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GrainGenes Sequence Report: AE000965

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Sequence
AE000965
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000965
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCACGAGGTCCTATCTGAAAAAGTGGCCAGTTCTCTGCCGACAGCCGAGC
GAGATGGGGTTCGTCGGCGACCAGGTGGAGTCGATCCGCTCGATGCAGGT
CCGCCAGGTGCTCGCGCAGATCATCAGCCTCGGTGACGCCTGCTCTCCCA
TTTACTTCTTCTCCTTCCTGCCCCCGGCTTTAATTCATGATTTCTTTCTC
ATCCCGAGAAGTAATTTTCGTGATCAGATGGTTAGGGCCACCGTGTGATT
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TCTCGCTGTTAAAATTGGGAGAACAGGTTTTTGGGTTGTTGATCTGGTTC
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ATAATTTACAGTAGATGCCACTATGCAGTTCTATTTCAACTGATAAACCG
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GTCAGCATTGGCTTCAGCAGCATCACATTATGGGTCGGGCTGTAGGGTGA
GTACCCATGACTTTTGCATCATTTATCTGCTTTCATGCTGGTTAAAAAGA
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GTCCATATGGAGGAACTTTTCCATCCGATTTTGGTCGAACCCCTTGGTCA
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TCTGATCGGTGCCCTCGGGTTGCTGGTGATAACATCGAAAGACTGAAGAT
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AGATATCTGTTGATCGTGCAGCGAAGGAAAGACTTCTTTTATCTGGTTCG
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TGATGATTTTTTATTGGAACGTCTAGCCATAGAACAGTCTAGACATAGTC
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GACGGAGGGGGTAATTTCCAATAGTTCTGCAGACTACAGCTAGTACATCT
TATAAAACTAGTGCTCAAGAACAATGCATTGATTCCATCACTCAGAACTA
CATTCCCTAATTACTTCTACAGCACAATGAGCCTTTATCTTGTTCATTTC
AGCTATGACATCGCTCATGGACGGCCTGTCAGTTGGTCTTTTCCTGCTGC
ATGCTAGTGCAAGTCTTGTGACGGAGTGCATGTAACTATTGATATCTCCC
CGTTTCTTTTCAACTGATAGCAGAAGGGGATCAATAATATCCATCACTTG
TGCTGGATATGCCATCTTTGCATACTCAACCAAGGTCAATCCTTCGGTAA
ACATAGGATGTGTAGGCGCTTTCCCTGTGAACATCTCAAGGAGCACAATA
CCGAAACTATACACATCTGCACTTGGGGAAATTTGACCACCTTCACCGTA
TTCTGCAGTTGCACAAACAACATGAATAAATAATACACAGAGCAAAGCTG
CCTGATTTGATGCAACATTTATAAAATAGAATTTAGTTACCTGGAGGAAC
ATATCCAATTGTTCCCACTATGGAACTCTTTGAATTGACCAACTGCTCGC
CTTCTGGATCTATGAGGATCTTTGCAAGGCCGAAGTCTCCAACATGAGCA
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TATTTTTGGCCGGCAGTGGTTGTGCAGATAGTCTAGAGCGGCGGCAATAT
CAGAAGCAATACTCAGTCTCTGCATTAGTGTTAGAATTTTGACTGGATTC
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GAAATCGAGAACAATGGCTTTGAAGTCATTCTGGTTGAAGTCGGAGCAAG
AGCAGCAAGTTATAACACCAACCAAGTTACGGTGGCGGATTTTGCCAAGT
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CCTTATAAACGCATCCATATCGTCCAGTACCAACCAAATTGTCAGTTGTG
AAGCCATTTGTTGCTTGAAACAAGTTGGAATAAGAAACCCGAGGATACAT
GTCACCTGTCAACGAAGGAGCTACCTGAGTTGATGGCAGTCTTAATTTAT
TTTTGAATGAAAAGAAACCTAGTGCCATTAAAAAGCACACAAAGATGACT
GTAATGCTTGGGATCACTGCATTTCGAATAACTTGGGATATCCTTTGACT
GTCCCCAATTGTTTTGGTTGCACATGAAGGCAAATGCAACTCTTGAATAC
CACCACAAAGCTTACCATTCCCGTAAAAAGTGAACCCAGTCAAATTGGTG
AACACACCATGTGCTGGGACTTGCCCATCAAGAAGGTTGAAGGATATGTC
GAGCCGGTAAAGTGACGGCATGCTTTCCAAGTTCTCGGGGATCTGTGCAG
ACAAATTGTTGTGTGCAAGATACAGTTCGTTCAGGCCATTCATGAGTCCT
AACTCTTGAGGGATCCCTCCCGTGAGTCTATTTTTGGTCAAATTCAGCAG
TGTCAAGCCTCGCATTCTACTTATGGACAAAGGAATCATACCGTTGAAGT
AGTTACCATCCAAACGGAGCTCCATCAAGCTCTGGCATTTGCTGAGAGCA
TCTGGCAGCATCCCAGATAAGTTGTTCTCGTGGATGTACAAGTATGTGAG
CTTTGAGAGACCACCAACTTGGGATGGAAGAGAGCTACTAAAATGATTCC
TAGACAAATCCAGAATGTATGACAAGGATGATAGGCTAAAGATCTCTCCA
GGTTATGGACCTGAAAGCGCGTTGTTGGAAAAGGTTGCACTGACAAGCTG
TTGTAGATTTCCAATGTTCATCGGAAGAGGTCCTTCCAACATATTGTTAT
CTGCCGAAAGGTGCTGCAACCGTGTTAAGTTCCCGAGCGAGTACGGCATC
ATCCCAGAGAGTTGGTTGTTCTCTAATGTCAAGAACTGGAGCATGTTCAG
TCCTCCTATGCTGTCCGGTATAGGGCCAGTAAAACGATTGCCAGAGAGCC
CTAGCTTGAATAGTTTGGGAAAGCTGCCAATGCCATATGGTATCTTGCCA
GAGATTTCATTGTACCTGATATCTAGGGCTTCAAGTTGCCCCGATAGGTT
TGCAACGGAGGCCGGGAGCCCACCGCTAAACTTGTTGTTTTGCAATGTGA
CCCAACGAAGGCTTGTGCAATTTGTCAGGAGAGTGAGGAACCCCCAGTCC
TGAACAGTGGTTGTCTTCAGCTGGTTTCCGTTGAGCATCAGGTAATTTGG
GCAGAGTGTTCCAATCTCTGGAGGAACGGTTCCGGTGATGTTGTTACCAG
ATAGGTCCATGGACCGAATTGTGGTTGCATTTGCAATTGAAGCCGGAATT
CTTCCCGTGAAATGGTTCTGAGCAAGGATAAGGTATTGGATGCTTGGGCC
CAAATTGGAGGGCAGAGCGCCTCTTAGTCGGTTCATTTGCAGACCGACGT
GGACGAGTTGTGAAATGTTGAAGAGCGTTTTTGGAATGTTTCCTGAGAGA
TGGTTTACTTCCAGTGCTAGAGACTCGAGCTTACTGAGCTTGCCAAGGCT
CTCGGGGATTGGGCCACTTAGGTGGTTTTCATTGAGGTACAATCTCCGGA
GCGATGATAGGTTTCCAAGCGATGGTGGGATGATCCCAGTGAAGCTGTTC
TTCCCAATTGATATGGTCTCAATCCTTGACAAGTCACCAAGCCAATCAGG
GATTCGTCCGTCGAGTTTGTTCAGGTCAAGTTTGACACTTGCAAGAAGAG
TGCAGTTCCGCAGGCCACGCGTGATCTCCCCTTGAAGCGAGTTGTTCGAT
AGGTATAGGAATGTCAGCTGTGGTAACCGGCCAATCGTCCAGGGCATTTC
ACCTTGGAGCGAATTATTTGACAAGTCAAGATATGACATTTGCATCAACT
GGCCAATCATCCATGGGATGTCACCGTGTAGTAGATTGTAGCTGAGGTCT
AAACTCCTGAGGTACGTGAGGTTCCCGATGGAAGGAGCTATGTAGCCGAG
AAGCCCAGCCGAGGAGAGGTTCAGCGCCGATACCCTTTGCTTATACCTAA
GGCTGCAGATGACACCACGCCACTCGCAGAAATCAGTGGTTTTATTCCAT
GAAGCCAGTGCATCAGCTGCCTGGAGGTTTAGACCTGCCTTGAATTCTAG
CAAGGTATCGAGATCAGTCTCATTGCTGGATGGCAGTGGTTGAGAGTACG
GAGCCGTTGCCAGTAGAAGCAGATGTGGCAAGAGAAGCAAAACCAGTTGA
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AGTCTTGGAAGCTTCTCTTATGTTTTGTCTAACACACAATGATCAACAAT
TTGACAGAAAATACTAGCCACCATCATTATGGGATCATGCCATCAACAAG
TAGCAAATTATCCGGTAATAAATGGTCAAGATGGCTGCATTTAGTAAACC
GGCTCAGGCTTGTTCAAATTAACGATGTCGAAGATCAATTGTGCAACTCC
TACTATCAATTGTGCAACTCCTACTATTACACATTATCTATTCCCTCCGA
TCCATATTTGTTGTCTCTGTTTTACTAAATCAGCGACAAGGGAGTAACTA
TTTTGTTTTGTAGAATTATCTGAACATATCACACCCCCATTATTTTGCAA
CAAATGTTGAGCATAGAGTCTAGTGTAGGATGCAGTTTGTATGATGGGCA
CATACATGAAAATAAAAAGGTCACCAAATCAAGCAGCAGCTCATCCGAGG
AAGAAAAAAACAAAGAGCAAGAGAGATCTTGTGTCTGTTTTTACTCTACT
CCAACTGATATACCCATGAAGACTGGTAAATTGTACTAGTTTTTTTTTTT
GAGTATAGTAAATTGTACTAGTTTGGAAGATAACTTGCACCGTTTCTTGA
TGTTCAATGAGTCAGCATGATGGATTGCATGATTTGGAGGGGAAAATGGC
GTGGAAGGAAATAACACAAAAAAGAAGATGGGATAGCAAACAAAGGTAGT
CCCGGAGAAAGCAAATGTTAGAAGTAGTACCTGAACTCCTGAAGCTCTCC
TGACCAAAGCTTTGCTCTTGCTCTTTGCTGCCTTGCTCTGGCCGCTTTTA
TCGCTGCCTCCAGGTCCAGGTACTTTTCGCGCTGGAATTGGAAACCATGA
CTCCTGAGCTTCGGCCTGCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGAAAACAAAT
TCACATTATAGAAGACAGCAAAAGGAGAATTCACATTAAAGAAGACGGCA
AAATGACGACGTGACAACTGGGGCATCGTTCCACGAGTAACTGACACGGT
TATTTCGGATGTGTGGGAATCAGCAAGACTGTACCTGCTGCCGCTCATGT
TCGCACGTGTGTCCATATATAGAGTTTGTCGCAGCTACTGTTTGCACGTG
TGGAATTCATGGAAGTTCCTTCATATAAGAGGTTTCTAGGGACAGAGCTA
CCGTTCGCCTGTGTTGTCGCTCTCTCTGTTTCTGCCCTTCCATTAAGCGA
GTCCACATCACCGTGCATCAAATTGTTCGCGAAAGTTCAGCACCAGTACG
CTCCTGTTTGAGGCTTCGACGTCATACTCCTTCGCATGGTTTTTCCATAA
GACGATTGAATACCATATGTGTTTCTGGGTGCTAGCTGCAAGGCCGTGCC
TGACGTCTGAACTTTTCAGATTAGTCTGCACGGTTGCACAGGCTATCTAC
TAGGATGGGTGACAGCATTCTAATAGGTTAGATGTTGTTTAAGGGAGTTT
TGGTTTTCTGGTTTAAGTGACTCATTTTTTTGCTAAAAAAGGCTAGTTTT
GCGCAGTAATTAGTTTTGCTAATTCTTTCTGAAGTCTGGTAAATTATTGT
TACTTGTGTTAATTAAATCTGTATTTTTGTCTTGTCCTGCAAATGCAGTA
TGGATATATATATATATTATATATATATATATAATAAGAATGTAAAGAGA
AAATACATTATCTAACAGTTTTGTTTTCTAGAATTTATCTGATCATATCA
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CCGATTAGATTAGAAAGATTGTTATATACAGAAGGTTCAAAGAACCGAAG
CCAAAAAACAAGGCGCTAGGCCAGGGTCCTGCGCATGGGCGTCCGCCCTT
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GCCTATTCCACTTCTTCCAAGCCCCCCACATGGCGTAGATGAAGGATCCA
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ATGGAAGGTTGTGCGATGTGCAACTGCGCCGTTTTTGTTTTACTTCAGCT
AGCTAGTCTAACTTCGATGTTCAACACGAAGGTGATTTGGTGCTCTACAG
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TTTTTTCAAAAAGGGGATCTGTCCTAGCCTCTGCATCGACCGATGCATAT
GGCCTTTATTAATCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.