Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE010046

[Submit comment/correction]

Sequence	AE010046
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE010046
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGAAATGGACGGCTGCACATCAACCTATACGGAAGCATGCGCGGTACCGC AACGTACCTAGCAGCATAGCGGTCTTGGATTCGCTTTTTTCTTGGAATCA GATGCTGAGGCTGCTGCGCGTCGTTGCTCTGCTCCTCGGCGCGGCGGCCG CTGGGTCGGCGGCGAGGAGCGGCGACATCAGCAGAGACGACTTCCCCAGG GGCTTCACCTTCGGCGCCGGAACGTCGGCTTATCAAGTGAGTTACATTAT CTGTGAGACGACGACGAGGAGGCTTGCTGGTTACATCGATCACTGACAAG CGTCCGTGGCCGGTTCGACTATTTGTTTCAGTGGGAAGGCGCGGCGGCGG AGGACGGCCGGACGCCCAGCGTCTGGGACACCTTCGCTCACGCTCACGCC CACTCCGGTACGCAACGTAACGCTTCTTTTTGCTCTGGCGCGTGCCGGCG TTTCTCACTAACATTCGTAAGTGCGGCAGGATCAATCACTATTCACCAAG TTTCAAAAGACAAAAACAGCAATGCACCAGAGATCGTATAATTTGGATTT TGGGGGTTGTTACACACCCTGAACAATAGTATCCCTGATGAAAAAAAGCA CTTCAGGCAGTTGCTGACGCGTGGATCCACATGCCGGTGACCCTCCTTAG GGCACCACATGTCAAATGATCCCCTTCCGCCCTACGAGCACACATGTCGG ACTTTTTTATTTTCATACCAACAGACATGTAGCGTTGCTCGTCCTCCCAA GTCCCAACCGAGTGTAAGGTTCACATGGTTTCCCAAGTCCCAACAGGTGT TTAAGTCGACGCCTTGCCCCTCCGTTGGCGAGGCCGTGGGACCCTAGCCC CCTTTGTTTGTCACTTCAACGACAGGAGGAGGGATCGTGGGGCTTCGACT CCCGCGTGTATGCAACTTTATGTTCTTCTAGGACATGTGTAGTAGGAATG GCGCAGTGTATGAATAAACAGAGCTTATTCTCCCTACCTTAGCGGTGCTC TAATCCGAGACATTGACAAGTTCATGGTCAGTAGGTGATCTGATCGTCTC GTGGGGCTTGGGTTCCGTTGAGTGCAGAGTTTAGTTATGGGTGTTCAATA TCCCCTAGGTGGCGGTGGTATCGACCTTTGCCTAAATTTTGTATGTTTTT GAGCGGCGTGTGTGGCGTGCTCTTCTTCACCGACCGTGTTAGATGAGGAA TAGGATGCAGGGATCTAGTGGACATGGTAAACATCTCTAGACGGAGATGA GCAACATGATCTACAAAGGTGTTCCCCCAGATCTAGGTGTGGTGGCTGGT CCCCTTGTTTTCAACGGTACCTTGGCGGAGGAGGAGATCAACGAGTTTAT GAGGTGTGAGGATCTTCAGGAAATGTATTTTTCCTTAATATGAGGCATCT GTGCAAAAATTCAACACACTCGTCTTCCTATTCCTGTTGTATATCCACGT TCATGTGTATTGTAATATAGTTGCTTTTTTTACTATCAATGCTATGATAT ATTTATAGTAGTTGTTAGGCTTAGTCCCACATCGAAGAGACCGGGAGTGA CTTGTAAAGCTAAGGGTGGCCCCAAAACAGGCTAGTCTTTTGGAGGAGAG AGCCCAATGTTTGACATAAGTCCGTGTTAGCCTCCAGTTGGGCTGGGTTG GTGGGCCGAAACACCCGTGAAGCGGGCCCACACCGATGATAATTGGTATC ACAACCTTGGTGTCTAGACGCAAATCTCGCGTGTACTCACATTGGTAGGT CATGGTTGGTGAGCTCGAAACGATGTATTAAGCGGGCTATGGTGACTGAT GTGTGAGGGGAATGTATTAAGCGGGCTATGGTGACTGATGTGTGAGGGGA ATATTTGTTGAGTTTAGTTCTACACAAGTTGTTGGAGGAAATCGGGAGCG ACTTATAAGGCTAAAGGTGACCTTTCTAATAGGCTAGTCTCTTATGGGAA GAGAACCCAAAGCCTTATGTAAGTCGGTGTTGGTCTCCGGTTAGTCTGGA TTGGTGGACCGAGACGCTCGTGAAGTGAGACCACACCGCTAACAATTCTT GTTAGCATATAACGTTATTAGATAATTGCATAAGATAAACAGGAGATAAT GTTTGGTAACACAGTTCAATGATATCTACATCCACAAGACATGTTTAACG GGCGCTCCTCTTTATGTACTATATCATAGTACCGTCAACAAAAAGCCCAT AGTGGTCTTACAGCTATATTAGATCTTTCAGACGTCATGCCACGCGCATC GGGTCGTCCTGAAAACGTTTATGTCGGACTTACAACTTGAGTTTATTCTA TTTTAACTACTCCCGGTGTCTTTATATATTACGTCATGTGTCATGTTATA AGTGTTCGACCTCAACAAATAACTTACCACATATTCAAGTCCAACGGTAT CCTATACACATATTTGCAAAATTCCAACCGTAGTGAATAGTGCATGTAGT AATACATGCAGTAAACAATTACAAAATAAGTCTAAAATCTGAGCCAATTT TCAAGATCTTCAAATTCTTTTTCTGTCATGACATAATCATGTGTTTTTCT TAAGATATCCGAACAAAAGTAACATAAAAACAAATCGCAAATTTCTACTC CCTCCGTCTCAAAATAAGTGACTTTACTTTATCTAGATACGTATAAATCT AGGCATAAAATGTATCTAAATACGTATCTAGACAAAGTTGAGTTGCTTAC CAAACGACGGTTCTAATTTGAGTCACAATGGCAAAACTAATTGCGCGCGT GCATCTATTAAAGAAATCGACAAGATTACTAACACTGGTATTTCAAAGAA AGACAATTGAACAGCCGATGTCGCTGATGAAAGTCAAGAGTATAAATTAC TCGACGAAGTATCAGTCGGGACGAATATTGCACACCTCTCCCGACACTGT CGAGGTCGGCCGGAGGAGAGGACCCGACTATGGCTGGGGGGCGGCTTTTC GGTGACGACGGGTTAAACGGCCACGGGCAAGGGAAAGCCGTAACACTGTT GCTGTTTAACGGAACGCGTGGCTGCTAATTCTTCGAAAAGAAATCTAACC GAGCCTCCTTCCCATTTCACGGCGGCGCCGCCGCAAGTCCGCCACCGGCG ACAGATCTCTTGCCATCGTGCTCTCCTCCGCCCCCCCACAATCTCTACGT ATTTCACCGCGCTACAGGGCGGTCCTACCCTAGCCTCCGATGGCACCGCT CGACCCCCACTCTCCACTCCCAGTTCCCTACCCCACCCCTACGCGGCTAC ACGCACACCACAGCGCCGAGGCCCGAGGGCGCGACCATAGAAGCTGCAGC TTCTACCTAGTCAGGCGAACATGAACTGGTAAGCTAAGCGCGCTTTGCAG TGACTGCTTCTCCAACATTTGCCGAACTGGGGATTGCTCCTTGTGATAGC AAGTGGGCAACTACTACTCCAGTGCTCTTGATTGTTTTGCCCAAGGTAGA ATCTGTATGCACAGCTGTTACAGTTTGTTGCAAAGGAGGCCATCTCATAT ACTCCTTCCGTTTCAAAATATAAGATGCTTTAGCTTTTGTAAAACGAGTG TATCTAGACACCTTTTAATGTGTAGGTTCACTCTGATTCTCCGAACCTAT ACACTAAAATGTGTTTAGATGTATTCCTTTCACAAAAGCTACTCCCTCTG TTTTATAATATAAGATGTTTTAGCTTTATGAAGGTAATATATCTTGACGC CTTTTAGTGTGTAGGTTCAGTTTAAAATTAAAAACTTTAGCGGAGGTCAA CGACGAAATGATTACACTTTCAGTATCATGCTCAGATTTTCCTATGGCCC CAAATCATAGATGTCGTAGTGGTTATACAAAACTGTGAATCTTGTGGGGT TTTCTGAACCCGAACTAGTTCAGGGTCTGGATTCAGGTTTACAGTGGAAA TCAAAAGAAGTTTGTTATGCATATGGTCTACGTCTCACTCAGTGCTCATA AGTTCTTCAATACAGGTGATGACTCTGTGAACGGTGATGTAGCAGCTGAC GGATACCATAAATACAAGGTGCGGTAATTTTCGTCATTTAGTTCTGCCAC CTTTAATTGGCTTCTGTATGTCAGAACGCAAATGCTCCTGTAGTTGCTAA GCAGAACTCATAACAGGCTATCAGAGAGGTTGCCTTTGTATGGTCCATTT TTAGATGGAGTGGGTAGTTGGTGGCACGCCGTATTGGGGAGAGATGAGAG AGTACTTTGTAGGTTGTGACTCCAAGAAAATGTTAGTGATAGTAAATATT TTCTTGGAAAAAAAATTAGATGATATAAGCATACAAACAGCATTGACTAA CAGTACGTGACAAAAAGTAACCAATCCTGGTAAAATGCTGCATGCTGTTG TATCATTTCTCGTGTTTGTAACAGGAGGATATCAAATTAATGAAGGAGAC TGGGTTGGATGCTTATAGGTTCTCTATCTCTTGGCCAAGAATTATTCCCA GTATGTTCTTGACAAACTTGTGTCAAAGTTTCATTGTTTAGTTGGGTTCT TAAATGATATAATTCTGATTAATGATTACCTTCCACGTGTCAGATGGCAG AGGAGAAGTCAATCCAAAAGGAGTAGAGTACTACAATAATCTCATCAATG AACTTCTTGATCATGGTAAATCTTGTATTCAAAGCTGTCTATGTTCCTAT TAAATCTAATAATCATGGGGATTGCATATAACTCCCTCTGTTAACAAACT AATGTAATTTTTGCATGCAGTAAAAGAAGTTAGGCCAGTATGTTACCAGT AGGTTTTTTTAGCAGGGCCCTACACCCCTGGATTTCTAGGGGACTAAAAT GATAGGCCACAGCTTGGACCAGGGAGTAAACCCGGGAATGCCTGGCTCAG TTGAACTGGACTGCCGATGAACACGTCCAGTTTAACTTACTCATCCTGTT TCTATTTGTATTTATCTGCATTCTAATGGTAAAAGTAGATGTACAAATGG AACTGAGGGATATGTTGCATCCATGATATTGAGCTAAGATTAAGTGGTGT TAATGAAGAATGTCGTTGAAGAACACTGTATATGGCCTTACTTAGTATGT CTAGCATCTTGCAGGAATTGAACCACATGTAACAATTTTCCAATATGATC TTCCTCAAATCCTTGAAGATGAATATGATGGATGGTTAAGTCCTCAAATC ATGTAGGTATTATATTTCCATGCATTTCATGTTTTCTCTTCATTTGTGAA AAATATGATGTGTTTGTATGATAGTATTCATTATAATTGTGTGTTATGCA TAATATTGCAAAATAATGAAAATTGCAGCTTAAAAACATGCATTAGATCT GCCTTGCACAAAACAGGATTGATTTTCCATGCCTGTCGTTCTTATCACAT GTAAATGTGTAGAATATATACACCTTTTAACCCCATTTCCTATTTCCAGT GATGATTTCACAGCATATGCAGATGTGTGCTTTAGGGAATTTGGGGATAG AGTTACCAATTGGACCACTCTAAATGAACCTAATGCTTTAGTTTCGCTTG GTTATGATGCTGGTATTGGGCCACCAGGGAGATGTTCTAAACCATTTGGA CTTGGTGATTGTTCCCGTGGGAACTCTGTAAATGAGCCATACATTGTAGC TCATAATTGCTTGTTGGCTCATAGCTCAGCTGTGTCATTATACAGGAAAA AGTATCAGGTACCATCTCTTTCCTGGCAAATCGGTTCTAAGATATTTCTG AAGTGCTTAGCTAAACCTATATTTTGAATCATCAATGTGACCCTGCGATG TAATTTTCGAATTATTGAAGATTAAATAAATTATTGGTTCGAATAATTAT TCTGCTCCAAGAAGTAAATCCGAATGCCATCTCTGTTGCCTATATTCTGT GCTAAATGCTGAAAGTATGTTATAACATTCATATTTCCCTTGGACTGTAG ATAGAGTTTACCTAAGTTTCCTAAACTGCAAATGTGATGTTGAGAAATAT GCGAATTACTACCATTTCTCATAATTCAACTTCATCTGGACTATTACGAA GGACCTAAAGATCATCATGTTTCATATGAAAGAGAAATTTGTTATATCCA TGGATAAAACTGTACTTTATGTTGCAGGCAAAGCAACATGGACTTATTGG CATGAATATGTTTATAAATAACATTTTACCTTTTACAAACTCAACAGAAG ATATAGCTGCAGCGAAAAGAGCACAAGCCTTCTACACAGGCTGGTAGGTT GATCATTCTGCCTTTTTTACCTCTACAGTGCCAGCATTGATTTCATACTA GTTGGATATCATTTGCCTTGACAAAAAATATTATACTAGAGCCAAAAACG AGGAACACCAAAGGAGAAGCTTTTTAGCAGCCTGCCGAACAAGGATGCCA TAAGGCTTATTTTACACATTTCATCCAATGGCTTTTGAATTTTTGCCAAA CTGCCAATGAAATATGCTGTTGAACTTGTTGAAATTTTACTATTTTTATC TCTCTGCCTACGATAGATAACATGTTGAGAGAAGATTATGTTAGCAGTGT CCATAAGTTGACCAACAGGGGAAGGATCCCTCCCTTGGCTTTACATTGTT AGCTAGATGAGACCTCTCCAGCGATTTTCCATGTAGATAGCACCCTGTTT AGTTCAAGCACTCCACCTGCGACTCGAACCCGGGTGGGCCGGCTCAACAC CCTGAGCTCTAGCCACCAAGCCAGCGCTTGGTTCTCATGTCAGCAGTGTC CATGGAATTTTTAGGTCTTGAAATAGGCTTGATAGAACTTAGATTACACC TACTTTAATAGCATACAACTGTTGTATGCTATTGAAATTACAGTTTATCC AATAAGCTTTTTAGTGGTGGTCTTCTGTATATGTAAATACATTATTCCTT GAATTCTATTGATGTCAGATATTCCAAAGATTGTAGATAATAGAGCCTTT TTGTGGTACTTCCTGCCATGGTTTCTAGTTCAAATGTTATCTTTGTTGGC TTTTCTCTTGGTAATGTTCTCAGTATATTTGCACATGTTGAAGTTTTTTC ATCGTATTTGTACAAGATATATGGTGCACATGGCTTGTGTAACCTTTTGT GTTCTGGTTTTTTCGATTTGTTGCATTAATAGAAAATTTCCAGCTCTAGA CCTCTAGTTTTCATTGCCACATGGAGAGTAATCTAAATATGAAGGTTATT GGTAGGCTCACTTGCATGAGAAAATTATTTTAATATATCGAGCTGCAAGG CATTTAATGAAAGTACTTACCATTATCATAGTATTCAAGAACAAATATGT CAGTTTTTTTTAACAGAAATATGTATATATATGTATGTGTGTTTCTGTTG GTAGTGGTTGTGGTGCATACATGTATGTTTTCTAGTCACACAACGGTGGG ACCCTTTTCATTTCAAGTATGGGGAAACTTATGGATCTGTGGAGTTGGAT TTCGTAATTATAATTGTTGTCATGCATTGCACTAAAATGGTGAAGAAATT TTGGCCCTTCTCTAAATTATGTTATTTCTCTATATTAGGTTCTTGAGCCC TCTTTATTATGGAGACTACCCGGTTGTAATGAAGGAGAACACTGGCTCCA AGTTGCCAAAATTTTCTCGAAACCAATCTGAACAACTAATCAACTCTATG GACTTTCTTGGTATCAATTACTACACCATTTTGTATGTGAAGGATAATCC ACACGATGCTCCTAGCGACGAAAGAGATTTTATGGCTGATATGTCTGCTA AAGCAATATGTGAGTGTCATATGTGTTATATTCTGGTGACTCAACTATTG TTGCTTTTATAGAGGTTATTCACGTTCAGACAAAACCTAGAAAGATGTTA GCATATAATATACCAGATCTTTTACTAACTTTGATATACTTTACATCATT TATGTGAAGGAGAATTATTGATCATAATTGATAATCTATGATTATTCATG AGTAAAACTATTTATTATTACTGTCTTGTGGACAATTGGAGACCTAGAAC TTTGCATACGTTGAGGCCTTGTTGGCCCTTGAGGTTGATCCAATCAGAGA TTCTCACGCTCTGGTAAGATCTCTTAGCATACCTCACTACAGAGACATCG GTCTCCATGGTGGATAGATATGGGAACCAGAGGGGAGGAGGGACGTATAG AGGCGGTGGCGGCGAATGAATGGTTCCAGGAGCATGTTAGCCGAAGGATG ATGGCCATCACACCTGTTGTTAACGAGCATGGTAGCGCACTCCAATGTGG AGCCTGCAAAGAGTCGGGTAGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGATGGAGGGTT ATGAGACAGACAGAGGTGAATGCCAATCCTAGAGATGAGTCATTGACATA CCATCCTACGTCCTGGTATTATCTCTTGGCTAACAATGTAGAGCTAAGTG AGACAATAGCGCAAGTTTATGGACAACACAGTTTATTCCATAGATTAATA GTTACTAACTTACTACCGGAAGTAATTTCTTCTGCACCGAGAAATATTTC ACTAATTAATTGTGTACTGTAAATTCATGTTGATTCTTTAATCATATGTA AATTCTTTACTATAGTGTGGTTATTCAATTTATGATTTCTCTCTTTGCAG TTGCAAGCAATTCTACCACTGGGGTAAGATAAACTTGCAGTAAATATGTT CTTACATATAAATATATAATAACAAAGTCTGACGTATAGTGCTATTCAGT TCTATGTGCCGGGTTATGGTCTCCAGCAAGTGCTTGAACATTTGAAGCAA TCTTATGGTAACCCTCCTATCTATATTCATGAGAATGGTAAGTATTTTTG CAACTACCAATAAGCCGATTGATCTGCTGACTTTGCGTATCTTTTTTATA CATCCTACTTATATGATGTCTAATATGTAATTTAGACGCAATGTTAGCCA ATATTACGAGACTATATTTTTTCTTTCCCTACATATTCTTCAGTGCTACA GGAACATGTAATTATTTTGTCTAAATATCCTGACTTACCAATGCCTATAT ATTTCGCATAAACACTTCGAGAGCAACTTACAAAAGGTTAAACTCTAGGA TATCCAATGCATCAAGAAGTGGTGTTTGATGATGGCCCTAGGGTGCAATT CTTGAGTGAGCATCTTAGAAGCCTACTTATTTCTATAAGGTATTACCCTT TTCCCCTCTAGTGGTCATGCATTAGATTTCTCTTCAAATGATTTGACAGT TGGCCTTGTGTTTATAATGCTATAAAGTTCATAACATAAAGAGGATATAA AACAACAATATGCATCTCTAATTGGATTAGTTGCTCTGTATGTTAATCAT AAAACTAATATCTTACTGCATGAATCATGGGAGTAATCGTCTAACATAGA TGTATTAGGGAATGATCTGATCTTGGTGTAATCATAGTTCAGCGCCATGT TCCTTTCCTAAAAAGGGAAAATAAAGACGTGCTGCTGGTCATTGTAGCAG ACTATATAGTGTCTAGCCAATGGCACACGGAAAAGTTCCTTTGTAATGGT ATGGTTGACATGACAGTGGCCTGAAATAACATTTCTGGTGCCTTGCAGGA ATGGTTCGAATACTAGAGGCTACTTTGTGTGGTCGCTGATGGATTTATAT GAACTACTGAGTCTCCAGGACACGTATGGGCTCTATTACGTGGATTTTTC TGACAAGGATCTGAAGAGGTACCCAAGGAGTTCTGCAATTTGGTACGCAG ATTTTCTCAGGGGCAGAAAAGGGTTGAGGCACATGGAGAGATTTTCAGAT CACTAGATGTCGATGAATGGTGCTTAGAATGCACTGGTTGTCGATTTTCA GATCATTAGCTGTCGACTCACTGGTTCTTGTGACATCAGTCAGTCCAAGA ATGTTCAAGTATTTCGTATATTACTTGTGGACAACTCTTGCTCCAACAGC TTTTGTAAAAGTAAGACAGTTTCTTCGATGTTGAAAGGGAGGCAAAAGCT TTTGTAAAAGTAAGACAGTTTCTTCGATGTCGAAACAGTTATACATGTCA TAATGAATTGATGAATGTACGGCCATTCTCACAACAGTCAAAACGGTGAT AAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.