Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE012705

[Submit comment/correction]

Sequence	AE012705
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE012705
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCGCACCAAAACCTGAGCTGCCCACCCAATCGGTAGGGTTTTTGCTCTCC CCTTCGCCCGCCGCCGGCGCCGCCGATCACAGGAAGGGAGGTCCGGAGAG GCCCGGCGAACGCACCAGGCAGGAGGAAATGGCACAGTCACTGGAGCTTC TGTTAATCCAGTTCCTGATGCCGGACAACGACGCGCGGCGGCAGGCGGAG GAGCAGATCCGGCGGCTGGCGCGCGACCCCCAGGTGGTGCCGGCGCTCGT CCACCACCTCCGCACCGCCAAGACCCCCAACGTCCGCCAGCTCGCCGCCG TGCTCCTCCGCAAGAAGATCACCTCCCACTGGCCCAAGCTTCCACCGCAC GCCAAGGCTTCCCTAAAGCAAGCCCTCATCGACTCCATCACACTCGACAA CAGGTGCTAACCGCCCACTTTCCCCACTCTCTCCCGCCTCCGCCTCCGCA ATTTACAATTTATCCACTGCTATGTTCAACTATACTCGGTTGTCTATGAG ATACCTGCAGTTATGTTGTTAACTGCCGAGCATTTCGTTCCTGTGAGTAA CGATTAGCTGAACTGTTAGACCTAATCAGAACTCGAATCTTGCCGGGGGG GGGGGGGGGGGGGGGGGATTTTATGGTTCATAGGTCAACCAATAGTACAA TTTACTGTGATTATGATAAACTGTAATACACCTGACTTGTTTGCAACCGA TGGCTGCTCAACTGCGGTTCCTCTTTGGTATAATGTTGTATTCATATGCT GGCATTCAAATGGAAAATGGTTTATGGAGATTCTGCGAAATTTTGGAAAT AAATGAATCACTGGAAAGCAACAGCCATCGGTATGTCTTTTTAAAACCAA AAAGTAGAAGTGTGAGAATAGAGGCTACAAATTGCTTAGTCCGGTCCTAC CGAATACAAAAAACTGTGATCTAAATGATGGACTGTCTAATTGTGATGTC TCAAAAATTCACCCTGGTAGAACTTTTGTTCCTCAATAAAAAGTCCTCTC CTTTAGACTTTGGACTGTCTAATTATGATGTCTCAAAAATTCACCCTGGT AGAATTTTTGTTCCTCAGTAAAAAGTCCTCTCCTTTAGACTTTGAGTACT TGTATTTGCATATATATTTTTATCTGTTTGATTCGAACTTGAACTTTAAT GTTTCTGTTATGTAGCATAAGCATTGATCTGTGTGTCAATTATGAAACGC AACAGGGTTACCATAAACTGGAAATATGGAAGTCAAAATATGTGTAGTTC AATTCAAACCAGTCACAATGTTGAGATTGGGAGTGGTTGATTTGGTTTCA CTGAGACTGGCTACAAATTATCAAGCTATTATCCCACTCTATGTTGCAAA TGCTGTCCGTTATTGGTTCAATTTGCCTCAGTTTTTTCCATATATAATGT TGAGAGGATGACAAACTGAGTTTTTTCTTGCTCCTTATGCAGTCATCTTG TAAGGAAAGCTAGTGCAAATGTGGTGAGCATTATTGCTAAGTATGCTATC CCTGCAGGAGAGTGGCAAGAGTTGTTACCGTTCCTTTTCCAATGCAGCCA AAGTGCACAAGAAGAACATAGAGAAGTAAGTGCATCTCGGAGTTTCCCCG TAGTTTCAGCCTTTAATTAAGTATGTATGCATTGTTTAGGATGTAAGTAT CAATATTTGTCAGATGAGTTATGAATCATGCCAGGTGGTTTTTTCATAAT AGATGATACACAATAAGAGCTTACCCGCACTTCCCTTTCTTTGATTTGGT GTTTGTTTAAGAACTTCTGCATAGTGAGAACACCGAATGTATTTTTTGTA TTGTCAAGATGATTGCAGCAGCATGTCAGCCTGCCCTTTTGTAATTCTTT GTTTGGCACATTGCTCAATATAAAGAGCTAAATGCTGAAATCCCAAGACC ATCCATAACTTATTTATTTATGGATTTTACAGTTTCTATGACTGGCCATC TTAGCTGGCTAAAGGCCTATACACTTCCTACACTAAGGTTTTTATTTTTC CTGCTGGTTAACATAATCATCAAATGCTAAGTCATAAGGCCGCACTGCTT ATGCATGTGTAAATTCTTGAAACCATCTTCCCTCTTTGCATTGGTGGAAG TTTCTACCTGGTGTTCACTTTTTTGTGCTTCCTCTATATGTGTGTTAGTA GGGGGATGCTAGTGCACTCTGTGTAATTAATAGATAGTGCATTCTGTGAC ATCAAATGTTCTGATTTATGTAGTATATGTAGTGTTGTGGAGAAACTGGT GTCCTAGTTCTGCAATTGGTAGGACTTGTTTGTGCATAACTCCTATATCA TCTCAAGGGAACTACAGAGGAAGGAAACACATGCTGCTTTATATCTGCAA ACAAAATGTCAATGTGTACTGACTCACTCTTTTCTTTACAGGTAGCTCTA ATTCTGTTCAGCTCCCTTACTGAAACTATTGGAACTACATTTCAATCTCA TCTGAATGCTTTACAACCTATTTTACTGAAATGCCTGCAAGACGAGACCA GCTCTAAAGTCAGAATTGCTGCTTTAAAGTACGGTTTAAGTCTGCGATGA AACTCTATATTTCCCTTTCTCAGTTGACCATTTTGTGACTGTAACGAAGC TAATTTTTGGTTTGTGCAACAGGGCTGTCGGATCCTTCATAGAGTATGTC AATGAAGGAGGGGACATTGTAAGTTCTGGCTGTCAAACCTGATTTTATGA ACATTTATTTTTCGAGGTGAAAGATGTGCCATCGTAATATTCATTCTTAT AGACCTTCTTTTGGTAATGTGCTCTTCAGTAAAGCCTTTTCTATACATTA AGCAGTACTTACGTTTTATTTTGGATTAGTTGTTCTCTTTGTTTGTAACA GTAATTTGTTGGTTTCGTTCTTCTTAGAGCTGTAGTTTTTCTTAGCTGAT TCTAAATCTTCAATAGTAGTATGTCATTTTACCGCTAGATGATTCTCAAA TCTTCAATAGTATGTCATGCTACAGCTAGAGTTGCCTCTTATGCCTGATG AACAGATCTTGTTTGGTACAACTGCTAGGTAAAGATGTTTCGAGACTTTG TTCCCAGTATCTTGAATGTATCAAGGCAGTGTCTTGCTAATGGTGATGAA GATGTTGCTTCTATTGCCTTTGAAATATTCGACGAACTAATTGAATCACC TGCACCACTTCTTGGAGATTCAGTGAGATCAATTGTGCAGTTCTCACTTG AAGTTTGCTCAAACCATGAGTTAGAAATAAATATTAGGCAACAGGTTTGA TCAGCCATCCACATTATTGATTATATGTTTGTTCATTTTCCAAAACAACT TCCTGTAAACTTTCTCTTATTTGTTTCAGGCTATTCAGATAATCTCATGG CTTGTAAAATTTAAAGCATCTTTCTTAAAAAAGAACAAGCTGATTGTACC TATCCTACAAGTTATGTGCCCCTTGCTTACAGAAACAGCTAATGAAGATG AAGAATCTGATTTAGCGGCAGATCGTTCTGCAGCAGAAGTCATTGATACA ATGGCTATCAACTTACCAAGACATGTTTTTGGACCAGTTCTTGAATTTGC TTCTGTGAGCTTTCGTCACATTAATCCCAAGTATCGTGAGGCTGCTGTTA CTTCGTTGGGAGTTATCTCAGAGGGTTGTTCTGAACATTTCAAGGATAAG TTGGAGGAATGTCTCAAAGTTGTTTTAGAAGCTTTAAAGGATCAAGAGCA AATGGTTAGAGGCGCTGCTTCATTTGCTCTTGGTCAGTTTGCTGAACACT TGCAGCCAGAAATTCTGTCTCACTATGAGAGTGTACTTCCATGCATCTTA AATGCACTTGAAGACCCATCAGATGAAGTTAAGGTATAACCTACTTCAGG TGACATCATCTCTGATATAAATAGGCAGAAACTTTGAATATAGATGATAT TTTCTGGAATAATTAACTAACGCGAATATGTAACGTGATCTTATAGGAGA AATCATATTATGCATTGGCAGCGTTCTGCGAAGATATGGGTGAAGATATC CTACCATATCTAGAACCTTTGATATGCAGATTAGTTATGTCTTTGCAGAG CAGTCCCCGGAACCTGCAAGAGACATGCATGGTTCGTATAGAAATCATTG CTCACAATTAATATGTATGTTAAGAAGGAGATAACCTCCCCCCCTTAAAC TGTCTTCTAAATTGACAATAATGATGTTTTTCTGCAGTCTGCAATCGGCT CTGTGGCAGCTGCTGCAGAACAGGCTTTTATCCCATACGCAGAGAAGGTT CTTGAAATGATGAAAGGATTTCTGGTGCTCACTAAGGATGAAGATTTGTG TGCACGAGCTAGGGCTACTGAGGTTGTTGGGATAGTAGCAATGGCAGTAG GCAAAACCAGAATGGAAGCGATATTGCCTCCTTTTATTGAGGCTGCTATT ACCGTGAGTCCTAATTCTAGTACTTTAGAGTTCAGATAACTCGAAGACGT TAGTGCAATTCTTTATGCTCTTTATACTTGCAGGGTTTTGGATTGGATTA TAGCGAGCTAAGAGAGTATACTCATGGTTTTTTTAGCAACATTGCTGAGA TTCTGGATGATAATTTCACACAGGTAACAATGGAAGTCAAAAGTTTGTTC ATTTCTCAAATGCTATTTATGCTTACAGAAGTGGTTGTTGCACATTGCAG TATCTTCCCCATGTTGTGCCTCTTGTATTTTCCTCGTGCAACTTGGATGA TGGTTCTGCTGTGGACATTGATGATGCTGATGGTGCTGACAATGGATTTA GTGGTGTTTCTTCTGATGATGATACAGATGATGAGCCAAGAGTTAGAAAT ATCAGTGTGAGGACTGGAGTATTAGACGAGAAAGCAGCTGCAACTCAGGC TATTGGATTTTTTGCACTTCACACAAAGAGTGCCTATGCTCCGTATCCTT AAATGATGCTTAGCATAATATTCTCGCCATCTTTTGTTCTTCAAAATTTC CTTAACTGGCACCAGGTACTTGGAGGAGTCTTTGAAGATTTTAATCAAGC ACAGTGGATATTTTCATGAAGATGTCAGGCTTCAGGCTATTATTTCGTTA AAACGTAATGTCTTTCCTAGTCCTCTTTAATATATAAGCTTATAGCAGCC TTTTGGTTTCCTTATTTCTCAGGCCTACATAATAACAACTAATGGAGATT CTGATGATTTTAGTTGTGGTTGGAAATTCCAAATTTCCAATAGTCATTTA ACATACAAACAACGTAATCTAGATGAATAAACTTTTGTTACATGTATCTG CACTTCTACAGAATCTGTCTCCAGCATGGTATATATCATACAGTACTATA CGACTACAGAATAAACTTTTGTCACACGTAACATACATTAACGTAGATCA CACGATGCATTCATGATCAATGTTCTTTTATGCAATCATATATAATGTTA CCTTGTGTCCATCATTTGAAGTTTTATTTTGGTTTAACTGCAAACCCATT CAAGCAGCATCATCAAAGTTGTAATACAGTAGTCACCTTGCTAGTGCAAT CATGGTAGTGTACCATTAATTGCTTGATTCGCTCGAATCTATCTACGGAG GCAATGCCCAGATCAGGCTCGAATAGTCATCAAATCTGAACCTAGCGATC CAGACAGGCTCAAATATATCTACGGAGGCAAAACCCATATCAGAAAACCA ACAAAGGAAATTGTGAGCAGAATGGAAGCTTGCCTAGCATCCTTCACCTT CACCCATGGGCGGAGCCTGCTATATACATGGGTGTACAAATGTACCCCCA TTATTTCAGGGGGAAAAGCTTTACCTCTATAGAATACAATAATACATATA TACTTTACAATAGACATATGACAAATCGAAAGGTTTTGACTACCTTTTGG ATCCTGGTACACCCATTTCCTGTAATCTAGCTCCTCTACTACCTTCACCT ATGCCATGCTCTTTTGTTATTTTTGTCATATTAGTCATGTATGGGATCTT TTGCGCACGAACCGGATACTGTGTTGTGACAAACCACGAATTGCAAACCC AGCGAACTCTCCGATCTGTTAACTCCCAAGAGATCATCAACAAACTGTAT ACGGATGGTAGGCACAACAATCACGAGCAATAGGAGAGCGTTTGACAATT GACACAGAACTTTAAGTTTGTAAAATTACAAGTTTCTTTGAGTTTTTTAA TTCTTTGAGACTTCCCCATTAAACGTATGTTTTGTGGTATTATCAGTAAT TATAATAATAAAACTACTATTGCAGACATCCTAACTGCAGTAAAGGCAAT ACCTGCACACGCTGTGAGTACTAAATGCATTGAATTGTCAATTCAGCAGT TGTTTGCTCTGGAACATCAAAATTCTGATACAGTGTGTACTTTTTCCACC ATGCAGGATATACTAGAGAAACAGAAGGATGTTCTTGGTAATCGCTACTT AAGTTGCTGACTTTTAAGTCCATTTTGCTACGTGCACATCAAGTCGTGCT CATCTTCTCTAGTTTTTTCCAGATACTATTATGAATATCTATATCAAGAC CATGACAGAGGATGATGATAAAGAAGTAGTGGCGCAAGCTTGCATGAGTG TAGCAGATATTGTCAAAGATTGTGGTTTTGCTGCAGTCGAACTTTGTAAG CTGCACTTTCTCAGAGTTAGGTGCACTGGAATACTAGGTTCCGCTGTTAA AATTGTCCATTCTGTCACTGTTTCAGATATACCGCGGCTTGCTGAGGCAA CACTTACTCTGCTGAATCAAGAATCATGCTGTCAGCAAGTTGAGTCGGAC GGCGAAGATGATGGTGACATTGATCATGATGAAGTCCTCATGGACGCAGT TTCAGATCTTTTGCCTGCTTTTGCGAAAGTGATGCGATCTTACTTCGACC CTATCTTTGCAAAGTTATTTGACCCCTTGATGAAATTCGCTGTGAGCCCC CCTCCCTCATCGTGGTCAACTAATGCCAGCTGTCCTAATCTTATAGTGAG CATTGTACATTTGATGTTTGAAGATGCTTTCTGAATGAATGCAGAAATCT CCACATCCTCCCCAAGATAAGACTATGGTCGTTGCCACCCTAGCTGAGGT CGCTCAAGAAATGGGTGCTCCAATTTCTGCTTATGTTGACGTATGCCTAT GGTTTTCTTTAAAACATGCCATCTTGTCGTTTTAATTGGCCTCTTGATGC TTACTAATATTTGAATCATTTGCAGAAGATAATGCCTTTGGCATTGAAAG AACTTGCATCTTCTGAGGCCACGAATAGGAGAAATGCCGCTTTCTGTGTT GGCGAGCTGTGCAAGAATGGGGGTGCTGCAGCACTGAGGTATGTAAAGTA CTTAAAATAACAGACATATTTCATACTCAATTTTGCAGAAGCTCCTATCT GAGGCTAATATCTTGCACTCCGGAAATGAGGAGCAAATGACTATTATTTA AATCTGCTGTGCACAATGTTTCTTTTCTTATGTTCCGAAAGTGTATCTGT ATAACAAATGGACATTAACATTTTGTAACTTGCTTTCACAATTATGACGG AAGTGCTGAAAGAATGGTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTGGAT TTATCTAGATTCGGATGTATCTAGCACTAAAACATGTCTAGATGCACTCG AATTTAGACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGCTAAA ATTGACCAAGTGTATTAGATGATAAGATATGCTGTTTAGTCACAAAATGA ACTAATGTTCATGGTACACTATGAACATAAACGGTAAATCCTGTAAATTC AGTTGTTCACAGGCTATTGTTCATCTTTCTGCAGGTATTACCCAGATATA CTGCAGGGTCTGTATCGATTGTTTGCCAATTCTGAACCAGACCTTGCAGT TAGAGATAATGCTGCTGGTGCTATTGCCAGAATGATAATGGTGCAACCTC AGTCAATTCCTCTCAACCAGGTTTGCACTATCTTGCATATAATACGTTTG AACAGCTTCAGATTTCAGACTTTAAAGTGCCTATCTAATACTTGGTTGCA ATGCTATATCTGTTTCTCAGGTTCTTCCGGTGTTTATCAAAGCTCTGCCA CTAAAAGAGGATCATGAAGAATCAATGGCTGTCTACAGTTGCTTATGTAA TTTGTTACTATCATCACATCCCCAGGTAACTTGGTCTTGAACCACCCAAT TTTTTGATTTGTTCCATGATCTGTGCTTTCATTATGTGAACTTTTTCCTA ACATTTTGTTGTTGCAGATCCTTACTCTAGTGCCTGACGTGGTACATGTC TTTGCCCAAGTGGTAGTATCCCCAGATGAGAGTGATGAAGTCAAAACAAT TATTGGCAAGGCTGTTTCTCATTTGATATCCGTTTATGGCCAGCAGATGC AGCCAATACTAAGTGCTCTACCACCAGCTCATGCGAATGCGTTGGCAGCA TTTGCCAGTAGAAGATAACCTTCAGAGAAACAATTACCTTCAAATTTTTG TGCTGCTGGAGTGTTTTTGTTAAAAGATTGTCCTTCCAGAAACACAACCG GTTTATCAGATATGGATGGATTCCCTCAAGTTTTGTCAATTGGTGCCATT TGCTGAAGAATATTTGTTAGCTGGATATGGATATGGTTTGAGCAGCATAG CCTATCTGGAGTATCTACGTTGGGATGCCCAATCAGCGCAAATGCTGGAA AAATATGAAAGATATAGTTTGTTTGTTTGCTGCTTATGTAGTGTATTTAC TTTTCGAGTTGGAGTATATTGCACTGGAATGGTGTTTACTGCGGTTGAAG ATGCAGTGCTTTGTCAGGCGGCAGCTTTGGTGAGTCCCCGTGTGTATTCA GGTTCCGTTTTTGGCTATTTATGTGTTTGATTTTATAATTATTTATTGGG TTGTGCAAATCATTGATGTACTGTTGTGTACATAAACTTGCTGGGCAAAA TTCTTCTGTAACTTGGATTTGTTGTGCCGTCTATCAAATTGCTTGGGGGC TGTTTGTGAGACCGTTATTTTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.