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GrainGenes Sequence Report: AE000192

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Sequence
AE000192
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE000192
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTATGTCGAAGAGATAGGGAAACGGAATCGAAAATACAAGAGAAGGGGG
AAGACGGAACAGGGAGAAGAGGGAGGAGAAGCGATGGGGACGGTAGCACG
GACCGCGACGGCCGAGGCGGCGGCGAACGCGATGCCGCACCTGTTGGAGA
ATCACCAGCCGCCGGCGAACATTCCCCGATCCCCTGGTACGCGAAATGCC
CCGATCTCTGCCCCCGCGGACACGGACCTTGAACTCGCATTTTTCTCCAG
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ACATTGGCTTGAATTCTTAATAAACTCTGTCCAATTTGGATTGTGTCCAA
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GCCGCTGTAAAAAATCCAGCATACTTGTAGACTTTAAAGTCAGCTTTTGC
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TCTAGTCAGAGAAGGTGGAGATGTGCTGCTTATTTGGGTTGCAATTTCAC
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AGCAGCCCTAATAGAGAACATCGTATTTTATATTTTTGGGCTATTCAGTT
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GTTTGTATAAAGTAGAAGTCCAAATATGAGTTGGTATTGCAAAGACAATA
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CTTATGCGAATGATTGGGTTTCTTCCTTTTCTGCAATTGAAGTTTCTGAA
CTTTGTTTGAATTTTTGTAGTTCTCTTATTATGGGAAATCAACCTAGAAC
TGGCGTTTTCTTTCTTATTTGTTAAGAACATTTATTGTAATGTACTACTG
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CAAGAACATTTATCTGCCAAAGAGTACATTTCTGTGTACTCGTTTGTCAA
CACTATAAAAACCTTTGTTCTTTTACTTGTATTTAAACATAAATTTCAGA
TCATTTTTTGAAATTTCAATTCATTGTCGCAGATCATAATACAAAGGATA
TATTTCATATGGACATGGATGAACATGTTAATCTGAGCCAAGGTTATAAT
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TTTGTATGCAAAAAAGGAACACACTGTACATCATAGAGTTGATGGGAGCG
AAGAAGACACCAGAGCATACAGTAGATGTAGTGTACCATATGTTTATAGT
GTTCTCAAAACTATCAATTGTTCAGAACATAGGAAAGGACTTGTAAAGAA
GATGGGATTTGAGCATATGCTTCAACTTGATGATGTTAATGTTCCAAGAC
TTTTTGCTCAGTGGATTGCAAACCACACAATACCAGACGAAGAAGCCATA
AAGATAGGTGACAAGACAATTCCAATTTCTCCAAAATCATTTCAGGACAT
ATTGGGCATTCCCAGAGGAGACATTCCAGTTGAAAGCGATGAGATGGCAG
GAAAAGCAGGGTTTCTTCAATTGTTTGGTCTATCGGAAGTACCATCTATA
AGATACTTTGGGGACAAGTTAATAATGGAAGAAGACCTCCCAGATGATGT
TTTTTGTCGTTGTTTTATGGCTGTTTTTCTGGGGGCTTTCATATGTCTGT
TTTTCTGGGGATAATTACAAACATAGATGGTACTTCTTCTTGAATTTCTG
AAAATTATAATAGCAGAAGGTGTTAGCAAGCCAACCTCTGAAACCACTGA
GTTAGTTGAAACTCATGACAGTACACAAGAAAGAGATGTTGAAGAACATA
CAGGTACAAAACCATGTTACCTTTTCCCCTTTTATATAAATGCATGTTAT
TATTCTCTGATCCATTTTATAATTCTAAAGTCCTTTTTATTTTCATGTTT
TGTTAACACCAGATTCTATACAAAGAAAAAGAAGATCTCATACACAGGCT
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CCATCATTTATATGCATATTGCTTTCTATGATACATTTAATTTTTTCTTA
TTTTTAATATGTCATTATTTTAATAGCAGACTTGATTCAAAGAAAAAGAA
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GCAATCAATAATATGGAAGCGCATTTAAACAAGGTGATTTTTTATCGAGT
TTTAATGGCGTTGTACTAGAGAAACAACTTTTGTTATTGAACAAATTGAA
TCTTTCTTTGGAACCAACTTTCTATCATGTTTTCCACTGCAGAAACCACA
AGTTGGAACAGAAACAATCTCACCAGAAAGAAAAAGGGCTTCTACTCTGT
CTCAGCAAAAAAGTATTAGCCTAAATCACACACCTTCTGATGACGATGCT
TCTACTCCTGTAGAACAAATTGAGCAAGAAAAAGAAGGTGGAAATTCAGG
TAATTGAGAATTTTTGGTTGATTTTATGTGTTAACACATTAACACTATAT
GATGTCTTGCGATCCTGTTTTTGTGTCTCATAAATTTTTACTTCTGTAAT
CTCCTTTGCTTTTGTAATCACATGAAGTACGCAACATAACCATGCAGAAA
AACAATCGGGCAACATCAAAGATGCGCATATGAGCAGGGAAGAGTATCTA
AAAGAAGCTAGAAAGAAATATTACTTCAAAGATAGTTCATTGCCATCTTT
TAGATTATTTGAGTTCTATGATGACAATGACAAATTCATCGAGGAAAAAG
AACTGTGGCGACCAGTCGGTACATATTCGCAAGACCTGCAAGCTGGTGAG
AACAAAGAAGTGAACGCCACATTAGGGGAGAATGATAAACATCAGGCAAA
CTCAAGCTTTGTTTATTGCTCACCAAAGGTCAAAACTCCTGCTTATAAGG
TATCTATTAATACTACACCATATACTTCTTCTAATTGAGACAATTCTCTG
TTAACTTGCATCAATTTTATTTTTTAACATGCATTTTTAACCAAAATGCA
GACAAACGCAAACAATGATTTTGAGTTTAGTTCCATTCAATGTGCCCAAC
GTCAACCTGCTCACGGTCATGGACAACAAACTGAACATATGCTGCCATCA
ACAAATCAAATAGAAGATGAATTGATTCACTTAGATGTAAGAGTTTTTCA
TTTTTAGCTATATGTTTTTATTATAATTATTGTTTATACCTTTTTGATTT
ACCTTTATCTTCTAACTTGAAATTAACTTTGTTACAGCCTTCGCAACCAT
CTGACACCGTGTCCAATTATGAGCAAGCACCAAGAATTAATATAGCAGGA
AGAAAATTATTTCCAGATGATTTTGATGATACTCCCATAGCAACAAATCA
GAAACTAAAAAACCCGGTAACGTTAACACTAAAAGTTTCTACCATGTTTT
TATTTTTTCTTCGCAGTAAACAAGCTTCCTTACTTTATATCGAATGTATG
CTAAGCAAGAACTCCATTCAGCAAGCTTTTATATCAAATAACTATAGCAT
TTGTTTTTGTCTACAAGTGAGCTCTTGTAATAATTTTTTTCTTCTGCCCC
CTTATTAGATTTTTTTGTTTTATGGCAGGTGATATTGCCTGAAGTACAAT
TTCAGTGGACAAAGGCAAACACTACTGGAACATCGTCCCAGGAAGTTCAA
TTCATTGGCGAAAAATTAAAGACAACAAAACAAAAAGATCAAATCAGCTC
TCCTGAAGTTCAATTTTTAGGAGAAATACCAAGAAGGGTTGTGCAAAGAT
CACCAGAAGTACAATGCTTGGGAGAAAGAGTTTTCAAGAATGTTTGCAAT
AACATGAGTGAAAAAGCTGATGAGGTTTATAATGTTGGGTTATCATTATC
GACCAGTAGTGTCTCAAGAGGGAAGGAAAATGTACGTCCACTACGAGTTG
TTGAGCCTAGTATCTGGTTAAGATCACCATTCGAGAACAACAGCAAAACC
ATAATCGAGCCACATGAGATGAATATATATGAAACAATTACAACATTGTG
CAATGACCCCAATCACCAGGAGTAACTACTAATATTTTTGTAATTTTTTC
ATATGTTTTCTGTTTCTAGTTGATGTTCATTTGTGGTTTTCTAACATACC
CTTTTTCAATTGGTCTTTTTAACTACAGTAGGTGGATTATAAACATGAAT
AACTGCAGAGTATCATTGAACCAGCTTGGAAATTCAACAAAACCAAATGG
TTGGGTGCATTCATGGGTGATTAATGCTTTCTGTCGCAAGCTTTTCAAGG
ACAAGCATCCAAAGAATTCAGACAAGCATTTCTTCTTTCACACATCAGCT
GTAAGAACATAAATGCATCCTTCCCAAATATATATTGCAATCAACTTCAT
TTATGTTTTTAGCATTATTTTTTACCGTTGTACTTTCATAACAGGAATTC
TTCCTCGAAAAATGGCCAAATGATTACATGAAAAATATCTGGCACAAAAA
TGTTATCAAAAAATTCCTAGCTGCTGATTCAGCAAAGAAGTTACATTTAT
CTGAACGGGTATGTACTGCAAATTTTATTTGTAGTAACTATATTTATATT
CCATCAATCTAATCACTTAATTTTTAATCAAGTACATTTTATTAAATATG
TTTGTTCCCTGCTCTTTTGTATGGGAAAACATGCAGCTACACTTTCCTGC
TTTGTATGATGACCATTGGTTCCTTTTTGCTGTTGACATCAAAACCCGTA
ATTTCCTATTTCTGGACTCACTTTATGGACAAGCAAGCAAATTACATCAA
CAAGTAGATGAGAAACTGGTATTTCCTATATCATGTTTTTTTGCTTATTG
ATTTTTATTCTGTTTTTATTTACATTGTTATGATACCTTGCTGCTACAGA
TTTCAAATTTCAGAAAAACTTGGAAAGATTGCAAACTGAAGGATCTACAC
TTTGAATCATTTGGAAAACTTTACCCAAACTTGCCTCAACAAAAAACCGG
GTATAGCATTTTTCGGCCTCTTATATCTAATATTGCCTTTTCTTTTTTCG
AGACAATCATTTGAAATCACAAAACAGAAATGATTGTGGAGTTTTCACTA
TCAAATACATGGAAATTTTTTGCACAAGGAATCCTCAGTCTTGCTCATTT
TCTGCAAAAGACATTCCTGATTTCCGTGTTAGAATAGCAATTGATACATT
CTTCAACGATCATAACTCTGCAACTGATCAAATGGATTTCATAAGCACAT
TTGACATGAAGGTAAATATTTTTTACCATCTTCGTTTACTATTTTTTGAT
TATATTTCGAGAACTTCTTTTTATTTATTATCTGTGGATTTCAGTGATTT
ATACATTTTCCTTGTTTTATTAACTTCTTATTCATAGTCATACAAGAGAG
ACAATGGCCAGTGAAATATCAACTTCGAGAAAATGTAAATACTTCATTTT
ATTGCTTTATATTGTTCTCCTTTTAATGAGCAAACATGGAACAGACCATG
TTTTTTGCTCATATAAGTTTTGCGCTTATTATTTTTTGACTTTCTGCTTT
CTTTTTTTCAATTAGGTTTTTTACAACAACACATGCAACAGGAAAGGATA
AATCAGCAAGAGCAGAGATTATACCAAACAAATACCGAAAGAATATCTAG
TCAGAAGAAAACATTTATGGATTTTTCCCTTTTTGTATGTAGTGCTATGA
AACAGCAGCTTATAATCTTGTAATATTGACAGCTATGAGTTTTGTTTTGT
TTTTTGCATGCTTTATGTCGTGTATATTAATACATAAGACAATATATAGT
GGAGTATGATATGAACATAAATCCACTTATCTTACAAAGCTTTTTATATA
ATATGTGTGCACATTTTTATAGGTATGTTTCACATTTTAACAAGCAAATA
GCATGTGGAATTTAATAAGGAAATTACATTTATGAAGAACACCAGAAAGG
TATATAATTTAGCATTTCTCTAATTATCTTCCTTAAGATTTTTCAGTCTT
TTTTCTCCAGTACAGACCTAAATTACATTATGTGACATGTTTCAGGCAAA
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TCTTTCCTACAAAATGATGGAATCGTGAAGAAAACATGCAGATCACAATA
AAGGTACATATTTCTAAGTTATCTCATGTCCTTTATTTTTTGTAAATGAA
AAACGGCAGATAGAAACCAAACAAACATCCGCAAATTTTGATCACGGATA
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AGAATGAAACCAAACATTTTATATTTTTATTGTATAACATTCTTTACAAA
AATGCATAGAACTGGGGTTGTCCTTTTTTCTGATTTCTTCTCTGCTTTTC
CTTCCGACTGGTGTTTTCCGGTACTCTGTCTCGGTTTTACATGCAGTAGG
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GAGAACATGAACCATCACAAAACACACATTCTTTTAACGAACTTGACCTG
AAGACTTCTTGTTTGGAGTTTTCTTCTGAAAAGTAGATTTATCTAGGTGT
TTGAATTGGCAGGTTGCATAGTTGTGTTCATGTGAGCTGCAATGACTACA
TGTTATCTTCTGTTTTGTACGGAATATCTTGGCTATGGTTTTGTGTCGAC
CAGCTACAGTAGGTCGACCTCTAGGCTTAGCCACATCAGGATTCTCAAGA
ATATTACCATAGCCATCATCAATTACGCCACTTTTGGTACTTGCTACATC
CAAACCTTCCTTTCTTTGCAACTCTTGTTGCTCCTCGGCTAATGACATTG
CATCCAACTTCTCTTCTATCTTTTTTGCTTCTTCAACAACCATTAGGTAT
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TCAATGAAATATTTCCCTGGTAGTTCAGACATGTTGAGATTTACAAGAAC
CCGAAGAATGTGGCTGCAAACAATGCCATCTTTCTGGAATTTACAACAAA
TGCAAGAGAAATCTTCAAGTGGTAGGTTAACCAGGACAACATAGCGCCGA
GACCTAAAATCCTTTTCTGCCAGTATTCTTGTCTTATAAACTTCATACCT
CTCATTTTTAACAATCTCATCAACATGGAGTTTGGCACTGAAGATTAGTT
GCTTCTGGAACTTGTAAAAAATCTGACGGTTGTATATGCGCGCGGCTTGC
AACTCTATCTCACTACTCACCCAGTATTTAGGTGTTGTAGTTCTTGTTAT
TGAGTCCTGCTCTCTCTCCCTATCCTCAATGGATTCACATATCCTTTGGT
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AAAACTGAGTTGGTGCCTTCGCTTCTAGCTGTCGAATGGATGAAGGGGAA
AAATATTTCTTGAAATATACAGGAACAAACAATTTCCTGTAAGTCCACAT
TGCCTTGAAATACTTGAGATTCGCAACATCATACCGTTGCAACATTTCTT
GCCAAAGCATTTCAAATTCTTCAATTGTTAAACAATTGCGCAAAATATCT
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TTCTAGAGCCTTCTTTCTTATATGGAAAAAGCAAAATCTGTGCACTGTAT
TAGGAAACACTGCTGGGATTGCTATACTCATAGATTTGCACTGATCTGTT
ATGATTGTAAGGGGTGCCTTGTGTCCCATGCAATCATCAAAAGTTCGAAA
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ATAGACAGTTGTTGCCATGTCCTGTTACACCTACAAACGGGGCAAATGGT
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GCACTTTGTTGCCTTCACCTAGCTTGAAACTATAATAGAACCTAGGGTCC
TCTTCTTTCCTTTTCCTGAAGTATTCCAACACTTGGGTCATGTCATTTTG
TCGGCACTCATTCCTTATTGCTGTTCGAACATTGCTAACATATTTCTTGT
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TTCGTCATCAGTCATGTGCTTATGAGACCTGAGATGTTTTGACTCATCCG
GTGGACTTAGTTCATGATTGTGTTCTAGATCAAGTGATATGACAATCCAC
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TATAGTATTTTGCCTTTTCCTTCTTGTGTTTTCTGGTGGCACAAGCCCTG
TCCTTTCTTGCCTCTTTTCCTCCTTTTTCTTTTTTGCTTCCAAAGTCTCT
TGATCAACAACCTTGCCTGATCGGTTGCACACAAATGTAGCACGTGTATG
GCCAGCACTCCCAGCTTTTTTGGCATGATAATTTCCAGCCTTTTTAATTG
AAAATCCACAAATAGCAGCATATTCATTGTAGAAACGGTAAGCAGCATCA
TCTGTATCAAAAAGCATATTCACATGTGGAGTATGATGCCTACGGACTTC
TTGACTGCATGTTTCTACACTATCACGCTCTATAAATGAATCGATATCTT
CCTGTGAAAGCTGCTCAACATGTGCTGCATGCTGCTGAGCATTGATGTCT
TCACCAGGAACTGCTGGTGGATGATCAGTGGGAGAGTTTGATGCATCATC
AACAAAAGCATTTGTTGTTTTGTCATCAAATATATCATATTCCGGTGTTG
GATCTTCCCATTCTCCATCAGAAATTTCTCTATCATGCATTGCACTATCA
AGTGCATACTTCATCTTCAAGCATTGTGTTTGCTATTTGAATTAGATTTT
CTTGTTGTTGTTCAAATGTGTCTTCTACTTCTTCTTCAATAATATCATTG
ACATCGGAGTATCTACCAGTGATCATGTAAAGTTTGTTCTGCACATTTTG
TTTAATACAATATAAGCAAAAGGAGAATAAAAAATATAAGGAGAAGAAAA
AAATACATACAAATACAGGAAACCAATCTTTGAACTTTAATTACCTCATC
TACCATTGGATCTTCTAGCAGTTGCTTATAATAATCTGATTCAACTGACA
TCTCAACTCCCCGCAACATTTGTGTGTATGACATACTTCCTCCTTGCGAA
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ATTTTTTCAGTTTTAACACAGAACTAGATGTTATTTAAGTAACATGCTTC
TACATTATCTGATTTGATTTTTTCACGGAATGTACCTGATTTGTTTTTTC
AGATGTTTCACTAGCATGGCTATTGTACTGTGGATGCACTGGATTTATTT
GTGGCATCCCAAAATATTGCCCACCATGTACCTGTGCAACAAGCAGTAGG
TCAGTTTTGATTTTGTTGCCTATTTCTACTTTAATTTTTTCCTTCTCTAT
ATTTCATTCAAAATGTACCTCATGCATTGTTTCACACATAAATGGATTGC
ACTGTTGCTGCATTGGATTCAAATGGTGGGTAAATGGATTTGGGTGCACG
CTTGAAATTTGATCTTTTTGCATCTGCTAAGAATACAAATGTAAATATAT
ACATCTTTTTGCATCTGACTAATCTGTGCAAAAGCAACCTCTCATTCATA
TAAATGGAACAACACGTGTCCATGCTAGACAAAGTACCTTTGAAGGTTCT
AGCTGTGTTCCAAACAAGTAATCACCATAACTTTGCATTATATCTGTACA
GATAAGTAAGTTCATCATTATTCATCAGAAATTGTATTTCTCATTCAGGG
AAACAACTAAAAAGTGAAGGGTTTTCTAGCATGAAGAAAAAGTAGAGAGA
TGGATTACTGACCTTGGCAAACAGTTGATGATCCAGTGTTATTAGATCCT
ATAGAAAAGTAAAAAATCAACAACATTTCTCTTTTGCCGTTTTGAAAACA
GGGGATTCAGATCCATCTGTGGTTTTTAAAGAAACTGGAGTACAAGAACA
AGCAAATTGGGAATCAGGCCAGATCTACTATTCATGGACGAATCATACCA
GGTGTACGTGTGTGATGCTCCTCCAAATATTCCATCGTCCTTTGTTCCAT
AGCTTTGTTTCGATCTACTTTTCATGAACGATTCTCGTTTCTGGAGATGG
TGGCCGTCGCAAGAGTTGGGGAAAAGTACTAGAGAGAGGCAGAGTGGTTG
AGGGTTTTTCTGTAATTTCGTTGTTGTTCCTTCCAGGAGCTTCTTCTAGG
TACAAGACAAAAAGCCCAATATATCAAGACAGAATCGAGAAGACAAGAAA
GCCCAACATAAAAAGACACAAGTCCAGACATATGAGACAGAAATCGATAA
TCAAACAATACAACACGAAAGCCCAAAATTACAAGACAAAAAAAGGCCCA
GAAGCGAGTTTCGGTTCTGACAATATTCATAGATCGGCTCCAAATTGTCA
AAGACGAAAGCGACTGAGAAATTAGTTATTTCTCAGACGCCTGAGAGCGT
AGACAATCCCTTGATATATCGGTGCCAGACGGTTACATGTACCTGTGCCA
TGAGGTTGAGATCTACTCCGTACATGCACGTTCGACTCAAATACAAGTTG
TAAACCTTCAGGTGTCTAAACTATCTCTAACACACCTGGCCCTAGATATC
ACAGTCCTTATTATAAACATAAGATTTTATTTATAAGAAACACTAGTGTT
GACAATATTTTCAGTTACACACCCTGGCTTTTATTATTACCGATGCAATT
AATTATTCTTGAGAGAGGGTCCTTGTGGACAGTGCAGCACCATGGCCTCG
ATTGTGACTCCTGGTCCAAAGGCCAGCATGACACCCCACTCTGGCAGCAG
ATTATCACCGTGGTCGTCCCCCCTCCTACTACGCTTGCGCAGCTCGTCGA
GCACGAAGACGATCGTTGCGGCGCTCATGTTGCCGTACTCGCGGAGCACA
TGTCGGCTGGCCCCCAACTTCCCTGGCTCCAGCTTGAACACCGTGTCTAT
GGAATCCAGGATTCGACGGCCACCTGGGTGCACAGCCCAGAAGAGGTCGT
TCCACGAGGAGCAGCATGGAGCATTGTTAAACGCGTCTACGAGACATTGC
TCGATGTTGTGTCCTATCAGCATCGGCACTTGGATGCCCACATGGATGTT
TACGCCAGCTCCTGAGACCTGCATGCCGAGCGCATGGTCGGTCCCTGGTA
TCGTGGTCTGCGTGGCAGAGACCATGTCGAATAGTGGGCGTTCACCTTCG
CCCAAGGGGCCGGCGCCCACGATGACGGCGCCGGCTCCGTCGCTGAACAA
GGCGTGGCCAACCAGGTTGCTCTCGTTAGGGCTGCGGATACCGACAAGGG
TTACCTCGGAGCAGGCCACAAGGACGCGCGCACCGTGGTTGTTCTCAGCG
AGCTCCTTGGCCAGGTGAAGCGCCCTGCCGCCTCCGGAGCAGCCGTGGAG
GCTGAGCATGGTGCGGCAGACCGTGGGACGGAGGCCAAGGAGCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.