Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE031108

[Submit comment/correction]

Sequence	AE031108
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE031108
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCTGGCGAGCGAGGCGGCGGAGGGCGGCCTCGACGCGGGGTTGGGGAA GGGGAGTGGTCCCGGTGGCGGGCCGGAGCGAGCGGTTGGCGAGGATGGAG AGCAGCGGCGGGATAGGAGGCGAGAAAGAGGCGCCGCAAGGGAGGGAGAA GATTACGTGCGGGAGGACGTGGTCGGTGGGGCGCGATGGGGACAGGGCGA AGAAACGGACAAGGGGAGCAGGGCACGTGCGAGAGAAAGCTGGGAGGTGG CGTCGCTCGCTCGCGTGTGGCGTGTCACGGGGCTGGGGTCGCGCGCGGTT GGTAGTCCTACCTAACCCAGCCGCCACCCCAACCAGCTTCCACCCCGCCG CCACCTGGGCGCGACCCCCTACCACCAACTCCCGCCCAACTGCCGCCTGT AGCCGACCAGCTCTCCCTACCCAGACGCGAGCCACGCTCCCGCCCTCCCC TGGCCCCACCTGGCCGCGTCCCCCGCGTGACCCATCTCCTACCAACCGCA CGCGACCCCAGCCCCGTGACACGCCACCCATCTCCTACCAGCTGCCTCCC CTAATAAAACGTTTTTTTATTAGACTATTATTTTATTTTTAAAACCTTTT TGTAAATATCTTTTAGACAAACAAAATATCCGGAAAGAACCGGCGTTTTG ATTTGAATGAAGACAGTAGATATTTAGAAAACAAAGACCGGCGGCGAGTC GGCCGGCGAGCTGTTGTGCCGGGCGGCGGCGCTGGTGCCCGCGGAGCACT ACGCCCTCGCAGCCATCGCCGTATTGTCGGTCCTCGGGTACCACTTCCTG GAGCTCCACGTCCTCGGCGACCTCCTCCGCGGCCTCCGCGGCGGCCGCGT CGACCTCGTCTTCCACCCGGCTTCCGAGATCTACCAATCCGTCGCCTCCA AGTGCCGCTCACTCCATCTGCTCGCTCCATTGTACTAGTTGTCCATGAGT ACTCTCTCGACCTGATATCATTGGTGCGTTGGACCTGTCCTTACTTGGGG AAATCACACTGTGTCATTGAACTGATCCCATCTTGTGATTATGCAGGTAC CTGGCAACGCCCTGGCTTGCGAGCCCGCATTTGCAGACATTGTTCCTGGG AATCTCTGGGAGACCACCTTCCTTCACATACAAGAGGTTAGACTAGATCC CATCTTGTGATCGATTGATTATTCATCATGTCTTCTCGAAAAACAACAAT GAGAACCCCATTTATTTATGTTGAAAGTATATGTCTCAGTCAGCTTGAAT GACCTCCAAAAGAGTTTATGGGCATACTTTTAGGGATTTGCTAATTCCAG GACCTGACAATTAGTTTTTTACTTAATCGTCTGGTCTATACGTCAAGATT TGTGCTATGTGCTGTTGTTTTCTCGTTTAATTTTTAACTCTTATAAGGCG ATTGCCCTTGGGCCGTTACTATGTGAGGCCTTTTGACCTTTTGTTTTTCT GTCTGTACCGATCTGGGCTTTAAATCCATGTGTGTGGGCTTTGCTTTTTT TTGTTCTCTTTGTACAGTCTGCTTTTCTTTTTCCATGCTCTATCTTGTTT TTGTTAGGACGGGTTTTCTTTTCTATTTTTTAAATACTGTCTATTTTTAA TCTATTTTTCGTTGCTTCATTTGTATTTATAATATATTTTTTGAACGATC ATATCCCCGGAACATTCCAAATCCCGTCCCCCAACGCCACTCCCCCTGGC CACATGTTGCGGATCCGACGGTGCGGGGAAAAACTGAAAAAAAGACCAAA TTTGCCAGGAAAAAAAAAGAAAAATGCCTTGACAACTTTCTTTTTGCGTC GTGCCGACAGACAAAAGTGGGCACGTTCTGCCCTTATAAGTTCTGTAGTT TTTTACTTTTCTTTTTAGTTTTTTCTTCTTTTTTCTCATTCTTTACAAAC TATTTCAAGATTTCACTTTTTCCAAGTTGCACGTGAGCTGTAATTGAGGT TTTGTCAGTTGCATATGGATTGCAAATGAGATTTCTCCAGTCACACATGG GTTTGCAACTGAATTTTGCCAGTTGCATATGGGGTTGCAACTAGCCAGTT GTATAACTGAGATGCTTTTTCCAGTTGCAACTAGAGTTATAACCGAGATG TTTTTCCAGTTTGAAGTGGGGCTGCAACCGAGATGTTTTTTCAGTTGCAA GTGGGGTTGCAACTGAGATAGTTTTCCTATTGCAAGTGGTGTTACAAGTG CGATGTTTTTCTAATTGCACGTGAGGTTGCAACTGAAATAAACCATATAT CTCACCCTCACGGTTCTTCTTTCTGGCGTTGTAAGCAAAAGAGTGTGTTC TCTGTGCCAAAATATGATGTTTTGGCAGGCTCTAGGGACTGAGGTAGTAT TTAGCTCAATACTATTTTTTTGAATAATTAGCATAATTTATGGACAAACA AAAGTGGCCCACTAAACAAAAAGCCCAGAAACTGAACATGAAAAGAAAAG AAAAGAAACGGACTATGCTCTCGGCCGGAGAAAAAACTGATCGGGAATCA CTCATATACGCGCGTAAGCATTCACGATGAGATGTTGCATCGCAATATAA CACCGATGCTGATCGGGAATAGTTTTAAATACTGATGGCAGCTGACACTA AGCTTTATACTGACCCATACTTTTATCTTCTTATTTAATTTCTGAAATTA ATTCTTATGGCCTTATGGGCATACTTTTTCTGTCGAGAATGACCGTGTAC ATCCTCTATACTGCAGGCAGTTGTACACACTTAGTGATGGAGGAACCGTT GCTTTGGACTGGCTGTTGGCCTCAGATTTGGAGGGTATGGGCCTCACTGA CAGTAGAGCTGTAATATCGTATATCATATATGGTGATGTCTGACCATTTT AGCGATGTGGCAGATGCAGATGGAATCATTTCTCAAGATGCTTCGACACC CCTTGTAGTTGTGGTCCCTGGATTAACTAGTGATTCTGATGCTGCAGTTA GTCCCTACCTTTTTTGGATGTTGGTCCATATGTGTTGCTAATTTGAAGGC CTCTTGGTTTCAAGATTGAATAACTTATTATTTATATTAATTAATCATTC TAAAGATGTAGTTGTTTATCGCAGTATGTAAAGCACTTGGTCCATTCCAT GGCGAGAAAAGGTTGGAACGTTGTCGTAGGCAACCACAGGGGTCTTGGTG GTGTGTCCATTACAGTAAGTTACCGAATGTAAAATTTCAATTATTAGAAT TTCACTCTCTAGTCTCCATATGCACTTAAAACTTTGCTACACAATTATGA ATTCGTGATTGCTCTATGAAGCTTGTTCGTCATCCGTAATTTGTAACCAG GATTTATATCTGTTGAGCCATAAATCTGATCATCGTAAAATGGTCACAGA ACCTTCTGAAATATGATACTCATACTGCAACAAGAAATTTAATGGGCAAT GAATGAATTGATTTGGTAAGTAACCATCACTCAACATATCGTTTGTTCTC CTGGCAGTCAGATTTCTTCTACAATGCTGCTTGGACGGAAGATATCCGAG AAATTGTTAATTATCTCCATCACAAGTCTCCAGAGGCTCCGATGTTCTGT GTTGGCACAAGCATAGGTGCCAATGTCCTGGTACCTTCTCTTAATCTAAA CTTGCCTTCTATTTTCTGCCACTGCAATTGTCTATTCAGTAGTGCTACTG CCAGTTGCCCAGTTTACCGTGTACCAACACCACTGGGCATTGGCTCTAGA AATCTGCATAAAATGACCTGGTCTACTTGGGCAACTATTTAAGTTTTATT TAGTTTTTAAATTATGTGTCCTTTCTATAGTGAACCCGAAACCAGAACGA ACCTGGTTGTGCTGGAAAGTGGCTGAACCAGCCATTCTCCAAACCCAGCA CATATGATGTTAAACTATCTATTATTTCTAAGAAAAGTAATACCCTGTTA GCTTATTCTAAGACGCATCACAACTAACGAAAAAATCGCATTCTTTTTCT TGCCAAGAACCCCGTAACATTGGCCACATATGTAATATGTTTGCAGCAGT CTGTTAGTCCAGGTATCCTTTGAGCTTCTTTTGAATGCATGGTGGTGTGC TTTTGGGATTTTTGGTTGTGTTCTCATGCATGCATCCACTTTTGATGATT TTTCATTTGACAATCCTTGTTGGGTTATCACCGACTCCCATGGTACACTT CTCAGAATCCCTAAATCTGCCACCCATCCACAGGCCACACAAGAATACAA ATATATGCCGAAGTATCTCACTGGATCTTAGAGCAATCATAATTGATGTA CTAACATGTATATTGGATCCACATATTTTCCCAGGTCAAGTATCTTGGAG AAGAAGGTCAGAATACTCCTGTGGCTGGTGCTGCATCTATTTGTTCTCCA TGGGATCTGTTGGTTAGTTGCTGCACCTAATTCACTACAATACATATACT TATAACTGCATATCCAAATTTACTTGCATGCTTGTTTTTCGGTAGAAAAT TGTAGCAACTTTTATCTCAATAATTTTCAACTTAGTTTGACCAATCTTTC TCAAATGCCTTTGTCATAAATGAAGAATTGAAGAGTCACTGCTTACAGAA CCTAAGAGCAACCTCTCTGATGTTTTAGTTTAGTAGTAACTTAGGGTTAG CTTGGCACTGGGAGAACTTCCTGGAATTAGTTTTTCTTTACTATTTATAG ATACATTAACCAATTCTCAACCTCCTCTTTTGAGCTATAACAAAACAAAG GGTTCTCTTCTCTACAACTAAGTCTGTACTCTGTCCTTACCAGAATGTAG TGCATATAATTTTTTTCAGAAGTCAAACGATCTAAATTTTTACCAAGTAT GTAGAAAAAATATCAACATCTAGAATACCATTAGATTCATCATGATGTAT TCCATATTTTTATATGGTATACATCTTGTGTTTTAGATATAGATAATTTT CTTAATAAACTTGGTCAAACTTTACATCGTTTGACTTTTGAAAAAACTTA TATTCACTACAGTGTGGCAAGGAGGGAGTACAATTGTTTCCACAGTGGAG AGCCAAACTAGCCCCTTAACATCATTGTGTTTTGCCATTTAACTTCGACT TTCTAGGTGGATGACCGGTTTATTTCACGTAAGCTTGTTCAGCGGTTGTA TGCCAAAGCCCTTGCATTTGGGCTAATTGGCTATGCAAAGCTGTAAGTAT CCATCCTTTACTTAGCATTTGTACACGTCTCTTTCTATGGAATCTACAGC TTTTAGGTTATGCTTATCGTTTTTTCTGTTGCCTTTGGTGCCATTCTTTT TAGAACTATTATTTGTATATTCTGAACCTAATTTTAAAAACGAGACCAAC AGGGGGAGGAACCCCTGTGTCATTTTATTAAGAAGGAGAATGTGTGACAC ACATGTCCAACCCCAGGGATCTAACTCACGCTGCCTGGGAGGCGCCACTG CTCTCTCACCACTAGGCCAAGAGCCCATCCACCTGAACCTAATTTTAGTG TTTCTTTCATATAAATTAAAATTCCCACTTGAGTAGAAGCTGGACCACGT GTATGCAACCTTAGTTCAGCAATGCCATTGCTTTTGTAGTGTTAATTATT TTATAGCTTGGTCTTGCATGTCTGCATCTTGTAAATGTAATGGTTGATAG CGACGAGCAAAGGAAAAAACTATATTTTGTATAGCGTTCGTGGTTTATGC TAGTGTAATGATCTGTGTTTCCACTTTTCGGTTTCCCAAGCCACTGGGTG CAAGTGGTACACGTCTGATCTGGTCTCACTATGATCACAGGCATTCATGA CAGCAGATGCAAGTTGTAGCTTGTAGCAATAAAATATGCAATTGAATAAC ATAATGGCTATTCAGCAAGATGACCCTTTCTTTATATGCCTTGCATTTTC CCACTTGCAGACATCAACCTATTTTGTCACGACTTGCGAACTGGGAAGGT ATTAAAAAGGTTCGACACACTCTTCTGCAAAAACAAAATCCTAACACCGA ATAAGTTTATGGGATTTATGTTCAACCACCCTTGAGTAAATTTTGTCACT TCCATATTATGGAGTTAGAGTACCTACTTGTCGACATATGTGGTTATTTA TAATTTGCTACTTAGTTTTGTAAAGAAAAATATTGAAATTCAAACTGCCA GGAGTATGACTATGTACTTCTGTACTTCATAAGTGATAGAATTTGTGTAG GGTAGCTCTTCATGACTCATGATATGCATTACTTATGTTCTATTATTTCT ACTTTACCATTCACGCTCTATCCGGGATTTTGACCTCCATGCCACTTGCA TTATTTCAAAATATGAGGTAACTTCCTGGCACCATGCCTACCTTTGCTGG TTCCACTATCAATCAGATGAGAATCTCGTACATTTACTGTTGCTTTCATG GCATGCCCGCCGCTCTATAATAAATCATAAGATTCAGAACTGCTGCTGTA ACAGCTAAATACTCGGCTGCTGCCTTTTTATTTCTCAGACGGTGGATACT TACTATCGCCAGAGTAGTAGTGCTAGTTATGTTGGCAATGTGTCAGTTCC CATGCTTTGTGTCAATGCTCTGGATGACCCGCTTTGCACAGCAGAGGCAA TTCCTTGGGACGAGTGCAGGTGGTTTTTTTGCTTTGTAGAAGTCGTTCTC CTAAACATCCTCTTATGTATTCATCGGAAGGATCTCTGTTTGATTTAGAG CGAACAAGAACATTGTTTTGGCAACTACACCGAATGGTGGCCATCTCGCA TTTTTTGAAGGACTGACTGCTGGAAGACTATGGTATGGCGACTGTACTAA ATCTGATATCTAATCTATCCATGTTACAGGTTATGTATTTTTGTTGCATG TTTATATCATTTTATTGGTAATTTTGTAGGTGGGTCGGAGCAACGTCGGA ATTCCTCTGTGCTCTGCATGACAGCTCTTACATGCATCGGCAAAAGGTGC GGTCTCTATTGGAAATGTTTCAGCCATTTTAAAATGTGTTTTCCGTAATG GGAGCATCTGCTCCTGTGAGCCAAAACGGTGCCTCCGCTCTTTATCATTA TCATTGTTCAAGGATGAAAATATCTATCGTTATGGTGGTTAAATGGTTTA ATCATGTCATAATTGAATGCAGGCAGAAGATCATGTTTTGCACTCTTCGC TGGAGTCGTCTATTGATAAGAGCCCATATATCAATGTCCTGGGAGATGGA TTGGTAGCTCCAGCGACAGATGATGTGGTCAATGAATTGAAACTGAATAA AGAGAATGAACACGCCAAGGAAGCTGAGAAGAAAAGTGGTGGCATAGAAG TAGATGCTGGATCTTCAAAACAGCAAGGGGAGAAGGATAATATGATCCAT GATGCCATTGCTCCTGTAAAGAGATCCATACACCTACTGACTCGGTACCA AGGGAGGTCAGTATGGCTGCTCGCCTACATATCTTTTGTTACATCATGGC CCCTCCTTGGCTCCCTAGCTTTCATCGTGTTTAGGAAGAAGTTCAGGAAT CCCTTTTCTGCCAAACAGCAGGGTAAATAAGTGAACTGCTCTCAGCCCAC ACGTATTTCATATTTTCATTCATCTGGATCATGGCATGTACAGACATTTG ATTCCACTTTAGTTCCTAAGTCATATGTACACCTTCCTTGGGCTACATGT ATTCAGGCAATTATGCTGAGTTGCTGATAAGATGCTCAATTGACCTGTCA CTAACTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.