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GrainGenes Sequence Report: AE044109

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Sequence
AE044109
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE044109
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGGAGAAGACGGATAGGGGCGAGGGAACCGTAGATCGAGGAATCGA
AGCCAAGCCTTAGGCAGGCGCAGGCAAGATCAGCGCTGTGACGCCGGCAG
GGCCAATGTTTGTCTTGTTCTAGGTACGCACTGCAACCGAACACCCAATC
CTGCAATGAACTCCGATCAGTAAATGGATCTTGGATTATTTGGTCGTACC
AGCTGATGCTCGTGGTTTGCTTCAGAAATTATTATTTTTGTTATATATTA
TCAGTTGTTTAAATGATTGTGCCACCATAATCACCCAACTCGTGCAAAAT
AAAAGTATCTTAAGAATATACATCAGTCCAATCAACTATATGCATGTCAT
CCACCCGTTGTAGTGCTAAGAGCAACTCTAGCAGATCCACCACATGCATT
CCCCATAAGCTGGATATATGGGGATCCCCCTACCATTTAGTCCTTGTTTA
CTTCTCTGGTATTTTCACTCTAAGGCCCTGTTCGGTTAATCCCCTTCTCA
AGTGTATTGGAGTGGAATGGAAGGGATTAGAGTGGATTTTGACTTATGGG
ATTTAATCCCCACCAAACCATGCCAATCCTGTTCAATGCAAGTGAAACCG
AACAAGGCCTAAGAGGTTTGGGGATGGGAGGGGATTTGGTGTTCACCCAA
TCCTCTTTCCTAAAAATACACTAATATGGAGGAGAGTTTCTAATCTAGAC
AAAAACAAGAGGAGTTGTGGGGATATCTCGGGATTATCCTGGCCAAACCC
TGCTTGGTACACGGACTACGGGATTTTGTGGGAATTGAAATAATCCCCTC
CTATTCCCGCAAATACACTAGCGAATACGAGAGATAAAACAAGACCTTAT
GGGGAAATGGGGGGAAGTTGCTATTCCAATCCCCAAAACAGCATCCCCGT
ATTATTTCTTACAAGTGGGATCTACTCGTCATTTTGTCTCCCTCTCTCCC
CTCTCCCTTCCTCCTCCTCCCGCAACGGTTCATGCATTGACCGCACTAGC
CCTATCCCCATGGTTGCCTCTAGGAATTCCTCCGGTAGCAGCTCGTCTAG
GTCCATGTTTGTCGGTTGCAGCAAGCTGGCGGCGGGCGGCCCACACATCA
CCCACATGAAGAGGTGGCTGCTGCATTCCAGGTTGGCGGCAACCTCCCTC
ACTTGCACCACAACGACATTCTTCAAGCTCCCCAAGCAGATGAACACAAC
TAGTGTCGCCGACTACGCTTCTAGCCACAACACAAACTCGTGCCGCGGTG
GCAGTTGTTGGTCGTCGCCTGGCCGAGATCGAAATGATGCAGAGCAAGGG
CAAGGGATGTCTCATTGGCGATCCAACAGTGGGTCTGCGAGGCAAGGACG
CGGCGGCTAGACACATGGTGGTCGAGAGGTCTCCAGCATGGAGGAAGTTG
GCGAAGGGGCACATACGCAGACGAGATGGTAATATCTGGTGTGAATATTC
CCTTATGGGAGGATATGAGGATGACCTAGTTCACCCTTCCAAATGGGGTA
TGGTGGGGTGCTTCGGGGCATCTCCAAAGAAAGACCGGTATGCCCAAGTT
TACCATCCAATCTATAGCTTTGTGAAACAAATGTTTCCATTTTTTCTACC
AATGATTAATGACACGTGGACTCTATCCTCCTTATTGCCATTGTATGTGG
ATTGCTTTCACCAAGATATTCTTGCATGTCACTTCATACTTATTGAAGCC
CTCTTCGTTGGCTCCATGTGTGCCGTTGTCAGTTGCCTATTTTGTTAATT
TGGAACATGGTAAAAGGACATGTTCATCTTTTTATTTAGAATAGGAGCAA
GCTGTGACTATGGAGGTGCCAAGGACCAAGTATCGGAACAAAGCCCTACT
CTTCAGCCTCATTTGCAACCCATGGTGGTTAACCACCTTCTAATGCTCCA
TATCTTTTTTGATAGAACAGGACGATGAACGATCGCAATGCATGTCATGG
AAGACCCTAGGGTTACTCTCGCCAAATGGAACCAGATCATCAGGCCGACC
ATCGAGTTGTAGCCCCAATTCTCGACTTCAGGGACGTGCTTCCGTCTAAA
GGGTGACGCGACCTCAAAGGCGTGCTTCAACGCCCAAAGCCTACTTTTTG
GGGTGAAGAGTGATGATACCTCGATTGTGTTTCTATTTTAGTTGGTCCCG
TTTGTAGCAATTGATGATTCACTATTATGATCCAGCAACGAAGTATCAAG
TTAACACCCTATGTGGTCAAAGTGGAGGCTATGTGTAGTGATTGGGCTCT
GTGGATTGCTCCCCCAAGATGGGTACCGAGTCAACCACATCGTGGCGCCG
AAGTGGAGATCGGGTGGCATACTCACCTTATCCATATTCTAATTCTATTA
ATAAGTAAACCACGTAACAAGATGATGTTACAATATTAATTCTAGTGAGC
ATAATTGAATTGTATTGTATGGTTATACTAGCTAAGATGGTGCATATGGA
ACTCAGTAAGAGTTATCTTGGGGCAAGATTCTACTTGCTTCTTTTGACTC
TACAAGCTTTTGGTCATGCTTGCTTTGGATGTAGCTTTGTGGCTACTACA
TGAACAACCTCATGGAGTTGCACTCATGTCAGTATAAATTCCTGAAGATG
CAAGCTTTCTTCTATGATGTGAGAGCCACCGAAGATCATCAACCATGAGG
CTACTTTAGTAAAGTCCTTCAAAAGATCAAAAAGGTTGAGAGCTTATGTA
ATGTTGACAAACATTGTGTTGTAGTGTTGAATAAGTTATCTTGGTGAGTA
ACTACGTCCAGCTGTGAGGTTCAACAAATGATAGATTGAAGAGCCAATGT
TGTTAGCAAGAAGACAATCATCGATGAAGGAAAAGGAAACTGAAATACAT
TGAGTTAAAGTTATACCTTTCGATGTCTAACCTAATATGGAATGTCAAGG
GAACATGAGCTTCGCGTCGTTTACCAAACTCCTTCCTGGTGATCCATTCG
AAGAGCTATTTATTCTTTATTTGAATTATCATCTAGAAAATCTCTCTGAA
CAAATGTCAAGGTACATGAAATTATGTGGAATTGCTTTGATAGAAAGAAA
ATTAAGCCTAGATAACCCCTCTCCTCCCATTGAAAGAAGGCATCCTCCAC
AATGAATAGCCGAGGTTGACTTGATGCCCATAGTTCTCTTTGCAATAATG
GACATATATACATTTTGTTTCCTTTTTAATGAACACTCGCACAAAAGTTA
TGAAATCCATAGCACTATATGGGCTATGTTTTTAAAACAGCTTCTTATAA
AAAAGGTCAACAAGTTAAAATACAATGCCATTTATGGAACACACCATTTA
TGGTGTTAATGTTGATACACCATCCTTGCAACATTTCCACGTCGGTAGTT
TATAGATGAACCAAAACCTAATCTAACATGCTAAACGTTGCTTAGTTGCA
CGAAAGAATGAAACTCTAACGCACTAGATATGTTAATACACTCACTCATA
GAGAAATAATTTATATCCATGTTAGCATCACAAGCCTCTCTATGGCCATG
CCCTGTCAAAGACCATTGCTTGCAAGTTGCAACTCTGCTCAATTGCAAGT
TCAGTTCCCACACCGTGATTTAGTGTAGGAGTTGCATACTTGAATACACT
GGAGCACATGTGGTTAGATCCTTTGAGCTCATGATCCCCGAGGATGGTTG
GGACCATGGGAAGATCTAGTTCCTCCTCTGATCATAGATTGAAAACCTAA
AGTTTGGTTCCTTTTGGTTTAAGCTAAAGATCATTCATGTAGGTCTACCA
TGACAGCGTTCGAGCTAAACTATACTAGTTCTAGCCCTTCCGAAATGCTT
TTTTTTATCAAACCTAGGATACTACTAAGAACAATTCTATAAGATTTCTA
ACAAAAATATTAGTTTCATAATTTTGTGTTTTTTACTTATATATTTTATT
GCAAACAACCTGAAGCTATTTAACCTCATAATAATCCGAACAATAGGGAA
CTCTTACTAGCACACATGTGCTAGATAGACTTCCCATGTTGTGGGTTGTA
ATAGTTTTTTCCCCTATGAAGAGACCAAGAGAGGAGATGTGGTGCTAAGA
ATCTGCCACCTCATGATGACATCATTTGTTTTAATTGCTAAATTTGAAAT
TTCTAAATGATTTATCTGACAAACTGCCATGCCAATTAGCGATCGTTCTT
CACCACTAAGTTTGTCTTGACCGGTGCTACAAAACAAAATCCCATGTTGT
TTTGTTTCGACAATTTTTTTCATCGCCAACCATTGCCAAGATATGGTATC
GTGGTTTGCCCTGTTTGCAAGGGCAAAGAAGTCGACACGTAAAAGCGATA
TCATCTAAAACACATCAATAATATCAAATTGTCATAATATATGTTTTGCA
GTTAAAGATAAATACATTTTTTCTAGTAGTTTGAAAGTAGATATATGCCC
ACTAGGCGTATCAAACAAATAAATGTTCTTATCAGTGTTGAACTTTGCAA
CTATCTCTTCCTAGTATATAAAACTGATTTACGATTTCAGCTGCAGAGTT
AGAGGTTGAAGCAACTAGCTCAAAAAATTGTCACTAACTAGTAGTATGTA
TAATCTAACTATAGATCTAGTTTTAGTACAAATATGAATATAATTCCAAA
TCGATCTAACAAAATATTCTAACTAATAGTTTGTGTGATCTAACTGCAAA
AAAAATGTATGCGGTACAACTTAGAGCTTAGATTAGACTGAGCCGTAAAC
CGTACAGTGAGGCTAGCGAGGCGCAGAGTTTGTCAATTGGCAGATCGGTT
GTTCGTATAGACTCTTAGTAGAACAGGCAACCGCATCTTCGCCAGTCAAG
GCAGTCACCTGACCAACAGCAATCCTCGACAGATAAGACGCTTGATGAAG
CCCTAACCCGCTCGGCGGCCTCGACCGATCGCGGATGGAGTCAAACAGCG
TAACAAATGGACGCCAAATCAGTATATGCATCCATGATCTGTGTTGATGG
TGATGGATCGATTTGGTTGTGGTTAGAACGCTCATGTGGTGTGTGGGCTA
GTAGTTTTCGACTAGTTTGTGTGTCACGTTAGGTACCTAGAAATTAATCC
TATGTGCTTGCTAATGGTTGGGGTCTTAAATGAGGATTAGACATCAAATT
GGTAAATTGCCCCTGCTCGCTCCCTTGTCTCCGCCCCTGCATGTTAGCAG
CAACAGTTGCAATGATATTAGTGTATGATTACCATAGATAATAATTTATA
TGTTTTTAGACATTGCAATGTCATAGAGCTAGAGAGTTAAGAGGTGATAT
GATACCATAAAAGTAATGCCATGCAAGTGTTATGTATGTGCCGAGCGACG
TTCAGTAGCCGGGCAACCAAGTTGCTATAACCTTGTAAGGATGTGCCACA
GCGAGCATGGGTGGTGGTGCCGTGAGCTAGGATTCGTCTCTAGCGAAGTT
GGCAACAAGCCAACAAGCTCTGTTTTTTCTCATACATTGTTCACTTGATG
TGCTTACGGATGGAATTATAACTTGAAACTCACGAGCTAAATGAGTAGCT
CGTGACTTGGCTCGACTCGGACTGAACTCGATGTTTAACGAGTCGAGCCG
AGTTTTAGAGTTGAGCTTGTTTATTCACCCAAGCAAAACGAGTTACTCGT
TTAGCTCGTTAAACTTGTTCAAATACAGAGTTTGAAATTTTCCATAGATG
AGTGCCAAACTGGTTTGTTTCTTGACCTGGAATGGTGTAGAGATACCATA
TTTTTTATTGATCCTGCCTTTGTGGAATTATGTAAGTACTATCATTGTTC
TAGTTCTAAATTAGTAGGAGAATTACTAGTTTTTCTTATATGTGCTCCTG
TTCGCAACTTATAACAAGCTAAACGAGCTACTCACGAGTTTACCGAGTGG
AGTCGAGTTGCAAATCTGAGCTCGTTGTGTTAACGAGCCGAGTCGAGCTA
ACTCGTTGTTGAACGAGTTTTAATGGTTCGAGCCGAGCTGATGAATCAAT
GTTGTGAGTGATCTCTGAGATAAGTCAAGGCTGGGTTTATGGGCTTAGTG
CATTAGGAGGCCTGCAGAGACAGGAATAGCTAGGCTGAAAATCCTAAATC
ACAGACCAAGCTCATTACCCATCTATACATAGTCAAGGAAAAAAATTCCG
GGCCCGGGCCCCTGGGTGTTTGGGCCCCAGCTTCGCGCCTCTGCCTCCTC
TCTCCTCCTATTTAATGCACCCTCTTTGATCTTGTCGTTGCCCTACCCTC
TCACCACTCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCGCCGCCGCCGCATCTAGGTAGGCCCCTCTTGTCTCCTC
TTCCTTGCTAACCACACTCCTTCAGCCTCCTGCTACTCGTGCCACCGTTT
TGAGTTGTTAAATTCCCTGACCGCCCACCGATAAGCGATCTCCACATCAT
CTTCCTAATCGTCGTTCAGCAAAGCCAACAGAGATATAAGATCGGTGTTT
GATGTAAATCTAAGGTGCCTTGACTTCATGGATCTTGTAACCAACCAGAG
GGTGGAGGAGGTAACTTCATTTTTACTCAAAAACAAGTTTTTTAGTTACC
AGTAGCGCGCTCAAAGGAGCGCGTAACACTCAGCAGACAGTATGGGTTAG
GTTTAGGGTTCGGGTGAGCGGCGGTGATCTGGTGGTGGGTGAGCTGGTGG
ATACTGGCATGTTGGTTGGGGGCAGGGGAGAGGGAGATGACTGCAGCAGT
GAGCCGGTGCCTCAGAGGATGTAGTGTAGCTAGGGCACTGAGTGTTGCGC
CAGATTCAACCAATGGAAGGTTGATCATATGTGCTGACTTCAACTCTCAA
AATTTATGAAAGTACGGCACTATTTCATTTCTGTATCCTGTTCCATCGAA
AAAAAAGCATGCTCTGAAAATTTTGCAATCTACATCAGCTGGGACAAACT
ATGGCACTTCCGCACTTCAGTGAGTTAGCCACTTATAGTTGACTAACTGC
TGATACACGTTCTATACAATATTGTAGTGCATTATGCTTATACTATGATA
CACTGTACGAAATAGTTCTTTGCCAAAAAACAACCAAAAATTTATTTTTT
GTTACACTGTCTAGAAACACTTTAACTATTGTAGATAAAATTAATTTTAA
GAGTAAACATAAGGTGTGATCCACTGAGCAGTGAGCAATCAGTAATATAG
AGGTAACATATGGATGGAATTTACCCTTGAAACTACCATATGATCCTGAG
TTGGTTGCCGCTTCTATCATTGATATTTTACATGTTGGATGTATTTGCAC
CATGAGCTAGTCTCTTATGGTAATGAAACATTACCGTTTCCTTTTCAGGA
TGATCTAGGGAGTGAAGTGTTGGCTCCAGATAATCAGAAGGTGCCTATAA
ATGCTGACACAGACACAGATCAATGTCTTCCTGTGAAGTCTTCTTCTGCC
TCTTCAGGGAGTGCACTCGAGTGTTCTGCCGAGCAACACTTCCAAATTAC
AAAACCAAAGGATGATCTCGACAATTTGCCTGCACAGTCTTCATCATCAT
CTTCTTCAAGGAGTATGGTCGAGAAATTTGCTGAGGTGGTAGCGATCCAG
GAGTCATGTATTCGTGCATTGATTGACCCAGACCAGGAAATAGCCTACAA
ACTCTGGAATCAGTCCCTAGAGGCTATGAAGAATCACTACGCTCCTGAAG
TTGAGAAGGCATTATGTGGGCAGCATCAGCCAAATACAAATGCTCCTGGA
AATGGAGAAATTTCTGAATTTTCTCAGATCCAAGATTTTAGCGGCGCACT
GCGCAATATCCGCAATTCTGGCCATGTAGTATCTACTGAGGTCGAATACC
TTCTTAAGCAGATCAAGTCTCCACTGAACCATCCTGTGCAGCTTATTCAG
CTCAAGGGTCACGTACCTGCTATCAGGTGCACATAACTCATGCAACCCTC
AAGTTCAGAATTACTTGGTTATTATGTTCTTGGAATTACTTAGCAATAAT
TTCAGTCTGTATGTCCATAAGGTTTTGTTTTCTGTTGTGATTTGTGTTCC
TTGAAGCGCTTGCAACCTTATATTGCTAAACCATCCATTACCCTTTGCTG
TACTGGACATGCAGTGTTGATCCAGTTGGGAGCCGCTTTATACTGAAGAA
ACTTAACTCAGCAACTACTGGAGAGATAATTATGCTCTATAATGAAATGA
CACCTCGCATCCTCACACTGATCATTAATGTCTTTGCCAATTGCGTCATC
CAGAAGGTTTCTTACTCCAATTCCTGAACATTTGTAACTTGAGTCTTTGA
TGATGCTCAGCTAAGCAAGCATAAAGTCTTTGTACTTACCTTCTATGTTT
TTCATCAGCTTCTCGATTATGGACCACCAATCTACAGTAGGAAACTCATT
GGTAATCTAAAGGGGCATGTGTTAGACCTAAGTCTTCAGCTCTATGGTTG
TCGAGTGATCCAGAAGGTAAACTGAACACTGCCTTTTCTAACATTTCAGG
TTGGAAAGAATTAAGGCATGTCTGTGGATTGCAAAGTTGCTCTCTTATAG
TTATTAGGTGGCCTTCGCTGTAATGTTCATATAAGTTAGAATATAATTTA
ATTACTCCGTTCATTATATGTTATTCTCCTAGTAATGTGTTTTTTTAATC
TTAGATAGCTTCTGCTGTAAATATCATGTCTTGTCAAATGCAATCTGATT
ATGTTTCATCCTAGTTAAGTTTGTACCTTGATATGCCATGTTGATTTGCG
ATGAACTTGATCACTAAAATGGTGTCTTTTTCTTCAGGCTTTTGAAACAA
CCGACATCGATCAGAAGATAGAGATGGCCAAGGAGTTTGGTAGCAACCTG
TTGAAATGTGCCTGTGATCAACATGCAAACAACGCCGTTCAGAAATGTAT
AGAGTTTGTGCCACCACAGTATATCCAATTTGTCTATAGAAGCTTATGTG
GGAAGGTCAAGATGCTATCCACCCATCCTTTTGGATGCCATGTCATTCAG
GTTGTTAGATTTGGCATCTGACACTTTTGGCTGCATCTTACCTTTTGATG
TTTGTTTCTTTCTGTTCATTTACTTATCCCTCTCATCCATGTGACCTCCC
CAGAAAGCGCTGGAGTTCTGCAAGGATCCACAAATTATGCATGCGATTGT
CGCGGAGATTCTCAAATGTGTCAACGAGCTGTCGGTAGACCCGTACGGAA
ACTATGTTGTCCAGGTAAAACAGTATGGAAGTGATTTTGCAATTGGTGAA
ACAATAGTCCCTCAGCAAAACGAGGATCTTACCTGCGTTTAACGGACATG
TTGCAGTTCATTGTGGAGCATGGAGGGCCCCGTGACCGACAAATCATTGT
GCAGAAATTTGAAGGGCGGGTTATGAGGATGAGCCACCAGAAGCACTCTT
CCAATGTCATCGAGAAATGCCTAACCTGCGGCAGCTACATGGATCGCAAG
ATGATCATAGTTGAGATTCTCTTCGCCAGGGGTGGCACAACCGCCGAGCA
TCTCCTGGTCTGCCTCTTAAGATGTTACCATCCATTGACGTGCCTAGCAT
TGTGCACATGACACTAATCTTGCGTGGTTGCGTCGTGGTGCAGGATATGA
TGGTCCACCAGTATGCCAACTATGTGGTGCAGAGGATGATGGACGTGGCG
CAGGACTGGCAGGTGAAAGTGATTGTGGACTTGGTGAGGCGTAACGTGGC
TTGGCTGGCCAATTACCCACATGGGAGGCACGTGATGGAGAAGGCCGAGA
AGGTCATCAAAGCCAGGGCCGGGTTCGGCGGCCCCCTTGCACCACCACCA
CCACCACCGCCGCCGTTCGCCTAGCTGCCTGCCTGCCTTCCTTCATCAAG
CTGTGGTGAATTGCAGTAATAATTGAACTATGCTGAACTCCGTTGCTCTT
GGTTTCCCTGTTAGGTGAAACTAGACTTTGTTGCTTTCGTGTAAGCGGAA
AAGTGAACTAGTACAACTTCCGCTGGTCTTAAGACTTGTCAGGTCTGTCG
TTTATTATGTACGCGACTATGCACTATTTCGTCAGAACTCAATGTTTAAG
TTTCAGACTTCTAAATTGTTGGTTGGTTTCATCATGCACGCGTGCATGAT
TTATGCAGTTCAATCAGGTAGCATAAAACATGCTCCATATGTGTAGGTAC
AGTTCATACAGGTTTTGGATTCATAGCGATCCATGGATCACTCAGGCTGT
GGCGGGCAGAATGTGATGAGGTATCGGTTGGCCTTGCAGCGGTTGAGGCT
AGAGGCGTCGTCGAAGGCGTAGCTGTAGGCCTTGGGGCAGATGGCCTTGA
ACAGGTGCGAGAACATGGTGGGCTTGCACGCCGCCGGCGTCCCGTACTCC
CCGGTGCAGCAGTACTTGTCGCCGCCCATGGCCCGGCACGCACTCCGGCA
GCCGGCCACCTTCCCTTCCCGGTCCCTCACCTCCAGCGCCGACGGGCAGC
ACACGTTCAGGTCCGCCTCGCACGACGCCACCCCGCACCCACGCCCGCCT
CCCACGGGCGTCATGGAAACCGGCGCGTTGAACCCGTCCACCAGGCTCAC
GTCGTAGAAGTGCATCGGCGACTGCCGGGTGCCGAGGGTCATCTCCACCA
CCGTGGCCGGGATGGCGCCGCCAGCGCCGGCGCAGCGTAGGACGCCACCG
CAGTCTCCCGTGGCGCAGTGGCCGAGGCCGCGGGAATCGAAGGAGCAGCC
ACGGCGCGGCCACACCCGGCCCGACCACCCCACAGGCACGTCGAAGGTGG
TCTCCTCACCGGCACCGAGATGGAAGCCGCCTGACTGCGGCGTAGCGTGG
CCGGCTGTAGCTAAGATGCCTGGCCACACCGACTCGGCGCAGTTGTTCAC
TAAGATGAGATGTATGCGACCATTTGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.