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GrainGenes Sequence Report: AE018003

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Sequence
AE018003
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE018003
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAGCGAAGCGAGGCAAAACAGGTCGAGGAGTGAGGCGCCCAGATCCAAAC
CCCCCTCCCCTCTGTTTCTCCAGATCTCGCATCCTCTCCCTCTCCTCGGA
TCCAACCACTTCATTTCCTTTTCCCCCTCGCCCCGCCGCGACCCGGAGGA
GGAGGAGGAGTGAGATCTGCCGCGGCCATGGCGGGCGCAGCGGGAGGGTT
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ACGCTCTCCCGTTCTCTCGCGCATTGTGATCCCGTAGCTGCGCCTGCCCC
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GAGTTAACATGTGGGTTACAGTACTGTTCTCCAGGTTTTGAAAGTCCTCC
TCAATGCTGTTGCTTCAAATAGGTTTAGAGGTAACCTTCCAGTCTTGCTA
AGCTTTTCTTTACATCTTTAACACTGTTTATTATGCAAGTTAGAAGCTAA
TATGGTTGGCTGAACAGTATCTAACCTATGATAGTATGGTCTAGGAAAAC
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TGTTCTTCACTCTAATCTGACACGGAGCTTAACTTTGCGTACATATAACC
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TTTTTGAAGGATTTTCTCGGTTTTCATCTTCCTTGTTCCGTGTCTCAGGT
TTCTATACCAGCTGCGAGTTCTGCAGTTAAAGATGCACCTTCGTCTAGCA
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AAAAACTACTCTTGGAGATGCGTTGTCCATAAACCGGGCTTCAGAAAAAT
CTCCAACATCCGTTGAAGAGCTTCAGACCCTTGCAGGAGGAGCAGATATT
AAGGTAGTGAAATTGGATTGCTTACTGTTTTAATCTTTCTATCAGGACCC
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AGGGGTTGGAGGCTGTTCTTGACAAGGCTGTTGAACTTGAAGATGGAAAG
AAAGTGTCGGGGTTTGTTGAGCTTTAATTTGTGTTTGCACTGACTCCTAT
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AACTTACTACATTTGCCTCCCTTCCCCCTCTTTTCCAGCGGAATTGACCT
GGACACAATGAATATAATACAGCGGGACGCACTATTGCTTTTTAGGACTC
TTTGCAAGGTCAGTATTTTTGTTGAATGGCGTACCTGATGTTACTTTGAT
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TCTTTTACCTGCAGGGATTGTTAGAAGGAGTCAGTGATTTGTTTGCCAAA
AATTTCCACTTCATTGATTCAGTTAAAGCATACCTTTCCTACGCTCTTCT
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TGGGATATTTTCAGTCCTGTTGCTTCGTTTTAGAGAGAGTCTAAAGGTAA
AATTGCTATCAACAGAACTGGCATTGTTTACGGTATGAGATTTCTTCTTG
TATCCTGACTTTTTATTATCATTCAAATGTTATGCAGGGAGAAATTGGTG
TCTTCTTTCCTTTGATAGTTCTAAGGTCTCTAGATAGCTCTGATAGCCCT
CTCAGTCAGAAGTCCAGTGTTCTTAGGTGATTCCTCTTTCTTTATGGAAT
CTCATCTTAATGTGTAATGCATAAACATATGTTGTGTTTGATCCAATTTT
GTCATCTTTGTCTTTTATTTGTTTTGCTGACGTAGATCATCTGATGTTAT
CTGATCGACTTGTTTGTCAATCAGGATGCTGGAAAAAGTCTGCAAAGATT
CACAAATGCTTGCAGATATGTTTGTAAATTATGATTGTGACCTTGAGGGG
CCAAACCTTTTTGAACGCATGGTAGGTGCAAGGAGGATTGTTTTCTAACT
ATGCAGGACTGGCATATCTTCTAGTTTGTCGATTTTTAATTTCTACATAT
CTGATTGTTCATATACGTCCTATCAGGTTAGTGCTCTTTCAAGAATTGCC
CATGGATCTCAAAGCGTTGATAGTAACACTGTTGCTGCATCTCAGACAGT
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CGCAGTGTTTGGTGAGTATTTTGAAGTCGTTAGTTGATTGGGAGCAAGCT
CGAAGAGATTCCTCAAATCAGGTGACCGTTGTTGAATCTCATGAAGATGA
TGCTTCTGCAAGGAGCTTGACAATTGATGAGACGAAGGTCCAAGATGATG
GTCGCAATCAGTTTGAGAGAGCTAAAGCCCACAAGTCAACAATGGAGGCT
GCGATTTCAGAGGTGAGAGGCTTGTTGTTTTTACTGTTTCATTTTGCAAT
CAAGAGGCCTCCTTTGCCTCATGGTGGTCCTCAAATACATGTACATATTT
GAAGCAACCAGTTATCCTAGTTTTTTCTCGCCGCACTACTGATTTTACCT
GGCCCTTTCCCCTTCTGTATTGCAGTTTAATCGCAAGCCAGCAAAGGGGG
TCGAGTATTTATTGTCAAATAAGTTGATTGAAAATAATGCATCATCTGTA
GCTCAGTTTCTCAAGAGTAATTCCAGCTTGAATAAGGTGATTTCAAGGAA
CTTAATGATCTTTGTCAAGTTGCATTTATTGGTCAGAGCGATGTGGCTAA
TCACTGCTTGTGATAACATTGCAGATCATGATTGGTGAATATTTGGGACA
GCATGAGGAGTTTCCCCTTGCTGTGATGCATGCTTATGTTGATTCCATGA
AGTTTTCAGGGTTGAAGTTTGATGCTGCAATTCGTGAGTTCCTGAAAGGA
TTTCGCCTTCCTGGGGAGGCACAGAAGATTGATCGCATAATGGAAAAATT
TGCCGAGCGGTATGCAATTATAGAATCTTAATACAATTATCTTTTCTTTG
ACATGTTGTAATGTGATCCTCAAGTACTTGTATGATGACTTGCAGGTACT
GTGCTGATAACCCTGGGCTTTTTAAAAATGCGGATACTGCTTATATTCTT
GCTTATGCTGTTATAATGTTAAATACGGATGCACATAATCCAATGGTGTG
GCCTAAGATGTCAAAATCAGATTTTGTACGTTTGAACACCGTGAGTGATG
AAGAGGAATGTGCCCCAAAGGAGTTATTAGAGGAAATTTATGATTCAATT
ATCAAAGAAGAAATAAAGATGAAAGATGATCTCCTTAATGCAAAAACCAG
ACATGAAATAGAAGAAAAAGGTCGCCTCGTCAATATCCTCAATTTAGCTC
TCCCAAGACTGAAGTCAGCAAGTGATACAAAGGCAGAAAGTGAAAAAATT
ATTAAGCAAACTCAAGCAGTTTTCAAAAACCAGAAACAGAAGAGAGGTGT
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CCTTACTCGTGTTCTTGGAATGGACACCATGCGCTATGCTTTCTTGACAT
CCTTAGTAAGGTAAGCCAATTACCCTTTCTACTTCTGAATTTATACTGTT
TATTTCTTCCTTTTTTTCATTTTGTTAACCTTTTGCAGGTTTACATTTCT
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GCTGTTTTAGAATGTGTCTCAAGACTTGAGTATATCACTTCAAGTCCTTC
AATGGCCGCAACTGTTATGCAAGGATCTAATCAAATATCAAGGGATTCTG
TAGTTCAATCACTGAAAGAGTTGTCTGGGAAGCCTGCTGAACAAGTGTTT
GTGAACAGTGTAAAACTACCAAGTGATTCCATTGTTGAATTCTTCACTGC
CCTTTGTGGTGTTTCAGCAGAAGAACTTAAACAGACACCTCCTCGTGTCT
TCAGCTTGCAAAAGCTTGTTGAAATAAGCTACTATAATATGGCCCGGATA
CGTTTGGTATGTTTCGCTATCCTTGTTTCATTATGTGTCCTATTGTTCTT
TTAGCAATTCTTCCTTGAACTAAAGCCACGTCAAGTATTTTGGAATGGAG
GAGTACCTAATTATTATCACACTAAGTAGGTCTAAATGGGTGTGGACAAA
TGGCTCCCGAGCTCCATGGAGCCCTTTAGTTCAAAAAATTCGCAAATAAT
AGTACAGAAAAATCTGAAAATTATTCTATAGGCATGCAGAATCTCAGTGC
AAAATCCTTGGTATTTATTTTTTTGTATCCTTGAATACATAGTATTTTGC
ATCCTTTTGTGTATATATCATTGACTACCTACAGAATTCTATTCAGATTT
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TTACAATCATATGCTGTTGTAGAAGATGCTTCGTTGAATCAGGCAATACT
TCTTTTTGTATCTAAGAAAAACTAATGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAAG
TGACTTGCATTTATTTAGATTCGGATGTATCTTACACTAAACCAAGTCTA
GATACATGCAAATCTAGACAAACCCAAGTCCCTTATTTTGGGACGGAGGG
AGTAATTTATTTATGTTAGGGCAGACCTGCTTATTTGGGAGCACTATGGG
GCTGGGGAAGAGTTGGAACTGGTTTATTTAGCCATTGACCAATCATTTTG
TGCTGATGCCAAATTTTAGAATGTCCCTTCGTACAGAAATAAATGAACTT
GTGCATATGATCATTAAGTGTTCCCGAACTTCACTTGAGAATCTGAGCAC
CTAATATTATTCCTTTTCCTTTTTTTCTGTACGAAATTTTGCTTCAAAAT
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GGCTTGCCGAAATTGTGAACTTTGAATTAGAGGAAATTACTGCAGTGCCA
CTGCAAACATATTAAATAGGGTTTATTGACCATTCTGATTAGAGTGAGCA
TGTTTGACCGTGGTCAGGTGACCATGGCCGGCTGAGCGAGAGATGGGGGC
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CACTGGAAACGATGTGCAGCAGCGGAGTGAGAACATGTGAATGGTGTGCG
TGGCATCCCGAATAAGTGTGTGTGTGTAGGGGGTGGGGAGCAACAGACTT
CGGGAAAAAGTTAGGAGCAGTCTGGACCTTCCTTCAAATATTTGCCCGTG
GAAGAAAAATCCCATAGCTTATGCTTTACCAGAACAATTCCGATGAATGG
GTTGGCAAAATGCCAGACGCACACATTAGCAGCAGTAGATATGCATTTTT
CTGAGAAAAAATGGGTGCATGTTGCTGTGAGAAGAAAAATGTGAAGGGAA
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TCTTACAGTGACGCTCATAAATTATATGGACGAAAGGAAAACAAGTATTT
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TCTGTGTGTTCCATGTACTTAAATATTTGGTGTACCTGCTGGAGCCATTT
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GCACAGCAACACCAGGGATCTTTCATTGGTAGGACTTGTCTCGAACTCCT
GACACAAATTCTAGCTGCTATTTGTCGTTCCGTCAAAATATTCGACCATT
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AAGTACTTGGAGCGTGCAGAGCTGAACAAATTCACATTTCAGAGTGACAT
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GTGGTCTAATTGTTGACTGCATTGTTCAGGTATGCCAATGCATATCTTTT
GACAAATCCATAAAATCTGATGATCTTGGGCTTTTATATCAAATGGTGCT
CTAAGTTTTTTTGTATGAATGTGTAGTTGATCAAGTCCAAAGTTGGTAGC
ATAAAATCAGGTTGGCGTTGTGTGTTTATGATATTCACTGCGGCAGCTGA
TGATGAGAACGAGCATATTGTTGAAAGTGCTTTTGAAAACGTCGAACAAG
GTAACTTAAACAATAATCTATATAGCTGGCATGATAATTGCTATTCCCCA
ACTTTGTTTTCACAATATTGGTTTTTTCTTGACCTATTTTTTAAACTAAA
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TTGCTTCATGGATTGTGTTAACTGCCTTATTGGTTTCGCCAACAACAAAT
GCACTCCTAGGATTAGTTTGAAGGCTATTGCTCTCCTACGTATATGTGAA
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ATCTGATCTGACCTTAGACTCCAGACCAGAAGTTAGGCATTGTGCTCTTG
AAGTGTTGTTTGATCTGCTGAATGAGAGAGGACATAAATTCTCCTCTCCT
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AGTTGTTACTTACTATTGGACCCATAGTACTTGATATTTATTCAGTTGTT
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CAATGTGATCTTTCAGGAAGTGTCATTTATGCTTCCACCTCTTCTGGGCT
TGCTGCTAGAGTGTGCCAAGAAAACAGACCAAACTGTTGTCTCAATTGCT
CTTGGAGCTTTAGTTCATCTCATAGAGGTTGGTGGCCATCAATTCAGTGA
TGGTGATTGGGAAACACTTCTAAAGAGTATTAGGTATTTCCTCAAATACT
ATTCCTACTAAAACATATTCTACCTTTTTGTCTTTCTTACATTAATGTTT
CTATAACCTTTTCAGGGATGCATCATACACAACACAACCCCTCGAACTCC
TCAATTCACTAGGATTTCAGAAGACAAACAATCAACAATTACTTTCAAGA
GAATCAGAGACCAACACTCTTGCAAGTAGTCACCATGATAGCAGGGAAGG
AGAAGCATCAGTAAGTAATAATGGCGAACAGGAAGATCGTCACGAAACAA
ATCCACAGACTGATCTGGAAAATTCGGAAGGTACAGTAGTCCACTTGTTG
TTTTGCACACCAAACAGTACTTTCATATGAATTGGAATAGTGAAATTTAG
ATAATATATTCTATTTATCTAGGTTTGCCATCACCATCAGGGAGAACACA
AGCTGCAGTGTCCCAACCTAGTCAAACCTTTGGACAAAGATTTATGGGTA
ATATGATGGATAATCTTTTGGTCAGAAGTCTTACATCTAAATCAAAGGGC
AAAATGGACGATGTTACTCCATCCTCACCTGTGAAGGTACATGTTCTTTC
CTCTTGATCATATTGATTGGGTGTCAGTAGTTACTATGATTTGGGCATTA
GCAGATTACATGTACTTCTGCACATAGGCCACTAGTCATCTGCTGCTTGC
TATATCTGCACATTAACCATACATTCTCACAATAAATACTAGATACAAAT
AAATCCAAATGTTCCTGCGCTTGGTTTAACTTGTGGACACCCTAGTTCAT
TGGGTGTGCGAACAATGCTAGATGGAGTTATATAAAAATATTGAATAATA
TACAATAACTTGATTCATTTAGTTGTTATTGGTATGTTACTGCCTTGTTG
CCATGCTAGGCATTTATATATTGTATGAACCGTCATCAGTATATAATCAG
ATAGAATATCAGGTTTGTTTTTGTGAAGTTTTCTGCTCTTGATATGCTGT
TTTAAATTGACGTTTGCTCGGCATCTGTGATTAGTTTTAACCTGCCATAA
GTCGTATCTGTTCTAGCTTAGCTGGCATCCGTGAAGCAGCTGTGCAGTAC
CGAGCGCAAAGCTACTCAAGTATATTAGGCTAGTAGTCGATATTATCGGT
GCACTTGGTTTGAAACAATTGAAGTACGAAGTGACAGTTTCTCCATGGTT
TGATATGTTCTATGTATTTAATGTGCTGGCTTGTTGATCTAGGCACCTGA
TGCTGATGGAGTTGACAAGACCGAAGAAGAAGAGAACCCTATGATGGAGA
CTGTTCGGAGTAAATGCATCACTCAGCTGCTGCTGCTTGGGGCTATTGAC
AGTATACAGGCAAGCATTTATGCTTCGTAGATGAATATTATATCTGAATC
ACTTACGTGGGTGCAGTCTGCTGATATATCAAATGGATGAACTTTGCAGA
AGAGGTATTGGAGCAAGCTACATGCCACTCAACAGATCGCAATTATGGAT
ATCTTGCTCTCGCTCCTAGAATTTGCTTCTTCATATAACTCACCTTCGAA
CCTTCGGACGAGGATGCACCATATACCACCAGAAAGGTAATGCTTGGATA
CTACATATAAATTAGCTCTCCAAATTAATATTTCTAACATCTGTAACTTG
ATTTTGTGTAGGCCACCACTAAATCTTCTTCGTCAGGAACTAGCTGGAAC
TACTATTTATTTAGAGATTCTACACAAGTCGACAGTGGACAATGATGCTA
ATAGATCAGCTGAGGAAACAAATGGATTCACTGTAGAATCTGATGAACAA
GAAAAGATAAAGAATTTAGCAGAAGGGAAGCTTGTATCTTTTTGTGGTCA
GGTTTTGAAAGAGGCGTCTGATCTCCAGCCAAGCACTGGGGAAACTGCTA
GTGCGGATATACACCGTGTACTTGACCTACGTGCACCTGTTATTATCAAG
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ATCCTTATGTGAAGAAATATTGTGCTCCCACATTTCATGTTTTTTTTACA
TTTCAGGTTTTGAATGGAATGTGTATCATGGATGCTCAGATATTCAAGAA
GCACATACGAGAGTTCTATCCATTAATTACCAAACTTATCTGCTGTGATC
AGGTATGTACGGTTTGTGGTGTTAAATATGTACAACAGTACTAGAAATTT
AACGTGTGTGCTTGTGTTTCAGATGGATGTTCGTGGGGCCCTTGGTGATC
TCTTCAGCAAACAACTTACCCCACTCATGCCTTGAATCCCTGTCAAACTG
TCAAATATCTTTCTCACTGGAGCATATGCTGCATGAGCATTTTTGTGCAG
ATAGTGCACCAAAACGAAGCTTCACGTCCTTGGGCACATGTCTGTTTCAG
TAGCTACTTCCTAGAAGGTGAATTGTATGTAAGCTGGAAATCTGTATATT
AGTGCACTACAAGTTTTTGCAGACAGTGTGAGTACAGATACCATGGAAAA
GTATCTTTGTTGTGGCACACCATTTTTCCAGGCGACTTGCTGTTATTTGT
CTGTGTCTGGATTGAGACCATGAATTCCATAAACAAGTAGAGATTTGAGA
AGATGGAACCTTGGCTATATGCTATATGTGTACATTGTTCAGCATATTGT
ACTTGCCTGTTGTTACATGGCAATACTAGATTACTCGAATGGTAGGCTTG
GGTTTGTGCATTTAATAAAATTGATGTCTGGTCATTGTTTGCCTATCTAA
TTCTGTGATTGTTATATAACTGTATTATTGCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.