACTCAATTGCTGCCAGTGGCAGCGACTGCCGTGG
CCATTTCCACGTCAGTGGCTTACAACTAGGAAGTCCAACCTCTATCAGAG
GCGGCTAGGGTTATACCCAGTACAAGAGATAAGATGAGCACATACGCTCC
AGATCCATGGCTTTATAGCCTCACACCTTACAAGTAAAAGTACATGTTGT
AAAGCTAAAAGGTAAAAGATGAGATGGCATTAAGAATATCCAGATGAGGT
AATTTAACGAGAGCCGTTGATTGGCTATCGTGCGGCTGCGTACCGGTTCA
GGTATCAATCTATCAGAGTGAGCCTGACATCCATGTTGTTTCAAGTTTGA
GCTTAGGATTTGTTTTTTTTGGGATCTGTGCTTGACTTGTCTTGGATGGA
TGGGTTGTCTTAGATGGATGGTTGCTGCAATTATGTTTTACGGACTCGGT
TTTTGTTTTTCCCTGGATGGATCGGAGATATTCACATCTTTCATCTGTGT
TTGGTTCAGGTTTATCCTTAGTTGATATTCTGATTCCATGTGATGCACTT
TCTCTGGTTTTGGCTTAGACTATATTTGAGGCTTAAAGTATCTATGCAGT
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TGGTCTAGTCATCGTAGAGCAACTTCAATTGTTTGGTGCCAGGCTTTGCG
CATTGGAGTTTAGCTTCAATTTCTTAAATTATCCCCCCTACATTCCTGAA
TGCAGAATGTTTTAGGAATTTGCATCTCAATCCTGACACGTGAGTACTCT
GTTTTTACTTGGTAAAATCATAATCTGTCATGCTTGCCTTTTTGAAAAAA
CAAAAAGGGAAATATCCCTTTCTTATGTGTTTATTGTAAGTCGAGTTGTT
TCTGAATTTTGTAGATTGGATCAAAATTGTGGAGGTACTATGATTTTGGC
CCCAAGGCTGTGCAACCCCTTATCTGCATCCCAGGAATCGCAGGGACGGC
TGATGTGTACTATAAGCAGATAATGTCCCTCTCTATGAAGGTGCATACAT
TAAGGGTGAATGTGTCCCGTCTCTTCTGATTTTGATTAGCTGTCTTGAGT
GTTCGTATCGTTGTAATTACCTGCAGATGTTCACATATGTGATATGCAAC
CCTTATGTTGACATAGGAGTATATGTTTATGCTTCAGTTTCTAGCATCAG
GGGTTATTGATTTCTAACAATATGTGAACATTTCAACTACGCAAAATACA
TACACCCATATTTCATTTATTTACATAAAGAAACAAGTACTTTAGCAAAT
TTTCTACCTTGATATTAATCATGAACAATGACATTTTTTATTTGGAATAG
AAATGCCAAATTTTAGTATTTGTGAAGATCTGAATACGTTTGAAATATCT
CTGTGTCCGTGCAAACAAAAAAAAAACTATGTGTCCATTGTGATATAATG
CTCTACAAACTGCAGTTTCATCTTTTGGTTTGTTTGAGGGAAAGCACATT
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ATATTCATGTTTTTCAATACATCCAAATTGTGGCGCACTATGAAGTGTCT
CACAGCTGAATTTTGACTTCTCTATTCTATGGATTTTACTAGTTGCTAGA
TGCATACTAGACTGACATAACATTTACGTCTTAATTTTCTTTCAGGGTTA
TCGAGTGATGTCTATCGATGTTCCCCAAGTATGGAATCACCATGAATGGG
TTCATTCTTTTGAAAAGTTTTTGGACTCCATGAATATCCATCATGTAAGA
AAACATCAGCATTTTTCTTTTTTATGAGGCTGTTATCCTAGTAATGCGTC
ACATTCTCATTATTTTCCACTCTTGCTTAAAGTTGGGCACACATATTTTC
TATCCGATGCATTTTCACTTCATGGGTGTTCCTGCTGCACCTATAACGCT
GAAGTATTTTGTACCTTTTCCCAACATTTTTGTTTGTAGATCTGGAAAAA
CATTAGAATGGTATAATGAGCTATAAATATGTGAAATTAATTTAATTCTG
GCTCCTATTTATTCTTGAAATATGCATGTTTTGATTAGTAAAAATAGGTA
CAATATAGCTACTACCGTTTCAGAATATAAGGCGTTTTAGGTAGGCTAAT
TAGCCTATCTTATATTATGAAACAATGGTAATGCTTGTTTTCGTATTATC
CCCTCAAGAGATGGCTATAGCAGGGTTGTTTTCATAATTTAATTGTTTAT
TCTATGAAAAATTATATTATTTCATTTATTTATATTCCCTTAACACTAGT
AGAGAAACCTTTATAGGCGCCGAACGTTAGTGGCGGGGTGAGAAAATGTA
AAGCCGCGGGTAACGCCCAAAATTACCGCTGGTGTGGTGAGAAGGGAAAC
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ACCTCACCTGGCATCGCCGGATTGATGCGTGTAGAGCGCTCGTGACTAAG
GCGGTCTGCTTTATTCGATGACTTGCCGATTCGCGTGCCATTTTCAATGG
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TTTCGCCTTTTGCCAGTAGCCACCGATAGGAATGCCTTAGCCTGTTTATC
TGCCGCCTAGCAAAGGGGAAGCGGATGAGGATGTGGATGGGATGGGCGAC
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CGACGGCTGCTACAGCGAAGAAGGCGGCCGCAACGTGAATACGTATGTCG
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TCCGCTAGGCTCGCGGAGCGGTGGCGACGACGCTCAGCCGCCGGACTTGC
TAAGTGGCTGCCGTGGAGGTGGCTATCTACGGCTTCGGAGGCAGGGTCCG
TGGCGAGGGCAGGACATTCATCGAGCTCAGCGATGATGATGCACCGAGTG
CCGTCGATGAGGCCCTGACCGCCGGAGATGAGGGAGCACGAGGAGGCGCG
GATGCAGAGCCTGAGGAGCTGCGCGGTGCGGCGGCGAGGGTCAACAATGG
CAGACTGCCTTATAAACCTTACCGCTGACATGTCCCCTCAGGCGCGGCGG
CGAGAGCGCGTCAACTCCTCTCGCTGCAGATCTAATTCGGATTAGATTAG
TTTGAAGCATTTTAAATTAGTTGTAATGGATTGTAAAATTTGAATATCTC
TTAAGATTTGAATAAGATCTGCCGATTTGAATTAATCACCTATAAATTGA
ATGCTATAGACGCTCAGCCGTTGATTCAGCATTACTGCACAGTTCGATCT
GCCGCGTACCAACCCCGCACGCCACTGTTGGCGCAGCGTGCTAGCGGCGT
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CTGCGGGTACCCTTTGTTACCGGCCGCCTGTGACGGCACGCTGCTGTTAC
ACCTTACCAGTGGCGCCGTATTAGTAGGGTGGCGTTTGCCCACTGGAACG
GCGATTTTGCAACGCCGCCAATGAGTCTTTTTCTGCTAGTGTAATTCCTT
AGGGATTCTTGTGAAGTTCAGTGGTACTGACACGTATTCAACCATCTTGT
GAGGCAGGTTCATATTTATGGTACATCTCTTGGTGGATTTCTCGCACAAA
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TTATTATAAACTGGTCGTATGCCTAGTATTTGATTATGTTTAAATGTCTA
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AGCTGGAAATACATCTCAAAAGTAACATGTATGCTTTCTTTTATTAGAGT
ACGACATACATGACTTGTAAGGTTGATCCTGAGCTACAATGATTTCTATG
CTTGATTTTATTTTAGAACGCACTTACTGGATTAACACATTTGTATATCT
GTGAAAGTGTTACAGTTCTACCCAAGTTAATTGATAATAAATGATTTCAT
CTGTGTACTGCACAAATCAAACTATTTTTGCCTAAGTTTTACAGATTCAT
GGTGTATTTCAACATTTGTACTTCTTAACTCTTGAAATTTGTTGAGACTT
ATGCATTTTTTTTTGAATTTAATATAAAAGGTTGGTCCACCGGAGCTCGG
TGTTAAGAATATGCAACTTGCATTTCCATGAGGCCATAGGCCGATATATA
TATACACGTACAAGTGTGTTAAATATGTAGAAAACCCTTACGCAATGGTG
ATAGTACTCAATTATGGCGTGGAAAGTATATACTTTATTGCTGGATGTAC
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TTGGACCCCTTCGTTTTTGCTGAAGAGGTACCTCTTGACAGGAATCCAAG
ATGGTCCACAGGAACCATTCCTTGCTGATTCTGTGGATTTTGTTGTGGGT
CAGGTCGTATCACGTTTAACACTTATGCATGTTGTACTAAATATAAATAA
TCTGAGTAATCGATCGTGATGCTCTTCTATTTTTTCCTAGTTTATCCTTT
TGTAATATTAAACTTCTGCATGCCAGGTAGAGACATTATCAAGAGAAGAC
CTTTCATCAAGGTTGATGTTAAATGTTAATGTTGCATCAGTCGGATCATT
GTCGCTACCTGATTGCTTCATTACTGTAATGGATGTAAGTACCTAAGTTC
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TTTTTTGCTTATGATTTTTTAAATTGTCTTTACCATTTTACTTCATTCCT
TTGATTTCGTGTAAGAGTTTTGGTTTTCCTGTGGTCGTTGGTTAAATTAA
GATTGATAAATCAACTCTTAACCTCTGTGGCTACATATTGCTGAGAGATA
AGCATGTTAAACTTTCCGTACCATACAACAACCTATTGCATTTGAAACCC
TCAATTGATAAGGACTGCAAAGGCTGGTTCTCTCTACAATCCATTAGTTT
TGACACTCGGGCATCCCTTGTATCATAACTATGTTCAGTGATTATCTATG
CATAGACAAACGACTACTCTGCTGTTCCTCAGCAGTTGAAGGACCAAGTG
AATGAAAGGTACCCAAGTGCAAGACGCGCGGTACTGAGGACTGGTGGTGA
TTTCCCCTTCTTGTCGCGTCCAGATGAAGTTACTTTGTACCTGCAGGTAT
TGTCAATTATTTTATATTTCCTCTTAATTGTTAATGTGGACCTTTCAAGA
ACAAATTAGAAAAAAATTGGCAGCTACACATGAGGCGAGTTGGAGTTAAG
CCAAGACCAGATCTGGTCCAGGGCTTCACACATGGTGGTAGCTCCGGCAG
CTCAAACGATCACAAAGATGGAAACAGTTTTGATGACCGTCCCAAAGATG
ATGGGGATCGTAGTTCAGGCGGCGGTGACTGTGAGATGGACCATTCTGAA
TCAGAATCACCGTATTCCAATGAACCGACACCAACGAGCATAATGCTTGC
CAATACCATGCTAGGTACGGCCAACTCAGCTCAGCATGTTTCACTATTAT
GGTCATGATGCATCATTGCTGTAAATCCCTTTTGTATAGTTCTGCACTCG
TCTTGTGGAATATTAGCAGAGTCGTGATTGGCGCACCAGCATTGGAACTG
GTTCTTCTGTCTTTGTCACAGCTGCTAGGAAATCGCACATCAACTGATGG
AAATCCTTTATATGTTTGTATAATAGTCTTTTTTGTCTTTGTGTATCCAG
ATATTATGTTTGTTTGTTTGTTTGTTCGTTGTTGGGAGTGGAGATTTTTT
TGGCTCCTGAGCTCTGGTGCTCTTGCTATTTAAAAAAAAAAAATCACAAT
CGTATTTTTGAGTTCCAAGAATTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.