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GrainGenes Sequence Report: AE008801

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Sequence
AE008801
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE008801
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCACCCCCAACCCCCGCCACTTAGGGTTCGCGTCGCCTGGCCTCGCCGC
GCCGCGCCGCGCCGCCGCAGCCATGGGTTCCTCGCTCCCTCCCAAGGAGG
CCAACCTCTTCAAAGTCATCGTTGTAAGCACCCCGCCTCCTCCCCTTCCC
CCTCGCTACTCGAATCGATCTGTTCGGCCTCCGAATCCGCTGCTCCGTGG
CCGCGTCTCGCTCGATTCGGCAGTCTGGGTGCACCCGGCGATTGGTGATG
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TCGCGTCGCCAGGCTGATATCGGGGAGAGGTGAAGCTTTAATTTGCGAGG
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TGTCTCGTTCCTTGTAGAAACTTTATCGATGAAAGGTTTGACACTAAATT
GCATGGACCGGAAATCTGAAGCATACGAGCTTGTTCGCCGTGGCTTGAAG
GTTCTTAATTAATATTCAAAGGGATTTGGCTCTAATTTTTTTTGTGATGA
TTCATGTTTACAACAATACAACTGATGTATCAATTTGCGCTAACTTTTGC
AGAATGATCTGAAGAGTCATGTGTGCTGGCATGTCTATGGTTTGCTTTAC
AGATCAGACAGAGAATACAGAGAAGCTATAAAATGTTACAGAAATGCTTT
GAGGATCGACCCTGATAACATTGAAATTTTACGTGACCTGTCACTTCTCC
AGGTTGGTACGATAAACCATTGTATTTCCCCCCTATTTTCTTCATAAACC
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CATCATAGACTTGGCCCATAAGCATTTGTAGATGTTCCAATCCAAGCATT
TGATTTTGTTGAGGTATTAGTACTGGATGAGTGAACAACAGGAAATAATA
TAACTAACTTTGTATGCCGGAGATACCTTGTTACTAGTGTTGGTAACACA
CTAATGCATAATACTCCTAAGAAATCCTGTTTGATTTTACCAATACCATG
ATTTTAAAATGTTATATACTCGTCTGTTATTTAAGGTGTAAGTTTGATTT
TACCTTCTAATAAACAAATCTTATTTTGTCTTTTTGACAGGCACAAATGA
GGGACTTATCTGGCTTTGTTGAGACTAGACAACAGCTTTTGACATTAAAG
CCAAATCACCGCATGAACTGGATTGGCTTTGCTGTAGCTCATCATTTGAG
TTCCAAGTACGCCACTTTCTTGGTAGCGGTCAATTTAGATCAATCAATTA
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TGTCAGCAGTAAATAAGTATGGACTGACTATAGGCTCATGGCCGCCTATA
TCATACTGTTATTAGAATTCTTCCGCAACAACATGGCATAACTAATGAAC
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GCTTGCTGTTGCATGTATGACAAGATGTAACCTTTATGATATCAAAACTT
CACCACTAATACGGACATATCTGTCACCTACTTGTAGTTCTTCCAAGGCA
ATAGAAGTGCTCGAGGCCTATGAGGGAACACTAGAAGATGACTATCCTCC
AGAAAATGAGCGATATGAACATGGTGAAATGCTTTTGTATAAGGTGCCTA
CACTTCTCTCATTTTTCTGGGTTGGGACTGCAGTACTAGCACCAATGTTG
TCAGTATCGGTTTGCATCTAGCTTCCACTTGGATGAACACTGAACTCTAA
CCGTAATTCACAACAGATTAGATATCTCTAGGGATCAAATATGTTTTCAT
GTCATGGTTTGGTTATTATATCTACATGTAATAGCTGACATAGTGCTGTT
AGCGAAATCTCTGGGAATTGCTTATAAGCATTCCACAATCCTGACACTAG
CTTGCTGTCCATCTCTTCTTTGAACGTTGCTGACGTTTTTTCCATGTTCT
TAATCCCATGCCACTTGAATTGTGTTTGTAGGTTGATTTATTATACTTAT
TGTTTTGGTGTGACCCTGTTCTGTGTGCAGTATTAGTTCTATTGCTTTAG
CTCCACTTTCATTGCCGATAAAGTTTGTGATTTCTAAATTGATCAAGTGA
TATTTAGTACGTTTTCTTACTTACTCCAATATGCGCTGCTGTAGATGGTC
AAACTTCAGTTATCAATATATTTACGAACATTTAGATTCGACATATGAAA
TTGGTTTGTGTAGTCTAAAACCCATCCTTCATACTCCCTCCGTTCTGTAA
GTAAGTGACTTGAATTTGTCTAGATTCGTAAGTCACTTATTTCCGGACGG
AGGGAGTATTATATATCATTACTACTACCCTTCATGAATAAAATAAAATA
AAATTACTGGTCAAAGATGTGTTTTGGTCTCCGTGTCAATTTCTCAAATA
TGACTTATTTGTGGCTAGAGGAAGTACATGATTCCAGTGTGCAGTATAAT
AATATTTTTTCAACCTTGCCCCGCTCCACCTTTAGTTTCATAGTTACTTG
ATGCTCTAACTCTAGAATTAACTCATTGTTTATTGCTATTCATTATCGTG
CTATTGTGGTTTCGCAGATATCGTTGCTTGAGGAATGTGGGATGCTGGAC
CGAGCCCTTGAGGAGATGCACAAAATGGAGAGCAAAATTGCAAGTGTCAT
CTTTCCATGTGTAAAAGAAAAAAAACTGTTGTATAACATGTTGTCTTCTT
GAATTTCATCTGCCAGGTTGACAAGCTATCATTCAGAGAACAAATGGCCT
GCATTTTATTGAAACTCAGCCGTTTTGAGGAGGCTGAGAAAATATATAGG
TCCCTCCTTTTTATGAATCCTGATAACTACAAGTAAGATGCTTGTACTTA
TTCTTACGCTTGCCTTTGTTGGTAATTTTTGTTTATGTACTTTTGCTGCT
ACTTTCTTTACATATTTTGTTTGTTTTCCTTCAACTAAGATATGTGCCTG
TATTCATGAACTGTAATCATTCAGAGGATAACTGTATTTGGGCAGTATTA
TTCTTTAAACTACTTGGGCATTCTATCACTAGATATAAACCTATAAGCTT
TGGTGAATTGCCGTCTTTCATGTATGTGACCTGGCTAGAATTTTATTGTA
GTTAGATGAAAATATGGAACTTTAGTCAATGGAGCAATTTCACCATCTAC
ACTACTTGTATTCTAAGTTGGTTATGATTATCTGCCTCCACATGCACAAT
TTCTGTGTGGCAAATCTTTGCATGCTTGTCTCATACAGAAATCCTATCCC
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CCCCTCCAACAGCATGAAGCAATAAACAGACACACATTTGGGATTAAAAA
GGGAACCATTGCAAAACTTGACCTAAAACATATGATGTCAACTTGACTCT
GGAACTCATTTGTATGCTAGGAGAAATATGCTACCTCCTTAAATCTTGTA
GACAGTCCTAACTGTTATGGTAAACCTACTTCCGATACTCTGGACTTGCT
TGTCACTCGTTTCTACTCAGGTACTTGATAGCCGTGCAGAAGTGCCTTGG
GCTTTACTCTGAGAATGGTCAATACTCAGCTGATGATGTTGAACGGCTAA
GTGCATTATATAAATCACTTAAGGAAGAATATAGTTGGTCATCAGCTGTT
AAGGTAAACCTCATTTTTTTAACTTGTAATTTCATTTGCATTGGTATTAT
TTTTGTTCTTTCGTGTATCCATGGTTGAGACCTCTGGGGACACAGCAAAA
ATATTCAAGATGTAGGAATATTTTTGTTTATTTTTATTTTTATGAGAATT
ATTTTGTTCTATATGCAAAGTCAAAATTTGTTTTATCATCCACTGTCTGC
TGGTAGGTCATATACTTGATAAGCTGTGAATCTAATTTTTTTCGTGCCTT
CTTTGCAACAGCGGATACCTCTTGATTTCCTGGAAGGTGCGAAGTTCCAG
GAGGCAGCAGATAGTTATGTCAGACCTCTATTAACCAAGGTAATTATAGT
AATTTCACTTTAAGTGACAGGCTGTTAGCACCTGAAAGGTGTGTGTGACA
TTTCACCTTAAGATTTTTGGGCTTACTGGGCAGCATGCTGTTACTCATTG
TTGTAATTGATCGAATGTGCCACATATCTTGTAGGGAGTACCGTCACTTT
TCTCTGATTTAAGCCCGCTTTATGAGCACCCTGGCAAGGTAACACAAGTT
GGACTAGTCAACATTATTTACTTCTTATTTTTACTGTTTGTGTTACAAGT
CAGAGGGATATTTATGGGACGATTCTGAATCTCATTAATAGGCAAACATA
TTGGAGCAATTGTTTCTTAAGCTAGAAGATTCAATTAGGACTTCTGGATG
CTTTCCTGGAAGGTAATCCTTTGTGCCTGGCCATTGTTTTCCGATTTATC
ATGTATTATTGTATCCCAATCAATCTGAAACTTTATATTTATTGGTTGGC
ACCTTTATATTTATTACTGGAAGCTAATCCTGTCAGGTTGTAATTTGTTA
TCACTCAACCAAGACTTTTTCTCTTCATGGCAACTAATTGAACACCTATT
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CTTATCTTCTGCTCTTTCCTTCATTTGGCGTCCTTGTGAATGCACAAAAT
AATGATATAGAATGCAGTGCATCTTGTCAATGTTTCCTATGCAAGGAACA
GTAATGCTCACTTCAAATGACAGAATAATGAGACACCGAAGTTGTATTGT
GAAAATAGTCCACATTGTGCAACATGTTGAGGCTGTGGGAACTCCTACAG
AGTTCTCTGATGTAATACTGCAGGTCTTAACTTGAAAGTGCTCTACCATT
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GCAACTTATACTTATTTCTTTTATCTGTTTCTTCTTGCAGTCTGCAGATG
GAACCCCCATCCACACTCATGTGGACTCTGTTGTTGGTTTCTCAGGTTAG
CATTTGGTGTGAACACTTGTGTATCTTCTGATGAACCATCGAGTTACTTT
AAATCTTTGAAGTTGCATCATTATGATTGTCACATGTCTTGATGCAGCAC
TATGACAGAAGGAGCCAATATGATACTGCTCTAGATAAAATTGACGAGGC
CATTTTACACACACCAACTGTAATTGATTTGTACTCCATAAAGGTATCCC
CTCACTGCCCGCGCTTGTGTTATACTTAGTATGGAATTAAGTTTTATCAC
CATTTCTCCATTATATGATTCCCTACGAATCTCACAATTATTTGGAACTA
AACTTGACTCTTTAGTTATGGTTTCTTTCAGTATGGTCACTAGATGCTAG
TACATCTCTCTAATACATGGTTTCCTCTAAATTTTACAGTTTTGGAAGTA
AACTTTACTCTTAGTTAATGGTTTCTCAGAGTGGTGCTGCTTGTACCAAA
TGCTAGTGCTTTACTGCTGATAGAGTATACTATATGTCTATATCGTAGTT
TTTCCATCATTGTTGCAACTGCTGTTTCAGGCTCTTTTTGGGTAAATAAC
TAGCAGGGTTCTGCTGTATTTTCTAATAAAGAAAGTTATTTACCTTTACT
AACCATCTTTTATCTCGCCTTTCTGATCTGTAACTTCTCTTCCTCCAATT
ATCAATCTTTCACTTATATTTTATTGATCTTATTCCTCTAAATAACAGCA
ACTAAATTTACTCAGTTTCACTGTGCATTGTGTTGAATTGACCGTGTGTT
GCTAATTTAGATGGCATATTTCTTTGTTAATAATCATGCTATTGCACATG
CTTTTATTTCAGGGAAATATATTGCAACATGCTGGCAATTTCTCTGCAGC
TGCAGCATTAGCAAATGAAGCTAGGTCCATGGACCTTGCTGATCGTTATT
TAAACAGTGAGTGTGTAATGCAGATGCTTCAAGCTGATCAGGTATAATTC
AGTTAAATAAACAACCATATTTGTACAGTGCTGCTGATGTTTGTTTTCAA
TACAAATGAAGCAGTTTGGTATTTCATTATGTGTGTTTGCGGACCTCCCA
TTGTTGTGAATAGTACACATTTTAACTGTTTATTTTGCGGCTTGTGAAGG
TCGGGCTAGCTGAGAAGACTGCTGTTCTGTTCACAAAAGACGGAGACCAG
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CCACATCACCATTTTCCTAGGTTTTCTTCACTCTAACTCGGTGATCTCTT
GTAAGGTATGAGCTTGCTTCTGGTGAGAGTTATTTTCGGCAAGGTGATCT
TGGCAGGGCCCTGAAAAATTTCCTGGCTGTTGAGAAGCACTACACCGATA
TGACTGAAGATCAATTTGACTTCCATTCATATTGCTTACGCAAAATGACA
CTTCGGGCGTATGTCTCTATGCTGAAGTTTCAAGATCGTTTGCATGCTCA
TGAATACTTTCAGAAGGCTGCTGCAGGAGCTATCAGGTAATGGTTACACT
ATTGATCTTTTCTGTTGATTATCTTGTACTTCCTTCAGGAAGTTTGGTGA
AGCTATTGTCACAAACTGTAGGTGTTACATGAAATTACATGATTCTCCAT
CAAAATCATCCACCGAGGAGAACGATGAGATGTCAAAACTGCCAGCTGCT
CAGAGGAAAAAGTTGAGGCAAAAGCAAAAGAAGGCAGAAGCTCGTGCTAA
AAGGGTAACCTCCACACGTTTCAGATCTGCTATCTCCACACTTTGTTTCA
GATCTGTTACTGCTAAGCCTGCCTTATGTTGCCCTTTAATCTCTGCAGGA
GGCTGAAGAGAAACAAGAGGATGAAATAACTTCATCTAACAGTTCAAAAT
CTGGGAAGAAACAACAATCAAGACCGGTGGATTTGGATCCACGTGGTGAA
AAATTGGTCCAGGTATTCATTTGCTAAACCATCAGTTGTACACTCCTAGT
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TCTCATTTCTTTTATGCAAGGCTTTATGTAGTGCGAGCTGTTCATCCAAA
TATTCTCATGTTGGTTATGCATTTCTGGTTGCAGGTTGAAGATCCACTTG
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TTGGAAACCCATATACTTTCGTTTGAACTTAACATGAGAAAGCAAAAGGT
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TTTGCTTTTATTTTGGATAGACTGACTGGTATTTTTTACATCTTATTTCT
TTATGATGAAGGATTTGTTGGAATGTTCTAAGAGCATGACTAACAGAGCC
CTTAAACGCCTGACCCGTAAAAAAACGTGAGTACAGGCCCCTGTACTCAC
AAATTTCACGTTTGAGGGCGCCGGCGCAGATCAGCGCCTGTAAAACCGAA
ATTCGAAAATCCCCGGGAAGATCGAACTCGCGCGTTTGTTGATCATCGTT
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GAGAGCTCGCCGGAGGACGCCGCCGTGTCCTCAAATGGCCAAAATCCGAG
CTCTTTAGTGCCTCGCCGGAGTGCCTCGTCGTCGACCTAGTTGTCGAGGA
CGACGATGTCCAGCTCCATGGCGCAGGGTCCGTCCGCCTCCTCCGTGACG
CGAATCGCCGCGATGGACTCCTCTAACTCCTCCTGCCGCTTGGCCGTCTC
CACCGCGGCGCCGGCGGCCGCTATCTCCTCGCGGCGCCTCTTCTCTGCGT
TGGCCGCGGATGTGGCGAGCGCCTTGGGAGCTCCTCAATCTCCTCGTCGC
CGCGGCGCCGGCGCGAGGACGAGGACGAAGCCTCACCGATGGCGAGTGGT
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TCCAGCGCCGGGCCGCGCGCCGCTTGGCCCCGATGGAACGGACCAGCGCC
TTCGCCGCCTCGTCGCCGCACGGATGCGGCGAGGCCCTCCCAGGTGGCCG
ACGGTCAACTCCTCCCCCGCCGCTACGGCCACCCCCAGGCCGCATTCATG
GCGCAGGGACGACATCCGCTCGTTGACCGTGCCGATCTGGCGCCGGAGGA
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CGGGCTCTGTTCGCTCGCCCACGCGGACCATAGCCCGTATACTCGCCGGA
AAAATACGGTTCTGGCCTGTTTACGGGCTCTGTTAGTCATGCTCTAACAA
CTTATGTTTTGTAATTTACCAACACAAAAACCATATGGTATCCACAATTA
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TTTTAAAAGTCAAACTATGTAAAGTTTGACCAAGTTTTTTAGAAAAATAT
ATTAATATTTATAATATGAAATACATACCCTTGGATACATCATGAAACAT
ATTTTCATGTGGTATCTACATAATATCATAGTTCTTGATAGTTTTTTCAA
AAAGTTTGGTCAAACTTTTCGTAGCTTGACTTTTCAAAAAAATTATAGGC
CTTAAGCCTTGGGACGGAGGGAGTATGTGTTTTCCTAATATATAAGATCA
TAGAATATTTTCTGAATGAATTGATTATTCATCCTGGCAATGTCAGTACA
AACAAATATTCTTAAACAGTTATAAGTGCAGTGCATATGTCAATATATCC
ACATCAGTACTCGTTTGGCCATTGTATAACCGGTCATTATTGCCTCGTTA
GTTTAGTTGGGGTTGCTGAAAATGAAAACCAAGTGAACTCCACTAAAAAA
TTGGTATATGCATGTTGCTTTATTTCAAAATAGACTTTTCCCCAATATAC
CTTTAAAGCACTAGGTTGTACATCAACATGTTAGTTAGTTTTGTAATATT
ACAGAACTTAATGGCAAATCTTCTAGTACTATTACTTTATCAGAGCAATC
TAAATAAACTAAAATAGTGTTAGAAAATTTACCATGTTTCAGAATTGTCT
TATGAACAGATGTTGCAGTTATATTTTTGAATTAGAACTAAATATATTAT
CTTAATCTTTTGTATAGTTTTCTTAGTACTCTTTATCTATCTATTGTTAC
AGGCGGTTAAACAGCTCATTAGATTGGACGGAAATAATCCAGACAGTCAC
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CAATTCTATGGAATGTGATAAAATTATGTTTCATTGTCTACTTATTAATT
ATTACATTCATGTATAACTGTGTTGACAATATTTTGGACTGCAGAGGTCT
GGGTTTGGCATGCATATTAATCTTAATTCTGTTGGTCTGAGGTTGGCACC
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GCCTTGTTATAAGGAATCAGCCCATACGCATTCGGTGTACTTGGAAATTT
AGAAGCATTTTTGTACTGAGTTTTCCCCTGGTTTGGAAGGAATTTGTTGA
TGAGCTGAACCCTGTATAGAGTAATGTCCTGTAAGGAATTGCTATTGTGG
TACAAGATTCAGTATTGCTTACTGAAAATTATTACCAAGTATTTTGGTTG
TGACCAAGTTCATAAACCAGGAATGAAATCTTTCTAGGAAATGGGTGACT
AGGGTTTATTGTTACTATCCATGATGAAGTTGTTGCTTTTTGGCTTCTAA
TTTGTTTAGGCTACTCTTTTATGACAATTCTGAAATACTTTCTGAGAATT
ACTGTATGTTTGGAGTGTGTATTTAAGCGAAACAACTTGTGTATTATTGA
GCTAAGCTGTTCTTTATTCAACCTTTTATTTATTCAATTACTTTTGCAGA
TAAGATTCTTCCACAAGATAAACAGTCTTCCTGCCCCAGGAACTGATTCG
GAGAAATTAATTTGGAACGTTCTGGAAGCTGAACGACCAGATCTAAGGTT
CTAAGCTACTGATTGATTTTATCAGTATGCACCTGCTTCAGTTTATTTGA
CTAGCATGTCCTTGCAGGCAATTACATGGGAAATCCCTTGTGGAAGTAAA
TAGTAACTTTCTTGAAAAGCACAATGGTAATTATACCTATTTTTTGGTTT
ATGGATTTTTTTTTTGCTCAGGAGTCTTACTTAATCAAATCTCGGTTTGC
TAGCTTCTTTGACACACAGAGCAGCAGCAGCTGAAATGATGTACCTCTTG
GAGCCAGATAAGAAGCTGCAGGCTATTAAATTAATCGAGGACTCAACAAA
TAGCACAGCGTCAGGGTAAAGATGCAAAAGAATAATGCGCCTCTGATTTA
TTCATCTGCTATGCACATTTTATTTATATCTAAACCTTATGCAGAAACGG
CGTGCTTGGTTCCATTAAGGAATGGGGCATTCAAGATTGTATTAATGTTC
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GTGCAGTACCCTGCTACTACCTTTGTTTGTGAAAAATAGGCGTCTAACTT
TTTTCTGAAGTCAAATGATGTAAAAGTTGACCAAATTTAGAGAAAAAACT
GTCAACAAATATAATATAATATTCTATAGATATACTATGAAAATATATTT
TATGATGTATCTACTAAGGTTGATTTGACATTGTAAAGGTTGATATTTTT
TCTAAAAGTTTGGTCAAACATCACATGGTTTGACTTTTAACAAAACTTAT
ATGGCTTCTTTTATGGAACAGAGGGAGTATCACTAATGTTCCCTCCGTTC
ACTAATGTAAAGACCTTTTAGATATCATAAAGTGGACTAGATACTCTCTA
AAATGAGTGAACCTACATACATACTAAAACACGTCTACATACATCTATTT
TAGAAAAGGGTAGAATGTCTTACATTTGTGAAAGGAAGGAGTACTACTTG
TGAGGTCTGATGGCATGCCTCGTGCTGTGGGTATTAAAATGGATTATCTA
TATCATGATGAAACAGTATTGTGGTTGTTGAACTGAATATACTTCTTCTT
AAAAGATGTTAACTTTTGGCACACTATTGAACTGCGGATGCTGGCCTGGA
CCTTTATTTTGGGCCTGTGGATAATATATTGTCAGGATTAACCTCACTAT
CTCTGCAGGGTGGAAGATACGCTGTGCTGAATACTTTCCATGCTCAACCT
ACTTTGAAGGTGCAAGGAGTGCTATGTCATATATTGCTGACAGTAGTTTC
GAGAGTTCAACAGAAAATGGCAATGTGCTTAACCCGGAAGCAAAAATCGA
AGAGGGAGATGCAGGCAGCTTGAATGGGACTGTGCATATTGTGGATGACC
TGAGCAACCTTAGCATGAGGTAAATGCGCCAACAGGTCGCAGCCTGGTTA
CAGCTGGAATAGAACAAATTTTAGAACTGGAGCCAGTGTCCAATTAACCA
AAGTGCACACCAGGATATCTAAATGAGAAGGTTTTTCGAGGGCAGGGATC
AACTTCTTGATGCATTCGTTTGAAGGGTAAATTATCGGTTGGGAGCTGAG
ATCTCTTCAATCCCTGGTGATTTTCTCAGTTCCAGCTTGTACCTTTTCGC
TGTCATCTTGCATTGGGTGAAAGGTCAAACCTTTTATCCCAGTTAATATG
AGGCTTTGCCACGGTTTGTTCCCTGGCAGCATCGATTCTTTTGTCGAAGC
CTATCTTGAATTGTTGCCTGGTTGGTTCTTTTTGTCAGAGTGCCACCTGA
GCACTTGTTAGACTACAACATTTTTGGCATAATACAGTTAATCTCAATTT
TTGTCATTCATAAACTTGTTGTTTGCAGTAGTCGGGTGTACCTGGGGTTG
CCTACCCCCTGCCTTTTCAACTTTTGGTCCCAGTAGTTGTAAATTATTCA
AGTTGATCCTGGGCATTAATATTGTATTTCGGTATGTCCAGACAAATAAT
TATCAATATTAACTGAGTTTTTCCCCATCTGTAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.