Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE000394

[Submit comment/correction]

Sequence
AE000394
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000394
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAAAGTTAAGCTAATTACTTGCTCCCACTCTTCCTCCATTAAAGGGCGC
CCCCAAGCAGCTATAGCTTGCTGCACATTGTGATAATCTCTTGCTCGGGC
CGGCTCGTTCCTTGGCCATTCGCACCACAGGCCGTCACCTCAGGTAAGCG
CATATATGTGGCTTTCTGGAATCTGCCCACTATTTACAGATTCCAATCTA
AGTGCACGTTAAGAACACAGTTGAAAAGAGCTCCTCCCGAACCTTATTAT
CTCCTCCTCCCCGAGCTACAGTTTCTGCGCCTCTTCCTCCCTACGCCGCG
CCGCCCCGAGGCCGACCTGGGATGAGGGGGGGGGGGGGGCGGCGGCTCCT
GGTAGTATAGGTTCGATTGGGGGCTGTGTCCCCGTCGTTTTGGTGGCTGT
GTGCTGCCGGTCGCCGCCCCTCTTCCTGGCCAAGATGCGGCGGTGGAGGA
TGGTGGTTGTGCTCCGCCTGAAGGTGCTCCGGCGGCCGGAGTTGGGGGTG
GAGGGCAGCCTCTCCTTCTGAATAAGGCCTAGGGCCTCTCCCCTTTCGTG
TGCCTCCTCCCCTTCCTTCCCAAGCGGCGAGGGACTAGGGTCTGGAGGTG
GGGCTGGGCGCTGCTAGGGTGGAGGCCGGGTTTGCTCCCGGGCTGGTGCT
TGGACGCGGCGCCAGGGGATGTTTCCAAGCCTCGGTGTTGAGCCTCCTTG
GTCGAGGACGACAGTGTGCTGCGCGGAGGCGAGCTTCCCAAATAAGTGCT
TCCATCGTCTTCACTGCTGCCTTTTGTCGACTTTGCTCTCTTGGCCGGCC
GGGGTGGCGGGGGAGAGAGTGGGTTCGTCAGTTGTGCGGCTAGCCTTTGG
CGGTGGTGGTTGCCGAGCTACTCTTGGCGTGCTGGGACAACGCGAGGAGG
TTGTGAAGCAGCCCTGCTTCGATGCCCCTATGGTAGGTGGTGTTATTGGA
GGTGCGATGTTTTGCAGCTCGATTGTTCTGCTCGTGCTTCTATGTTGAAG
CACCAGATTTTGCTTCTTCTCTTTCCTTGTGGCCGGTCGTGGAGACGAGG
GCGAGCGGAGAAGAGGCGCCTCGTTGGTGGTTCTACTCAGCAAAGTGCTT
CCTTGCCTAAGCGGTGCTATGATGTTGTGTTCTTCTGGAGCTTCTCTCTG
ATGTGTTTTGGTGGCTTTGCTCCATCACCACTTCGGACTTTATGGCAGTA
GGGCTCTGCCGCTGCTCTATCTCTGTGTCGGTGCTCGTCATCTCCTCTTC
GCCAAGTGGTTCGTCCCTGGTGCTTTGAAGATGGCCGGTTGAGGAGGTTT
TTTTCGCCGGTTCGAGCTTGGTCGAGCCCTTTGCTCAGACTTCAACGCTG
GCTTTGTCTCCGAGGTCGCCGGCGATGGTCGAAGAGACGCCCAGGGCTTG
TTTGTGTTGTTTTCCTTCGTTTCAGGGTGTTTGCTGTATTTTCTGGAGGC
CCTTATCTTCGAATATGTAGGTCCTTGTGCAAGTGTTGTTTGGGCCTCCT
TGTAAACTTTCTTGTCACGTGTTCTTTTTGCAGCAATATATTTAGGTGCG
TCACACCCTTGATTCGTTCAAAAAAAAATTACAGATTCCAATCCAATTCA
AGCCCCTATCGGCAATTCTCTACGGCTCGGACTTCACAATGTCTTCACCA
CCGGCACAACCGAGTTCTGGTTCTAAGTTTCTTTCTCAGGTGTGATTTAG
CAGCTCTAAGTTGATAGCTCTGTGCTTAACTACAAGCAGATTCTTGTTAA
TTAGTACTATCATCATTGTAACATGTATGTCTTGAATATGTGATTCTACG
GATTTGCTATTTATTAGTGGCTCGAGAGTCGAGAAATTGTTATCTATGAG
TCAAACAAGTTAGTCGTTATGAAGTCTATTGTTGGCAAAAAGCACAATAT
GCACAATATGAAGGTGTTCATTTTTTTAGAACTACTATGTTCCACACATA
GTAAACTGTGCACTGTGGAAGCTAATTTTGTTGGATAAAGAGTCAATGTT
CACATTGTTGTTTTTTAGAAATAATAATCTCTTAGTCGCCGTTCAAATAG
ACAGCCTTTAGTTGTAAAGCTTGGGGAGGTTAAGGAGGCTCTCGCAACTA
CTTTTGCAAGCATTCCTACTCCCTCCGGTCCAGTTTATTAGGCACGCACG
TAGTTTAAAAACAAGTTTAACCATCAATTTTGACTAATAAAATATGCAAT
ATATGTCCTAAAAAATATACCATTGGAAAGTATTTTTAAAGATGAATCCA
ATAGTATAATTTTTGTGACATATTATGTAAAATTTATTGCCCAAAATTAA
TGGTCAAACTTGTTCTTAAACTACGTGTGTGCCTAATAAATCGGACCGGA
GGGAGTAATTCTTTGTAAAATATTAATCATGTGCATCAATGCTCTCTGTC
CCACAGATAGACTCACAAGGTTCAAGTTCCGACTCAATGATGCCGTCATA
TACATTTTTCAAGGACGCCACAAACAATTTTTCCGAGGAGCATAAAGTTG
GCAGTGGTAAATTGGGACATGTTTACAAGGTATTCCCTCATGAATTACAT
GCATTAGCATCATCCATGTTTTTTTCAAATACTCTTGTATTTGTATTATT
ATTTTTCTCGGAAAAAGTACACCGATGTATTACAATAACTTATTTTGTTT
TTCGCTTTGTTTCCTAACTTCCTCAGTGCATCTTTAACAAGGTCTTACAT
GTTAATGAGGGGAAGTACTCTCTCCGTTCGAAATAGATATCGCAAGGTTT
TTCAAAATTTGGATGAATATATACACTAAATAGTATATAGATTCATTCAA
ATTTTGACAAATCTGAGACATCTATTTTGAGATGGAGGAAGTACAAAATT
TGTGGCATGTGAATGTATTCCATAGGAATTTGTAAACCCAAATCATTTGA
TACAAAATGACACTTGCAGGAGAAAAAACTAACTTAAGTAAGATCCTCTA
AAAATTGTACTCCCTCTGTCCAAAGGGCATCTCAGTACGACCCATTTCGA
ACAGCCAATGTATTTGAAATGGTCAGTTTAGATCGATCCATGGAATCGAT
CCACGGATATGAAATGGGTCGCTGTCCGGCAAACACAGATGACCATTTGG
GCCAGACGCGACATTTTTTCACACATTTTCATTAAATTCTGCAAGCCGAA
GATAAATCAAGCTAGACGATGGTGAAATCTGACTCTGGATCTTGGAGGGT
TCCGGGGGATACTGTTGGGGATATACTTTCCGGATATCCGCACAGTATCT
CGCTGACCAGGGTGGCCCACTTCGGGTTAGAGCTTTGCTTCACGGGTGGT
CCAGTCAGAGAGAAGAGACGGAGTCCAGTCCAGCTACTGGAAGGCCCAGA
AGACTTACCGACATAGGCATGTAGTGTTACTTGTAGTTTAAGATGTACTC
TTTAACCGACTCTTAGTCGTAACCGGATAGGTCTCTCGTGTAAACCCTAG
GACGGATATCTATATAAGTCGTCCTAGGGGCCAACGTTTAGGGCACCCTC
ACAATAGTCTACAATCTTAACTCGCATAGGCGAAACCCTTTTAACCCATA
TTCTGCTCTGTCGTATTACTAGATTGCTAGCAGGAGTAGGATCCGTCCAC
CGTCGGCAGATTTGAACTTGGATAAACTTGTGTGCTCATTGTCCCGGAAC
ACCGTACGACTCACACCCCTCTCTTCCACACGCATCGAGGACCCCATCAT
GGTGTACTTATCCTCAATCCGACGACATCGGGTGGCCTCCTCATCGGTTC
GTGCTCCTACTTCACGGCATCAACTGTGTCGTTCTCCTCCTCCTCCTCTT
CATCATCGTCATCATCATCATCATCTTCGATGGTCGTGGGGAGCTCATGG
TAGTCGATCTCCGACCTGAAGTCGCTCCTAAACGAGCATGCCCGCTTTTG
TTTGTGCTCCTGGGGAGGAAGGCTCACCAGAAACCCGGTCAGAGGTATGC
ACACTTGTGCCGCAGCGCCTCCAAGAGCAGTGCGCGGTGGGCGCCGGATC
TCGCCTCTAGCGTCGGTCCATGTACGGCTGGTATAAGAAGTTCTGGCCAT
TAATGCCAGCGCAGGAGGTGAGGCGCCACTGCAGGCACATGAGGCGAAGC
GGCATCTCAGACGGTCAGCAAATGCATTGATTGCGAGGGCAGCTTTCAGC
GGCCAGCCTTCATGGCGTTACGAGGCCATGGGCAACGCTGTCATGCGGAG
CCCAGCAGCCGACGCCCGGACGTGACTCGCGATCTAGGATGTGTCCGGCC
ATAGTCATTTAGACTAAATTTGGTGGGGGAAATGAGTCGTGCCAAATGCG
TTAGTTCGTTTGGATCGCACTGCTGGACTTACTCCTCTCCACGCGGACCG
AATCGAAACCGTGCGGACTGTTTTGGGTCGTGCCGTTGAAGAACCAAACC
TCTTTGGTCGTACCGCAACTGCTTGTCGTCCAGTGAATCTACTTATAACA
GAAGAGCCTATCCTCGATGCGTATATGTGTTTTTTTTTTTTTGAAATCCT
CGATGCCTATATGTAGTTGTGCTGTCAGTTGGGCCAAACCCGCTGCTAGC
GCGTGATGATGCCAGCCCAACTATAGGTTCGCAGGCGAGGATGTCCTGTA
AGATTCCGGGTGGGCCGGCCCATGTACTATCTCGATCGTTGCTTTTCCTT
CTTTCCTTCCTCCATAGCTGGTTCACGTGCTGGTTGCATTTCATCTGATT
AAAATTTGATTCAAATTCAAAAATGGTTTAAATTTTAAAAAATGTTCAAA
AAATTAGGTTGTTCAAATTTTAAAATATTTTAAACAATCGTTTAAATTCA
AAATTTTGAGGATGTTCAAATTTTAAAATAGTTTTAAAACTTGTTCAAAT
TAGAAAATTATTCCCATTTGACAATGTTCAAACTTAAAATTGTTCATATT
TGAAAACTGCTCATATTTGGAACTGTTCATATTATTTAAAAAATAAAGAA
AAAACAGAAAAGGAAAAAAGAAACGAACCAGAGAAAACTGACCGGAGTCT
GTGTACTGGGCCGGCCCACGATGGAATTCCAAGCGAGCATTGGCTCTCTA
GGCGACACAACATGCGTCCTTTAGGGATTATTAGGGGCCAAATCATAATC
AACCCTTCACGCGTTTGTAATCGTGTCAGCGTGTACCCTCTCCTCTTCCA
TCACTGTTCTTGGGCCGGCCCACCGTGGTGGCTAGAGGAAGAAGAGAGCA
CGCGGAAGAACCTCGTTGGAGACAGGGACGACACGGCTGGACATAGCGTC
TCCGGTGAGGCGAGGCCTAGACCTCACCGGAGACGGGGACGACACGGCCA
GCCGCAACATCACCGGCAGAGGTGAGGCCTTCAACTTAGGGCTTGGCGTG
CGAGGGTCTTAAGGGTTCGCTACATGGGGGGCACGGACGTCGAAAGCTCC
TCCATAGTCGACAGGGGCACTTGTCCTGGGACGGCAGCAGCACGGACATA
CACAACATATTTCCATTAGTACACACGAAGTATGATCAACGATTCCGCAA
AGATATTAATTCCAGTGTAGTGTTCAAACGATCAAATGGATGAGATGATC
AATGATTGCTCAGATTAACAAACTAGAAGGTACAGTTACAACTTAACAGA
TCAGTGCACTCAGAGTTTGAGAAGACTATATATATATAGCATCTGCATCA
CTAGGACACTCGATACTGTAATTAGTAGGCAGTTACAAGTTAATAGAACA
GATGCTGCGAGTAGAAGAAGAAGAATGGAATCAATAATAAGACATTTTAT
CATACAATCAAGTTTGAATCTATATTCCTATAGCCCTATAGCAGCATATA
ACAAGAAATGGAGAGAACACCGCAAGTGAAAATCCAAAAAATTGGTACAT
TCAAAAGAGCGGGTGGGTGACATTGCCTTAGGGTTCCGGTGAGGCCTTAC
CAGAGACGGGGACGGTGTGGCTAGTCGTGGCGTTGCCAGCGGACGTGAGG
CCTAGAACTTAGGGTGGTGGGTGCGGAGGGTCTTAGGGTGTTCGGGGCAC
CGCTCGTGAGGCTTAAAGGGAAGCCGGGGTACGGGAGCTTCCGACGTTGG
AGGCGGGGATCGGCAAATAAGGTGCGGGCGCTATGTTGGGCCCGATCCAC
CAGCTCCTCCTTCACGCGTAGTCATCTAGCAATGCCAAAATAGGCCATGG
ATGCACCGGAGCAACGGTGGGCCCAAACACGAAGCTGGATAGTGATGCCA
GCACGTGAAGGAGAATGAGCCACGAATGCCCATCGTAGGGACGAGTCACC
CCTGCAAGCCAACAATGCCAGCTTTTAATTAATAGCGGAAAAATGGGATC
ACTATGTGCTTCCAAAATTGTAGGCGAGGACAACAGATCAATGGGTGCAT
CGCGTGGGCCGCCAAAACTTGAAACTTACCCGATGGTTGACGAGATTATG
AATCGACTAGGGACCAGGACACGGAGGGATGGAGACAGAAATTTGAGATA
TTGTCCTTGTATACAAAAAGATGGAGAGAGTTTATCCGAAACGTAGGACC
TTTACCGTCCCTAGTCTTTTTTTTGTTATATGTCATTCCTGGTAAGAGCA
AGTTCAATAGTAAACTGTTGCTGGCTACTACATAAGTTTATTTAAAGTAT
TATAGCCAAATATATTATTTAAAGTATTATAGCCTGTTTACATAATTTTA
TTGTATTTACTCTAAGTCGATTTGTTGTGGCATAAATCTAATAATTAACC
CAAACTGTTGAATAGGCACATCTTCCAAATGGAGAATTGGCCGCCGTGAA
GCTGCTCTATCAGTTGCAAACGTTTAATGAGAAAGAATTCATATATGGAC
ACGGTCAACTTATGAGGGCCAAACACAATAATATTGCGAGATTTTTTGGC
TATTTCTACGCAAATGATTTTCGATATATACAGTTTGATGGCCGTACACT
ACGCGTTCAAGACGTAGAGAGGGTAGTCGCCTTCGAGTTATTGCTGCCAT
GGACGGCCGTGAGTGTGTTGATCATGTATGAATAAGCTGATCTTTGTATA
TGCCAAATTTAAAAATTACTATAGAGTTAGTACAATTCAAGTCATAATCT
TCACCTGAAATTATTGCAACAGTATGACTTTTCTTGTGATGAATTTTCTC
TTGGATCCGTGCTATACAAAAGATACTTTCTTAGGGAAAGGCAAAATATT
GTGCGTCCGATTTTGAAATTTGACCTTTCCCTATGAATACACACTCATAC
TCTATTTTTTGAAGGTTTACAAAAACTGGAGGAAATGGCTACAAGACATA
AGGAAGTATCCCTCGTTCAAAGCAGATTGCAAACAAGTGAGGACTTGTAT
CGAAATCGCAGTAGCATGCACAAAGAAAAAACCATATGAAAGGCCTCTGA
TGAATGATATTGTTCATAAACTATATGAAGTACAAACCACAGGACATTAC
CCATCGTCGGAAATAGAATGGGTATGGACATTCTATATTTGGTGCTGAGT
GCTCACTATGGTACATATAATCCATAGTTACAAAAATGTTTTCAAGACCT
CTCACTATAATTTCCCGGTAATAATCATAGGATAATTAAGTCCGGATTGG
ACACGAATTGTATGTGAACTCTTTATTTTATATCCACATGTACCATAGTC
ACTCTCATGTTTTACTCTTCGACATAGTCATCGGTATGTGAACAATTAGA
GAAGTTCATATCCACCAATTTTTTACTTTAAATGTTTGTTTGCATCTAAA
AAAGGGTATTCACGAAGCAAGGAAAATGTCATTCAAAAGGCTGGCAGACA
TGACGAGTAACTTCGATGAAAAACTTGGCCATGATGGCTTCGGTGCTGTT
TATAAGGTACAACTAAGCATTTCCTCCTTTTGGATGCCCACGGGTGCAGA
TTCCTAAATTCATTTCTACTACCTCGGTTCCCAAATATAAAATGTTTTGA
TATGCTAATTTAGCCTACGAAAACATCTTATATTTAGAAAAAAGATGTAA
TATATTAATAAGGACATGAGCAGGGAAAGCTTGAAGATGGAATATCGGTA
GCTGTGAAGAGACTCGATCAGAGATCAAGAAAATCAGAGAAGCAGTTTGA
GAGAGTTGTGAGTCTTATGAGACTCGAGCACAAAAATGTAGTACGACTGG
CAGGCTACTGCTACGAGACAAGAAAAGTACCAGTTCCAGATGATAAGAAT
TCAGAATTGTACGTATTGCAGGATGTGATAGAAAATTTATTCTGTTGCGA
GTTTTTGCCAAATGGAAATCTGGACAGGATATTAAACGGTATGACAAGTC
AAGCTACTAGTTCTTATGTATTTTCTACTTATTTCTCATCTCTTACTTTC
TTGGTGCAGACAAATATTCCGAATTTGATTGGCAAACACGTCATAGGATA
ATAGGTGGCATTTGTGAGGGGTTACACCACCTTCATGTGGAATGCGAAGA
TGCACCAATTATCCATGAGGGTATTAAACCTACCAATATTTTGCTCGATG
AGGGCATGGTCCCGAAGCTAGGGGATTTCTGCACTTCATTGGGTGTCACG
CCAAGGTAACCTCCGGTTTGAGAAAACTAGATGGTACCCTGCGCGTTGCT
GCAGGAACACATGCTAAAATAGTAAAATTTGTTAAACACTATATAAACAA
TGTGAGGTTAAAAAAATATTATCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.