Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE022320

[Submit comment/correction]

Sequence	AE022320
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE022320
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCTGAGGTTTGGTCCAATCATGAAGACGAGGTGTGAAGTGAGGAACAA GAAGCAGCCCGAAGCCGTCTAAAGTAAAATATTTCACATTGTATATCTCG AAAGTTCCATAATTAGCTTATGTTTTGGATCTTAATTAATTTATCCAAGT GATGGTTACAAAGTTCAAAATAATCATGATCACTGAATCACGTACTCTCT CCAACACATATTAGTTGACTTGGATTTATCTAGATTCGAATGTATCTAGT ACTAAAACATGCCTAGATACATCCGAATCTAGACAAATTCGAGTCAACTA ATATGGGTCGGAGGGAGTACTAGATATTCATAATTGTCGTGGTGGGAGGA AGCTAGCAAAGTTGAAGGAAGTAGATTTTGAGTTTTTGCGTTTATAGATT TTTCTCTCACGCTACAATGCACGGTCATATTTGCTAGTGAAAATCCTATC ACCGAGAACACAATTGTTCAAACGTATCATAAATCTTACTTTCATTGAGA ACATATTATGACTGGAACTTTTAAATCGAATTGAAATTCATAGGTTGCTG TAATTTGTTTGCGCTCCGAAAGACCAGCATTGTTTTTTCACGGTCGTAGC ATGCCATGGAAGCCGTCACGCACCGTTCCTAGTTCGTGTCGATGTTGTTT CGTATTGAGAGGACCTCATGGTCTTTGTGGTATTTCGGTTCCACTCCGAT CCAGCCCTGTAATGAAATAGCAGTCAGGTTCAGACTATAGTATCCGAGAA CGTCTATGTCTTGGAGCTAGATTAGATATAACTTCGACACGACAGCCATA TATATATATTACTCTATAACTTAAGCCTGAGCACATGCAGAGCCTCTGAG GCCATCTGCCATTCCGTGTGTCTAGCACGTGGGCCCTTGTGTCCATCTTT TAATATACTAATTGCTCAGCTCCCCAGCAGAGCAAGCCAGCTTAGCTTGT CATTTCGCTCCGCCGCAAAGGAGAATAATATATACACGTGTTGTTGCCTC TTCAACAACCGTACTTTTTTTAGGGTAAAAAAAACCGTACTAGTCGCACA CAAACGGCGTAAACAGTCCAGGATTTTATTTTCTTGAAGAAACAGTCGAC CTATTATATCTCTCTTTCGAAAGAGAGAAAAAAAATTGGAGTAACGGATT ATGGCTGACGAAGAGCAAAACCCAAGATAAGTTCATCCAGACTTCCTTAT TTCTTTTTGTCTGGAGAAATTTTTCCTAAATTTCCAAGTTATATGGTTCT AGAATTTTTACGGAAAATTATTCAGAGTATCGTATCGATGTTAGCACATC TAAATTAGATGCAGTACACCACTACGCGTATGAGAGAACGTTGTCAATCA ATCAATAATAAAAGAAAAAAACGTTCCAATACATCAGCGACCGAGCCACA TTAAAAAAGGAAAACCTGGAAGAGTCCACGATCGGATTCCCCTTCGCCAC TTAGCACTCACCAAGCCCTCACCTCCCGCCGCCGCCTCGCCTTTGCTGCC TCCGTGACTTCCTCCCAGTCCCTTAGGGCATAACCTCCTCCGGCGCTGCT CTGATGCCGTGGAACCCCCTACACGGTTTCACGCGTTTTTGGAGGAAAAA TCCTGGCGCTGAGGATGTATCTCTTACAACACCTTCTTCTCCGTCTGAAC CTGATTCCGTAGGAGCTCTTCCCTCACCTCCTCCTTCTCCTCCTGATTCT AGTCCCCCAGGAGCAGCTCTTCCATCACCTTCTCCTGAATATGATCCAGC AAGAGCACGTCGTCCACTTCCTCTTGAATCTGCTTTCCGAAGAGCACCTT TTTCTTCATTTAAGAATCCCCCAGTTTGTGTTTACCAATCAAGATTCAAC TTACTATCGCCTCTCGACTCATCTTGCGGGTATACTTATTATTACTACGG TTTTCTCAAAACGATAGTATGAGCGTTATTTATCTTGTTTTTTTTTTTTT TTGCATCGGTGTCTTCGTCCATTGCACATAACCTCGTTTTTGCTTCATCA GTCCTTGCGCTTGTCACTAGCTTTTTCTCACTATTTCTGGCTCATTTCAG GCATGCTGCTGATAACAATGATGGACAGAACAGTGGTGAAGGTGCTGTTG TTCCTAAACACAGGTAATACTTTCACCAATGTGCCTCCCCATGCCTTTAG CGGGAAATGTGCTATCCTTTAACCTTTGTTTGAAGTCACTCAATTGGAAT TTGTGAAAATCTGGATGTTTCAAGTAGAATTGTCGGTATAGCATGAGATC AGATCCTTCTTTATACCACTAGGAAACTGCAATTAAAATCTCGTCGTGTC AAATTGAAAAATAATTCTTGATCAGTCACTTGATTGTACTATCGGCACTA TCCAGAGATCTGTAATGCCTTAGATCTCTTGTACGCTAGAAAGTGATGTG AATTGGTCAAGTGGACAATTCACGTTCATATGAACAGTGCAGCACAAAGA AATATATATATTTTACTATGACACCATAGATCACAAATTACAGCCAGGCA TGGCAATAGTAATACACACCAAGAAACAAATAACAACAGAAGATTCTCCA CTCCAGCCAGGCATGATAATTCAGGTTTGGATCATAGACGATTCAGTGCG CTGGTTTATTACAGATGATCATAAATGAGCTTATGATCCATTCTTCTCTT GAAGTACAATTTCTGTACAGTTTGTATAAAGATTTATGACCACTAGATTA ACTATTGCTCTCTGGGCATACAGTTTTTGTACATTTTACATAAATTTCCA TAACTGCAAAATAATTATTCTCTTCCGCCATTTACGTTTTATTTACATTT TTTAACTTGGCATAAAGACTTGTGACCACTTGCGCAAAGATGACTTTAGC GAACATGGCACTTTCCTCTTTCACCCAAAAGGGAGATTTAGGGATTTGCT CACATTAATATAGATTTTTAGATATCCATATGCTGCAATTTTCCATCATA AAATTTTGACAATTTTGTGTTGACTTGTCAAGATCCAAGCCACTGCTGGA TGACGGAGATTCTCTTCCTTCTGACTTATCTGGCAGGTATGCTCATTGCT ATCGTCTTTCTCGTATGGTCAAGATTTAGTTTACTCAGATGATGTGTGGT GTTTGTATGACGTACAATCATCTCCCATGGAAGCGGTAGTGAACTATGAA CTGTCTTTCGTTTTTCTTCCAAATTCACATACATAAGTTTCTTTACCTAA ATAAAAATACAACAAACATCATGTAGTTTTGTAAACATTCTGCATTTTAC AAGCACCCTCAAATGCACCAATCACTCTGCCAGCGGTAACATGGGCAGCA CCCAAAGTATCATTACATAGCCATGGCCAACTCAGACACAGAAGTTGAAG ATTGTCTTTGTAGCATCCAGCCAAAACAAACATAAAGTACAGTATTAAAC ATAATAATGAGAGTCTTATATCACTATTAATTGCCTTATGTAGGAATGTT AGTACTATTTGTTGAATATCTATGGCTTACCTTCATGTAGCAGTAATTAA TATAAAAGTGTGATCCTCTGTTAAACTGATTTTAAACTTGCAATTTTTAT TATTTGCAAAAAATATGTTGTAAGAATATAGATTAAATTATACAAAATAA GACCATTTGGAGCAATTGTAAAATAAAATCATACTTATAATTGTTCTGGC ACAAAACTGTTGAGGATGCTCCAATCCGGTCATTTCTCCTCCATTTTTGT TATGCCCACTAAAATTGGCAAATGGGTTTCCACTAGCCGGTCAGGATGAA CACTAAAATTGGCATCTTTTTCTTCACTTGTACTTAAACATCCCCCAGTT TGTGTTTACCAATCAAGATTCAACTTACTATCGCTTCTCGACTCATCTTG CGGGTATACTTATTATTACTACGGTTTTCTCAAAACGATAGTATGAGCGT TATTTATCATTGTTTTTTTTGCATCGGTGTCTTCGTCCATTGCCCATAAC CTCGTTTTTGCTCCATCAGTCCTTGCGCTTGTCACTAGCTTTTTCTCACT ATTTCTGGCTCATTTCAGGCATGCTGCTGATAACAATGATGGAAAGAACA GTGGTGAAGGTGCTGTTGTTCCTCAACACAGGTAATTCTTTCACCAATGT GCCTCCCCATGCCTTTAGCGGGACAAGTGCTATCCTTTAACCTTTGTTTG AAGTCACTCAATTGGATTGTGTAAATCTGGATGTTTCAAGTAGAATTATC GGTATAACATGAGATCAAATCTTTCTTTATACCAGTGAGAGACTGCAACT AAAGTGTCAAATTGAAAAATAATTCTTGATCAGTCACTTGATTGTACTAT CAGCACTATCAACCGATCTACATTGCCTTAGATCTCTTGTACTCATAGAA AGTGATGTGAATAGGTCAAGTGGACAATTCACGTTCATAGTACAAAGTTT TTTATTTTTTTACTATGAGACCATAGATCACAATTTCAGCTAGGCATGGC AATAGTATAACATGAGAATTCTAGTTATAACATGAGGTCAGTCAGATATT TGTCTACACCAATGAGCAAACTGCAACTAATATCTCGGCATGTCAAATGA AAAGTTATTCTTGATCAATCACTTGATTGTTCTATCAGCACTGTCCCGAG ATCTGTATAACATAAGATTCATGACCGCAAAATAACAATTCCTAACTGAG AGTATAACCTTTCTACAGTTTGCAAAGTTTCTTGACAACAAAAGAACCAT TATTCTCTGGAATTACAATGTTCGTACAATTCGGATCAAGATTCATGACC CACACAATTTCAGAATATGATGCCCTCTGTTCCATATTAGTTGTTGATTT GTACTAAATCAGCGACAACTAATATAGAACAGAGGGAGTAGCAAATAGGT TGACATGAAATGAACACTAGTAAGCTAAGGTTTTTTTCCTACTTCCTATT CCTCTGTTATTAAATGTGTCCCATTCATCAAATTCTTCTGATTCTTGTAC TTCCTGCATCCATCACCAACCCCATCTATTCTGCCGTAAAAATGCACTGG CCAGCCTCCAAGAGGAACACAATCAAACAAATAACATGCACGGGTTCTGC CAAGTTATCAGCTTAATAGTTTCTTTGATGGTGCTGGGGTTTATGAGGAG AGGTTGCCAGGAGCCTTGTGCCTCCTGCTCTCTGATCCTAGCTCTCCCAC TCAGGGAAAACCAAGTCGCACCACAAGCGGATGGCAAGTTGAGATGAGAA GCAGACTCGTGGTAGAGAGGACAATGAAGGAAGCCTCTGGTGAGATATCC GGTGGGGGACAGCTCTGGGGTGTTGGGGTGCCTCCGTCATGGACTATTAG AGAGGGAGAGGGAGAGCTTGAGGGAATGTGAGTGGCAGGACACCATTGGT TTTTTTCTTGCCTAGATGAGAGAGGGGGGAGCGATGTTCTTCTTTCAGCT CCATTATAAAATGAAATGAAGAATTAGGTGCCACTCTACTCCACCTCAAC ATCATTCTACTAAAACAGCTGTCTAGTGAGGCTGCCCCAAACACCCAATA GAGGATAAGTGGATAACAACCAGGAATCTCCTGTAGATTTGTAGCTCCTC CATCAAATTGCCATCATTAATTGTCGGATGTTTTATTTACTAGTTGCCGA ATCTCTATAGCAGCTTGTTTGAAGTCACTTCAAGTTTCCTAATTTATCAT TAGTGTTGATTATATGGTTAATTATGTTTCCTAATTTGATGTTTCAGTTC TAGTGATGATAGTGATGACGATTGGGATGACGATCCTTTTCTTACCGATA GTCAAGGAAATTTAACAACTTGGAAGCTGAGTGATATGGAGGCAGCATTC GAAAAACATCTTGAAGATGAAGCAAGTAAACCAAAGGTAGAAGAAAAAAA AATCCAAGGAAGAAATATTAAAGCATAATGATGATCGTAAGAAACAGTTC ATGGAATATGCTTTACAGAAGTATAACAACGAAGAATGTCTTGCTGGGGT TTGTGCTCTTTCCTTTTAATTTGTAAATTCTTTATTTTGAGCACATTCCC GTGTTATAATTTGAGAATTTTTTTCAGGAGATGCGCTTTGTGTTCGATGA AATTAAAAAAGAAGTTTACGTTGTTGAAGGTGGCCTGAAATTCTATGAAC ATTTCAACTTCACAGCTAAGCAGGCTGGTTCCACGGTTTTGTTTTTTGCT GAACTGGTCCCACATGGAGACAATTGTGATGTTCTCTGCTGCAAGCCTTT GGATTGTAATGACAACGGTATGTTTCTAAATTGTACTATGACTAGTGGTA GTACGGTAGTGCTATACATGACTTGTTGCATTACCTTTAATATGTTCGGA ACTTTATTTGACGGTTGTATAGTTAATCTGTTCATTTATCCACTTGACAT GCTTAGAGTGGATTGTTAACCTTAAATATAAAACCTTACAAAGTGACTTC GTAAGTAGGAATTCCACTAATATGAATTGTCTGAAAAGTTTTTATGTGTA AATTTACTACTCTAAGCTGATGTGTCATGTGGGGACAAACCTTGTAAACT GATCTTTTGTCATGTGGGGATTACCTACAATTGATGTGGCGTACATGGCT AGGTCCCCCTAGGTCCGTTACCTTGCCCAGTCCATGTGTTCATATCTTAG TCACGATTTGTAACTGATTGCTACTCGACTTGATTTGTTTTTAAGAAAGA GTCCTGATAAGATTGAATCTGTATCAAACTATAGGCACAGTTCAATTTGT ATTCTTATAGTCTTGCGTAAAGACATCCTTTCATATAAGGTAGCAATCAC GTTGGTTTGAGTTAAGCAATCAATAAATTTAATGTTCTATGTCTTCTCCC TCCTGGTTCTGTTTGTTGGCGACGACACTTACCTGCCAGCGTCTTGTTGG TTCTGAAGCTCCTATCGGCATGGGCTGTGCCCTCAAATCAAGGAGCCATA ACACCTTTGTATTAGATACCATTATTTGTTTCGTTTTGCAACGATCCATG GACGAGATGATGACTGGTATGGAGCTCTAGAGGAGGCAATAGGAGGACAG CTTCAACAGCAGTTGCAGGAGCCGTAGAGTGCATCGGCTATTGGGTCCTC TCCCATACCCACAACTACCACCGCCACCACCCAATTTTCGCTGACCATGG CACCAGCACCGCCATTGCTCCCAATCACCACTGTCCACACAGTTTTTTGC ATCTGCTGCCACCCACGTGCCCTCTACCAACCAACCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCAGCCTGCTGCCTCTACCAGTTCCCACGATCGA CCACCCAATACCCACCTTGCCCAATCAGATCACTTACCCCGTTACTCGAC ATGGTCCTTGCAAATCTGTTTGTAATCACACCAGTTGGCTTGTCTGTGTG GTACCCACCAGAAGCAGGAGTGTGTAATTAATTTTGTTTACTGAAGCACC ATAATAGGTTTTCTTTATAGAGGTTGTGACATGTAAGTCTCTTAATTTCT TATCGCTCTGTTATCACACAAATTGCATGTGCTAAATCACCTGGTCCGCA TATATTTTGTGTATTCATTAGAAGCATGTATTGTATTATTATTATTTTGA TCATATACTGAGCTGGTGAGACCGGCTAAATTGGGGCTTCAGTTGTACTA GTATTCTGGTCATACTAGAGAAGCCAAAACTTTGTTATTTCAAAGATCAG TTACCATGAATCGATCCTATGCACACAGGCATCTAAGTCTCATACTTTTA GGGAAATATATGTATTAGGAGTTCTAGAATTTTGGATGTCAAAAACGTAT GTATCCATTATGCCATATACAGACCTACTCTCTCCTATCAGTTTATAAGG CATACATATATAGTTTGTCTTGAGTCAAACCCTCATAAATTTGACAAAGT GCATAGAAAATAATATCAACAGTTACAATACCAAATCAATATCAGCAAAT TCATCATGAAATATCTATTCATTGTGTATGAACTTGTTCAAACTTAAAAA GAGTTTGACTTGAGACAAACTAGCTATACCTTATAAACTGAAAAGAAGTG GGTAAGTTTGAGCCAAGCAACAGTAATCCTTCCATTTTGTTCGGTTAACC TTCCAGTTTGAAATATGGCTATGTTCAGCACAGGAGTTATGATGTTGTAG ATCAAAGTTTGTAACATGTTACTTATTCACAAAGTAAGTCCATCATTTTC TTTGTTGAAGGACACTGTTATGCTTGTAAGAATCAACGTGCTATGAACTT GAGGCATCCAGCTGATGAAGCTCTGTATGTTGGAGGTCATGAGGATTGCC ACTTCCCATTTATGTGGGATAGTATCGGTGAGGTATTGTAAATCAAGCTG ACATCCTTTTGTGCTGTTTTTTGTGCCTTCAATATTTCTATAATATGCAT TATATTGTATTTCACATTTCAGGATGACTCCGATTGAGAGGAAGCTATGA CTCTGGAGAAGGCCTTCTTCATTTGCTTCTCATTTTAACGTCTATGTCAT TCATCTTTTATTCAGAGGGCATGTAACATATGTTACGTTCGGCATAATAC TTTTGGTATTAATACATTGATTGTATGTGCAATGATGGTTGATGGTACAT CATGCACACTTAGTCATCAGCATGTAAAACTTTGAGGGAACATATGGAAC CATTTATACAGCCTGATTGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.