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GrainGenes Sequence Report: AE012335

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Sequence
AE012335
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE012335
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCAGATCTCCATGCTTGAGCAGCTAAGCACCTTCTCCTACCGCACTCG
CCTGCCTGCGCAGAAGCTAAGCACCTTCTCCGACCGCACGCGCCTGCCTG
TGCAACAATGCCGCCTTGGCGCTGCCCCCGCCCCCGCGGCCGTGGGGCAC
CTCCCGGAAGGGCTCCGAGCAGAGTCTCTTCCGCGGCACGTGGCAGTGGT
GATGGACGGGAACTCGCGGTGGGCGCGCGCGCGGGGGCTGCCGGTGACGG
TAGGGCACCAGGACGGGTTGCACGCGCTGGAGGGGATGGTGCGCCTCTCC
TGCGCGTGGGGCATCCGCGTACTCACCGCCTTCGCATTCTCACACGAGAA
CTGGAACCGTCCCAAGGCATATGCATGCTGCCATATTATCCTCCCTGCTC
CCTGCCTGTCTCTTTTATCTCTCACGCACTCAACTTTTTATTATTGTTGT
TGTTGTAACTCGCAGCGGGAGGTTGACTTCCTGATGGTGCTGATCGAGGG
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CTACAGCCAAGGAATCCGTCTCCGTGTAATTGGTGACTACTCAAGGCTGC
CTGCCTCCTTGCAAAACACTGCGAGGGAAGCCGAGGAGGCCACCAGGGAC
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TCTTCTTCACCAATACTCTCTGGCCTGATTTCGGAGAGGCTGACAATGTG
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ACAACTTATTTCTGTTCCACACTTCTAATTTTCCTCGCTATACTTCTACT
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TGTTGATTCACCATTCATGGACAGAGAGCCTCACATGTCGAGAACTCGAG
ACCCACTTAAGGCTTACACGGGAAACCTACCATAAACTTACATGGAACGC
GCACAATGTCACCAGTTGTTTCCCGTATTTGCATTCCCCCCTCTTCACCC
AATTAGCGCGAGCATCAATGCCCTTGCCCTGTGCCCGCTGGCATGGCCGA
CCGCATCTTGCCTAGTCTAACCTACCTCATACTTGGCCTGTCAAGCCGAA
TCAAAGCGTAATTTTCATCAAGTATTACTTAGTCGAACTATCTCGATGAA
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ATGCCTATAGAACATGATGGAGGCGAATATTCTGTCTTAACTGATCCACG
TCACACAGTTTGCCTCTTAGTGAGCTCAAGACCGCCCTTATGGCTACAAA
TTCTGGAGAGCGAAAGTCATACACAAAGTCCGGCTAATCCACTACCTAGC
TTGTGCAATCACCTCAGATCTAAGGATTATTGTGCTAGTCAGATATATGT
CGGCTTGCTCATGTCGTCTAGCTCCTAGGTTGGCATGGCTAACGTACCTC
TTCCATCTAGCCAATGTAAGTTAGGTAACATATTATATGCAGATGAATCA
TAAAACTTAGTCATCTTCTAGATTACACGTTAGTCTTGACAGTGGGTGTC
CAAGCAAACATCAAACAACTAAAGAGAAAGCAACATGAACTGAATATAAG
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TTTTTTCTCACTATCCCCTTGCCGGAAGAAGATTGATCGCTAATAGTTCA
ATATATTTAAGACCCTCTAGAAAAGATAGGAAAATGAATTCAAATGTATT
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GTGCTTCCATTCAGCATTAGTTAGTCTCCGATAATATATCGGAATACTCA
AGTATCTAATCGATACATACCTTTCCCACAAATAGATAATTCAGCATATA
GGTCGGCCCCGTCTTGGGCCTCGTCAAAACAAAACATTCACTTGTACGAA
AAAATATTTTGAGAACCGAAACTTGTTTGAATGCTGATAAAATTAACTTC
AGGTTTGTTTATTTTTCGAGGTCGAGGTCCATAAAGAGAGTCGTATCGTC
GACATATTTAAAGCATAGAATGTCCACCATCAACTATATGTGGAATCAAT
CCACTATATTGAATAGCATTGGCCATAATGTCTCACCTTGTGTTAGTCCT
TTTTTGTTTGGAAGTATCCACCAACGTCATTTACTTTGATGTGCATACTA
CCTTCCTAGAAAAATTATGTATTAATGGGTGCCACTCTGCACAGAACTTA
GAAAAACTATGATACTCTGGAACCACTATATGGTGTAGTGTACAGATACT
CTGGAACCACTATTCACGAAAGTCCTCTTCCACAAATACTACAACCCTCA
GGGTGGTACAACGGAACCATTGCGGCTCCAACTAATTATATATTCTTTGA
TAAAAACACAAGAAAAATACAAGGTTCGAGTTCCTCCTCGGCCAATTGAG
GATTTATTGGGTTTAGATCTAGGTTGCTCACCAGGACTATCCTAAGCATG
CATAAGTACTCTCCTAAGTCTACGTCTGCCTTCTCAATTGCAGACTCTAT
TCCATAATCTATGCCTTAAATATCTCGTGAGATATCAGGTTCTTCGTAGT
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CTTAAGAAAGGGTTTTAAGAAGGATAGCTGGATTGTTTGATGGTGGTTCT
ATGGTGGTTGTTTGATGCACTATATATAGTGGTTGATAAGAATCCTAGGT
TTATGAGTTGTTTCTAAAAACGTTTTTATTAGAAAAGGTAAGTTTTAGTT
TTTGAAAAACTATGTTTGTTAGTGTTCACAGGTTGTACGTGATTTTAGAC
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GCCGTCACCACCGCCGCCACCAGCCCCAGCAGGTAGGTGCGCCCCTCGTT
CTCCCGCCCCATGGTTAGTAGTTGTATTAGCGAGGCAATTAGCTAGGTAA
TTAGTCTAGGGTTAATGGTAGTAGTAGTATAGTGGTAGTGGTATAGTAGT
AATATTAGTAGTAGTAGTAGTATAGGCATATTAGTAGTAGTAATAGTAGT
AGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACTAATATTAA
TAGTAGTAATATAGGCATATTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTAG
TATAGGCATATTAGTAGTAGTAGTACTAATATTAGTAGTGGTACGTATTG
GCTAGGCATATTTATTTGTCTAACAAAAGAAATGATTATAAACAAAATGT
AAGTATATATTTTTGTGTATAAACAAAATAAATGATTATTATGAAAGTGT
ATGTATTGTAGTGTATGTATACATAAGAAAGTATAGGTGAGTTATTTTCT
TTGTTTATATAGTTATTTTATTTAGTTGTTTAATCAGTTATTTTCTTAAT
TAGTTGTTTAGTTATTTTCTTAGTTGTTCAGTTACTTTAGTTGTTTAGTT
ATCTTAGTTACTTAGTTATTTTAGTTAGTTGTTCAGTTACTTATTAGTTG
TTATTTAGTTATTTTACTTAGTTGTTGTACTTAGTTATTTTACTTACTTT
ATGGATTATTTAGTACAAATTTGATATTATTTCTATAGGAATTTGTTATC
AGCGGTGATGCCCATCTCTCATCCTTGTCGTCGACTCGGTGGCAACGACG
GAGGACTAGGCTCCGCCGGGCATGTCCGAGACTGGGCTCCGTCGGGCTGG
CACTGGAAGTTGCTACCTTCCGGGACGTGTAACTTGATGAGGAATCCGGG
ACCCGTCATCAGTCCGAAGCTTTTTTGGTGGCGGTCGAGTGGTCTACCAT
CGGTGCAGAGGTAGTCGGCCCCCCAGGAGGTGGTACAAAATCGTGTCAGG
GAGGAGGACGAGAATGTCCATCGCTATATGGCTGTGTTGGACATCAGGGT
CTCCAATACCTGGAAGTTTATCTAGGGATCTCACCCGAGCTATACTCTTG
TGATGGTTCCTTCTCTTTGGGTGTTCACCACCCGTGGCTCAGGACCTGGG
AGTCGACGTCCAGTTTGATTAAGATAGATATGTATTAGTGATGTCTTATT
CGAGAAGTATTAATTTACTTATTGTTTATTCAGAGATCTGATATTATTGT
TGCATTAACCGGATTATTCGAAATGTAATAACTTTACTTATTGTTTCATT
AGTACTGTTTTATCTTCTATATTAATGAATCTAAGGACTTCAAGGACAGA
CAATGTGAGGAGGATATGTTCTATGTAATACGGAATCTCCTTGGTGGAGC
AGAAGACGGTGGAGCATATCAGGGTGTAGTAGAAGACGATGGAGCTGAAG
ATGGCTCACCGTTTCTAATGAGTCCAGTGAAAGAATGGATATAGAAAAAA
ATGAAGCGCCAACGAGTTTGGTTTGCGATGACGGTTTGCAAGAGATCGAA
TATTAATTATATATGCATCAACATGTACTATGTATGATAGCGTAGAATGT
GTATGAAAACATCTTTGAAATTATAATGAAACACAAATTGAAAAAGGAAC
GAAATGGAAAAAACAAAATTAAAATGTAAACACAAAATATGCCGTGGCAG
AGAAACACACGAATTCTCTGCCGCGGCAGAAAGAGCTTTAGTCCCGGGTT
GTGTTACGGCTCGTGACTAGAGGTCCTCCAGCCCCCGCCGCGTTGCTGCT
GCCACGTGGTGGACTCTAGTCCCGGTCTGTAGCAAACCGGGATTAGAGAT
AGGGGTCTCTAGTCCCGAATTGGTAGTCCCGGGTGCGAAACCGGGACTAG
TGCCTGTTACTGACCGGGACTAGAGCCCTGTTTCCCACTAGCGTAATATC
ACCACCATGATCTTGTTATGATCTACCTATTTATCACAATTTATGAGCAA
AAAAGGTAGATCATAGCAAGATCATGATGACGCTTATTTTTAGCTTGATA
TCACTAATTTTTAGCAAAATGTCACTCCATCACGTAGAATCCTCAAGTGA
ACCCCACAATTTTTACTTCCCACTACCTTTATACATGCTCTAATGGTCTT
CATTATGTGGTCTATTGCTATAAGGTAAAGATAAGATTTTGCTACCTTCG
ATGGATTCTCTTCCTAGGACTATGTCAGACCATTGGTATAGGGGGTATCG
CGTCCCGTCAAGTTGCTGGACCCGCATCATGCTCTCCCTGGAAGTCTCGA
AAGGGGCACATCCATCTAGAGGCTAGGCGAAGCCTCAACACAATACCTTT
TTGTCGTGTAAAGCTAAGTTGCCTCCTGTCCAGCCTCTTGGATGGGCGAG
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GAGAAACAAGTCCAAGTAAGAAAGAGATAGAAATAGACATCCACTCTCGT
GGCCTAAGTTGTATGGCGAAGAGATGACCTCGTAATATATGCCTCCTCCA
GTGAGCAATACAATGTTACCGTCCGAGTGGCTTGAACCTGGGTAAAATCC
TTCTGTGTTCTTCAGTTCTAGCGCATAGACGATGAACTAGAGTCTTTTTG
CCGCCCACTGCTGAACAAATGAAGGGGTATCATATTCCCTAGTGTACATG
TTCTCACACACGACATGCTCTTTCCCTGATTCTTCTTTCCTTCGTGTCTT
TTTCTTTTAAAGTCAGCGATGACATGTTCTCTGATCTTGTCGTTCCAACG
AAATTCGCATTTGGTGTGCGACGATCTGCCAAATCGACCGGGGTGGTGAG
TCCAAGGAATATTATAGAACTCCTTCGGGATTTTTCATTCGAGATAACCG
ACGGCTGACTAAGAATCTTGGAGTGTTTCGGGAGCTATTATTGGGGATAT
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GGTCCATTGTTAGGGAAGCCAGTGGCTCACCGGGCAGCCCAGTTGACCAT
ATAAGAAGAAGGTTCATCCGGCTATAGGGAGGCCCAGTGGGGTTTTCGTC
TCTCTCACATATGGTATACGACTTAGAGTACAAGACTTAATATTAGACGA
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TAGGACGGATGAATATATGAGTCGACCTACGGATAGCCCTCAGGGCATGT
GCACAACTCTCTCTGTAACCTTGGCTTATTGTCCTTGTAGCGAATTATAG
AGCAGTATGATCCGGCCACTGCCGTTGGGTCTGAACCGGTAAACCGCGTG
TCTTGCCATCCTGGACTTCCATCGGGCTTAGGCCTCTCTCTTCCCCACTC
CACGAGGACCCACTCCTTTCATACTTGTATTCAATACGACGACAACATAG
TGTCCTATATTGTTGGACCCTTTTGGTCTCATTAATCTTTGGTAATAAAA
TCATTTCAATGAAATTTAGGTGAAATGGGTCTAGTTGTCCGGCATTAAGG
AAGGCAAACAAGTCTAGAAGGTCTGAGTTGATGCCATCCCATATGTTCTG
GTAGAACTCAGATGGAAAACCATTTGGATCTTGTGCCTTATTGTGTTTCA
TTTCGAAAATAGCTTTTCTTACTTCCTCCGATGGGGATTTGACAGTCGGG
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TGCAGAAGATAAGATTACCACAGAAGAAAAAGATAATGCATTCCACAGGA
TGCTGTCACCCTAGATACTTTATGTCTCATGTAGATTAATGAAAAATAAC
AAAAAAAAAAAGAAAAAGATACGACCTCACGGGAAGCTTCACGTACTACC
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CTGAATAAGAGCTTGTCTCGGATCTACGCCACATCGCTCAAGAGCAATCA
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AAGTAAAGAAAAGAAAACAAAACGGATTGTAATAGGCCCTGATCACAAAA
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ATGCTGTTTTAGCTTGCTGAAGAGGTTTATACTCCCTCCGTCTCAAAATA
AGTAACTTGAATTTGTCTAGATTCGCATGTACCAATATACTAAAACGTGT
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GCATAATATGTACACCTCGAGTCAAAACGATGCTGCGTGTTCCCTCACAC
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GGTTATGCAGTTTTAGCTTGCTAAAGAGGTTTATATTATAAAAGAGAGGG
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AGGTGGGCACGCGCGCGGGGCCTTCCGACAATGGCCGGGCACGAGGCTCT
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GCGCGCTCACCGCCTTCGCCTTCTCCAACGAGAACTGGAACCGCCCAAAG
GCATGCATGCATATGCCTATACCCTTCTCCATCCTAACTTTTAACTTGGA
CTACAACGTAATTGTTCGTGTTCGTGTTTTTTGGAACAATGTGCAGGCGG
AGGTGGACTTCTTAATGCGTTTGTTCGAACGGTTCATCCACGACAATGTC
AACCAATTTGTAAGGTATGTATGGTTGCATCCACAATTTGTGGCTAAAAT
TCTTAGTTATTATTGTTTCTATTCTCGTTTTTTGGTCCTCGTCTATATGT
CCAGCTAGGCTTTCTTTTGGAAAACTCATAGTAGAGAGTAATATAAGATA
GTGTCATTCATATGATACTACTCTATTTTATTGCCTCCCTAGTAGTATCT
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GTCTAGTTACCACAGCATTCCGCCTTCATAGTGCATAGTAATACCGAAGG
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ATGCAAACACACCATATCTTACAAAAAATTACTAGGGTATTTGCGCACTA
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ATTTTCTATGTATATATAATAGGTGATTTGGTTCGAGGATTAAACGAGTT
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GATCTATGTCTATAAATCTTGATGTCTAATATGTATGTAGCTTCATCAAG
GTTTTTCATTGAACAACTTTTTTTCAAATAAAGTTTAACACTTTCAAGTA
GTTCTATGATTTTTTTTAATTAATAATATGCCATCTACATACAGTATTAG
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TAGGTTGGACAAATCCAAAACCTTTGTCACCGCATCAAGGATTCAATGTT
CGTAGCCCGTAATCTGATCGGCGACCAACATACATAACGAAACTTTCAGA
GCTTGTACGTATTTAATCTGTCACACCAATATAGTTTTGTGGAGTTGTAG
GGCTTTGAATTGTGTAAGAAATCACGATGTGGATTTTATTTGATTTGATA
GCCACATTTATCTTATCAGGATGAGTATATTTTGGAATAATAAAATAAGG
AAGTTATTATAAGAAGGATTATCCTATGGCCAGAATAAGGAAGGTCCATG
CGTGCGATTACCCTGTGTTTTTCTCGATCTACCTAGTTTGCCATTTGATA
ACAAATACAAGTCATTTGGTCAGAAAGTATTGTTCAATCTGTACAATCGG
ATATGCTGGTTGGATGGTTAGCATTTCTTTGTCCCTATTCCACTACTTCT
CTCTATACTTTTTGCCATCATTTTTGCTTGATCCCTTCTTGCTTGAATAT
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AGTTCATATAACATAAGAATTAATTCATACAACACATGAAATAGTTGATA
AATATGAAATAGTTCATACAACACATGGTCTCATCTCATGTCCAACAAGA
CAAAGAGTTCACTCTAAATTTCACGCAAACCTAGTTGATCACCCATGCAA
ATTTCACGAAATAGGATTTAGCTTGTTCAATTACGTATGCTTACGCAATA
CCTTAGGCCATCTATGTAGTAATTTAGCTCGAAGCAGTCTCGCCTCCTTG
CTACTAATCAGTCTTGTCTCGGGATCAGCACAAATTTCGATGTTGGGATC
CATAGAAGGATGTTCAAACTTGCTTGTGCTGGCACTAGGAGTAGATGAAC
CAGAGGCAGAATTAGAGAACTTTTTCTGTTTTTTGTTAGACACCTCATCC
TTCGAGATTGAACTCAGATCAACATTAGATGGATCCGCCATCAAATCAAT
CTGCATCAAAAAATTGACAAGAATTTCACAATAAATGGCAGGCAACAATA
CTCAACAATCCATCGATGCTGACAAGGCGCCAGATGGCCCCTACACCCTG
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AAACCGCCAGTCACTGCCCGTGGCGCCCCTGTCGTGCCACCGCGTGCGCT
GCGCTCCAGCCAGCCTTCATAAAAACCAGCCCCTTCGAACGTTCATGTAT
ATAACATATTGTCCATAAAACAAAAAACAAAAAATTGAAAAAAATTCCTA
ATTAATACTACTCGGCTTATATGGATCATCTAGCTAGCCGAATTCTAACA
TATTCTTGTTCTTTGCAGGGAAGGAATTCGTCTAAACGTAATTGGAGACT
GCTCAAGGCTGCCTGTTTCTTTGCAGAAGACAGTCAGGGAAGCCGGGGAG
GCAACACGTAACAACCTGAAGCTTGATCTGATACTAGCTATCAGCTACAG
CGGGCGAAGGGACATGGTGCAAGCATGCACGAGCCTGGCCGAGAAGGTGC
AGGACGAGCTTCTCTCCCCCGATGACATTGACGAGAAGCTGTTTGCCCAC
GAGCTCCAGACAAGTTGCGCCAACGATTTCCCTTACCCTGACCTGCTCAT
TAGGACCAGCGGCGAGCAGAGGCTCAGCAACTTCTTAATGTGGCAGTCGG
CATACTCCGAGCTCTTCTTCACCAACACCCTCTGGCCTGATTTTGGGGAG
CCTGATTATCTCGAAGCACTCTTCTCCTTCCAGGGGAGAGACAGGCGATT
TGGGCAAAGAAAGAGCCTACAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.