Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE012804

[Submit comment/correction]

Sequence
AE012804
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE012804
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTCGCCGATCTGAACCACCTCAAACCCCCAACCAAAACAGCACCGCGTCA
CTCCCCTCCCCCTCCCCGCGCAGATCCAGATCCACCCGGCGCGGCACAGC
CGCGGCCACCCGAGATCCTTCCACCAATAATGGCATCCGCGGCGGCGCCG
CCGCCGCTGTCCTCGCCGGAGTCCGACCCGCGCCTCGTGGAGGCCTTCGT
GCCCTTCCTCGAGAAGCTCGTGAAGAACGCCTCGTGGCGCAACAAGGCGC
ACTCCAAGCTCTCCCACACCGCCAAGTCCATCCTCGACCGCCTCCAAAGG
CCCCCGCCCCCCTCGCCCGCCACTCCGGCCACACCCACCTCGCCTTCCAC
GCCGACATCGTCCTCCTGGCAGCCGGGCCCTCTCCGCAGCCTCTCGCTCG
AGGACTCGGAGCTGCTCCTCTCCCCCATCGCCTCCGCGCTTGGCTCCGGC
AGCGCCAAGCTCGCCGAGGCCGCGCTCGAGCTACTCCACAGGCTGATCGC
GCACTCCTACATCCACGGCGAGGCAGACCCGTCGGCTGACCCCTCGGCGC
AGATCGTCGCGACACTCCTCGAGGCAGCCTGCAATGCGCTCCACCTCGAC
GACGAGCACATTGAGCTCCTCCTCCTCAAGACTCTCCTCTCTGCGGTCAC
CTCCACCTCCGTGCGCCTCCATGGGGACTGCCTGCTCCGTGCAGTGAGGG
CTTGCTACGATATGTACTTGGGGAGCCGTAGTACCGTGAATCAGGCCACT
GCCAAGGCGTCGCTCGTGCAGATGTTGGTAATCGTGTTCCGCCGAATGGA
GGCAGACTCATCCACGATCCCCGTGCAACCCATCGTAGTGGCTGAAGTGA
TCGAGTTGCCTGAAGCTCCTTCAGGTGGAATACCTACCGCCGATGCCAAC
TTCGTACAGGGATTCATCTCGAAGATCATTGGGGACATTGATGGTGCGCT
CACACCTCTAGCGCGGACAACTTCATCCGCAGGGGCAGGCACGGCTGTGC
CCCATGATGGTGCTTTTGAGACGACAGCAGCAGCTGAGGAAGGGGCGAAT
CCTGCAGATTTGCTTGATTCAACGGATAAGGACATGCTGGATGCCAAGTA
CTGGGAGATCAGCATGTACAAGACGGCCCTTGAGGGACGTAAGGATGAGC
TTGGCGTGGAGGGGGCAGTGGTAGCCACATTGGATGATGATGCTGATGTC
AGGATTGGGAATAAGCTGCGGAGGGATGCTTTCTTGGTTTTCCGGGCATT
ATGTAAGCTCTCCATGAAGACACCACCCAAGGATGCGCCATCTGATCCGA
TAGTGATGCGGGGGAAGATCCTTGCTCTTGAACTTCTCAAGATCTTGCTT
GAAAATGCTGGGGCTGTGTTCCGTACTAGCGACAGGTACAAATATCCCTT
GCCCGAAACTCTGTCTACTGTTTTGTCTCAGATCGTCTCAGTTTCTTTCT
GTAATCTGATAACAACATTGCGCGCGGATTTGAATACTAGTTTTTTCTGT
GAAACGTGGTGTAGTTACAGCTTAAGAGAGAATTCTTTACACCAACTATT
TTTTAAAAGATTAGGCAGTGATTTGCTAAGGGCAGTACAGTTTTGAGTAA
TCTGTAGTAATGTTGCTCTATCGATAAAAAATCCTATAAAATCCAGTATT
CAAATTCTTGTTGCAATTTACGGAAGTTAGAAGTGTGTAGTTTATGCTTG
TTGCTATGACATCGTAATAAAAATTTACCATGCTTGACCAATCTCATAAA
AAAAGTTCAGTCAGGTTGGTTCTGATAATGGCATTTCCTGGCAACAATAT
CATCCTTGGATCTGATACAGATGTTAGGTTACACTACGCAGGTGTAGCAT
AGTGTTGGTAATAAATTTATTGAAAATATAAAATTGTCCCAAACATTGAG
AAGTGTAAAGTAATTTCTTTGAGATGTGGCACTTTATCTTTGAATTGTTG
AAAACACTGGGAGATGGTATTGTAAAGACAAACAATGGACGCATTACACG
ATATGGGGTTTAAAGTTTGCTAAAGCCCAGTTAGCCAGTTCCCATCCAGG
TAGGGCCTATTCATGCATAGCAACATATCTAGTCTTTGTCACCGTGCGTT
TAACACAGTGAACCCAGAGTTCTATACATTTGAACCCTCCAGCACTAGAT
GCATTCTGTGATCAATCCCAGCACTACTACACTTGAGGGCCATCATTGGG
TACACGTTTTGCACTCTACTCCCTTCTGGAAGAGCTGAAATCTCACTCAG
CATAGCACACTGCAGAGATGGAAATTCCCAGAGTCACTAGTGGGTACAAG
TTCTGGTTTTGTGTTCTCCATTGGACACAAGGCTGTGCGCCCCCATCATT
GGGTACACGTTTCCAAGATTCATCAAACTTCTGCATGCCCTTCTCTTGTA
TTCCTTTGTTTTCTACTCCTTTGTCACCATTGTTCTTAGCGCTTTATCGG
AGTACTCCCTACAATCCTTTTGAATGTGACGGTCTGGATAATAGTTGGAG
ATACCAAGGTGAGGTTAATTAGGGTGTATTTAATACTCTGCCCTTAGGCT
GGTCCTAGTGGGAGTATCATAGCTAGTATCATGCATGCCATGTTGGCAAA
AGTCTGATGTGGCACAACAATTAATGAAGAAGATGGTTAGAGTATCATAG
GTAGATACCGTATCATAGCACGTAAAACTAGAAAATTCTCATGCAAATAA
ATCTTGTACACAATTTTGCATTGAGATTCTACAAATCATTAAATATAGTA
CTAGTATGATACTACCATATGATACCATGCACTACGGAGATAGTATCATA
TACTAGTATCATATGCATGATACTAGTAGTATGATACTACCACTATGACC
AGCCTTATTAAAATAAGATGCCCAGAGTAGTGTTTGGTTGGATCTCAATT
AGCTGGCACATGTCTTGAATCCTATTACCTGCAGTTTTTAAACATTTAGC
TGCGAAGGGCAGCATGACACAATAATTCGCACTCCAGATGCATGTTTTTG
GCACCTGATTTTATTTACTCCTTTCTTTTTTCTATCTGGGATTTTGAGCT
GCACGTGTTTGGTGCTTGCATCACCTTGTCTTTGTTTGTTTCATGTTCTT
GTTTTCTTGATGATCCATTGTTGTAGTACTAATTTTGCTTGAAAAAGTCT
GTATATACACTGACATGAGCGAGTATCAGTTGTCCAGTTTTGGTAACAGA
GAAGAACAGCTAATGCCATAATTCCATGCATGACGTTGGACTGAAACCAG
GGAAAAACAGGGCAAATACTCACTTGCATCCCTCTGGTAACTCTATGTAG
CCTTGGCAGGGAGCAATTAGCAGCAATACTGAACTCGTGCCAACAACTGA
AGTTACTTGATGGAGAAGTACTAAAAGCTTTATTATGTTGTAATTAGTTC
ATGCAGTAAGTAAAAAAAATGTTGGAAATGACATCAATGTGAATGATTAA
GCTTGGGAAAATGACATATGGTCACATACTTCTCTGGATCCTCTTCTGGG
ACTAACTAGGTTGCACCAGACCATAAAGGTTACTTGCTAGGCAGCAAATC
CTACACTCCTCTGCCTGCAACAGCTTCATTGACTCCTCGACAATGTGGAA
CTGTGCTAGCAACAGTAGCTAGCTAGTGCCATATGAAAACTGATGGGTTT
ATAATTATGTACATTGACAATTGTTGGTTTAATGTGCCTCCTTTTCTTCA
ATGTAATGCTAATTTGGTTGACGATAAAGTTCTGTTTGTTGAATAACTAT
AAACGATAGAGAACTAAAGATAGGTGCAGGTTTTGGGTTAAAGCCTTTCG
TTCTAACTAAGTTACATTTCCCATGAAAGTCATGGTGATTGTTTCTATTA
TGATTGCTAGTGTTTCTTATTAAACTGGAGTTCAGGAACCTATAAGCAAA
CCAGTTGATAGTGATGGTCCATTGGCCTTGAGGTCATACCAACCATCTAA
TTCTGTATAAACTGTTCAGATTGTGATGGTATTGCTCAGCAGTTTGCACC
CACCTAAAACATGTTTTTCAAAAACATCACGATCAGAAGTTTGAGCAACA
ACCTCAATTCAATAAAATAACTAGTCTTGTTAAATATGTACTCCCTCTGA
TCCAAATTAATTGACTCGGATTTGTCTAGATTCGGATGTATCTAGACATG
TTATAGTGCTTGATAAATCTGAATCTAGACAAATCCGAGTCAATTAATTT
GGATCGGAGGGAGTAGTAAGAAAATTTTAGTCTCCTAGTAAAGTAATAAT
ATTGGGCATGCGGATTATCAAGCCTAACATACTAAGGTACATTACTGTTT
AGTTTCCAGGTAGAGCAGCAGTTCTCAAAATACGCTATAATGTTCCCAGC
TAATACTGTTGTATTCTTATACTGACCGTGGTATAGCCACATTTTCTTAT
CAATTGCTACAGTATGTTTGATGTTTTTATATGAATATACTTTTTTTTTT
GCCTAACTATTTTTACCTAACTTGGTCAGGTTTCTCGGTGCTATCAAGCA
GTATCTGTGCTTGTCACTTTTGAAGAACTGTGCCTCGTCACATATGATTG
TTTTTCAGTTATCTTGTTCAATCTTTATTAGCCTGGTTGCAAGATTTAGA
CCAGGATTGAAGGCAGAGATTGGCGTATTTTTTCCCATGATCATTCTGAG
AGTTTTGGAAAATATTGCACAACCAAATTTTCAAGCAAAAATGATAGTTC
TTCGTTTTCTGGAGAAGCTCTGTGGTGATTCTCAAATCTTGGTTGACATT
TTCATTAATTACGACTGTGATGTCCACTCATCGAATATATTTGAGAGGTA
CTTCATCACTGACTGTTCATTGCTATAGTTGAGTACTGAGGTTTTATTCT
TGTAAATGCCATCCATAAACCCTTTATCTGCTGTGTTACGTTTTCTTGGA
CAACAGGATGGTCAATGGTCTGCTGAAAACTGCTCAAGGGCCTCCAGCGG
GTATCCCTACCACATTGGTACCACCTCAGGATACCACAATGAAGAGTGAA
GCGATGAAATGCTTAGTTTCTATCCTGAGATCCATGGGAGATTGGATGAA
TAAGCAGCTACGTATTCCAGATCCCGACTCTCCTAAAGTTGAATCAGAGC
AAAACGATAATGATGGTGGAAACGAGTTTCCCCAGACAGAGAACAATGGA
GATGCTTCTAGTGAAGTATCTGATTCACATTCAGAATTATCGAATGGTGT
TTCAGAGGCTGCATCTCTGGAGCAGCGCCGAGCTTACAAAATGGAACTTC
AGGTGGATCTCATTCCACGCTCAGTTTCTTTTATGCATTTTTTGATGATA
ATATGGCAATGTGGTGGCAGTTCTCGTTTTACTCATCACAGTTCCACTAT
ATCTAGGTTGATTTGTTTCCCTCTTCTTATGTGGTCAATTGATTTATGAA
TGACAGGAGGGTATCTCTCTGTTTAACCGGAGGCCTAGAAAGGGAGTTGA
ATTCCTGATAAATGCCAACAAGGTTGGGGAGTCAGCTGAGGAAATAGCTG
CTTTCCTAAAAACTGCTTCTGGCTTGAACAAGACAATGATTGGTGATTAT
TTAGGGGAAAGGGAAGATCTATCCCTTAAAGTCATGCATGCATATGTGGA
TTCTTTTGAATTTCAAAATATGGATTTTGATGAAGCAATTCGAGCATTTC
TTCAAGGTTTTAGATTGCCTGGAGAAGCTCAAAAGATTGATCGGATTATG
GAAAAATTTGCAGAGCGTTACTGCAAATGCAACCCAAAGGCCTTTTCCAG
TGCAGATACAGCTTATGTTCTCGCTTATTCAGTCATAATGCTTAACACTG
ATGCACATAACCCAATGGTCAAAAATAAGGTATTTTCAAGTTATGTTAGT
CTACACTTTATCCATTTTATGATGCTATTGTAATGTAATAATTGATGCAG
ATGTCACCAGAAGATTTCATAAGAAACAATCGTGGTATTGATGATGGGAA
AGACCTGCCAGAAGAATTTATGAGATCCTTGTATGGAAGGATTTGGAAAA
AGGAAATTAAGATGAAAGAAGACGATTTTGTTCCTCAACAGCAACAATCA
ACAAGCTCTAATAAAATTCTTGGGTTGGATAACATTCTTAACATCGTCAT
ACGCAAACGAGGTTCAGCTATGGAGACAAGTGATGATCTCATTAAGCATA
TGCAGGAGCAATTCAAAGAAAAGGCCCGTATGTCTGAGTAAGTTATTTTT
GATATCTAGATGAATAAGCACAATCTAAGCTGTACAGTGTGCCTGATCCT
TTTATTTTTGTTTGCCCATTTGTGTATCCAGTTATATTGTTCATGTTGAT
ATGTTTCATTGCAAATAATATTTTTTGTATTTTGAATGATGATTTAGGTC
AGTATTTTATCCAGCTACAGACGTAGTAATTTTGAAGTTCATGGTTGAGG
TTTGCTGGGCTCCTATGCTTGCTGCCTTCAGTGTCCCACTGGACCAGAGT
GATGATGAGATTGTCATATCCCAGTGCCTCGAGGGATTTCGCTGTGCAAT
ACATGTCACGGCAGCTATGTCGATGAAGACTCAGAGGGATGCTTTCATCA
CTTCCCTTGCCAAGTTTACATCACTTCACTCTGCTGCAGATATCAAGCAG
AAAAACATTGAAGCCATTAAGGTTTGTTCTAAAAGCCATTAATATTGAAT
CTGCAGTGCTCAGCTGGTATACTACCAGCAGAGAAGTTTCATCTGTTATT
AGTGATGATTGTCTAAAAGGAGAATAAAATCAATAAGGAAACAAATGGTA
CTCAGAAGTTTGTTTCGTGTTGGTTGACTTTAGGGGTAGTTGTAGCTGAT
TTGTGACTTAGCTGGTTAATGCTAAATTTTCGGAAAGTCCATCATTATAG
CTGGATGTGCTGTCCTGAGGAGAGCTTGTCAGTATCTCTATTAGAGCTAC
TATATTTGCTTCTTGCGTGTACTGAGCATTTGGTATCTTTGTAATTGCCC
AAGTCATTTGGGTTGGCTGAGAAAATGTTAAAAACTTACTGCTCAGAGAA
CTCACCTTTAGTCTCGTTTGGTCTGCCATTTGAATGGTTCTGCTGCACGC
TTTTATTACAAGCATATGCCGTCGTTCTAATTGCAGTTTTCCATATCTTA
GAGCATAGTGAAAAAAAATCAGTTTTCCATTCTCACATTCTTGCGGTGGT
GGATTGCCTTCTAGGCAATTATGTTGATTGCAGAAGAAGATGGAAATTAC
TTGCAAGAAGCATGGGAGCACATATTGACTTGTGTTTCTCGTTTCGAGAA
TCTACATCTTGTAGGAGAAGGTGCTCCTCCAGATGCCACTTTCTTTGCAC
TGCAACAGCCAGACCTTGATAAATCGAAACAGGCTAAATCCTCGATTATT
CCTAGTTTGAAAAAGAAGGCTCCGAGTGCTGCTTCTAAAAGAGGTACTTA
TGACAGTGCTGGTGTGGGTGGAAAAGCTTCTGGTGTTGATCAAATGAATA
ATTCAGTGACAATCCTCTTGGAGCAAGTCGGGATGGCTGAAATGAATCGT
GTATTCGCAAGAAGTCAAAATCTCAATAGTGAGGGCATAATTGATTTTGT
AAAGGCCCTTTGTAAGGTTTCAATGGAGGAATTACGGTCCGCATCTGATC
CACGAGTTTTTAGTCTGACTAAGATTGTCGAGATCACGTAAGGAATGCAA
GACTTCACATCAATAATGTATCCACATTGCAATATGTTTTATTACACTCT
AGTTACACTATATAGTCACAGAAGTATGATTGTTTATTTTTTTCTCTTGT
AGGCATTACAATATGAACCGCATCAGGCTTGTCTGGTCAAGCATATGGCA
CGTCTTGTCTGATTTTTTTGTTACCATTGGCTGCTCTGAAAATCTGTCAA
TTGCAATATTTGCTATGGACTCGTTGCGGCAGCTGGCAATGAAGTTCCTG
GAGCGAGAAGAACTTGCGAACTACAATTTCCAAAATGAATTTATGAAGCC
TTTTGTTGTTGTTATGAGGAAGAGTAGAGCTGTTGAGATAAGAGAACTGA
TCATCAGGTGTGTATCGCAAATGGTATTGGCCCGTGTTAGTCATGTGAAG
TCAGGATGGAAGAGCATGTTTATGGTATGTTATCTTTACTTGCACTATGC
ACCTTGATTTTGGTACGAGGCTGTTTGGAGTAGCTTTATTAATGCAATGC
TGATTGTTGTGTGCACAATGTTTTCAGGTTTTCGCAACGGCATCATATGA
TGATCACAAAAATATTGTACTCTTGGCCTTTGAAATAATCGAGAAGATTT
TGCGAGATTACTTCCCGTACATTACTGAGACCGAGTCGTCGACTTTCACT
GATTGTGTGAACTGTCTTATTGCATTTACCAACAGTAGGTTTAACAAGGA
TATAAGCCTCAACGCAATTGGTTTTCTTCGATTCTGTGCGGCAAAGCTGG
CAGAGGGTGACATTGGATCCTCTTCTAGGCTGAAGGAAAGTCCATCTTCA
AACAGCAATGCACTCTCGCCTCATTTGACCAAGGTTGGAAAGCAGGAAGG
TGCAGTCCATGTTGACAAGGATGATACTATACACTTCTGGTTTCCTTTAT
TAGCAGGTAATTACGTTCGGCTCAAGGTAGCCTTTCTACTGCTTTCCTTT
GAATTATTTTCCAGTAATAATGCGTGGACCCAACTTTTCAAACCTTGCAG
GATTATCTGAACTTACCTTCGACCTTAGACCTGAAATTAGGAAAAGTTCT
TTGCAGGTGTTATTTGACACATTAAGAAACCATGGTCATCTTTTCTCTCT
TCCTTTGTGGGAGAAGGTGTTTGATTCAGTACTTTTCCCAATATTTGACT
ATGTACGGCATGCTATTGATCCATCTGGTGGTTCTTCACAAGGACAAAAT
GAAGAAAATGATCCTGCAGAACTTGATCAAGATGCTTGGATGTACGAAAC
ATGCACGTTAGCCCTTCAGTTAGTTGTAGACCTTTTTGTCAAGTTCTATG
ACACTGTCAATCCACTTCTGAAGAAAGTTCTTTCGCTCTTGACAAGTTTC
ATAAAGCGTCCCCATCAGAGTCTTGCTGGTATAGGCATTGCTGCATTTGT
TCGTCTGATGAGCAGTGCTGGATCTGTCTTTGTGGATGAAAAATGGCTAG
AGGTTGTGCTGTCTTTGAAAGAAGCTACCACAGAGACACTTCCTGACTTT
TCTTATATCTCATCTGGAGCTTACCTTGAAAATGTATCAATAGAAAATGG
TGACTCTTCAGATAACAGGGAAGAAGAACCTCGACCATCAGAGGATGGTA
CTGAAGAAACCTCTAGATCAAGGAACTTATATTTCGCAATTGCTGATGCC
AAGTGCCGAGCTGCTGTTCAACTCCTATTGATTCAGGTCTGTAGTATTTG
TTCTTATCTTGATTCTACCACATCTCTAGTTGCACTGTAGGAACTGATTT
GTTGATTCATAGGCAGCAAGACTCTAATGAGAATGGCTTATAATTCTTAG
CTTGTTTGACTGAAATATGCTAAATTTTTCCAGATTTAACTCTACTTGAC
ATGACAAGACAATATAGATACAGTATGGTTGTTAATTTCATACCTTTTTG
CCCCACAGCCTTATCTAGCCATTTTTAAGTTACTAAAGCAAAATTCTAGT
CTTCTTCATTAATTGTATTTTGTGCACGTGCTCTGCTTTATCATGTTTCT
CATGCAATAGGCTGGTAATTTCAACATGACCCCTGTTTTAATTACTTGTA
TGTATTCACTTTCTGTAGGCTGTGATGGAGATATATAACATGTACAGAGC
TCAGTTGTCGCCGCAGAACACAATAATCCTCTTTGAGGCCTTGCATACTG
TTGCCACTCATGCTCACAAAATAAACAGTGACAATGACCTGCGGACCAAG
TTGCAGGAGTTGGGCTCTATGACCCAAATGCAGGATCCACCATTACTACG
CCTTGAGAACGAGTCATACCAGTTGTGCCTCACTGTTCTCCAGAATATAT
TTTTGGACAGAGCTCCAGATGAAGGGAGCGTAGAGGTGGAACACCACCTT
GTTAGCATTTGCAAGGAGGTCCTTGAGGTGTACCTGAGCACAGCAAGGCC
TGCTCACCTTTCCGGTGGTATACAACCACTTGGCCATTGGCTTATCCCGG
TCGGTTCTTCAAAGCGGAGGGAGCTTGCAGCCAGGGCACCCCTTGTTGTC
TCAACCTTGCAAGCTATCAGCGGTCTTGGTGACTCATCTTTCGAGAAGAA
CCTCGGCCAGTTTTTCCCCCTCCTAGCTGATCTAATAAGCTGCGAGCATG
GTTCAGGCGAAGTGCAGGTGGCCTTGAGTGATATGTTTAACACTTGGGTT
GGCCCACTCGTGCTTCAATCCTGTTGATGCTGAGCACCCTGTGATATAGT
ATACCTCCACATGTAAGTTATTCTTTGTTTCAGTGTTATATCGTCAGATT
ACTCCCTTTCCCCCATTTTGTTGTGTTCATCATTTTAGTTGTGGGAAGTG
GTTTCCAGCGGAACTACTCATTGTAGATCTTTTTCCCTTCAATGCTCTTG
GTTTTCCGCATTGGGAAGAATGTATGTTACAAGATGATTAAATTGTATGC
CATAGTATAGTTCACCAAGTTTGGAGCAGTTCTGCTATGCATGTTGTAGT
TGCAGCTGTTGAAGCACAGGCAGCTCCAGCATTGTGTTGAGCATTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.