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GrainGenes Sequence Report: AE047271

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Sequence
AE047271
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE047271
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGTTATTTTAGACTAGCCATCCAGCCGCCGCGGCAATCTCCATCCACCT
CCCCCCTCTTTTGACTCGGCCGCCTCCTCGCCCCCACCAGCTTCTGTCCC
CACTGCCCACGCGCGCACACCGTCGTTCTGGGAAGAGGGCCTCCCGCGGT
CCCGCCCGAAGGATTTTCCGTGGCGTGCTCCGGGGTCGATGGGTATAACG
GAGGCGACGGTGGTGCACCACGCCGCGCTGGTGCTGGCCGCGCTCTGGGC
CGCCGCCTCCGCAGGGTGGGCGCACCCGGCGCTCTTCCTCGCCGCCCTCG
TCTACCTCTTCGCGGTGAGTGCTCTCTCTGCCACCCACCCACGCACCTCG
CACCCCTGATTGCCTCGCATTCATTGATTCCGGGTGGTCGCCATGGTTCC
TAGGAGCTTTAACCTACTCCCCCACTTATCCCAACGCCGAATTAATTCCG
TGCTCTGGTCGTTCCTCCTGACGCTCTGAATTCTAAACTGGAGCTCCAGC
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GTCTCCTGTATGTATTTAAATGTCCAGAGGCCATTCTTGACTACCTGCAC
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TTCCATTCACACCAAGATTCATATTCAGTAAACAGCTGGATTAGTTACTA
GCATTAGCCATCATATGTGTTCGTATTGTGTAACTGTTACACATGTATTC
TATTGCTCTGTTTCTACTTAAAAAGTATTTAATTCGATGCGTTGGAACAT
TTCTTAAAAGTATGTATTTCTCAAGATGCATGTATGTTTGGAAGAGATGA
ACTTAACCATGCTCTTCACCACCATGGCTCAGACATTCTCTTGAAGAAGA
TGCATATTACAGCCTGCTGACCTCGTGAAATAATCCTTATGCCTCAGATT
TCCTAGGGATGTTTTGTAGTGTGTTACTTCCGAAATTTAGGAGGTATTTG
GTTTGTTACGTTACTATGCCGCCACACCCAAGCTAAGGAAGTTTGACTTC
ATTAGGCCACAGTTTGTTTCCCGCCAAGTTGTGTCTTTCCACACTTTCTT
TTTCACATCATATCCGTGTATTCTTGCCAACTTTCCGTAACTTGTTTGAA
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ATGTGTGGTACTGAACCAAAACACCCCCATTGTCCTTTTGAGTCGATGTC
CTACAAAATTGAATGGAAGAGGTAGTTCTGTATTCATCTCGCTTTATTTT
TTGTACTTTCACGAGGAGGAACTATACTTAATGAGAGAAACAGAATAATC
ACAATAATGGTGGTAAGCATAATTGTTTTGTTTTATTTTTATTTTTAACC
AAGAGGAACTATACATAATCAGAGAAATAGATTAATCATCCCTTAAAAAA
AATCAGAAAATAATGGCATACTGAATACTACCTCTGTTCCTAAATATAAG
ATGTTTTGGTAGGCTAAAATTGTCTACCAAAACATCTTATATTGTGGAAC
AGAGGTAATACTATGGTAAGCATTTGGTGCTATCAACAGAAAGAATTTCG
GATGAACTTGATGTGGTGTGGAGCTATAGCCCTACTTATCATTTGTCGAT
CTTCTGCTTATTTCCTTTATAGCGTCTATGGCTTGTGATATGTTCCAAAT
CAGGTGAATGAACGGTACACAATGAGACTGCGGAAGCGATTACAACATGA
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GGTGATATTTTTTATATATGCACTCCTTAGGTCTAACTGATCTTTACTTA
GTCTTTCGTGTCATGTAAACCACAGAGCCTCCTTTCACTAGTTTCAGCTC
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AAATTATGCTGTTGAGAAGATCTGGCCAGTTTGTCTGGAAAGGGTTGCAT
CCCAACAATTCCTTCTGCCCATATTCCCATGGTTCATAAACAAGTTCAAA
CCATGGACCGCAGTAAGCTTGGTTTTCAGACACCTCATTTTGTTTATTTT
CTCATGTGCTGCCTACGAGAGTAAGCCACTAGATAGCTGAGAGTATTCTT
GGTTGTCCTTGACATACTTATTACATTTGCAGAGGAAAGCAGAGATCCAG
AACCTTTACTTGGGTAGGAATCCGCCGATGTTTACAGATATCAGGGTTGT
CAGTCAATCAGCTGATGATGACCATCTGGTGTGTTAATGTGATACCTTAC
ATATATACTGTTCAGATGTCTTCTCTGGTACTCACCATATAAATTTGTAA
GGTTAACATATGATGATGTGCCAGGTTCTGGAGATAGGAATGAACTTCCT
TGCCGCAGATGATATGGATGCAAGGATGGCTGTGCAACTAAGGAAGAGAT
TAGGGTTTGGTATTACAGCAAATATGCATATAACTGGCATGCATGTTGAA
GGCAAGGTAAGCAACTAAGCATACTGAGATACATCATGTTACGCTAAGTA
GGTATACCTTAGTTCTAGGAGGGTGAAATCTCTTCTTATAATTTCTTCCT
GAACTCCTAATGTTAGACCAAGAAAATGTCATGCATCTGGTAAGGTTGGT
GTAGTCTTTAGGGGAAAAAATCTGGGATGGGCCAGTCCCATGGACCTCCA
CACCCTCTTATATATATATAGCTGAACTTAGGTACATCTTAACTAGTACA
CTATAGAATACTCTAGAATTAGGTAGGACACTAACTTAGACTACAACATA
CTGGAATGTTCCAGGCACTCCTAGGACAACACTAATATACTAACACTCCC
TGAAATATTCTAGGCTCTCCTAGGACAGTCTCCAACACTCAACCTCAAGA
TGGGTGATAGATATCTATCATTCCCATCTTGTTACAAGCTGAACTACACT
CTTTATTTCCTAATCCTTTAGTTAAACAGTCTGTAATTTGCTCGCTAGAG
GTTACATGATTTATCTTAATTATACCGTCATCCAATTTCTCCTCTATGAA
GAAGCGATCAATCTCCACATGCTTGGTTCTATCATGTTGAATGGGGTTGT
TTGCGATGTTGATCGCCGACTTGTTGTCACACCACAAATTTAAAGGGCCT
TTCCTCAATACTTTCAGTTCTGAAAGAAGATTCCTCACCCATAACATCTC
ACTCAAACCTTGCGACATAGCTCTATATTCAGCTTCAGCTGTTGACTTTG
AAACCACCTGCTGCTTCTTACTTCGCCATGACACCAAATTGCCCCCCACA
AACATACAATAACCAGAAGTTGATCTCCTATCATCCAAGCAACTTGCCCA
GTCAGCATCACAATACCCATCCACATTTAGATGACCATTCCTTTTGAACC
ATAGTCCCTTTCCTGGACTACCCTTCAAGTACCGGAGGATTTGATTGACC
GCATCCAAGTGTCCGCTCCTAGGATCATGCATGTATCTACTCACTACACT
CACTGCATATGAAATATCAGGTCTTGTGTGCATAGATAGATGAGTCTTCC
AACAAGCTTCTGGTACTTCTCCTTATCCACTGGATCACCAGATTCGGCAC
ATAATTTGTGGTTTTGGTCGATAGGTGTTGATGCAACCCGACACCCAAGC
ATGCCCGTGTCACTAAGCAAGTCCAAAACATACTTCCGCTGGGAGAGCAC
AATCCCTTCGGGAGATCTAGCAATTTCTATGCCAAGAAAGTACTTGAGTT
GACCAAGATCCTTTACCTCAAATTCCTTGCGTAGGTTGTCTTTCAGCCGT
GATATCTCCATCGCATCATCTCCCGTGATTATGATATCATCAACATATAC
AGCAAGGATTGTAATCTGGCTATTTGAGTGCCGATAGAACATTGTATGAT
CCCCATTACACTGCTTATATCCCATACCACATATCACTCGTCTAAATCTA
TCAAACCATGCCCGTGGAGATTGCTTGAGGCCGTATAGAGATTTTCTCAA
CCTGCATACCTTTCCTGATGTTCTAGGAGTGGAGAAACCAGGTGGGATCT
CCATGTATACCTCCTCCTGTAAATCTCCATGCAAGAATGCATTCTTGACA
TCCAACTGATGCAAAGGCCACCCAAAGTTAGTTGCACAAGAGATTAGGAT
CCTCATTGTGTTCATCTTTGCCACCGGCGCAAATGTCTCATCATAGTCAA
TCCCATATGTTTGACTATATCCTCTGGCAACTAGTCTTGCCTTGTACCTT
TCAATTTTCCCTTCTGGATTTTGTTTCACAGTGTAAATCCATTTACACCC
AACAGCTCTCTTTCCTACTGGAAGATGTACAAGTTCCCAAGTTTTATTCT
TTTCGAGAGCATTTAACTCCTCTATCATGGCCTCGCGCTACTTCGGGTCT
TGCTTTGCTACTTTCCAGTTTCTTGGGATCACCACGGGTAGCAATGATGC
AATGAAGGCCAAGTAGTTTGTTGATAGAGATGTATATGATACATAATTAG
CTATGTCATGCTCATCTTGGTACCAATTTGGAGGTTTTCTAGCTCCAACT
CGGATTCCTTTTCTTAAGGCAATGGGCAAGTCCATTGAATCTCTCGTATT
AGATGGACCTGCACCCTCAGTCAATTCAACAATTTCAACACTTGTTGGAG
CATGTTGCTCCCCCGGCACCTGTGTGTCACCTGCTGTAGGAGCTACGCCC
TCAGTCGATTCAACAATTCCACCACTTGTTGGAGCATGTTGCTCCCCCTG
CACCTGTGTGTCACCTGCTGTAGGAGCTTGTTGCTGCTGCTCATGTTGTG
GTTTTCTCCGTGTATACACTTTTAAGTTTTCTTCCTCATTTGGCTTTCTC
CATCTATCTTCACTTGCAGGAGATGGAATTGAACCAACAACAACTCTCGA
TTGTTCATCTTCCTTTGTCCTCAACAATTCAGTCTCCCCCTCTCGACTAG
CATCAATTGTGCTAGGAGAGTCAAAGTCAAACAACGAGCTGAGGTCCGTC
TTCTCTCCGTAGAATGGCTCAGACTCTCTAAATGTCATATCCATGCTAAC
AAATGTTCTCCGCTCACTAGGGCTCCAACACTTTTAGCCATTTTGTCCAG
ATGGGTATCCAATGAAGATGCACTTCAGAGCATGTGGGTCCAATTTTCTT
ACCGAAGGTCTATGGTCTCTGACAAAGCATGTACACCCAAACACCTTTGG
TGGAACAATGAACTCATTTTTACCAAAGATCATTTCATATGGGGTCTTCA
TCCCAAGAATTCTTGATGGCATTCGGTTGATGAGATAAGTAGCAGTCATA
ACTGCTTCACTCCATAAGAATTTTGGCACATTCATAGTAAACATAAGCGA
TTGAGCTACCTCTAGTAGATGTCGATTCTTCCTCTCAGCTACTCCATTCT
GTGGAGAAGTATCAGGGCATGAAGTTTGATGAAGTATTCCTTTTTCTGAA
AGAAAGTTGCCAAATTCATGGTTCATATACTCTGTCCCATTATCAGTCCT
GATAATTTGAATACCAATGTTGAAACGATTTTGGATATATGCATAGAAGT
CCCTAAAACAACTAAGCACCTCACTTTTTTGTTTCATGAGATATATCCAA
GTCATCCGCGAGTAACAGTCAATGAAGGTGACAAAGTACTTCATTCCACT
AATAGAGACCATAGGAGAAGTCCAGACATCAGAGTGAATCAACGCGAAAG
GCGATGTGCTTCGGAGTCCATGACTCACATATGATGTCCTTGTGTGTTTT
CCATATTCACAAGCATCACACACAAGTTTTTCTTTATCCACCTTCTTCAT
TTCCTCGGGAAATATCTTACTCATAGTATCAAAGGACATATGGCCCATTC
GACAATGTAAGAGTATCACCTTTGCTTCATCGTCACCAGCAACAATTGTC
AAAGCGGTGCATAATGCATCATCTGTTTCATGTCTATCCAAGTACCATAG
TCCCTTATGCCTGATGCCAACCCCAAGTCTCCTTCCAGTTGTCCTCTCCT
CAATTATACACTTGTATCGGTCAACAATAATTCGACAATCAATGTCGTCA
ACCAAGGCACTCATAGACACCAAACTCACTGGAAATGATGGAGCATACAA
GACCGAAGACAATGTAATTGACGGAGTGCATTTCACCGTGCCAACTCCTT
TGACGGGCTGATAAGTTCCATCAGCTGTTTGGATGGTCTCTTTATGCATG
GGTGGATTTGGCGCATATGATGCGAACTCACTCCTCCTTCCCGTGACATG
TGCAGATGCTCCCGAATCTAGTATCCAATTTGAACAAGTTCCGTTTAATG
TAGGAGCTTGATTTGACATACCTTCTTCCGCTTGTGCGAGATTTACACAA
TTTCGTAGGGCTGTTGTTTTTTCACCTTGTTTTGGAACTTCCGCAATCTT
CTTTGACTCTTTCAATTCTTCTATCTCCTTCATCAATTGAGTCATTTTCT
GAAGTAGCTTCTCAATTCTTTGATTTTCCGCCATTGATCAGTGTTGTTGA
GACTGAATCCACAACGCTGTTCAGCTGTTCTACAAGTCCAGCCTGCACAC
ACTCTTCTCCGTAGCTATAGCACAACCCAAACCGCTCCTCCGCTGCAGTA
CAGCCCACTCCTAGCTGCACTGTCTGACCACTTCTCCTGGCTGCACTACA
CACACACCACTGTCCGCCACCACAGAAACCTCAAAGTGGAGCAGCACAAC
ATCCGGTCCCTTTTGCTTTTGCTAAGAGACACAAGCTCACGAAGCTCTCT
CTTCTGTCCTCTCCTAGCACACACCGCAAACAACAATCACCTCTGCTTTG
AGCAGCTGCAACTCTCTTGCTTCTCCTTCTTTCCTACGAGTCAACCTGGC
CAACACTTTTCCACTTGAGCTAGCTACCCCTGTCTGCACTCACACCTGAA
CGCCTGGAGCTCCTCCACAAGCTGCTGTTTCACCACCGGCCACCACCAGG
ACCAAGCGCCTCCTTCCTCAGCTTATGCCATAGCAGAGCAGCCCTGCTTC
ATCACCATTGCCACTTCTCAGGAGAACCTTGCTCTGATACCATGTAGTCT
TTAGGGGAAAAAATCTGGGATGGGCCAGTCCCATGGACCTCCACACCCTC
TTATATATATATATAGCTGAACTTAGGTACATCTTAACTAGTACACTATA
GAATACTCTAGAATTAGGTAGGACACTAACTTAGACTACAACATACTGGA
ATGTTCCAGGCACTCCTAGAACAGCACTAATATACTAACACTCCCTGGAA
TATTCTAGGCTCTCCTAGGACAGTCTCCAACAGTTGGTGGTAGCATATGT
TCTTACAAATAAAAATATGCTTGAAGTAAATGGGAGGATAATAGAAGACA
TAGGAAGGAACTCTCATATTTGTTTCCTTAGCTTCAATGAGATGGGGTGT
TTAATACTTAAAATTTCATTGTGCTCACCAAACATGCCTAACTCGTGTAG
GTCCTTGTTGGTGTGCGGTTCCTTCGACAGTGGCCTTTTATTGGTCGTGT
AAGAGTATGCTTTGTTGAGCCTCCATACTTTCAGATGACAGTGAAACCTT
TATTTGGTCACGGGCTTGACGTGACTGAACTGCCAGGAATTTCTGGATGG
CTTGTATGTTTTCCTTTTGATGTGCTTTTTTTTATTCTCTTTATTGAATT
TATCGCCACATTTCATTGAGGGTACTAATTTCCCTTGATGTATCCAACTA
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AGATTCTAGAAGTCATGCATTTTTAAACCAACATGTATTTTGTTGGAGTA
TCTTCTTGCATCTACTCTGACATTCTTCAAAAATAATATTGAGCAATAAA
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ACACACGGTAATCAATAATCTGTGAAATTTCTTTTCCAGCCTAATATGTT
AGTTATTGATATGGAGAAGTTCGCCTCGGATTCGGAATCTACAGGTAAAT
GTCGTAATCTTATTATTGTGCTTCGAGTTGTCCTTGAACTGACTTAATGT
GTTGTTTTTTTCACTTAACTGTTGTTAGTTGTGACCAATTCAGTCAGTTC
ATTATGGTACCATTCTGTTGTTTTGTTATTTGATTCTGAGGGTAAAACCT
AGATACTGTAGGGCCATGTCTAAGTGGCTTGCTTTTGTGGTGAACTGAAG
TTGATTTTCAACTGAAGAAAATAACATGTTTACCGATACATGCTATTTCG
GTTGTCAACTTGGTTTCCACTACATAATTTGATGGTGATTTAAAATTGTA
CTGTTATGGGTGGAGTACCTTCTGAGTGACTACAGATTATTTTTTGCATC
CTTCATGTGGATCATTTGACACCACTTTCTAGGTCTTGCATATATTTTAT
CGAGTACTAGTAGATAACACTTGGTACCACTGCAGTGGTGGGAAATAGAG
TTTATGTGCGAAGGGGAAGAAAATTTGAGATGGATTACGCACCACTATGC
TCTGACGTAATAGAAAAATGGAAATTTCACCTTGGCTTGAGTTTGCTGTC
AGCCAGCTGTGTCGCCGGACACTATAGCCTGCTAGCGCCATGTGTCAGCC
GGCGGTGGAAAATACCCACCTCTCACGTTTCTTAAGTGGATGGCAGATAA
TTATCTCCTCATCTTTTATTCATATATGGAACTAGTCCTATTCCGCTTTA
CTCTTTTAAGGATTGGAATTGATTTGCATCTATTATTATGTGTCAGGTAA
TTGGTTCACTATTGATGAGAAGCCACCTATTGCACATGCCAAGGTAGAGA
TTTTGGAAGGGGCTGATATGAAACCATCTGATCCAAATGGTACGTGTTCA
GAAACCAAGATTGGCTAAACATTCTTTCAGGAAAATGCTTCATATTGACA
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ATCTTTGATGATGCACTTGGGTTGGTCTCCATAGACTATAGCATCTCTTT
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TGGGAGATTGCAAACACTCGATTGCATGCTCTGGATATACTCAGCATTCT
GATTTCTGTATGTTACTTTTAATGTAGCGATTGTTCAGTTAGTATCAACA
AATTGAGAGGGGGACAAAGACACGATATATGGATTGCCCTAAAGCATATA
AAGACAGGGAGGATTCATATAGCTGTAACTGTACTCGAAGATGAAAATGG
AAAGGTGAGAACAGATGAAAGATTTTAAGATGTTTGTTCTGGACGCCAGC
CATTTCTTAGTAAGGAATAGGGATGTGGGAGTTCTTCTAATATTTTTTGT
TTGTATGGAATCTGGTGAGGATTACAGTTCTTGGTTATCGCTGAATCATG
CATGAATTGTACTAAACATGAGCTAGTCGTTCAAATTTGAGTTTAACTCA
CTGCTAGTATCATATGCTGATGCTTGCAGGTACCCGATGTCAGAGATGAG
CAGTGTGGAACACCCAAGGAGGGGAAAGCTAGCACACCGAGGTCTAGCAT
CTCTTCCAAGACCAACACTGAGAGTGCATCATCTGTGGAATACCGGAAAA
TGTCTGATGAATATGAACCAGTGGACATTGAAGGACTAGATAAGGCTGAT
GTCTGGGTACACCGGCCCGGCAGTGATGTGACAGCTACCTGGGAGCCTCG
GAAAGGACGAATGCGGTGCCAGGACTCCCAAATACTACGGGAAAATGATG
CCTGCAGTGATAGCCCCAGGTCATCAATGTCAGACTCTCAGACAAGCAAC
TCCAGCACCGAAGAACCAGCCAGTGGTAAAGCACATCGTCACCTTCACAA
GGTCAAAAGGGGTTTGGTCAAACTAGCTGGAGCAATGCGCCACAAGAGCC
CCAAGAACGGGAGCGACGATGAAACTCCTCGATGCGAAGTGTCTCGCCAA
AACATACAGCCTGTTGGAGAAAGCAGGGTGTCGGTAACCTATGTTGTCGA
CGAAGATGCGGAGAACAGCAACAGGACGGAGCAGAGGCCTGATGGCCATT
ATTCCAGCCCTGAGAGAGGTGAGGTTGAAAGTCCGACCAAAAGGCGGCTG
AGGAACAAGGCAGTGCGTATGGTGAAACATGCTGGGAAAATTCCCGCTCA
GGGCCTGAAAAGCATGTTCAGCAGGAAAGGTCTTGACAAGAGCAAAGAAG
ACGGATGCAGGGACGATGAGGAAGACGATCTCGATGAAATGGGAGCTGAC
TCTCCTGCACACGACAGCACCGTCAGTGATGCACCGGAGCCCGTAGCTGA
TAGCAGGGACAAAGCGCAGTAGAGCATATATACACTAAATCTGGCAATGG
TGGGGATCTGGAGTTCTGGACTGTACCTAAAATGATTCCAGTAACCGTAG
TTTTAGCTTATGGCTTAAGATCAGTTCCCCACTCTTGTTGCACGCGCCTG
AGAGCATAGAGCATGTACAGTTTGTTGGTACACGTACATATTTTGCACCT
GACAGCTTAGAACATGTGAGAAATTTCTGAACGAAGAGATCTCTGCAAAG
TTTAGTTCTTTTTAACCACTTGTACACAGAGCAATTATAAGGTGAAGAAC
TAAAAAAAGCTATTGACGTGATTACCCGGTACCAGTTTCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.