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GrainGenes Sequence Report: AE006178

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Sequence
AE006178
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006178
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCCTGGGTTGGGTTAGCAATTTAGCAGCTCCGGTCCCGTGTACCCTGCC
TCCCCGTCCCAATCCCTCTCTTCTCCTGTGCCAAGAACGGCAGGCAGGCT
ACTCACTTGTCGTCGGTCGTAGAGGGGACGCGAGAAAATCGTTCAGCGGA
GGAGGGGGGCCGGGGACAGCGTTTGGCGCCAGGCGCAGGTGCATGGTGGA
AGCCGCCGCGGGACGCCGGTCAGGCACCAGCCGTCGGCGGCCTAGCGGTG
GAGGGGAGCAGCAGCGCCTGGTCGCGGTCGCGGTCGCGCTCGCCGCGCGC
GTCGTCATGGTAACGTCCGCTTCGCCCGCGGGGAGCGGTGATGGGGGAGG
AGATGGAGGCGCCGGCCGTAGGCGGTGCATCGAGGACCTTCTCGACTGCC
TGCTCGGCGTGCTCCGCGCGCTTGGCATCCCGTGGGCCGCGCGCCCGCAG
GGGCAGCCGCGGACGTTGCCACCACGCTGTGCCATCCCAGCGGCAGAGGA
CGGTCGGAGCTTGGCGGCGGAGCTGAGGCAGATCCCTGGGCGGATCGCCG
GCAACGGTGCCTGCGCTGTCGCATCGCTTTATACGATGCAGGGCAAAAAG
GGCGTCAATCAGGACGCGATGATCGTCTGGGAGGTAAAACCATACACAAT
TTCTCCCTTTCAATTCTTATTCCATGTGATTCATCCTGCAGTAGTGTTAC
TGCTACTTGACTAGATCTCGCTAAGCGAAATGAACGTGTTTCTACTTTTG
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TGAGTTCATCTTGATGCTAACCTCGATACAACTGTTTAATTCGGTCACTG
TCATTGTATGTTCTTACGAATTATGTAACACTGTGCACATACCAATCCTA
TAGCTGCCAAAAACTGAAGTTTGACTCGACTTATATATTCTGTGAAATGG
ATTGCCATTGGTTGTTGCTGGTAGAGAGTTCCTATTTCCCTAGCTTAATT
CAAGTGCAATGATTGGGTTTCTCTTGGATACTACCTGAGCGTTGCAGGGG
CTCCATATGATTGTCATCCTTATCCATTCGTAGTTCCCTTTGTTTTTCCT
CTCCTTGCTGGATGATCTTATTTTTAGAGCAACCTGGATGGTTTTATCTG
CTTGACGCTCATTCCTTCCTTTTCAATATGTTTGATTACAAATTTGGCTG
CGTGTCCAGTGTGCCACATATACCATTCACATGTCACCTTTTTGTAGAAC
TCACTTGCCTTCTAACAATTTGCTAGGCAGTTTGCTTAACTAGAGACACG
TGCCTGATTTGGCAAACTATCTTACAAAAGGTGGTAGATGAAAAATGGGA
AATATAAGTTTCTAACTTTGCACGGGTACCGCTGTACGTGCTGAATTATT
TGTGAACCAAGTACCGACTAAGAACATGCAACCGGTGAGATGAGTACTTC
ACATGTATTATTATGTACCCCACATTCAATTTCTCACATAGACACGAGGA
CATACTTAATCAGTACCCTAATCTGGACATGCAGCATGATGGTCTTTGCA
TTAATTATTCATATTTCTATATTCCTTTTCAGTCTGCTGTTTAACATATA
CTCCTACAATCTGCTGTTGCTGTTGTTTCTGATGATGAGATGATTAATTT
TGATGAGATATTTTACTTTTTGTCAGAACTTCTGTTCAAGAGATGATACC
ATATTTTGCGGCGTGTTTGATGGTCATGGACCTTACGGCCATTTGGTTGC
TAAGAGAGTGAGAGATCTTCTGCCCGTAAAACTTGGTGCGGATTTGGAGA
AAGATGAGGGCAGAGAGACACATACTAGCAACATGAAAAACAACACAAAT
GAAGTAAGCTTTCCTCTAAACCCTGAGACAACAGAAACTACCACTTCCGC
TAGAGCTGAGCAGAATGCAGAGCACCCAGAGATATTCACAACATTCAGGA
CTTCTTTCTTGCGGGCCTTTCACATAATGGACAGGGATCTGAAATTACAC
AAGAATATTGATTGCTTTTTCAGTGGAACTACAGCAGTGGCAGTGCTCAA
ACAGGTATGAATTGAATACCATAAACCATTTTTTAATGAACTCTGTTTTG
GGGTTGCATTTGAGTTGGAAATATTAGTGAAGCAGTGTGTTTGTACTCAT
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CAAGAGCTGTCTTATGCACTCGAAATGAAAATGATCAGCTCATTGCTGTC
CAATTGACAGTTGATCTCAAACCTAACATTCCAAGTATGCTTGGTATTCT
CTTTAGGATTTTCTTGTGTTCATTTTTTCTTATCCTATATTGTGTAATAG
GTGTATCATGTATGCAGTGTAGGATTTTGTGACTGTTGGGGCTTACAAAC
TAGTGTAATTAACATGCGCTTGTCTATGCCATGTGTACTTGACATTTGTA
GATCTTGTGCCCCCTGTGTTGTCTTCATCATATAACAGACTAAGTTTGAA
TATTTGGCCTGTATGAGCTTAGAGCATCTCCACTGGTAGGCCTAATAGGG
TGTCTGCCAGCGCGTGTCCGGACACCGTATTGGGACTGACTGTCGTCAAT
TTGTCCCGACGTATGGGTGAGGATGCCTCCCACCGGTGCCTCTAATACTT
TTCTAGTTTATTTCTACATTCTTTTTTCCTTTGGGTAGAGCAAAACAACA
AACATGTTCCGTGCGTGTTCGGCTTCTACCACTGCCCGCCACGGTCAGGA
CGAAAAGCCTTGCCACCACCCTCCCACCATGGAGGCCACCTCCTTCTTGC
CACCATAGATTCAGCCTCCTCTGTCCCCGCGGTAGATCCGACCATTAGCG
GGCAGCAGCACATGCACTGGCCCACACATCTGTGCATGCTCCAGCTGCCT
ACCTCCTGCAGCACTAGTGTGTCGAGGAAGCGCACAGCCATGATGCGGCC
TACCTCCTGTAGTGCGGGCGCGGGCATCCAGGATGCGGGCACGTCCTGAT
GGATCTCGAGGACCACTAGGTCACTTTGGTCGGCGTCGAGCTCTAGGGTC
TCTAGGTTGCCTCAGACGTGCTGGCCTCGCTACAGTCGGCATCGAGGCCC
AGGACTTCCGGCGCATGGCAACGCGCTGGCCACGCCACTGCCGACGTCGA
GCTCGCAACGGAAGTGAGATGCCTGCATGACTACGACAGTGTTCTTCCGC
GAGGAGGTGGTGTGTGTCGGCGAGGTTGTGGAGTCCATCCCCTTCTCCAC
TCGGGAGCTGCCAGCCTGCCATGCTCGGCATCGCGCCGGTCTTTGTAGCG
AAGCATGCCATGGCGGCTCTCGGGAGATTTGAGGGTAGAGGGCACATGCC
AGCGTGGGCTTGTCCCTGGTGCTGCTCATGCCTCGAGGCGGCATGGCTGA
GGCCGAGGGATGAGGGCTCTGTTCCGCGCCGGCAGCTCCGACCCGTAAAA
CAGTTCTTTCGCAGCCTGTAAACTGCGTTTACAGTTTCGCTGTTTAAGGT
GTGTGTTAGTGATGCTCTAAATATACTCCCACCCACTACTATATAAAGAG
CACCACCCCACCCCAAGAGGAGGTTGGTGGCATTCCCCCCACTTGGGCCG
CCTCAGAGAGAGGGGAGGCAGCTGACTACCCACCCAACCCGTAAAACAGG
CCGGCATCTCTGTCACGTCATTGTCAACCTTCGTCATATCGTCGTCAACC
TCATCATCCTCATTGTCCATGCTGCAGGGATCGAGGTGTGGATCAGAAAT
GTGAACCTCCGCCTCGTTTAGGAGATCCGTGGACGAAATTGTAGCCTCGG
ACGCATGAGCATTGTTGCTAAACCAGAGAAAAGCCCACTGTAGGCTAACA
ACTCCCCGCGAACACATCCATGCGACTCAAAGATAGAAATTTCTCACCTT
GTTGACCCATCGTCGAATATGTGGGGGGACACCGGTGGCGTTGTGGACAT
TGGAAGACGGAGGGGTTAGCACTGGGATGTGAGGCGCAGTGACCGGCGGC
GGCAGGCCGCTGCAGTGGACGGACTTCTTTGTCTTTGGCCCCGTCGCCTG
CGACTTGGCGTGGGTCGTCTTTGGCTTCGGCACCGGGGCGGGGGCCGCGT
TGGGGTTCACCGCTGGGACAACACCGGTGCCTGCCGTGGCTTGCGGGACT
AGGTGAGTGCCCGCGTGCTTCCGCTTGTTGATGCTCGTGGCGGCAACCAT
GTTAGCAACGTTGTCGGCAGTGGGGAGATCTTCGCCCACTATGGGAGCCA
CGGACGTGCTGGCCTCACTACGGTCGGCGAGGCCGAGTTGAGGTTCATGC
CGCCGAGATTGGGCTGTGGTGTTGCAGGAGACGGTGGGGGTGGGTAGATC
GGCGGCGGCTCGTGGGCGGGAATGGGGAAGAGGTGAATGCTCCCTTGCGG
GCAAACGACTCGACGGGTGCGGGTTGCATATAATTTTGGCCCTGAGCCCG
TGAATGTAGAGGTTGACGAGTGGATTTGGCCCCGACCTGTAAATTTTTTT
ATGGATCGTCTCGTTTACGGTTTTTGATCTGCGTGGTTTTTTGTCCGAAA
CTGCAAACTGTTAGTTATTTTATAGGTTTGGCCTATTTACGGTGTTTGTT
AGTAATGCTCTTACAAGGCATGCCACTAGGTGGGGGGAGGTACTTTCCGT
TTTTGGTAACTTGGCTTAGTGGCCCACCCACTTCATGCTACTTTATGTGC
TACCTCCTACCTTACATACAACTCTTTCTATCGCTCTATTTCTATCTGCT
ATTTCCGCTAGAATGCCTACACACGCACTGTTTCTATCATATCTTCCTCC
TTGGATAGCACCATTGGACCGTCACATGGGTGGCCATTGGTGGGAGCTAC
CGGTGGCGTGCTGTGGGGGTGGGGGTGTAAACCAGCCGACCACCATGTTC
TTAACTCACAAGACGGTATAACCCAAAAGTGGATGAAGGACGTACTACCG
TAGAGGCCGTGAGGCCGCCCACAAGCAGGCCACAATGGCAGGGCATGGTA
CCGGCCAACCATCCCACCCACTTTCATGGTTATAGCTTCAAGTGTCAGAA
ACATGCCCGACTACGGGTTGCGAGTCAAGCATACACAAGTAAGAATGTAC
ACCAACGACCTACAAGAGTACATCAGAGCATATCCATCTATGAAGAAACA
GAAATATATTGCAACGCCATTACGGCAAGGTCCAAATATATAGATAATAA
TATCATAGTTGGGCGCTTGACCTCATACATCATTCATCCAACATTAAGGG
GAAGCGGAAAACACAGATCTGAGTACGGATTAAGAGTCAAATGGGCGTAA
GATGCCATGAACAAAGCACATTCCCGCCCACTTACCCCAGAATCTCTACT
CAAGGGAGTCATTGCCTCCATCATCGGCGTCATCAACGAAGTATCCTCCA
TATGGGTATACCTGACAATCTTATCAGTAGAGTGAGACCCTAGGGGCACA
CTCAACAAGTCTTTATGCAACTAAAGGAATTAATCGGGGTGACGTAATTG
TAGTGAAAGATAAAATATCTAAACAATTCTATAGAGACACGCTACAACAT
CCGCCTAACAAGATATAGACGGATGCTCATTAATCGGAACCAACAGATAT
ATATATATATATAACATAAACTAAACATGTCCTCCTTCTCGCTTACCAAA
CAAGAAGGCGGAAGGACATCCCATTCGTTGGCAATTTTATTAACCATTCT
ATGAGTATTGCACTATTTACTGGTCATGTTTAGTCAAGTTAAACGCAGTA
CTTTAGTTTGAGTTGTCTATGATCGAGAAACTATGGTAGTCCATAACCGT
GGACACGGCTTTCGAAAAGATTTACCCTGCAGGGTGCACAAATAGCACAC
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GCTACCCACAACGAAATTGGTCGTGCTCTGAAACGGACCCAGAGGTTTGC
GCCAATGGCGGTAAAAGACTAGGAACCCGAAAGTGTGACTGGGTGTCGGC
CTCGTGGAGAAAGGGGGTCACCACGGAGACTCCCCGTAGACCTGACCACG
CACCACAGACTCCCCGGTGAGATACCTGGCGGCTTCGCCCGGGAAGCAGG
CCGCCCAGGTTCCCAGGGACATGGAACCCCGGGAAGAAGAGCGCGGGACC
AAGCTGACAGATGGCGGTCGATGCCTGACCTGCGTGGCAGGCTACGACTG
CTGCCATCATAACCCTACGCTCCTAGGGTGCGGCATCCTTGAGCCACGTA
GAGACCATGCATGCCATGCCCGGCCATGTGGCGTGACTATGCTACCGCGT
GTCTGTCGACCCATGTGGTGTCCCCTTAAGCTTGTAAAAGGAGGCCCAGG
TCACCGGACGTAGGGGAGTTTTCTTAGCTTAGATCCTTCCAAGGGAAGGA
ACCCTTGTACTCGTGATCATCCACCAGATAGTTGATAGTTGCAGGACGTA
GGGATCCTCACATCGAGGACCTGAACCTGGGTAAAAAAACCTGTCTGTGT
GTGTGTGTTCGTCTAGCTCGCCGATCGAGCTCGCCGGACGTTGCGCCCCT
GCCGAACTAACAAAGGGGATCCCTATCCCCGGTGTCGAAAATCAAGACAT
GACATCTGGCGCGCTAGGTAGGGGGCGTATTGATGGCGATTTGTGTCGGC
AAGTTGTGACGCCGGCTTGCTTGGTTGGGCTCGGGCCATTGCGGTACCTG
CGGGCTCTAGTTAGGAATAGGTCAAGACACCAGCTATGTCGTATCGGCTC
GCCTTTGACGACCACGATCTGGCGGCGAAAACGGAGCACGGCGGTGGCAC
AGTAGGAAACGGCAGCGGGGTTCGGTGGGGTTTCAGGAAGGGAGGAAGGT
CGCGTTCGACGCAGTGAAGCGAGGCGGAACTCGACGTGCTCGCGGATGGG
CTTGGGATGCGCGGCAAACGAAGCTAGCTTGCGGGGTTAGCGCCGGGCGG
CGGCGCATGCAGGGTGCTCGACGAAATGTTCTCGCAAACCAGGAAGCAAA
CGAGTACAAGGGCATGTCCGGGACGCTTAGATGCTCACCGCGGGGCTGTT
GATGCTCGAGGAGGCTGCGATCTGCGGCGAGGCTCGCGTCCGACTCGTTA
GGGTTTCGGCTCGGCATCTTCACGATCTGCTGCTCCTGTGGGTTCTCCTC
CCCGTATCCGTGTACAGGCGCAAGCACAGGCACGTCGTCGGTCTTCCTCA
ACGCCCAGGGCTCCTCTCCTCCTTCACCTCTTTGCCGGAAACAAGCTGAG
CTGAAGCTGCAGCTATGGCGGTAGGTTTGGCTAGCAGGGAGGAAGGGGAT
TGGGGAAGCTCCCTAGCGGATCTGATCTGGGAAGGTGACCAGGGTAGGCA
GATAAAGAGGAAGGGACTCGACCCTGGTTAGCTAGGAGGGCTCGGGTTTA
GGCTCCTTTTCCTTCTCTGTCTGTTAGCTCAGAGAGAGAGGAGGGAGAGG
GGACCAGGGGTTTGCGAGGTGGTTGGTCTGCTTGCTTTGCAAGCAAGGAT
GGTGGGGGGACGTGGCCAGTCCAGGGCCATGTGTGCCATGGCAGCCATGG
TGAACTTGGGATGGCATGGGGTTAGGGTTTAACCTTGGGTTAGCTAGGTG
GGGTAGGTGTTGAGGTAGATCCTAGTCTGGTTCGACCAGACCATGAAGGG
GGAGGTGGTGGCTCGGGTAGATTAGGGTTTTAGAGGGTGGGTAGCTAGGT
AGATGGTAGGTTTGGGTTTTATTTTTCTTTTATTTTTACTTGTTTGATTT
CTCTTCAAACTATTGTTTAAAATTCCAAACCATGCCAAAAGAACCAATGT
GAGAATAAAGGAAGGGAGATAGCTTGGATATGTGGTTTATTGTATCTGGT
TTTATTTGTCCTTTAGTTTGAATTCAATTTATCATATAACCATGTTTAAA
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TGCATGTAGTCATGTTGTAGTTGTAAAACAACTTCACTCCCATGGACATT
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AATTGATGGGCGTATTTGAATTAAGAAGGCCAAATATAGTGTGTATGTAC
CGCTATGATTAAATGTGACCTTATTAAGTCAAATATACTTACAATTTGAA
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TAGGATTTTGGGGATAGAACCAAAAGAAGGTGGCAATGTTGATAGATGGA
TAGATTGTAATAGATATGCCCCCAACTCAACTTGGGCATCAAGTAATATA
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AAATGCAAGATGCAATTATAAGGATAAAGAACCAAATACAAGTGTTTGAA
TATGATGCTCAAATGCAATGTGGCATAATGACATGACCTTGATATTATGA
TGATGCAATAATGACAAGTAGAGAGTAGCATTATATTAATTTATCATGTA
GCATTACAATATTAGACAATTGGGATGCTACAGGGGGCATCGCGCCTAAA
TCTGGAAATGGGTCTGAATTAACCAGTTTAAATAGTTTAGTTTCTAGCAA
TGGGCTTAGCTGGTTCGGTTTGCTATGGGTCTACCTTGCCAGCAGGTTGG
TTTAGTTTGGGTTTACGGAGGAACGAGTTGGTTACGGTTGGGTATGGGCC
TATTCAATTCGGTCCCTAGAAGTTATTAACTATGGTTGAGAACCGGTTCT
CCATAGTGGTTCTGAAACAGCGATGAGAAGAAGCGGCCGCCGAGCCAGAC
AGAAGGGTCACTGCCCGTCACGGATACGGTGGTGGCACACTAGAACATCC
AGGCGGTGGTGATTTGAAGGAAACCATGGGCCCAGAATTGGCGAGGAGGC
CTCCGCCCGCCGCGTGCTTGTGGTCGTTGTCCTCGTTGACGGATGAGCAG
CAACAGCGCACTTGGTTAAGCTGCAGGTTGTTACCTGTATGTACTCCTGT
ACAAGTGCATGCAAACACGGATGGTTAACTGATCACAAACCGCAAGTTAG
AACCATGGTTCCTCCCATTAATTTAGTCCGGTTTAGGTAGAGATAGCTTG
CGGTGTAGTTTGGGTTGGGTGACAATACAATTTTTGGCAGGTTAGTTTGG
TTTAGTTTCCCTCAATCCGTGCCGTGGTTTCAGTTTGGATATGGTTTAGT
TCCCCAACCATTGCCAGGTTGAATCGCTCCTCTTGTGCTGCAAGCGGCAC
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GGGACCAATGGGAGCTGTCAGAGGCCGTCGGTGGGCCATGGTGGGAGCTT
GAGGTGGCCGTGCTCCTGGCCGCCTTGTCCTCTTTCCTCGCTCCTTGGGT
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TTCCTAGGACAAGATTATCATAGGACTTCACATAAGTATCATTGCAAGTC
GTCAGATGAGCAAATTTACGTTGCCTTGCGGTCAACCTGAAATTCGTGTC
ACCACATTTGCTATTGAGGGCACTGGTGGGAGCTATTTTTTCGTCCAGCG
CCCAATAGACTACTAGCCGGAATTACCGGTGGAGATGCTCTTAGCTTATT
TATGAGGTTACCCACATATAACAATTTATTTGTTTTAGCGTGAGGTAAGG
CAACCAAGCTTGTCGTGAGGTGTTAGTACATTGATTTATTAGCTTAATAT
GTGATCCATAAGGTGTTACTACATTAATCATGGTAACCACATAGTTCAGT
TGTTGATTTTATGTGATCTTGAAGTGAAAAAATGGTGAACATCATCTTAC
TGACAAAATATGTCGTTATGTTTGTGGTGAATTAACATGTTCTTCTCATT
GTAATTATAAATCAAATGTTCCTGTTCTCATTGTAATTATAAATCAAATG
TTCCTGTTCTCATTGTAATTATAAATCAACTTGAGAGGTCTTTCGTCCGT
TTTGCACCCAAGAGATCTGTGAAAGTAAAACAAAGTGTTCATTTTTTATC
GGTAATTGTGTTTCTAAAATGAAAACTACACTTCAAAAAATTGGAAATAG
CAACAGTGTGATGCTGACAAGTGAAACCTGTCTGTCAATGAGACTGGTGT
TAATTTCCATATACCAAATTCTATTGTTTTGCTGATTACTGAGCTATATG
CCCCTTATAAACAAAAAAAGTACCTGTACTCCAGATGATTGTTTAGTCAT
GCTTGTACATCATCTGGGGAACTAGTTTGTTATCTTAAGTGTCTTTTTGC
AAGATATACATGTTGGGTTAGTAAATTGTAGAGAGGGGAGTATATGATGA
TGGCAGACATTTAAATGTTACTCCAGCGTCAAGTAATGCTGCACTGTGGG
TGAAATACCATGCATGAATAGCTGCCAATGTCGGCTGTGTTTTTAAGCCT
TTTTTTTCTTCAAATTATACACTTCCTGTGAGGTTATTTCTGTTGAGATG
GACTGATGGATCACGTCTAGATAAAGGATTCTTTAGACGCTTCTGACATG
CATATTAGGAATTTAATGGCATGGTTGTTTTTCAGGTGAAGCACAACGAA
TCAGGCAACGCAGGGGGAGAATATTTGCACTTCCTGAGGAGCCAGAGGTT
GCTCGTGTTTGGCTTCCTAAGTATAACTCACCTGGATTGGCCATGGCAAG
GGCATTTGGGGACTTCTGTCTGAAGGAGTATGGTCTAATTTCTATGCCTG
AAGTCTCTTGTCACTGTGTCACACAAAAGGATGAATTTATTGTGTTGGCG
ACCGATGGGGTGAGCACATCTTGACTTTTAATTTCCTGAAATTTCCGATT
ATGTGCTATAAGATATGATTATCTATTTTTGTTGTTGTTGTAGGTGTGGG
ATGTTCTTTCAAACACCGAAGTTGTTAGCATCATCAGCAGAGCCACTTCT
CGTGCTTCTGCAGCACGCTTCCTAGTTGAATCAGCTAATCGTGCCTGGCG
TACTAGGTACCCTACTTCTAAAATTGATGACTGCGCTGTTGTCTGTCTCT
TCCTGAATACACAGGAAGCAAATAAAACCTCCAGTTCTACAGCCAACAAT
TTGGCAAATGTTGTAGAAGTGAGTGGCGATAAGCATTCAACAATTGTCCA
GCTTAGCACTGGAGTATCTGCTGAGAGATGAGCTCTCTGTTGTTGATACT
GTTGCAAAGCCAGTTACTATCTCAGATCTGAGGAACGATGATCCAGGTAC
AAAGCAAAGCATCATGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.