Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE020488

[Submit comment/correction]

Sequence
AE020488
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE020488
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTTGCACCGCATATCAACCACGGGCGTTGACAAGCGCTAGAGTTCCTTG
TTGGACGCCTTCTCGAGGTTAGTTTGTTCAACATTTCTTTCCATCCCTTG
TTTTTGTTACTGATTGCTTTCACAAGCCGATGATTAAGTCCATGCAAGCA
TACTTGATCATCAGATGCGCCATATTTACTGTCTATTTTGCTTTTACCAT
TTCTGTATAAATTGCCATATCTCTGATGTATGGCTGAATGCATGCTAAAT
ATAATTCATGGCAATTTATCTCTATTTAGGCCATGTGTGGAACTAGAGAG
TTCTCTACATCCCAACATAAACTGATCTATTTTTCTGGCGAAACTTATTG
CTGCTAAATTCATAAATTCGGCACATGCTCTTAAGGCGAAATTAATTGCT
GCTAAATTCCTTTAATGTGTTTTCATGCATGGTAAATGTCAACAAGGAGA
AGAGCAACTATAAATTGATCATAATCTTATTCACCAGTATAATATAAACA
TATACCACCATGTGCAACAATCTGATTTTCTTTTACCAGAGAAAGCACAT
AAATGGACTATGCGTGTGAGCCAAGGGATCTGTCGTTCCATTTATTAGAA
GAAATAACAAATGGTTTCTCTGAATCACGGAAACTTGGCAGTGGTGCCTT
TGGAAAAGTTTACAAGGTATCGTTATCCAACCCAGCTAGATTATGGTGCC
ACATTATTTTTGAATTGTCATACAACACACGTCTATGGTCAAGTAGACAA
ATGATTATTCGGTTGCAGTCAAAATTTTATTTTTATATTTTTTGTAGGTT
CACATGCGGGAAATGGACTAATTTATTTAGTCATTACACGTTAAGTTCAC
TGTTTTAGTCACTGCACTTTTTGGTATAAAAAGAAATAACCATAAAAATG
GTGTGCGTGTGCGTGTGTAAATATATAACCCATTTACTGCTTTGTGTATG
CTCATTCCAATGGTGAACAGGGAGTGCATAAAGATGGGGAAAAAGTTGCT
GTAAAGGTGCTTTATGACATGCCACGACTTGAGGATAATGAGGAGCAATT
TCAAAAGGAGTTTAACAACCTTGTGAGCCTCCAGCACAAAAATATTGTGC
GATTAGTTGGCTATTGCAATGAAATTCAGAAAAAGTACATGGAGTACAAT
GGGAGACACATTTTTGCTGAAACAATGCGTAGAGCACTCTGTTTTGAATA
TATGGATAATGGAAGCCTTGACAAATATATCTTCGGTATGCTGGTGCTCT
TAACTTTAGTAGTTAGCACACTACCAAACCATTCTTCACATTTCATTTGG
AGAATGCCTTTTTGTCTCTACAGATGAATCTAGTGGACATGATTGGCCCA
CACGCTATGCCATAATTAAGGGGATATGCATGGGACTGAAATACCTTCAC
AAGGAATTGGAATTTCCTATTTACCATTTGGATTTAAAACCAGAAAATGT
TTTGCTAGATTACAATATGGTCCCCAAAATCGCTGATTTTGGCTTGTCTA
GGCTCTTCGGAGGAGAACAAACACAAGTCACAAATAGTTCTATAGGTACA
CGGTAAGTTTAATTATACATGTACAAGAAATTTCACTAAAATTTTCTTTA
AGCATCCTTTTTTTTTCTTTTGCTTTACATGAATGGTATAATTAACACAC
ATTGTGTCATGCAGTGGATACATACCACCGGAGTACATCGACGCTGCTAT
AATCTCAATTAAGTTTGACATATTCAGCTTGGGTGTTGTAATTATAAAGA
TAATGACAGGACCCGAGGGATACTTCCGAAGTGCTGAGATGACTTCCGAT
GAATTCACTGAGCGTGTAACAATAGATATCCTTTACCGAGGCTTATTAAT
TTGTAAACCAATAACATATGACAATATGTTCTTACTAATATATTGTTTTC
TTTAATGTTCTAATTTGTAGGTACTAAATAATTGGAGGAGGAGGCTATGC
AGAACGTCAATGTATGAGCTCGAATCAATACAAGTAAGAAGATGTATCAA
AATAGCTTTAAGCTGTGTGGATACCGATCGGTGCAAACGACCAAGCATAG
GGGTTATCGTAAACAGATTGAGTGAGACGGAGACTATGATTCATTATCCA
CATTTGTTAGGAAATGACCCTTGGTTAGCGATTCACCAGGTTCTATTCAT
TATCGTCATTTCCTTCTAGTTTTATGTGTCTTCTCTTTTATTTTTTGCAT
ACCACATATAAAAGAATATGAGCATATATTTGGTGCATCCTACCTAATAG
GCCAATGGACTTGAATAGTCGTGATTCTACTGGAAAGATGTGATCCCACA
GATTCTAAAGAACACCAAGAAATTTGTACAGGATTAGCAAACTTTTGTAT
GTTTTATTAGGAGTTCATCTATTTGAAACAAGTAGACATTAATACATGAA
GTGTTAATTGTACATTGTAAATGTCTCATTTTATCGAAACTTTGTCGTAT
CCTATGGGAAAGAAAATCTGTCAGAAAATAATGTTACACTGCTGAAACAT
TTCAACATCATTCAGATACAATAAGTTAGGACATATTCTCAACAAAATGA
GAAAACACTGATTGAAGATTCATAATAGTGGGAAGAATGACCAACTGGTT
CGACCTTAAACACCATAATATCGTCATAATGGAAAAATAATGCTAACAAT
TAGAGATGAAAGGGAAATCGTAAAATGAATGTACAGTATGGGGTCTAGAA
TTTGTCTCTAAGCATAGTGTTATATTTTCAGAGCATCGTTTTTGTCAACT
AAGTGGGTGTATTCGTCTTGAATGTAGACGATCCCTGGCATGTCCACTAG
GAGAGAGTTTCTGAATGCATCTGAAAATATGGTATGTGAGTTGCTAGATG
TCCATCCCAGCCAGCTCCAGTTCCTCTTCGGGCCAAACAAGTTGATCTCA
TGCCCACTGCGCCTAACAAACAAGACAGATGATCACCACGTTGCCTTTAG
GTGTCTACCAAAAACTCCGGAGAGTTACATGGATGGACTATCGCGACTTC
ATGGAATTTTACCACCAAGGTCCACGTGCACCTACGTTGTAACCATGGAA
AAGCAACAGCAACTGCCGACAAACATGGATGCGTTTTCCATTATCCTAGA
GACATGTGTAGCACATGCAGACACAAAAAACGTGGACGACTACATTTCTA
GGCGAGGCCAGGTGCATGAGGTAACACTGACGGCCCTTTGTGAACCAGAT
GGCAAGGGGATGACCTCTGAGGTTAGTTAATAAAGTTCTTTTGGAGAAAC
TAGTTAATTACCTGACTATATATATCTCATACATCAGGCATGATTTTGTG
TGATATTTTTCCTTTTTTGTTGTTGTTTGATGCGTGTTTATTACCTGGCA
GTCAGTCCAACCACGAATCAAGGTGAAAGTTAAACCACTCTTTCATAATT
ACATATTTATTAATTAACCTTTTGTGCTTAAGGACTTTCCAATCATGTTT
GTTCAGATCATATACTGCAGGGAGAGTTTTAGAGAAATATTAGCAATGGA
TGTGCATCCGACGGAGTCTTGGTGAGAAACCTGTACAAATAAGTAACTGT
AGTTGTACCTATTTCCAAATATATTTTTTATCTTGTACACTATACACCTA
TTTTGATTCTGACGGTACTCTTCTTGACCTAAACAGGATTAACGTAAGAA
ACCTGTACAAATAAAAAACTGTAGTTGCAAATGTCAAGATAACTTTTTTT
CTTTTTTAATGTATTTCAGTAGCACATAGTGAAAAGAAGTATATAAAAGA
GTAAAAGATGTGTTTTACCGAGACCCACGACAACAATTTTGTTAAGAATT
GAGAGATGGCATAAAAAATGGGGCTGACTTAGCTCTTTGAAGTCGGCCAA
CCGGTGCCCAATTTTCTTAGACAGTGACACACTTCTTTTGAGATGGTTAT
TCATTGATCATCAACCTTTTGTGCAAACATGTTACCTCACATAAAAATAA
TGGTACCAAATGAATCAAGTAATGTCACTTTGAAGTTAATAAAATTGTCA
TTTATTTGAAGCAATACACTGTCTAATAAATTGATGCTTGATGTGTCACT
TTGAACATTGCAGCTATCTTAAAGGTATATTTTTAAGAAGTGATCAAAAA
TTCTCATGATTCATTTCTGGCTTCCCGTTCTATATTCCTTGTAGCTATCA
TCTTCTTAATTGTGGTTACATGTAGACTACCAAAAATGGTTAGTGTTGGT
CAATATATTCTACACATCTAATGTTAGGAGCAAATGACAACACCAATAAG
CATGTGGATTTTATACATGCAAGGTTATGTGCTTGAGTTTAGGATTTTCC
AAGTTATGCATCTTAAAAATTTCTCAAAAAAGAATCATAGTTGTATATCA
GTATTATTTCTTGTCAACGGTATCTGTCTTTTTTCTTGGCAATATATTTA
TAGGGTAATATGAGGCATCGATGTATACATTGCCAAGCCAAAGTATGGAA
ATGTTCTATTCATTTGGTTTTTGCCACACTTTATTAACTATAGGGTAAAT
TTGATGCCAATTTTTTGCCACATTTTGTGGCTTCCATTTTATGGGCCACA
CTTTTGTGGTTGCCACAATTGCCAAATGTAGGTTTGGAAAAGTGTGGTCG
GGAATCAAACAGGCTCATTTTCTCCCCCCCGAATTGGCATTGTGCCACTT
TGGCATCACTTCTTATGTTTTCTTCTTTGAAGGTTTGGAAAGAGCGGAAT
GCTAGATTTTTTTGGAACCAATTGGCTATGTCCATCATGCTTCTCAATAA
GATTAAGGACACAAGGTCACTATGTGGTGTTTGCTGGTTCCTAGGCTTTG
AGTATTGTGATGCCCCGAGAGTAGCTCTTATTGTTGAGGATTGGTCTTTT
GTATTCACCCCTCTTTGAAAACCATTCTAAACATACTAAGTTTTTGAGAA
AATGCAATGGACCTTTGCGTTTCATTACGTTGAACAGATAGAGTTTTGAT
TACTTCTTCCTAAGAGGAAGATAAAAAGATCCAACATAACTAGATTTAGA
CAAAAAGACCGCGATCCACTAGTGCTCGTCGGCCTTGAGTGCGACAGCTC
TAGGCACAGGTCGGCGTCGTCGGTCCGATCTGCTCGCCTCTAGTTTTTCA
GCTACGCGGGATTAGCGCTCGATGCGGGAGGGGGAGGGGACCGCGTAGTG
GTAGAGGAGGAGAAGCGGAGGCGGACAGAGGGAGAGTGGAGGTTCATGGG
GTCTAGATGAGACTGCAGATTGGAGAAGAAAGTTCTTACAAGTGGGTTCA
TGTGTCAGTGAGGATAGACTATAATCCCAGTCGGGATTCTAACTTTCCCG
GTGCGCCAAACATGTTCAAGGTTCATGTCTTTGCCGAGCATGTGCGTGTG
GCACTGGGGCCGTAGGTTCCCGGTGGGGTGGTAGATCCGTGGTGGGCTCC
TGATGGGTTGTTGGAGATGAATTGCCCATCTCTGTCTCCTTGCTACAAGA
TTTGGCAGGAGAAGGTGTCTGCGGTGGTGGCCTTGTTGTCTCTGGCTGCG
CATAAGGCTCCAAATCTTCCTATGGTGCCGATCGTGCAAAAGCACACTAC
TACAAAATAGCCTACCAGTGTCAGGCTCAAAAGGCCCATTAGTGACAGGC
AAGACGCCTGTCATTAATAACATGTCACTAGTAACAGGCTACCAGCGACA
GGCAAGCGCCAGTCACTAGTATTTGTTTACTAGTGACAGTCGTTTATTCA
TGCTTGTCACTACTTAGTTTTCACAGGTCATGCTTTTGTGTCTTAGCAGC
GACAGATTCGGTAGTTCGCCTGTCACTAGTAAATTATTAGAAATAAAAAT
ATATTTTAGGAATAATAAAATATTACATTTGCACATCGATAACACAATAT
GATTAGACACGCATAGAATTAACATGATAGCACAATATCCATCGATACAT
ACGATTCATCCATAATTGCATACATTCCACATAACCGAAAAAATTATTCA
CTCTTCAATATCTATTGTACATTTATTTCATATAACCTTCGTAACAAATA
CTTTCAAGTCTCTACTGATAACTGAACCAAAATAACTAGATAAGGTACCA
ATACACAGCAGATGGCCACCGATGAATGGAAGTCAAACCAAATTAATTAG
CTGATTGCAAGAAACCACATCCTTTCTCTCTGTACTTGATGTATTTTTTT
ACCAAAGTGCAAAATATGTATTTCCATCGTGTTTGGCTGGTCACCACATG
CTTGCATCTCTGTACCAAACACCAACTCACCAATCCTCAAATAGTTGGCA
ACACAATATTCTAAGTTGCGTGATCCTGCCTCAGTTCATCATAAATTGCA
AAGGCATGTCAATAAAGGAGTCTTATTCCTCTCACTAAGAGGCATATAGA
AAGAAAAAATTGGAACTGAATGTTACATGTAATAACTTGATAACATACCT
ATATACACAAATAGGCAATGTGACAAATATATACACAAATAGGCAATGTG
ACAAAACAATCCTGATCAGTTTCATCGAAGTACTAATGAGAGACCACCTA
ACGGTTTACCACATAACATGATAATAACCTCCTCAAGAAAATTACCTAGC
CATTTGGCCTATGCAAGCATATATATGAATAGATATCCAAAAAACAGATA
TAATACAATGATTCGTGTTTGCTTCAACATTATATAGTTTTGTATAAACA
AATAGTCTTCAAATGTAAAAAAACAATGGCATTAGCTTTTTCAATGGTGC
GTTATCAACGATAGAGAAAGATTTTATTGCCATAAGACTAAAGAACTCAA
CAAACATGAGCAGAGTTACTAACATGCTGTATCTGGACAAACACACATGT
TTCTTTGAGCTTAATTGTTCCAGATTATCCGAGTGTCGAGTTTCTGAACT
TCCTTCCCCAAATAAAATGACAATCGGGTAACAGCTTTAGTAGTCCATTC
TTTTAGAAGATACAAAAGAAGAACACGCCAAAATAGCAAACACTTCGTCT
CCAAATTAATCTCCTTCAAGCACCAATAGCTATAAAAATAAATGAGAAAG
TTATGTCAAAAGCTTATATAGATTAAACACATTCACGATGGAAGTGAAGA
GATTGAGAGGTGCCAAGTTTTACAGCTCGAGAGCACATCCAAGAACACAT
ACTTCGTAGGGAACAATTCACTTGTGTCATATAATTCAGGACACTTCACG
TCATCTGAAAAAAAGAAATGGAAAAGTATAGCAGCAAAAAGATAAATATA
TATTGTAGGGAACAATTCACTTGTATTATATGATTCGCCACACTTTACAG
CCTAGTGTTTACCGATTGTGTTTGCACCAAAAGGATCTGGCCAATCCATC
CATTAACGAGGGGAGCTACTTCTCTTGGATTTTCTGGATCAAAACATTAG
ACATATCTGAGTGAGCCCCTACAGTTTTGATGGTAAGAAAAGGCGGATCT
GACTGGGAAAAAGATTGTGCTGCTGAAACTTTACCTAAAATTAGCGAATT
TTTTATTGAAAGATTGGTGTCCGGCCGTCCACGATGGTGCAAACTTTTGG
CCGTCATGGCCCAGAGACGCACAATCTGCATGCAGATTGGCCACGGATGG
CGGGGCGAATCTAATCCTTCTGTCTGCATGATACGGATTCAACAGGAGCT
AGCTGATCTGGAGGATGATGTCCTGTTCGAACTCATCTCCATCAGATCGG
AAACGTTTTATCTTCTTCTAAAAAAAGGCAAGCGGGGAGAGATAGGTAAG
AGAAGAGTCACAATCTAAAAAAAATAGTAAGATCCATCGTCAAATCCCAG
GGCTCAACCCTGGACAGGCGGTGGAAACTACCGAGTCATGCCTTGCGTTG
GCAAGAAGTACTCCTAACAAATCACGTTAACAATTTAGACCGCAATACAT
CTAATCAACTAACCTAACAGCGAAATCAATATATCGTGCTTACCTTCACG
GACATCCTGAAGTGGGATGGGGGCGGGATGGTCACAGTAGCGTCGATGCA
ATAATTGTACCTCTAGTGGCGGAGGTCGTGAAGCAGCAACGAAGGGCTAG
GGACGCGGCAGCAGGACGGTCACCATGGGCAGTAGAGGCGGAGACTGCGG
CATCGGACGGTGGAGTAGGGGCTCATGCAGGAACAAGAAGAGGTTAAGGG
GACTTTTATGGATGCGGCAGCAGTCATGCTCACCATGGAAGAGGGGAAGA
CCCGGGTGGGTGGCCGAGCGATGAAGGGGTGGTCTTGGCTACCATTGCTC
CGCGGGAGGAGAAGGACGAGTGCGGCGGCAGCGGTGCGGGAGGCAGAGTG
CGGCGCCGCCATGTGCAGGGAGAAGCGCTAAGTATGGAGAACTTTGGATC
TAGGGATTCAGTGGTGGAGTGATAAATTTGGACACATCACGCGGCTAATT
CTCCAAATATTTTTCTCCACGCGCGCTAAATCGGGGACAACCGCGCCAAA
CGTGGCATCTATAATTTTGGCTAGAAAAAACTCTCCGTTATCTCGAAGAT
ACCCATCACCATTTTTTCCTTTTCAGCTGGCATCTGTTAGAAGTGACGGG
CACATTTTAAGGCAATCGCTAATCATAGGTTTACTAGCGACGTGCATTTA
TAAATGCCTGTCACTACATAATTTTTTCATTCATCCGCTTTCCATACAAA
GTACTAGTGGCAGTTCCTTTTATCTGCCTGTCACTAGTGTTCTGTACTAG
TGACAGGCTTATTTTAGCCCGTCGCTGGAGATACTTACTAGTGACAGGCA
CGGTGTTGTCTGTCACTAACCACCTAGAGGCTATAAGTATTTCTGCAGTA
GCGGCACCACTCTGCCCGACAGCAAACCGCCTTTTGGGACTGATTCCTCA
AGCTGAGAGTCTAGGACCACGCTGACTAAAGATAAAAAATCTTCCCAATC
CGGGTGAGGACCGATGTCCGCGTCAGGATGGACCGCAACGTCTATGTTGT
CACACCCACTAGTGGCATGGAGTATGAAATCGACGAAGACTCAGTCGAGT
GTCCGTTTCCGCGCGATCCACCTCCTGCCCGAAATATTTGGCCTTGTTTA
CAGAACATTTATCATGTAATCACATGAGCACCAATAGAATTTCGTAGAAA
AATATGACCAAATATACCCTGCACAAGAAGGATTGTTGTTCAATTTATTT
TTGAATAGGGTAAACAGTGACCACTTGTTGTTTTGGTACACGCCTAAGTA
CCCTCTTGTGTCATACAGGATTTTGACAGGTCATGTTAATGGGTATATGT
GTATTTGGGACTACCAGACCCAGGTAGGTAACTAGCTATATGCCACCTAT
GGAATCTAAAGGTAATTCTATTATCATTGGGAACGCATGAATGCCCTTAC
AAAACATGTATCCATGCATCTATCTTGGCAGGCACGAGTGATAGCACTGA
GAATCACAAAGGAGTTAGGGCTGCAACAGACTGATGAACATTGGATTCTT
TCGGCTAGATTCATCGCCCGAAAGCAATGGCTTGTGGCAGGTGGTGGCAA
CGGATACATGCACGTACTTTCATGTCCGTCAATGGACGAGCTGATCGTAT
TCAGAGCTCACAGTAGTTGGGTCGAATCACTAGCGGTTCACCCAAGTCAA
CCACTTCTGCTCTCAGCATCTCAGGACAGCCTAATCAAGCTTTGGAACTG
GGAGAGTGGTTGGGAATGCGTTCGGATATTTCGAGCACACACAAGCAATG
TGCAGCAGGTCATGTTTAACCCGCGGGAAAGCAACACCTTTGCCAGTGTT
TCAAAGGATGGCACAACAAAGGTTAATTCCTTCTTTTTCCTATGCAATAA
AAACTATGAGGTCAGTTGCAGTTTTGTCAAACTATTTGCACTGAGGTGTC
TAACGGTTACATCCCATTAGTTTGCCAAAACATACTAGTACTACATGATG
AAACAGAGGGAGTAGTTATCTAACCAAATATGTTTTTAACACCCTTATGT
TTGACATTCATAGATATGGGACATTTCTTCTTCCAACCCTATGGCCATGT
TGAACTGCAATACGGGTCAACAGATCTGCGTTGATTTTTTCTCACCCGGT
GGTGGTCGAGAGTATCTGGTTACAGGATCAATAACTGGGATTGCATGTGT
ATGAAATTATTATTATTGATTTTACTATTCGACTATAATATTATTTTATA
TTGACTAGTATTATATATATTTCTGTAACTGTATTTGCTACTCCATCATT
TTATTTTATCAGATCTGGGATTTGCACACAAAGAGATGTATTCAGCAACT
CAGTGGGCTCCAAAAAAATGGAGGCTGCATTATTGCCATGGTGAACTGCC
ACCGGGACCATCCGAGAATGATTACAGCTTCAGAAGACCTGGTTGTGTCT
TTTCGCGAGACCACTAACTATAGGTAAAGCTTTTGAGTTTACACAGATGA
TATTGATAGTCTGTCAAATAATCATTCACTTGTGAAACGTCGTTAAATAC
CTCCCAAAGACTGCTTTACACCTTGTTGTGCCTATTAACTCTATCCTAGC
CAGAACAATCACATCATGGGTCGGGCACCTATCAATTATAAGTTGTAACA
CATGAGCCACGTCAAGCTCATAATGCCACTACTAATCATAAAAAGGGGTT
AAACTGAAAGCATTATCAATAATTTTGGCAGCATCACCTATTTATATATT
GTGCAATGTCACAATAGAGGAAAATGTAGATGCATGCAGTCAATTTGTTA
AGGACAACGCAGGCTGCATCCGATCAATCTTTCTTTTGTATCCGTCCATC
CGCAAATACAAAGCGCAAGTGATGTTTGAGATTTAACATTGACCAGTTAT
GTGTACAAAATACGAGGATTATTTTAAACAAAATTGGTACCATTTGAGAG
TTCTTTACAATTTGAATCTAGTGATATCATTCTTCTTTTTATTAATCGGA
GTACCGTTGAACAACTTCTTGGTCGAGGACAAATCCTAGAAAAGCACATG
TTGTAGTATTGCTTGATCCATGAAGTAATTGCTTTGTTCTTGAGTTTGTA
TATGCCAAAGGATATAACATTTCTAGTATAAAATTAGCCTTCAAATTTTT
TTAGGTGTGAGAACATGCTTGACTTCAAGCTCGATGTGGTTCGTGGTGGT
TATGCATACATTAAGGAGACAAGAAGGTAAAAACAAAATGTTCATGCTAC
TTTCTACTTATGTCCCATAATACATTTTATGTTCTATTTTTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.