Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE012300

[Submit comment/correction]

Sequence
AE012300
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE012300
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAGCACCGCGGCAGCCTCCTTCCCTGTTTTGGGCTCACCCAAGCTCGC
ACCGTCCTCCTTCCCCTCCTGCTGCAAGCCCCGGGCTCGCCTCCTCTCTC
ATGGCATCATCGTCGCTGCAACAAATTGCCGACGGCCGGAGTACATCCCG
AACCTTATCGACGATCCAAACTACATCCGCATCTTCGACACCACACTCCG
CGACGGCGAGCAGTCCCCGGGGGCCAGCATGAGCAGCGCCGAGAAGCTGG
CCGTGGCGCGCCAGCTCGCGCTCCTCGGCGTCGACGTCATCGACGCTGGC
TTCCCGGCCTCCTCGCGCGACGACTTCCAGGCCGTGCGCTCCATCGCCAT
CGAGGTTGGGAACACGCCCGTCGGCGTGGGCGGCCACATCCCCGTGATCG
GCTGCCTCTCCCGGTGCAACAAAAGCGACATCGACGCTGCGTGGGACGCC
GTCAGGCACGCCCGGCGACCCCGCATCAACACCTTCATCGCAACGAGCGA
GATCCACATGCGGCACAAGCTGCGGAAGACGCCGGAGCAGGTGGTGGCCA
TCGCCATGGAAATGGTGGCCTACGCGCGCGGTCTGGGATGCCCCGATATA
GAGTTCTGCCCCGAAGACTCGGGCAGGTACGTATATATATGCGCGCGTTC
GGAAATTATATCTAGGAAACGTCCGCGCGCTCATGTGACCTCGCGATCGA
CGACGTGATAGCCTATGGATCGCAATTTTCTAATTTCTTACGAAAAACAA
CACCAAGTGGATTAATTGGGGTGGTGTCCACCAGCAGGATTTTCCCTTGC
AATTTCTGTGAGAGTCGCGCCGCCGCACTCTGGAGCAAACGTGCCTACTG
ATGTCTTCACAGGAGAGCATCTGGTCTCGCAGACAGGCAGAGCCGTCCTC
CTTCCTCTCCTCCCCATTGCTACCAAATAGTAGTAGGTCCAATATTGTAG
GAGAGCTCCCAAAATAATCACCTCACCTACGTGGTAAAATCTCAAATCAA
TCGTTGCGCGTGTGGTTTTCATCGACGAGGGCTAATCAAAATTTAAGAGC
AACTCTAGCAGATCCCGCATATCCAACCCCGCAAACACACGGCTGCTTAT
TACCATTCGGGGATGCGGGATCTGCCTGTCCACAGCCTTCCGCCCACACC
GTAAACAACAGGGTTTTCATCAATTTAACATATGAATCTGATGATCAGCT
CGTTGCAGAGCACTACAGGAATAGATAGCTATGCCGAGGGTCGGGAGCTA
CGCCGACGGCCAAACGTCGGCGCCGTCGGCGTAGGTCACGATCTGGGCGC
CCCAGGAAGCTGGCCGTCGGCGTAGAATTTCCCTCGCCATAGGAGAGCTA
CGCCGACGGCTGTCCTCGGCATAGCTATTTTCCCTTTTACCTCATTAATC
TTTAAAAAATCATTACTAAATCATTCTAATTTAGAAAAAACAAATAATAT
ATCGAAATTTGCAGGAAAATAAGATCTATCTATCTACACTCAAATATTAC
ACATTTGTAAATAAAAATTAAGTAAAACATAAAACATTACATATAGTTTA
AAACAGGCATAAAAATTAAAAAACGATCCAAACAATGCAAAACATTCGCG
TGGGGTCATATTATGTGATATAGTTGTAAGGAAAAAATGTCAAACTTGGT
ATATTGATTGGGACCTTATAGCACATGCTAGCCCCCCGGTATACCCGCAG
CGGAACTATTACCCATACACGTCCAGAAATCTACTAAGTGTTATCGCACG
CGGGTCTACCCCTGTAGCTTTCTTTGTACGAGATTCAAACAACGCGCTTT
TTTGTTGGTTTAGCTTTGTTTAGGTCATATCTACATAGAAAACAAAGGTT
GGGACCTTATAGCACATGCTAGCCCCCCGGTATACCCGCAGCGGGACTCT
TACACCTACACGTCCAGGAATCTACTAAGTTTTATCGCACGCATGTGAAG
AAGGTCAGACCGAGGATCTAGATATTGCATCCATGGACCTTCCACCACAT
TTGGACACATATACTAGGTCCACGTGCAAGTTCCAGTGGGACTCCGGAGC
TCCGGCGGCCCTTTTCCAGTGAAACCCTATGCGGTGGGGCCCGCGGGTCT
ACCCCTGTAGCTTTCTTTGTACGAGGTTCAGACAACGCGCTTTTTTGTTG
GTTTAGCTTTGTTTAGGTCATATCTATATGTAAAACAAAGGTTGGGACCT
TATAGCACATGCTAGCCCCCCGTGCAGCAGGACTCTTACCCCTACACGTC
CAGAAATCTACTAAGTGTATCGCACGCATGTGAAGAAGGTCAGACCGGGA
TCTAGACATTGCATCCATGGACCTTCCACCACACTTGGACACATATACTA
GGTCCACGTGCAAGTTCCAGTGGGATTCCGGAGCATCGACGGTCCTTTTC
CAGCGAAACCCTAGGCGGTGGGGCCCGCCGGTCTACCCCTTTAGCTTTCT
TTGTACGAGGTTCATACAACGCGCTTTTTTGTTGGTTTAGCTTTGTTTAG
ATCATATCTACATGGAAAACAAAGGTTGGGACCTTATAGCACATGCTAGC
TCCCCGGTATACCCGCAGCGGTACTTTTACCCCTACACGTCCAGGAATCT
ACTAAGTGTTATCGCACGCATATGAAGAAGGTCAGACCGGGGATCTAGAA
ATTGCATCCATGGATCTTCCACCACACTTGGACACATATACTAGGTCCAC
GTGCAAGTTCCAGTGGGATTCCGGAGCTCCGGCGGTCCTTTTTCAGCGAA
ACCCTAGGCGATGGGGCCCGCGGGTCTACCCTTGTAGCTTTCTTTGTACG
AGGTTCAGACAACGCGCTTTTTTGTTGGTTTAGATTTGTTTAGGTCATAT
CTACATGGAAAACAAAGGTTGGGACCTTATAGCACATGCTAGCTCCCCGG
TATACCCGCATCAGTACTTTTACCCCTACACGTCCAGGAATCTACTAAGT
ATTATCGCACGCATGTGAAGAAGGTCAAACCGGGGATCTAGACATTGCAT
CCGTGGATCTTCCACCACACTTGGACACATAGACTAGGTCCACGTGCAAG
TTCCAGTGGGATTCCGGAGCTCCGGCGGTCCTTTTCCAGCGAAACCCTAG
GCGATGGGGCTCGCGGGTCTACCCTTGTAGCTTTCTTTGTACGAGGTTCA
GACAACACGCTTTTTTGTTGGTTTAGCTTTGTTTAGGTCATATCTACATG
GAAAACAAAGGTTGTGACCTTATAGCACATGCTAGCCCCCCGGTATACCC
GCAGCCATGTGACCTCGCGACCGACGATGTGATCGCCTATGTATCGCAAT
TTTCTAATTTCTTACGAAAAACAACACCAAGTAGATTAATTGGGGTGTCC
ACCAGCAGGATTTTCCCTCGCAATTTCTGTGAGAGTCGCGCCGCCGCACT
CTGGAGCGAACGTGCCTACTGATGTCTTCACAGGAGAGCATATGGTCTCG
CGGACAGGCAGAGCCGTCCTCCTTCCTCTCCTCCCATTGCTACCAAATAG
TAGTAGGTCCAATATTGCAGGAGAGCTCCCAAAATAATCTCCTCACCTAC
GTGGTGAAATCTCAAATCAATCGTTGCGCGTGTGGTTTTCATCGACGAGG
GCTAATCAAAGTTTAAGAGCAACTCTAGCAGATCCCACATATCCGCCCCC
ACAAACACGCGACTGCTTAGATGCGGGATCTTCCCGGCCGCAGCCTGCCG
CCCACACCGTAAACTACAGGGTTTTCATCAATTTAACATATGAATCTGAT
GATCAACTCGTTGCCGATAAGGCGGTTGCGCGGGATGCAAAGACGGCCAA
GTTTGGAGCCTCGCCGCTTCTTCCTCAATGGCTCCTGCAGCTTCTTTGCG
GCGAGGAGCAACACGAACTGCTCCATGTCGTCGTCTAGCAGGTCGTCAAT
GTCGGAATCATCCGGCGAATCGAAATCATAGAGTGTGCTATTACTCGAGC
TCATCTACGTACACAAAGAGATACTACGAATAAGCACCAACCTCCGCGTC
TTATTCTAGAAGAAATCGACAGGGAAATACCTTGCCCGACGACGAGGAGA
AGCGGAGGCGCCGCGGACTGGTTCCGGCCGGGTGGTGGCCCTAATTGTCC
GGGCGGGCGGCGAGAAACACCGTCGGTGGCTAGATCTATAGTCTCGGCGG
GGAAAGAACGTGGATTTGGGCCGGAATCGAAGGCGGCATTGGTAGCAGGC
GGATGAGGAAGAGGGAATGGGAAGGCGCACGCTGAAACTTCCCTCCCGCC
AACGCCTTCCGCGGGATGAAGGGCACGCTCGGTTCGGTGGCCAAACCAGC
TTCTCTGCGGGTTTGCCTCACGCGAATGCGGACACTTGCAAAAATATTTG
CAGGGCGCGCGGATGCGGAGTCTGCTTGTTGATGTCTACGCACTTCTATT
GCTGTAGACAGTTGTTGGGCCTCCAAGTGCAGAGGTTTGTAAAACAGCAG
CAAGTTTTCCCTTAAGTGGATCATCCAAGGTTTATCGAACTCAGGGAGGA
AGTGGTCAAAGGTATTCCCTCTCAAGCAACCCTACAATCAAGATACAAGA
AGTCTCTTGTGTACCCAACACACCCAATACACTTGTCAGGTGTATAGCTG
CACTAGTTCGGCGAAGAGATAGTGAAATACAAGTGGTATAGATAATTATA
AGCGGTAACGGTGATAAAAAATAACTTGATGGCGTGTGGTTGACGTGGGA
AAAGACTAAAGGCAAACTGAAATAAAGATGGAAACAAGCAAACATGTAAC
AGATCTAATTGCAAACGGTGTATCAACGCTTAGAAACAAGACCTAGGGAT
CATACTTTCACTAGTGAACACTCTCATATAAATATATTCTTCTTTATGAT
ACTACGCTGAACTACTCTCCGGTTGGACACTTTAATCGTTGGTAGGGCTA
TAACAGCACACCTCAAAGTTCGCTTTCCGCATCTAGATAACCCCACACTG
TCACCTTGAGCACTAGATGGTTCCAACAAACACCACAATTTCATAAAGAC
ATCCAACTCCAAATATAACTCATAATAAGTATTTGTAATCTCAAGCCTAA
GTGCCACCATGGTGTGCACGCTGTCACTTTCACACACATGGGGAGAGCAG
AGATCTAATAAAGCACTTGAGTAGCAAGGTAGATCTACTTGATTACAAAG
ATCATGATCACAATATGATCATGCATAGAGAGAGAGAGAGACGAACACAT
AGCTACCGGTAGAACCCTTAGCCTCGACAGAGAACTACTCCCTCCTCATC
ATGGGAATCAACAACGGTGATGTAGATGGCGGTGGAGATCGATGGAGATG
GGTCCGGGGGCACTTCCCCGTCCCGGCAGGGTGCCGGAACAGAGACTTTC
TGTCCCCCGAATCTCCCCTTCGGTGGTGGCGGTGCTGCGAAACTTTTTGT
GGATTTCTGATTGACGATTTAGGGTTTTTGCATCAGGAGGCTTCTTATAG
GCGAAGAGGCAAGGTCAGTGGGCGGCCAGGGGGCCCACACCACCTGGTGG
CACGGCCAGGGCTAGCCCGCGCCACCACATGGTGTGGCCACCCTGTGGCC
CCTCTCCGTCTCGTCTTTTGGCTCTATGAGTCTTCCGATAAAATATCGAC
TTTGGCTTTTGTCCCGTCCAATTCCGAGAATATTCATTTTCTGACTTCCT
GGAACCAAAAATAGCAGAAAACAGGCAGCTCGCATTGTGGCATCTTGTTA
ATAGGTTAGTCCAAGAAAGTCTATGAAAAGTACTCCAAAGTGTGGACAAA
ACATAAGAAAGTAGATAAAACCAAGCATTGAACATCAAAAATTATAGATA
CATTTGCAATCACTTGTTCCCCGGTTTTCATAGAAATCTGTATTTTGGCG
GTTATTATGCCGTTTTGGCTGATATGCGGGGTCTGCTAAAGTTGCTCTAA
GTTGGGAATTCTAAAGGCAACGATACATAATGGAATGCCACATCATCACG
AAGTGACACATTGCTGACTAAACTACTGAATTTATTACAAAATCATGGAT
CGCTCAAATTTGAAACATGAATCGACCTGCAAAAAATAACCAGTATAAGA
CAACCTAAACATGTTGTAGCCGACTAGTATGCTACCAGTCAGATCGGTTT
GAACATATCTTGTGTGGCCGTCAGCACTTGGTTGCACCCAATAGCCATAG
TATCCCGCTGGTCGGACAGGGGAGAAGCGCCCACAGCTTAACCTAGTTGC
CACCATCTGTATAACCTGCAAAAGGTTGAATGATCTTTTATTGTTAAAAA
TTATGTCATTCCTGCACTCCCAAATTGACCAACATAAGTCTGAAATACCA
ATGCGAATTCTAGCCTTATCAAATTTATCTACTCCATTAAGCAAATTGCC
AAACATATTGGTGACATTAGTCTGTGTAGGTAGGTCTAAGTGATACAAAC
AATAGGCCAAATAAGCTTAGAAAAAAGACTTGAGATAAAAAGATGCTACA
TTGTTTCTTGTGCACCACAGAAACAATATTCTGTACATCCTTTTCAATTT
ATTTTTGTTGAGTTATGTTTAGTTAATAGTATTTTGTTAGTGAGGAGCCA
CATGAATATTTTTATCTTTAGTGGTATTTTGAGCTTTCATAAATACTTAC
GAAGGAAAATGTGTGTGTGATCATTCATTAAATCCTCAAACATTTATTTG
ACAAAATAAACAGAGGTTGTGAATTTCCATACAAACCTATCCGGACCATT
TGATAATTGCACCTTTATTAATCTTTGCCATAAATGCAACCATGTTTTCC
ACTTGCTATTACCATTTAGGGACTGTCTGAAACCAATGTTCACATTACAA
AGCCTATGTCATGAGAGGTTTTACTTTGTCATCTAGGTCAAATAAAGAGT
TCCTTTATCATATTCTAGAGCAAGTCATACAAGCTGGAGCAACAACCATC
ACAATTGCGGACACTGTTGGCTTCAATCTTCCTACTGAATTCGGAAAATT
AATTGCTGACATAAAAGCTAATACTCCTGGGATTGATAATGCTATTATTT
CTGCTCATTGCCATAATGACCTTGGCCTTGCAACTGCCAACACATTAGCG
GTACTCCCTTCTCCTTATTTATTTCTGTCCTCGAATATTAGTGTTGATCT
AATCATACTACTAATTTAACCTACCTCTAGGGAGCATATGCAGGAGCACG
TCAGTTAGAGGTTACCATTAACGGTATCGGTGAAAGAGCTGGAAATGCTT
CCTTGGAGGAGGTGTGCTTAGAATATTTCTTGGATTTTTTTCATGTTCAT
TTGAATAGGTTGTAAAATTTAGGAATTTGGTATGATATGGATCCAGTACT
TGCTATATGTCTAATATTTGACACAATTTCAGGTTGTGATGGCACTTAAC
TGTCGCCGGGAGATCTTAGATGGCATGTATACTAGAATTAATTCCCGCCG
TATTTCCATGACAAGCAAAATGGTACAATTTAGTGTCGTGGCACTTTTTT
GGGTAACTTTTGCATTTCTTACAAACTGAAGTTTCTTATGAAAACCTCTC
TAACTATTCTAGGTACAAGAATATAGCGGACTTCATGTACAACCTCATAA
AGCTATTGTTGGTGCCAATGCGTTTGCTCATGAAAGTGGAATTCGTCAGG
TGACCAATTTTGCAGTTCCTTATCACCGTTCAAGTTCCTAGCTAGGCTTT
TAGTAAGGATGGGTTGACAGCTTTCATGTCGGTAGCATGACTCCAGTCCG
CTTAGTTATGAAAAATAATTCGATTTTGTGAAGTTGGTTCTTATTTATGA
ATATAAAGTTCATCATTGAGCAATATTTGCGAATTTGAATGCTTCTGCCA
CCTTTTTACATATGATGACTAAGAAGACCTAGCTTAATTGTAATAAACAT
ATGGGGTAGTCAATTTATTTTTGTGCATGTTGTAAACTTGGGAGGTTATT
TATAGTTTATTTATGATCGATTAATCATGTTATAGTATAAAATATATCTT
GGCTGCTCACTCTGAGATGTGCTAGTTTTCATTCCCTGATGGCGTTCATC
ATTGTTATATATATTTTACTATTATATAATTTTAACTTCAAACTCTTTCG
ATTTTAATGACTATTGGTTGGTTCAAGAACTAAATACCTACATCCAATTT
ATGTTGTTTTTTAGGATGGGATGCTTAAATATAAAGGAACTTATGAAATA
ATATCGCCTGATGATATTGGTTTAACTCGTGTCAATGACTCCGGTATTGT
TCTTGGGAAGCTCAGGTATCTTGCAAATGTCGCCCCCACCCCAGGTTATT
GTACTACAAAAATATTCTATGATGTACCTTGGTTTTTATCTCTTTGATGA
ACTCTAGTAATTGGTGCATATTCCATCTGCCTAACCCAAATGCTTACACT
CTGATTACTTATATAGTACAACAAATCCTTCATTTTTATACTAAAAAATC
TAAGAAAAAAATATTCATGAAATTGAATATGGATCAATTCTCATGGAGTA
AATACCAATTACTACTTTATTTCTTTAATACTCTTATAAGTCATCAAGGT
CCTATAGATTTACTAAGGTCAACATTAGATTATAGTTTCCAATTCATAAT
TGTGTGTTTTGATCTTCTTTTACAGTGGAAGGCATGCTGTTAGATCTGTA
CTAGTGAAGGTATTGCTCTAGGAGGTCTTTTTGACATTTATGTTCTAGGA
GGTCTTATTTTCCCATTTATAGTGACATGCTTGTGCAAATGTGTAGCTTG
GATATGAGATCAATGACAACGAATTTGAGGACTTTTTTAAACGCTACAAA
GAGGTTGCAGATAAGAAAAAGGTGACACTTGATACATCATATTGTTATAT
TCTCTACCATTTTTTAATTCTCTCTAAAAACAAGCATTAATTTGTAATTA
AGAATCCCTTGATTTATTTGCCAGTATTCTATATTGTTTTACTCAACAAC
GATATTGCGTCTATATATGTTACTCATTTGAATGGTTAATTAATTTCATT
CACAAAGTTGTCTCCTGATATTTACCTTCAACTTTAGATATCTACTATAC
ATATGAGTTCACGAGTTAATCTCTTGTAGAGCGTAACCGATGAAGACATC
AAAGCATTACTATCTGATGAGGTATTTAAGCCCAAGGTTATTTGGTCCCT
TGTTAATGTGCAGGTATATATACTTTAGCTGCAAATGAATACTAATTGAT
TAATGAAAAATTGACATCAAACTTTAAATATTCTCGTTGGCAGGCAACAT
GTGGAACGTTGGGTTTATCTACAGCTACTATCAAATTGAAAGCTCTAAAT
GGAGAGGAGAAGATAGGTTGTTCAGTTGGAAAAGGTCCAGTCGAAGCCGC
TTACAAAGCTATTGACCAAATAGTACAGGTTAAATTTTGCATTACTGTTT
CATATTTCTTCGACCGGTTCGCTACTTTATTTGATTTTTTTTTCTAATAC
ACAATAGCTTCCATCATATGTCCTTTGGATGCAATACATTTTATGTTCAT
ACATGAACTTGTGCATCCACTTGCCTATTTTATAGCTTACTACCATCATT
GCGATATTCAAAACCACTAATAGAATATTTGACATTGTAATTATTTTCAT
GTAATGCATCACCATCATAAGGAATTGTGTATTATAATCAATAACGTATA
TCTAGTGGTATTGGTTGTATCTTATTCCCATTGTATGATTTCTAGAAATA
CCAATATCATATTTATTGATTAGTCTGAGACTCTGTAATGATTAGCATCT
TGATGAAGATATTGAACTTGTTATTGTGCAATGAGATGTAGCATGTGCTA
GAGAACGTTTGAAGGGCAGTTGTATATTTTTGCTTCTCAACCAAGTTATG
GACAATGAAATGTTCTAATCATATTTTTTTTATTTGATTAGCCATAGTTC
ATCATGATATGTGGAGTCTGAAATATTCCAATCATATAAAATGTATCAGG
TAAATTTCATTGGAATAACTTAGCTGCTAAATAACTCCAATGTTGATTAG
CCCATCTTGTAATTTTACTACTTAGTTGTATCTCCTACATTGGGAAAATT
CTTGATAAGCAATTATACAAATATCATGCTAAATGAATGGATGCCAATAG
CAAGGCTTTACTAGCTCCTACTAATTTTAATGATAAATTGGGATGCATTT
ATAGAGCCAGAAATCAAACCTAATGTATTTGAATCCCTTATGTTTGTTTG
ATGTATCACCAATTTATCAGAATCATATATACTTTCACTTAATCGGTGCA
ACTTTGTACAATCTCCAGATTCCAACCGTTCTTGGAGAATATAGCATGAC
AACCGAAGGTGTTGATTCAATTGCAATGACTCGAGTGGTCATCATAGGAG
ATGTCAGTAAGAATGAACATGCTTTGCCAGGTCAACACATCAACAATCGT
GCCTTTAGGTAAAACACCCTCAAAACTTTTTTGTTTTCACATCCAGGGTA
ATTGAAATATCCATTTATGCCATTGCCTTTTTTGTTCTCGATGTCTAATA
TTAACTGCATGGCTGGCTTCAGTGGGAGTGGCGCATCGACGGATTTTCTT
GTGTCCAGTGTACGAGCTTACATGAGTGCTCTGAACAAGATGTCTAATTT
CATTGGTGACGACGAAGCACCTGGAAGTATGAGCGTTCAAACGACAAATG
AATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.