Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE020387

[Submit comment/correction]

Sequence	AE020387
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE020387
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCCACCGGCTCCCACCCCCCAACTCCAACTCCAACACAGCAACACAGCAA GGTGGTGGTGAGAGAGGAGGAGAGACGAGCGAGGGAGCGAGGGAGCGCGA GAGAGATCCAATCCGCTCCAATCCAGCCCCGAGCCGCCCCCGCCTCTTCC TCCTCCGCCGCGCTCGCTTCGCTCCGGTTCGCCTTCTCCCGGCTTGCTTG CTCAGGCGAGGCGAGGCGAGGTAGGTTTGGGGGCCTCGTTTGCCGTTGCT TCGATTCGGCTCCCTCCCGGGCTCGGTTCCGCGCCCAGATCCGCGCGCGC TCGAATTTTCCAGCGGCCTCCCTCCCCGCTTCTCACGTCGGGTGCCGCGT TTGCTCGGTGCGTGCAGGTTTGGTTGGCGGCGAGGGAGGGGGATCGGAAT GGGCGCAAGGGTCTCCAAGGCCACCTCCTGCTGCTGCCTCCGCGGCCAGC TCCCCGGGAGCACGCGCCTCGACAACGCCGATGCCGGTGCGTATCCGCCT ACGAATCCTATGCTCCCTAGTCCCTACTAGTAATGCTTCCTGCCTGCTTT GCTCGCTCGCCTGCCTGCCTGTGCTCGCTCGCCCGCGTCTCTGTATTTTC CTCCTGCTACCTCTGCCGCTTCGCATCCACCTTCTCGAGAGACTTGTCCG TCGGCTTCCTGCGCGAGTTTCCGCTGTTTATCTCCTCTATACTTGCCGCC CCCCGCCGAGATCGTCGGTAGGGGTGGGATTTGGGGTGCTTTTTCCGACT CCGCATTTGAGTCCAAGGGTCATTCGCTCGTTAGGCCTGCGCATTGACCA TACTACTGCCAGATTGGCTTTATCCGTGTGATGGAAATCAGAGCAATCTG ACTGGAGCAACCTTTTTTCTTCTCCGTGTTCGCCGCGCAGTGGACGAGGA CCAGGGGGAGGCCTACGAGCTGCCGCCCTTCCAGGAGTACTCCTTCGACC AGCTGCGGCTCGCCACCGCGGGCTTCGCCGTCGACAACATCGTCTCCGAG CACGGCGAGAAGGCGCCCAACGTCGTATACAAGGGGAAGCTCGACGCGCA GCGACGCATCGCAGTCAAGCGCTTCAACCGCTCCGCATGGCCCGACGCGC GGCAGTTCCTGGTATATGCCTGTCCGACGCCCTTCGCCTATCATCCTTTC TAGTTTCTACCAACAATGTGCGTTTGGTGGGGTGTTAATGGCAGTTAGTT ACCTGGTTACTCGCGGTGTTTGGTAGATTATTTGCAGTTTTTGGCTCCAT TGAGAATGATGTATCCTGTCATTGAGGTCGTTGATTTCTACCTGTTCCTG TGGTGGGTGATACGCATGCTTGTTAAGTTGCCTACTCATTCTGCTTCTGG ATGGATTCTGTGCTGGCTGGCAACCAGATGAGAGGGTGTCATCTGCCAAC TGTCTGCGCAACATATTGTTTTCTTTTTCTAGTATGATTATTAGATTCCA ATGCCAAACCAGTGTGAGACAGCAATCATTACCAGCCACTACTTAGTCCC ATACTCCCATCATTGTGCTCCTCTAATGCTATTGGCAAATCAATAATTCT TCATTTTTACCATCTCTATTACGTTCTTATCATAATTAGCATCGCTTGTT ATTCTATTTATTATCATGGTCACGTTTTTTTCTTACTGTACCAGGACTAC TACTTGCTCTGGTGCTTTATATCACCATTTGCTATATGTTACTCCCTCAG TTCCATAATGTAAAATGTTATTACAACCAATATGCTCATATATTGGTTGT AATAACATCTTATATTATGGGATGGAGGGAGTAGTATGTTACCTCATTGA TTATCTTTGTCTTTTAGGGAGGTTATTATTACTTTTAATTACATGTCCAG GAATATGTAGAGGATTTTAACCAATCTATGGCAGTGCCTCCTGCCCTCCT CTATGTGAATGACATTTTGTTGCATTTAAAACATCTTTTCGTTTGTTGAT ACATTTTGTTTTGCTTGACCTGTTATACAGTTCCAGTATTTTTTCTAAAA TTTGCCCATGTCTGTTGGGGAAATAATTATGTTTCAGGATGAAGCTAAAT CTGTTGGTCAGCTCCGGAGCAAAAGGTTAGCAAATCTGCTTGGCTGTTGC TGCGAAGGTGACGAGAGATTGCTTGTTGCGGAGTACATGCCTAACGACAC ACTAGCAAAACATCTTTTCCACTGTGAGTTACCCTGCATTTTCCAGTTAT AATTATGTTTAGCTCTGCCTGCTATTGTTATTTGTTCTCGTTGTCAACCA AAACCTGAGTACTTATAAGTTGATGGCTTCACATCTTTAATGATTGGTTT ATGTCTATATTTTGCGTCATAATCGGTTTAAATTGTCTGGATCATCCCTA TTCAAAACATTGTCGCAATGACTGTTGGTACTTGTTACATAATGCAGAAG AGTAATAAGATACCTGTTCTAGACACATTAGGTCATGCAACTCAAATAAC TAATTGTGTGGTATACGGAGTCCTTAATGCTTTAAGATCAGTGATGTAAT GATTCCACATTATTTTATGCATTTCACAGGGGAAACCCAAGCAATGAAGT GGCCCATGAGACTAAGGGTTGTTCTCTATCTTTCTGAGGCTTTAGAATAT TGCACAAGCAAAGGGCGTGCTCTCTACCATGATCTTAATGCCTACAGAGT TCTGTTTGATGATGTTAGTATCATGCAATTTGTTTTTCCAGCATGGTTAA CTTTTGTTTGTATGTGCTTTTTGTAAAATCTGTACATTGTTTACATGCTG CAGGATTGTAACCCTAGACTTTCATGCTTTGGCCTTATGAAGAACAGTCG GGATGGCAAAAGTTACAGTACCAATTTGGCATTCACTCCCCCTGAATACA TGAGGACTGGTTGGTGCCTTCTTATGTTGCTAGCACCCTATAACTTCCTT TTATGCAGCACTCACTGGATGATGTTGGTAGAGTCTCTTGTCAGGCTCAG GCTACATTGTTACTGGGCTTTCTTGCAAAGCTGCTATGTTCTACTAATGA TGTCGTTGTATAGTTTGAGTTTATACCTTGAGTTTGTTTCTGTGTGTGGA GCATCCTTAACCTTTGTTAAGTGGGGTGGGTTCAGCTTCCTTAATATCAT GTTGTGTCATAATATAGCACCCACTTTCATAATATGGTACATTATGTTCT CAGAATTTTTTTGCACCCTAATGATTTGGTTTGTCAAGTAAAATATTCCC AGTGTCTTATAGATTAGCTTGAACTGGTTGAAGATTAGAGTGTTCCATTT ATGTTCTTTGTACTAGTCTGTCTAGGCGATAAATCCATCTTTTCTTTCAC TATGCATAGGTTATAACGCTTGACTGCTCTTAAGTTAGTGTTGTCATTTT TACACCACAGTTCACCTCTAACATCACCCTGTCACTTCTCTATTTACTCT GTTTAACTTGGCAGGACGTATCACACCTGAAAGTGTTATATACAGCTTTG GGACCTTGCTACTGGATGTTCTTAGTGGGAAGCATATTCCTCCGAGCCAT GTAACAACTTCAAGCTTTAGTTCTTTCACATCATTTTCTATCTTACTCTG TTTGCTTCTTAGGTATCATTATACAGTTATGGCTATCATATGTCAGAATT GATCTTATGTCGATCTAGCTGTCTGATAGGTAGTTTGACCTGGGAGTTAC TTGATCTTTTAGTTTTTTTTCCAACTGGCTTTGGGTTTTCATGCCTGTGG GGCAATGTGAAACTATTCTCCGTACATGATATTGTTCTTCACTGTCAGTG TAAATATAAGACCTTATCTCCATCAACTTGCATGCTAGCAAACCAACACT TTTGATAATGGATAAATAATTTGGTAGAACAATACTGGCACTTGACTTTG AACCAGTTGACATTTAATACCTTTATCTTTAGAATACTAACTGAGACTAG TAATATCTGCAGGCCCTTGACCTGATTCGAGATCGGAACTTTAACATGCT TACAGACTCCTGTTTAGTGGGTCAGTTTTCAAATGAGGAAGGAACAGAAC TCGTGCGATTAGCTTCAAGGTGCCTGCACTATGAACCCCGTGAACGGCCT AATGTAAGATCTATGGTTCAAGCATTGGCTCCTCTTCAGAAGGATGTTGA GGTGAATTCATTTCCTTGCTCTCTCTAGAACAATTGAATTCATGCTACTT CCTGTAAAATTTGGTTGGAAAATGGCACCAGGGGTTTTGATACGTGTAAT GCACCATTCAGTCCTTGTCTTCAAATAAATCATTCCCATCTCTAAGCCTT GCACATACTACTGTAGTCTTTCCTGGCAGTTTTCTTAGCCTGACAGTATA ATTGAGCATGTCAAGGATCAATAAACTGGTAGACCATTTTAAATTTCAAT GTGAAAAATGTTCATATGTCGAACAGTCTTAACTAATTATTGATTTGACT TCAGGTCAACAGTGGACATGAGTATAGTGTTATATAACTGCCGTGGTGTC AAATTGTTTTGCAGGCTCCATCTTACGAGCTGATGGATATGCCTCAAGGT GGTACATCATCTGTCCAATCGTTGCCTCTTTCTCCTCTTGCCGAAGCTTG TTCTAGAAAGGATTTGACAGCAATACATGAAATTCTAGAAAAGACGGGGT ACAAGGATGATGAGGGAACAGCAAATGAGGTACCTTAGGTTCTGTTTCTC ATTAATTTTCCATTGAGGTATAACGACATTGTCTTTTGATTTGTACAAAC ATTTGATATGAAACTTTGTTTCTGTGTGTTATACCTTGGCACAAGATTAT CAGGAACTAACAAGCAGGCAAAACATCTCTGATGTGTTGAACAAGTACAA CTAACATAATCATCAGTTCATTTAGGTGGTGTGATTTTTATTTTGACCCA ACATATATCATCACATATCTTTTCATGGCATGCGAAATGCATTTTTGGTT GATTGGAATACAGATATCACATATCTTTCAGGGAAAAGTTTTAGTGCAAG ATCTCTTTGCATGATCATTATTTTATCCTAGAGCAACCCAGGTTAATGTT AGTTTGATTTTTTTCGATAAGACAATATTAGTTTGATGTTCCAAACAGAT TTCCCTTTGGACTTCTTGATTGCGGTGTGTTGGTGATCATAGTCTATCAA GTAGTTAGGCAATCAAAGATTTTATTCCTCCAAGTTGTTTTTGTGTCCTA TTCTGTTCTTATTACCGAGTGGTCTGGTTAATATGTCTGAATACCAGAGA TAGGTACTCATGGAACGGAGCCTTTCAGTTTCTTCTGAAACATTTTGCAA GAGTTTGCACTACATTAAAACATAAAACTAGACTGATACTATCAATAGCT ATTTCAGAGCTGAAACTATGTCCTGTAACATTATCTTGAATAATCTTTGG ATTTCTACATTCCGATGCGGAGAATTGCCAAAGTCTTCAAACATATCCCC TCTTTCTCTCTGTTCTTGGAAGGCCTGTTTTAAGAACAATCATAGATTTG GGCAGAGTCTAAGATTCCCCTCCAATCTTTTGATAGCTTCTCTAGCCTAA TGTTGTAAATTTAGTATTTTCTTGGGCTACGCTTGTATATATTGTCTTTT ACTTCTAGTAAAATTTACTATCGGGCTTCCTTATAGTTCTCTGAAAAGAT AACTTTGGATTTGTAATGCAACATTGGTACACCACTTGTTTTACTGAAAC TACTACAATTGTTTTGTTTGTTGTTACCTGATATTTTTGTCCTCTTCTTT GCTGCAGCTCTCATTTCAGATGTGGACCAATCAAATGCAAGACACATTAA CCTCAAAGAAGAAGGGTGACAGTGCTTTTCGGCAAAAGGATTTTACTACA GCTATTGATTGTTACTCCCAGGTCGCATCACTTCTCAGTTACTTATGTTC TTCTATACAAGTTGACATGTTACTGGAATCTCATACTGAAATGTCACTAG TGTCCTGCCTAGAATAACCACCTTTAAGCCAATGTTGACCTTGTTCATTC TGCTTATCTGTGACATGCAGTTCATTGATGTCGGTACGATGGTTTCCCCA ACCATTTATGCTCGGCGTTGCCTGTCATATCTGATGAATGACATGGCAGA ACAAGCTGTCAGCGATGCAATGCAGGCGCTAGTAATATCTCCGACGTGGC CGACTGCATTTTACCTTCAGGCTGCAGCATTACTTTCTTTAGGGATGGAG AACGAAGCTCAAGAAGCGCTCAAGGATGGTTCTGCCCAAGAGACGAGCAG CAGCAGTGGACGCTGAATATGAACTGATTTCTTGTCCAGAAAATGCACAT AATTTGAGGTACTTTCTTTTACTAAATCTTGACACTGTAGATTTGTAGCA CCTCGCTTAATTTGAGAGTCTAGGGAATTAACCAGGTACTCAGGGGGTCA TGACTAATATGTCAGTTTTGCTTAGCTGGAGTTAACCCATGGATTTCTGA AAATGTTTCTGCAATATGCAGTTACATTGTGGATCATGCAAGTCAAATAC AAAATACAACTTAAATTGTACACTATTTTGTTTTGTTGTAAATGGCATTA GCTGCTAATGTGTTTCAAATAGCATTGTTGTCACTTGGAAGTCAGAAAAA TTGTACGCAATCAGGAAATTTTGGTTGCTCAAGATATTCTATGAGCAAAG AGATAATGCACTACTATGAATACAGACAATAAAATGACTTGAGATAATCT ATGAACAACAGATGCTGTACTGACTAGAATTTTGGTTGCTCAAGTTTTCC TCATTATTCTACTTGTGCCCCAGGTGCTCGCTCGAACAAAATCATTGGGT ACGGAAGCAGCTGTTGTTCATCTGTCAACTTGGCTAAGTGTTCTTTGAGC TGTGTGCGAAACATCCGTATGTAAATATGGAACAAAGCGACAACAGAGAT CAGGAAAGAGATGCGCCAAATACATTGAAGGATGAATAAGTCCAGTAGAC AGGAAATTTTTTGTGGAAAAGGAAAAATCTGTATCGGTTCCTCCCACCGA AAAAAGGGTGGAAAAAAAAAGGATTGGTGTTGTACATCTTGCTAGATGTT TGAACTTGTACAGTTTTTCCTTTCTAGGGCAGCAACGTCTTTGGCCGAAT GGTTGCTGAATATCCTCAATTTCTATCGCCATGGTTTCGACGATTGCAGT ACATTTTTTCTTTGATGCGAAAGGTTGGAAAAATATTGCATTTGGTGATA AAAACTACCAAGACTAATATGTTCAGGAAAAATTCCATAGTTTCCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.