Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE022556

[Submit comment/correction]

Sequence	AE022556
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE022556
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CACAGTTCCACTCCCCCAGTCCCCCGCTCTCGCTCTCCACTCCGACGAAA CCCTCCCGCTTCTCCGCTTCAAACCCCCAAATCCACCAAGTCGCTCCCAC TCCGCCGCCATGACGCGCCCTAGCAACGAATGCACCTACGGTAAGCGCCT CCCCCTACCCATCCGCCGCCGAAAACCCTAACCGTACCTCACTCGGTCGG CTCCTCCTCCACCTGCAGCTCCCGGGACGCCAGAGATGCGGCTCCTCAGC GCGGCGACCGCAGGCGATCTTGCCCTCCTCGAGCGTACGCTTCTGTCCCT CTCCCACCTCTCCTCGTTCTGGCCGTGCTGTGTGCGCCGGCCCTGTTTTT CTTATACTACTGTATTTGATTTGTGGGAGCCCGATCGATCCGTACGTACG TACAGGGATGGCGAGGAAGCTCGATGGTGGTCGTGGCCGCATCGCAGAGG CAGTGGAAGCCGTTAAAGATCGCGGCGCTGGGGCGCTGCACCTTGCCGCC GCGTGCAAGGAGGCGGAGGTGTGCGAGTACCTGGTCGAGGATGTTCGGGT GGATGTGAATGCCGTTGACATATGCGGTGTGTCTGCTCTCTCAAATTAAC ATGCTACCTTTATAGAGAAAGACTGAATATATGCATAGAAAACTTTCACT TGTTCTTTTTTTTTTTTGAAGTTAAACTTTCACTTGTTCGTTCTGATGTA AAGGCATCAGCTTCCTTTTTTGTCTTCTTGACAGGTAGAACACCTCTTGT TTGGGCAATCACTTGTAAAGGTGGTAGTGGTCTCGTGGATATTGTCAGGT ATCTTCTTGATCATGGTGCCAATCCAGATAATGTCGACCAAAGAGGGTTT ACTCCTCTCCACGAGGCCGCCAAAATAGGTAATTCTCTAATCTCTACTCT CTCTTTCTCCTAGTTGGTTATTCCTATGCATTATACTGTCGCCATTACCT TCATCAACATGTATTCAAGTGATGATTTTTGTGAAAAATTTGATATACTC TGGGATCTCCATTTGGTGGATGAAGAGAGACAAAAGAGATTGCAATTGTG GGAGTTAGTTTTCTGTATTTGTGCTAGAGTAGAAAATATGGATAATATTT TTTCTGACATAGAACAAGGTCACAAATTGTTCATCTGTGCACGGCCCATT TTGTGCGCAAGACACACCGTTCAGGTAGTGATCTATGGCTTTGTAGAGTT GTGTCGTTTCACAACTCAATAGTTACGAGTCAAAATAACTGAAATGGAGC ATATAATATTGCACATAAGAGGAATTGTCATGTAGTTTATTATATTTATA CATTCCAAATGTCTGATTCAGGACTCTGTGAAGTATTAGAACTCTCTAGA GGCGCTTATGTCAATCCGTTTTTTACTGAGCATGGAACACCGTTGCATGT TGCTGTTATACATAAGCAAGATGGCGCCATGAAGATTTTGCTGGATCACC ATGCAGATGTACGCTCCATTATACGTTTCTTTGTAGTTTTCTCACAGTTG TGTTTGGTAATTTTTGTCCGTCTACTTTCTCCATTTTACTTTTAGTTGAA TCTTGACAGTAAGATTACCTAGTAGTTTGCTATTTTTCTCTGAAATCTGG AGAAGTGCAGAGAGTTGTGAACATGTGGAAATTAAATTAACCTCCTCCTT TTACTCATTAATTGGTTGTACAATCATGTCCCATCAAAGTTATAAGTGAT GCTGAAAAGCTAGTTTCACGGTACATGCTGTTCTGCAGTAAGAAGAGAGT TGTGGGCCCTTTCTATGAATTATATGCTCATCATGTACACAGTTTCACTT CACCTTCTAAGTTTGAAAAGGATTATCATATAACACCTTCTGCATATAGA CCTCCACTAAATTGTCATTTCCACTGAAGTTTCTTGTCTCCACCTCTATT ATCTGCATGTCAAAATTTCAAGATTGAAGTTTGCATGTGCTAAACCACTG ATGTTCTGAGGCAGTTTCTCTATGTGGATTGCTTGTCCCGACAAGAAGTA GCTTAATTAATTGGTCTGTTTGGATTTTTTCCCCTTCTTCCGACAAACCG AAAATCATTAATAAAATTTCTACTACAAGATTCACTTCCTTTACACCTGT AATATAGATAGACCTTATGCATTTTGTTTAGGAATCTGATATTTCAACCC CAGAATATCCCACCCAAATAGCCACACTTACTGCTGCTAACTATATCGGA AAATAGAGGAATAAGTCCCAGAAACTGATAATGATGGTTAAAAAAAATGA TCAGCACTTGGTGTCCTGTCATATTGGATATAAGATCTTCTTGTGGGTGT TGCTATGGTCATGCTAAAAGGATGAATTGTTGGAGATGATTAGATTCAGT ACAAAGATCTGTGGAGCTGATGAGCACCAAGGGAGCTTGAGAACAAGGAG GGCAATAGGTGCGATCATCAATACAAGAAGGGGAGCAAAGGCAGTATGTG TCGTGCGAATGGTGGCGTTGGGGGACACATTTAGTTGTAGAGGTCGAACT TGTATGGCCGTATGGGGTGGGGAGGCGGGCACAAAGTTGGTTGCAGATAA GAGCACCTCACTAACTCGAAATGTTCTACACTTAACATTAAAAAGGAAGA CCACATTACCAGGATTCTAAATTTGTTCCGGTGTATGGTGTACCGAAGCA CAACTGTGAAGGTCACCATCTATTCTTGTTGGGCCTGTTTTTCAGATGTG ATGACCGAAAGTACAAGCAGGCCATAAGTCTTATCTTTCCATCTCAAAAG AGTTGTTGGTTGTCACATGGATTTAAAGGCTAATAGTGAAGAACTAACTA GAGATGCATTGAATGCTACGCTACCAAATATTTTCATGTTGAATTGTGGA TAATGTGCATTTTCCTCATCTTTTTTTTTTGCAATTCTGCACCAACTGCC CTCTGTTTCTTTGATTCACTAAGGTTCATTGTCACAGTGACATGGTTTCA TCTTTTTGTTTATGTATGTATCTGGAAACTGCCATTAATCTGGTGTGCTA ATTACTTGCATCTGTTTTCAGTGTAACAAGATTCTAGGCTCTTTCAGTTC ACCTCTCATGCTTGCTATGCATAATCGTTCAGTGAAATGTGTGAACCTAC TGCTAGAGGTACGGCTCCATCTTATGTGTTAAGCTGAAAATGTTAGTTTA CTGAAGATCTGGACAGATTTATTGTGACACATATTTCTCAGAGGAACCAT CTACTATTCTGTTCTATGCTAGGCTGGTGCGGATGTGAAGGGTATGCATG CTACGACCCCCTTGCAAGCTGCTGCAACTAATGGCCTAACTGACGTCCTC AAGACCCTATTGGATGCTGGTGCAGATCCCAATGTCCGGAATGAAGTAAG TTCTGTGTTTCACCGGCATATATTTAAATCACATCATGGTTGGTTGTTTA CACATGTGGCTGTAACATTAAAATATCTAAGCATTGTCCATACTTAAACG GTAATACGAGTCCCATAGTCAGTCATTATGTAATTAATAGTTAACTCAGG TTGGGTGCACATGCTTAAACTTTGGTACTCCCTCCGATCCAAAATAAGTG TGGAGATGTAGTACAAACTTTGTACTAAAACAGTACTAAAACACCGACAC TTATTATGGATCGGATGGAGTAATACAAGTCCCACGTGAGTTATATCTAA GTAATATTTAACTCAGGCTAGGTGCACTAATATAAACTCAGTCAGATAAA CGTGTACCAGTGACATATAAATTATAATACTACAATTTCATGCCTTCTGA TACTTTTTGTCAGGTGTAACCTACTAACCTTTTCATTTTCTTAATGATCA ATATTTTGGAATGACAACGCGTCAATATTTTTAGCACTAGTACACTTCTA AAGAAATAGTTTTGGTTGATTTAGCCTGCCAATTTTAATGCCTTTTCTTC CCTTGTAATTTGAATTTGTGGTATGGGAAGACGTGTTCGTTTTCAATCTG CCAAATAGTATGGTTTGTATATAAAACCTTTAGTCGCAAGCAAGTTAGTG TAGGATAGAGTCATAAAGATGACACCCAACAAAAATCACATGAACCAAGA CATAGAAAGTAAAAATAACAGGTACAACTAGCAATGAAAAATACTACTAG TAAAATTGGTAGTGATGAAAAATTATTTAAGAACTTGCTGCCTGTTTTTT AGATAATGGACAAGTTGACTCCTGGCCTCTGCATCTAGGATTCACACAAC CAATAGTTTACGACAAAAGGGACTTGCTGGATTACTTAGAGCCATGTGCC ATGTGCACTGCCTTATGGATAAGGGCGAACTCATCTCATGACCTACGTTT TGGTATGAATTGAGTACTATTGGTCATATTATTGTCTATGTACACCTTGC ATGTGGCTATTCTGTTAATTTATTTCTCCTCCAAATAAATCGATGAGATA CATCTTCTTCTTTTTCTGAACAGTTTGGTCACTTGCCAATACAAATCGCG GCATACTGTGGTGCACGCAAAGATGTCGAGATCCTGTTTGAAGTTACCAC TTCTTGTATTACAGCTGTACATGATTGGAGCGTTGATGGAATAATTAGTC ATGTAAAGTCAGAGCCAAAGTTGGAGGTATGAGCAAGAACATCATTGGCA TTATTAGAACATATTTACTTATGTGCCGTAGTCTTAAGCAAAGTTTTGAC TGAAACTATTTAGGCCGGAAGCTTAATATTCATCTCTCATACTGTAAAAG ACTGTTGATCTTGCATTTTTCATGAATCCTGGTTTTGACACTTTTGAACT ATAAAACTTCTATTTTTGACACTAGATGACATTCCCTGCTTTTGGTGTTT CATTCAAAATTATGACCCGCCATAAAAAGATCATGCAGCTGAGCTTGGGG GATTGGGGTTAATGTGGTACCTGAGTTACAATAACATGCGATCCTACCAA ATTGATGAAATCATAACGCGTTTAAATCTGAAAATATATCTATTCCACCT TTAAGTTCTTTGCACATATATATCCGCAATCTCAAGGCTGTTTAATTTCT ATTTAAATTTTCAGGATAACCCTTTGTCTAAAATGTCAGTAGCTAAGTTG AAAGAAGAAGGAAATAAAGCTTTGCATCAAGAGGATTACGATGCGGCATT AAAATTCTATGACATGGTACGCTATTGCACTATCCGTGCTCCTGAAGTTC ATTTCTTTTCCCATGCAATTGTTGTCTCATTTGTATCCATTTCAATTGCT TACATCACTATCTGATGTATTAATGGATGTTCATGCAAACAATACATTTG CTTTATTTCTCTTCGCTCATATTTTCCTACTCTTTTTTTTTGGAGCAACC GGCAGGAGCTCTGCCTTTTCAAATAGATAGAGGGAAAATGATCCACAAAG TACAAGGGCATGTTTTGGTTAAGGTGAAAACATGCCAAAAAAAAACACCG GAAAAAACCAAAACTGAAAAATGCCTAGTCAGGCTCTGCAGGAATGGCAG GCCCGAAGGCCGCAAAAGCCCGGGCGCGTTGCCTGATGTCCTCCCTTGCG ATCTCAGCCACCTCAACATAAGTCAGCCGCTGGCCGGTGAAGATTCGTCT GTTTCTCTCTTTCCATGCATTCCAAAGGACATATAACAGTCGACCACTTA AAGTTCTTTTTTTCGCTCGATGGTCTTCCGTCAATCAGAGTGTCCCACCA TTCTGTGAGGGAGTGGAAGTCGTGGCCATGGAGCCCCCCCGCGGCGTTGT CCCAAACCTGGGTGAGGTTCCAGACAGCAGTAGTGAAAGGGCAGTCTTTG CAGAGGTGATCGGCTGTCTCAGGCGCGCTTAGGCAAAGAGCGCAGATGGG GTCGTGCGTCCACCCCCTAGTGGCTAAGTTATCTGCCGTGAGGAGCTTGC GATGCAAGGCCAGCCAGCCGAAAATCTTGCATTTGGGTTCCGCGTGGGCA GTCCACAACTTCTGGGCAATGAACTTGGGGTGACTTCCGTGGAATTGCAC AAGGTACGCAGAGGTAGCACTGTAATTACCATCCGCCGTCAAAGTCCAAA CTATCCCGTCTTTTTGTCCTGGAGTCAGCTGCGTGTGCTCCACCACGTCC CAAACTTTTATGTACTGGGCGAGCTGCACCGGAGTGGTCAGGCTAGAAAT GGCACGTATCCAGTTTCCGTCAGCTAGTTCTTTGGCCACGCTCCTGGTTT TTCTTGAAGCAATCTTGAAAAGGTCTGGCGCCCAAAGGCATATGGGGCCA TGCTGAGACCAGATGTCGTGCCAGAATGAGGCCGTCTCCCCATCGCCCAG GGAGATTTTCGTGGAAGCTCTGAAGAGGTCCATGTCGGCATCATCGCAGG GGAGCTTAGAACCCGCCCAAGTGCGTTGAGGGTCAGTCCACTGTAGCCAA GGCCATCGGAGTCTGAGTGCCCGTCCTGTCCGTTGCAGGTGAGGCATCCC AAGCCCTCCCAAATCTTTTGGTCTGCAGAGCGTCGTCCAGCTAACCAAAG CTTTTCCTCTTGCCGCGTGCTCGCCTTCGTCGCCGGCCCAGACGAAGTTC CTGGCAATGTGAGTAATCTTATCTCTAGCCCATTTGGATAGGGGGAGGAC GGTAGCGTGGTAGACGGCGATGGCCATTAGGACGGACTTAGCAAGGGTAA TTCTTCCAGGGCGAGCAAGAAACTTCCCTTTCCAGCCAGGAAGCTTTACT GCAATCTTGTTGATGAGGGGCTGGAGATCGACTTTACGGAGTCGCCTGAA GTGCAGGGGGAGACCCAAGTATTTCCCTGGGAACGAAGCAATCTTAGCCA GGAAAGCCGAAAGGACATTCAGAAGGTCGATGTTGTCGCATCTAATGGGG AGGACCTCCATCTTGTTTAGATTGGTGATGAGGCCACTAGCCTTTCCGAA GCAGTCGAGAATGTTAGAGATAGCCTTGAGCTCATCTTTCACAGGGTTGA TAAAAATTTCGGCATCATCCGCATAAATGGAGATTCTGCATCGAGGCTTG CGCGATCGGAGAGGGCTAAGGATACCGCATTGACTTGCAAACGAGAGGAT GCGTTGCAAGGGGTCAATGGCGAGGATGAATAGCATGGGAGAGAGAGGAT CACCCTGTCTTAAACCCTTGGCGTGCCGAAATGGCTTTCCCGGATCTCCA TTAAGAAGCACTCTGGAGGAAGCCGAAGATAAGGACAGACAGACCCAGTC ACGCCACAATTGTCCGAAGCCTAGGGCCGTCATTACCTCGATGAGATAAG CCCAACCCACGGAGTCGAAGGCTTTAGAGATGTCAAGTTTTAGGAAGAGG CTTGGTGTTCTTGAGGAATGTAGCTCTTTGATGAGGTTTTGCACGTGAAG GAAGTTGTCATGGATGCTCCTTTTCTTCACGAAGGCGCTTTGGCATTTGG AAACAATTTCAGGCAGGATTGGAGCCTGACGGTTTGCAAGAAGCTTGGAG AAAATCTTTGACAAACTGTGGATGAGACTGATAGGCCTGTAGTCACTTAT AGTCGCCGCATCCTGCTTCTTGGGGATTAAGATGATGTTTGCAGAGTTTA TCAAGTTTGTGCAGCCCCCCTTCAAGCCAGCCATATGGGAGATAGCGGCC ACAATGTCATTTTTGATAACGTCCCAGGAGCTCTTGAAGAAAGCACCGAT GAATGTTGTATTTCTCGATATATGGAGAGGAGTGCAAGTGTGAACAGCTA AATTGTATTGCATAGCCCAAGTTACAAAAATGTATCAGAAGGCTCATGGG CACTCAAAACCATGGTGTGCCCTCGTTAGTGCCAGAACAAATAAGCCTGC GGGCCTGCACAATGAAGTTGCTTTTGAGCATGTCATTTCTGGAGTGCTTG CCTTGTAAGACTTTCATATTGACATCACCGAGCACTGTCACCTTCACAGT GGCCCTGATAGAGTGATAGCACCACGGTGGGATCAATGAGCATTCGGGCC GCTGGCAGTGCAGAAGCCTACACTGGCCATTTCTCTGCTAAATGTGGCTA CACCACTTCCAGAAACTGTCTGAGCATATTTCCTCAAATTAAGACGGCCC TTGATTGAGACCATGGTGGATCATGATCACTTTCATCACAGTGCTTTTAG TTTGGGAATTGGGTGGTGCTGGGCTTTGTTTTTTAATCTAGGTTAGGTAC AAAGACTAGAGCTCAAATGAAAAATAATATACCATGTGGTAGATCGTTTA GAATAAGGAAATGATCTATCATGTTAGTTTATCGTGGTTACATTTGGGAT TTGAATTTGGACTCCCTGTTATAAGGGGAAGTCCAAGTTCATTATGGGAA AATGAGCATTCGGGTCCCTCGCAGTGCACAAGCCTACACTGACCATTTCT CTGCTAATGTGGCTACACCACTTCCAGAAACCGTCTGAGCATATTTCCTC AAATTAAAACGGTCCTTCATTGAGACCATGGTGGATCATGATCACCGCTT TCATCACAGTGCTTTTAGTTTGGGAATTGGGTGGTGATCAGTTCATGCCT AACAGATGATCGAACGGTATCTTATTTTTTTTTCATTTGCTTTTTTATGC CTCTGCTATAGAAAATCATAATAGATTTAGTATGACACATCGCCGTTTCT TATATTTCTTTGGATGTATCTTCAAATCTTTGCTAGTATGTTTGGGTACG GTCTCCAAGGTTTTAGCTTTACCTTGTTGAGTGTAGATGTGTGCATAGGC TCGTTGACCCGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCACGCGTTGTGTT GAAGAAGAGGCACAATTGGGAACAGAAAAAGTTTGTTGACATACGCATCA ACAGCAGTTTGACTTTTTTTTGAACATTTCAGTAATTTTGACTTAAAACT GTTTTCACTTTTCAATGACACCTCCATATGTGATTTATTTTGTCATTCAT GATATAATTGGTTCTCTTTGTTTGTTTGGTACCTCATATTTCCCATTCAT TTACTTACCGTGTCTTTTTCCTAGAAATCTAACAATTATATGCAGATTTT TCAGAAAATATGTAATTGTTCGTTTGATTTGTTGGCTGTAGGCTATGTTG GTTAATCGTGAAAAATTAGATACAATCTTGATTGGCAATAGGGTTTTTGC TGGCTTCATCTGGGCTATGCAAAGGGTGCTTTAAATGATGCCCATTTCTG CAGGACAATGCAGCCTGACTCTGCACATCCATGCTGGCTGCAGGGCTACT CATATGTGCAACTACAGGTGATACAAAATCATGATTTTGTGCTTGTTTAA ATCTTATAGATAAACGTTTTCGACGATCCACTCAACTCTACATCGTTATT CTTAGGAGTATGAAAAGGCATGTGATGCATTTCTTGATGGTCTCAAATTG AAGCCACGATTTACTGGAATTGAGAAGGCGTTAAGGTAGCCTACTTGATC TACTTTAGCTGCCTTCTTTATTTAAAGTCCATTTTGTGTAGAGGCAGTAG TATTTTAGCCTACCAAAACGTCTTATAATTTTTGTACAGAAGTAGTAGTA TTTAGTGGTATCGATTCCATGATTCAGTTATTATGGTAATGTATAGACGG TTATATGTAGTGTGTGCGAACACAATCAAATAAATGGACTTGTATTAGCC AAAAAGAAAAAAAATGAGTACACCCTCCACCCATATTAGTTGACTCAAAT TTGTCTAGATACGGGTGTATCTAGCACTAAAACTTGACTAGATACATTCA TATCTAGATGAATCTAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACAATAT TTTGTCTTTGTACAGTACACGTATGCATACGTTCATATCTTTGCATGAAA GTGTTTACTACATCAAAAATATGTGTAATTTTTTTCATGGTTGTGTCCGA TTTGCCTGTTTGTCCCACTTCCACAGGAATTTACTTGTGGAAAAGGCATT TCAGATCTTTTGCTGATGGTCTTGTCTGGAATGTGCAGGGAGGCTCTGAG ATTATTGAAAGAATCTCACACAGACAAGAAGAATGGCTTAAAAGTAGAAT ATCGTGAAGCACATATTTTCCTCTGAAGAGAGCATTTTGACTAACAAGTC TGACGTCTCGACTCTTGACAAATTGCTTGCTGCGTGCTGAAGAATGTGGT GCTTGGTGCCCTGTTGAACTGTAGGTTCTTTTTTGTGTCTGCGGCTGCAA ACCCGGAGGCCTGAAATTTGTTTTTCATATGCATACTGATTGTGTAGTGC AAGAAAGTAGAAACTGCTGTTGAGATGTTCAACCTTGTGATTGGTGTCAC GCTCTGAGGTGATTCAGTTGGGTATCAGTAGATTTGAACATTATCATATA TATCATGGTACTCTGGTAATGCATGCATTTTTTCTTCTTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.