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GrainGenes Sequence Report: AE031206

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Sequence
AE031206
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE031206
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAAGCTTAGCCAGCTGATCCCAGATATTAGCCCGCGCCAATAAGCTAAG
AGTGTACGGAGAGACCGGCGACATGTGGAGGCTGAAGGTCGGGGAGGGCA
GCGGGCCATGGCTGCGGTCGACCAACGGCTTCCTTGGCCGCACGGTATGG
GAGTTCGACGCTGGCGCCGGCACACCGGAGGAGCGCGCCGAGGTCGAGAG
GGTGCGGCGTGAGTTTGCCGACGGCCGGTTCCGGCGCAGGGAGTCCGCCG
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AAAAGTACACAAAGAGAAAAACTCGCACTATAGCAGAGCGATGTGGCGGC
CATTGATTGGGCAAAAATAGCCTATCTGCAGTATATGTGGGTGTGGGCGC
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ACGACAAAAACACAGACATCTTGCATCATGTTCCAAAAGCGACACGCATG
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TCTACAAAAAGTAATTAGATTGATTTGTATAAAGTTGGTACTTAGTCTTG
GACTCCTGATACTCTAAACCATTGGTATGGTATGTATGATGGGTACTTAT
TGCGGTTAGCGTTGGATTGGGACGAATTATTTGGACGCCGTCAACGGGTA
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AAATAAACATATTAATCTTCGCAATATCTAATGCATATAGCATGAAAGTG
TATTTCATCGTGGTCCTTGTAACATAAGTTTCATACTGTAGATTTTAATA
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TTGTATGCAACATAAACTGGGACAGAGGGAGCACGCAAGAATGGAAATTA
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GTATAAAATTATATTCCCACTATCTGCTCCTAAATTTGGTGAAGTATGAA
TTTCATATTCAAGCCTAATATATATTGAGTTTTTGCTGGGAAATTATTGC
AGTTATTCGCTTTGTACGTCACCAGATCACTTGACGCCGTGGTGACGCCG
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CTAACAATCCATGCGTGCGATGCTCATTCTCTTTTAGATACAAAAAATAC
ATGCATGTTGTTCATATACGTGATTTTATTATATGCACTGAAAAATTTGC
TGACTTGTACACCAAACCGGTCTTTGATGCAGATGTTAATCTTGTCTATC
TGTCTATTTATTTACTCTAGAACGAGGACGGGGGATGGGGCACCCTGATT
TTAGGGTCGAGCAGCATGTTCGGCACATGCTCGAACTACATCACCCTGAG
GCTCCTCGGCGAAGAGCTGGATGGCAACGCAGCGTTGGCACATGGGCGTG
GCTGGATACTGTCCCATGGTGGCGCAACTCTTGTGCCGCAGTGGGGAAGG
ATATGGCTCTCGGTACGTGTAACACCTGTGTATATGTAATAACATCATAA
CCACATGATATAAGTGCATGTACTATCTTATAGGATTCATAAATATTTAC
CGTCGCATAATTGACCTGGTCATAGAGGTGACTACCATGTACTAGTAACT
GCATATTATACTAGTTTATGATACTATTTCCCTGATGAATTAGAACCTCG
GTACACGAGTTGAAACTTTTAAGACCTGCATACGGTTTCCTCCAAACTTT
TAGGACCTCCGGTGCATTTTACTCATCTAATATTATCATAGTTAACTTCT
ATTTAATTATTTATAGAATCTTAATGCAAACTAGTGTACAAGATTTATTT
GTTATGCTATGTAATCCGGTATCATAATACCATACTATAATCATTTGATT
TTCATCAATTGATATGCCACGTCACTATTTTGCTAGCTTATTATGCATGA
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AAAAAAAAGTTAAGTGATTCCTTTTTTACAATATACATGGCCGTGTGTTT
CAATTGGCTGCAAAGCTTCATAAATAAAGAAGATATGGCTGTTGTCTAAA
AAAATCGAATCTCAAGGAAAACAATTTTCAGCTAAGAAAAACAATTTTGC
AATCACCTTTTTTTTCACACATGGCACAAAAGTTATATTTGTTCCATGAA
AGTTTGTACACGTGAGATATGGTTGCTACCTGGAAAAAAACCAGATGCTC
TAGAAAAAATGGTTTTACAAGCACCAATTTTTTTCCACACATGTATATGT
GGGACATGGACATATACTTTGTGTAGTTTTCTTAGATTATTTAACATTAC
TAATAATATTGTCTAGTTCATCCCAGAAGCATATGCTCTTTGGCGTTGGT
TTAAATATTCGTCCTAATTAACTGAGATTGTCTATATTTAGGAATGAGTT
GGTTGATAATTATTGTAGATACTTGGGGTATATGACTGGTCCGGGAATAA
CCCGATCTTTCCCGAACTATGGCTAGTGCCACAATTCCTCCCATTTCATC
CAGGTATATAACCTCTAATGATCTGTTGACACTTTTATATCAATGTTTTG
ATGTATTTTTATACTAAAAGAAACCTTTCACTCATGTACAGGGAAATTCT
GGTGTTTGTGTCGTATGGTTTACTTGCCCATGGCTTATCTCTACGGGAAG
AAGTTCGTAGGGCCCATCACGTCAACGATCCTGGCGCTAAGGGAGGAGAT
CTACGATGTGCCGTACCACAAGATTGACTGGGGTCAGGCTCGCAACACAT
GTGCCAAGGTATTTTGCCCACTGGCTGATTTCTTATAGTAAATCTTTTAT
TAATTTCATGGTTTGGTCATTGTTTAACTATATCAGATGACCATGCCTTA
ATTTTCACTGGGGAGTGTTAATGTTCTCTTTTCATATGAATGTGTTATGT
TGAAATCGAATAATTTTTCGAGTTTATGTGTTCTGTTGAAACATAAAAAA
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TGAGGTGGCACACCGGTGATGTTGAGTAATGGCTTGCACCGCCATAGGTT
GAGGTGGCCACGATATGCCGTGGCCTCGAGCGGCCGACATGTGCATCACC
AACATTTGGGTACATGCCTTCTCAAGTAGCACAGTACCTTCATCTCTCTC
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CCAAATCTTATAAAAAATATGATGATAGAGCGCATAATTTGTTTACCGCT
CATTTTTCACTAAATCGTAGAAGGCGCAACGGATTTTGTAAAAGAATAAG
TTTGGTTCGAGGGGAAACAATCAAAGAGTAAGAACCCATTTCCAAACCCT
AGTTCATCACTACTCAATAACAATAATATGCTAGATAGACAATGTTCGTT
TGTTCTATTGTTTAATCTTATGTGTTCTGTTTTTCTTGATTTTAGGAGGA
TCTTTTGTGTCCACGCACAACGTTGCAAAATGTTGTGTGGACTTCACTCT
ACAAGTATGTGGAACCAGTGTTAAGCAGTTGGCCGATCAACAAGCTAAGG
GAGAAAGCAGTGAAGAACCTCATGGAGCACATCCACTACGAGGACGACAA
CACACAGTACCTCTGTATATGTACCGTTAATAAGGTAATATGTGGTCTAA
TTTCTTGGTCTTCCGCCTAGATATAGCCATGCAAGGTGTAGCATTTATTT
CCTAGATATGATGATATCACAATTTGAGTGTGTTCTTTAATTCATCACAA
TGTCGGCTGATGTTTAGGCTCTGAACATGGTTTGTTGCTGGGCTGAAGAT
CCAAATTCAGATGCGTTCGAGCGGCATCTAGCGAGGATACATGATTTCTT
GTGGCTCTCAGAAGATGGCATGAAGGCACAGGTGTGCCACTTCGATTTTC
ATGCACTTCAACTATTTCAGTTTATTGCATTTTTTCTATCACCTTTTCCA
TGATCGATCATTTAATGGATGCACTTTCCTATCAAATTAGAGTAATATTT
TCAGCTTGGAACTTTCCCCTATTACTACTTCTTGTTGTCGTTAGTTTTAG
ATCAACCGAGGAGAAAACTAATGCTGGTTTTATTTAGTGATGTTGATCGC
ACATGTTAGGAATACAACAACTAGAATACACGTTTTCTTAATATTTACGT
TTGAAATTGCAGTGTGTGTTAAACAAAGGTAATCCAAGTGGTTATAGTTA
AGCTTTGAGTTAATAGACATATTAACCTTGATGTTTAGCCATGTAAAATT
GGATCACAAATTTACATGTGTGTATTGGTACTATCATAAGTTGCTTGGTC
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AATAACACTATATGTGCTTAAACTACAACACACCTCTCATTGTTCCAAAG
AGAGCTATTTTTTCTAAAGACACAATTATTTATAAATTATAGGTATATGA
TGGCGTTCAGAGCTGGGAGACATCATTCATAATTCAAGCAATTTGCGCTA
CGGATCTCGTTGGCGAGTATAGCCAAACACTCAAGAGGGCCAATGCATTC
ATGAAAAAGTCACAGGTTCTTTGTTTCCTCTAATCATCTTAAGTAGTAAA
ATAACCATTAGAGAGCATAACCTAACACAGTGCGCATGTTCATACATGAA
GGTTCTTTGGAATCATCCTGGTGACCAAAGTTACTCACATCGCCATAGAT
CGAAGGGTTCGTGGACTCTTTCAAGTGCCGACAATGGATGGACTGTATCT
GACACTACTGCGGAAGCACTTAAGGTCAATACATTTTTATCAATTTATTA
TTGTCGTAATATCACCAAGTAAACTTAGTTATTAGGTAAGTAGTAAGGAC
TATCATATAACTTTACCTTAACAAGTTATATCCAACAAGATGATACTTTT
ATAGAAAGCTCACTTTGTAAGTTGTTGATTCACTCCGGTTCTAATTTTTA
TAAGACCTTACATAATTTCATTTACAGGCCTTACTGTTGCTTTCAAAGAT
CTCTAGCAACCTTGTAGGGGACCCAATAGAAATCGAAAGGGTGCATGATG
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AGCGACATGATTTTGCAATTTCCCAGCATTTGTTCTTATTGCTATGAAAA
TTGCAATGGTCTCATATAGTTATGTGTATGAAATAAATTTGCAAATTACT
AGTTGTGTCAATTTAGGCGATAATCTACCATACAATAATGTATCTAAATA
AGTTAGCAGCCATAGTTTATGGATGTTGTAAAATGAAAATACATTCACAA
GTTTGCACAATGTACCAACACCTTTAGATAGCCAATTAGTAGATCTGTTA
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ACAACCGTTTAAACTTTTCCATCTTTGTTGGCATTGTTCTAAGGTGTGAA
GGCCACCTGGTTAACAACTTATCACTATTCCTTGTAGAATAAAGATGGTA
CATTTTCTACATATGAATGTAAAAGAACTTCTGCATGGATAGAGGTAAGA
TTTTACGGAATGCTACTCTTTTATTTATGAATGGAGAGCTAACCATTAAG
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TATATCTTGTCATTGGTTGTGGTTTCATGATCTTTCTCTCAATTTAACAA
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ATTTTTGCATGTTTGATGGTCTTATATTCAAGAATTTACCATGCATAACT
CATATCCCAAGTTCATATAGCTATGTGCTAATGTGTTTCTTTTAATAATC
AAGATCCTCAATCCTTGTGAGAGTTTTCCAAACATGATCGTTGATCATCC
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TCATGTATTTTGATAAATATTGGCAGATATCCGGAATGCACTTCCTCGGT
TCTTCAAGCTCTAATGTTGTTCAAAGAACTACATTCTACTTACCGTACTA
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GGCAGGTTAGGAACTTGGGGTGTGTGTTTCACATATGGAGCCTTCTTTTC
CGTTAAAGCATTAGTTGGTGCTGGAAGAACGTACGAGAATAGTTCTTCCA
TCAGGAAAGCGTGCCACTTTATATTATCAAAGCAGCTCATCACTGGTGGA
TGGGGAGAAAGTCATGTATCTAACGAAACAAAGGTAAGCATTGATTGGCT
TTTTCTCTAGGTACTTCCATTTATGGTTGCTCATTAGGGGTGGAAATCAT
TTTTTAACTATGCAAATTGTATAAGATGCAATGTGTTGAAATTCTGGTTA
ATTAGCATGTGTTTGAGTTGCAGCCATATCCCTCACTATATTCATCTTAT
ATATCTGGATTTTCTATCTTAGCATGTTCCCGTTCCATTTCTTAAGAAGC
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AGGTATCGATAAGGACTAATCATTCCTTCGATTAAAGGAGTACAATTTGT
CTACCTTTTATACTTATCGTTGAAGTGATATACGATTAGACTAATTTCGA
AAAAAAAAAGAACTATTATATTCACGTGACGGAGGCATGACGGCCGGCTT
TCGTCGACGAGGGCGGCTTCAGCATCCGTACACGCCTAGAATCGGCAGTA
TTTGGACGGAAACTGGGCCGAGCAACGACAGGTAGCTATTGTTCCCGAGG
AATTGGTCCGGCCGCGATCTAAACGGACCATATCAGCCGAACGTGTACGA
TCGAACATGAGGAGGGCAGGAAGCCAAAAACCTGGCTCAGTCGGACGACG
TAAACTGACACGATACACGTGGACCGATCTATTTCTGGCCTAAATATAGG
TTAAGAATGCGTCTGCGTGAATTTTATTTATGGGTAGCGTTATTTCCCCC
GATTCCCCGGTTGCCAGCCTGCCACGTGTCCGGAAAACCATGTCTAATCC
CGTTTTTGCTACAAAAGTAATATTTTTTTCTATAAAATGTCCTCTTTTAC
TACCTGTAGCAAAACAGTTTTTCCAGGAGACAAAAAAATCTCGCGAGAGA
TCTCACCGAAGTTTCGCCGGAGACTATGTAGCAAACAAGTTATACTAATG
TAGCAAAAATGACTTCACCGATGAGATCATTGGAGACCGTCGCCGGAAGA
CCTTGCCGGAGACCACGTAGCAAAAGCTTTGCACGGTTGTAGCAAAAATC
ATAAGACGGTTGTAGTAAAAAAATTACAATTGTAGCTAATCGAACTTCGT
CGGAGACCTTGTGCCAAAAGCTTTACGGTATTGTAGCAAAATCATAAAAC
AGAGGTAGCAAAAAATATGTGCAAAAATAGCAAAAACCGATTTCGCCGGA
GTCAACGCTGCAAATCTCACCGGAGACCTCGTAGCAAAAATATTGCGCTA
TCTTAGCAAAACACCGAACAATTATAGCAGACAAAATTATGACTCGTAGC
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ACAGGACTTGTCGGCACCGCCAGCTGCCATGACTACGGTTTGGGGAAAAA
AGGCGCTGCGGGGAACCAATGTCTTCCCGCCGCAACACCACCGACCACGG
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GTGGGAACAACGGCGCGTTTTGGGGACGGCGGGAATGGAGGTGGCGCACG
TCGGCGACTCTGGGAATGGCGGCGGCGCACATCGGCGACTGCGGGAATGG
CGGCGGCGCACAGACTGCGGAAATGACAACGGTAGCCGCACATGGTGGAC
AGAGTTTGCCGGAGTCTTCCTTTAAGGAGAAGATAAAGTACAGGTGGACC
ACGTCATTTCGGTTCAGAACGACCCGGGATGCGCGATCCCCCGGAAGATG
AGTATCATTTTCTTTTATTTATATCGGAGCCTGCAATACCATGGCCGCGT
TCGCCGCTGGTGTAGGCAGAGCAAACCCTACTTTTAGCTAGGATCTTTGT
TTACTTATTATTTTGGTCCCTTTTTTGTTGCTATGATTATTATGAAAAAA
TATGCGTCAGCCCACTGAGATCACACCGCCCCGAATGGACTAGGGGGTAC
GTGACTGTGTTACAAACGCGAGAAGCAATAAAACAAAGAAAAAACAAACC
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GAGAAAAAACTACAGGTGTCAGCCAGCAAAACTTTGCTATATATGGAGTG
TTTAACAACGCCGGAGATTTTTACATATGTGAGTTATCCCAACCGCTGGC
TTACAAGAGGTCTATATAACGGCGGAAATCTAGGTCATGAAAGCACTACG
GAGGGGGCGTTGCCCCCACCCCCACCCCCCGGCGTCCCTGCGGATCACAA
CGTTATGAGGTAACTTCAAAGTCCAGTGAGGGGTCTCGCTCCCCTCGTCA
TAAGTTAGCCTCTTTAATGAATTTGGATCAAACTTCGGCACACCAGTGGC
ACCTCCTACCAAGCCTCCGGTGTCGATAGCCCTCGATGTGGTGTCATCGC
CACAGTTCTATTTCGCGCATCTCCTCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTGTCAA
CCTCAAGGCGAACAACTATATGTATTGGCTTACACATGTGCTCCCGCTTG
TCCACTTTGCTTCGGCCCAAGCCTACCAGGGAAGGGACTCGTTTCGTTCC
GTCGTTTCCTTCTCACTAAATTTGGATCATAATATAATGAAATGGACAAC
ATTTGCTGTCCGAAATGGCTTTAGTCGCTTAAGATGCGTTTACAGCCTGA
TTTTGGTCGGCGGCAGAGGTACTGTTCATGGGATGAGAGAGAAAGAAGAG
GGCAAAAGGAAGACATGTGTTTCGTGGACTGATGCTCAAAGACGTGATGG
TCTGTACCTGGTATGCGCGCTCACGTTCTTATCGTCCAAGTCTACAACGA
TGTATACTCCGTCTAAGTCTCTAAGACCTGAACAACATGAGTAATATTTT
GAAAAGAATAATATTATTTTTCAGAATTTATTTAAATAATAATTATTAAA
ATATTCCATCAATACTGCATGTTTTGTTTTTACTTACTTTTACTGTGACC
TGAAATTAAACAGGTGTATGTAAGTATCGAAGGTGACCGTGCTCATGCAG
TGAATACTTCTTGGGCAATGTTGACCTTAATATATGCTGGACAGGTATTT
ATGTCATGTACATTGTTTAATTCCACTGTAAGAGCAAGGGCAATAGTAGA
GCCACCTGTTGGCTATAAGCCATGTTCATGTCATCTAGAGTTAATCTAAA
TCAATATTTACAATAGTTAGAGGTAAAAATATACTACTTTATTAAAGTAT
GACCCACTTTTCACTCTCACGTAATGCCTAGGAGCACGTGCTGCAGTTGG
CTCTTAACTAAGAGCAAGTATAATAGATCCTAGTCAGCTGACTATAAGCA
AATCCACATCAGCAATATCCTAGGTGGAGGGGAGAGAAAAGAGGAGACAG
ACTAGAGCGGGTGCTTCAATTATCGCCGGCGGTAGCTCAAAAACCAAGAG
CTTGCAGCCGGCATGCAGCCCAGCACTAGCGCAAAGACCCAATGCATGCA
TTAAATGTCAAACCGTATGTGTCTTGCATGCAAGCCTGGCAAAGCCATGC
TTAACATTTAAAATTGAAGAACAACAGAGAGATTGAAGTGAAAAGTGATT
CTTTATTGATTTACTGTTCAGCCTTTTATAGCCTCTGAACAGTCACGAAT
ACAATGTCGGTTACAGTTTATGTATCCTTTTGGAAGAGACATGATGGCTG
TTCGGGATTTTGGCGTTTGGACAACGCAAAGAAAGACAACCGTTGGCAGT
TTATACTAACACAATCCTAACTGCCCGTTTGGCTTGCATGTTACGTTAAC
TACTCCTAACAAAAATATTCACTAGAGCCGGTGCAACAGCCAGTCTATTA
TACAAGTGTTTATTAGTGATGACTCTAGATGATGTGGCATGAGTATAGAG
TCGACGGTCGGCTCTATTATTGTTCTTTCTCTAAGCACCCACTCCTCTTC
TCTCTCATCCAACTAAACACAAATATACTATTTTAAGTCCTATAGTCTGC
TGACTGGATCTTATTGTACTTGCTCTAAGAGGAATATGTTGTTGATCAAA
CTAATCTGATTTCCTTCTTTGAATACCAGATGGAACGAGATCCAACACCA
CTGCATCGTGCTGTAAAAGAATTGATCAATATGCAGATGGATACAGGAGA
ATTTCCCCAACAAGTAAGTTCCATTTTGATTTATGCTGACAGCATTCATT
TCACGAATGAAATTGTTAGCTTCATTTCCGGTTTCAGCAGTTTTTTTATG
GATGATGTGTTGGAGACTCTGAAAAATGTCCTATATATGGTGCAATGTAC
TCGGATCAGATCATGCATAATGGCTTACTTATTTGTGCTTGTGTTGTGAT
GACAGGAACACGTTGGATGCTTCAATTGTTCCCTTTTCTTCAACTACCCA
AACTACCGTAACTTATTCCCTATCTGGGCTATTGGGGAGTACCGGCGCCA
TCTCCGCGCGAATACCATAAACGGGTGTGCATCATCATCTTAAAGAACAT
GCGCTTGACATTGCACGGACATTCTTTAGCCGCAAAATTGCCGTAAACAA
CTAAATTGGTTATATCCCCCAAAGATGTATCGTAAGGGGGTTTACTTTCT
TTAGCATATGTAGTAAGTACTTGACTTTAAAGCTTTGTACTCATAAAATA
ACTTGGTTTTGTGCTATCTCTTTGCGAAGATGCATGCGTAGGCACCTTGA
CTTTGTCATGGAAGAACCATATATGAGATCGTTATATGATCTTCAGTTGA
TATTGTTGCGGAGGAAAAAATAGATGGTATCAGTTATAAAAAACAGGGTC
ACCATGTGTGATGTGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.