Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE043334

[Submit comment/correction]

Sequence	AE043334
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE043334
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCCACCACCGTCCGCCGCCATCACCTCGCCGGCGACCCCCAGGTGAGG AAGAAAGCCACCCCAGCCGCACGACCGCCTGCCAACGGCCAAGATCGCCG CGGACCATGTTGACCGCTAACTAGTTAAACCGCGTCAGTGCTGACGTGTC CAGTCAGCGTTGACTGCGCAGTAATTCGGTTAAAGATTGAATTACTTCCA AAATTGAATAATAGACAGAAAAATGTATAATCTTGCTAAATTCATAACTG GAGTTCTGTAAGTCTAAATTTCGCAAATAATATATCTATGGATTCATAAA AATATGAAGAACATTAATATTCTGTTAGATCCAACATGTACTATATATAT TTACTGTACTAATTTAATTACTTTAATGGATTTATTGGAGTAAATAAATC ATCGTAAATTATTTAAAGATCCTAAAAATACAAATAAGGTATCTATGGAA TCCTTGTGTCATGTAGGACATTAATATATCCTTAGATATAATTTTTTCCT AAACAAATGTGTTTAAATGATTTAAACCCGTTTAACTAGTATTTAAATCA GAGGAAATTATCAAGAACTCCAAACCTAGTGAAACCAATTGCCACTATTT TGGTTTGACAATACCTATCCGTAGAAATTGTAAACAAAATTATTTGGTAC TGTTAAAACAGAAAGTTTTACAGAAAGCTTTAAATCAATTACAATAGTAA TTAAATCATAGAAAAAGATCTGTATATGGTTTTTAGGTGATTCGAATTGG TACTGTCTATAAATAGAATTACATATCCAGTAGTATTTATTTTAAAATTT AATATGACAGATACATCAGTACTTGAATAAAAGTGAGTTAAATATATTAA ATCAATATAGCTTTAATAATAAATTGATTTATTTCATTAAATGGTTTTCC ACATGCATCATATGATCTCATAATATTCAGAGAACTAAATACAATCATTT TTACATATTCAATCATCATGCATGCATTTGTTTCATCATTGTTTTATTGT ATTGTTGCATAGTTGCTTATTGCAATGTTTTAAATGGTGTATTTGTTGTG CTTTGTTCGAAGCGATAGATTGCGAGGAGTGTGACTATTGCGATTGTGAG AAGTGCAATGATTGCAATTGTGAGGATTGTTTGAACGACTACATCAACTA AAGGCAAGTGACACTATCATAAACGTCCTACTTATTTTCCTATGCATTGT AGTTGCTTTTAATAGAAGTGCATGTGTAGGAATATTTTTACTATATGCTA CGCTATGTCCTATTTAGGATTTTTTTTGTATCTTTCCTAGTGGAGACATC GTAGTTATAGTATGCTTAGCCCTGCTATAGATTCGGGGTGGAATATCATG TTATGAGTATTATGAGGTATTGGAAAAAAGGATATATTTTTATATAATAA AACAAGTACTCAATGAATCGCCTGGGTGGAATGTGGATACTCAGTTGTGA ATAAAGTGGCAACGAAGGGGACCGTATCTTAGGTTACCTCTCTCGTGTGT GCACTAGAAGAATACCACCTAGGATCATAGAGATTTGACATGTTTCTCGT ACAATGGCTTCCGTGTACAGCCACATGCTAATATGGGATCTGGCTTAGTT AATTACATAGCGGAAGACCCTTTGCATTGGTGCCTGTTAGACGTGCTAGC ATTGTGTATTGGGAGGACTTCTATGGAAAGACTTCGTCATATTCTCGAAT CTACCGGTATACCAATTGGTGTGTACTAATCCAGCGGCCACTGGTGGCGT CAAGACGAGATTGTGTCGTGTGGGCAAAGTGTACAACTTCTGCAGAAGAT ATAAATCTAATCGATTAGCCGTGTCCCCTATTATGGACATTATTAAGCAA CTAAGGCCTGAGCTTATGGATGATCTCGACATTCCAATTTCTTAATAAAA TTTGATGGTTTGAACAAGGGAATAGGAGCACTTGGTGTTGTCCAATGTGT TCAGACAATTTTCAAAAAGGATTAAAACTATTTGCAAATGTTAGGATAAA ACTGTTGCTTTATGCAAATCACCCTGAACTCCACTTAGCCAAATATGCAT GTACTTGATAGGCTCCATTTTATATCCACATACTAGTGACACTTGTCAAT ACATTCAAAGTATTGACCATTCGTGGCTGCAACCTTTCATGTTGCAGGTT ATATTGTTTCTGAGTGATCGTTATAGGTTGCGAGACTCCACTCAACAATT GTTCGTCTGTGGCACATTTGAAGGATGGGGATCTACCTTATATTTGTTTT CCGCTGTGTACTTGGATAATGTAACGTAAATTCTGGATCATATTTGTTAT ATTTATGATGCACGGTTATATTTGATATCATTTTGTACTGTGTGTGCTAG TGAACTGATCCAGGGATTAGCACTATACATAGGAACTCAGCCTTATCAGG CGAGGGTGTTACACAATGGTGAATGCTACAAGTGTGGAGGTAAAGGACAC AAGTCGGCCAAATGTGGAAACAAGAAAGTATTGTTCATCCACGACAATGG TGAAGAAGAGTACTTGAGTGAAGATGAATTTGATGCCCGAGTCAAGGAAG CAATGGCAAAGCAACGAGTGGAATTGATCAAGAACTCTTCATGTGTGAAC ATGATGCAAGTCCATCGCTTGTCGTCACAAGGATCTTGACCACTCAAGCA TAAGAGCATGAAGACCAATGCTCAAATATCTTCCAAACACGAGCCGACAT CAATGGCAAATCTATGAAGGTGATCATCGATGGTGGGAGTTGCCACAACC TTGCTAGCACCGAGTTGTGTGAGAAGCTCAACATCACGCTCCATCCGCAC AAGCACCCCTACCACGTGCAATGGCTAAGTGACCAAGGGTCCATGAAGAT CAAGCATACCGTATGAGTCTCCTTTGCCATTGGTCCTTACAAAGATACGG TGGAGTGTGATGTGGTTCCTATGACAGTTTGCCTCATGCTTCTTGGTCGA CCATGGCAATTTGACAAGGCTGCTCAACATGATGGTCGCACCAATGTATA CACCTTCAAATGGCTCAACAAAACATGTGTTTTGCAACCAATGACTCCTA GCCAAATAATTGCGGACAATGCAAAGGCTTTAGCGAGGGCGCAAAGCACA ACACCTACTTGTGAGAAGAGCGGTGAGAGAGAGAACCACCTCATAGTGAG TGAGAGATACAAGCCAAACTCGAGCGGAAAAACTAAGAGTGTTCTCCTTG CCACCAAAAGTGAGATGAGAGAAGTTCCTCCTTTGCAAGGGACTAGCGCA AGGAACTAATGAATTAACCAATGTTCCTCCATATTTGATGATTGTTTTGC AGGAATTCAAGGATGTGTTTCCCGAAGAGCTTCCACATGGATTACCCCCT CTTCGCGGCATCGAACATCGCATTGATCTCGTCCCCGACGCACCACTTCC CAACCACGCCGCCTACCGCACGAACCTGGAGGAGACTATAACACCCCAGA TTTCTATCTAACTGGAAGTGCTATCACTAATCTTAAATTTCTACAAAATA GATGATAATTCAAAATTTCGGCAACACCTACTTTGTCTTAAAGGACATCC ACGACATACAACAATTTAATATAAAGGATTTGTCCAATAACAACCATATA AATAGGCATCCACGTAGTTTATATAGGCATAATCAATCCGGAACACGAAT ACTAACGCTAGAGTGACCAAAGACTCACAAGAAGATGCCAATGACTCCAG AAGTTACGCTAAGTAATAATGGCAAAACTGAGAATTATGTGTGGTAGATG TTCTATGATATGTAGTATTGATATGTGTGCCAAAGTGGTGGCAAGCTAAT CCCTCCCAAGCATGTCGCTACGCTGAGTACCTGAAATCCAAACAAAAACC AAAGGAAACGCAAGGGTGAGTAAACTATACTCAGCAAGTACAAGTTCAGA ACCAAAACAACAACATACATGATCCAATACTCAATTCAAAGGATAACCAG AAAACAATGTTATGCATGTTATAATTTATGGTTAGAGCATTCCGGAATAT TCACTGTTAACTTCTTCACCGACCTCGCGGATTAGTTAATCAAGTGAATT GTCACCGACCTAGCTCAAGCTCACTGGAGTAGTTACATCATAACTTAAAT CGCTGTCCGCTCCGAACTAGTCTTGTGTAACTTATTCACCGCCCTGGCTT AAAATAAAATTCTCGACAACATCTCAAGGCAAAAACACCAAAGAACCAAC ATCATACCACCAACAATTTAAGATGGCAATCGTTAACACAAAGGGCTCAT CATGCACTTGCCTTAGGAAAGACGTTCAAGTTGAAGAACAACCCCCAGCA CCCGTAGCTCCAAATCCTGTAAGTAAAAATAGTTTTAGGGGTTGTTCCTG AAGGAAACAGTCTAAACTATAGTACGTAGTCATATTCCTACTGCTATCCT GGAGTTCCCCAACGTACCCAGATCGGGCACCTCCATAGCAACTACCCGTG GCTCGCTCAGCACCTCAACTCTAAAATTGATCAATTGATTTTCTAGCTAT CTTCAACTAACAAGCAAGCTTCGTGTAACAATCTATAAAGCAGCGGCAGG AGCATGTGTGCATCATAATCCTTCTATTAACTCGGGCACTTGTCGTTAGC AGCACAAGTGTGCACGCACTAGGAAACGTACGATCTAGCGAAAATTAATC TTGTAGTATCCCATGTAGCTTCCGCCGGTGTGGCCAATTGCAAGACGACT GAATTAGCAAGGATAAGAATACAAAATCAATCAGCACCGACCGATTGCTG CAGGAGGGAGGATCTACAAACCTGACAACACAGTAGAAACGGAGGTGGCC AAAAGGTTGAAGGCAACGCGGACGAGGACGCCTGCACTGGAGTTGCTACC TGCGGCAGACGTGGAAAGAACCCTAGGCCACGACGGTGGCGGCGGCGGCG TCCGCGAGTTGGGGAGCGTTTTGGTTCTGGGTGAGTCTAGGTCTGGTCCG AGAGTTTTTTTTTCTTTTTATTATTCCCTGTTTTTTTCTACTCGGAAACA TAGTCGGGGTCCACCGGAAAATATTAATAACCAAAAATTTAAGAAACTTC AATAATTTATTTGATCTCCGATTTGCATAAACTTATACTATTTTTTGATC GACGAGACAGACCCAACCACGGTGTTTGATTCTCCATCTGGCTTATGGTT CAAAAAATCAAATTTGGTCAACTACAAAGATAACACGGGATATTACATTC TCCACCCGTTTAACAGAATTCGCCCTTAAATTCATGCTGACTACTCAACC GAAGAGTAACTTAAGCTTAAAAAACATATTTACTCACCGGGTGTAAATAA CTTTGGATATTTCTCTCGCATCATTGACTCAAGTTTCCATGTTGCTTCAC TCTCCGTCTGATTTGTCCAAAGAACCTTGACAAACTTGATAGTGCGACTC CTCATTACTCTATAAGCCTCCTCCAAAAATTTTACCGGGCGAGCCTCGAA AGTTAAATCTTGCTCAACTGTGATCGGCTCTAGTGTCATTTGCCGTTCTG GGTCTCAAATGTACCTTCTCAACATCGAGACATAGAATACATTATGTACA ACTTTCATAGACTCAGGCAACTCCAGACGATACGCCAACTTCCCAACTCG TGCCACTATCTTGAAAGGTCCAATATATTGCGGGATTCTTTGATATTAAA TCTCACAACACCCTTAGTAGGTGATACTCTAAGAAGCACCTCGTCACCTA CTTGAAATTCCACATTTCGTCTCTTCGGATCAGCGTAACTCTTTTGCCTG CTCTGTGCTGCCTACATGTGCTCTCTAATCTCAGCAACCCTCTCGGTAGT CTGCTGAACCCAGTCTGGCCCCAATACAGATTTTTCACCCACGTCCGTCC AACAAAGCGGAGATCTGCACTTTCTTTAATATCCCGTATTTTCCTTGTAG TTGACCAAAATTTGAATTTTTGAAACATAAGCCGGATGGATAATCCAACG CCATGGTTGGGTTCGTCTCGTCGAGCTGATCGAAAAAGAGTATAAATTTA TGCAAATCGGATGTCAAGTGAATTATTGAAGATATTTTAAATTTGAGCTA TTGAATATTGTCGTTTGAGCTGGAATCCGTTTCCAACTGGAAGAAAAAAA AAGAAATAATAAAAATAAAACCTCCGGACTAGACTAGTCCTCTCCCTAAG ACCAAAACGTTCCCGACGCTGCCGCCGTCACTGTCGCCTAGGGATTCCTC CGATTTCCGCTGTGGATAGCTGATCTAGTGCGGGCATCGTGGTTGCCGCG GCCTGCATCGGTTTTGGCCTCATTGATCTGTGACTGCTTGCTGCCAGGTA CGTAGATCCCTTCGTAGGCAGCAACGTGTGTTGCTGGTTTGATTTCTAGT CTAGTCTGCACCAAATTAGTCGCTGGGTACGAGTTTTGCCACCGGCCACA TTAGATTGGAAGCTAGCTGAGCTAATCATTCGTTTTACATCTTTTTCCCG TTAGAAGACCAGTACTAGTAGGTGCAGCTATTAACTGTATGCTAGTGCGT GTTGGTTTTGTTGTAATTAACAACAATCATCGTAAGGCAAGGTTTAAATT AGAAATAATAGTGCTGCTCATGTATAATTGATACGAGGTAGCTGTTTTGG TTAGTTGATGGATGCTACGAAATTAGTTGGTTAATTTCAGTGTGAGGCTG TTAGCTACAGATAGTTACCACAACTAGGTTCGGTTATGTCTGCTTCTAGC TATAGGATCAAATCTGGACCAAGACTACACACTGTAATTTAGACCGTTTC CTTCGAGAACAGCCTCTAAAACTATTTTACCTACAGATTGATTTCTAGTT TTTCAGTCAGTATACGGTAGATATATTGAAGTCTGTTACGTCATTGCGTG GTTGGGACGAGTAGGGAGTTAATTATTTCAATTGCAGATTGAGTTGCCTG GCAGTTGGCATGGATGGATTAAATTATGTCTGCCTTGACATATTGATCAA GTCTATGCGCTGTATTTTAGGCTGTTTCTTTCAAGAACAGTTTCTAAAAT GGTTTCACCTACAAGATTTGGAGTTTCGGGTGCTGGGGGTTGTTCTTCGG CTTGAACGCCGTTCTAAGGCAAGTGCATGACAAGCCCATTGTGTTGATGG TTGCCATCTTAAATTGTTGGCTGTGTGATGTTGGTTTTTATTTGGGGTTC TTGCCTTGAGATATTGTCGAGAAGTTTATTTTAAGCCAGGGCGGTGAATA AGTTACAAATGACTATTCCAGAGCGGACGGTGATTTAAGTTATTATGTAA CTACTCCGGTGAGCTTGAGCTAGATCGGTGACAATTCACTTGATTAACTA ATCCGCGAGGTCGGTGAGGAAGTTAACAGTGAATATTCCGGAATGCTCTA ACCATAAATTATAACATGCATAACAGTGTTTTCTGGTTATCATTTGAATT GCGTATTGGATTCTGTATGTTGTTGTTTCGGTTCTGAACTTGTACTTGCT GAGTATATTTTACTCACTCTTGCGTTTTCTTTCGTTTTTATTTGGATTTC AGGTACTCAGCGTAGCGACATGCATGGGAGGGGGTAGCTTGCCACCACTT TGGGGCACATATCAATACTACATATCATAGAACATCTACCACACATAATT CTTAGTTTTGCCATTATTACTTATCGTAATTTGTGGAGTCGTTGACATGT TCTTGTGAGTCTTTGGTCACTCTAGCGTTAGTATTCATGTTCGGGATTGA TTATGCCCTATATGAACTGCGTGGATGCCTATTTATACGGTTGTTATTGG ACAAATCATTTATATTAAATTGTTGCCTGTCGTGGATGTCCTTTAAAACA AAGGAGGTGCTGCCGGAATTTTGAATTATCATCTATTTTGTAGAAATTTA AGATGATGGGTAGCACTTCCAGTTAGATAGAAATCTGGGGTGTTACAGTT GGTATCAGAGCCTAGGCTTTAGATCTCTGGTGTAGTAAGTTAGGATAAGA TTTGTAAACATCTAAAACTTGAGTTAGGACCAACCAAAAAAAATTGACAC ACTGGTGCACAGTAGGATGGGGTTTATGGGATATGCATCTTATTTGTGTT TCTGGTTATTCAATTTTGCTTGTTTATCTTACCCATTGGAGTAAGGATGG AAATTATTTGATGTTATTTGATTTTGTTTGCTCATTATTGATAATGTGTT GTATAGTTATGGTGCCGAATCGTAGAGGTCGGGCTCGTGGCCGTGCTGGC CGCAACGGTCCTGCAGAGGGGTCAAATGAGGAAGTGAGCCAATCTGGGAA TAGTGATGGACGTCATGCTGCGAACATGAAGCTCACCAAGTGGCTGGATA TGAAATTGGACAAGTTTCATGGATCAGGGACACCAATGGACGCTGCAAGT TGGCTTCGCACCATGGAGAAATACATGGATGCATCGGTGATGATGCCAGA GGACAGGGTTGTATATGTGGCTTTTCAGCTGAAGGGTCTCGCTGATGTTT GGTGGGATGGAGTACGTGCAGCTTGGACACCGGCTCATGGACCGCCTACA TGGGATGTTTTTGTTACACAATTCACTGCTAAGTACTACCCGGCTTCATT CAAGGAGAAGATGGATGTTGCCCTCAGGAATATCAAGCAAGGGAATAAGA CGGTGGATGAGTATGATGCCGAGTTTAGTAAGATGGTTCATTTTGTGGAC CATATTAATCAGAATGAGCCAGAGAAAGTAAGGAGGTTCTTCGAGGGACT TAATTCGCGATATCGACATGTGATGGGAGTGAATCGCCCATCCAACTATT TCGCTGTGGTTGAGCAGGCTAGGGGTTTGGAGTTACAATATGAACTCACG GAGGCAGAGAAAACTCGCACAAATGGTGCCAACAACAATGGTGGTGGGCA TAAGAGGAACTACCAGGATGGGAGTGGGTCTACTCAGCGATCTGACTTCA AGAAGTTCAAGCCAGAGCAGCGGACTCAGCAGTCATTCAAGCCTAGGCAG TCAGGGGCTCAGTCTTATTCAGGGTCACGCTCTGCATCACCTACATTCCT ACGACCTGTTCCAGGACAGGGTATGATTTGTTTCAAGTGCGGCGAGGGCC ACCGTGCTTCTGAGTGTGACTTTTCAGGGTCTTGTTGTCAGTGCGGTAGG AATGGGCACATGAGTAGGGTATGCAGGGAGAACCCAAATTCTGTCATCAA GTGGGAGGTGGCCACATCTTCTAAAGTAGGGCCTTCCGTAGATGGAGCCT CTCGTGGTTCAGCATCAGCAGCCAAATCTTCCCAGGGTTTAGTGCATATG ATGGCATCTTCTCAGCAGTTTCAGCCACACTATCAGGCGTATCCATCACC ACAATTTCTGCCTCAACAATTCTCACCTCCACCGCCAGGTTATTATTGGT CAGCTACTCCACTTCCGGCACCGCATGCCCCACTTCAGTTACCTGCACCA CCTACTGCTCCACTGCCACCACAACAGAATACTGGGATTTCTTCTTCAGC ACCTCCTGGGATCCATGCCATGCCTACTATTTCTTATTTGGGACGTCCAG ATGTCGTTACGGGTATACTTCCAGTTGATTCGCATGATGCTTTAATTCTC TTTGATTCTAGTGCTACCTATTCGTTTGTGTCACTTGACTTTGTCAAGAA AGTTGGCCTCTCTAGCCAAGAGATTTCTGAATCTGTTTGGGTTAGTTCAC CGGGAGGATTGATCACTAGTTCTGTAGTATGTCCGGGATGTGTGATTTCC ATAGACGATGAAGATTTTGTGGCAAATTTGATGGTAATTCCCTTACCGGC CTTTGATGTTATTCTTGGTATGGATTGGCTACATCGCTATCGTGCCGTTA TATCCTATTTCTGGAAGACCATCACTTTGGAGGCTCCCTTCGGAAAACAA TTAATCTTTCAGTGCAGTGCACCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.