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GrainGenes Sequence Report: AE004765

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Sequence
AE004765
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE004765
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCGCCCACCATCGCCGAATCAGAGGCCGCCGCCCACCTCTCGCCGAC
CCTCGTTACCGGTGGAGGCAATGAGGCCTCTGAGGCGGCGATCGACGTCG
GCAGCAGCGACACGGAGTCGGACTCCGGCGGCGCGAAGAGGCCCCGGCGC
CGGCGGAGGGCCGGCCGGGAGGAGAAGAGGGCTAGAGTGCTAGCCGCCGT
ACCACCCGGGTTCCTCGAGCCGCTTCCGCCGCCCAGGTGTGTGACGAAGC
AGTTCTGGAAGGCCGGGGATTACGATGGCAAGGGGCAGATGCTCTGGAGC
GACCATGCGCAACACTCTGGTACTGTTCATCTGCGAAGTTTCTAGCTAGC
GTATCGCCATTGCTTCAGAATTCAGATCGGTAGAAATCGAGGTTCTGCTA
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CCCCATGTCATATATCTTAGAAAAGCATTCTGACCACCCAGCCATTTATT
TTTCTGTCCTCGGAAACTAAATTGTGCTGTTGTATGGTCTTATTAACGTG
CCAGCTTTCGCCGAGCTGCTGGACAACTCTCTTGATGAAGTATGCTTGAC
TGAAAGAGAGCACAGTTCTATTTTCCAGTTTCAAATCTTCGTGTGCTCAC
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TGACATGTTGGAAAATAAGAAAGATGGAACTCGGATGCTGCTTGTTCAAG
GTGTAAAACTGTCTCACTTTGCATAGCTACGTAGAATGATCTGACATATC
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TGGCAATACAAAAAAAAAATGAATGTCTTACTTTTCTGCCGATATGAACA
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GTACTGAAGTGCCATATTTGAGATTTGATATATATTTTCAACATTGTATA
TGAATGTGTATGTGATTCATACCTGAGGTTATTTTCATGTTCAATTGTTG
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ATGTAGGGAAGGGGAACTTTCAGCAACAGTACATATAGTTGCTCTGAATC
CACATTTTTTAGTGCGTTCATCAAGATACACGAGATTCAGTTTTCTTCCA
ATTGTACGTCTGCAGATGGAAATGGTTTCAAGACAAGTACAATGAGACTT
GGAGCTGATGTCTTGGTATTCTCACGTAGTCATAGTAATGAAGAAAGAAG
GTTGTTTTCTGTTAGCTTGATTACTGCAAACTAAAAACAGCATATCTCCA
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AAAACTATATTTGGTTACTTGACACCAGAGGCGGCAGAGTTTATGCATCC
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AAATAATGATCAACAAAATATTTCATCATAATTTAGTGACAATGAATATA
CAGCCGTGTACCTGTAGCTGTAACAGCACACATAAACTAGTGAGCTTTCC
CTGTTTACTATCTGCAATTGTAATAAACTATATCTCTGGACAGTTGTTAG
TAACTAATTTATTTGGTTATTTCCCAATTGTGTCACTACCTATCAATATT
TGCTAGAAGTTATTACTCCCTCCGATCCTAAATAAGTGTCGCTGTTTTGA
ACTAGAGTAGTTCAAAACAGCGACACTTATTTAGGATCGGAGAGAGTACT
TATTTTCCTTGCACAAGGTGCTAATCCTTTTCCACTCCTTGGGTGGCATA
AAAGGCTTACACAAAGCATTGGGATGCTATCTTATACCTTCCTGAAGAGC
ACTGGTAAAGATGACATTATTGTTCCAATGGTAAGCTCGATTTCATTCTC
TGATTTCTTCAAGATACTACTACCATTTCACTTGAGTTTGATGATTGGGT
TTCACCAGTAAGAATAGTCTAGTAAAACATGTAGTATGTCATGTCTCGTG
ATCTAAAATTTAGCTGCTGTCATTTTGTCTGTATCAAATATCAAGGTCTC
AGTATCTATCTGCCATTTAGTTTGTATCCTTATTTCTGAGAATGGCCAAA
CTAGCAAGCGTCCTGATGCTTGTATAAAATTCGTAGATTGATTATGAAAA
AGAACAAGCGTGGAAAAGGAAGGTGCGGACAACATCGGGTGACTGGTCTA
CAAGCTTACAGACGATAATACAATGGTCTCCCTATTCTAATGAAGGAGAG
CTTCTTCAGGAGGTATAACACATGTTATTGCATACCATTGTTTATGTTGT
AGATATAGCTGCGTTTGCTGTTCTTACTTAGTATTGTCATGAAACCTATT
TATTACAGGATCTGGTTTTGCAAACAAAAACCTTTCTTGTGCTACGCATT
AGTTTAGGATCGTTCCATTCTACACGTATCATGTTAGCAGTTCCAACGCC
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GTTGATGCACCCAACCTTTTATTAAAAGTTCAAAATCCAGAATTATTACA
AAGTAACAAAATCAAGGGTCACTAAGAGTTGACACAAGATATCCCGAGCG
ACCATCAGGAAACGGTTGCACCCAGTAACCATAGCATCCCGTTGATCGTG
GGGATGGAGAAACGCCCATAGCTGCGCCCAGTATGCCACCATATGAATCA
CCTGCATAAGATTGAAAGATCTTGTTTTGTTAAATGGGATTTGCTAGTTC
TCAGTCGCCTGAGAACTTCTTACGTCTCAGTCACCTCTTTCATCATTGGA
TTTACCTCGGGATTCGTGCAATGTGGGAGTTACACATGAGTTGCAACTAG
GTTGTAACTGAGAATTTAATTAGTTGCAACTAGGTTGCAACTGAGAATTA
GGACAAATATTATATCATTCATGCATCTCCAAATAGACCAACATAAGGCA
GAAATACCATCGCGAATTCTAGCCTTAGAAGCCTTGTCAATTCCATTCAA
GACACAAGACACATAGCTATTATAGCATAGAATAGTAAACTTGAATAATG
AACAAGGAAATATATAATAACTATTATTGCCTCTAGGGCATATTTCCAAC
AAAAAGGCGGGCACACGATCCACTATGGGACACTTAAGGGCCGTCACCGA
ACCCGTACAAGCTTGAGGCAATCTCCAGAACACAATTGGAGGCTTCCAAG
AATCACCACAAAGGCCACCAACCATCTAGGGTTCTAAGAACCCAAGAGTA
ACAAGCTTTCTTGATTTCACCAACCAAATCCTCCGTAGAGAACTCCAATC
AATGCACCTAATGCAATGGCAAGTCCTTCGCTCTCAAATTCCACCAAATC
TACAAAAGCTATTGGGAGAATAAGAGAAGAACACAAGAAGAACTCCATGA
AAGAATCCAAGATCTAGATCTAATAGGTTTCCGGCACAAAGAGGAGATTT
TATTTTGTAGGATTGTAGATCTAGATCTCCTCTTCCAAAACTCTCAAAAC
GATTCAAGAAAGATTGGAGGGAGAGGGAGTATGCAAGCTCCAAAATATCA
ACAATGGTGGACAAAACGATCTAAAGAGTTGGGGAAACATTGGGGAAGAA
GGGCCTCTTAAATAGGGCAAGAGAATACTGACTGTTTAGGTCAAATTCGC
ACGTTACCAGAACTTCTGGTGATCCACCGGTACTACCGGTGAAAATACAA
GAGTTACTGCAAGGAAACACGTTTTTGGCGGTAGTAAACCGGAAGTTTGC
CGGTACTACCGCCCATGGAAAAACATTGGACAACATGGTACGAAAATTTC
AATAACCTTTGCATCCGAACTCCGATTTCGATGATCTTGGGCTCATTTCG
AAGAGGACAACAAGATCTACAAGATTATGCAAAGAAACATCATAGTCCAA
CATGAGAGGATAAAACCAAATGGAGAAAGGTATGAACTGTCTAAAAACGG
CGAACCGGTAAAATCTCCAAAAACAAAAATGCAATAAGTTGAGCTTGGAA
ACTCCGATTAGAATGAAACCAATTTTGTTGGAATATCAAGATAAGTAGTA
TCCAACAAAAATACCAAGTATCTATAGGTGTGGAACCTCCCTCATAGAAG
AACCGATAAAGACTTCAACATAAAAAATGCAACAAGGTATTCACTCAAAA
TCCGTTTTTGATGAACTAGAGCTTGTTATGAAGATAACCAAAAGCTCTAG
AACCTAACAAGGATGAGATCCAAATAAAAACCAAGAAAGATGATGCCAAG
ATGCAAAAGTTTGAGCTCTCCCCGAAAGACTCACTTGAGAGCACCTCTTG
ATAATACGACGATCTATCCTATAACCTGGTCTCCCAACTAACAACAAGAG
ACCGACAAAAGAGAAAACCTATCAAGATCATACCTTTGCCTCGCGCATTC
CACTTGAGCATGATGGAGACGGTCTTGTCCTTCTCAAGATGGAACACCTT
TCTTGATTGCTCTTACTCGTGCTAGCTTGAGGAAGACTTGCGAATGGCTC
CCCCATACTCCCATAGGAGAGTCTCTTCTTGGGCATGTCTTCACCTATCA
ATGATCACCGAGGATGGCAAGCTTCAAGCGTATGGTCTTCTCGAGATGGC
TCACCTTGAACTTGCACTTCTTCATTTCTTCTTGAGTGTTGATCCACTTG
AAATCGCTCTTCGCTTTTTTCTCTTGATCAACCTTGAATCTTCTTTTTAT
TCATTATCGTGTCTTGAAGAAATGCAAGAATGCTCACACTATCTTCTTCA
AGACATGCTTCCAATAGACTCAACTCTCACATGACCATTCTTCGGATCAC
ACCTTGAATATCTCGTTGGTCATTGCTTATTCTTCTTCCTTCCTTCATCC
TTCAACCTTGAAGCCAACAAATGGTTTAAACGATGCCAATGGACATTTCC
TACAAGTGTAACTCAATGCAAACATTAGCTCATAGATATTTTCATTAATT
ACCAAAACCACACATGAGGGTGCACATGCACTTTTAGTTGGTGTATTTTC
TCATGTTGTGATGGTTATTCGGTTGTTCTCCACTTCATGTTCTCCACAAG
TAAGTTGATGCCTTAGCCCTGTTGAGCCATACCTTTGAGTCTCTTTGTGC
GGCGCGAGTGTGTTCTCCATTCATGAAGGCTTCATGAAGGCGGGCACTGT
TGCCTAAGAATAGGGACTTAGTCGTAGGTGTATTTTCTCATCTTGTGATG
GTTATTCGGTTGTTCTTCACTTCATGTTCTCCGCTTGTAAGTTGATGCCT
TAGACTTGTTGCCTTGCATCTTTAATACAGTTATTGATATGTGCATCTGA
GGAGGCAAGGCCGGGAGAGTTAAGCTTCCTTTTCGAGGAAAAAAATGTAA
TGAATATTGTGAAATAAAATTAGAGGCCTTACAGTCATGGATCACAATTG
GTATCCATCCATGTTCCTGCAAGCAATGCGACTCGAAAGCTAGTTCTTGT
TGGAGTAGAATTCTTCCTGAGAAGCACTGTATTAAGCAAGGGTGTATACA
CATAGTGCTTAGCAATTTGTTTGCAAAGATGTCTAATAACGAGGATGCCT
CACAGGTTTAAATGTGTACTCCCTCCGTCCCAAAATTTTAAGGCAAATAA
GATTAGTCAAAATTTAAATCCTACTATGTTTGACCAAATATTTAGGGAAA
AATATCAACATCTACAATATTTAAATGGACACATTGAGAAAATATACTTC
ATGGTGAATCCATTGATATTGATTTGGTATTGTGGATGTTCATAGTTTTA
TGTGTAAACTTAGTCAAATTTAGAAGATGTTAACTTTTGACTGCCTGAGT
ATTTTGGGAGTATAAGTTACTACTTGAAATTTCAATTCAAAAATAAGTAA
TTGAAAATCCAAAAGTAAAACTGAGTAACAAACACATAAAGTAAACCGGT
TGACAAGGTAACAACTTGTGACCTCCCTTCCTTTCCTATACTTTCAAAAT
CGTGGTATGTATTATGAATGTTACCCTTCTTCTTGATTTGCCACAACTTT
GAAGCATACCGGGAGAAATTGGCATTGGCAGCAAGTAGAGGAGCACAAGG
GCTGTACTTTATGGAAGTTCTATATGGCACTTGAGAAGGCAAGAATGAAG
TGTTGTCGTTGGTGGCACGTGTGATTCTTGTAATGGAGGAGAATCAAGGT
ATTGAGCAATTGCTCGACAAATTGGTTAAATTGTTCGAGGTGAAAAACAA
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GGCCATGCAAAGTGGGAAAAGCGACAATTCTATCAATCTTGCTCAAATTG
AGAGGGGTACCCCATATCATGCTTATAGTTTAAATGAAATTTCCCACTCA
AATTGGATACTAGATTAGGGAGCATTAGATCATGTCACGGGCAGGTGGAG
TGAGTTTGCATTATATGCTCCACATCCATCGATGCATAAAAAGACGCTTA
CCAACCTGTCAAAGGGGTCGACATGGTGAAGTGCACTCCATGTATTACAT
TGCCTTCAGTATTATATGCCCCATCATTTTTTTGTTAGTTTGGTGTCCAT
TAGCTCTTTGGTTGATGGTATTGACCATTGAATCAAATTGCATAATTGAG
GAGAGTAAGACTAGAAGTAGTATCGGGAAACGGTATCAGATATATGGGAC
TGTGGTACTTGGATAGACACGAGACACGAAACTGATGAAGCATTGTGCAC
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ATTGTTGGTTGGGCCATATGTCCATTCATACTATAAGTAAGGTATTTTCT
GAAGAAATGAAAAAGGTGGATAAACGTAAGCTTGTGTGTGATGTGTGAGT
ATTGAAAACACACAAGGACATCATATGTGAGTCGTGGACTTCGGAGCATG
TCACCTTTTGTGTTGATTCACCTTGATGTCTGGACTTCTCCCGTTATCTC
TATTAGTAGAATGAAGTACTTTGTCACCTTCATTGATTGTTACTCCCGGG
TGACTTGGATGTTTCTCATGAAATAAAAAAGGGAGGTGCTTAAATGTTTC
TGAGACTTCTATGCATATATCTAAAACCATTTTAGTATTAATATTCAAAT
TATCAGGATATTTTTTCGATAAAGGGAATATATTAATACCAAGATGATAC
AATTACACCTAGCCTCTGCAACAACATAATATCCAGAGCAAGTCTAGAAA
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GAAGGTTATAGTGCACAAACACCATCGTCCTCCGGTCCAACCATCATAGT
TAGATCTTGGGTTTTCACCCCGGAAAAGGTTCAAATCTCCAAACAATGCC
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GGTTTTCACCCCGAAAACTGAGACCATCAAGAACGAAGTCCACCAGTGTC
GCCACCCCACTCGCCGAGATTACTGCTGCAAAACTCGAATCGTCTGACAC
GCAAACTTCTTCCGATCTGACCCATCCAGTCTTCTTCTTACATCGCCGCC
AATACCAAGAAGTCTCACACAGTGTTAGTGTGTAGAACCTCTGGCCTTCG
ATCCATCTTGACATACCCGCCTCCGTTAGTACCAAGGAAAAATGTTTGGC
CGACGAGGTGGATAATGCGATGTGGTAGAGCCGCCTCTTGTACCTCGTCA
CGGTGATCCGTGCGCAAGGCCGAAGATCTGTGGGCAGCCGCGGATGGCAT
CTGATCATGCCCCTCGCCTCCGTCACTATGGACGACCGCGGCTGGAGGGG
CGCGCGCCTCGCTAGATTGTGACCGAATGCCGCTGTCCGCGCCGGGATCA
GCCACAATCTTGGCCAGGTTGTCTCGGCAGATCAGATCAGATCAGATCGA
GAACAGATGTGGGGATAGGAGGATGAGCTAGGGCGAGGGAAAAATGAAGG
AAAAAACTGAGGACGCCTCGCCGCTGCCATCCACCATCGGACAGCCTCCT
CCTCCGGCGGCAGGGGTAGGGAAGGAGGTGAGGGAGGGGCCGCCGGAGGC
TGGAGGTTGGGTTCCCCCGTGTCGCCCGGTTGAGGACGACGCGGGGTCTT
GTTCTTTTGGAAAAAGGGATACTTCATCAAACTTCGTGTGGTTCTACTTC
TTCACGGAATGGAGTAGTTAAAAGGAAGAACCGACATTTGCTGGAGGTAG
CTCAGTCTTATGGTTACTATGAATGTGCCCAAATACTTATGGAGTGAAGC
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TCTGAAGTTGTTTGGATGCACGTGCTTTGTGAGAAAATTGTATCCATGTA
CTGTTAAATGCATCTTCATGGATACCCATCTGGAAAAAAGGGCTACAAGT
GTTGGAGCCCTGCTGTATATATATACTGATACTTGTAGCTAGCAGAATAG
TGAGAGTTCCAGAAATATCCCCAAAATACCACAGTTTTCAAATAACTAAC
CAAACATTGGGACTTGGCAACTTTGCAGAATAAGGGAACAAACACACGAC
TTCTGAAATCTTTCTGCAGATTAATCAAACTTCAGAACTGAAATGATGTT
GTCTGTTGTGCTTCAAGTGGCAAAAGCAAGCAACTATTTTACTACAAGTA
AAAGGACCTAGAAGTACCATATAATCTATAACTTAGAAAGACCTATTGTT
CAAATTGGTACTTATTCTTCTTGTTTGTTTCTTCTCATTGTTAAGTTTAG
CTTCAATTATCTTTATTCTTCCCTTTCATCGCATGCATCGTGATATTTTC
TTTTTCATGATCTTAACTTCTATGTGCCTGTATGGTACTGCAGTTTACCT
CAATTAATGAACAAGGAACTCGAATCATTATATACAATCTGTGGGAGGAC
GAGCAGGGAGACTTGGAACTCGATTTTCATGCTGATGTAAATGTACGTCC
CTACTAATAACTGGCCAGGTATTATTGCCATCAATAAAAAGATATGGCTA
ACCATGAATTTTTTTCCGCTGTCATTGTGAGATGGCAGGATATTCAAATC
AGAGGGGTTAATAGGGATGCCAAAAACATCTTGATGGCAGAGCAGTTTCC
AAACTCCAAGCACTTCTTTACATATAGACATTCTCTAAGGGTAATACTCG
AGATGTACTTGTCTGTTTGTGCCTAAGAAGTTATTACTTTTGTATTCCAT
GGAAAGAATAATTATTATTACTATAGCAGGATATGATAACTGCTATTCCA
TACAGTATGGTTGATTATTTAGTTCGTCATACTACAAGTGCTAATGCAAA
ATACAATGGGATTTTTTTAGGGGAGTATGGTTGATTATTTAGTTCGTCAT
ACTACAAGTGCTAATGGAATTTTTTTAGGGGAAAACGCAAAGGATTCTTT
GCATTTTATTTCATTGAAAAGATAGGGTTTGATACATGCCTCCTAAGAGG
TAGTCACACTTTATTACAAGAATAATGCAATGGAATTTTTACTGTAGCAG
AAAAGAAACTAGATAAGCTTCATTTGAAGAACAAAACAAGCATGCACTGG
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TTATGCATCCATTTTATATCTCCGAGTCCCATACGTCTTCCGGATGATTT
TACGAGGAAAAGAGATTGAACGCCATAACATTATCAATGATATGATGCTA
AAGAAGCAGGTTACTTACAAGCCAGTCATGAGTAATGGATATCCGAATGA
TACAGATGTAAATACTATGAGCTTTTCTATGTACTGTAACCTATACAATG
ATGTACCCAGCATTCAGATAATAACTTGATTTTGCCCTCATATTTTGAAT
GCCAGATGGTGGCTAATGTTATAATTGGTTTTGTTAAAGACGCAAAACAT
CATGTTCCCATTCAGGGATTTAATGTTTACCACAGGAACCGCCTAATAAA
GGTATCCATTAACCATGCCCTTTTATATTGTGGGTTTTATTTTGTTGAAG
ACACAATATATATACTCCCTCCGACCCAAATTAGTTGGCTCAAATTTGTC
AATATACGGATGTATCTAATACTAAATCATGTCTAGATACAATTGAATTT
AGACAAATCTAAGTCAACTAATTTGGGTCGGAGGGAGTATTTTTTTAGAG
CAACCGCCAGGAGCTCTGTCTATTCAATGACGCAAAATATAGCTTGTCTT
TTACTTCATGCATCGACATTGACTCTTGTAATATGCACATTAAAGTTGAA
AGACTATATTTAGTGGAAAATTTACACAAGTTATGTATGTTTCGTCAGCA
ATGCGTTTCATTGTAAAATGCCTGTATAATGAGCTGGATTTTTTTTTTGG
TGTTAACTTGGAAGTTCTATTGTGGGTTTTATTTATTTGTTATTTGATGT
CCCATGTTTATTTTAGCCTTTCTGGAGAGTATGGACTCTTCCTGGATCTC
AAGGACGCGGTGTTATAGGCAAGTAAGCATGTTGCATGTCTGTTTTCTAA
GGTCATGTTTCTTTCATCATTATAAGTGGCTATTCTTTTTCTGTGCAGGT
GTACTTGAAGTTAACTTTGTAGAGCCAGCTCATGATAAGCAGGACTTTGA
ACGCACAAATAGTCTCTCAAGACTTGAAGCGCGATTAACACTAATGCAGA
GGAAATACTGGTTCGTTTTGATGATATTTGGCATGGTCATTTTGTGGTCA
ATTTGCATACCAGTTTGTTGGAAGAAAAAGTTTCTTATCTTGAAATATTG
TTCATTATTCAGGTCCGAGAATTGCCATCGAATAGGTTACGGTGGCAGTC
ATGCTAACGGAAGTTCTGGGAAAAGACACAGAGGTATGAAGGGTCTCCAT
TTGGTTTATTTCGATATTTTTGTTTGGTGAGTGTAGTTTTTCTATCTTAA
TATTATACAAAACCAAATGAAACAATTTTTTGCAAAGCCTTGAAGTCATT
TATCCTTAGAAACCAGAAATTGATTTTGATTTCTTCGTATTCAAGTCATA
GCAAAAGAATCTCAAATGCTCAACATGCTCTAAATGAGTTAACATCTGGT
TAGTAGTTCATGGCATGTTGACTACTTAGAAATACATGTTGACAACTCAG
TGCTATAACTTAATATGAAACATGTACTCCTACAAACAAACGAGTTAGTT
GCGATAGTTTGTTTGTCCTGGGATTGCATTGACCTCCGACTTGCTAGATG
TGACAACTTATGACCCTTAATTGTGTTTTACAAGTAACAAGAACACTCCA
GTGTACCATGAATTTTGCCGAAATGCTGTGCAGCAGCTGCATCCAATAAA
TGTAGTTAGTCTTGTAGAACATATTGTATTATCTTTTAAATCCGTAGCAA
TACAAAGGTTCTATCTTAGTACAGATAACATGTAGACAAAACTATAATTT
GAGCAAATTACTTATGTTTAACTACATCGATATGCATCACCAAGAAGAAG
AAATAATGACATTATGTGGAGTTTGAAATACGAATTTCTGGTGCCTGAAA
CAATCACATTGAGTGAAAAATTGTACTGTGTCAATGGAGGTGGGTTTATT
TTTAGTGTTGAGTTATACTGTACAAAGAACATCACAGAACTACCAATTAA
GTGAATAATGTAGTACAGTTTGGTGTATTAAAAGGTTTTGCATTGAGGAA
ATACGTTGAAGATGGGTTAAATTTGCTAAATTCTATGGTTGACATGGTAA
CTTTTGGTTGACTAAGCATGCATATTTTTTGTCGGGATAGGGAGTTCACC
TGGAGATAGCCCCCGCACAGCTCCATCATTATATCAATCTGAGAGAAGTT
GTGGAATGTCAAATTATTTGCAAAGATCTCAAGCTGCTGATATATTATAT
TCTGGGTCAAGTGATAAGATTATTTCCAACGCCTCGGGAAGCAGGTCGAG
ATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.