Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE004161

[Submit comment/correction]

Sequence	AE004161
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE004161
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAACCGCTCAAGCGAGTGGTGGCAGTTCAGGTGAAGGAGGAGGCGTT CTCTCGTATCTCTCCTTCCAAGGTTGGATCGTTACCCTTTACCCTCGAAA AAATTTCAAATCCTCCAAATATCCATCCAGGAAAGGACCCTAACTACCAG CTCCCCTTGCAAGGCGTAAGCAAGCTCCGGGAGAGGTGGAGTAGGTATAG CACACTCGGGGGTAGTAAGCGGAGGAAGAGGTGTAATGCAGCATCCTTGT TCGTCTCGCGAAATGCCGAGTATGTTGCTGTAGCTGTTGGGAACCGCATT ACCATCTTGAGAAAGGGCGATGGCTATGTATCACCCTGCGGCATATATAC AAGTCAGTGAACATTCTTTTTTTTTTGAGGGAAAAGTCAGTTAACATTCT ACTTGTTCCCGTATTGCATTAAGTGTGTACTAGTATAACTCATTGGAAAA CTGTACAAGCTCTTACTGCTGCAAGTCCCTGTGTGAAATGTTACACCTGA TGCTCATACATTGCATTCTTAAATATTTGTTTACACTGGAAGTTGTTTAA GCTGTCTTTTTTTTTGTCTTGGCAATATTGTTTCATGCTTGTAACTTAAT AAGAGTGCTATTCACGATCAATCAAATGCCAACTTTCAAATCATTTGATT ATCATAGGTTAATGCTGCCGTGGCAGTGCATTTTTTAGTTTGTTACTACT TGCTACTTCACATAAAGGGTCTACTGAGGCTCGAAATCAGTGATGAACTT GTTGTTCACGTTAAGTATTCAGGAAGAAAAGCTGCACTCTTATTGATAGT TTTTACAGTCCTTGAATATCTTGTTATATTTGTTCTACATGTTTAGCAGA AGTTATTATTTTTGAATGTTCTCAAACATGCACTGAAAATTCAAACTTCA TCAAGCTTAGGAGCAGTAGCAGTAGATTCTTTTTTTCTATCATTGCCATT GATGTATGTTTGTGCCACACACCAGACAGTCTGATATGCTTCCTTTGATT TGCAGTTTTGTTGCATCTTGCATTACTGTTTCATGTGCATTGGGTTTGGA TTAGTTTTCACAGGATTATGATGCATGGAAGTTATCAAAATTGTTATGAT GTGATACTTTAACAAGCATTTTCCGATTCCTTCTGGTCAGATAATAATAG AATGGCCTTTTTTACAAATGGGGCCTGGCTGGAGGACCAAGGCATTTTTG GTGTGGTGGATGATTTAAACTCGCTGTATCTGATAAAAGAAAATGGAGAT GCATTAACTAGGAGAACAAGCAATCAGTTGAAGCTATCTTCTCCTATCGT TGATATTCTTGCGCAGGATGCTTCAAGTTCACAAAGGTGATTCTCTGTTA TTTGCAGTTAAGAGCATTTCCGTTAAAGATGTAATTTGTGATTGTTGCTA ATATTTTGGCAATAGCTAATATGATGTTTGTAAATGTGTTAGGGGTTTCT ACATTTTTACTACTGATTGCACGGTCCATAAATTCGATTACACTGAAGAA CCAGATGCAACTTTATACCAAGTTTCTATAGTGACTAAAGACGCGCCTTC AACCAGGCCTCCTCAGTTACCTAAGAGTTTGCCGTGCGTTGATTATCATC AAGATCATTCATTGGTAGTCCTAGTTGGGGATTCCAGTCTCTCGTCAAGC TCCAATGGCTCTTTCGGTACACCTTTAAAAATTATCTGTTCTCTACTGCT GCATCCATCACTTGATATCTGTTTTGCACTATATAGCATATGTAGGGAAG CTCTGCCTCATATAGCCATTGTATATTAATATCTCCTGTCTTGATAATAA CATTTTCTTCCTGGAAGAACATATCATGATTTTTTTGGTATCCCACAAGA ATTTATATAGTGGATTTTAAACACCAAAACCTATGGTTGCAGTTGTTTCT AGGGAACCCTTGTTTCTAACTTTTTTCTCTGTTATGTTGTAGGAGCATAT TTTCTGTATATATTGCACTTCGACGGATGTCTGGAACTTCGCCTTTCATT CCAGAGCATGCGGTTGGAAGGGTTGTTTTCAGCTCCTACGGATAAAAAAA CTTTGGTCTCAGTTCCAAAAGTCAGAATCTCACCTCAGGGCAAGTGTATT GCTACATTAGATTTGAATGGTTCTGTCAACATCTTTGTGCTTGATGAAAA TATGCGCTCTGTTTCGCTTCATCCTCATGGGAGTGGCACTGGAACACACC TGATTGATGTGAAGGACATCAGTTGGTGGACAGATAGTATTCTCATGGTA GTAAAGGAAGATGGTAGGATTAGCATGTACAGCATTGCTGAGAATATTGT TGTTTCAAAAGACGACCCTGTTTTATCTACACCACTGCTGGAAAAGGCGA AGGCTATTGGAGGATATGCATTTGTTTTGCAATCTAGCAGACAAATGAAT ACTGTTCCTGGGGATCATCAACACACTGAGATGGAGAAAATATTTTGGAG CCTCGTATCATTCTCCAAAGTTACAGTACTGGAGATGTACTCTGTTCTCA TCAGGGAAAATCGACAAAAGGAGGCTTTGGATTTTGCCATGCAATATAAT CTAGATAAGGATGACGTGCTTAAAGCATGCTGGTTGCACTCTGCTGGAGA TATTCACGATATACAGTCATACTTGGCGAACATCAAAGACCAAGCATTTG TGTTATCAGAATGTGTGAATAAAGTTGCACCTACAGAAGTTGCTTTGAAA GCCCTATTTTCTTTTGGCCTTCGTATAACAGACCGTTACAACTTTTCAGA GTCAGATAAGAGCAGCGAGGGCTCAGCATGGGACTGTCGTATTATTAGGC TTCGTTTATTGTGGTACAACGACTTGCTGGAGACATTCTTGGGAATTAAT ATGGGAAGGTGTGTCACAATTTTTACTATTTTCTCTTGCTAAGAAATGCA GTCAGCTCACATAGGAGGTGTTCACAACTATACTGCAGCTGTTGAACCAT ATTCATCATGCAAAAGTTTACAAATAGAACTAATTTAACTTCTTCCATCA TACATGCATTGGCCATTTTGAGGCTCTATCCAATATTTTTAAAATTTATC ATAGATACTTCTGAATACTGATTTACCCAAATCAATTACACTTGTCACTG TTTGCAATTCCCAAATTAGCATAAGGTAATGCCTAGCTGGCTCTTGGTTT AGGTATATCAAGTAAAAGGGAAAATAAGAGGTAATTAACACTTCAAGTGA ATTCTTTGTTATTTTTCAAGTCTAGCTAGTGGCTCGAACATCTAAGAGCT TACCTGGTTGATTTGTCCCTACTTCAGTATGTCGATTTCCAACTTCACTG CACAGTAGTGTTAGCTCTCATGGAAAAACTCTTCATAAGTTGATTGTACA GGGGACTTACATATTTCTTGTAGCTAAATGTGCTGTTCTTTTTTATTTAG GTTCTCAGCTGGCGAATATAACAAGTTCCGTTTGACGCCCCTTGTTGATA CTGCTATTGCTCTAGCTGAAAGTGGCAAAATCGGAGCCCTTAATCTTCTC ATGAAGCGTCATCCATATACTATCTCTTCTGACATTTTACATGTTTTGTC TGCGATTCCAGAAACTATTGCTGTACAAACTTATAGTCAGTTGCTTCCTG GGAAATATCCTCCTAGTATTGTAATATTAAGAGATGGTGATTGGGTTGAA TGCGAACAGATGGCATCATATATAAACACTTCTCCTGGTCAAGTGGGCAA GAGGGGACAGGTCAAAACAGAAATACTTTTAAAGCACTCTACTGGTTTCC TGTGGCCATCTGTCGCTGAACTTTCAGAGTGGTACAGGAGTAGAGCTAGG GACATTGACTGCTTAAGCGGACAGCTGGAAAATTGTCTTTCCATGATAGA ACTTGCATGTCAAAAGGGAATTGTGGAGCTGCAGCCATTCTTTGATGATA TGAAATACCTCTACCGAGTTGTATATTCTGATGAGTTGAATGAGTTTAAA ATGAACCTTGCGACCTGGGAAAATTTGCCTGACTATCAGAAGTTCAAAAT CATTCTCAAAGGAGCCAAAGATGAAACAGTTGTTCAGCGACTAGATGATA TGGCTATCCCTTTTATGAGTGAGAGGTTGCAGGTGATCTCGTCGAGTAAT ACTGACAAACAAGAAGAGTCCTACCTGAGTAGATGGATTAAAGAGGTTGC TGCTGAAAATGAGCTGTCCGTTTGCTTGTCTGTCATTGCAAATGGTTGTG GGGAGTCACCAATTCGTGGGCTCTTCAAGGATCTTGATGAGATGATTGAA ACAGCTATTCACTGCATTTATGTGTGCTCTGCAACTAACCAGTGGAACAC CATGTCATCAATTTTGTCAAAGTTACTCCATAAGACAAAGAGAGAGAAAT CTTTAATGGCCAGTGAAGAAGATTTTAATCTGAAAGATGCTAAGCAAGCT CTTGGGACTTCTATGGTTTCCTATGATGACATACAGCATGTGTGTGCTGA TATCTTGTCTGGTCTGGGTCATAATGCACGGGATTCTGATTGCGATGATT CAAGTGCCTACCAGTTTGATAACATAAAATCGCTTGATATGCGAGAGAAG ATGCTAAAAGTTGCTGAAGGTCATGTAGAAGCAGGGAGGCTCTTTGCTTA TTACCAGGTACTGATATCTCTTCTTCAAAGGAAAGTTGCTACTTAAATCA ATCTCCTTCCGTTCCTTCGGGTATTTATTTTCACATAGGCATGTTCACAA TGTTAACTGCTTTGCTAGCACCTCACAGTAAACTACAGAGCTCTGTTAGC AGTGTATTCCTTTTTGTACCATGATTACTTGTTATCAATAGTTTTGACCA ACTAGATAGCTGGATGCCTGGATGAGATTAACTGTGTACATTATTGTTTA TTTAATTTAACTCGTGTCCTACTTTGGCAGGTTCCAAAGCCAACACATTT CTTCCTTACTGCTCACTTAGACGAGAAGAATGTAAAACAACTCATACGGC TGATCCTGTCAAAATTTGGCAGACGTCAACCTGTTCGATCTGACAATGAG TGGGCTAACATGTGGCGTGATTTGAAACTCTTCCAAGAAAAGGCATTTCC TTTTCTTGATTCACAATATATGCTCGCAGAATTCATTAGAGGGCTTCTAA AAGCTGGTAAATTTTCACTAGCCAGGAACTATCTTGGAGGTACTAGTGCA GTTTCTTTGTCCACAGAAAAGGCTGAGAATCTTGTTATCCAAGCTGCAAG GGAATATTTCTTCTCAGCTTCAACTTTGTCATGCAATGAAGTAAGTTCAT GCCACCAAATAGGTTTTCATACATGATGTTCTTACTGATTAATATTACTA ACTTGGATTGTACAATCATTTGCAGATATGGAAGGCTAGGGAATGCCTAA ACCTGTTACCAAACAGCAAAAATGTTCAAGTAGAAACTGATATAATTGAT GCTTTAACTGTCAGACTTCCTTCTCTAGGGGTGACCATCCTTCCTGTTCA GTTCAGACAGGTAAAGGATCCTATGGAGATCATCCGTATGGTGATTACGA GTCAAACAGGGGCATATCTTCATTTTGAAGAGATTATTGATGTTGCTAAA CTTCTAGGATTAAGAAGTGAAGAAGAAATAGCTGCTGTTGAGGAGGCCAT CGCTAGAGAAGCAGTGGTAAATGGTGACCTTCAGCTAGCCTTTGATCTCT GTCTAAATTTGATTAGAAAGGGTCGTGGTCAAGTCTGGGATTTATGTTCT GCAATTGCAAGAGGTCCTCAGCTTGACAATTTGGATACAAGTACCCGGAA AATGCTATTGGGCTTCTCCCTTAGCCATTGTGATGGAGAATCTGTAGGGG AACTACTGAATGCTTGGAAGGAACTTGATGTCCGTGATAAATTTGAACAA TTAATGGTATTAACAGGAACAAACCCTCCCAATTTCTTTGTTGATGGCTC TACGTATATACCTCTTCCTGTGCAAAGTGTACAAGACATACTTGACCTGA GAGAAGACATTAGCCATGATAGAGATCACGATCATGTGGCAATTGCTAAA GAAATGCTATCAAAGGTTTGCATGGACTTAACAAATGATGATACATATAG TTGGGAATCTACATTTGCAGAAAATAGGAAACTGTTGTCCTTCTCTGCAC TGGAATTGCCATGGCTTTTAAAGTTATCTAATGGTGAGATGCATGATGGT AATGAACATTCTTCGGATACAAATCATCCCAGCAGGAGATATCGATTTTC AACAAAAACAGAGGCAACAAATAGCATCATATACTGGTTAGGTGTAAATA GCTTTGCTCCCAGTGATGATCTAATCATGTTTCTTGCGAAGTCTGTAATG GAGCCTCCTGCTGATGAAGATGATTATATTCGTTCCTGTTCGATTCTTCT GAATCTCATGGACCCTTTCAACGGAGTGAAAACAATAGAGGAAGAGCTCA AAAACCGAGAATGTTATCAAGAGATTAGTAGCATAATGAATGTAGGAATG ACATATAGCTCCCTCAACAGTTCAAAGAAAGAATGTTCTACTCCTGAACA GAGGAGAAATCTCTTGCTTCACAAATTCCATGAGAAGTTTACGTCGATAG ATTCAGGTAGGTGCACTGAAAACAACAGTATATCAAGAACTAGCTGAATC ATGGCCTCAGTTTATTTTGTGAATACTCATCTAGTCCAGTATTCTGTTTT TACTTTATGATTTATATGATTTTTACTTTATCTTTACTTGTACTATGATC AGATGAGTTAGACCAGATTGATATGGCGCATGCCACTTACTGGGGAGAGT GGAAATCAAAGTTAGAAGAGGAGAAACGGATGGCTGATCAAGCAAGAGTG CTAAAAAATGTACTGCCTGATATAGACACATCTCGATTCCTATCTGGCGA CGCTAACTATATCAAAAAGGTTGTTTTCTCCTTTGTTGACTCTGTGAAGC TGGAGAGAAAACATATACTAAAGGAAGCAGTAAAGATAGCTGAGAACTAT GGGTTGCAGCGAACTGAGGTCTCTCTCTCTCGCTCTCTTTCCCTCCCTCC CTCCCTCCCTTTTGTTCTATTTTCCATGTGATGTAAGCTTCTCTTGTCTC TGAATATTGTAGGTGCTTTTACGATTTCTGGGCTGTGCTCTTGTCTCTGA ATATTGGGATAACGACGATATTCTGAATGAAATTTCTGAATTCCGAGAGG ATATTGTCAAATCAGCTAAGGGGGTGATTGATATGATATATTCAGATGTC TACCCAGAGATCGATGGGTATAATAAGCAACGCCTCTCCTACATATTTGG CATCCTTTCAGCATGCCATTCGTATCTTAAGAGGACTGGTGAGATAGAAT TGACATACCAAGAACATGTCCACACACATAAGCTTGAGCTGTTTCAGTAT TACAAGGTCCTGGAGGAAGAGTGCAAGAAAGTCTGTTTCATTGATGGCTT AAACTACAAAAATATTGCTAGTCTGGATAATCTGAACTTTGAGCATTTCA ATGAAGAGGTATGCCAGAATATCCATGCCTCGACCGTCAGTGCTCTAGCT GATATGGTACAAGCTCTCGTGAGTATGTATGTTGATGTACAGGCTAAGGG TCTTGTATCACGTCAAGGTGTTTACAAGCATTATGTTCTTGGCATGTTGG CATCTTTAGAAGGCCGCAATGAAGCGCGATCAAACAGCACAGATTGTGAA AAGTTGCAAGCGTTTCTTTGTGAAATTGAGGTGAACTATGATAGTTGCAA GGAGTATATCCAAACTCTTCCTGCCACAGATATCTCATACATCATTGGGA GGTATTGCACGCTATGTTTTCCTTACAACTTAGCGAGAAGCCACCCACAT GAACCTTCATGGAAGAAACCTCTCTGTATGCTGATAACGCTTTGGGTTAA ACTTCTTGATGACATACCAAGGCAGTCAACTGTTAGCTCGTATGAAAGGA CAGGCTACTTGGATCCGAACCGGTTATCTCACTGCATGAATGCTTTCAGA CAGCTATTAATAAATGATGAGATAACAGTGCACCAAGGTTGGGATGCCAT CTCCATGTTTGTACAAGCCGGCTTTAATAGTGAAATGATAATTGACACAT CACACATTTGCCGAGCTATGATTCTTTCTGGATGTGCTTTCAAAACTGTA GTTGAAGTGTACTACGGAGGACAGGAACATTTGGAAAGTATGGGTGCAGA CTCAAGGAATCCTTTGGATCTCTTAGAGCTTTATGGTGCTTCTACAGATG GCTGTTTGTCCGATCTGATCGGAGGCTCTTGTGAGTCCGAGGTATTGCTG CATAAGCTACTGTCTTCATTGAGCCAGTCAGCAGGGGAAGATGCCAGCTC TCTTGAAATGATCAGGTCTGCTGTCTGGGGAAAGTTGATAACCTTTTCTG AGAACATGCAGCTAGGTAGCCAACTACGTGTCTATGCTCTGCAGCTGATG CAGTGTATTACAGGAAGCAACCTCAAAAGTCTCCCAAATGAGATTGTTTC CCAGGTTGAGCCATGGGAATCATGGTATGAGCCTGGAACAAGTGCTTCCA TAGCTGATGAGGGTACGACTCCCTCTAGCAGCATCACAGCAACTCTAGTG GCACTCAGATCTAGTCAGATGGTCACTGCAGTTCTGCCAGATGCTAGTAT CACGCCCGAAAACTTGTCGAGTCTCGACTCTGCAATATCTTGCTTCTTAC ACTTGTCGGAACATGCTTCTTCTGTTGAGAGTGTTGCTGTTCTGGAAGCA GTGCTAGAGGAGTGGGAGCAGTTGTTCTCTTCCAAAGAAGAATTTACTGC GCCTCTTGAATCGCCAAAAGAAGCAAGTGACTGGGGTGATGGATGGGATG ATGGCTGGGAGGCCCTACCAGAAGAGCTGGAGAATCCAACGCAAAAGCAA GATGATGCGTCATCATCTGTCCATCCTCTCCACAGTTGTTGGATGGAGAT TATAAGAAAACTTGCAGGGTTTGGTGAGCTCCAGAAGATCATTGAACTTC TAGATCGTGCATCTTCAAAACATGGCCTGTTGCTAGAGGACGAAGAAGCA CATCGCTTGCTTGACCTCGTATCTGCAGCGAACTGCTTCATGGCTCTCAA AATCATGCTGCTGCTCCCATATGAAGCTCCACAGTTGAAGTGCCTGCAAA TGGTCGAGGCAAAAATTAGGGAAGGAACTGTGTCCAGCTCATCAAATGCC GAGGACCATGTGCTTCTGGCATTGGTTCTGTCATCTGGAGCCCTGCAGAA GATCGCTGCCGAGGAAGGGTACTCCAAACTCTTCTCTCATATATGCCACC TCGTCGGACAGCTCTCGAGGTCATTCCAGAATGATCTCTGCGCACACTGG GAAGCCAAATCTAACTCATCGGAGACATCTAAGATAAACCGTTCTTTACT GTTTGGCAAGGTCTTGCTCCCGTGTTTCATATCTGAACTGGTGCTCAGCG GACAGTATCTATTGGCTGGGTTTGTCGTCTCGAGATGGATGCACGTCCCC CCATCCCTTGGCCTGATAGATATTGTCGAGCCCAGCGTGCGACGCTACCT GGAAGGCCAGGTTGCTCAAGCTCAGCAGCAGGTGGGGGAGAGCTATGCTT TTGCTGAAAATGAACTGTCGTCTGTAAGCCGCACATGGTCCAGTCTAAGA TTGAAACTGGTTTCTCTTTTGCAAGCAGCCTTGGTAGCCCTTCCAAACCG AGATTCTTAGACTTGGTTGTAGATTATAACTTAACGCTGCTGGTGCACCT CGATGTAACTGTAACATGGCGAATATTACAGGGTTAAAAACTAGCAGGGG CAGTGTGCTTTGGGAAAAGACAAGCTATACAATGTTCTGTTACTCGATCG AAATTTATTCGCAGTGCATTTCTTGTGCTGTGGAGCTAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.