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GrainGenes Sequence Report: AE019280

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Sequence
AE019280
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE019280
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCGGCAGGAATCGAGTGGACGGGGCTCGGGGAGCGATGCGAGAG
AGTGTTCTACGTGATCGTGATGGGGTTAGTGCCGAGGTGCGTGGTGTGCG
TGTACTGTAGATATGCGTGCGTGTATGTTGGATCGGTGTGTGAGTCCGGT
GTGTGAGTGCAGCTTGCATGGTGGACCGAACATATGTGTATGACCGCCTT
TCTTTCTTTTTTAATTTTTATATTTCTTTTTCCATATGCTTTTAGAAATA
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CCGTCACTTGAACATGATCATTGCAGAGATTAATGGCAAGAAAGAAGCTT
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TGCAGGAGCTGAATAGGGATAGATCTGATAAACAGCAGTTACCCATGCTG
AAAGCAGAGATTGATGGCCTTCAGCAGGAACTTACTCATACAAGGTACAC
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CTGAGTTGGCTAATCTTGATGCGAGACCATGGGGCACAGGTATGTAATTT
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TACTGCATTTCTTTTGAGAATCTGCAATCTGCCAGGTTTATAAGAAACAG
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TCTATATGCTCATTTCTACAATGGTGCCCTGTTAGGAGTTAGGACATGCA
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TACTATTTATTCCATGTATGGAATCTTAAACACATTTTGTAGGACACCTA
TTTGCAAAGCCATTCGAAGCATGGAAGTTAGAAAAACCTCGTTGTTTTTA
CGAACTAGACTAAACATGCCCAGCGGCCATGTGTTTGTCATTTATGGCAT
AATGAGATTTACGTGCAATTTTGGAAGATGCCATCACTACGTGCACCACA
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GCAACTGCCATTGTTATCTGCTTGTGTGTGGCGTGATAAATGATATTGAT
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ACATGAGAGGGAGGGAGGGCAAAACTCTGTTCTATTTTCTTCCTTCTCCT
TTGTTGAAAGATTGGCTGCTTACAAATTACAACTAGAGATAGATTGCAAT
AAGAGAGATAATATATATTGTTTAATATGTCTTCTACTTTTGATCCTTTC
CTGATTCGCACCCTTAATTATATCCTAATTTAGACTCACACTCGTATGTA
AATCTAAAGACCTAACATGATGGGAAGGTTAGGAAAGTTCTAGCCATCCC
GATCATGACATGCCTCCCAATTTATAGTGAATTTTGAGTTTGGAAGTCTT
CGAATATGAGAAGAAACCTCCTGATTTTTTTTGGTAATTTTTAGTTTGAG
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AATGACACTTACGTTATAAGTACATGGGCAAATATATATTTTAAATCGTA
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TCTGGGTATGCAAATTCAAAATAAGAAGTAAAAACCATGCTGAATTTTAT
ACCTACTACGAGTCCGAAATGCATATTTATGGTTTCTCTTTGCTGCAGGT
ATGAATGGAAATCATTTTTTTTCTGTTAGTAGGAAATTGTCAGTTAATCC
TGCATTTCATTTATTACATGCTTTAAAAAGATGAGACCCAAGGGACTAGC
ACCCTCAACACATTATTAAGAAGACAATGGGATACACTGGTTTATTAGCC
CCAGGGAATAAATCAGCAAGAATTAATCTGACCCGTAGCCCAATCTTTTT
CGCAGTTGACCTTCTACCTGCCTCAGCAGTACCTTTGTTTAACCGACCAA
TAAAAATCATAAAACGTATTATCATGCTTTCCACAATGGTAAACACAGGA
GTGTTCTTGCCAACAATGAGAGCATAAATCATCATAGCAGACTTATGACT
TATCCTAGATGAGGATTTTCTCCAAGCTAGACTACCTGAATATTATCTCT
TTATCAGCGTCACTCTCATGGTACTATGTTTACCTGCTCTTGAAGGTGGA
GCATATGGGATGAAGCTGGGCAGTCCTGAAGCGACCTTCCCTACTCAATA
TGGAGATAAATACAATATCCATTCGGTATGATCTTTTGAAAGATGACATC
TTCAAGGAATCTCATTCTTTCCTTATCGTCCTATGATGATTTTTTCATCT
AATTCCGAAATCTACTATTTTGTTACCAGGGAGTTTCTGACAAAGGTCCA
TTGCATCCTCCTGAGTCTTCGTGGGGCACATATGACAAGAATCGTTTCCA
GTACCGCTAAGATCCCAGCTGATACATTCCTGGGAGAAAGAATCACCTTC
TAGGTGTTAATGATCATATCACATGGTTTAGAGTATCTTATCTACCTACT
TGTTTGTGTTAGACTCCAGACTTCTTCAAATGCTTCTTATAATTTTGCTT
TCTGTGTTAGTTGATAAAATTTGTCACAGCAGTATCCTGTTACTATTTAA
ATTTCGGCTCCAGATCTATGCATGTTACTAGGATATCAAGGTATCCTGGT
TATATGGATCTATGACTGGCAGATATTTTTACATGGCTTGGACTTTGGAC
ATATATGATAATACATTAGTCGGAGTGACTTAGTCGTGCCACATATAGAG
CATACATTCTGAATTTAATATGAAGCCATGGAGGTCATAACTGATGAACT
TTTAATATACGTATTTACAATAGCTTCCACCATGCTGCACAAGGAATTAA
TGAGCTTGAGATGATACGGGTAGTGCATATGTATGTGCATAAAGTTTACT
CCTGGTGATAATCAAGTGTATGGTTTCTCTCATGTTACTTAAATAATGAT
AAGCTATGGTGGGGTTGTTAGTCACTTAATGCTAGGTGATATTAAGAGTT
TATACTTCATAATTATTACCAAATTATTCCAACTTGTCAAGCACATTTTC
TGTAAAAACTGAAGCCTTCTGGTTATGTGACACCATCTCCTCACTGACCA
TATTCTCTACATCTAGGTTTATGTAGGCCGAAGTTGTCCCATGTAGCGAT
CATATGTTCTCTAGATTTATGTCAACTGCTGCATATTTGAATGTGTAGTG
GATCCAAGACTGTTATCAACAGATAGAGATCACTAGTTGATATTTTTATA
TGAAAACTGATCTTACCTCCTTCAGTCTATAAGACAATACAGTGTGAACA
AGTCTACATTATGTAGGTTCATTGTTAGTTTTTTTTGAACTTCTGGGCAG
TAAGTTGTACTGCTAAACTCGATGGCAGTTTTAGCACACAAGTTGTTTCA
ACTGAATTGGTTTGCATCTGATACTTGCATCATCAGTTTTCTCAGTTTGT
AGTTGTCTTGTGCTTGATGAATTTTAACTTCCACACCTTGTGTGAGCATG
ATTATAAATTCTTGCTCTGGCACTTTGTGTAGATTTTAGTCAAGCTTTTA
CGGTACTAGTCTGACTACTTCTAGCATATTTTGGATTCGGAGTCTGGTCT
CTGGTGTCTGAAGCCTTAGGGGGCTCCTATTGGTACATGTAGAGAAGAGC
GAGGCTGTTCAGAGACTTGTCGCTTGTTAGATACTAGATGTTCAGCATCA
GTTCTTACGCATGCAAAGATTGATCGAGGAGCTCTTTTAAGGAAATCGCA
GCTACCATTAGTCATAGGACTACTGTTGGACACTGGCGTACCATGGCCTC
TCTTGCTCCCTGAAATTAGTAGAGTGTGCATCTACATGCCACTTTTCTCA
TTCTTTTCCTGGCTTGATGCTGTATGCATAAGGCTGTGGCATGATAACTA
TTTCTTTTTTTTTGTGCCTATTACCCACTTGGCTGCCTATACCTATGTAG
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GTAGCTCCAGTATCCAAATTTCAGTCAGCAGTTCAGCTTAGTATATTGGA
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TATTTAGAGTACCGTTCCTGAACTTTCTTAGCATTGGAAGATTTTGCTCA
CGTCGAGAACATGAAACCATACAGTCTTTGTCGTGGAAGACAGAGAGCAA
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TGGAAGCTTATGCCGCATCATGATCTGAGCCTTGCGAAGGCCACGACCCT
CGGATCTCCCTGGAACAGATTTTAATGGTCTCCACAACTCCTAGAGAACT
GAAGACTGGAAGAAGTGCACTCTCCGTGATAGGCTAGAGTACCTACCGGA
TTTTAACACGGAGGATTCTTCTTGGTTGAAATCCATTGTGATTGGCTCCG
ACACAAGATGTTGTTGTGCATAAACAGTGCTCTTGCGAATGGAAGCTTGA
TGCATCCTTCACTTTAATGCTCAAAAGAAGTGAAGATTCTGAATAGAAGT
TGGCTTAAGAGTGCAGTGCCTGAGCCCCTTGTACAGGAGAACTGGGCTCA
ATTTGTGAGGAGGGGAAAGCATTCCAAATTTTTTGTGTGAAAGCAGCAGA
TGGAAGGTTGATGCGTTCTTTCATGGGATGCTTAAAGCATAGTGCAGGTT
TGAATAGAAGTTTGTTGAAGAGTTAAGCGATGATCTGACTATGGATAATC
TTTACCTCTATTAGGTGTTCCAACAGGATGGACTTAGTTATCCCTTTGTA
GAGTTCGGATTTTGGGTGCTCTATGGGATTCAATTGCTTTTATAGCGTGT
CAGGTTATGGAGAATCTTTGGCAGAGCTTATTGACTGAAGTTGGCCAGAG
AGTATGGTGCCTGAATTGCATGAGCTCTTAGTGCTGGAAACCTTTGCTCA
GGTTGTGCGAACGGCAAAGAATTCTTGTGCTTTTTCATGACAGCAGACAG
ATGGAAGTTTGCTCTTTGATGCCATTGAATGCTTAAGCTGACAGGCAGAC
TACTCTTGAGCAGAAGTGGGCTGGAAAGGTAGTTGATCTTCGGACTATGT
GGATTTTTAAGGATTTAACCTTGTCTGTTATAAGTCCATCTGTGCATATT
GAGTCTGAATGGGCTTGAGCTTACTTAGTCCATGTACAGAGCTTGTAGAT
AGTTGTTATGCTGCTGTTCTATTTTGTGTATCACTCTGTGAAGGGTCAAA
GAGAGATCATTTTGAAGCTCTCCAAATGACAATCTGGTGATGGCTTACCA
ACCTTGAGGCAAGTAATTTCTTCATCAACGCCACAAGTTATGCTGGGTCT
CTTTCTATTATTTTAAACGATCATACTTGATAGTGCACATTCATTAACCT
CTAGTAGTATGTTAATTTCCAGTTTTATATTTGGTATTCAAATAAATCCG
GTGGAACCCTATTAGTTTTACTGTAGGATAGACCTGAGAATTTGTTGTCA
GTATGCCATGTGTTGGAGAAGCCTAGCTAGTAGGCCGGTGTTCTAAAAGT
CAGCCAAGTTCAATTTGAGCTCGGCACAGCGTGTCTGAACGTGTGTTGAG
GTGCAGTATAGGCCGCATTGGAGCACACTGGTAAGGGCGGCGACACATCT
GTGACTGGAGGAAGACAAGGCCACGAGAAGATTTGAGCCTAAGTGGTGGC
GTGGGAGATGATCCGATGGGCTGTATGGGCTGATCAGAAGCTTTATCCAC
TTTAATGTCCTGGTTGAGTTTATAACCATATAAGGTTGAAGCAACCCTAG
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TGCCCTCAACCTTCCGCCCCTTTTCTTTGGCCCCCTCCCAGTCTCTGCTC
TTTGTCTCCTCGTCATCCTCCTTTGCAGACAGTCAGCATATGTTGCATAG
GGCAGACTAGGCGCTAGTTCGCCCCCTGTCAATCAACCGGTGCATGCCAA
TTTCCTTTTTCCCGAACACACATCAAAATGCGTGTCGTTGTGTATTAGAA
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AAAAGACATGACCTCTCTCTCATGCCCCCACCCCCACATCAGGAGACCTA
GTAAAAAGCCGGAGCCTGCGTTCGCCTTTGCACTTCCATCTTCCACAGCT
CAACCTCGGCCAAAATTGCCTTGACCAATGACCACTACCTGACAGTCCAG
CCCTGCATCTGGCGCCTAGCAATTTAGTGAACACTGGTTGTGTTCATTTT
CTGGTGAAGAGCCTGGATCTGGTGATTAATTGCCACACATAAGCTTATCG
GAATGTGGCTTTAACATGTTATGGAGTTAGGACTTACTGTTAGCATGTTG
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TACTTGGGTACTTGGAGCGACAATCTGATCTGAATTGTATTCAAGATGAC
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TTTCAGGTTCTTGAACCTCTTAAAAGTTGGCACTTCTTTGGTGGATGGGA
TGTGGCTGGAATTTGTTGAGAGGAACTGAGAACAATTTAACTGTACAGAT
CATATGTTCTAAACCATGGGGTTTTACTGTGCAACTAGTATCACTGGCTT
ACTGCTTCAGGAGTGCAGTAGGAAACAGTTCAAACTTCATAGTTGATTGC
TTCATGTCATCCTGTTAGTTTTGGAGAAACATTGTGATATTGGCTGTTTC
CACATTAGGTGTGAAGAGAGATAAGCAAAGTTAGATTCCCTATGCTGTGG
GGAGATGAGTAGCTGCTGAGCAGAGGAGCTTCAGAAGGGAAATTGCCCCT
TTCCCTTGGAAAATGTTACTTTGCTTTGTGTTTTGAGATTTTCACCTTAC
GTTTTACTTTCGTGAACAAAAGGAGGAATACAGAAGCCGTATCTTATTGG
ATCTGCAAGAGGAGTTACTGACAGTAGGCCATGATCTCCAACTTTATGTG
TTATATGGGCTGGGTTTGGCATCGTAGATGATAGCTGGTGGTGACGGGAG
GCTGGCACAGTGACAGGAAGGTTAGATGGAGAGAGGTAGAGAAAGTACTT
CTTGCCTGCCTAATTGAAACCCGTGACACCTCATATAGCCCTCCTTACAT
CTGATTCTAGCTTGACCATTACGTCCATGATAGTGAAGTTTCCATGGAGT
GTACTGTTTCTATCGTACTAATATTCAATGTTTGATTGTTTACAGTTTTG
CATATTCGGTGTTATTTATTAACTGTTCTGTACAACTCTTCTGATCATAT
TGTAATTCGGATCATAATGTCTAACACAACTGTTGTTTGTCTTACAGGTC
CTTTTCCTTTGGCAGAAGGTATAGTTCATTCACGAGGAGGAGTTACTGCA
AGAAAATAGTAAATATATCGGGATAACTGTTGCCTTTCTGATGCTGAAGG
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CCTTGAATGTCAGGCCGTGGGTGATTGTATTCATCTGCAGGCATTATGCT
TTGTTGTGGTTTTGAGGGAAAGGCAAACTTGTGCTTTACTGGAAGCCTCT
GCTTCGTGTCAGTGCCATAATAATTTGGAAGTTCAAAACAGATTTTGCTG
CAAATTGTATAGGTTACGGCTTACCCAGTTGGTGGGTTGAGTTGTGCCAG
CTCATGATGTTTCCAGTTGTTCCATTTGGATGCATTCACCGGTTTGGCCA
GCAGTGGAGCTTAAGGTCAGTACAGTGGTCTGATGCTTAAGATGTCAGGA
CCACAGTAAGTTGCTCCATTCATATTCGTCAGGACGTTAAGGCATGGCGT
TAGAATCTTGTAAGGGCTGGTGTTATGCTGTTTTATTGAAGCTGGTGATG
ATCATTATGCTCATGGTATGGCAGTGGTGCGACCTGCACATAGACCAAGT
CACCAACAAGCCCATCTGAGTGTTTGACTCGATTTTAAGGCAGTGGCAAT
CCTGCAGGACCTACGCATGCTTGCTGTCACAGCCCTGCTCACGAGTTTAA
CTGGAACTGAAGATCTTGCAGGTAGAGCGTTTCTTGGCTGTCCAGGAAGG
TTGTTCATGCGAAGCATATGTAATTGATCTTTTTGCGAGTGATGTAGCAC
AGAATTGCTACAAGTACAGAATAAGTTTTGCTCCATCAGCTTTTGATATC
ACAGCTGGATCATGGCTCAGAAGTAGGGATGTAGGCGGACGTTCGGGAGT
GTCCGCCTAAACCAGCTAGTTAGCTAATCACCAAGTTCTTATCACGTATG
CAGTACTAGTACTTAGCTGATTCGTTTTGCCGCGGACTGTCCGCCTTGTC
CGCCCATCCCGACTCAAAAGGCTGTCTATAAGAAGAGAAACCAGATATCG
CTGGCCTAGGAATTCCTGCTGAACAAATGGATTTTCCTTGTTGCTCCATG
CCATGCATCCTCATCGAAACACCAGCGTCTGGCTTTGTGAGGCATGCCAC
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TGTCGGCCACTGAACTTGACTTGTTGGAAGAAGCTCTCAGATAGTATGGG
CAAGGAGTAAGAAAGGGAGGTTGTAAGTAAATTGCATCCTGCGAAATGGA
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GCATTTTACATAAGCGCTAGGTAGCCTAGTGATTGGTATTTAGCACAGTT
GAACGACGTATAAATTGTGTTGCGTGATACTTTGGGGAGGTAGGGGTGGT
TCATAGTACTCTCTCTGTCCTGAAAAGGATGTCGCAGATTTTTCTGAATT
TAAATATATCTAGACACTATTTAGTATATTGATACATTTGGTTTTTGACA
AATTTGAGACATCCTTTTCAGTACGGAGGGATGGGATTGTAGATTGCCAC
CTAGAAATGAATTAAAATTCCTGTGGAAATGGGCACCGGTGCTCCCTTTA
AAGAAAAATGAAACTTGTACTCCCTCTGTCCTGACATCTTTTTTAGGACG
GAGGGAGTACTTTTAGTTCTCCAAAAATTCTGAAAATAAATACTGTAACT
AGATACATACATTTAGAATGTACGATTAAATCATACATGTTTCTAGTCTT
ATTTACTGTTAGAATTTTTCTTCTTCTCGTAGACAAATTTGGCACAAATA
TATGGACCATGTGCATGTATTCCTGAGATCTTTTTTTTTCAATTTTCTTA
GTCAGAAGTACCATTTTTTTTTTCAAAACGAAGGGAGCACTGGTGCCATG
TGCACCAAATCTCCATTGAAATTCCTACTAATTCAAATGTATTTTACAGT
AACTTTGGTGTTCTATTACGTGCTTCACGAAACCTGTGTTTAGGTTACCG
TTTGGAGCTATATGCACGACTAGGTGTTCAACGGCAGCATGAGACTACTG
GCCAGCATTTTGATACTGTATTTTCTTCTTTCAAGAACGCTAGCTTAAGA
AATGCATCGCCGGCCAGCCGGCCAAGTAGTTGCTTAATTCACTCTTCTTG
CGTTGCACTGAGCTTTCAAAGATAGTGCATCCAGCCACCATCTGTTGACT
GTCCAGAACGTTGGATCCAACGCCCCCATCGGAGTTGCCCCAACATCTTC
TCCCACGCAGCCACAGCACTCCCCATGGCGCCCTATAAGTACAGCACCAC
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GGCAAACAGGTTAGGGGTATCAATGGAAGCAGGGGGAGTGCCAGCCCCAG
CCGCCGCGAAGAACTCGTGGCCGGAGGTGGTGGGCCTTTCGTCGGAGGAG
GCCAAGAAGAAGATCATCGAGGACAAGCCGGAGGCCAACGTCCAGGTGGT
TCCAGCTGACTCCTTCGTCACCATGGATTACAACACCAGTCGAGTTAGGA
TGTTCGTCGACTCCAGCGACAAGGTCACCAAGGCCCCCAGGATTGGCTAG
CTGCCTAGCTACTCAGGCTCATCCATACGTTTGTACGAATAAATCAAGAC
ATACTAGTAGTAGTAGTAGTTAATTCTGGATAACAGTATGCGTGTGTACT
AATACGTGGTGTTGTGGATCCGTGGCGTTCCAGAACGAGTGAGTTTGCTG
GAACAAGTCGGACCCATTCTCGTGTTCTGCTTCTATAGGTTTTGGGGATT
GAGTTTGTCATTGTGATGTTTCCTTTTCTTTTGAAACTAATTAAACTTTA
CAAACCAACGACAAGTTATTGAAAAAAAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.